Ecologia de Tropidurus torquatus (Wied, 1820) (Squamata, Tropiduridae) no Costão de Itacoatiara, Parque Estadual da Serra da Tiririca, municípios de Niterói e Maricá, RJ

O lagarto Tropidurus torquatus (Wied, 1820) possui ampla distribuição geográfica e é encontrado em abundância nas áreas onde ocorre, sendo considerada uma espécie apropriada para estudos ecológicos. No presente estudo nós analisamos o período de atividade, o uso do microhabitat, a intensidade de forrageamento, a dieta e a ecologia térmica de uma população de T. torquatus do Costão de Itacoatiara, no Parque Estadual da Serra da Tiririca, situado nos municípios de Niterói e Maricá, RJ. Os dados foram coletados em dois períodos: entre julho de 2004 e janeiro de 2008 para estudo do período de atividade, uso do microhabitat e intensidade de forrageamento, e entre julho e agosto de 2010 para estudo da ecologia térmica e dieta. Todos os indivíduos coletados eram adultos, com comprimento rostro-cloacal médio de 66,2 12,0mm para machos (n = 11) e 64,1 8,0mm para fêmeas (n = 03). O período de atividade de T. torquatus no Costão de Itacoatiara durou de 12 a 14 horas. Teve um padrão unimodal na estação seca, com pico de atividade entre 09:00h e 13:00h, durante as horas mais quentes do dia. Na estação chuvosa o padrão de atividade foi bimodal, com um pico entre 8:00h e 9:00h e outro entre 16:00h e 17:00h, ambos associados aos horários de temperaturas ambientais mais amenas. O período de atividade não diferiu entre as estações, o que pode ser explicado pelo extenso pico de atividade dos lagartos na estação seca. Os microhabitats mais utilizados foram o substrato rochoso do Costão e a bromélia, refletindo a disponibilidade destes na área. A intensidade de forrageamento não diferiu sazonalmente e o tempo médio que os lagartos ficaram parados foi maior do que o tempo médio em deslocamento. A dieta foi onívora e esteve composta por artrópodes, principalmente insetos, e material vegetal, principalmente frutos. Os principais insetos consumidos foram Formicidae, Coleoptera e Hymenoptera não-Formicidae como pequenas vespas e abelhas. Os frutos, as sementes e as flores consumidos pertenciam às cactáceas Rhipsalis cereoides e Coleocephalocereus fluminensis, para as quais T. torquatus pode ser um potencial agente dispersor de sementes na área. Lagartos maiores consumiram itens maiores, mas em menor número, indicando um balanço energético positivo. O consumo de material vegetal variou de acordo com o tamanho dos lagartos, aumentando sua proporção nos indivíduos mais velhos. A temperatura média em atividade de T. torquatus foi de 34,3 2,5C, estando na faixa de temperatura corpórea média encontrada para outras populações e para outros Tropidurus. O substrato foi a fonte de calor ambiental com maior importância relativa para a termorregulação dos lagartos durante a estação seca, explicando cerca de 48% da variação na temperatura corpórea da população. Os lagartos termorregularam de forma passiva, principalmente em relação à temperatura do substrato.

Área de vida do lagarto saxícola Tropidurus semitaeniatus (Squamata: Tropiduridae) em área de Caatinga, Nordeste do Brasil

A área de vida pode ser definida como o espaço físico necessário para um animal desempenhar as atividades essenciais para sua sobrevivência, desenvolvimento e reprodução. O conhecimento sobre área de vida é essencial para a compreensão dos processos que regem o uso do espaço e a organização social em populações animais. Neste estudo, investigamos aspectos das áreas de vida do lagarto saxícola, endêmico da Caatinga, Tropidurus semitaeniatus, avaliando possíveis variações intersexuais, ontogenéticas e sazonais nos tamanhos das áreas de vida, bem como elementos da organização social da espécie. A área de estudo consistiu em uma área típica de Caatinga stricto sensu, localizada no município de Pentecoste - Ceará. Realizamos coletas em dois afloramentos rochosos, nos quais demarcamos pontos de referência a cada cinco metros. Coletamos os lagartos residentes nestes afloramentos, registrando, para cada indivíduo, o sexo e o tamanho rostro-cloacal (mm), e posteriormente, identificando-o com marcação única. Vistoriamos cada afloramento durante 20 dias em cada estação (chuvosa e seca), respectivamente em junho e dezembro de 2011, realizando recapturas visuais e coletando registros de posições espaciais de cada indivíduo. Estimamos as áreas de vida pelo método do Polígono Convexo Mínimo, para os indivíduos recapturados pelo menos seis vezes. Obtivemos 56 áreas de vida, das quais 10 foram de machos, 20 de fêmeas e 26 de jovens. Não existiu relação entre os tamanhos das áreas de vida e os comprimentos rostro-cloacais dos indivíduos. Não houve diferenças sexuais, ontogenéticas ou sazonais nos tamanhos das áreas de vida. Contudo, o espaçamento entre as áreas de vida foi menor durante a estação chuvosa e a maioria das sobreposições entre áreas de vida também ocorreu neste período. Ao todo, registramos 81 sobreposições de áreas de vida, sendo estas mais frequentes entre fêmeas e jovens e menos frequentes entre pares de machos. A proporção da área de vida total sobreposta com outro indivíduo foi maior entre pares de fêmeas e menor entre pares de machos. Os machos estiveram associados em média com 1,5 fêmeas, possuindo de zero a sete áreas de vida de fêmeas sobrepostas com suas áreas de vida. O número de áreas de vida de fêmeas sobrepostas às áreas de vida de machos esteve positivamente associado ao tamanho dos machos. Por outro lado, não houve associação entre o número de áreas de vida de fêmeas sobrepostas às áreas de vida de machos e os tamanhos das áreas de vida dos machos correspondentes. Em suma, à luz do conhecimento acumulado sobre a história natural do organismo de estudo, acreditamos que sua extrema especificidade por ambientes rochosos e a disponibilidade limitada de habitats adequados à ocupação constituem fatores preponderantes na determinação dos padrões singulares de uso do espaço e organização social em T. semitaeniatus.

As comunidades de anfíbios e lagartos dos remanescentes de restingas do estado do Espírito Santo: uma análise da ocorrência e distribuição das espécies

Ecologicamente, comunidades são conjuntos de populações convivendo no mesmo espaço e tempo. A forma como as espécies que compõem estas comunidades, como elas se distribuem e como estão estruturadas, depende de inúmeros fatores, entre eles históricos, biogeográficos e evolutivos. Neste estudo, buscamos compreender como as comunidades de anfíbios anuros e de lagartos estão estruturadas e quais fatores ambientais e de degradação são determinantes nesta estruturação. Amostramos cinco remanescentes de restinga no estado do Espírito Santo, utilizando método de procura ativa em transecções lineares nas diferentes fisionomias vegetais destes ecossistemas. Realizamos amostragens nas estações seca e de chuvas em todas as restingas, e somamos um total de 60 horas de esforço amostral para os anfíbios e 75 horas para os lagartos. Registramos um total de 32 espécies de anfíbios anuros conjuntamente nos cinco remanescentes de restinga, sendo duas destas espécies endêmicas deste ecossistema: Scinax agilis e Melanophryniscus setiba. A restinga do Parque Paulo Cesar Vinha foi o remanescente com a maior riqueza de espécies de anuros, enquanto a restinga da Reserva Biológica de Comboios foi, comparativamente, o remanescente com menor riqueza de espécies. Em termos de composição de espécies, as restingas de Praia das Neves e Paulo Cesar Vinha foram as mais similares, enquanto a restinga de Comboios foi a mais distante na análise de agrupamento. Registramos no conjunto de restingas seis modos reprodutivos para as espécies de anuros, sendo 75% deles relacionados aos ambientes aquáticos. A disponibilidade de locais de desova esteve positivamente relacionada à riqueza de espécies. Todos os mesohábitats das restingas, com exceção das fitofisionomias de halófila-psamófila, foram utilizados pelos indivíduos registrados, entretanto, uma porcentagem considerável dos indivíduos foi encontrada nos alagados. Em relação às comunidades de lagartos, adotamos além dos nossos dados, aqueles disponíveis em Dias e Rocha (2014) e aqueles disponíveis em Winck (2012). Registramos um total de 23 espécies de lagartos nos remanescentes de restinga amostrados nos estados do Rio de Janeiro, Espírito Santo e Bahia. Observamos que as comunidades presentes nos remanescentes estudados possuem considerável diferenciação entre elas. A diversidade beta (β) foi elevada enquanto o grau de aninhamento foi intermediário. Registramos ainda a presença do lagarto exótico invasor Hemidactylus mabouia em ambiente natural nos remanescentes de restinga estudados neste Tese. Encontramos 45 indivíduos, distribuídos em três dos cinco remanescentes amostrados. Registramos ainda ovos de H. mabouia (2 deles eclodidos) em dois dos cinco locais estudados, indicando que o recrutamento de indivíduos está ocorrendo com sucesso nas populações invasoras. A presença de H. mabouia esteve relacionada à restingas com maior frequência de degradação ambiental. Consideramos que os dados obtidos nesta tese, fornecem informações de considerável importância para o entendimento da estrutura das comunidades de anfíbios e lagartos nos ecossistemas de restinga ao longo da costa brasileira

Padrões de assimetria associados à ecologia de cinco espécies de lagartos tropicais Cnemidophorus (Squamata, Teiidae) em áreas de restinga ao longo da costa leste brasileira

O estudo da instabilidade do desenvolvimento (ID) em organismos pode ser útil para identificar os primeiros sinais de estresse ambiental. Alterações na ID também influenciam a aptidão dos organismos. A variação entre a simetria dos lados esquerdo e direito, manifestada como assimetria flutuante (AF), é um indicador da ID. Ao quantificarmos a literatura científica referente aos estudos de assimetria em répteis identificamos as seguintes tendências: perturbações ambientais aumentam a AF nas populações, fêmeas tendem a escolher machos com características sexuais simétricas, a instabilidade térmica durante o desenvolvimento do ovo pode produzir indivíduos com maior assimetria, a ocorrência de lesões é mais frequente em indivíduos assimétricos para um determinado lado e há uma correlação negativa entre a assimetria e o desempenho locomotor. Considerando os nossos critério de busca, não encontramos estudos sobre assimetria em répteis na América do Sul. Neste estudo, utilizamos diferentes caracteres merísticos e métricos bilaterais para identificar a AF em diferentes populações de cinco espécies de lagartos do gênero Cnemidophorus (C. abaetensis, C. lacertoides, C. littoralis, C. nativo, C. ocellifer) em 15 áreas de restinga ao longo da costa leste do Brasil. A AF foi maior em populações de Cnemidophorus com maior densidade, menor em populações de restingas com maior degradação ambiental e a sua relação com a concentração de mercúrio variou dependendo da espécie. Provavelmente os agentes estressores ambientais avaliados atuam com intensidades diferentes. O nível de degradação ambiental e a concentração de mercúrio causariam a deterioração precoce dos indivíduos com maiores valores de AF. Isso resulta em uma relação inversa entre esses estresses e a AF das populações. Indivíduos com vestígios de autotomia caudal tiveram maiores valores de AF, o que pode ser um indicativo de que indivíduos com menor aptidão efetuam mais autotomia caudal do que aqueles com maior aptidão. Lagartos com evidências de autotomia também tiveram maior tamanho corpóreo, provavelmente devido a estes estarem expostos a mais tempo aos riscos de predação. Não encontramos diferenciação entre as espécies na frequência de autotomia caudal sendo esta talvez melhor explicada por fatores ambientais como a intensidade de predação. Os índices de AF para caracteres múltiplos se mostraram mais eficientes do que a AF de caracteres individuais nas comparações entre indivíduos vivendo em populações com diferentes níveis de estresse e entre indivíduos com e sem autotomia caudal

Densidade populacional do lagarto endêmico Cnemidophorus littoralis em três restingas do estado do Rio de Janeiro: implicações na sua conservação

Cnemidophorus littoralis é um lagarto teiídeo ameaçado de extinção, endêmico de restinga e restrito ao estado do Rio de Janeiro, tendo sido encontrado em apenas quatro restingas da região: restinga de Grussaí (limite norte), restinga de Jurubatiba, restinga de Maricá e restinga de Marambaia (limite sul). Devido à sua restrita distribuição, os efeitos da degradação de hábitat e mudanças climáticas são especialmente danosos para os indivíduos dessa espécie, podendo levar a uma extinção local ou até total. A fim de aumentar a gama de informações sobre esta espécie de lagarto, investigamos a sua densidade e o seu tamanho populacional em três áreas de restingas, além de termos registrado as temperaturas às quais estão sujeitos nos diferentes micro-hábitats disponíveis, bem como suas preferências a determinadas estruturas da vegetação, e a situação atual de degradação das restingas, comparando-a com a de anos anteriores. O presente trabalho foi realizado nas restingas de Barra de Maricá (Maricá), Jurubatiba (Macaé) e Grussaí (São João da Barra). Os resultados revelaram uma diferença na estrutura da vegetação entre as três restingas, sendo a de Grussaí a que mais se destaca. Essa restinga é também a que apresenta menor densidade populacional e maior índice de degradação. Por outro lado, a restinga de Jurubatiba foi o local com menor quantidade de distúrbios encontrados, possuindo a maior densidade populacional dentre as três e se caracterizando como a melhor área para manutenção da espécie. O folhiço no bordo de moita foi, no geral, o hábitat mais utilizado pelos lagartos, sendo o período entre 10h00 e 11h00 o que teve maior número de avistamentos. A altura de arbusto demonstrou influenciar negativamente a ocupação dos indivíduos na restinga de Grussaí, enquanto os períodos de observação ao longo do dia influenciaram a detectatibilidade dos indivíduos nas três restingas. As restingas também apresentaram uma temperatura ambiente semelhante ao longo do dia, sendo Maricá a restinga com média mais alta (34,6C), seguida por Grussaí (33,9C) e por último Jurubatiba, com uma média de 33,2C. As temperaturas corpóreas às quais os indivíduos estariam sujeitos nos micro-hábitats disponíveis variaram de 27C (folhiço sobre vegetação) a 42,5C (areia nua), na restinga de Grussaí e de 28C (folhiço no interior de moita) a 32,9C (areia nua) na restinga de Jurubatiba. Uma vez que a estrutura do ambiente influencia na característica termal dos lagartos e, consequentemente, na manutenção das populações, a conservação das restingas e de suas estruturas vegetacionais são indispensáveis para a perpetuação da espécie.

East African Fisheries Research Organization Annual Report 1954/1955

This Report covers the period 1st January, 1954, to 30th June, 1955. Scientific work of the organization carried out during the reporting period included the following: Hydrology, Mollusca, Arthropoda , Tilapia, Haplochromis , The Fishes of Uganda , species of fish occurring in Lake Victoria, Analysis of commercial catches, Experimental fishing, The Relative fecundity of Tilapia species, The breeding behaviour of Tilapia, The rings on Tilapia Scales, The Growth of very young fish, The reproductive cycle of non-cichild fishes, The food of fish, some notes on the food of crocodiles, Varanus Lizards and Otters and List of Publications

A phylogeny of Chinese species in the genus Phrynocephalus (Agamidae) inferred from mitochondrial DNA sequences

We investigated the phylogenetic relationships among most Chinese species of lizards in the genus Phrynocephalus (118 individuals, collected from 56 populations of 14 well-defined species and several unidentified specimens) using four mitochondrial gene fragments (12S rRNA, 16S rRNA, cytochrome b, and ND4-tRNA(LEU)). The partition-homogeneity tests indicated that the combined dataset was homogeneous, and maximum-parsimony (MP), neighbor-joining (NJ), maximum-likelihood (ML) and Bayesian (BI) analyses were performed on this combined dataset (49 haplotypes including outgroups for 2058 bp in total). The maximum-parsimony analysis resulted in 24 equally parsimonious trees, and their strict consensus tree shows that there are two major clades representing the Chinese Phrynocephalus species: the viviparous group (Clade A) and the oviparous group (Clade B). The trees derived from Bayesian, ML. and NJ analyses were topologically identical to the MP analysis except for the position of P. mystaceus. All analyses left the nodes for the oviparous group, the most basal clade within the oviparous group, and P. mystaceus unresolved. The phylogenies further suggest that the monophyly of the viviparous species may have resulted from vicariance, while recent dispersal may have been important in generating the pattern of variation among the oviparous species. (C) 2003 Elsevier Science (USA). All rights reserved.

Phylogenetic analyses of Fringillidae (Aves : Passeriformes) using mitochondrial tRNA gene sequences and secondary structure

Fringillidae is a large and diverse family of Passeriformes. So far, however, Fringillidae relationships deduced from morphological features and by a number of molecular approaches have remained unproven. Recently, much attention has been attracted to mitochondrial tRNA genes, whose sequence and secondary structural characteristics have shown to be useful for Acrodont Lizards and deep-branch phylogenetic studies. In order to identify useful phylogenetic markers and test Fringillidae relationships, we have sequenced three major clusters of mitochondrial tRNA genes from 15 Fringillidae, taxa. A coincident tree, with coturnix as outgroup, was obtained through Maximum-likelihood method using combined dataset of 11 mitochondrial tRNA gene sequences. The result was similar to that through Neighbor-joining but different from Maximum-parsimony methods. Phylogenetic trees constructed with stem-region sequences of 11 genes had many different topologies and lower confidence than with total sequences. On the other hand, some secondary structural characteristics may provide phylogenetic information on relatively short internal branches at under-genus level. In summary, our data indicate that mitochondrial tRNA genes can achieve high confidence on Fringillidae phylogeny at subfamily level, and stem-region sequences may be suitable only at above-family level. Secondary structural characteristics may also be useful to resolve phylogenetic relationship between different genera of Fringillidae with good performance.

沙蜥属部分物种分类性状评价

沙蜥属Phrynocephalus Kaup，1825隶属于爬行纲（Reptilia）有鳞目（Squamata）蜥蜴亚目（Lacertilia）鬣蜥科（Agamidae），是欧亚大陆荒漠和稀疏草原常见蜥蜴。沙蜥属的分类及系统演化关系、地理分布格局与新生代第三纪以来古地中海的变迁、青藏高原的抬升及亚洲内陆干旱荒漠化的过程有密切的关系，长期以来有关沙蜥属的研究一直受到中外学者们的关注。由于沙蜥属地理分布广、形态变异大、体色和斑纹变化复杂，虽然前人使用过许多形态性状来描述和分类沙蜥属物种，但是仍然存在许多问题。性状的分类学意义不明确是造成这些问题的主要原因之一，因此本研究针对沙蜥属常用的鉴别性状进行分类意义的分析，希望能对沙蜥属物种鉴定及分类学其它研究有所裨益。 中国沙蜥属物种主要分布于西北的干旱荒漠区域及青藏高原的大部分地区，大约为18种。 本文研究了中国境内12种沙蜥：青海沙蜥（Phrynocephalus vlangalii）、西藏沙蜥（P. theobaldi）、南疆沙蜥（P. forsythii）、变色沙蜥（P. versicolor）、旱地沙蜥（P. helioscopus）、荒漠沙蜥（P. przewalskii）、乌拉尔沙蜥（P. guttatus）、草原沙蜥（P. frontalis）、叶城沙蜥（P. axillaris）、白稍沙蜥（P. koslowi）、无斑沙蜥（P. immaculatus）和白条沙蜥（P. albolineatus），对它们的65项外部形态性状进行了观察和测量，其中数量性状29项、质量性状36项。评价了这些性状的序级性、间断性和代表性，结论如下： 1. 对于数量性状，得出了适合各级分类的数值区间； 2. 给出了在不同序级上适合分类的质量性状。 并利用各性状评价的结果，给出12种沙蜥的检索表，以及对中国沙蜥物种某些尚存在争议的问题进行了探讨。 详细记录了青海沙蜥红原亚种的骨骼系统，首次发现并命名了肘骨（elbow bone）和垫骨（stepping bone），为沙蜥属系统学研究补充了骨骼方面的证据；解剖了乌拉尔沙蜥、旱地沙蜥、荒漠沙蜥的雌体和雄体的骨骼系统，并在14项骨骼形态性状上对这3种沙蜥进行了比较。 Phrynocephalus （Squamata，Agamidae） is a familiar genus of lizards inhabited desert and sparse steppes in Eurasia. The taxonomics, phylogenetics and distribution pattern of Phrynocephalus are relative intensely to these events: the vicissitudes of the archaic Mediterranean sea since the Cainozoic, the uplift of Qingzang Plateau and the expending arid areas in the inland of Asia. Owing to the wide distribution, the large variability of the morphology and the different colors in Phrynocephalus, it is difficult to identify them. Tough many morphological characters are used to describe and discriminate them，a lot of questions still exist. One of the most important reasons is the confusion in the morphological characters. In this study, we demonstrate the validity and the invalidity of the familiar characters. There are about 18 species of the genus Phrynocephalus in China, which exist in arid desert in Northwest China and Qingzang Plateau. Twelve Chinese species was analyzed in this paper. They are P. vlangalii，P. theobaldi，P. forsythia，P. versicolor，P. helioscopus，P. przewalskii，P. guttatus，P. frontalis，P. axillaris，P. koslowi，P. immaculatus，P. albolineatus. We measure 29 quantitative characters and observe 36 qualitative characters in each individual. Through analyzing these characters, we made some conclusions as follows: 1. to every quantitative character, we get a clear numeric area to discriminate the different operational taxonomic units. 2. we chose the valid qualitative characters in these operational taxonomic units. This paper is the first to describe the “elbow bone”, which is a bone in pectoral appendage equivalent to patella，and “stepping bone”, which is a bone under carpal. A detailed description of the skeletal system of female Phrynocephalus vlangalii hongyuanensis was conducted. We also anatomise the skeletal systems of three species: P. guttatus，P. przewalskii，P. helioscopus, and compare or contrast 14 skeletal characters in them. What’s more，this paper offers some suggestions to the questions of Chinese Phrynocephalus species and keys to 12 species of Phrynocephalus basing on our conclusions on the evaluation of the morphological characters.

黄河上游青海沙蜥种组的系统地理学研究

沙蜥属（Phrynocephalus）的卵胎生类群主要分布在我国青藏高原，包括南疆沙蜥（P. forsythii）、西藏沙蜥（P. theobaldi）、红尾沙蜥（P. erythrurus）、贵德沙蜥（P. putjatia）和青海沙蜥（P. vlangalii）。其卵胎生生殖方式适应了高寒生境，与青藏高原隆升有关。纵观前人的研究，上述几种卵胎生沙蜥的分类、系统发育关系以及生物地理都还存在疑问。本文研究了分布在若尔盖湿地的青海沙蜥红原亚种（P. v hongyuanensis）以及分布在黄河上游其它地区青海沙蜥种组的地理分布格局，并探讨了其形成机制。 青海沙蜥在黄河上游主要分布于若尔盖湿地以及青海湖周边地区。若尔盖湿地青海沙蜥红原亚种的生境由于沼泽的形成被切割成不连续的斑块，通过遗传分析可以推测这种特殊生境对它们遗传结构的影响。其次，贵德沙蜥、青海沙蜥的青海湖周边各居群以及若尔盖湿地居群之间的系统地理格局还未见报道。因此本文以居群为单位，将它们作为一个复合体，通过系统地理研究，可以了解其种群遗传结构，据此分析相关的地质历史事件对其分布的影响。主要结果如下： 1. 若尔盖湿地青海沙蜥红原亚种的种群遗传结构： 共研究了三个地理单元（红原（HY）、辖曼（XM）、玛曲（MQ））的7个采集点的72个个体。所有ND4-tRNALeu序列比对得到785 bp的片断，定义了9种单倍型。结果显示总的核苷酸多样性较低，单倍型多样性较高。分子变异分析（AMOVA）显示3个单元间差异显著（P<0.01），遗传变异主要存在于地理单元间，占62.61%。除MQ单元，XM各居群与HY居群混杂在一起，单倍型网络图没有显示出单倍型和地理位置的对应关系。XM单元单倍型的不配对分布（Mismatch distribution）为明显左移的单峰，且Fu’s Fs test为负值，表明XM单元可能经历了近期种群扩张，有足够的时间积累单倍型的多态性，还不足以大幅提高核苷酸多样性，这是其单倍型多样性较高和核苷酸多样性较低的原因。MQ单元遗传多样性低而与其他单元显著分化，推测这与3万年前黄河在若尔盖玛曲之间贯通有关。近期沼泽的形成对XMb居群的隔离时间短，使得其遗传多样性低但还不足以形成大的遗传差异。无论黄河的贯通还是沼泽的形成其隔离形成的时间都不长，其作用改变了单倍型出现的频率，也出现了一些特有单倍型，但共享单倍型还广泛存在，还不足以使得不同居群之间形成较大的遗传距离。 2. 黄河上游青海沙蜥种组的分布格局与地史过程的关系： 黄河上游青海沙蜥种组包括贵德沙蜥、青海沙蜥指名亚种的青海湖周边各居群、青海沙蜥红原亚种若尔盖湿地居群、以及青海湖以西的部分居群（序列由Genbank下载获得），总计22个居群189个样品。所有ND4-tRNALeu序列比对得到703个位点，定义了39种单倍型。以南疆沙蜥为外群构建的贝叶斯树以及MP法构建的无根树，都分为A、B两大组。其中A包括若尔盖湿地居群以及玛多居群（A1）、青海湖以西的居群和兴海居群（A2）、西藏沙蜥；B包括青海湖以南的居群和天祝居群（B1）、青海湖以东北的居群（B2）。单倍型网络图分别对应了系统发育树上的各支。按照系统发育结果分组进行分子变异分析，得到组间变异占88.63％，各组间差异显著（P=0.000）。种群遗传结构分析得到，A1和B2可能经历了近期的种群扩张，前者扩张时间约为0.105－0.189 Ma B.P.（million years before present），后者为0.057－0.102 Ma B.P.，可能与末次间冰期的气候变暖有关。A2和B1对应的两个地理单元都具有较强的种群遗传结构，较为稳定。 青海沙蜥种组A、B两大支之间遗传距离大，分化明显，分化大约发生在4.29－2.38 Ma B.P.，推测青藏运动的A幕运动后复杂的地形变化可能是它们产生分化的原因。B1和B2分化大约发生在1.73－0.96 Ma B.P.，这与湟水流域构造运动发生的时间相符。在早、中更新世时期，B1支内部各居群可能有交流，中更新世末共和盆地出现的抬升以及河流溯源改道等事件可能是引起这支内部多个单倍型丢失的原因。A1、A2支的分化可能与倒数第三次冰期降临之后气候变冷、阿尼玛卿山的大冰帽有关。 The viviparous group of genus Phrynocephalus is mainly distributed in the Qinghai –Tibetan Plateau, including P. forsythii、P. theobaldi、P. erythrurus、P. putjatia and P. vlangalii. These species are adapted well to the cold clime there, and the origin of this group was the result of a vicariance event associated with the uplifting of the Qinghai -Tibetan Plateau. Although many works have been done, there are still several questions about classification、phylogenetic relationships and the biogeography of this group. The phylogeographic pattern of the P. vlangalii complex on the upper reaches of the Yellow River and the P. v. hongyuanensis in Zoige Wetland were studied in this thesis. On the upper reaches of the Yellow River, P. vlangalii complex are distributed in Zoige Wetland and the southeast and northeast region of Kuku-noor Lake. Because of the forming of the wetland in Zoige, the habitats for sand lizards are divided into many discontinuous ones, and it is necessary to analyze genetic structure in these unique habitats. The phylogeographic patter among P. putjatia、populations of P. vlangalii in the southeast region of Kuku-noor Lake and populations of P. vlangalii in Zoige Wetland hasn’t been studied yet, and the complicated geological events of the Plateau may play an important role in the populations’ diversity and species forming there. So these populations were gathered as a complex, and phylogeographic analysis were used to clarify these doubts. According to the two topics above, this thesis has two parts of results as follows: 1. Three geographic units of P. vlangalii hongyuanensis in Zoige Wetland were defined, and they were Xiaman （XM）、Hongyuan （HY） and Maqu （MQ）. 785bp fragments of the mtDNA ND4-tRNAleu were determined from 72 samples and nine haplotypes were identified. As a whole, the nucleotide diversity was low，but the haplotype diversity was high. Analysis of molecular variance （AMOVA） showed that the three units were distinctly different（P<0.01），and 62.61% of the total genetic diversity was attributable to variation among units. There were 3 haplotypes shared among XM and HY，and no geographic clustering was observed except MQ from the TCS network. The results from the mismatch distribution analysis and Fu’s Fs test implied that there might be a recent population expansion in the XM unit, and this may be the reason why XM had a high haplotype diversity but a low nucleotide diversity. We estimate that the MQ and XMb have lower diversities because of some very recent geographic events, such as the formation of the Yellow river’s upriver and the Zoige Wetland. Although they are distinctly different, not enough time has passed for them to have diverged a great genetic distance. 2. 189 samples in 22 populations of P. vlangalii complex were collected, including P. putjatia、populations of P. vlangalii in the southeast and northeast region of Kuku-noor Lake、 populations of P. vlangalii in Zoige Wetland and the data from Genbank. 703bp ND4-tRNALeu sequences identified 39 haplotypes. P. forsythii was selected as outgroup, and both the Bayesian tree and the MP unrooted tree were divided into two groups（A、B）. A included populations in Zoige Wetland and Xinghai（A1）、populations in the west of Kuku-noor Lake（A2）、P. theobaldi, and B included populations in the southeast of Kuku-noor Lake and Tianzhu（B1）、populations in the northeast of Kuku-noor Lake（B2）. The haplotype network agreed with these groups. AMOVA showed that these five groups were distinctly different（P<0.01）, and 88.63% of the total genetic diversity was attributable to variation among groups. There might be recent population expansion in A1 and A2, which corresponded to the dry climate of the last interglacial period. The expansion times were 0.189-0.105 Ma B.P. and 0.102-0.057 Ma B.P., respectively. A2 and B1 had strong genetic structure. The large genetic distance between A and B showed that they had been separated from each other for a long time（about 4.29-2.38 Ma B.P.）, and it corresponded to the A phase of Qingzang Movement. The diversity between B1 and B2 at 1.73-0.96 Ma B.P. may be caused by the geological event in Huangshui valley. In early Pleistocene, populations in B1 may have gene flow because of geographic linkage, and later the uplift of the Plateau and the change of river route there made a few haplotypes lost. A1 and A2 were divided into two parts by A’nyemaqen Mountains at 0.66-0.37 Ma B.P., which maybe corresponded to glaciations at about 0.7 Ma B.P.

Distribution of the common lizard (Zootoca vivipara) and landscape favourability for the species in Northern Ireland

The common lizard (Zootoca vivipara) is Ireland’s only native reptile, forming a key part of the island’s biodiversity. However, there is a general paucity of distributional and abundance data for the species. In this study, we collated incidental records for common lizard sightings to define the distribution of the species in Northern Ireland. Maximum entropy modelling was employed to describe species-habitat associations. The resulting predicted landscape favourability was used to evaluate the current status of the species based on the distribution of its maximum potential range in relation to the degree of fragmentation of remaining suitable habitat. In common with previous studies in the Republic of Ireland, sightings were highly clustered indicating under-recording, observer bias, and fragmentation of suitable habitat. A total of 98 records were collated from 1905 to 2009. The species was recorded in 63 (ca. 34%) of 186 × 10 km Northern Irish grid squares. Lizard occurrence was strongly and positively associated with landscapes dominated by heathland, bog and coastal habitats. The single best approximating model correctly classified the presence of lizards in 84.2% of cases. Upland heath, lowland raised bog and sand dune systems are all subject to Habitat Action Plans in Northern Ireland and are threatened by conversion to agriculture, afforestation, invasive species encroachment and infrastructural development. Consequently, remaining common lizard populations are likely to be small, isolated and highly fragmented. Establishment of an ecological network to preserve connectivity of remaining heath and bog will not only benefit remaining common lizard populations but biodiversity in general.

The structure of helokinestatin-5 and its biosynthetic precursor from Gila monster (Heloderma suspectum) venom: Evidence for helokinestatin antagonism of bradykinin-induced relaxation of rat tail artery smooth muscle

Here we report the primary structure of a novel peptide, named helokinestatin-5 (VPPPLQMPLIPR), from the venom of the Gila monster (Heloderma suspectum). Helokinestatin-5 differs in structure from helokinestatin-3 by deletion of a single prolyl residue in the N-terminally located polyproline region. Two different biosynthetic precursors were consistently cloned from a venom-derived cDNA library. The first encoded helokinestatins 1–4 and a single copy of C-type natriuretic peptide, as previously described, whereas the second was virtually identical, lacking only a single prolyl codon as found in the mature attenuated helokinestatin-5 peptide. Helokinestatins 1–3 and 5 were synthesized by solid-phase fmoc chemistry and each synthetic replicate was found to antagonize the relaxation effect induced by bradykinin on rat tail artery smooth muscle. Helokinestatins thus represent a novel family of vasoactive peptides from the venom of helodermatid lizards

Jettisoning Ballast or Fuel? Caudal Autotomy and Locomotory Energetics of the Cape Dwarf Gecko Lygodactylus capensis (Gekkonidae)

Many lizard species will shed their tail as a defensive response (e.g., to escape a putative predator or aggressive conspecific). This caudal autotomy incurs a number of costs as a result of loss of the tail itself, loss of resources (i.e., stored in the tail or due to the cost of regeneration), and altered behavior. Few studies have examined the metabolic costs of caudal autotomy. A previous study demonstrated that geckos can move faster after tail loss as a result of reduced weight or friction with the substrate; however, there are no data for the effects of caudal autotomy on locomotory energetics. We examined the effect of tail loss on locomotory costs in the Cape dwarf gecko Lygodactylus capensis (similar to 0.9 g) using a novel method for collecting data on small lizards, a method previously used for arthropods. We measured CO2 production during 5-10 min of exhaustive exercise (in response to stimulus) and during a 45-min recovery period. During exercise, we measured speed (for each meter moved) as well as total distance traveled. Contrary to our expectations, tailless geckos overall expended less effort in escape running, moving both slower and for a shorter distance, compared with when they were intact. Tailless geckos also exhibited lower excess CO2 production (CO2 production in excess of normal resting metabolic rate) during exercising. This may be due to reduced metabolically active tissue (tails represent 8.7% of their initial body mass). An alternative suggestion is that a change in energy substrate use may take place after tail loss. This is an intriguing finding that warrants future biochemical investigation before we can predict the relative costs of tail loss that lizards might experience under natural conditions.

Functional and Structural Diversification of the Anguimorpha Lizard Venom System

Venom has only been recently discovered to be a basal trait of the Anguimorpha lizards. Consequently, very little is known about the timings of toxin recruitment events, venom protein molecular evolution, or even the relative physical diversifications of the venom system itself. A multidisciplinary approach was used to examine the evolution across the full taxonomical range of this similar to 130 million-year-old clade. Analysis of cDNA libraries revealed complex venom transcriptomes. Most notably, three new cardioactive peptide toxin types were discovered (celestoxin, cholecystokinin, and YY peptides). The latter two represent additional examples of convergent use of genes in toxic arsenals, both having previously been documented as components of frog skin defensive chemical secretions. Two other novel venom gland-overexpressed modified versions of other protein frameworks were also recovered from the libraries (epididymal secretory protein and ribonuclease). Lectin, hyaluronidase, and veficolin toxin types were sequenced for the first time from lizard venoms and shown to be homologous to the snake venom forms. In contrast, phylogenetic analyses demonstrated that the lizard natriuretic peptide toxins were recruited independently of the form in snake venoms. The de novo evolution of helokinestatin peptide toxin encoding do-mains within the lizard venom natriuretic gene was revealed to be exclusive to the helodermatid/anguid subclade. New isoforms were sequenced for cysteine-rich secretory protein, kallikrein, and phospholipase A 2 toxins. Venom gland morphological analysis revealed extensive evolutionary tinkering. Anguid glands are characterized by thin capsules and mixed glands, serous at the bottom of the lobule and mucous toward the apex. Twice, independently this arrangement was segregated into specialized serous protein-secreting glands with thick capsules with the mucous lobules now distinct (Heloderma and the Lanthanotus/Varanus clade). The results obtained highlight the importance of utilizing evolution-based search strategies for biodiscovery and emphasize the largely untapped drug design and development potential of lizard venoms. Molecular & Cellular Proteomics 9:2369-2390, 2010.

The natriuretic peptide/helokinestatin precursor from Mexican beaded lizard (Heloderma horridum) venom: Amino acid sequence deduced from cloned cDNA and identification of two novel encoded helokinestatins

Natriuretic peptides are common components of reptile venoms and molecular cloning of their biosynthetic precursors has revealed that in snakes, they co-encode bradykinin-potentiating peptides and in venomous lizards, some co-encode bradykinin inhibitory peptides such as the helokinestatins. The common natriuretic peptide/helokinestatin precursor of the Gila Monster, Heloderma suspectum, encodes five helokinestatins of differing primary structures. Here we report the molecular cloning of a natriuretic peptide/helokinestatin precursor cDNA from a venom-derived cDNA library of the Mexican beaded lizard (Heloderma horridum). Deduction of the primary structure of the encoded precursor protein from this cloned cDNA template revealed that it consisted of 196 amino acid residues encoding a single natriuretic peptide and five helokinestatins. While the natriuretic peptide was of identical primary structure to its Gila Monster (H. suspectum) homolog, the encoded helokinestatins were not, with this region of the common precursor displaying some significant differences to its H. suspectum homolog. The helokinestatin-encoding region contained a single copy of helokinestatin-1, 2 copies of helokinestatin-3 and single copies of 2 novel peptides, (Phe)(5)-helokinestatin-2 (VPPAFVPLVPR) and helokinestatin-6 (GPPFNPPPFVDYEPR). All predicted peptides were found in reverse phase HPLC fractions of the same venom. Synthetic replicates of both novel helokinestatins were found to antagonize the relaxing effect of bradykinin on rat tail artery smooth muscle. Thus lizard venom continues to provide a source of novel biologically active peptides. (C) 2011 Published by Elsevier Inc.