Base Excision Repair Activities Differ in Human Lung Cancer Cells and Corresponding Normal Controls

Oxidative damage to DNA is thought to play a role in carcinogenesis by causing Mutations, and indeed accumulation of oxidized DNA bases has been observed in samples obtained from tumors but not from surrounding tissue within the same patient. Base excision repair (BER) is the main pathway for the repair of oxidized modifications both in nuclear and mitochondrial, DNA. In order to ascertain whether diminished BER capacity might account for increased levels of oxidative DNA damage in cancer cells, the activities of BER enzymes in three different lung cancer cell lines and their non-cancerous counterparts were measured using oligonucleotide substrates with single DNA lesions to assess specific BER enzymes. The activities of four BER enzymes, OGG1, NTH1, UDG and APE1, were compared in mitochondrial and nuclear extracts. For each specific lesion, the repair activities were similar among the three cell lines used. However, the specific activities and cancer versus control comparison differed significantly between the nuclear and mitochondrial compartments. OGG1 activity, as measured by 8-oxodA incision, was upregulated in cancer cell mitochondria but down-regulated in the nucleus when compared to control cells. Similarly, NTH1 activity was also up-regulated in mitochondrial extracts from cancer cells but did not change significantly in the nucleus. Together, these results support the idea that alterations in BER capacity are associated with carcinogenesis.

The mitochondrial transcription factor A functions in mitochondrial base excision repair

Mitochondrial transcription factor A (TFAM) is an essential component of mitochondrial nucleoids TFAM plays an important role in mitochondrial transcription and replication TFAM has been previously reported to inhibit nucleotide excision repair (NER) in vitro but NER has not yet been detected in mitochondria, whereas base excision repair (BER) has been comprehensively characterized in these organelles The BER proteins are associated with the inner membrane in mitochondria and thus with the mitochondrial nucleoid, where TFAM is also situated However, a function for TFAM in BER has not yet been investigated This study examines the role of TFAM in BER In vitro studies with purified recombinant TFAM indicate that it preferentially binds to DNA containing 8-oxoguanines, but not to abasic sites, uracils, or a gap in the sequence TFAM inhibited the in vitro incision activity of 8-oxoguanine DNA glycosylase (OGG1), uracil-DNA glycosylase (UDG), apurinic endonuclease 1 (APE1), and nucleotide incorporation by DNA polymerase gamma (pol gamma) On the other hand, a DNA binding-defective TFAM mutant, L58A, showed less inhibition of BER in vitro Characterization of TFAM knockdown (KD) cells revealed that these lysates had higher 8oxoG incision activity without changes in alpha OGG1 protein levels TFAM KD cells had mild resistance to menadione and increased damage accumulation in the mtDNA when compared to the control cells In addition, we found that the tumor suppressor p53, which has been shown to interact with and alter the DNA binding activity of TFAM, alleviates TFAM-Induced inhibition of BER proteins Together, the results suggest that TFAM modulates BER in mitochondria by virtue of its DNA binding activity and protein interactions Published by Elsevier B V

Myoglobin-H(2)O(2) catalyzes the oxidation of beta-ketoacids to alpha-dicarbonyls: Mechanism and implications in ketosis

Acetoacetate (AA) and 2-methylacetoacetate (MAA) are accumulated in metabolic disorders such as diabetes and isoleucinemia. Here we examine the mechanism of AA and MAA aerobic oxidation initiated by myoglobin (Mb)/H(2)O(2). We propose a chemiluminescent route involving a dioxetanone intermediate whose thermolysis yields triplet alpha-dicarbonyl species (methylglyoxal and diacetyl). The observed ultraweak chemiluminescence increased linearly on raising the concentration of either Mb (10-500 mu M) or AA (10-100 mM). Oxygen uptake studies revealed that MAA is almost a 100-fold more reactive than AA. EPR spin-trapping studies with MNP/MAA revealed the intermediacy of an alpha-carbon-centered radical and acetyl radical. The latter radical, probably derived from triplet diacetyl, is totally suppressed by sorbate, a well-known quencher of triplet carbonyls. Furthermore, an EPR signal assignable to MNP-AA(center dot) adduct was observed and confirmed by isotope effects. Oxygen consumption and a-dicarbonyl yield were shown to be dependent on AA or MAA concentrations (1-50 mM) and on H(2)O(2) or tert-butOOH added to the Mb-containing reaction mixtures. That ferrylMb is involved in a peroxidase cycle acting on the substrates is suggested by the reaction pH profiles and immunospin-trapping experiments. The generation of radicals and triplet dicarbonyl products by Mb/H(2)O(2)/beta-ketoacids may contribute to the adverse health effects of ketogenic unbalance. (C) 2011 Elsevier Inc. All rights reserved.

Gas-Phase Nucleophilic and Elimination Reactions in Simple Alkyl Nitrates

There has been increasing interest in the gas-phase reactivity of alkyl nitrates because of their well-known applications as explosives and because of then role in atmospheric and in marine processes This manuscript describes an experimental study by FT-ICR techniques of the gas-phase reactions of OH(-) and F(-) with methyl and ethyl Innate For methyl nitrate, the main reaction channel is found to be an elimination process promoted by abstraction of an a proton from the methyl group. Nucleophilic displacement of nitrate anion through an S(N)2 process at the carbon center Is also found to he an important reaction channel with methyl nitrate In ethyl nitrate, Ruination of NO(3)(-) is greatly enhanced and this is attributed to the ease of an E2-type elimination process promoted by proton abstraction at the beta position of the ethyl group. Theoretical calculations at the MP2/6-311+G(3df,2p)//MP2/6-31+G(d) level of theory ale consistent with the relative importance of the reaction channels and suggest that these reactions proceed through a double well potential The calculations also predict that nucleophilic attack by OH(-) at the nitrogen center (Sn2@N) is energetically the rueful ad pathway but experiments with (18)OH(-) showed no evidence for this channel. Single-point calculations reveal a strong preference for approach to the emboli center and may explain the lack of reactivity at the nitrogen center. Calculations were also carried out or NH(2)(-) and SH(-) to establish the reactivity pattern to provide a better understanding of environmentally relevant nitrate esters.

Electrostatic and Hydrophobic Interactions Involved in CNT Biofunctionalization with Short ss-DNA

This work is aimed at studying the adsorption mechanism of short chain 20-mer pyrimidinic homoss-DNA (oligodeoxyribonucleotide, ODN: polyC(20) and polyT(20)) onto CNT by reflectometry. To analyze the experimental data, the effective-medium theory using the Bruggemann approximation represents a Suitable optical model to account for the surface properties (roughness, thickness, and optical constants) and the size of the adsorbate. Systematic information about the involved interactions is obtained by changing the physicochemical properties of the system. Hydrophobic and electrostatic interactions are evaluated by comparing the adsorption oil hydrophobic CNT and oil hydrophilic silica and by Modulating the ionic Strength With and without Mg(2+). The ODN adsorption process oil CNT is driven by hydrophobic interactions only when the electrostatic repulsion is Suppressed. The adsorption mode results in ODN molecules in a side-on orientation with the bases (nonpolar region) toward the surface. This unfavorable orientation is partially reverse by adding Mg(2+). On the other hand, the adsorption oil silica is dominated by the strong repulsive electrostatic interaction that is screened at high ionic strength or mediated by Mg(2+). The cation-mediated process induces the interaction of the phosphate backbone (polar region) with the surface, leaving the bases free for hybridization. Although the general adsorption behavior of the pyrimidine bases is the same, polyC(20) presents higher affinity for the CNT Surface due to its acid-base properties.

Simple Method to Evaluate and to Predict Flash Points of Organic Compounds

Flash points (T(FP)) of organic compounds are calculated from their flash point numbers, N(FP), with the relationship T(FP) = 23.369N(FP)(2/3) + 20.010N(FP)(1/3) + 31.901. In turn, the N(FP) values can be predicted from boiling point numbers (Y(BP)) and functional group counts with the equation N(FP) = 0.974Y(BP) + Sigma(i)n(i)G(i) + 0.095 where G(i) is a functional group-specific contribution to the value of N(FP) and n(i) is the number of such functional groups in the structure. For a data set consisting of 1000 diverse organic compounds, the average absolute deviation between reported and predicted flash points was less than 2.5 K.

Short terms effects of air pollution from biomass burning in mucociliary clearance of Brazilian sugarcane cutters

Nasal mucociliary system is the first line of defense of the upper airways and may be affected acutely by exposure to particulate matter (PM) from biomass burning. Several epidemiologic studies have demonstrated a consistent association between levels of air pollution from biomass burning with increases in hospitalization for respiratory diseases and mortality. To determine the acute effects of exposure to particulate matter from biomass burning in nasal mucociliary transport by saccharin transit time (STT) test, we studied thirty-three non-smokers and twelve light smokers sugarcane cutters in two periods: pre-harvest season and 4 h after harvest at the first day after biomass burning. Lung function, exhaled carbon monoxide (CO), nasal symptoms questionnaire and mucociliary clearance (MC) were assessed. Exhaled CO was increased in smokers compared to non-smokers but did not change significantly after harvest. In contrast, SIT was similar between smokers and non-smokers and decreased significantly after harvest in both groups (p < 0.001). Exposure to PM from biomass burning did not influence nasal symptoms. Our results suggest that acute exposure to particulate matter from sugarcane burned affects mucociliary clearance in smokers and non-smokers workers in the absence of symptoms. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Diagnostics for the Developing World: Microfluidic Paper-Based Analytical Devices

Microfluidic paper-based analytical devices (mu PADs) are a new class of point-of-care diagnostic devices that are inexpensive, easy to use, and designed specifically for use in developing countries. (To listen to a podcast about this feature, please go to the Analytical Chemistry multimedia page at pubs.acs.org/page/ancham/audio/index.html.)

A influência do estilo de liderança na gênese dos dort em uma fábrica de calçados

O estudo teve por objetivo investigar,em uma fábrica de calçados destinados ao mercado de exportação, a influência de fatores psico-organizacionais, em especial o "estilo de liderança" na gênese dos Distúrbios Osteomusculares Relacionados ao Trabalho (DORT). O trabalho buscou, ainda, a identificação das prevalências dos DORT na referida empresa. A amostra foi constituída por 111 funcionários voluntários de ambos os sexos, selecionados de maneira aleatória, restringindo-se aos que tinham tempo mínimo de dois anos de atuação na empresa. Para a realização do estudo foram aplicados questionários com base em ferramenta de investigação de DORT do National Institute for Occupational Safety and Health (NIOSH) adaptada às condições da empresa. Os resultados observados mostraram que o estilo de liderança autocrático é significativo na gênese dos DORT, e que o Odds Ratio é 6,39 vezes maior que os não expostos a esse fator. Verificou-se ainda que a prevalência geral de DORT na empresa é de 35%, atingindo em 94,9% os trabalhadores do sexo feminino. A patologia específica mais encontrada foi a Síndrome do Túnel do Carpa (STe) em 20,5% dos casos. O índice de absenteísmo constatado foi 2,47 vezes maior entre os portadores de DORT. Como conclusão o estudo aponta para a necessidade de tomada de medidas mais adequadas do ponto de vista ergonômico no processo produtivo bem como na capacitação dos chefes, supervisores e gerentes no que conceme às relações interpessoais.

Soft IP para criptografia usando o algoritmo Rijndael e implementação em lógica programável

A criptografia assumiu papel de destaque no cotidiano das pessoas, em virtude da necessidade de segurança em inúmeras transações eletrônicas. Em determinadas áreas, a utilização de hardware dedicado à tarefa de criptografia apresenta vantagens em relação à implementação em software, devido principalmente ao ganho de desempenho. Recentemente, o National Institute of Standards and Technology (NIST) publicou o novo padrão norte-americano de criptografia simétrica, chamado de Advanced Encryption Standard (AES). Após um período de aproximadamente 3 anos, no qual várias alternativas foram analisadas, adotou-se o algoritmo Rijndael. Assim, este trabalho apresenta um Soft IP do padrão AES, codificado em VHDL, visando a implementação em FPGA Altera. Todo o projeto foi construído com funções e bibliotecas genéricas, a fim de permitir a posterior implementação sobre outras tecnologias. Foram geradas duas versões: uma priorizando desempenho e outra priorizando a área ocupada nos componentes. Para cada uma das versões, produziu-se um circuito para encriptar e outro para decriptar. O desempenho alcançado em termos de velocidade de processamento superou todos os outros trabalhos publicados na área, sobre a mesma tecnologia. São apresentados os detalhes de implementação, arquiteturas envolvidas e decisões de projeto, bem como todos os resultados. A dissertação contém ainda conceitos básicos de criptografia e uma descrição do algoritmo Rijndael.

Projeto para a criação do Centro de Memória do Instituto de Matemática Pura e Aplicada: uma história de competência, paixão e perseverança

O Instituto Nacional de Matemática Pura e Aplicada (IMPA) foi o primeiro órgão de pesquisa criado pelo Conselho Nacional de Pesquisas (CNPq), em 1952. Desde seu início o IMPA dedicou-se à pesquisa científica em matemática do mais alto nível e promoveu a formação de novos pesquisadores, promovendo também a difusão e aprimoramento da cultura matemática no país. Mais recentemente, passou a dedicar-se também às aplicações da matemática em outras áreas do conhecimento e em setores tecnológicos. Ao longo de mais de cinqüenta anos de trabalho, consolidou-se como o centro de referência em pesquisa matemática e formação de novos pesquisadores no Brasil e na América Latina. Tendo em vista a relevância da instituição para os rumos da pesquisa na área no país, este trabalho de conclusão de curso tem como objetivo estabelecer as diretrizes para a criação do Centro de Memória do Instituto Nacional de Matemática Pura e Aplicada (CEMIMPA), que seria um espaço para produção e re-elaboração de identidade e memória institucional – seguindo uma tendência que se afirma, no Brasil, desde a década de 1970. Discute-se aqui a trajetória do IMPA, os conceitos sobre memória, acervo e identidade para conseguir demarcar as linhas gerais do CEMIMPA e precisar sua importância para a instituição. A criação de um centro de memória como o que propomos, ajudaria a dar visibilidade à história do IMPA, de seus pesquisadores, suas áreas de atuação para além dos limites do cenário da pesquisa matemática, alcançando um público cada vez mais amplo e diverso. Isto poderia influenciar de forma ainda mais vigorosa a formação de jovens em geral, e em particular, de futuros matemáticos. Também poderá incrementar as pesquisas sobre a história da matemática no Brasil e a trajetória dos pesquisadores que a fizerem e dela fazem parte.

Alterações na via intracelular do fosfoinositol : implicações para a fisiopatologia do transtorno bipolar e mecanismo de ação do lítio

Uma possível disfunção nos processos intracelulares de transdução de sinais pode estar implicada na fisiopatologia do transtorno bipolar (Soares and Mallinger 2000). Particularmente, a via intracelular do fosfoinositol (PI) pode ser um sitio de disfunção (Soares et al 1997b). Plaquetas, células periféricas, e amostras de cérebro pós-mortem têm sido utilizados como modelos em estudos prévios com o objetivo de investigar esta hipótese. Os achados que emergem destes estudos são consistentes com a hipótese de uma hiperatividade na via do PI na fase maníaca, que pode estar relacionada com a fase do transtorno. Nesta tese de doutoramento está descrita uma série de estudos preliminares que utilizaram um modelo plaquetário para estudar alterações da via do PI em pacientes com transtorno afetivo bipolar, e também em relação ao mecanismo de ação do carbonato de lítio. Utilizando um método para quantificação de fosfoinositois em membrana plaquetária desenvolvido pelo Professor Alan Mallinger e colaboradores na Universidade de Pittsburgh, o passo inicial envolveu o estudo da reprodutibilidade teste/reteste do mesmo, que foi documentada como estando dentro de limites aceitáveis (Soares et al 1999a). Subseqüentemente, conduzimos um estudo preliminar em pacientes bipolares já tratados com monoterapia com o lítio (Soares et al 1999b). Nestes pacientes, alem de estudarmos os níveis de fosfolipídios de membrana comparados com voluntários normais, também estudamos, em colaboração com o Professor Husseini Manji e colaboradores do National Institute of Mental Health (NIMH), EUA, os níveis de subespécies especificas de PKC em plaquetas de pacientes bipolares (Soares et al 2000a). Nossos achados principais destes estudos colaborativos sugerem uma redução dos níveis plaquetários de PIP2, concomitantemente com redução seletiva de subespécies especificas de PKC. Como um passo adicional, também estudamos os níveis de fosfoinositois de membrana em indivíduos bipolares na fase depressiva, quando não medicados, que estavam significativamente elevados comparados com voluntários normais (Soares et al 2001). Por último, conduzimos um ensaio clinico aberto com carbonato de lítio em doses terapêuticas em um grupo pequeno de pacientes bipolares, que sugeriu uma diminuição significativa dos níveis de PIP2 após o tratamento (Soares et al 2000b). Estes estudos documentam uma disfunção na via do PI em plaquetas de pacientes bipolares, possivelmente modulada pelo tratamento com o lítio, sugerindo o envolvimento desta via na fisiopatologia do transtorno e no mecanismo de ação do lítio. não se sabe se tais alterações plaquetárias refletem o que se passa nesta via em neurônios humanos in vivo, o que constitui uma limitação importante, em potencial, desta abordagem. No entanto, na falta de metodologia de neuroimagem que permita o estudo destas vias no cérebro de pacientes vivos, o modelo periférico plaquetário é de valia para se começar a fazer inferências sobre o funcionamento desta via em pacientes bipolares. Estudos futuros com amostras maiores de pacientes que possam segui-los em fases diferentes do transtorno e tentar determinar correlações entre alterações nesta via produzidas pelo lítio e os efeitos terapêuticos desta medicação serão de grande valia.

Teletrabalho na administração pública federal: uma análise do potencial de implantação na diretoria de marcas do INPI

This dissertation analyses the implementation of the telework project of the Marks Directorate at the Industrial Property National Institute, an agency of the Brazilian federal administration. The analysis focuses on the public servants and their expectations, since the work developed at the Marks Directorate is mainly based on the intellectual capital of its staff. This research first addresses the subject by describing the current technical and sociological context. In which information society and globalization's impact on labour's evolution, and information and communication technology's impact on e-government development are both considered as having important roles. A review of the state of the art on telework research is presented as the basis of the analyses, including a definition of telework and its most relevant aspects. National and international cases of telework, both in the public and private sector, are used as examples in the analyses. The matter of performance control and evaluation is also briefly addressed. In order to assess the viability of the implementation of telework, a review of the activities developed at the Marks Directorate is performed. Emphasis is given to the modernization of examining procedures, without disregarding administrative facts, such as the new career plan and its performance evaluation procedures, that might affect the telework project. The case study is conducted by means of a survey with open and closed questions served in a questionnaire. The analyses of the results leads to the conclusion that telework can be successfully implemented in the Marks Directorate, being also an opportunity to study the adaptation of a working practice originating at the private sector and applied in public administration, taking into account their differences.

Sistema de gestão de unidade judicial

A prestação jurisdicional eficiente e eficaz é uma exigência social e constitucional. Um círculo virtuoso pode ser instaurado pela cobrança social de melhoria dos serviços prestados pelo Poder Judiciário. A resposta a essa exigência é necessária, com a reformulação e revisão de conceitos, estruturas e cultura organizacional. A atuação nessa seara impacta a legitimação do Poder Judiciário, podendo elevá-la tanto mais satisfeitas as expectativas sociais. Os conceitos de gestão e sua implementação devem ser parte das atividades judiciais, desde a alta administração até a gestão da unidade judicial. Há necessidade, portanto, de um sistema de gestão que permeie todas as atividades desenvolvidas. O Tribunal de Justiça do Rio Grande do Sul desde 1995 adotou o Programa Gaúcho de Qualidade e Produtividade (PGQP), através do Plano de Gestão pela Qualidade no Poder Judiciário do Rio Grande do Sul (PGQJ). A recente formulação do Planejamento Estratégico trouxe novas perspectivas, objetivos e desafios. A concreção dos objetivos estratégicos traçados depende do alinhamento das unidades judiciais. Surge aí a importância de um sistema de gestão das unidades judiciais, com elementos e indicadores definidos, permitindo a visualização pela alta administração do andamento da instituição em busca dos objetivos estabelecidos. Alinhada à importância do tema, propõe-se a apresentação dos principais elementos formadores de um sistema de gestão de unidade judicial: direcionamento e alinhamento estratégico; planejamento da microgestão; estrutura organizacional; processos de trabalho; procedimentos operacionais padrão; rotinas cartorárias; gestão de pessoas; treinamento e liderança. O Sistema de Gerenciamento Matricial dos Serviços Judiciários (GMS- JUD), desenvolvido pelo Tribunal de Justiça do Rio Grande do Sul com a consultoria do Instituto Nacional de Desenvolvimento Gerencial (INDG), é apresentado como direcionador de acompanhamento do planejamento traçado pelas unidades judiciais, compondo o sistema de gestão proposto.