Classification of antimicrobial resistance using artificial neural networks and the relationship of 38 genes associated with the virulence of Escherichia coli isolates from broilers

Avian pathogenic Escherichia coli (APEC) is responsible for various pathological processes in birds and is considered as one of the principal causes of morbidity and mortality, associated with economic losses to the poultry industry. The objective of this study was to demonstrate that it is possible to predict antimicrobial resistance of 256 samples (APEC) using 38 different genes responsible for virulence factors, through a computer program of artificial neural networks (ANNs). A second target was to find the relationship between (PI) pathogenicity index and resistance to 14 antibiotics by statistical analysis. The results showed that the RNAs were able to make the correct classification of the behavior of APEC samples with a range from 74.22 to 98.44%, and make it possible to predict antimicrobial resistance. The statistical analysis to assess the relationship between the pathogenic index (PI) and resistance against 14 antibiotics showed that these variables are independent, i.e. peaks in PI can happen without changing the antimicrobial resistance, or the opposite, changing the antimicrobial resistance without a change in PI.

Metodologias empregadas em estudos de avaliação da atividade alelopática em condições de laboratório: revisão crítica

Nas últimas décadas, tem proliferado a formação de grupos de pesquisa dedicados aos estudos na área de alelopatia, em diferentes partes do mundo. O Brasil não ficou imune a essa tendência; prova disso são os números cada vez maiores de artigos científicos publicados em periódicos nacionais e internacionais. O fato de a alelopatia ser uma ciência relativamente jovem, podendo ser considerada em sua fase juvenil de desenvolvimento, tem propiciado a proliferação de técnicas de estudos diversificadas e muitas vezes carentes de embasamento. Adicionalmente, essa peculiaridade dificulta o entendimento das grandezas expressas e do valor biológico que os resultados apresentados podem significar. Uniformizar os procedimentos é, sem dúvida alguma, ponto de partida quando se pensa na dimensão que a alelopatia pode representar em futuro próximo. Neste trabalho, foram revisados criticamente os protocolos pertinentes aos processos empregados nos bioensaios desenvolvidos para caracterizar as propriedades alelopáticas de extratos brutos e de substâncias químicas. Ao mesmo tempo, os pontos fortes e as limitações de cada procedimento são apresentados.

STUDY OF AUTUMN-WINTER WEEDS IN PORTUGAL AND ITS ECOLOGICAL PREFERENCES

ABSTRACTThe conclusion of the dam project located in Alqueva, in Southern Portugal, has resulted in a significant increase of new irrigated areas, since 2006. This has meant that, in recent years, there have been progressive flora changes in farming systems traditionally implemented in the Alentejo region. The present work has analyzed the weed flora in an early stage of these changes, and the impact of environmental factors on the distribution of natural vegetation under Mediterranean climate conditions in the influence area of Alqueva. In 2007, 105 floristic surveys were carried out in autumn-winter crop plots or other soil use, and 264 species were identified. Families with higher expression were: Asteraceae, Poaceae, and Fabaceae. Only three species have been identified in more than half of farms, Avena sterilis, Phalaris minor and Lolium rigidum and they were part of the 15 species that revealed high and very high infestation degrees. Soil texture and extractable phosphorus have been determined as active ecological factors, according to the method of ecological profiles and Mutual Information. Therefore, these factores were those with the greatest influence on the species distribution. L.rigidum distribution showed to be associated with medium soil texture and A.sterilis distribution also showed to be associated with medium and fine soil texture soils, without showing ecological preference by extractable phosphorus. The distribution of P.minorwas not related to the soil texture but showed preference for soils with medium phosphorus content.

Perfil florístico e estrutura da comunidade arbórea de uma floresta de vale no Parque Nacional da Chapada dos Guimarães, Mato Grosso, Brasil

O propósito do presente trabalho foi descrever a composição florística e a estrutura da comunidade arbórea da floresta de vale da queda d'água Véu de Noiva, Parque Nacional da Chapada dos Guimarães, Mato Grosso, Brasil. A análise florística e fitossociológica procurou avaliar, respectivamente: (a) a influência das principais províncias fitogeográficas brasileiras na composicão florística desta floresta de vale e (b) o papel das espécies mais importantes da comunidade arbórea em termos de sua abundância, grupo ecológico e porte dos indivíduos adultos. Foram amostrados todos os indivíduos arbóreos com circunferência do caule à altura do peito (CAP) ³ 15 cm contidos em 36 parcelas de 30 x10 m. Foram registradas 172 espécies arbóreas pertencentes a 133 genêros e 61 famílias. O perfil florístico apresentou fortes laços tanto com a flora Amazônica como com a Atlântica (sensu lato), evidenciando o caráter transicional desta comunidade arbórea. As principais espécies arbóreas, em termos de valor de importância, se repetem entre as mais abundantes em outros levantamentos realizados na região.

Crescimento inicial de Euterpe edulis Mart. em diferentes regimes de luz

Plantas sob forte sombreamento (2% ou 6% da luz solar direta) apresentaram, em relação às plantas sob maior nível de luz, menor biomassa, menores taxas de crescimento, menor razão raiz/parte aérea, menor massa foliar específica (MFE), menor razão clorofila a/b e maior razão de área foliar (RAF). Com o aumento da irradiância as plantas apresentaram três tipos de comportamento, dependendo da quantidade de luz dada: 1) até cerca de 20% da luz solar direta as plantas apresentaram, com aumento da luz, aumento de biomassa, das taxas de crescimento relativo (TCR) e de assimilação líquida (TAL), maior alocação de biomassa para a raiz, maior número de folhas, maior MFE, maior razão clorofila a/b e menor razão de peso foliar (RPF) e RAF; 2) entre 20% e 70% de luz as plantas não mostraram alterações morfológicas ou fisiológicas com aumento na quantidade de luz, à exceção de um aumento na razão clorofila a/b; e 3) plantas crescendo em luz solar plena apresentaram uma redução do crescimento em massa seca. As plantas transferidas de 4% para 20 ou 30% de luz mostraram respostas similares àquelas das plantas crescidas sempre em mais luz. A densidade de estômatos mostrou uma leve tendência ao aumento em plantas transferidas para maior quantidade de luz. O menor crescimento em níveis mais fortes de sombreamento e o maior crescimento com aumento de irradiância até 20-30% da luz solar total sugere que a espécie possa se beneficiar do aparecimento de clareiras para sua regeneração. O menor desempenho das plantas em condições de luz plena ou forte sombreamento sugere menor capacidade competitiva da espécie em grandes clareiras ou sob dossel fechado.

Um novo conceito de monitoramento e comunicação ambiental: a rede européia para a avaliação da qualidade do ar usando plantas bioindicadoras (EuroBionet)

Apesar de todo o progresso alcançado na redução da emissão de poluentes atmosféricos durante as últimas décadas, a poluição do ar ainda representa um dos principais problemas ambientais nos centros urbanos da Europa. Plantas bioindicadoras têm um papel cada vez maior no controle da qualidade do ar, já que seu uso comprova e demonstra os efeitos negativos da poluição em seres vivos de uma maneira facilmente inteligível, inclusive para leigos. Em uma rede de municípios, o projeto pan-europeu EuroBionet utiliza plantas bioindicadoras para a avaliação de possíveis efeitos da poluição aérea. Através de um conceito de comunicação específico, os resultados científicos do projeto são traduzidos e divulgados de uma forma que chama a atenção do público em geral e que sensibiliza a população urbana. Desta forma, pretende-se induzir a uma mudança no comportamento e aumentar a aceitação de medidas corretivas. No presente trabalho, os objetivos científicos e de comunicação do projeto EuroBionet são apresentados. Os primeiros resultados da exposição de plantas de tabaco em dez cidades européias, durante os meses de agosto e setembro de 2000, demonstram um gradiente de impacto de ozônio do norte para o sul e centro da Europa, com efeitos leves na Escócia e Dinamarca e fortes nas plantas expostas na Itália, França, Áustria e sul da Alemanha.

Fitoplâncton em três lagoas marginais ao Rio Paranapanema e em sua desembocadura no Reservatório de Jurumirim (São Paulo, Brasil) durante um período prolongado de seca

Durante um período de desconexão (de outubro de 1999 a dezembro de 2000) entre lagoas laterais e o Rio Paranapanema, a estrutura da comunidade fitoplanctônica e suas alterações foram examinadas em amostras coletadas trimestralmente nas zonas litoral e pelágica. Um total de 183 táxons de algas foi encontrado, sendo a comunidade predominante constituída por Chlorophyceae e Bacillariophyceae no Rio Paranapanema e em um ambiente lacustre permanentemente isolado, e por Bacillariophyceae e Chlorophyceae em duas outras lagoas. Ao longo do ano, diminuição na riqueza de espécies foi encontrada somente no ambiente lêntico com maior perda de conectividade. Cryptophyceae foi abundante (densidades maior que a densidade média do fitoplâncton) nas três lagoas, zonas e épocas do ano, exceto na zona litoral da lagoa com maior perda de conectividade em novembro de 1999. No Rio Paranapanema, Cryptophyceae predominou em mês chuvoso (fevereiro), sendo os índices de diversidade mais elevados nos demais períodos. A seca severa acarretou redução significativa do volume e área de superfície das lagoas, uma delas, a lagoa isolada, sendo extinta no último período de amostragem. Somente, nesta última, um efeito de concentração na abundância do fitoplâncton foi evidente. O predomínio em densidade de Cryptomonas brasiliensis Castro, C. Bic. & D. Bic., Chroomonas spp. e Chlamydomonas spp. nas três lagoas foi atribuído às condições adversas para o desenvolvimento das demais algas. A baixa profundidade, a grande quantidade de sedimentos suspensos na água após episódios de ventos fortes e, em conseqüência, a extinção acentuada da luz, foram fatores limitantes para as algas não adaptadas a essas condições, a despeito das concentrações favoráveis de nutrientes. No Rio Paranapanema, as alterações temporais na estrutura da comunidade fitoplanctônica parecem estar associadas a flutuações de velocidade e fluxo de água bem como ao nível hidrológico.

Dinâmica do componente arbóreo de uma mata de galeria inundável (Brasília, Distrito Federal) em um período de oito anos

(Dinâmica do componente arbóreo de uma mata de galeria inundável (Brasília, Distrito Federal) em um período de oito anos). As matas de galeria são importantes na manutenção dos recursos hídricos e da biodiversidade do Planalto Central, mas estão submetidas a fortes impactos antrópicos. Aquelas que ocorrem em solos mal drenados são pouquíssimo estudadas, com consequências negativas sobre sua conservação. Este trabalho objetivou avaliar a dinâmica florística e estrutural de um trecho de mata de galeria inundável na Fazenda Sucupira (15°54'22" S; 48°00'34" W), Brasília, Distrito Federal, em um período de oito anos (2000 a 2008). Nas duas medições realizadas, em 40 parcelas (0,8 ha) de 20 × 10 m, foram amostrados todos os indivíduos arbóreos com DAP ³ 3,0 cm. A primeira medição registrou 3.048 indivíduos, distribuídos em 50 espécies e 41 gêneros (32 famílias). Na segunda medição foram encontrados 2.728 indivíduos, pertencentes a 59 espécies e 48 gêneros (36 famílias). Em 2008 verificou-se diminuição de 320 indivíduos, mas acréscimo de 9 espécies, 7 gêneros e 4 famílias. O período monitorado revelou altas taxas de mortalidade (4,25% ano-1) e recrutamento (3,67% ano-1), mudanças consideráveis na importância de muitas espécies, sem alterações significativas na diversidade: H' = 2,84 nats indivíduo-1, J' = 0,73 em 2000; H' = 3,02 nats indivíduo-1, J' = 0,74 em 2008. Esses ambientes diferenciados parecem ser muito dinâmicos em sua florística, sem que a estrutura comunitária e a diversidade sejam afetadas. Mais estudos de dinâmica, por períodos mais longos, ainda são necessários para que se possa compreender o ambiente florestal inundável do Brasil Central com mais segurança, gerando informações que subsidiem ações prementes de conservação.

Texto e contextos da fé: o discurso mediado de Edir Macedo

A partir do livro Os mistérios da fé, de autoria da principal liderança da Igreja Universal do Reino de Deus, Edir Macedo, procuro refletir sobre a noção de fé e sobre as características do discurso do autor. Considero que, a partir do texto de Macedo, é possível falar sobre estratégias discursivas reproduzidas no interior da denominação, assim como caracterizar as investidas proselististas que se realizam a partir delas. Ao examinar a tradução que Macedo faz sobre a noção de fé nessa publicação, destaco o emprego das idéias de "fé natural" e "fé sobrenatural", sublinhando continuidades e descontinuidades entre mundo secularizado e universo religioso dentro da proposta do autor.

Sera from chronic chagasic patients depress cardiac electrogenesis and conduction

We report results obtained with sera from 58 chronic chagasic patients that were evaluated for effects on heart rate and atrioventricular (AV) conduction in isolated rabbit hearts and screened for the presence of muscarinic and beta-adrenergic activity. We show that sera from 26 patients decreased heart rate, while 10 increased it and 22 had no effect. Additionally, sera from 20 of the 58 patients blocked AV conduction. Muscarinic activation seems to be involved in both effects, but is not the only mechanism, since atropine did not antagonize the decrease in heart rate in 23% of sera or AV block in 40%. Sera from patients with complex arrhythmias were significantly more effective in depressing both heart rate and AV conduction. Sera that induce increases in heart rate seem to operate exclusively through beta-adrenergic activation. Two of these sera, evaluated with respect to intercellular communication in primary cultures of embryonic cardiomyocytes were able to block gap junction conductance evaluated by a dye injection technique after 24-h exposure. The mechanisms underlying this uncoupling effect are currently being investigated.

Fingerprinting of cell lines by directed amplification of minisatellite-region DNA (DAMD)

The development of in vitro propagation of cells has been an extraordinary technical advance for several biological studies. The correct identification of the cell line used, however, is crucial, as a mistaken identity or the presence of another contaminating cell may lead to invalid and/or erroneous conclusions. We report here the application of a DNA fingerprinting procedure (directed amplification of minisatellite-region DNA), developed by Heath et al. [Nucleic Acids Research (1993) 21: 5782-5785], to the characterization of cell lines. Genomic DNA of cells in culture was extracted and amplified by PCR in the presence of VNTR core sequences, and the amplicons were separated by agarose gel electrophoresis. After image capture with a digital camera, the banding profiles obtained were analyzed using a software (AnaGel) specially developed for the storage and analysis of electrophoretic fingerprints. The fingerprints are useful for construction of a data base for identification of cell lines by comparison to reference profiles as well as comparison of similar lines from different sources and periodic follow-up of cells in culture.

Gender differences in vascular expression of endothelin and ET A/ET B receptors, but not in calcium handling mechanisms, in deoxycorticosterone acetate-salt hypertension

We determined if the increased vascular responsiveness to endothelin-1 (ET-1) observed in male, but not in female, DOCA-salt rats is associated with differential vascular mRNA expression of ET-1 and/or ET A/ET B receptors or with functional differences in Ca2+ handling mechanisms by vascular myocytes. Uninephrectomized male and female Wistar rats received DOCA and drinking water containing NaCl/KCl. Control rats received vehicle and tap water. Blood pressure and contractile responses of endothelium-denuded aortic rings to agents which induce Ca2+ influx and/or its release from internal stores were measured using standard procedures. Expression of mRNA for ET-1 and ET A/ET B receptors was evaluated by RT-PCR after isolation of total cell RNA from both aorta and mesenteric arteries. Systolic blood pressure was higher in male than in female DOCA rats. Contractions induced by Bay K8644 (which activates Ca2+ influx through voltage-operated L-type channels), and by caffeine, serotonin or ET-1 in Ca2+-free buffer (which reflect Ca2+ release from internal stores) were significantly increased in aortas from male and female DOCA-salt compared to control aortas. DOCA-salt treatment of male, but not female, rats statistically increased vascular mRNA expression of ET-1 and ET B receptors, but decreased the expression of ET A receptors. Molecular up-regulation of vascular ET B receptors, rather than differential changes in smooth muscle Ca2+ handling mechanisms, seems to account for the increased vascular reactivity to ET-1/ET B receptor agonists and higher blood pressure levels observed in male DOCA-salt rats.

Effects of estrogen on the vascular system

The cardiovascular protective actions of estrogen are partially mediated by a direct effect on the vessel wall. Estrogen is active both on vascular smooth muscle and endothelial cells where functionally competent estrogen receptors have been identified. Estrogen administration promotes vasodilation in humans and in experimental animals, in part by stimulating prostacyclin and nitric oxide synthesis, as well as by decreasing the production of vasoconstrictor agents such as cyclooxygenase-derived products, reactive oxygen species, angiotensin II, and endothelin-1. In vitro, estrogen exerts a direct inhibitory effect on smooth muscle by activating potassium efflux and by inhibiting calcium influx. In addition, estrogen inhibits vascular smooth muscle cell proliferation. In vivo, 17ß-estradiol prevents neointimal thickening after balloon injury and also ameliorates the lesions occurring in atherosclerotic conditions. As is the case for other steroids, the effect of estrogen on the vessel wall has a rapid non-genomic component involving membrane phenomena, such as alteration of membrane ionic permeability and activation of membrane-bound enzymes, as well as the classical genomic effect involving estrogen receptor activation and gene expression.

Respiration, oxidative phosphorylation, and uncoupling protein in Candida albicans

The respiration, membrane potential (Dy), and oxidative phosphorylation of mitochondria in situ were determined in spheroplasts obtained from Candida albicans control strain ATCC 90028 by lyticase treatment. Mitochondria in situ were able to phosphorylate externally added ADP (200 µM) in the presence of 0.05% BSA. Mitochondria in situ generated and sustained stable mitochondrial Dy respiring on 5 mM NAD-linked substrates, 5 mM succinate, or 100 µM N,N,N',N'-tetramethyl-p-phenylenediamine dihydrochloride plus 1 mM ascorbate. Rotenone (4 µM) inhibited respiration by 30% and 2 µM antimycin A or myxothiazole and 1 mM cyanide inhibited it by 85%. Cyanide-insensitive respiration was partially blocked by 2 mM benzohydroxamic acid, suggesting the presence of an alternative oxidase. Candida albicans mitochondria in situ presented a carboxyatractyloside-insensitive increase of Dy induced by 5 mM ATP and 0.5% BSA, and Dy decrease induced by 10 µM linoleic acid, both suggesting the existence of an uncoupling protein. The presence of this protein was subsequently confirmed by immunodetection and respiration experiments with isolated mitochondria. In conclusion, Candida albicans ATCC 90028 possesses an alternative electron transfer chain and alternative oxidase, both absent in animal cells. These pathways can be exceptional targets for the design of new chemotherapeutic agents. Blockage of these respiratory pathways together with inhibition of the uncoupling protein (another potential target for drug design) could lead to increased production of reactive oxygen species, dysfunction of Candida mitochondria, and possibly to oxidative cell death.

Anxiety and depression in parents of a Brazilian non-clinical sample of attention-deficit/ hyperactivity disorder (ADHD) students

Higher prevalence rates of anxiety and depression have been reported in parents of children with attention-deficit/hyperactivity disorder (ADHD). The interaction between the burden of ADHD in offspring, a higher prevalence rate of this highly inherited disorder in parents, and comorbidities may explain this finding. Our objective was to investigate levels of ADHD, anxious and depressive symptomatology, and their relationship in parents of ADHD children from a non-clinical sample using a dimensional approach. The sample included 396 students enrolled in all eight grades of a public school who were screened for ADHD using the SNAP IV rating scale. Positive cases were confirmed through a semi-structured interview. Parents of all 26 ADHD students and 31 paired controls were enrolled. A sample of 36 parents of ADHD children (21 mothers, 15 fathers) and 30 parents of control children (18 mothers, 12 fathers) completed the Adult Self Report Scale, State-Trait Anxiety Inventory, and Beck Depression Inventory in order to investigate anxious and depressive symptomatology. Probands' mothers presented a higher level of ADHD symptomatology (with only inattention being a significant cluster). Again, mothers of ADHD children presented higher depressive and anxiety levels; however, these did not correlate with their own ADHD symptomatology. Only trait-anxiety levels were higher in ADHD mothers. Our findings suggest that: 1) anxious and depressive symptoms might be more prevalent in mothers of ADHD students; 2) anxious and depressive symptomatology might be independent of impairment associated with ADHD symptoms; 3) anxious and depressive symptoms are independent of the presence of ADHD.