Evolutionary simulations to detect functional lineage-specific genes.

MOTIVATION: Supporting the functionality of recent duplicate gene copies is usually difficult, owing to high sequence similarity between duplicate counterparts and shallow phylogenies, which hamper both the statistical and experimental inference. RESULTS: We developed an integrated evolutionary approach to identify functional duplicate gene copies and other lineage-specific genes. By repeatedly simulating neutral evolution, our method estimates the probability that an ORF was selectively conserved and is therefore likely to represent a bona fide coding region. In parallel, our method tests whether the accumulation of non-synonymous substitutions reveals signatures of selective constraint. We show that our approach has high power to identify functional lineage-specific genes using simulated and real data. For example, a coding region of average length (approximately 1400 bp), restricted to hominoids, can be predicted to be functional in approximately 94-100% of cases. Notably, the method may support functionality for instances where classical selection tests based on the ratio of non-synonymous to synonymous substitutions fail to reveal signatures of selection. Our method is available as an automated tool, ReEVOLVER, which will also be useful to systematically detect functional lineage-specific genes of closely related species on a large scale. AVAILABILITY: ReEVOLVER is available at http://www.unil.ch/cig/page7858.html.

Hemmi [vainqueur] 100 mètres plat et 200 mètres et de l'équipe relais du 400 mètres [Colombes, 20/7/19 championnat de France d'athlétisme] : [photographie de presse] / [Agence Rol]

Référence bibliographique : Rol, 55062

Avaluació de programes formatius de seguretat viària i la reincidència posterior

Els programes formatius d’educació viària són una mesura penal alternativa que s’imposa habitualment als autors dels delictes relacionats amb el trànsit (articles 379 i següents del Codi Penal) per suspendre o substituir la pena de presó. Aquests programes tenen un doble objectiu: aconseguir reduir a curt termini la sinistralitat viària i propiciar un canvi cultural permanent en la conducció. L’objectiu principal d’aquesta recerca va ser identificar les característiques comunes dels infractors de trànsit que fan aquest tipus d’intervenció, conèixer els factors de risc associats a aquests infractors i en quina mesura l’estat psicològic és un factor de risc en l’estil de conducció. També es volia determinar si hi havia diferències entre les entitats que impartien la formació, avaluar l’efectivitat d’aquests programes en l’estil de conducció dels participants en finalitzar el curs i conèixer la reincidència dels seus participants i la seva relació amb l’estat i el canvi de les variables de l’estudi. La mostra va comptar amb 278 participants voluntaris del total de 354 infractors de trànsit que van realitzar un programa formatiu entre l’1 d’abril de 2009 i el 13 de febrer de 2010. D’aquests, un total de 100 participants van autoritzar a ser contactats novament entre el desembre del 2011 i el gener del 2012, per mirar la reincidència. Les fonts d’informació van ser els qüestionaris passats als infractors i el buidatge de la base de dades d’execució penal del Departament de Justícia, amb informació judicial i personal i el seguiment dels usuaris fins a dos anys després d’haver finalitzat el curs formatiu, per saber si havien tornat a reincidir en el mateix delicte.

Evaluación de programas formativos de seguridad vial y su reincidencia posterior

Los programas formativos de educación vial son una medida penal alternativa que se impone habitualmente a los autores de delitos relacionados con el tráfico (artículos 379 y siguientes del Código Penal) para suspender o sustituir la pena de prisión. Estos programas tienen un doble objetivo: conseguir reducir a corto plazo la siniestralidad vial y propiciar un cambio cultural permanente en la conducción. El objetivo principal de esta investigación fue identificar las características comunes de los infractores de tráfico que han de hacer este tipo de intervención y conocer sus factores de riesgo. También se estudiaron las diferencias entre las entidades que imparten los cursos formativos, se evaluó su efectividad y se estudió la reincidencia de los conductores. En total participaron 278 infractores que realizaron un programa formativo entre el 1 de abril de 2009 y el 13 de febrero de 2010 y se les siguió hasta enero de 2012.

[Edward A.] Teschner [américain], gagnant du 100 m [100 yards d'après le Petit Parisien, championnats de l'armée américaine à Colombes, le 1er juin 1919] : [photographie de presse] / [Agence Rol]

Référence bibliographique : Rol, 54192

Arrivée du 100 mètres plat [vainqueur Hemmi, Colombes 20/7/19 championnat de France d'athlétisme : [photographie de presse] / [Agence Rol]

Référence bibliographique : Rol, 55052

Identification of a novel splice-site mutation in the CYP1A2 gene.

AIMS: To identify the molecular basis for a low CYP1A2 metabolic status, as determined by a caffeine phenotyping test, in a 71-year-old, nonsmoking, Caucasian woman who presented with very high clozapine concentrations despite being administered a standard dose of the drug. METHODS: The nucleotide sequence of the 7 exons, exon-intron boundaries and 5'-flanking region of the CYP1A2 gene was analysed by direct sequencing. RESULTS: Only one heterozygous point mutation was identified in the donor splice site of intron 6 (3534G > A) of CYP1A2. This mutation could cause abnormal RNA splicing and therefore lead to a truncated nonfunctional enzyme. No other carrier of this mutation was identified in a population of 100 unrelated healthy Caucasians. CONCLUSIONS: This is the first report of a splice-site mutation affecting the CYP1A2 gene. This polymorphism is a likely explanation for the low CYP1A2 activity associated with high clozapine concentrations in this patient.

Using a single tablet daily to treat latent tuberculosis infection in Brazil: bioequivalence of two different isoniazid formulations (300 mg and 100 mg) demonstrated by a sensitive and rapid high-performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry method in a randomised, crossover study

The recommended treatment for latent tuberculosis (TB) infection in adults is a daily dose of isoniazid (INH) 300 mg for six months. In Brazil, INH was formulated as 100 mg tablets. The treatment duration and the high pill burden compromised patient adherence to the treatment. The Brazilian National Programme for Tuberculosis requested a new 300 mg INH formulation. The aim of our study was to compare the bioavailability of the new INH 300 mg formulation and three 100 mg tablets of the reference formulation. We conducted a randomised, single dose, open label, two-phase crossover bioequivalence study in 28 healthy human volunteers. The 90% confidence interval for the INH maximum concentration of drug observed in plasma and area under the plasma concentration vs. time curve from time zero to the last measurable concentration “time t” was 89.61-115.92 and 94.82-119.44, respectively. The main limitation of our study was that neither adherence nor the safety profile of multiple doses was evaluated. To determine the level of INH in human plasma, we developed and validated a sensitive, simple and rapid high-performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry method. Our results showed that the new formulation was bioequivalent to the 100 mg reference product. This finding supports the use of a single 300 mg tablet daily strategy to treat latent TB. This new formulation may increase patients’ adherence to the treatment and quality of life.