896 resultados para striated activator of Rho signalling (STARS)
Resumo:
El propósito de la ponencia es elaborar un panorama sobre la relevancia de la gestión del paisaje dentro del ordenamiento territorial, un tema cuya discusión ha emergido en los últimos años y en base al cual se han desarrollado numerosas normativas y técnicas dentro del contexto europeo y norteamericano. El proceso de globalización ha intensificado las dinámicas homogeneización urbana de dispersión territorial, y especialización funcional. En Europa y EEUU, como respuesta a éstas dinámicas, se han impulsado estrategias de gestión territorial sobre la base del ordenamiento del paisaje. Las acciones emprendidas responden a la instrumentación de políticas, metodologías e intervenciones impregnadas de una concepción de paisaje entendido como atributo de la totalidad del territorio; referido tanto a los espacios singulares y/o destacados como a los cotidianos y degradados. Desde el diagnóstico urbano y territorial comienzan a implementarse instrumentos que profundizan en el conocimiento del territorio desde este enfoque. El establecimiento de acuerdos internacionales dirigidos a impulsar la gestión del paisaje, ha promovido el desarrollo de legislaciones, instrumentos y proyectos que sitúan al paisaje como un componente destacado dentro del ordenamiento territorial y la planificación urbanística, que se establecen dentro de dos líneas claramente definidas: una línea propositiva en la que el paisaje es considerado como reactivador de territorios patrimoniales y una línea normativa, integrada por leyes que intentan guiar la gestión del territorio asociado a la valoración del paisaje. Las experiencias desarrolladas en Europa y en Norteamérica en materia de gestión del paisaje Invitan a pensar en estrategias adecuadas al escenario latinoamericano. Puede verificarse que dichas estrategias presentan cierto nivel de transferencia a otros contextos, dejando en claro que es posible utilizar el concepto de paisaje para dar respuesta a cuestiones de ordenamiento territorial en contextos con menor nivel de desarrollo que el europeo, sin dejar de tener en cuenta que las demandas son diferentes. De esta manera, queda por responder cómo implementar este tipo de proyectos dentro del contexto latinoamericano, resolviendo problemáticas que exceden la escala de los países desarrollados, y donde el paisaje puede constituirse como una herramienta de reconocimiento de la particular identidad local, además de cumplir un significativo rol en el aspecto medioambiental
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El propósito de la ponencia es elaborar un panorama sobre la relevancia de la gestión del paisaje dentro del ordenamiento territorial, un tema cuya discusión ha emergido en los últimos años y en base al cual se han desarrollado numerosas normativas y técnicas dentro del contexto europeo y norteamericano. El proceso de globalización ha intensificado las dinámicas homogeneización urbana de dispersión territorial, y especialización funcional. En Europa y EEUU, como respuesta a éstas dinámicas, se han impulsado estrategias de gestión territorial sobre la base del ordenamiento del paisaje. Las acciones emprendidas responden a la instrumentación de políticas, metodologías e intervenciones impregnadas de una concepción de paisaje entendido como atributo de la totalidad del territorio; referido tanto a los espacios singulares y/o destacados como a los cotidianos y degradados. Desde el diagnóstico urbano y territorial comienzan a implementarse instrumentos que profundizan en el conocimiento del territorio desde este enfoque. El establecimiento de acuerdos internacionales dirigidos a impulsar la gestión del paisaje, ha promovido el desarrollo de legislaciones, instrumentos y proyectos que sitúan al paisaje como un componente destacado dentro del ordenamiento territorial y la planificación urbanística, que se establecen dentro de dos líneas claramente definidas: una línea propositiva en la que el paisaje es considerado como reactivador de territorios patrimoniales y una línea normativa, integrada por leyes que intentan guiar la gestión del territorio asociado a la valoración del paisaje. Las experiencias desarrolladas en Europa y en Norteamérica en materia de gestión del paisaje Invitan a pensar en estrategias adecuadas al escenario latinoamericano. Puede verificarse que dichas estrategias presentan cierto nivel de transferencia a otros contextos, dejando en claro que es posible utilizar el concepto de paisaje para dar respuesta a cuestiones de ordenamiento territorial en contextos con menor nivel de desarrollo que el europeo, sin dejar de tener en cuenta que las demandas son diferentes. De esta manera, queda por responder cómo implementar este tipo de proyectos dentro del contexto latinoamericano, resolviendo problemáticas que exceden la escala de los países desarrollados, y donde el paisaje puede constituirse como una herramienta de reconocimiento de la particular identidad local, además de cumplir un significativo rol en el aspecto medioambiental
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Postestimation processing and formatting of regression estimates for input into document tables are tasks that many of us have to do. However, processing results by hand can be laborious, and is vulnerable to error. There are therefore many benefits to automation of these tasks while at the same time retaining user flexibility in terms of output format. The estout package meets these needs. estout assembles a table of coefficients, "significance stars", summary statistics, standard errors, t/z statistics, p-values, confidence intervals, and other statistics calculated for up to twenty models previously fitted and stored by estimates store. It then writes the table to the Stata log and/or to a text file. The estimates are formatted optionally in several styles: html, LaTeX, or tab-delimited (for input into MS Excel or Word). There are a large number of options regarding which output is formatted and how. This talk will take users through a range of examples, from relatively basic simple applications to complex ones.
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La resistencia de las plantas a los hongos necrótrofos como Plectosphaerella cucumerina es genéticamente compleja y depende de la activación coordinada de distintas rutas de señalización (Llorente et al, 2005; Sanchez-Vallet et al, 2010). Entre éstas se encuentran las mediadas por la proteína G heterotrimérica, un complejo formado por tres subunidades (Gα, Gβ y Gγ) que regula tanto la respuesta de inmunidad a diferentes patógenos como distintos procesos de desarrollo (Temple and Jones, 2007). En esta Tesis hemos demostrado que, en Arabidopsis, el monómero funcional formado por las subunidades Gβ y Gγ1/Gγ2 es el responsable de la regulación de la respuesta de defensa, ya que mutantes nulos en estas subunidades (agb1 y agg1 agg2) presentan una alta susceptibilidad al hongo P. cucumerina. Además, hemos identificado varios aminoácidos (Q102, T188 y R235) de la proteína AGB1 esenciales en la interacción con los efectores correspondientes para la regulación de la respuesta inmune (Jiang et al, enviado). Para determinar las bases moleculares de la resistencia mediada por la proteína G heterotrimérica, llevamos a cabo un análisis transcriptómico comparativo entre los genotipos agb1 y Col-0, el cual reveló que la resistencia mediada por AGB1 no depende de rutas defensivas implicadas en la resistencia a hongos necrotrofos, como las mediadas por el ácido salicílico (SA), etileno (ET), jasmónico (JA) o ácido abscísico (ABA), o la ruta de biosíntesis de metabolitos derivados del triptófano. Este estudio mostró que un número significativo de los genes desregulados en respuesta a P. cucumerina en el genotipo agb1 respecto a las plantas silvestres codificaban proteínas con funciones relacionadas con la pared celular. La evaluación de la composición y estructura de la pared de los mutantes de las subunidades de la proteína G heterotrimérica reveló que los genotipos agb1 y agg1 agg2 presentaban alteraciones similares diferentes de las observadas en plantas silvestres Col-0, como una reducción significativa en el contenido de xilosa en la pared. Estos datos sugieren que la proteína G heterotrimérica puede modular la composición/estructura de la pared celular y contribuir, de esta manera, en la regulación de la respuesta inmune (Delgado- Cerezo et al, 2011). La caracterización del interactoma de la proteína G heterotrimérica corroboró la relevancia funcional que presenta en la regulación de la pared celular, ya que un número significativo de las interacciones identificadas estaban comprendidas por proteínas relacionadas directa o indirectamente con la biogénesis y remodelación de la pared celular (Klopffleisch et al, 2011). El papel en inmunidad de algunos de estos potenciales efectores ha sido validado mediante el análisis de la resistencia a P. cucumerina de los mutantes de pérdida de función correspondientes. Con el objetivo de caracterizar las rutas de señalización mediadas por AGB1 e identificar efectores implicados en esta señalización, llevamos a cabo una búsqueda de mutantes supresores de la susceptibilidad de agb1 a P. cucumerina, identificándose varios mutantes sgb (supressor of Gbeta). En esta Tesis hemos caracterizado en detalle el mutante sgb10, que presenta una activación constitutiva de las rutas de señalización mediadas por SA y JA+ET y suprime el fenotipo de susceptibilidad de agb1. SGB10 y AGB1 forman parte de rutas independientes en la regulación de la respuesta inmune, mientras que interaccionan de forma compleja en el control de determinados procesos de desarrollo. La mutación sgb10 ha sido cartografiada entre los genes At3g55010 y At3g56408, que incluye una región con 160 genes. ABSTRACT Plant resistance to necrotrophic fungi Plectosphaerella cucumerina is genetically complex and depends on the interplay of different signalling pathways (Llorente et al, 2005; Sanchez-Vallet et al, 2010). Among others, the heterotrimeric G protein complex has a relevant role. The G protein that is formed by three subunits (Gα, Gβ and Gγ) is a pleiotropic regulator of immune responses to different types of pathogens and developmental issues (Temple and Jones, 2007). Throughout the Thesis, we have demonstrated that Arabidopsis’ functional monomer formed by the Gβ and Gγ1/Gγ2 subunits is a key regulator of defense response, as null mutants (agb1 and agg1 agg2) are equally hypersusceptible to P. cucumerina infection. In addition we have identified several AGB1 aminoacids (Q102, T188 y R235) essentials to interact with specific effectors during the regulation of immune response (Jiang et al, sent).To determine the molecular basis of heterotrimeric G protein mediated resistance we have performed a microarray analysis with agb1-1 and wild type Col-0 plants before and after P. cucumerina challenge. A deep and exhaustive comparative transcriptomical analysis of these plants revealed that AGB1 mediated resistance does not rely on salicilic acid (SA), ethylene (ET), jasmonates (JA), abscisic acid (ABA) or triptophan derived metabolites biosynthesis. However the analysis revealed that a significant number of cell wall related genes are misregulated in the agb1 mutant after pathogen challenge when compared to wild-type plants. The analysis of cell wall composition and structure showed similar cell wall alterations between agb1 and agg1 agg2 mutants that are different from those of wild-type plants, so far the mutants present a significant reduction in xylose levels. All these results suggest that heterotrimeric G protein may regulate immune response through modifications in the cell wall composition/structure (Delgado-Cerezo et al, 2011). The characterization of Heterotrimeric G protein interactome revealed highly connected interactions between the G-protein core and proteins involved in cell wall composition or structure (Klopffleisch et al, 2011). To test the role in immunity of several effectors identified above, we have performed resistance analysis of corresponding null mutants against P. cucumerina. In order to characterize AGB1 mediated signalling pathway and identify additional effectors involved in AGB1-mediated immune response against P. cucumerina, we have performed a screening to isolate mutants with suppression of agb1 phenotype. One of the mutants, named sgb10, has been characterized during the Thesis. The mutant shows constitutive expression of SA, JA+ET-mediated defense signaling pathways to suppres agb1 hypersusceptibility. SGB10 and AGB1 proteins seem to be part of independent pathways in immunity, however its function during development remains unclear. At present, we have mapped the sgb10 mutation between At3g55010 and At3g56408 genes. This region contains 160 genes.
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Several bradyrhizobial isolates from L. mariae-josephae root nodules [1] contain a type III secretion system (T3SS) within a cluster of about 30 genes. Among those genes, ttsI codes for the transcriptional activator of the system. Mutation of ttsI resulted in the formation of white, non-fixing nodules with the natural legume host, L. mariae-josephae. The T3SS cluster also contains a gene coding for a NopE-like protein. NopE proteins have been demonstrated to be effectors in the Bradyrhizobium-soybean symbiosis [2] and belong to a small group of poorly characterized proteins from plant-associated bacteria that contain one or two autocleavage motifs known as DUF1521 (Schirrmeister et al. 2011). The amino acid sequence of a NopE-like protein in the L. mariae-josephae strain LmjC contains just one autocatalytic motif. This is unlike NopE1 and NopE2 proteins secreted by the T3SS of B. japonicum, that contain two motifs [3]. The autocleavage of LmjC NopE protein was analyzed after expression in E. coli and purification. Two protein fragments of the predicted sizes appeared in the presence of Ca2+, Cu2+, Cd2+, Zn2+ and Mn2+ cations. In contrast, autocleavage did not take place in the presence of Ni2+, Co2+ or Mg2+. Site-directed mutagenesis of the DUF1521 motif in LmjC NopE abolished self-cleavage in vitro. Symbiotic competence of a NopE- mutant with the L. mariae-josephae host was not affected. Possible roles of NopE are discussed.
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En un mundo cada vez más poblado y complejo, el flujo de datos se incrementa a pasos gigantescos y la tecnología avanza en la profundización de temas cada día más concretos y específicos. A la vez, se ha entrado de lleno en la era digital, proporcionando infinitud de posibilidades de conectar campos de la ciencia, de la comunicación y del arte, que antes eran disciplinas independientes. Añadir la capa sonora en el ámbito arquitectónico intenta darle un significado más amplio al hecho de proyectar espacios. El sonido provee conjuntos de información cognitiva, tanto relacionados con los procesos mentales del conocimiento, la percepción, el razonamiento, la memoria, la opinión, como con los sentimientos y emociones. Al percibir el espacio, no somos conscientes del complejo proceso en el que se implican diversos sentidos, siendo el sentido de la audición un importante protagonista. El sonido, aun siendo parte del entorno en el que está inmerso, también afecta a este contexto y forma parte de los datos que adquirimos al leer entornos espaciales. Esta tesis investiga las relaciones en el marco de digitalización actual e implica la introducción de parámetros y datos vivos. Al mismo tiempo, y desde un punto de vista perceptivo, pone énfasis en la manera que el sonido puede ser un factor esencial como generador y conformador de espacios y analiza las distintas acciones sonoras que inciden en el cuerpo humano. El interés de ‘Espacios Sónicos’ se centra en que puede significar un aporte a los conocimientos arquitectónicos formulados hasta ahora únicamente desde fundamentos espaciales estáticos. Si entendemos la materia no sólo como un sólido, sino, como un compuesto de partículas en vibración constante; la arquitectura, que es el arte de componer la materia que nos rodea, también debería ser entendida como la composición de cuerpos vibrantes o cuerpos pulsantes. ABSTRACT In a more populated and complex world, data flow increases by leaps and bounds, and technological progress extends every day into more concrete and specific topics. Today's world is dramatically changing our soundscape. People live in new sound environments, very differently from the ones they used to. From a biological point of view, our ever-changing society is suffering neural mutations due to the irreversible inclusion of the technological layer in our lives. We have fully entered the digital age, providing infinitude of possibilities for connecting fields of science, arts and communication, previously being independent disciplines. Adding the sound layer to the architectural field attempts to give further real meaning to the act of designing spaces. Sound provides arrays of cognitive information: Whether related to mental processes of knowledge, reasoning, memory, opinion, perception, or to affects and emotions. When perceiving space, we’re not aware of the complex process through which we read it involving various senses, being the sense of hearing one important protagonist. Sound, being itself part of the surroundings in which it is immersed, also affects such context, being part of the data we acquire when reading spatial environments. This research investigates the relationship involving the inclusion of real-time data and specific parameters into an experimental sound-scan frame. It also emphasizes how sound can be essential as generator and activator of spaces and analyzes sound actions affecting the body. 'Sonic spaces' focuses in what it means to contribute to architectural knowledge, which is so far formulated only from static space fundamentals. If the matter must be understood not only as solid, but also as a compound of particles in constant vibration, architecture - which is the art of composing the matter that surrounds us - should also be understood as the composition of vibrating and pulsating bodies.
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Recent work has shown that strychnine, the potent and selective antagonist of glycine receptors, is also an antagonist of nicotinic acetylcholine (AcCho) receptors including neuronal homomeric α7 receptors, and that mutating Leu-247 of the α7 nicotinic AcCho receptor-channel domain (L247Tα7; mut1) converts some nicotinic antagonists into agonists. Therefore, a study was made of the effects of strychnine on Xenopus oocytes expressing the chick wild-type α7 or L247Tα7 receptors. In these oocytes, strychnine itself did not elicit appreciable membrane currents but reduced the currents elicited by AcCho in a reversible and dose-dependent manner. In sharp contrast, in oocytes expressing L247Tα7 receptors with additional mutations at Cys-189 and Cys-190, in the extracellular N-terminal domain (L247T/C189–190Sα7; mut2), micromolar concentrations of strychnine elicited inward currents that were reversibly inhibited by the nicotinic receptor blocker α-bungarotoxin. Single-channel recordings showed that strychnine gated mut2-channels with two conductance levels, 56 pS and 42 pS, and with kinetic properties similar to AcCho-activated channels. We conclude that strychnine is a modulator, as well as an activator, of some homomeric nicotinic α7 receptors. After injecting oocytes with mixtures of cDNAs encoding mut1 and mut2 subunits, the expressed hybrid receptors were activated by strychnine, similar to the mut2, and had a high affinity to AcCho like the mut1. A pentameric symmetrical model yields the striking conclusion that two identical α7 subunits may be sufficient to determine the functional properties of α7 receptors.
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The life cycle of angiosperms is punctuated by a dormant phase that separates embryonic and postembryonic development of the sporophyte. In the pickle (pkl) mutant of Arabidopsis, embryonic traits are expressed after germination. The penetrance of the pkl phenotype is strongly enhanced by inhibitors of gibberellin biosynthesis. Map-based cloning of the PKL locus revealed that it encodes a CHD3 protein. CHD3 proteins have been implicated as chromatin-remodeling factors involved in repression of transcription. PKL is necessary for repression of LEC1, a gene implicated as a critical activator of embryo development. We propose that PKL is a component of a gibberellin-modulated developmental switch that functions during germination to prevent reexpression of the embryonic developmental state.
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The rapid modulation of ligand-binding affinity (“activation”) is a central property of the integrin family of cell adhesion receptors. The small GTP-binding protein Ras and its downstream effector kinase Raf-1 suppress integrin activation. In this study we explored the relationship between Ras and the closely related small GTP-binding protein R-Ras in modulating the integrin affinity state. We found that R-Ras does not seem to be a direct activator of integrins in Chinese hamster ovary cells. However, we observed that GTP-bound R-Ras strongly antagonizes the Ras/Raf-initiated integrin suppression pathway. Furthermore, this reversal of the Ras/Raf suppressor pathway does not seem to be via a competition between Ras and R-Ras for common downstream effectors or via an inhibition of Ras/Raf-induced MAP kinase activation. Thus, R-Ras and Ras may act in concert to regulate integrin affinity via the activation of distinct downstream effectors.
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The efficient activation of p90rsk by MAP kinase requires their interaction through a docking site located at the C-terminal end of p90rsk. The MAP kinase p42mpk1 can associate with p90rsk in G2-arrested but not in mature Xenopus oocytes. In contrast, an N-terminally truncated p90rsk mutant named D2 constitutively interacts with p42mpk1. In this report we show that expression of D2 inhibits Xenopus oocyte maturation. The inhibition requires the p42mpk1 docking site. D2 expression uncouples the activation of p42mpk1 and p34cdc2/cyclin B in response to progesterone but does not prevent signaling through p90rsk. Instead, D2 interferes with a p42mpk1-triggered pathway, which regulates the phosphorylation and activation of Plx1, a potential activator of the Cdc25 phosphatase. This new pathway that links the activation of p42mpk1 and Plx1 during oocyte maturation is independent of p34cdc2/cyclin B activity but requires protein synthesis. Using D2, we also provide evidence that the sustained activation of p42mpk1 can trigger nuclear migration in oocytes. Our results indicate that D2 is a useful tool to study MAP kinase function(s) during oocyte maturation. Truncated substrates such as D2, which constitutively interact with MAP kinases, may also be helpful to study signal transduction by MAP kinases in other cellular processes.
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5-lipoxygenase (5-LO) catalyzes the initial steps in the formation of leukotrienes, a group of inflammatory mediators derived from arachidonic acid (AA). Here we describe that activation of p38 mitogen-activated protein kinase in human polymorphonuclear leukocytes and in Mono Mac 6 cells leads to activation of downstream kinases, which can subsequently phosphorylate 5-LO in vitro. Different agents activated the 5-LO kinase activities, including stimuli for cellular leukotriene biosynthesis (A23187, thapsigargin, N-formyl-leucyl-phenylalanine), compounds that up-regulate the capacity for leukotriene biosynthesis (phorbol 12-myristate 13-acetate, tumor necrosis factor α, granulocyte/macrophage colony-stimulating factor), and well known p38 stimuli as sodium arsenite and sorbitol. For all stimuli, 5-LO kinase activation was counteracted by SB203580 (3 μM or less), an inhibitor of p38 kinase. At least two p38-dependent 5-LO kinase activities were found. Based on migration properties in in-gel kinase assays and immunoreactivity, one of these was identified as mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 2 (MAPKAP kinase 2). The other appeared to be MAPKAP kinase 3; however, it could not be excluded that also other p38-dependent kinases contributed. When polymorphonuclear leukocytes were incubated with sodium arsenite (strong activator of 5-LO kinases), platelet-activating factor and exogenous AA, there was a 4-fold increase in 5-LO activity as compared with incubations with only platelet-activating factor and AA. This indicates that 5-LO phosphorylation can be one factor determining cellular 5-LO activity.