Colección ex situ de plantas vivas de especies nativas del orden Zingiberales del Sur del Lago de Maracaibo, Venezuela

The loss of biological diversity in the Southern Part of the Lago de Maracaibo, Venezuela, due to cattle rising, has caused the extinction of 97 % of the original the Zingiberales order for purpose of study and conservation, because of the importance of this subject in the tropical floriculture (cut flowers, foliage and landscaping). The use of the biological diversity and the new native species flora could promote the efficient and sustainable use of the natural resources of the Southern Part of the Lago de Maracaibo. For that reason, it was collected 18 samples among varieties and species which passed the nursery stage, and then they were transplanted in the field after three months, besides, it was accounted the humidity and light conditions they had in their natural ecosystem; as a result plants showed favorable adaptability indicators.

Ex situ sulphate reduction and methane oxidation rates of sediment at the rim of a vesicomyd clam colony in the Japan Deep Sea Trench (dive 956)

Sediment samples were collected from the rim of a large vesicomyid clam colony in the Japan Deep Sea Trench. Immediately after sample recovery onboard, the sediment core was sub-sampled for ex situ rate measurements. Sulfate reduction and anaerobic oxidation of methane were measured ex situ by the whole core injection method with three replicate measurements for each method. We incubated the samples at in situ temperature (1.5°C) for 48 hours with either 14C-methane (dissolved in water, 2.5 kBq) or carrier-free 35S-sulfate (dissolved in water, 50 kBq). Sediment was fixed in 25 ml sodium hydroxide (NaOH) solution (2.5%, w/v) or 20 ml ZnAc solution (20%, w/v) for AOM or SR, respectively. Turnover rates were measured as previously described (Kallmeyer et al., 2004; Treude et al., 2003).

Treatment of phenanthrene and benzene using microbial fuel cells operated continuously for possible in situ and ex situ applications

Bioelectrochemical systems could have potential for bioremediation of contaminants either in situ or ex situ. The treatment of a mixture of phenanthrene and benzene using two different tubular microbial fuel cells (MFCs) designed for either in situ and ex situ applications in aqueous systems was investigated over long operational periods (up to 155 days). For in situ deployments, simultaneous removal of the petroleum hydrocarbons (>90% in term of degradation efficiency) and bromate, used as catholyte, (up to 79%) with concomitant biogenic electricity generation (peak power density up to 6.75 mWm−2) were obtained at a hydraulic retention time (HRT) of 10 days. The tubular MFC could be operated successfully at copiotrophic (100 ppm phenanthrene, 2000 ppm benzene at HRT 30 days) and oligotrophic (phenanthrene and benzene, 50 ppb each, HRT 10 days) substrate conditions suggesting its effectiveness and robustness at extreme substrate concentrations in anoxic environments. In the MFC designed for ex situ deployments, optimum MFC performance was obtained at HRT of 30 h giving COD removal and maximum power output of approximately 77% and 6.75 mWm−2 respectively. The MFC exhibited the ability to resist organic shock loadings and could maintain stable MFC performance. Results of this study suggest the potential use of MFC technology for possible in situ/ex situ hydrocarbon-contaminated groundwater treatment or refinery effluents clean-up, even at extreme contaminant level conditions.

Comparación de las comunidades de aves en dos áreas de conservación ex-situ: El Jardín Botánico-Vivero Santa Elena y Arboretum Alain Meyrat, Managua 2016

El presente trabajo tuvo como objetivo la comparación de la diversidad de aves en dos sitios de la ciudad de Managua: 1. Arboretum Alain Meyrat y 2. Jardín Botánico y Vivero Santa Elena. A la vez, se identificaron las acciones y actividades antropogénicas que ejercen presión en las aves, valorando paralelamente la cultura ambientalista de la población aledaña a cada sitio. En ambos sitios se establecieron dos puntos de conteo de aves, los cuales fueron visitados con una frecuencia de dos días a la semana entre los meses de agosto y diciembre del año 2014 y febrero y abril del año 2015. En los dos sitios se observaron 263 individuos agrupados en 47 especies, 40 géneros, 21 familias y 11 órdenes. Tanto los valores de riqueza de especie como de diversidad calculada por el índice de Shannon-Wiener fueron significativamente mayores en el Arboretum Alain Meyrat comparados con el Jardín Botánico y Vivero Santa Elena. Sin embargo la composición de especies no varió marcadamente entre los dos sitios. A pesar de esto,es posible que las aves hayan preferido el Arboretum porque la composición florística es más diversa. La mayoría de las especies observadas prefieren hábitats abiertos, borde de bosque, sistemas agroforestales y áreas urbanas, exceptuando para algunos mayormente reportados en la literatura en bosques secundarios e interior de bosques como Pachyramphus aglaiae,Trogon melanocephalus y Cholorostilbon canivetii. En su mayoría, las especies pertenecían al gremio alimenticio insectívoro –frugívoro. El 95 %de los pobladores aledaños y estudiantes manifestaron, a través de sus respuestas a encuestas estructuradas, que no se ha promovido ninguna acción de protección de la biodiversidad en sus barrios. Además, 5% de los mismos exteriorizaron que en su momentose habían hecho jornadas de reforestación.

A comparison of in situ vs. ex situ filtration methods on the assessment of dissolved and particulate metals at hydrothermal vents

The objective of this study was to assess the impact of the filtration method (in situ vs. ex situ) on the dissolved/particulate partitioning of 12 elements in hydrothermal samples collected from the Lucky Strike vent field (Mid-Atlantic Ridge; MAR). To do so, dissolved ( <0.45 mu m) and particulate Mg, Li, Mn, U, V, As, Ba, Fe, Zn, Cd, Pb and Cu were measured using different techniques (HR-ICP-MS, ICP-AES and CCSA). Using in situ filtration as a baseline, we showed that ex situ filtration (on-board and on shore after freezing) resulted in an underestimation of the dissolved pool, which was counterbalanced by an overestimation of the particulate pool for almost all the elements studied. We also showed that on-board filtration was acceptable for the assessment of dissolved and particulate Mn, Mg, Li and U for which the measurement bias for the dissolved fraction did not exceed 3%. However, in situ filtration appeared necessary for the accurate assessment of the dissolved and particulate concentrations of V, As, Fe, Zn, Ba, Cd, Pb and Cu. In the case of Fe, on-board filtration underestimated the dissolved pool by up to 96%. Laboratory filtration (after freezing) resulted in a large bias in the dissolved and particulate concentrations, unambiguously discounting this filtration method for deep-sea chemical speciation studies. We discuss our results in light of the precipitation processes that can potentially affect the accuracy of ex situ filtration methods.

Avaliação preliminar da produção de jacareúba (Calophyllum brasiliense cambess.) em plantio ex situ no Amazonas.

Este trabalho objetivou contribuir com a ampliação do conhecimento sobre a espécie jacareúba (Calophyllum brasiliense Cambess.).

Conservação in situ de recursos genéticos animais no Brasil: espécies de pequeno porte - Memória descritiva do 1o. Workshop.

2009

Can gut microbiota analysis be beneficial for ex-situ and in-situ conservation of threatened animal species?

Ex-situ conservation and the in-situ conservation of natural habitats are the tools to conserve biodiversity. Habitats and ecosystems have been becoming altered by human activities and a growing number of species requires form of management to ensure their survival. Conservation queries become more complex and urgent. Developing scientifically based and innovative approaches to ex-situ conservation is necessary. Recent studies underline importance of gut microbiome in animal health with implications for animal conservation and management. Animal and human studies have demonstrated that environmental factors can impact gut microbiome composition. Within this scenario, the present work focused on species belonging to different taxa, reptiles and mammals: Aldabrachelys gigantea, the giant tortoise of the Seychelles islands and Indri indri, the greatest leaving lemur of Madagascar. The Seychelles giant tortoise is vulnerable species with declining population, whereas the indri is a critically endangered species that could reach the extinction within 25 years. Both need research to help them to survive. Tortoises live for very long time and to observe how they can afford the environmental changes is very difficult. Indris, instead, are able to survive only in a small area of the Madagascar forest, with a very strong link between the species’ survival and the environment. The obtained results underline importance of environmental factors, both in-situ and ex-situ, for species conservation. Microbiome could help the organisms to respond on a short timescale and cope with, environmental changes. However, species with long generation time might not be able to adapt to fast changes but bacteria with a short generation time can adapt on a shorter timescale allowing the host to cope with fluctuating environment. Gut microbiome plays an important role in an animal’s health and has the potential to improve the management of individuals under human care for conservation purposes.

Germinação, crescimento e desenvolvimento in vitro de orquídeas (Cattleya spp., Orchidaceae)

As orquídeas no ambiente natural sofrem exploração devido a sua importância ornamental, levando algumas espécies à extinção. O cultivo in vitro é uma forma alternativa para a conservação ex-situ. Procurou-se determinar um meio de cultura eficiente para a germinação in vitro de sementes e o crescimento inicial de plântulas de Cattleya forbesii, bem como para o crescimento de plântulas in vitro de Cattleya harrisoniana. No primeiro caso, sementes foram inoculadas em meio de cultura básico de Murashige & Skoog (MS) = T1 e MS básico acrescido de 2,5 g L-1 de carvão ativado (CA) = T2. No segundo, plântulas com 1 ± 0,2 cm de altura foram submetidas aos tratamentos T1, T2, MS com a metade da concentração original de macro-micronutrientes (T3) e MS com a metade da concentração original de macro-micronutrientes suplementado com 1,25 g L-1 de CA (T4). Verificou-se aos 30 dias em C. forbesii uma porcentagem de germinação de 45% em T1 e 90% em T2. A adição de CA ao meio de cultura trouxe aumento na altura de plântulas de C. forbesii de acordo com análises realizadas aos 180 dias de cultivo. Em relação ao crescimento de C. harrisoniana, aos 240 dias observou-se que todos os parâmetros médios avaliados (altura da parte aérea, massa de matéria fresca total, número de raízes e folhas, comprimento da maior raiz e diâmetro do pseudocaule) foram significativamente maiores em T2. Dessa forma, sugere-se o uso do meio MS acrescido de 2,5 g L-1 de CA (T2), uma vez que é significativamente favorável tanto para a germinação de sementes quanto para o crescimento de ambas as espécies.

Variabilidade genética do umbuzeiro no Semi-Árido brasileiro, por meio de marcadores AFLP

O objetivo deste trabalho foi avaliar a distribuição da variabilidade genética do umbuzeiro (Spondias tuberosa), no Semi-Árido brasileiro, por meio de marcadores AFLP, para subsidiar estratégias de prospecção e conservação da espécie. Foram analisados 68 indivíduos de umbuzeiro de 15 ecorregiões, pelo dendrograma UPGMA e pela dispersão em escala multidimensional (MDS), com o coeficiente de Jaccard de 141 bandas polimórficas de AFLP. A análise da variância molecular foi realizada pela decomposição total entre e dentro das regiões ecogeográficas. O dendrograma apresentou valor cofenético de 0,96, e o gráfico MDS apresentou 0,25 para a falta de ajustamento. A variabilidade genética do umbuzeiro foi estimada em 0,3138, o que indica grande variação entre os grupos de indivíduos. Agrupamentos específicos foram observados em seis regiões ecogeográficas, enquanto nas demais regiões observaram-se pares entre alguns indivíduos, sem formação de agrupamentos específicos por local de amostragem, o que indica que a variabilidade genética do umbuzeironão está uniformemente distribuída no Semi-Árido. Sugerem-se estratégias para o estabelecimento de maior número de áreas para conservação in situ ou amostragens de menor número de indivíduos, em várias unidades de paisagens, para conservação ex situ da variabilidade genética do umbuzeiro.

Potencial germinativo e morfoanatomia foliar de plântulas de pinhão-manso originadas de germoplasma criopreservado

O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial germinativo e caracterizar morfoanatomicamente a estrutura foliar de plântulas de pinhão-manso originadas de germoplasma criopreservado. Inicialmente, as sementes foram avaliadas quanto à dessecação, a cada 24 horas, por até 120 horas. Posteriormente, as sementes foram dessecadas por 0, 24 e 48 horas e avaliadas mensalmente quanto ao potencial germinativo, antes e após armazenamento em nitrogênio líquido por imersão direta e congelamento rápido. Para caracterizar a viabilidade das sementes que não germinaram após o período de avaliação, os embriões zigóticos foram imersos em solução de tetrazólio. A morfoanatomia foliar após criopreservação foi caracterizada por meio de estudos histológicos. As sementes de pinhão-manso toleraram a dessecação a níveis críticos e a criopreservação com umidade em torno de 8%. A dessecação das sementes até valores baixos, associada a períodos prolongados de exposição ao nitrogênio líquido, causa anormalidade de plântulas, danifica as células e os tecidos das folhas, e afeta negativamente a germinação.

Sobrevivência e viabilidade de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em sementes de feijão armazenadas sob condições controladas

O estabelecimento de bancos de sementes para conservação ex situ de germoplasma vegetal é largamente utilizado, mas a contaminação das mesmas por fitopatógenos pode comprometer sua integridade. Este trabalho teve por objetivo monitorar a sobrevivência de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli, em um lote de sementes de feijão (Phaseolus vulgaris) cv. Roxão)submetido a três condições de temperatura, durante 60 meses de armazenamento: -18 e 5 ºC, condições preconizadas para a conservação de material genético vegetal a longo e médio prazo, respectivamente, e à temperatura ambiente (20-30 ºC). A sobrevivência da bactéria foi avaliada pela percentagem de sementes contaminadas e a viabilidade pela manutenção da patogenicidade dos isolados. A população de X. axonopodis pv. phaseoli nas sementes foi quantificada ao final de cinco anos de armazenamento. Os resultados mostraram que a percentagem de sementes contaminadas decresceu de 64 para 36-37% nos primeiros seis meses, para os três tratamentos. A partir de 30 meses observou-se que as sementes conservadas a -18 e 5 ºC apresentaram níveis de contaminação (58 e 72%) que diferiram significativamente das conservadas à temperatura ambiente (20%), e aos 60 meses taxas de 46%, 46% e 8%, respectivamente. A temperatura mais propícia à sobrevivência da bactéria foi 5 ºC em que se encontrou uma população máxima de 1,2 x 10(8) ufc/semente. Constatou-se, igualmente, a manutenção do poder infetivo dos isolados durante todo o armazenamento. Pode-se concluir que as condições ótimas para a conservação de sementes são as mesmas para a manutenção da longevidade de X. axonopodis pv. phaseoli.

Temperatura, luz e substrato para germinação de sementes de Pau-Brasil (Caesalpinia echinata Lam., Leguminosae - Caesalpinioideae)

Programas de preservação de Caesalpinia echinata, espécie considerada em risco de extinção, incluem a conservação ex situ, que poderia ser ainda mais intensificada pelo armazenamento, no longo prazo, de suas sementes. Embora já se tenha desenvolvido tecnologia suficiente para preservar a germinabilidade dessas sementes por até dois anos, ainda são insuficientes as informações acerca das condições adequadas para a germinação, mormente as referentes a temperatura, luz e substrato. Este trabalho visou avaliar os efeitos de temperaturas constantes de 10 a 45 °C em presença ou ausência de luz e o tipo (papel, areia e vermiculita) e umidade do substrato sobre a germinação das sementes de pau-brasil. Concluiu-se que a semeadura deve ser realizada em rolo de papel, umedecido na relação 1:2,5 a 1:3,0 (substrato:água, em massa), e na temperatura de 25 °C, sem necessidade de luz.

Avaliação de dois métodos para condicionamento e coleta de sêmen em quatro espécies do gênero Mazama

O desenvolvimento de técnicas não invasivas para a obtenção de sêmen de cervídeos facilita a criação de bancos genômicos, que são importantes instrumentos para a conservação ex situ e in situ. Este trabalho teve como objetivo criar uma metodologia não-invasiva de coleta de sêmen e comparar duas técnicas de coleta em quatro espécies do gênero Mazama: M. americana, M. gouazoubira, M. nana e M. nemorivaga. Para tanto, foram utilizados seis machos (M) e duas fêmeas (F) da espécie M. americana, 3M e 2F de M. gouazoubira, 1M e 1F de M. nana e 2M e 1F de M. nemorivaga. Para cada técnica testada, foi realizado um período de habituação dos animais ao manejo. Em seguida, duas técnicas de condicionamento e coleta foram avaliadas. Na primeira delas foi utilizada uma fêmea em estro com desvio lateral do pênis para vagina artificial (FEDL), obtendo-se a coleta de 50% dos indivíduos (100% dos machos de M. gouazoubira e 50% dos machos de M. americana), não obtendo ejaculados das demais espécies. Na segunda técnica, utilizando um manequim taxidermizado com urina de fêmea em estro (MUFE) não foi possível a coleta de nenhum ejaculado. Em todas as fases foi observado o comportamento do macho quanto ao tempo de interesse e aproximação, reflexo de "Flehmen", ato de cheirar ou lamber, exposição do pênis, ereção, número de falsas montas, tentativas de cópula e ocorrência de agressividade entre os animais.

Perfil hematológico, bioquímico sérico, proteína C reativa e cortisol de ararajubas (Guaroba guarouba) mantidas em cativeiro

Objetivou-se determinar os valores hematológicos, bioquímicos séricos, proteína C reativa e cortisol de 14 ararajubas (Guaroba guarouba) clinicamente saudáveis mantidas em cativeiro no zoológico do Parque Estadual de Dois Irmãos Recife/PE. Amostras de sangue foram obtidas da veia jugular com volume médio de 0,8ml, fracionando em duas porções, a primeira depositada em tubo MiniCollect®CE contendo EDTA e a outra tubo com gel separador, para a separação do soro sanguíneo. Os indicadores bioquímicos e PCR foram determinados através do analisador ARCHITECT c8000. O cortisol foi analisado no Cobas E411 da Roche. Para a determinação dos números de eritrócitos e leucócitos, foi utilizada a metodologia da contagem em câmara de Neubauer. O hematócrito foi avaliado pelo método do microhematócrito e a hemoglobina pelo método da cianometahemoglobulina. Para a contagem diferencial de leucócitos, foi utilizada a técnica de Shilling. Os índices hematimétricos (VCM, HCM E CHCM) foram determinados com os valores encontrados na série eritrocítica. Os dados foram caracterizados por dispersão de freqüências, utilizando-se as seguintes medidas de tendência central: Média, desvio-padrão, mediana e percentil de 25 e percentil 75. A determinação de alguns parâmetros como ferro, triglicerídeos, PCR e cortisol foram identificados como sendo pioneiramente referenciados nesta espécie de ave. Os dados são apresentados como sendo de referência para a ararajuba (Guaroba guarouba) criada em cativeiro em condições similares de manejo e higidez e ainda pode contribuir para os trabalhos de conservação ex situ desta espécie.