907 resultados para Independent contrasts


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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

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The gerbil is a rodent considered a good model for studies of prostatic morphophysiology under different experimental conditions. Studies involving castration and steroidal blockers of aged gerbils showed that the glandular epithelium persists after long-term therapy, preventing the organ atrophy. Thus, the objective of this study was to evaluate the phenotypic characteristics and behavior of prostatic epithelial cells that remained after different periods of hormone ablation in aged gerbils. The identification of elements that influenced the survival of this cell type was performed by morphometric, nuclear phenotypes, ultrastructural and immune histochemical analysis. The most significant responses to treatment, by analyzing morphometric features, were observed during the first three time points (day 1, day 3, and day 7), after which there appeared to be an adjustment of the gland to the hormone ablation. All treatments led to changes in the state of chromatin condensation, DNA methylation pattern and phenotypic changes indicated cell senescence. Additionally, an increase in the basal cells seemed to guarantee self-renewal properties to the epithelium. These data indicate that changes occur at many levels, including gene expression and nuclear architecture in the epithelial cells, when aging and steroidal blockade are associated. These aspects are important when considering castration-resistant prostate cancer, a malignant tumor posing difficult therapeutic intervention. © 2013 Elsevier GmbH. All rights reserved.

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Aims: To investigate the prognostic value of expression levels of the genes STEAP1 and STEAP2, and of STEAP1 protein, in prostate carcinomas (PCa). Methods and results: STEAP1 and STEAP2 transcript levels were evaluated by RT-qPCR in samples from 35 PCa, 24 adjacent non-neoplastic prostate (AdjP) tissues, five cases of benign prostatic hyperplasia (BPH), and two histologically normal prostates (N). STEAP1 expression was assessed by immunohistochemistry in samples from 198 PCa, 76 AdjP, 22 BPH, and two N. The findings were compared with clinical and pathological parameters and patient outcome. STEAP1 and STEAP2 transcript analysis showed no differences between the groups tested. Although not significant, higher STEAP1 mRNA levels were detected in tumours with high Gleason scores and in patients who presented with biochemical recurrence (BCR). STEAP1 overexpression was detected in PCa, and was significantly associated with high-grade Gleason scores, seminal vesicle invasion, BCR, and worse outcome (metastasis or PCa-specific death). STEAP1 overexpression was significantly associated with shorter BCR-free survival. Multivariate analysis revealed that STEAP1 is an independent marker for BCR. Conclusions: These findings provide evidence that STEAP1 is a biomarker of worse prognosis in PCa patients. © 2013 John Wiley & Sons Ltd.

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Pós-graduação em Ciências Biológicas (Biologia Vegetal) - IBRC

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A sistemática da espécie politípica Dendrocolaptes certhia (Aves: Dendrocolaptidae) foi estudada até hoje apenas com base em caracteres morfológicos e até então não se conseguiu delimitar as relações e propor diagnoses consistentes para todos os táxons / populações agrupados na espécie. Caracteres moleculares se tornam assim uma ferramenta potencial para fornecer um grau maior de resolução acerca da história evolutiva desta espécie politípica. Para tal, foi utilizado um banco de dados multilocus composto de dois genes mitocondriais e três loci diferentes de genes nucleares, e a partir de análises com diferentes abordagens (bayesianas, coalescentes e genético populacionais) foi então proposta a primeira filogeografia para esta espécie. Os dados moleculares sugerem alterações na taxonomia de Dendrocolaptes certhia em relação a arranjos propostos onde propomos um novo tratamento taxonômico que reconhece sete espécies diagnosticáveis ao invés de uma única espécie politípica reunindo todos os táxons de D. certhia. Estas sete espécies estão distribuídas de maneira a corroborar com as principais áreas de endemismo na Amazônia, e sua diversificação parece estar fortemente correlacionada com a formação da drenagem moderna da Amazônia durante os períodos do Plio-Pleistoceno.

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A interpretação de anomalias gravimétricas é de grande importância no estudo de feições geológicas que ocorrem na crosta terrestre. Esta interpretação é, no entanto, dificultada pelo fato das anomalias gravimétricas serem resultantes da soma total dos efeitos produzidos por todos os contrastes de densidades de subsuperfície. Desse modo, com o intuito de separar efeitos de feições mais profundas de efeitos de feições mais rasas, bem como a caracterização da geometria desses dois conjuntos de feições, apresentamos um método de separação das componentes regional e residual do campo e a subsequente interpretação de cada componente. A separação regional-residual de dados gravimétricos é efetuada através da aproximação do campo regional por um polinômio ajustado ao campo observado por um método robusto. Este método é iterativo e usa como aproximação inicial a solução obtida através do ajuste polinomial pelo método dos mínimos quadrados. O método empregado minimiza a influência de observações contendo forte contribuição do campo residual no ajuste do campo regional. A componente regional obtida a partir da separação regional-residual é transformada em um mapa de distâncias verticais em relação a um nível de referência. Esta transformação compreende duas etapas. A primeira consiste na obtenção da continuação para baixo da componente regional, que é pressuposta ser causada por uma interface suave separando dois meios homogêneos, representando a interface crosta-manto, cujo contraste de densidade é supostamente conhecido. A segunda consiste na transformação do mapa de continuação para baixo em um mapa de distâncias verticais entre o nível de continuação (tomado como nível de referência) e a interface. Este método apresenta duas dificuldades. A primeira está ligada à instabilidade, havendo portanto a necessidade do emprego de um estabilizador o que acarreta a perda de resolução das feições que se desejam mapear. A segunda, inerente ao método gravimétrico, consiste na impossibilidade da determinação das profundidades absolutas da interface em cada ponto, bastando entretanto o conhecimento da profundidade absoluta em um ponto, através de informação independente, para que todas as outras profundidades absolutas sejam conhecidas. A componente residual obtida a partir da separação regional-residual é transformada em um mapa de contrastes de densidade aparente. Esta transformação consiste no cálculo do contraste de densidade de várias fontes prismáticas através de uma inversão linear pressupondo que as fontes reais estejam das a uma placa horizontal, com contrastes de densidade variando apenas nas direções horizontais. O desempenho do método de separação regional-residual apresentado foi avaliado, através de testes empregando dados sintéticos, fornecendo resultados superiores em relação aos métodos dos mínimos quadrados e da análise espectral. O método de interpretação da componente regional teve seu desempenho avaliado em testes com dados sintéticos onde foram produzidos mapeamentos de interfaces bem próximas das estruturas reais. O limite de resolução das feições que se desejam mapear depende não só do grau do polinômio ajustante, como também da própria limitação inerente ao método gravimétrico. Na interpretação da componente residual é necessário que se postule ou tenha informação a priori sobre a profundidade do topo e espessura da placa onde as fontes estão supostamente confinadas. No entanto, a aplicação do método em dados sintéticos, produziu estimativas razoáveis para os limites laterais das fontes, mesmo na presença de fontes interferentes, e pressupondo-se valores para profundidade do topo e espessura da placa, diferentes dos valores verdadeiros. A ambiguidade envolvendo profundidade do topo, espessura e densidade pode ser visualizada através de gráficos de valores de densidade aparente contra profundidade do topo presumida para a placa para vários valores postulados para a espessura da placa. Estes mesmos gráficos permitem, pelo aspecto das curvas, a elaboração de uma interpretação semi-quantitativa das profundidades das fontes reais. A seqüência dos três métodos desenvolvidos neste trabalho foi aplicada a dados gravimétricos da região norte do Piauí e noroeste do Ceará levando a um modelo de organização crustal que compreende espessamentos e adelgaçamentos crustais associados a um evento compressivo que possibilitou a colocação de rochas densas da base da crosta a profundidades rasas. Este modelo ê compatível com os dados geológicos de superfície. É ainda sugerida a continuidade, por mais 200 km em direção a sudoeste, do Cinturão de Cisalhamento Noroeste do Ceará por sob os sedimentos da Bacia do Parnaíba, com base nas evidências fornecidas pela interpretação da anomalia residual. Embora esta seqüência de métodos tenha sido desenvolvida com vistas ao estudo de feições crustais de porte continental, ela também pode ser aplicada ao estudo de feições mais localizadas como por exemplo no mapeamento do relevo do embasamento de/bacias sedimentares onde os sedimentos são cortados por rochas intrusivas mais densas.

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

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The Virgo detector is a kilometer-scale interferometer for gravitational wave detection located near Pisa (Italy). About 13 months of data were accumulated during four science runs (VSR1, VSR2, VSR3 and VSR4) between May 2007 and September 2011, with increasing sensitivity. In this paper, the method used to reconstruct, in the range 10 Hz-10 kHz, the gravitational wave strain time series h(t) from the detector signals is described. The standard consistency checks of the reconstruction are discussed and used to estimate the systematic uncertainties of the h(t) signal as a function of frequency. Finally, an independent setup, the photon calibrator, is described and used to validate the reconstructed h(t) signal and the associated uncertainties. The systematic uncertainties of the h(t) time series are estimated to be 8% in amplitude. The uncertainty of the phase of h(t) is 50 mrad at 10 Hz with a frequency dependence following a delay of 8 mu s at high frequency. A bias lower than 4 mu s and depending on the sky direction of the GW is also present.

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)