Caracterização de múltiplos polimorfismos de Pneumocystis Jirovecii por multiplex-PCR/Single base extension

Pneumocystis jirovecii é conhecido por causar infecções específicas no aparelho respiratório de seus hospedeiros, principalmente em doentes imunocomprometidos, manifestando-se por uma pneumonia grave e por vezes fatal, normalmente designada por pneumonia por Pneumocystis. A caracterização da diversidade genética de P. jirovecii tem demonstrado que determinados polimorfismos de base única poderão ser reconhecidos como marcadores moleculares de eleição para o estudo da distribuição geográfica, vias de transmissão, resistência/susceptibilidade a fármacos, factores de virulência e genética populacional de subtipos genéticos. Este estudo teve como objectivo a caracterização de polimorfismos de P. jirovecii, através da metodologia PCR multiplex/Extensão de base única (do inglês single base extension), com a principal finalidade de constatar eventuais associações entre polimorfismos de base única, genótipos multilocus, e dados clínicos e demográficos da infecção. Sessenta e seis espécimes pulmonares, previamente considerados positivos para P. jirovecii, obtidos entre 2001 e 2012, a partir de doentes portugueses imunocomprometidos, foram seleccionados de forma aleatória para este estudo multilocus. PCR multiplex foi utilizada para a amplificação simultânea de três regiões genómicas: subunidade grande do rRNA mitocondrial, superóxido dismutase e dihidropteroato sintetase. Cinco polimorfismos de base única, previamente correlacionados com parâmetros da doença, foram genotipados por extensão de base única: mt85, SOD110, SOD215, DHPS165 e DHPS171. Um total de 330 polimorfismos de base única e 29 genótipos multilocus putativos de P. jirovecii foram identificados e caracterizados nos espécimes pulmonares analisados. Os padrões de distribuição dos polimorfismos foram analisados, sendo considerada a variação temporal e/ou geográfica das suas formas alélicas. Constatou-se grande diversidade genotípica entre os isolados de P. jirovecii que poderá ter influência a nível epidemiológico. Foram observadas associações estatísticas entre mt85/genótipos multilocus e parâmetros demográficos e clínicos. A correlação mais importante verificou-se entre mt85C e cargas parasitárias baixas a moderadas, enquanto mt85T foi associado com cargas parasitárias altas; MLG5, MLG9 e MLG13 foram associados com cargas parasitárias baixas, moderadas e altas, respectivamente. Tais associações demonstram que potenciais marcadores moleculares da infecção por P. jirovecii poderão existir e que polimorfismos/genótipos específicos poderão determinar perfis epidemiológicos da pneumonia por Pneumocystis. A análise genética cruzada permitiu verificar associações entre polimorfismos de base única. Os polimorfismos SOD110T e SOD215C, SOD110C e SOD215T, DHPS165A e DHPS171C, DHPS165G e DHPS171T foram associados estatisticamente. Os genótipos multilocus mais prevalentes foram considerados para o teste recombinatório d1. Dois genótipos multilocus (MLG7 e MLG9) foram observados com elevada frequência, e a análise genética indicou que estes se encontravam sobre-representados na população de P. jirovecii estudada. Estas evidências indicam que o fenómeno de desequilíbrio de ligação e a propagação clonal de subtipos genéticos é frequente, considerando que a espécie P. jirovecii poderá ser representada por uma população com estrutura epidémica. O presente trabalho confirmou a importância do estudo de polimorfismos em P. jirovecii, sugerindo que a caracterização multilocus poderá fornecer informação relevante para a compreensão dos padrões, causas e controlo da infecção, melhorando assim a investigação deste importante patogéneo.

Millennium BCP- The almond hill credit extension proposal

This Work Project is a case study on the credit lending process and loan pricing policy of Millennium bcp, one of the main Portuguese banks. The goal of the case study is to provide an opportunity to understand the above mentioned process and policy in a major bank and to explore the issues and interests at play when a relevant credit decision must be taken. I would like to thank Dr. José Miguel Pessanha without whom this project would not have been possible.

Product extension services deployment platform

Due to the progresses made in the branch of embedded technologies, manufacturers are becoming able to pack their shop floor level manufacturing resources with even more complex functionalities. This technological progression is radically changing the way production systems are designed and deployed, as well as, monitored and controlled. The dissemination of smart devices inside production processes confers new visibility on the production system while enabling for a more efficient and effective management of the operations. By turning the current manufacturing resources functionalities into services based on a Service Oriented Architecture (SOA), in order to expose them as a service to the user, the binomial manufacturing resource/service will push the entire manufacturing enterprise visibility to another level while enabling the global optimization of the operations and processes of a production system while, at the same time, supporting its accommodation to the operational spike easily and with reduced impact on production. The present work implements a Cloud Manufacturing infrastructure for achieving the resource/service value-added i.e. to facilitate the creation of services that are the composition of currently available atomic services. In this context, manufacturing resource virtualization (i.e. formalization of resources capabilities into services accessible inside and outside the enterprise) and semantic representation/description are the pillars for achieving resource service composition. In conclusion, the present work aims to act on the manufacturing resource layer where physical resources and shop floor capabilities are going to be provided to the user as a SaaS (Software as a Service) and/or IaaS (Infrastructure as a Service).

Unusual abdominal tumors with intracardiac extension. Two cases with successful surgical resection

Abdominal tumors that can grow through vascular lumen and spread to the right heart are rare. Although these tumors have different histologic aspects, they may cause similar abdominal and cardiac symptoms and are a serious risk factor for pulmonary embolism and sudden death when they reach the right atrium and tricuspid valve. The best treatment is radical surgical resection of the entire tumor using cardiopulmonary bypass with or without deep hypothermia and total circulatory arrest. We report the cases of two patients, the first with leiomyosarcoma of the inferior vena cava and the other with intravenous leiomyomatosis of the uterus that showed intravascular growth up to right atrium and ventricle, who underwent successful radical resection in a one-stage procedure with the use of cardiopulmonary bypass. We discuss the clinical and histologic aspects and imaging diagnosis and review the literature.

A GIS extension model to calculate urban heat island intensity based on urban geometry

This paper presents a simulation model, which was incorporated into a Geographic Information System (GIS), in order to calculate the maximum intensity of urban heat islands based on urban geometry data. The method-ology of this study stands on a theoretical-numerical basis (Okeâ s model), followed by the study and selection of existing GIS tools, the design of the calculation model, the incorporation of the resulting algorithm into the GIS platform and the application of the tool, developed as exemplification. The developed tool will help researchers to simulate UHI in different urban scenarios.

A model to simulate the moment-rotation and crack width of FRC members reinforced with longitudinal bars

The present work describes a model for the determination of the moment–rotation relationship of a cross section of fiber reinforced concrete (FRC) elements that also include longitudinal bars for the flexural reinforcement (R/FRC). Since a stress–crack width relationship (σ–w)(σ–w) is used to model the post-cracking behavior of a FRC, the σ–w directly obtained from tensile tests, or derived from inverse analysis applied to the results obtained in three-point notched beam bending tests, can be adopted in this approach. For a more realistic assessment of the crack opening, a bond stress versus slip relationship is assumed to simulate the bond between longitudinal bars and surrounding FRC. To simulate the compression behavior of the FRC, a shear friction model is adopted based on the physical interpretation of the post-peak compression softening behavior registered in experimental tests. By allowing the formation of a compressive FRC wedge delimited by shear band zones, the concept of concrete crushing failure mode in beams failing in bending is reinterpreted. By using the moment–rotation relationship, an algorithm was developed to determine the force–deflection response of statically determinate R/FRC elements. The model is described in detail and its good predictive performance is demonstrated by using available experimental data. Parametric studies were executed to evidence the influence of relevant parameters of the model on the serviceability and ultimate design conditions of R/FRC elements failing in bending.

Plastic-damage smeared crack model to simulate the behaviour of structures made by cement based materials

This work proposes a constitutive model to simulate nonlinear behaviour of cement based materials subjected to different loading paths. The model incorporates a multidirectional fixed smeared crack approach to simulate crack initiation and propagation, whereas the inelastic behaviour of material between cracks is treated by a numerical strategy that combines plasticity and damage theories. For capturing more realistically the shear stress transfer between the crack surfaces, a softening diagram is assumed for modelling the crack shear stress versus crack shear strain. The plastic damage model is based on the yield function, flow rule and evolution law for hardening variable, and includes an explicit isotropic damage law to simulate the stiffness degradation and the softening behaviour of cement based materials in compression. This model was implemented into the FEMIX computer program, and experimental tests at material scale were simulated to appraise the predictive performance of this constitutive model. The applicability of the model for simulating the behaviour of reinforced concrete shear wall panels submitted to biaxial loading conditions, and RC beams failing in shear is investigated.

Postharvest shelf life extension of blueberries using a chitosan-based edible coating containing aloe vera juice

Poster

Range extension of Centronycetris maximiliani (Mammalia: Chiroptera) for southern Amazonia

Bat species of the genus Centronycteris are some of the rarest Neotropical Emballonuridae and fewer than 50 specimens have been deposited in scientific collections. The aim of this study is to extend the distribution of Centronycteris maximiliani. Three C. maximiliani specimens were recorded in the Brazilian Amazonia, providing the first record of the species for the state of Rondônia, the southernmost record of the species for the Amazon biome in Brazil, and an additional record for the state of Pará. Although these new records of C. maximiliani reinforce the idea that this species is widely distributed throughout the Amazon biome, its low capture rate reflects the rarity of this species, since only three specimens were collected during three to four year field effort.

Estratégias desenvolvidas por usuários de crack para lidar com os riscos decorrentes do consumo da droga

OBJETIVOS: O objetivo deste estudo foi identificar, sob a ótica de usuários de crack, quais são as estratégias que eles utilizam para minimizar ou evitar os riscos decorrentes do consumo de crack. MÉTODO: Utilizou-se método qualitativo de pesquisa, desenvolvido mediante entrevistas semiestruturadas em profundidade. Foi entrevistada uma amostra intencional por critérios, composta por 30 usuários de crack, selecionados por meio de informantes-chave e distribuídos em oito diferentes cadeias. As entrevistas foram transcritas literalmente, inseridas e analisadas no software NVivo 8, com exploração dos dados mediante a técnica de análise de conteúdo. RESULTADOS: Os entrevistados acreditam que os maiores riscos decorrentes da dependência do crack sejam os relacionados aos efeitos psíquicos da droga, como fissura, sintomas paranoides transitórios e sintomas depressivos, assim como os decorrentes da ilegalidade dela, como a polícia e as questões referentes ao tráfico. Entretanto, os riscos de complicações físicas do consumo quase não foram apontados. As estratégias se concentraram no controle dos efeitos psíquicos, principalmente pelo consumo de álcool e maconha. Para lidar com as consequências da ilegalidade da droga, mostraram se preocupar com a postura que adotam perante o traficante e a polícia. CONCLUSÕES: As estratégias desenvolvidas pelos usuários focam na tentativa de se autoprotegerem principalmente dos episódios de violência e no alívio de sintomas desagradáveis causados pela droga - principalmente fissura e sintomas paranoides transitórios. Essas estratégias podem parecer efetivas a curto prazo, porém apresentaram riscos de longo prazo, tais como dependência de álcool e maconha.

Relação entre o craving por tabaco e o craving por crack em pacientes internados para desintoxicação

OBJETIVO: Verificar se há relação entre aumento do craving por crack e aumento do craving por tabaco em pacientes internados para desintoxicação. MÉTODO: Ensaio clínico tipo quase-experimental de análise quantitativa. Amostra composta por 32 homens dependentes de cocaína (crack) e tabaco, em duas a três semanas de abstinência. Realizou-se intervenção em grupo, no qual, inicialmente, foram aplicados: CCQB (Cocaine Craving Questionnaire-Brief ), QSUB (Questionnaire of Smoking Urges-Brief ) e BAI (Inventário Beck de Ansiedade). Em seguida, foram aplicadas imagens relacionadas ao crack e reaplicados CCQB, QSUB e BAI. Após, foi realizada entrevista individual em que se aplicaram FSD (Ficha com Dados Sociodemográficos) e FTND (Fagerström Test for Nicotine Dependence). RESULTADOS: A partir da exposição de imagens relativas ao crack, houve aumento significativo do craving por crack, do craving por tabaco e dos sintomas de ansiedade, estando essas medidas correlacionadas positivamente entre si. CONCLUSÃO: Os resultados indicam uma associação significativa entre craving por crack e craving por tabaco, sugerindo que a abstinência de tabaco pode ajudar na eficácia do tratamento para dependência de crack.

Associação entre fissura e perfil antropométrico em dependentes de crack

OBJETIVO: Verificar a variação da fissura de dependentes de crack no decorrer da internação e a associação com perfil antropométrico. MÉTODOS: Trata-se de uma pesquisa quantitativa com delineamento transversal (n = 30). Avaliaram-se o perfil de consumo de substâncias psicoativas; dados sociodemográficos; variáveis antropométricas (peso, estatura, índice de massa corporal, relação cintura-quadril, perímetros, dobras cutâneas e diâmetro ósseo); e fissura avaliada por meio do Cocaine Craving Questionnaire Brief. As coletas de dados ocorreram nas 24 horas iniciais e finais do tratamento. RESULTADOS: Observou-se aumento significativo do percentual de gordura e diminuição significativa da fissura. Não se evidenciou associação entre variáveis antropométricas e fissura, tanto no início como ao final da internação. CONCLUSÃO: Houve significativa diminuição na fissura e modificação na composição corporal, entretanto não houve correlação entre essas variáveis.

Validação psicométrica do Cocaine Craving Questionnaire-Brief - Versão Brasileira Adaptada para o Crack para dependentes hospitalizados

Introdução: O craving (ou fissura) é um fator muito importante no tratamento da dependência de substâncias psicotrópicas. Objetivo: Validar o Cocaine Craving Questionnaire-Brief - Versão Brasileira Adaptada para o Crack. Método: O delineamento foi experimental e seus participantes foram randomizados, em grupos: experimental, para o qual foi apresentada uma imagem de um indivíduo consumindo crack (G1), e controle (G2), para o qual não foi apresentada nenhuma imagem. A amostra foi composta por 109 sujeitos (G1 = 50 e G2 = 59) do sexo masculino, internados por causa da dependência do crack. Os instrumentos utilizados foram: Entrevista Clínica com dados sociodemográficos, CCQ-B Versão Adaptada para o Crack, Escala Analógico-Visual do Craving, Inventários Beck de Ansiedade e de Depressão e o Estímulo Visual indutor de craving para o G1. Resultados: Na análise fatorial, foram encontrados dois fatores: o fator 1, relacionado ao craving propriamente dito, e o fator 2, relacionado à percepção da falta de controle do uso do crack. Os dois fatores apresentaram variância total de 68,84%, e a correlação entre os fatores foi significativa e de baixa intensidade (r = 0,204; p = 0,041). O alfa de Cronbach do seu total de pontos foi 0,85. O instrumento no total de pontos foi correlacionado com a Escala Analógico-Visual (r = 0,515; p < 0,01). Conclusão: O CCQ-B - Versão Brasileira Adaptada para o Crack demonstrou ser, psicometricamente, satisfatório para utilização em pesquisas e em ambiente clínico.

Pregnant crack addicts in a psychiatric unit

OBJECTIVE: In this study we aim to characterize a sample of 85 pregnant crack addicts admitted for detoxification in a psychiatric inpatient unit. METHOD: Cross-sectional study. Sociodemographic, clinical, obstetric and lifestyle information were evaluated. RESULTS: Age of onset for crack use varied from 11 to 35 years (median = 21). Approximately 25% of the patients smoked more than 20 crack rocks in a typical day of use (median = 10; min-max = 1-100). Tobacco (89.4%), alcohol (63.5%) and marijuana (51.8%) were the drugs other than crack most currently used. Robbery was reported by 32 patients (41.2%), imprisonment experience by 21 (24.7%), trade of sex for money/drugs by 38 (44.7%), home desertion by 33 (38.8%); 15.3% were positive for HIV, 5.9% for HCV, 1.2% for HBV and 8.2% for syphilis. After discharge from the psychiatric unit, only 25% of the sample followed the proposed treatment in the chemical dependency outpatient service. CONCLUSION: Greater risky behaviors for STD, as well as high rates of maternal HIV and Syphilis were found. Moreover, the high rates of concurrent use of other drugs and involvement in illegal activities contribute to show their chaotic lifestyles. Prevention and intervention programs need to be developed to address the multifactorial nature of this problem.

Exposição a trauma e transtorno de estresse pós-traumático em usuárias de crack

OBJETIVO: Verificar a ocorrência de trauma e transtorno de estresse pós-traumático (TEPT) em uma amostra de mulheres dependentes de cocaína tipo crack. MÉTODO: A amostra foi composta por 99 mulheres, entre 18 e 52 anos, internadas em uma unidade de desintoxicação e extensamente avaliadas por meio da SCID-I e a ASI-6. RESULTADOS: Verificou-se uma taxa de exposição a trauma de 86,9% entre mulheres dependentes de cocaína tipo crack. A taxa de TEPT na amostra foi de 15,1%. Os clusters de revivescência e hiperexcitabilidade foram os mais frequentes - 24,4% e 20,9% respectivamente. Entre os tipos de eventos relatados, os mais frequentes foram sofrer agressão/abuso físico e ser testemunha de violência a outros. CONCLUSÃO: Os resultados sugerem uma frequente exposição a eventos traumáticos. Com relação à idade da experiência traumática, sugere-se que as usuárias expostas a trauma durante a infância e adolescência apresentam um início do uso de drogas em idades mais precoces que aquelas cujo trauma ocorreu na vida adulta.