Triagem de genótipos de hortaliças para resistência a Meloidogyne enterolobii

O objetivo deste trabalho foi identificar genótipos de alface, batata-doce, feijão, tomate e Capsicum resistentes ao nematoide Meloidogyne enterolobii (Syn. M. mayaguensis) e classificá-los quanto ao grau de resistência. Foram avaliados: 10 genótipos de alface, 8 de batata-doce, 10 de feijão e feijão-vagem, 25 de Capsicum e 6 de tomate. Foram calculados o fator de reprodução e o índice de reprodução, e os genótipos foram classificados quanto ao grau de resistência ao nematoide. Foram observados níveis moderados de resistência na cultivar de feijão Aporé e nos acessos de pimenta, BGH-433 e BGH-4285, e de pimentão, PIM-031, PIX-022I-31-07-02 e PIX-022I-31-13-01. Todos os genótipos de tomate são suscetíveis a M. enterolobii. As cultivares de alface Julia, Hortência, Verônica, Grand Rapids e Babá de Verão, e os clones de batata-doce UFLA07-49 e UFLA07-53 são muito resistentes ao nematoide. A resistência a M. enterolobii aparentemente é mediada por genes diferentes dos que conferem resistência a outras espécies e raças de Meloidogyne.

Proteasome-assisted identification of a SSX-2-derived epitope recognized by tumor-reactive CTL infiltrating metastatic melanoma.

The tumor Ag SSX-2 (HOM-MEL-40) was found by serological identification of Ags by recombinant expression cloning and was shown to be a cancer/testis Ag expressed in a wide variety of tumors. It may therefore represent a source of CD8(+) T cell epitopes useful for specific immunotherapy of cancer. To identify potential SSX-2-derived epitopes that can be recognized by CD8(+) T cells, we used an approach that combined: 1) the in vitro proteasomal digestion of precursor peptides overlapping the complete SSX-2 sequence; 2) the prediction of SSX-2-derived peptides with an appropriate HLA-A2 binding score; and 3) the analysis of a tumor-infiltrated lymph node cell population from an HLA-A2(+) melanoma patient with detectable anti-SSX-2 serum Abs. This strategy allowed us to identify peptide SSX-2(41-49) as an HLA-A2-restricted epitope. SSX2(41-49)-specific CD8(+) T cells were readily detectable in the tumor-infiltrated lymph node population by multimer staining, and CTL clones isolated by multimer-guided cell sorting were able to lyse HLA-A2(+) tumor cells expressing SSX-2.

Modelo de Clutter na modelagem de crescimento e produção de eucalipto em sistemas de integração lavoura-pecuária-floresta

O objetivo deste trabalho foi definir a melhor forma de uso do modelo de Clutter para estimar o crescimento e a produção de clones de eucalipto em sistemas de integração lavoura-pecuária-floresta. Foram utilizados dados de sistemas de integração localizados na região noroeste do Estado de Minas Gerais. Os dados foram originados a partir de 180 parcelas permanentes de inventário florestal contínuo, de 30x40 m, contendo três fileiras de dez árvores, com amostragem casual estratificada de intensidade de uma parcela para cada 10 ha. O número médio de árvores por hectare foi de 242. Foram avaliadas plantas com idades de 20 a 95 meses. As melhores relações funcionais foram obtidas a partir do uso do modelo original de Clutter, com base na significância e nos sinais esperados das estimativas de seus parâmetros. O ajuste do modelo de Clutter deve ser feito na sua forma completa.

Functional diversity of bacterial genes associated with aromatic hydrocarbon degradation in anthropogenic dark earth of Amazonia

The objective of this work was to evaluate the catabolic gene diversity for the bacterial degradation of aromatic hydrocarbons in anthropogenic dark earth of Amazonia (ADE) and their biochar (BC). Functional diversity analyses in ADE soils can provide information on how adaptive microorganisms may influence the fertility of soils and what is their involvement in biogeochemical cycles. For this, clone libraries containing the gene encoding for the alpha subunit of aromatic ring-hydroxylating dioxygenases (α-ARHD bacterial gene) were constructed, totaling 800 clones. These libraries were prepared from samples of an ADE soil under two different land uses, located at the Caldeirão Experimental Station - secondary forest (SF) and agriculture (AG) -, and the biochar (SF_BC and AG_BC, respectively). Heterogeneity estimates indicated greater diversity in BC libraries; and Venn diagrams showed more unique operational protein clusters (OPC) in the SF_BC library than the ADE soil, which indicates that specific metabolic processes may occur in biochar. Phylogenetic analysis showed unidentified dioxygenases in ADE soils. Libraries containing functional gene encoding for the alpha subunit of the aromatic ring-hydroxylating dioxygenases (ARHD) gene from biochar show higher diversity indices than those of ADE under secondary forest and agriculture.

Genetic diversity of cultivated accessions and wild species of rubber tree using EST‑SSR markers

The objective of this work was to evaluate the efficiency of EST‑SSR markers in the assessment of the genetic diversity of rubber tree genotypes (Hevea brasiliensis) and to verify the transferability of these markers for wild species of Hevea. Forty‑five rubber tree accessions from the Instituto Agronômico (Campinas, SP, Brazil) and six wild species were used. Information provided by modified Roger's genetic distance were used to analyze EST‑SSR data. UPGMA clustering divided the samples into two major groups with high genetic differentiation, while the software Structure distributed the 51 clones into eight groups. A parallel could be established between both clustering analyses. The 30 polymorphic EST‑SSRs showed from two to ten alleles and were efficient in amplifying the six wild species. Functional EST‑SSR microsatellites are efficient in evaluating the genetic diversity among rubber tree clones and can be used to translate the genetic differences among cultivars and to fingerprint closely related materials. The accessions from the Instituto Agronômico show high genetic diversity. The EST‑SSR markers, developed from Hevea brasiliensis, show transferability and are able to amplify other species of Hevea.

Genetic similarity in a hybrid population of 'Montenegrina' and 'King' mandarins

The objective of this work was to confirm the hybrids obtained in plants originated from the crossing between the mandarins Citrus deliciosa 'Montenegrina' and C. nobilis 'King', and to estimate the genetic similarity among hybrids, and between each hybrid and its parents. Twenty‑three pairs of microsatellite primers were tested. Fourteen of these pairs showed polymorphic bands between parents. Primers CCSM 129 and CCSME 52 were sufficient to identify the 12 nucellar clones observed in the studied population. Genetic similarity analysis of the population (hybrids and parents) showed 0.56 average similarity. Besides the 12 clones of 'Montenegrina' identified, 25 hybrids were found of which D18, C32, D06, C05 and D09 are the more similar to 'Montenegrina'.

Gene transfer of the Ly-3 chain gene of the mouse CD8 molecular complex: co-transfer with the Ly-2 polypeptide gene results in detectable cell surface expression of the Ly-3 antigenic determinants.

The CD8 molecule is a glycoprotein expressed on a subset of mature T lymphocytes. It has been postulated to be a receptor for class I major histocompatibility complex molecules. In the mouse, CD8 is a heterodimer composed of Ly-2 and Ly-3 chains. We have isolated and analyzed cDNA and cosmid clones corresponding to the Ly-3 subunit. One of the isolated, cosmid clones was subsequently transfected, alone or in combination with the Ly-2 gene, into mouse Ltk- cells. Analysis of the Ly-2,3 molecules expressed at the surface of the double transfectants indicated that they are serologically and biochemically indistinguishable from their normal counterparts expressed on lymphoid cells. Ltk- cells transfected with the Ly-2 gene alone were shown to react with a subset of anti-CD8 monoclonal antibodies whereas Ly-3 transfectants did not stain with any of the anti-Ly-3 antibodies employed in this study. Since at least one of these antibodies (53-5.8) has been previously shown to recognize an epitope which is retained on the Ly-3 subunit after dissociation of the heterodimeric Ly-2,3 complex, these observations suggest that the expression of the Ly-2 polypeptide is required to permit the detectable cell surface expression of the antigenic determinants carried by the Ly-3 subunit.

Proteomic and transcriptomic analysis of human CD8(+) T lymphocytes over-expressing telomerase.

Human T lymphocytes have a finite life span resulting from progressive telomere shortening that occurs at each cell division, eventually leading to chromosomal instability. It has been shown that ectopic expression of the human telomerase reverse transcriptase (hTERT) gene into various human cells results in the extension of their replicative life span, without inducing changes associated with transformation. However, it is still unclear whether cells that over-express telomerase are physiologically and biochemically indistinguishable from normal cells. To address this question, we compared the proteome of young and aged human CD8(+) T lymphocytes with that of T cells transduced with hTERT. Interestingly, we found no global changes in the protein pattern in young T cells, irrespective of telomerase expression. In contrast, several relevant proteins with differential expression patterns were observed in hTERT-transduced T cells with extended life span upon long-term culture. Altogether, our data revealed that T lymphocytes over-expressing telomerase displayed an intermediate protein pattern, sharing a similar protein expression not only with young T cells, but also with aged T cells. Finally, the results obtained from this global proteomic approach are in agreement with the overall gene transcription profiling performed on the same T-cell derived clones.

Investigation of classical epidemiological links between patients harbouring identical, non-predominant meticillin-resistant Staphylococcus aureus genotypes and lessons for epidemiological tracking.

According to molecular epidemiology theory, two isolates belong to the same chain of transmission if they are similar according to a highly discriminatory molecular typing method. This has been demonstrated in outbreaks, but is rarely studied in endemic situations. Person-to-person transmission cannot be established when isolates of meticillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) belong to endemically predominant genotypes. By contrast, isolates of infrequent genotypes might be more suitable for epidemiological tracking. The objective of the present study was to determine, in newly identified patients harbouring non-predominant MRSA genotypes, whether putative epidemiological links inferred from molecular typing could replace classical epidemiology in the context of a regional surveillance programme. MRSA genotypes were defined using double-locus sequence typing (DLST) combining clfB and spa genes. A total of 1,268 non-repetitive MRSA isolates recovered between 2005 and 2006 in Western Switzerland were typed: 897 isolates (71%) belonged to four predominant genotypes, 231 (18%) to 55 non-predominant genotypes, and 140 (11%) were unique. Obvious epidemiological links were found in only 106/231 (46%) patients carrying isolates with non-predominant genotypes suggesting that molecular surveillance identified twice as many clusters as those that may have been suspected with classical epidemiological links. However, not all of these molecular clusters represented person-to-person transmission. Thus, molecular typing cannot replace classical epidemiology but is complementary. A prospective surveillance of MRSA genotypes could help to target epidemiological tracking in order to recognise new risk factors in hospital and community settings, or emergence of new epidemic clones.

Antigenicity and immunogenicity of Melan-A/MART-1 derived peptides as targets for tumor reactive CTL in human melanoma.

Some cancer patients mount spontaneous T- and B-cell responses against their tumor cells. Autologous tumor reactive CD8 cytolytic T lymphocyte (CTL) and CD4 T-cell clones as well as antibodies from these patients have been used for the identification of genes encoding the target antigens. This knowledge opened the way for new approaches to the immunotherapy of cancer. In this review, we describe the characterization of the structure-function properties of the melanocyte/melanoma tumor antigen Melan-A/MART-1, the assessment of the T-cell repertoire available against this antigen in healthy individuals, and the analysis of naturally acquired and/or vaccine-induced CTL responses to this antigen in patients with metastatic melanoma.

Porta-enxertos para a produção de mudas de cajueiro

O objetivo deste trabalho foi avaliar clones de cajueiro como porta-enxertos para quatro genótipos-copa. Foram avaliados como porta-enxertos os clones CCP 06, CCP 09, CCP 76, CCP 1001, Embrapa 50, Embrapa 51, BRS 189, BRS 226, BRS 253, BRS 265, BRS 274 e BRS 275 e, como copas, os clones CCP 76, BRS 189, BRS 226 e BRS 274. Aos 60 dias após a semeadura, os porta-enxertos foram avaliados quanto às características biométricas e quanto às taxas de germinação e de aptidão à enxertia. Aos 80 dias após a enxertia, foram avaliadas as taxas de sucesso da enxertia, a aptidão para o plantio e as características biométricas das mudas. Houve correlação negativa entre massa de semente e taxas de germinação e de aptidão à enxertia. BRS 226, BRS 253 e BRS 274 apresentaram taxas insatisfatórias de germinação e de aptidão à enxertia. As maiores taxas de plantas aptas ao plantio, para a copa CCP 76, ocorreram nos porta-enxertos CCP 06, CCP 76 e CCP 1001; para BRS 189, destacou-se o CCP 06; para BRS 226, destacaram-se CCP 06, Embrapa 50, Embrapa 51, BRS 189 e BRS 265; e, para BRS 274, os porta-enxertos CCP 06, CCP 76, CCP 1001, Embrapa 50, Embrapa 51 e BRS 189.

Correlações do índice de área do cladódio com características morfogênicas e produtivas da palma forrageira

O objetivo deste trabalho foi avaliar as correlações do índice de área do cladódio com características morfogênicas e produtivas da palma forrageira (Nopalea sp. e Opuntia sp.). Foram avaliados três clones de palma forrageira, em condições de sequeiro: IPA Sertânia, Miúda e Orelha de Elefante Mexicana. Dados morfológicos dos cladódios e da planta, índice de área do cladódio e biomassa acumulada foram obtidos na ocasião da colheita. A relação entre os dados coletados foi avaliada por meio da análise de trilha, após a aplicação da matriz de correlação de Pearson e do teste de multicolinearidade. Foram observadas maiores correlações das características morfogênicas com o rendimento da cultura do que com o índice de área do cladódio, com R2 entre 0,5930 e 0,9502. As variáveis altura x largura e número total de cladódios foram as que melhor explicaram a variação do índice de área do cladódio. O número total de cladódios, o índice de área do cladódio e a morfologia dos cladódios de quarta ordem são as variáveis que melhor explicam a variabilidade do rendimento dos clones de palma forrageira avaliados em ambiente semiárido.

Início da tuberização, duração do ciclo vegetativo e tolerância ao calor em genótipos de batata

Resumo: O objetivo deste trabalho foi avaliar a relação do tempo para o início da tuberização e da duração do ciclo vegetativo com a tolerância ao calor em batata. Grupos de clones com diferentes tempos para o início de tuberização e durações do ciclo vegetativo foram definidos e avaliados em dois ambientes, e seus índices morfofisiológicos foram estimados em condições de estresse de calor. A amplitude para o início da tuberização foi de 31,8 dias e para a duração do ciclo vegetativo de 30,3 dias. Os grupos de clones formados apresentaram os seguintes parâmetros: tuberização precoce e ciclo vegetativo curto, tuberização precoce e ciclo longo (PL), tuberização tardia e ciclo curto e tuberização tardia e ciclo longo. Em condições de estresse de calor, a produção de tubérculos graúdos do grupo PL apresentou média superior à dos demais grupos. Seis clones (IRF 10-24, IRF 7-61, IRF 2-71, IRF 2-14, IRF 6-104 e IRF 10-44) e três testemunhas ('Markies', CBM 16-16 e CBM 9-10) foram considerados tolerantes ao estresse de calor (média diária de 21,2ºC) e responderam favoravelmente ao ambiente com temperaturas amenas (média diária de 19,0ºC). A partição de matéria seca para os tubérculos foi mais rápida nos clones do grupo PL. Os clones de tuberização precoce e ciclo vegetativo longo apresentaram maior tolerância ao calor, com maior produção de tubérculos do que os demais grupos.

Número de repetições, de plantas por parcela e de avaliações para testes clonais de eucalipto

Resumo:O objetivo deste trabalho foi determinar o número de repetições, de plantas por parcela e de medições necessário para avaliação de caracteres de crescimento em testes clonais de eucalipto (Eucalyptus spp.). Foram avaliados dados de altura, diâmetro à altura do peito e volume de madeira, em três testes clonais, realizados em delineamento de blocos ao acaso, com 30 (testes 1 e 2) e 10 clones (teste 3), com seis repetições de seis (teste 1) e de 10 (testes 2 e 3) plantas. As avaliações foram realizadas dos 14 aos 74 meses de idade. Foram estimados os coeficientes de repetibilidade e de determinação, bem como os efeitos do acréscimo na frequência das medições sobre a eficiência seletiva. O volume de madeira é a característica com maior variabilidade na parcela e menor repetibilidade; portanto, exige maior número de plantas para que se obtenha elevada exatidão na estimativa do valor real do indivíduo. Em testes clonais de híbridos de Eucalyptus grandisxE. urophylla, recomenda-se o uso de três repetições, com seis plantas por parcela, e de três avaliações, em idades superiores a 2 anos, para que se alcance acurácia seletiva em torno de 90%.

CLONAGEM DO JAMBEIRO-ROSA (Syzygium malacensis) POR ESTAQUIA DE RAMOS ENFOLHADOS

O jambeiro-rosa é uma fruteira exótica que representa uma alternativa aos fruticultores, devido às características organolépticas de seus frutos. Em virtude da segregação genética e ausência de sementes em vários clones, procurou-se, neste trabalho, estudar a propagação vegetativa, utilizando-se de estacas com folhas e a influência do tratamento com AIB. O trabalho foi realizado na Área experimental de fruticultura da Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias -- UNESP, Câmpus de Jaboticabal, São Paulo, no período de outubro de 1998 a março de 1999, tendo como objetivo avaliar a capacidade de enraizamento de estacas com folhas apicais e subapicais de jambeiro-rosa com a utilização de diferentes concentrações de ácido indolbutírico (AIB). O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado, em um esquema fatorial 2 x 4 (2 tipos de estacas e 4 concentrações de AIB), com 4 repetições e 10 estacas por parcela, num total de 320 estacas. As concentrações de AIB utilizadas foram: 0; 100; 200 e 400 mg.L-1, e as estacas foram colocadas em imersão lenta por 14 horas, no escuro. Foram avaliados os percentuais de sobrevivência das estacas e enraizamento das estacas, número médio de raízes e brotos por estaca, e comprimento médio dos brotos. Observou-se que o jambeiro-rosa pode ser propagado por estacas com folhas apicais sem a utilização de AIB.