Sequence context analysis of 8.2 million single nucleotide polymorphisms in the human genome

We analyzed n-mers (n=3-8) in the local environment of 8,249,446 human SNPs and compared their distribution with that in the genome reference sequences. The results revealed that the short sequences, which contained at least one CpG dinucleotide, occurred

生物膜-人工湿地组合工艺处理城镇生活污水的研究

采用以天然植物中空纤维作为填料的生物质-生物膜反应器(BBFR)串联复合垂直流人工湿地(IVCW)的组合工艺处理系统,研究了5种不同的运行工况,即不同的停留时间、水力及污染负荷条件下对城镇生活污水的处理效果。结果表明,5种工况下组合系统的出水均能达到一级排放标准,COD、TN和TP的平均去除率分别达到89.86%、93.5%和74.78%。各工况条件下因为装置控制参数和稳定程度的不同,各运行阶段下的净化效果也有一定的差异。通过探讨BBFR和IVCW的最佳耦合模式,即系统处理效果达到最佳时的运行参数,实现了

74-fs nanotube-mode-locked fiber laser

We report an erbium-doped, nanotube mode-locked fiber oscillator generating 74 fs pulses with 63 nm spectral width. This all-fiber-based laser is a simple, low-cost source for time-resolved optical spectroscopy, as well as for many applications where high resolution driven by short pulse durations is required. © 2012 American Institute of Physics.

香溪河鱼类群落组成及资源评价

采用定置刺网的捕捞方法,于2005年3—4月在香溪河官庄坪库湾连续捕捞20次,共调查到21种鱼类。对采集的渔获物数据,分析了多样性和种群优势度。确定上层、中上层、中下层和底层的优势类群分别是贝氏、蒙古、翘嘴、鲫、鲤、蛇、鲇。三峡水库蓄水对官庄坪鱼类群落构成影响显著:鲤科鱼类种类组成比例占总种数76.2%,其中亚科有7种,占鲤科总数的43.8%。静水性生活的鱼类所占比重较大,已经形成优势种群。经济鱼类在生物量上占有举足轻重地位,上层肉食性鱼类以蒙古、翘嘴为主。鳅科鱼类基本绝迹。

污水中8种雌激素化合物的定量测定

采用固相萃取-气相色谱-质谱法(GC-MS)测定污水中辛酚(OP)、壬酚(NP)、双酚A(BPA)、己烯雌酚(DES)、雌酮(E1)、17β-雌二醇(E2)、17α-乙炔雌二醇(EE2)和雌三醇(E3)8种具有雌激素活性的化合物。被测组分的加标回收率为(65.4±4.0)%～(110.0±4.5)%,检出限为1.0～7.5ng/L(相对标准偏差为5.2%～15.6%)。经检测,武汉某城市污水处理厂进水中的目标化合物(除EE2外)浓度为6.5～8954.9ng/L;除EE2和E3外,出水中的浓度为3.2～2

~(14)C标记1,2,7,8-TCDD在鲤体内分布及代谢的初步研究

利用14C标记1,2,7,8-四氯代二苯并二噁英(1,2,7,8Tetrachloro[U—14C]dibenzodioxin,14C1,2,7,8TCDD)初步研究了其在鲤体内的分布和代谢规律。14C1,2,7,8-TCDD溶解于丙酮/植物油中,腹腔暴露。暴露1、2、4、8、12d后取样,肝脏、胆汁、腹腔脂肪等消化制样后用液闪仪测量放射性活度。肝脏和胆汁内的放射性活度同步变化,都是第8d达到峰值后下降。腹腔脂肪内1—2d放射性明显高于随后取样的样品。肝和腹腔脂肪的分布量之比呈现“S”型变化趋势。暴露4d

长江水系草鱼遗传多样性的微卫星DNA分析

利用已发表的鲤微卫星引物在草鱼中进行PCR扩增 ,结果有 5对引物 (6个座位 )能成功扩增并且有较高多态性 ,等位基因数在 3— 7个之间。这些异种扩增的草鱼微卫星符合孟德尔遗传规律。测序证明草鱼中的微卫星核心重复序列部分与鲤中的原始核心序列相似 ,也有一些变化。随后用这 6个多态微卫星座位研究了来自长江水系的四个草鱼群体的遗传结构 ,结果显示每个群体的平均等位基因数在 3 8与 4 8之间 ,平均观测杂合度 (Ho)在0 4 0 0 0与 0 5 74 1之间 ,平均期望杂合度 (HE)在 0 4 7

麦麸—黄粉虫—鳝鱼食物链的物流与能流分析

对食物链麦麸—黄粉虫—鳝鱼的物质流和能量流作了定量分析 ,结果表明 :该食物链经济产品的物质、能量转化效率较高 ,生物量转化效率为 2 .9% ,能量转化效率为 2 .8% ,N、P转化效率分别为 7.4 %、5 .3% ,经济、生态效益明显 ,且有利于给鳝鱼投喂药饵。但该食物链劳动效率低 ,不利于鳝鱼规模养殖和长期养殖。

利用mtDNA 16S rRNA序列差异鉴定江西青岚湖的河蚌物种

对从青岚湖采集的 10属 14种河蚌的 19个样本进行了 16SrRNA的序列测定 ,并同GenBank中鄱阳湖流域相同物种河蚌的序列比较 ,分析了基于Kimura 2 parameter模型参数得到的遗传距离 ,并构建了它们的UPGMA树。结果显示 ,所有用于比较的河蚌种间遗传距离变化范围在 0 .0 2 74— 0 .2 2 90 ,平均为 0 .132 5 ,种内遗传距离在0 .0 0 34— 0 .0 0 6 8之间 ,平均为 0 .0 0 4 5 ,种间遗传距离远大于种内距离。表明以 16SrR

椭圆背角无齿蚌对重金属元素的积累作用

检测了滇池水饲养 1a的椭圆背角无齿蚌 (Anodontawoodianaelliptica)体内重金属等元素含量 ,结果显示椭圆背角无齿蚌体内锌含量为 7.0 8× 1 0 2 mg/kg ,铅为 3 5 .6 8mg/kg ,铜为 9.0 4mg/kg ,铁为 4 .74× 1 0 3mg/kg ,砷为 6 2 .0 9mg/kg ,磷为 4 .4 4× 1 0 4mg/kg .与滇池水中锌 0 .0 2 0 5 μg/L ,铅 0 .4 1 2 μg/L ,铜 3 .1 98μg/L相比较 ,表明椭

2,3,7,8-四氯代二苯并二英(TCDD)和苯并芘(B[a]P)对原代培养鲫鱼肝细胞中卵黄蛋白原诱导的影响

通过测定原代培养鲫鱼(Carassius auratus)肝细胞中雌激素受体所介导的卵黄蛋白原(Vtg)生成以及芳香烃受体所介导的CYP1A1基因转录水平的变化, 建立了一种类雌激素体外实验模型. 实验结果表明, Vtg和Vtg mRNA的表达与己烯雌酚(DES)之间均有很好的剂量-效应关系, Vtg和Vtg mRNA均可作为指示类雌激素毒性的生物标志物. TCDD, B[a]P可显著抑制鱼肝细胞中DES诱导的Vtg和Vtg mRNA的表达, 呈明显的抗雌激素效应, 并同时激活了CYP1A1 基因的表达;

湖北江汉平原农田生态系统铜的循环与平衡

对湖北江汉平原农田生态系统 8种种植模式中Cu的输入、输出和平衡进行了分析 .结果表明 ,农田Cu的输出主要是作物收获 ,其输出量占总输出量的 85 .9%～ 95 .1% ,流失和淋溶输出很少 .农田Cu的输入主要是有机肥输入和降雨输入 ,其次是降尘、作物自然归还和灌溉 ,而种子种苗和无机肥输入占很少的比例 .农田Cu的平衡分析表明 ,按照当地施肥习惯 ,菜田和水田Cu盈余较多 ,而旱地 4种种植模式基本平衡 .