Fecal pellet ingestion rate and feeding behavior of Oithona similis, Calanus helgolandicus and Pseudocalanus elongatus from the North Sea

Studies of fecal pellet flux show that a large percentage of pellets produced in the upper ocean is degraded within the surface waters. It is therefore important to investigate these degradation mechanisms to understand the role of fecal pellets in the oceanic carbon cycle. Degradation of pellets is mainly thought to be caused by coprophagy (ingestion of fecal pellets) by copepods, and especially by the ubiquitous copepods Oithona spp. We examined fecal pellet ingestion rate and feeding behavior of O. similis and 2 other dominant copepod species from the North Sea (Calanus helgolandicus and Pseudocalanus elongatus). All investigations were done with fecal pellets as the sole food source and with fecal pellets offered together with an alternative suitable food source. The ingestion of fecal pellets by all 3 copepod species was highest when offered together with an alternative food source. No feeding behavior was determined for O. similis due to the lack of pellet capture in those experiments. Fecal pellets offered together with an alternative food source increased the filtration activity by C. helgolandicus and P. elongatus and thereby the number of pellets caught in their feeding current. However, most pellets were rejected immediately after capture and were often fragmented during rejection. Actual ingestion of captured pellets was rare (<37% for C. helgolandicus and <24% for P. elongatus), and only small pellet fragments were ingested unintentionally along with alternative food. We therefore suggest coprorhexy (fragmentation of pellets) to be the main effect of copepods on the vertical flux of fecal pellets. Coprorhexy turns the pellets into smaller, slower-sinking particles that can then be degraded by other organisms such as bacteria and protozooplankton.

The vertical distribution of Eucalanus elongatus in the San Diego region during 1909,

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Parasitos metazoários de duas populações de Leporinus friderici (Characiformes, anostomidae) do sistema do Rio Amazonas no Brasil.

Leporinus friderici Bloch, 1794 é um Anostomidae com ampla distribuição nas bacias dos rios Amazonas, Paraná e Araguaia-Tocantins. Tem hábito alimentar onívoro, alimentando-se de insetos, material vegetal, detritos, frutos, sementes, camarão e pequenos peixes, bem como hábitos diurnos e sedentárias. No sistema Rio Amazonas, esse peixe se reproduz no período de abril a outubro, e tem desova total. Este estudo comparou a estrutura das comunidades de parasitos metazoários em duas populações de Leporinus friderici de diferentes bacias do sistema do Rio Amazonas, no Brasil. Em julho de 2012, 47 espécimes de L. friderici (22.1 ± 3.8 cm e 171.1 ± 86.3 g) foram coletados na bacia do Rio Jari, município de Vitória do Jari, Estado do Amapá (Brasil), e de julho a dezembro de 2012, 50 espécimes de L. friderici (15.1 ± 3.6 cm e 57.4 ± 42.8 g) foram coletadas na bacia Igarapé Fortaleza, próximo à cidade de Macapá, estado do Amapá (Brasil), para análise parasitológica. Métodos usuais de coleta, fixação, conservação e identificação dos parasitos foram usados neste estudo. Os termos ecológicos usados foram os recomendados na literatura. O índice de diversidade de Shannon (H) e uniformidade (E), riqueza de espécies e frequência de dominância (FD%) foram calculados para avaliar a comunidade componente de parasitos. O índice de dispersão e índice de discrepância foram calculados, para detectar o padrão de distribuição das infracomunidades de parasitos para espécies com prevalência >10%. As duas populações de L. friderici estavam parasitadas por Jainus leporini, Urocleidoides paradoxus, Urocleidoides sp., Tereancistrum parvus, Tereancistrum sp., Clinostomum marginatum, Procamallanus (Spirocamallanus) inopinatus, Contracaecum sp., Octospiniferoides incognita e Ergasilus sp. Houve diferença na riqueza de espécies de parasitos, índice de Shannon e equitabilidade entre ambas as populações de L. friderici, pois a comunidade de parasitos mostrou similaridade de apenas 33%. Somente os monogenoideas, C. marginatum e P. (S.) inopinatus foram as espécies de parasitos compartilhadas por ambas as populações de L. friderici examinados. Os parasitos apresentaram padrão dispersão agregada, exceto Contracaecum sp., que mostrou padrão de dispersão randômica. Diferenças no tamanho dos hospedeiros foi um dos fatores que contribuiram para as diferenças nos níveis de parasitos encontradas entre as populações estudadas. O hábito alimentar contribui para ocorrência de endoparasitos em L. friderici, hospedeiro intermediário para tais esses parasitos como ciclo de vida complexo. Este é primeiro registro de O. incognita, C. marginatum e Ergasilus para L. friderici.

Non-ribosomal peptides produced by Brazilian cyanobacterial isolates with antimicrobial activity

Cyanobacterial strains isolated from terrestrial and freshwater habitats in Brazil were evaluated for their antimicrobial and siderophore activities. Metabolites of fifty isolates were extracted from the supernatant culture media and cells using ethyl acetate and methanol, respectively. The extracts of 24 isolates showed antimicrobial activity against several pathogenic bacteria and one yeast. These active extracts were characterized by Q-TOF/MS. The cyanobacterial strains Cylindrospermopsis raciborskii 339-T3, Synechococcus elongatus PCC7942, Microcystis aeruginosa NPCD-1, M. panniformis SCP702 and Fischerella sp. CENA19 provided the most active extracts. The 50 cyanobacterial strains were also screened for the presence of non-ribosomal peptide synthetase (NRPS) and polyketide synthase (PKS) genes and microcystin production. Putative fragment genes coding for NRPS adenylation domains and PKS keto-synthase domains were successfully PCR amplified from 92% and 80% of cyanobacterial strains, respectively. The potential therapeutical compounds siderophores were detected in five cyanobacterial isolates. Microcystin production was detected by ELISA test in 26% of the isolates. Further a protease inhibitor substance was detected by LC-MS/MS in the M. aeruginosa NPLJ-4 extract and the presence of aeruginosin and cyanopeptolin was confirmed by PCR amplification using specific primers, and sequenced. This screening study showed that Brazilian cyanobacterial isolates are a rich source of natural products with potential for pharmacological and biotechnological applications. (C) 2010 Elsevier GmbH. All rights reserved.

The interaction of water flow and nutrients on aquatic plant growth

A long-term experiment was conducted to compare the effects of flowing and still water on growth, and the relationship between water flow and nutrients, in Aponogeton elongatus, a submerged aquatic macrophyte. A. elongatus plants were grown for 23 weeks with three levels of nutrition (0, 0.5 and 1g Osmocote Plus(R) fertiliser pot(-1)) in aquaria containing stirred or unstirred water. Fertilized plants grew much better than non-fertilized. The highest fertilizer level produced 29% wider leaves and 58% higher total dry weight in stirred water. Stirred water increased leaf area by 40% and tuber size by 81%, but only with the highest level of nutrition. These results suggest that this plant depends on its roots for mineral uptake, rather than from the open water, and the major limitation to growth in still water is the supply of dissolved inorganic carbon. It was the combined effects of nutrient availability and stirring that produced the strongest response in plant growth, morphology and composition. This study provides some explanation for the observations of others that these plants grow best in creeks or river systems with permanently flowing water.

Phylogeny of the Sporobolus indicus complex, based on internal transcribed spacer (ITS) sequences

The entire internal transcribed spacer ( ITS) region, including the 5.8S subunit of the nuclear ribosomal DNA ( rDNA), was sequenced by direct double-stranded sequencing of polymerase chain reaction (PCR) amplified fragments. The study included 40 Sporobolus ( Family Poaceae, subfamily Chloridoideae) seed collections from 14 putative species ( all 11 species from the S. indicus complex and three Australian native species). These sequences, along with those from two out-group species [ Pennisetum alopecuroides ( L.) Spreng. and Heteropogon contortus ( L.) P. Beauv. ex Roemer & Schultes, Poaceae, subfamily Panicoideae], were analysed by the parsimony method (PAUP; version 4.0b4a) to infer phylogenetic relationships among these species. The length of the ITS1, 5.8S subunit and ITS2 region were 222, 164 and 218 base pairs ( bp), respectively, in all species of the S. indicus complex, except for the ITS2 region of S. diandrus P. Beauv. individuals, which was 217 bp long. Of the 624 characters included in the analysis, 245 ( 39.3%) of the 330 variable sites contained potential phylogenetic information. Differences in sequences among the members of the S. pyramidalis P. Beauv., S. natalensis (Steud.) Dur & Schinz and S. jacquemontii Kunth. collections were 0%, while differences ranged from 0 to 2% between these and other species of the complex. Similarly, differences in sequences among collections of S. laxus B. K. Simon, S. sessilis B. K. Simon, S. elongatus R. Br. and S. creber De Nardi were 0%, compared with differences of 1-2% between these four species and the rest of the complex. When comparing S. fertilis ( Steud.) Clayton and S. africanus (Poir.) Robyns & Tourney, differences between collections ranged from 0 to 1%. Parsimony analysis grouped all 11 species of the S. indicus complex together, indicating a monophyletic origin. For the entire data set, pair-wise distances among members of the S. indicus complex varied from 0.00 to 1.58%, compared with a range of 20.08-21.44% among species in the complex and the Australian native species studied. A strict consensus phylogenetic tree separated 11 species of the S. indicus complex into five major clades. The phylogeny, based on ITS sequences, was found to be congruent with an earlier study on the taxonomic relationship of the weedy Sporobolus grasses revealed from random amplified polymorphic DNA ( RAPD). However, this cladistic analysis of the complex was not in agreement with that created on past morphological analyses and therefore gives a new insight into the phylogeny of the S. indicus complex.

Biologia alimentar de três espécies de Triportheus (PISCES: CHARACOIDEIL, CHARACIDAE) do Lago do Castanho, Amazonas

Neste trabalho, é discutida a composição do conteúdo estomacal de três espécies de sardinha: Triportheus angulatus, Triportheus elongatus e Triportheus culter, do lago do Castanho, um lago de várzea localizado na Amazônia Central, com o objetivo de determinar o comportamento alimentardessas espécies, comparativamente, em funções de variações hidrológicas e ecológicas regionais, e desenvolvimento dos indivíduos. Paralelamente, procura-se correlacionar determinadas estruturas morfoanatômicas de adaptação ligadas mais diretamente ao tipo de regime alimentar de cada espécie como dentes e rastros branquiais. Em conseqüência dos tipos de alimentos ingeridos e observações de campo é feita a caracterização do possível bíotopo ocupado pelas espécies.

Inventario taxonômico e redescriçâo das espécies de Anostomideos (Characiformes, Anostomidae) do Baixo Rio Tocantins, PA, Brasil

RESUMOComo parte dos estudos ambientais que foram desenvolvidos pelo INPA, de 1980 a 1986, em convênio com a ELETRONORTE, na área de influência da UHE Tucuruí. são redescritas e ilustradas 20 espécies da damília Anostomidae do baixo rio Tocantins, entre Cametá e Itupiranga, PA: Leporinus affins, L. tigrinus, L. desmotes, L. sp. 4, L. trifasciatus, L. friderici, L. sp. 1, L. sp. 2, L. sp. 3, L. granti, L. pachiycheilus, Laemolyta petiti, L. taeniata, Anostomoides laticeps, A. sp. 1, Anostomus ternetzi, Leporellus vittatus, Schizodon vittatus, Sartor tucuruiense e Abramites hypselenotus. Cinco espécies (Laemolyta petiti, Leporinus affinis, L. sp. 2, Anostomoides sp. 1 e Sartor tucuruiense) somente foram assiladas até agora para a bacia do Tocantins-Araguaia. Por outro lado, outras espécies anostomídeos, melhor representadas na bacia Amazônica, não foram encontrados no baixo Tocantins, fazendo supor que esta área, do ponto de vista ictiológico, está relativamente iosolado do restante da bacia Amazônica e possui um certo grau de endemismo. A maioria das espécies ocorre amplamente no baixo Tocantins, sendo que algumas apresentam acentuada preferência por determinados biótopos, como por exemplo Leporinus pachycheilus, L. desmotes, L. sp. 1 e Sartor tucuruiense, por corredeiras; Leporinus sp. 3, Anostomus ternetzi, por igarapés; Schizodon vittatus e Laemolyta taeniata,por zonas marginais, periodicametne alagáveis. A partir da análise dos caracteres merísticas e morfométricas, sobretudo o número, a forma e disposição dos dentes, posição da boca e número de escamas, a apresentada uma chave de identificação para as espécies estudadas.

INVENTÁRIO TAXONÔMICO DOS ANOSTOMÍDEOS (PISCES, ANOSTOMIDAE) DA BACIA DO RIO UATUMÃ-AM, BRASIL, COM DESCRIÇÃO DE DUAS ESPÉCIES NOVAS.

O presente estudo trata do inventário, descrição e ilustração das espécies de anostomídeos da bacia do rio Uatumã. Ele foi desenvolvido com base na coleção de peixes do INPA, montada a partir de um intenso programa de coletas, na bacia do Uatumã, nas áreas de influência das usinas hidrelétricas de Balbina e Pitinga, ambas no estado do Amazonas. Para a maioria das espécies são feitos comentários sobre os caracteres diagnósticos, área de distribuição, biótopos preferenciais e principais variações do padrão de colorido entre adultos e jovens. As vinte e duas espécies identificadas pertencem a 8 gêneros, sendo Leporinusdominante, com 12 espécies, seguido de Laemolyta, Anostomuse Pseudanos,com duas e de Schizodon, Anostomoides, Synaptolaemuse Gnathodolus,com uma espécie cada. Dentre os peixes inventariados, duas espécies são consideradas novas e descritas (Leporinus uatumaensissp.n e Leporinus pitingaisp.n.) A partir deste estudo, as espécies tiveram sua área de ocorrência ampliada, já que algumas delas só haviam sido assinaladas para a localidade-tipo.

Two new Haploporidae (Trematoda) of Fishes from the Brazilian state of Rondônia

Two new Haploporidae (Trematoda) are described from fishes of the State of Rondônia, Brazil. Rondotrema microvitellarum gen. et sp. n., an intestinal parasite of Hemiodus microlepis, is characterized as having intercecal vitellaria limited to one small cluster on either side postero-lateral to the ovary. Lecithobotrioides elongatus sp. n., from Prochilodus nigricans, has an elongate, cylindrical body, short thick ceca, a small hemaphroditic sac and extensive vitellaria.

Produção de frutos de espécies da floresta de Várzea da Amazônia Central importantes na alimentação de Peixes

Com o objetivo de quantificar a contribuição que quatro espécies, Cassia leiandra Benth., Crescentia amazonica Ducke, Macrolobium acaciifolium (Benth.) Benth. e Vitex cymosa Bert. ex Spreng., oferecem através de seus frutos à alimentação dos peixes, foram marcados, aleatoriamente, dez indivíduos adultos destas quatro espécies da floresta de várzea na ilha da Marchantaria - Amazônia Central. O período de maior produção de frutos dá-se no período do alto nível das águas, entre janeiro e maio. A espécie Cassia leiandra apresentou a maior produção com 1.836 kg/ha e amplo consumo pela população local. Os principais peixes consumidores de frutos são tambaqui (Colossoma macropomum), matrinxã (Brycon cephalus), pirapitinga (Piaractus brachypomus), pirarara, (Phractocephalus hemioliopterus), bacu (Lithodoras dorsalis, Megalodoras sp.), pacu (Mylossoma sp., Myleus sp., Metynnis sp., Mylesinus sp.) e sardinha (Triportheus elongatus). As espécies de plantas estudadas apresentam potencial de aproveitamento como fonte de alimento para peixes.