EGASP: the human ENCODE Genome Annotation Assessment Project

Background: Non-long terminal repeat (non-LTR) retrotransposons have contributed to shaping the structure and function of genomes. In silico and experimental approaches have been used to identify the non-LTR elements of the urochordate Ciona intestinalis. Knowledge of the types and abundance of non-LTR elements in urochordates is a key step in understanding their contribution to the structure and function of vertebrate genomes. Results: Consensus elements phylogenetically related to the I, LINE1, LINE2, LOA and R2 elements of the 14 eukaryotic non-LTR clades are described from C. intestinalis. The ascidian elements showed conservation of both the reverse transcriptase coding sequence and the overall structural organization seen in each clade. The apurinic/apyrimidinic endonuclease and nucleic-acid-binding domains encoded upstream of the reverse transcriptase, and the RNase H and the restriction enzyme-like endonuclease motifs encoded downstream of the reverse transcriptase were identified in the corresponding Ciona families. Conclusions: The genome of C. intestinalis harbors representatives of at least five clades of non-LTR retrotransposons. The copy number per haploid genome of each element is low, less than 100, far below the values reported for vertebrate counterparts but within the range for protostomes. Genomic and sequence analysis shows that the ascidian non-LTR elements are unmethylated and flanked by genomic segments with a gene density lower than average for the genome. The analysis provides valuable data for understanding the evolution of early chordate genomes and enlarges the view on the distribution of the non-LTR retrotransposons in eukaryotes.

El olvido de los derechos del hombre (G. Agamben, R. Esposito)

La paradoja más lacerante de nuestros días es la creciente distancia entre la Declaración de los Derechos del Hombre de 1948 y su escasa implantación en la realidad cotidiana. Los derechos del hombre sólo son posibles teniendo como horizonte la Humanidad, no los Estados-nación. Los apátridas, los refugiados, los inmigrantes son el escándalo y la denuncia de esa distancia entre "derechos del hombre" y "derechos del ciudadano". Cualquier razón -cultural, política, económica- nos sirve para demonizar al "otro", al que no es como nosotros.

La ontología del espíritu: principio de epistemología de G. de Ockham

El principio radical de toda la filosofía de Ockham no es ni una metafísica del singular, ni una actitud logicista, teologal oescéptica. El Inceptor es la culminación de una tendencia neoplatónica, también central en el Eriúgena: aun para la creatura humanalo "inteligente" es anterior y ontológicamente superior a lo "inteligible" o "sensible".Heredado de Agustín de Hipona, pero transformado en el análisis hasta ser inmediato precedente de la Modernidad o comienzo de ella, el "yo pienso" es el quicio del sistema de Ockman. De la exacta acotación moderna de "espíritu" arranca todo el sistema; a partir de él se justifican incluso los rasgos que más sorprende hallar en un filósofo del siglo XIV: la centralidad de las nociones opuestas "intuición/evidencia", la plena actividad cognoscitiva del espíritu junto a la pasividad del intelecto, la nula causalidad próxima de las cosas sensibles en el conocimiento humano, e! paradigma perfectamente lingüístico del conocer. El nacimiento de una moderna "teoría del conocimiento", se da a partir de la constatación de que el acto más perfecto y paradigmáticode la vida del espíritu es la intuición de los "intellectualia" que radican en él mismo, y no la captación de los externos "sensibilia" aristotélicos.