Comparative Study of Protein Unfolding in Aqueous Urea and Dimethyl Sulfoxide Solutions: Surface Polarity, Solvent Specificity, and Sequence of Secondary Structure Melting

Elucidation of possible pathways between folded (native) and unfolded states of a protein is a challenging task, as the intermediates are often hard to detect. Here, we alter the solvent environment in a controlled manner by choosing two different cosolvents of water, urea, and dimethyl sulfoxide (DMSO) and study unfolding of four different proteins to understand the respective sequence of melting by computer simulation methods. We indeed find interesting differences in the sequence of melting of alpha helices and beta sheets in these two solvents. For example, in 8 M urea solution, beta-sheet parts of a protein are found to unfold preferentially, followed by the unfolding of alpha helices. In contrast, 8 M DMSO solution unfolds alpha helices first, followed by the separation of beta sheets for the majority of proteins. Sequence of unfolding events in four different alpha/beta proteins and also in chicken villin head piece (HP-36) both in urea and DMSO solutions demonstrate that the unfolding pathways are determined jointly by relative exposure of polar and nonpolar residues of a protein and the mode of molecular action of a solvent on that protein.

Polymorphism in cocrystals of urea:4,4 `-bipyridine and salicylic acid:4,4 `-bipyridine

Polymorphic cocrystals of urea:4,4'-bipyridine and salicylic acid: 4,4'-bipyridine were obtained by crystallization from different solvents. The urea tape is a rare phenomenon in cocrystals but it is consistent in urea:4,4'-bipyridine polymorphic cocrystals. The polymorph obtained from MeCN has symmetrical N-H...N hydrogen bond distances on either side of the urea tape. However, the other form obtained from MeOH has unsymmetrical N-H...N hydrogen bond lengths. In the polymorphic cocrystals of salicylic acid:4,4'-bipyridine, the basic supramolecular synthon acid-pyridine is the same but the 3D packing is different. Both the polymorphic pairs of cocrystals come under the category of packing polymorphs. All polymorphs were characterized by single-crystal X-ray diffraction (SCXRD), PXRD, DSC, FT-IR and HSM. N-H...N and the acid-pyridine supramolecular synthons were insulated by FT-IR vibrational spectroscopy.

Remarkable isomer-selective gelation of aromatic solvents by a polymorph of a urea-linked bile acid-amino acid conjugate

We report an unusual, isomer-selective gelation of aromatic solvents by a polymorph of a urea-linked bile acid-amino acid conjugate. The gelator showed selectivity towards gelation of 1,2-disubstituted aromatic solvents.

Synthesis and electrocatalytic properties of manganese dioxide for non-enzymatic hydrogen peroxide sensing

Manganese dioxide nanoparticles were synthesized by chemical reduction route at different growth temperatures of 40 degrees C, 80 degrees C, 100 degrees C and were characterized using X-ray Diffraction (XRD), Field emission scanning electron microscopy (FESEM), X-ray photoelectron spectroscopy (XPS), Cyclic Voltammetry (CV) and chronoamperometry (CA) analysis. FESEM results show that on increasing growth temperature the morphology changes from clusters into mixture of rods and flakes. XPS analysis reveals the formation of MnO2. Then these particles were immobilized on Pt electrode. A platinum (Pt) electrode modified with low dimensional MnO2 was investigated as a chronoamperometric (CA) sensor for hydrogen peroxide sensing (H2O2). The sample prepared at 100 degrees C shows good electrocatalytic ability for H2O2 sensing when compared with the samples prepared at 40 degrees C and 80 degrees C. At an operating potential of 0.3 V vs. Ag/AgCl catalytic oxidation of the analyte is measured for chronoamperometric (CA) monitoring. The CA signals are linearly proportional to the concentration of H2O2. It is also found that the morphology of the nanostructure plays a vital role in the detection of H2O2. (C) 2014 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Urea-Functionalized Self-Assembled Molecular Prism for Heterogeneous Catalysis in Water

Reaction of a ditopic urea ``strut'' (L-1) with cis-(tmen)Pd(NO3)(2) yielded a 3+3] self-assembled molecular triangle (T)L-1 = 1,4-di(4-pyridylureido)benzene; tmen = N,N,N',N'-tetrame-thylethane-1,2-diamine]. Replacing cis-(tmen)Pd(NO3)(2) in the above reaction with an equimolar mixture of Pd(NO3)(2) and a clip-type donor (L-2) yielded a template-free multicomponent 3D trigonal prism (P) decorated with multiple urea moieties L-2 = 3,3'-(1H-1,2,4-triazole-3,5-diyl)dipyridine]. This prism (P) was characterized by NMR. spectroscopy, and the structure was confirmed by X-ray crystallography. The P was employed as an effective hydrogen-bond-donor catalyst for Michael reactions of a series of water-insoluble nitro-olefins in an aqueous medium. The P showed better catalytic activity compared to the urea based ligand L-1 and the triangle T. Moreover, the confined nanospace of P in addition to large product outlet windows makes this 3D architecture a perfect molecular vessel to catalyze Diels-Alder reactions of 9-hydroxymethylanthracene with N-substituted maleimide in the aqueous medium. The present results demonstrate new observations on catalytic aqueous Diels-Alder and Michael reactions in heterogeneous fashion employing a discrete 3D architecture of Pd(II). The prism was recycled by simple filtration and reused several tithes without significant loss of activity.

Stimuli-responsive colorimetric and NIR fluorescence combination probe for selective reporting of cellular hydrogen peroxide

Hydrogen peroxide (H2O2) is a key reactive oxygen species and a messenger in cellular signal transduction apart from playing a vital role in many biological processes in living organisms. In this article, we present phenyl boronic acid-functionalized quinone-cyanine (QCy-BA) in combination with AT-rich DNA (exogenous or endogenous cellular DNA), i.e., QCy-BA subset of DNA as a stimuli-responsive NIR fluorescence probe for measuring in vitro levels of H2O2. In response to cellular H2O2 stimulus, QCy-BA converts into QCy-DT, a one-donor-two-acceptor (D2A) system that exhibits switch-on NIR fluorescence upon binding to the DNA minor groove. Fluorescence studies on the combination probe QCy-BA subset of DNA showed strong NIR fluorescence selectively in the presence of H2O2. Furthermore, glucose oxidase (GOx) assay confirmed the high efficiency of the combination probe QCy-BA subset of DNA for probing H2O2 generated in situ through GOx-mediated glucose oxidation. Quantitative analysis through fluorescence plate reader, flow cytometry and live imaging approaches showed that QCy-BA is a promising probe to detect the normal as well as elevated levels of H2O2 produced by EGF/Nox pathways and post-genotoxic stress in both primary and senescent cells. Overall, QCy-BA, in combination with exogenous or cellular DNA, is a versatile probe to quantify and image H2O2 in normal and disease-associated cells.

Efecto de dos niveles de urea en bloques de melaza sobre la ganancia de peso en borregos criollos

En el presente estudio se compararon dos niveles de urea (5 y 10%) adicionada a los bloques de melaza, sobre la ganancia de peso en borregos criollos. Un total de 12 borregos fueron asignados aleatoriamente en tres grupos, utilizando un arreglo en Diseño Completamente al Azar. Las raciones experimentales se basaron en una dieta básica de forraje de pasto colonial (Panicum maximun), para los tres grupos, suplementando ad-libitum a los grupos 2 y 3 con bloques de melaza con un 5 y 10% de urea respectivamente. Se encontraron diferencias estadísticas entre tratamientos (P<0.01) para la variable ganancia media diaria de peso. Para los grupos 2 y 3 se observaron consumos de 470 y 375 gramos de bloques de melaza con ganancia diaria de peso de 65 y 32 gramos respectivamente, el grupo 1 observó pérdidas de peso (30 gr/animal/día). El grupo 2 obtuvo ganancias económicas de $ 2.09 dólares por animal durante los 77 días que duró el ensayo en el Centro Experimental "Santa Rosa” (PNP). Se concluye que los niveles de urea (5 y 10%) adicionada a los bloques de melaza constituyen una alternativa alimenticia para rumiantes, que puede ser usada en nuestro país.

Evaluación de la suplementación de tres niveles de miel y urea en novillos de finalización bajo pastoreo

El presente trabajo se realizó en la Finca Sta. Lucía, jurisdicción de Camoapa departamento de Boaco V región, durante los meses de octubre a diciembre del año 1991. Se utilizaron 16 novillos mosaicos con peso promedio inicial de 359. 125 Kg., evaluando en el los la ganancia media diaria (G.M.D.) durante 45 días y utilizando cuatro tratamientos consistentes en melaza con 9%, 3% y 5% de urea para los grupos I, II y III respectivamente, además un grupo control. En cada tratamiento se evaluaron cuatro animales que pastoreaban juntos en la misma parcela cada día y en pastos jaragua (Hyparrhenia ruffa). Los resultados obtenidos nos demuestran que como consecuencia de la adición de la mezcla miel-urea en los tratamientos a suministrarse, éstos obtuvieron mayores ganancias de peso que el grupo control, siendo 0.7389, 0.6056, 0.6333 y 0.4889 Kg/animal/día, para los tratamientos. I, II, III y grupo control respectivamente, lo que estadísticamente presentó diferencias altamente significativas evaluado y analizado mediante un diseño completamente al azar y mediante la prueba de rangos múltiples de Duncan. Económicamente el tratamiento I resultó ser el mejor por presentar menos gastos por kilogramo de aumento, mejor conversión alimenticia y mayores ganancias de peso.

Composición química de la biomasa verde y amonificada con diferentes niveles de urea del pasto Gamba (Andropogon gayanus), cv CIAT-621 en etapa fonológica de pansoneo, Santa Rosa, Sabana Grande, Managua

Se llevó a cabo un estudio con el objetivo de determinar el mejoramiento de la composición química de la biomasa verde y tratada con Urea como proceso de amonificación. El pasto utilizado fue el Gamba (Andropogon gayanus Kunth), cv CIAT- 621 el cual se encontraba en etapa fenológica de pansoneo. El muestreo se realizó durante el mes de noviembre del año 2009 en la Finca Santa Rosa, Universidad Nacional Agraria. Managua, Nicaragua. Los tratamiento consistieron en cuatro niveles de aplicación de Urea; 0, 1, 3 y 5 % en base al forraje verde a tratar, diluido en 0.5 lt de agua, y almacenados en bolsas de polietileno durante 21 días a temperatura ambiente. El diseño utilizado fue un DCA (Diseño completo al Azar) con tres repeticiones. Las variables de estudio para cada tratamiento fueron, porcentajes de; materia seca, proteína cruda, fibra ácido detergente (FAD), fibra neutro detergente (FND), calcio y fósforo. Se realizaron análisis de varianza (ANDEVA) y separaciones de medias, usando Duncan (P<0.05). Para el análisis estadístico las variables codificadas en porcentajes se transformaron, según, 2 arco seno p (Dos veces Arco seno de la raíz cuadrada de la proporción). Se encontró diferencias significativas (P ≤ 0.05) para las variables Proteína Cruda (PC), Fibra Ácido Detergente (FAD), Calcio y Fósforo. La PC varío de 5.24 % a 11.48 % para 0 % y 3 % de Urea respectivamente, mientras la FAD disminuyo de 56.06 % a 43.64 % para los mismos tratamientos. Los minerales evaluados presentaron una tendencia inversa con los tratamientos de Urea, incrementándose el Ca y disminuyendo el Fósforo a medida que aumentaba la dosis de Urea. La Fibra Neutro Detergente aunque no presentó diferencias estadísticas entre los distintos tratamiento fue mejorada (disminución del contenido fibroso) con el tratamiento 3 % de Urea. Se concluye que el tratamiento de 3 % de Urea es el más recomendado para la amonificación de forraje verde en etapa fenologica de pansoneo en Andropogon gayanus Kunth cv CIAT 621. Estos resultados son halagadores ya que con el uso de esta tecnología se evidencia la transformación de materiales maduros de baja o nula calidad en alimentos que provean nutrientes (Proteína – Energía y Minerales) al animal durante la época seca

Composición química de la biomasa verde del pasto Guinea (Panicum maximum, Jack), CV Colonial, con diferentes niveles de inclusión de urea. Finca Santa Rosa, sabana Grande, Managua

Se llevó a cabo un estudio con el objetivo de determinar el mejoramiento de la composición química de la biomasa verde y tratada con Urea como proceso de amonificación. El pasto utilizado fue el Guinea (Panicum maximum, Jacq) CV Colonial el cual se encontraba en etapa de plena maduración (75 días). Durante el mes de septiembre del 2011 se realizó un corte de uniformidad para proceder al muestreo durante el mes de noviembre en la Finca Santa Rosa, Universidad Nacional Agraria. Managua, Nicaragua.Los tratamiento consistieron en cuatro niveles de plicación de Urea; 0, 1, 3 y 5 % en base al forraje verde a tratar, diluido en 0.5 lt de agua, y almacenados en bolsas de polietileno durante 21 días a temperatura ambiente.El diseño utilizado fue un DCA (Diseño completo al Azar) con tres repeticiones. Las variables de estudio para cada tratamiento fueron,porcentajes de; materia seca, proteína cruda, fibra ácido detergente (FAD), fibra neutro detergente (FND) y cenizas. Se realizaron análisis de varianza (ANDEVA) y separaciones de medias, usando Tukey (P<0.05). Para el análisis estadístico las variables codificadas en porcentajes se transformaron, según, 2 arco seno p (Dos veces Arco seno de la raíz cuadrada de la proporción).Se encontró diferencias significativas (P≤ 0.05) para las variables Materia seca (MS), Proteína Cruda (PC)y, Cenizas (CEN), no encontrando diferencias estadísticas ( P > 0.05) para las variables Fibra Neutro Detergente (FND) y Fibra Ácido Detergente FAD).El porcentaje de materia seca vario desde 48.04 % hasta 24.30 % para 0 y 5 % de Urea respectivamente. La PC pasó de 3.36 % para el tratamiento sin Urea a 8.37 % cuando se aplicó 5 % de Urea mientras la CEN aumento de 7.85 % a 8.60 % para 0 y 3 % de urea. La FDN y FAD aunque no presentaron diferencias estadísticas para los tratamientos evaluados, fue mejorado (disminución del contenido fibroso) con el tratamiento 5% de Urea. Se concluye que el tratamiento de 5 % de Urea es el más recomendado para la amonificación de forraje verde del pasto guinea (Panicum maximum, Jacq) CV Colonial. Con estos resultados se confirma que con el uso de esta tecnología se evidencia la transformación de materiales maduros de baja o nula calidad en alimentos que provean nutrientes al animal durante las épocas críticas

Evaluación del efecto de cal y urea en la sobrevivencia de P. solanacearum E.F. Smith raza dos causante del moko bacteriano en musáceas

Con el objetivo de determinar el efecto de cal, urea y la combinación de ambos en la sobrevivencia del moko bacteriano en plantaciones de Musáceas, se desarrolló en la finca TICOMO en el Km 9 carretera Managua-El Crucero en el período de Octubre del 95 a Julio del 96 el presente estudio de investigación, el cual se dividió en dos etapas: una etapa de campo que incluyó metodología para la realización de los tratamientos, formas de muestreo de suelo y período para muestrear. La otra etapa se realizó en Laboratorio y consistió en la realización de pruebas bioquímicas para la identificación de la bacteria, métodos de siembra y conteos de colonias. Dentro del mismo período se realizó una encuesta a los productores del departamento de Rivas. Se realizaron análisis económicos de los tratamientos y se compararon con el producto químico Glifosato. Como resultado final de la Evaluación se obtuvo que la urea reduce en un 93.89% las colonias de bacterias iniciales, en segundo termino la cal disminuyó las colonias de bacterias en un 88.29%, la combinación de ambos tratamientos aminoró en un 86.5% el número de colonias de bacterias y el testigo redujo el 71.86% de la población. En general la Urea P.S el tratamiento más eficaz para bajar las poblaciones de bacterias en menor tiempo comparado con los otros tratamientos; cabe señalar que con sólo el saneamiento en la plantación la bacteria sin ningún tipo de tratamiento puede disminuir sus poblaciones, pero significará esperar mayor tiempo para que la bacteria descienda sus poblaciones y se atrasaría la época de resiembra, quedando a criterio del productor el utilizar o no sólo el saneamiento. Los resultados de las encuestas reflejan que los productores reconocen la enfermedad en sus distinto síntomas, la mayoría sabe como se transmite y como se puede prevenir pero no cómo controlar. Sin la debida Asistencia Técnica y la falta de información acerca de las enfermedades e indicarles la importancia de las medidas fitosanitarias, los productores tendrán siempre los mismos problemas de enfermedades en sus plantaciones

Evaluación de dosis y momentos de aplicaciones de urea cuarenta y seis por ciento de nitrógeno en el sistema tradicional de producción del sorgo (Sorghum bicolor L.) su efecto sobre el crecimiento y rendimiento del cultivo

El presente trabajo se planificó con el propósito de determinar la influencia de diferentes dosis (64.41, 128.82 y 193.23 kg/ha) y momentos de aplicaciones (100% 25 dds; 50% 25 dds; 50% 45 dds y 100 % 45 dds) de urea 46 por ciento del nitrógeno sobre el crecimiento y rendimiento del cultivo del sorgo (Sorghum bicolor L. Moench), variedad Pinolero y análisis económico de los tratamientos en estudio, bajo las condiciones ecológicas de la finca La Concepción, Nagarote, León. El ensayo se estableció en la siembra de Postrera de 1999 (4 de Septiembre al 24 de Diciembre de 1999), utilizándose un diseño de bloques completos al azar con arreglos en parcelas divididas y estableciéndose cuatro repeticiones. Los resultados estadísticos mostraron efecto real de los niveles del Factor A (dosis de urea 46 % del nitrógeno), Factor B (momentos de aplicaciones de urea) y la interacción AxB (tratamientos) para las variables altura de planta en cm, diámetro del tallo en cm y hojas por planta a los 35 y 60 dds. De las variables evaluadas para los componentes del rendimiento, solamente el peso de mil granos resulto ser no significativas al momento de las diferentes dosis y momento de aplicación de la urea. Los resultados del análisis económico de los tratamientos indican que cuando se pasó del tratamiento a2b1 (128.82 kg/ha de urea aplicado 100 por ciento a los 25 dds) al a2b2; (128.82 kg/ha de urea aplicado 50 por ciento a los 25 dds y 5O por ciento a los 45 dds), se obtuvo la más alta rentabilidad económica, con un rendimiento de 3 646 kg de grano por hectárea y una tasa de retomo marginal de 262.21 por ciento.

Et avié una viña rica, de mejor non nos cala” : la representación del palacio de Poro y la viña áurea en el Libro de Alexandre, diálogos intertextuales y funciones literarias

Resumen: Según se narra en el Libro de Alexandre, después de la muerte de Darío III, rey de los persas y opresor de los macedonios, Alejandro comienza su exploración hacia el Oriente profundo, en busca del sátrapa indio, Poro. Al hallar los palacios de este, el macedonio se encuentra con una serie de objetos que podrían integrar un catálogo de maravillas mecánicas y artificiales, entre las que destaca una viña hecha de oro y piedras preciosas que el gobernante oriental posee en los jardines del alcázar (cc. 2126-2131). El trabajo cuyo resumen presento aquí pretende, en primer lugar, develar las funciones intra y extratextuales que posee el episodio, además de –en segunda instancia– defender la idea de la representación de la viña áurea como un motivo recurrente en las descripciones de palacios orientales en la literatura medieval y en obras como la Historia de Proellis, el Roman d’Aeneas y textos que se insertan propiamente en la tradición de libros de viajes, como el Livre des merveilles du monde de Jean de Mandeville.

“Un claror de fuente” : presencia de la lírica española medieval y áurea en la poesía de Ángel Escobar (Cuba, 1957-1997)

Integran este número de la revista ponencias presentadas en Studia Hispanica Medievalia VIII : Actas de las X Jornadas Internacionales de Literatura Española Medieval, 2011, y de Homenaje al Quinto Centenario del Cancionero General de Hernando del Castillo.

Comportamiento agronómico del pasto Cuba CT-115 (Pennisetum purpureum) ante diferentes aplicaciones de Urea 46% en la comarca Cuisalá, Comalapa, Chontales

La producción ganadera tiene como base alimenticia el uso de pastos como el principal insumo. Los productores en su mayoría no disponen de información sobre la calidad y cantidad del alimento suministrado a su ganado. En busca de brindar información sobre el efecto de la fertilización nitrogenada en el pasto Pennisetum purpureum Cuba CT-115, se estableció un experimento en la comarca Cuisalá, Comalapa, Chontales, en el período comprendido de Julio a Diciembre del 2010. Se utilizó un diseño de Bloques Completamente al Azar, los tratamientos evaluados fueron de dosis de kg de nitrógeno ha-1 (0, 100, 200, 300 kg respectivamente). Se realizó un análisis de varianza (Pr<0.05) y se aplicó técnica de separación de medias D.M.S. Las variables evaluadas fueron registradas a los 80 días después del corte de uniformidad, éstas se dividieron en variables de crecimiento, variables productivas y nutricionales. Al aplicar D.M.S a la variable altura de planta, el tratamiento 200 kg presentó el promedio más alto con 190.25 cm, grupo a. El número de yemas encontradas en el mismo tratamiento fue de 9.43 (a). En la producción de MS los tratamientos 200 y 300 kg presentaron los resultados más altos con 109.03 y 104.45 toneladas respectivamente por corte y los porcentajes de proteína encontrados fueron de 7.90 % y 12.33 % para los mismos tratamientos.