cDNA-AFLP analysis of Psidium guajava L. cultivars under water stress and mechanical injury: methodological implications

Studies involving amplified fragment length polymorphism (cDNA-AFLP) have often used polyacrylamide gels with radiolabeled primers in order to establish best primer combinations, to analyze, and to recover transcript-derived fragments. Use of automatic sequencer to establish best primer combinations is convenient, because it saves time, reduces costs and risks of contamination with radioactive material and acrylamide, and allows objective band-matching and more precise evaluation of transcript-derived fragments intensities. This study aimed at examining the gene expression of commercial cultivars of P. guajava subjected to water and mechanical injury stresses, combining analyses by automatic sequencer and fluorescent kits for polyacrylamide gel electrophoresis. Firstly, 64 combinations of EcoRI and MseI primers were tested. Ten combinations with higher number of polymorphic fragments were then selected for transcript-derived fragments recovering and cluster analysis, involving 45 saplings of P. guajava. Two groups were obtained, one composed by the control samplings, and another formed by samplings undergoing stress, with no clear distinction between stress treatments. The results revealed the convenience of using a combination of automatic sequencer and fluorescent kits for polyacrylamide gel electrophoreses to examine gene expression profiles. The Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean analysis using Euclidean distances points out a similar induced response mechanism of P. guajava undergoing water stress and mechanical injury.

PLANEJAMENTO, OBJETIVOS E DEFINIÇÃO DE PADRÕES NA DESCRIÇÃO DOS METADADOS DA COLEÇÃO DA BIBLIOTECA BRASILIANA DIGITAL

O projeto „Por uma Biblioteca Brasiliana Digital‟ é parte integrante do projeto BRASILIANA USP, uma iniciativa da Reitoria da Universidade de São Paulo (USP), que tem por objetivo facultar para a pesquisa a maior Brasiliana custodiada por uma universidade, tornando-a disponível na internet. O trabalho que ora apresentamos é resultado da implantação de um modelo de biblioteca digital que atende aos padrões de interoperabilidade e compartilhamento de informações. Especificamente, apresentaremos os procedimentos e processos de descrição de conteúdos das diversas tipologias documentais (livros, periódicos, mapas, gravuras etc.) e formatos digitais (pdf, mp3, jpeg entre outros), bem como a consolidação de um esquema de metadados gerenciais e administrativos que contemplam as informações e dados produzidos pelo Projeto da Brasiliana Digital.

USO DO DUBLIN CORE NA DESCRIÇÃO DE OBRAS RARAS NA WEB: A COLEÇÃO DA BIBLIOTECA BRASILIANA DIGITAL

Acessível ao público desde junho de 2009, a Biblioteca Brasiliana Digital, da Universidade de São Paulo tem por objetivo facultar para a pesquisa, a maior Brasiliana custodiada por uma universidade. Sua intenção é disponibilizar virtualmente parte do acervo da Universidade oferecendo-se como um instrumento útil e funcional para a pesquisa e o estudo dos temas e cultura brasileiros, além de oferecer um modelo tecnológico de gestão que possa ser difundido a outras coleções, acervos e instituições. Este trabalho apresenta os resultado da implantação de um esquema de metadados baseado no formato Dublin Core, para a descrição de obras raras e especiais na web. Especificamente, apresenta os procedimentos e processos de descrição de conteúdos das diversas tipologias documentais (livros, periódicos, gravuras etc.) e formatos digitais (pdf, jpeg entre outros). Palavras-Chave: Bibliotecas digitais; Metadados; Dublin Core.

Boletim Temático Mulher - Biblioteca do Museu Paulista e Museu Republicano "Convenção de Itu" - USP

Texto de Apresentação

Atualização da Biblioteca Digital da Produção Intelectual da USP : melhorias & resultados

Atualização do DSPACE, implemenção de todas as funcionalidades e as novas funções da versão 3.1 Comparação das versões utilizadas do DSpace para avaliação dos benefícios no desempenho, com a adoção de novos serviços e implementações, plug-ins e integração com banco corporativo da Universidade.  

Biblioteca Digital: a experiência da USP

Visão Geral do SIBiUSP: Proposta e foco de atuação. Projetos: Portal de Busca Integrada, Projeto de obras raras, Acessibilidade

BDPI: Biblioteca Digital da Produção Intelectual da USP

Biblioteca Digital da Produção Intelectual da Universidade de São Paulo Objetivo: captura, armazenamento, indexação, preservação, busca e disseminação de material digital.

Repositório digital em biblioteca acadêmica: desafio na garantia de acesso para informações em saúde pública

Introdução: A Faculdade de Saúde Pública, assim como a Universidade de São Paulo, tem, na sua produção intelectual, literatura científica de relevância para a área da saúde, que sempre está a frente no desenvolvimento de tecnologia e na organização da informação. É importante que essa produção esteja acessível à sua comunidade, técnicos e profissionais da saúde, além da população em geral. A Biblioteca da FSP/USP, por ser uma das curadoras desse conhecimento, constitui-se, além de memória bibliográfica institucional de importância para a história da saúde pública brasileira, em uma fonte de informação valiosa, cujo acesso deve ser garantido. Objetivo: Apresentar o desenvolvimento de um repositório digital em uma biblioteca acadêmica. Métodos: A oportunidade da criação do repositório surgiu como parte de um projeto de infraestrutura de pesquisa da Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Na sua concepção foi previsto o uso da plataforma DSpace e o padrão de metadados Dublin Core, com adaptações. para sua implantação foram adquiridos: dois servidores e respectivos no-breaks, um “storage” com capacidade de 8 terabytes e dois escâneres com design especial para acomodação de lombadas. Uma equipe de informática responsabilizou-se pela instalação e configuração dos softwares, e a de marketing desenvolveu o design gráfico. Resultado e discussão: O repositório dispõe de cerca de 600 registros, com os devidos níveis de possibilidade de acesso – aberto, restrito ou embargado –, em fase de inauguração (prevista para 2012). A equipe do projeto é formada por profissionais com experiência e conhecimento em diversas áreas: metadados, preservação digital, usabilidade, design gráfico, marketing, direitos autorais, arquivamento de dados, backups, sistemas de autenticação e firewalls, entre outros. Parte da digitalização dos documentos foi executada por empresa especializada, que também treinou a equipe da Biblioteca, tendo sido digitalizadas, até o momento, 205.000 páginas. A Biblioteca instalou uma Oficina de Digitalização para dar continuidade ao repositório, que é atrelado à área de Desenvolvimento de Coleções. Além da produção intelectual da Faculdade, esse repositório conterá documentos da história do Estado de São Paulo e a do Brasil, no que se refere à informação científica em saúde publica. Entre sua concepção e implantação foram dois anos de trabalho da equipe da Biblioteca. Conclusões e comentários: O Repositório Digital da Biblioteca da FSP/USP foi desafiante desde sua concepção até o financiamento, capacitação e manutenção de equipes, entre eles a customização do DSpace. Da mesma forma, foi uma oportunidade para a equipe ampliar seu “know-how”. Os impactos positivos de um projeto desse porte incidem sobre o acesso ao conhecimento muito mais facilitado, de forma gratuita e universal, agregando maior valor aos registros das bases bibliográficas à medida que disponibiliza links para os textos completos, áudios, vídeos e imagens, para a divulgação da ciência.