Contributions to the Geology and Paleontology of the Canal Zone, Panama, and geologically related areas in central America and the West Indies. Part 11: The biologic character and geologic correlations of the sedimentary formations of Panama in their relation to the geologic history of Central America and the West Indies

The paper presents: 1) biologic summaries for each of the formations for which paleontologic data are available, with brief discussions of the geologic age; 2) geologic correlations of the formations and the distribution of their age-equivalents in Central America, the West Indies, and the southeastern United States; 3) an outline of the paleogeography of middle America. The biologic summaries are based on the paleontologic memoirs in this vol. by Messars. Howe, Berry, Chuchman, Jackson, Canu and Bassler and Pilsbry, Miss Rathbun and myself.

Detección automática de presencia/ausencia de atún en imágenes obtenidas mediante sonar de largo alcance a bordo de buques pesqueros y aplicación de Optical Character Recognition (OCR) para la extracción de parámetros

En esta tesis de máster se presenta una metodología para el análisis automatizado de las señales del sonar de largo alcance y una aplicación basada en la técnica de reconocimiento óptico de Optical Character Recognition, caracteres (OCR). La primera contribución consiste en el análisis de imágenes de sonar mediante técnicas de procesamiento de imágenes. En este proceso, para cada imagen de sonar se extraen y se analizan las regiones medibles, obteniendo para cada región un conjunto de características. Con la ayuda de los expertos, cada región es identi cada en una clase (atún o no-atún). De este modo, mediante el aprendizaje supervisado se genera la base de datos y, a su vez, se obtiene un modelo de clasi cación. La segunda contribución es una aplicación OCR que reconoce y extrae de las capturas de pantalla de imágenes de sonar, los caracteres alfanuméricos correspondientes a los parámetros de situación (velocidad, rumbo, localización GPS) y la confi guración de sonar (ganancias, inclinación, ancho del haz). El objetivo de este proceso es el de maximizar la e ficiencia en la detección de atún en el Golfo de Vizcaya y dar el primer paso hacia el desarrollo de un índice de abundancia de esta especie, el cual esté basado en el procesamiento automático de las imágenes de sonar grabadas a bordo de la ota pesquera durante su actividad pesquera rutinaria.

Meristic variation in Sebastes (Scorpaenidae), with an analysis of character association and bilateral pattern and their significance in species separation

This report presents meristic data for nearly all of the known species of Sebasles. Rudimentary caudal ray counts tend to be higher in more active species. The number of caudal rays supported by the hypurals is consistently 14, whereas the number of branched caudal rays varies between 11 and 13. Vertebral counts and most fin-ray counts tend to be lower in species or populations in warmer latitudes, except for pectoral ray counts which tend to have an opposite geographic pattern. On the basis of the small magnitude of meristic and morphometric differences and the lack of other differences between northern and southern samples of "Sebasles caurinus," Sebaslichlhys vexillaris Jordan and Gilbert is regarded as a junior synonym of Sebasles caurinus Richardson. The patterns of bilateral variation in paired meristics are analyzed and their mechanism discussed. The frequency distribution of pectoral ray counts in their right-left combination is shown to be useful in species separation. No association was found between any combination of two meristic features in any species. The author proposes that intrasample associations between meristic features are evidence of sampling heterogeneity. (PDF file contains 21 pages.)

The intestine as a diagnostic character in identifying certain clupeoids (Engraulididae, Clupeidae, Dussumieriidae) and as a morphometric character for comparing anchoveta (Centengraulis mysticetus) populations

ENGLISH: The several species of clupeoid fishes used as baitfish in the Eastern Pacific tuna fishery are, in some cases, sufficiently similar to make identification difficult. During a review of the anatomy of the intestine of clupeoid fishes it was observed that the morphology of the intestine is sometimes a useful character in the identification of systematic groups. The genera at least can be distinguished by means of the topographical anatomy of the intestines. This also may be a useful character because it is often found that a species occurs in the same area as another species that may be confused with it on external inspection, although it belongs to a different genus. SPANISH: La gran similitud morfológica de varias especies del órden Clupeoidea usadas como cebo en la pesquería de atún del Pacifíco Oriental, hace que su identificación sea en algunos casos difícil. Al realizar una revisión anatómica del intestino de los peces clupeoides, se observó que la morfología del mismo es a veces un carácter útil para la identificación de los diversos grupos sistemáticos. Al menos los géneros pueden ser distinguidos por medio de la anatomía topográfica de los intestinos. Esto también puede ser un carácter útil, puesto que a menudo dos especies pertenecientes a géneros diferentes y que ocupen la misma área, pueden ser confundidos si nos basamos solamente en la morfología externa. (PDF contains 24 pages.)

Generating artificial homologous proteins according to the representative family character in molecular mechanics properties - an attempt in validating an underlying rule of protein evolution

The molecular mechanics property is the foundation of many characters of proteins. Based on intramolecular hydrophobic force network, the representative family character underlying a protein’s mechanics property is described by a simple two-letter scheme. The tendency of a sequence to become a member of a protein family is scored according to this mathematical representation. Remote homologs of the WW-domain family could be easily designed using such a mechanistic signature of protein homology. Experimental validation showed that nearly all artificial homologs have the representative folding and bioactivity of their assigned family. Since the molecular mechanics property is the only consideration in this study, the results indicate its possible role in the generation of new members of a protein family during evolution.

A model for energy and morphology of crystalline grain boundaries with arbitrary geometric character

It has been well-established that interfaces in crystalline materials are key players in the mechanics of a variety of mesoscopic processes such as solidification, recrystallization, grain boundary migration, and severe plastic deformation. In particular, interfaces with complex morphologies have been observed to play a crucial role in many micromechanical phenomena such as grain boundary migration, stability, and twinning. Interfaces are a unique type of material defect in that they demonstrate a breadth of behavior and characteristics eluding simplified descriptions. Indeed, modeling the complex and diverse behavior of interfaces is still an active area of research, and to the author's knowledge there are as yet no predictive models for the energy and morphology of interfaces with arbitrary character. The aim of this thesis is to develop a novel model for interface energy and morphology that i) provides accurate results (especially regarding "energy cusp" locations) for interfaces with arbitrary character, ii) depends on a small set of material parameters, and iii) is fast enough to incorporate into large scale simulations.

In the first half of the work, a model for planar, immiscible grain boundary is formulated. By building on the assumption that anisotropic grain boundary energetics are dominated by geometry and crystallography, a construction on lattice density functions (referred to as "covariance") is introduced that provides a geometric measure of the order of an interface. Covariance forms the basis for a fully general model of the energy of a planar interface, and it is demonstrated by comparison with a wide selection of molecular dynamics energy data for FCC and BCC tilt and twist boundaries that the model accurately reproduces the energy landscape using only three material parameters. It is observed that the planar constraint on the model is, in some cases, over-restrictive; this motivates an extension of the model.

In the second half of the work, the theory of faceting in interfaces is developed and applied to the planar interface model for grain boundaries. Building on previous work in mathematics and materials science, an algorithm is formulated that returns the minimal possible energy attainable by relaxation and the corresponding relaxed morphology for a given planar energy model. It is shown that the relaxation significantly improves the energy results of the planar covariance model for FCC and BCC tilt and twist boundaries. The ability of the model to accurately predict faceting patterns is demonstrated by comparison to molecular dynamics energy data and experimental morphological observation for asymmetric tilt grain boundaries. It is also demonstrated that by varying the temperature in the planar covariance model, it is possible to reproduce a priori the experimentally observed effects of temperature on facet formation.

Finally, the range and scope of the covariance and relaxation models, having been demonstrated by means of extensive MD and experimental comparison, future applications and implementations of the model are explored.

On the character of the phytoplankton of the Yakimvarskii Gulf (Lake Ladoga) [Translation from: Botanicheskii Zhurnal, T. 44, No. 9, 1311-1314, 1959]

The Laboratory of Lake Studies of the Academy of Sciences of the USSR in 1956 undertook this complicated study of Lake Ladoga. The plan of the laboratory made allowance for the detailed investigation of the phytoplankton of the lake during a series of years. In the present article are given the preliminary results of observations on the phytoplankton of the Yakimvarskii Bay from 1956 to 1957. Details are also given on the concentration of dissolved gases and biogenic substances of the bay.

O vampiro é o leitor: o processo de vampirização do leitor na literatura fantástica

Parte-se da perspectiva do fantástico como um entrelugar espaço plural e fragmentado, marcado por descentramento e heterogeneidade, capaz de comportar até o contraditório percebido como um ambiente caracterizado por uma inerente duplicidade. Entendido isso, observa-se que esse caráter dual intensifica-se nas narrativas vampirescas, na medida em que ele é estendido ao vampiro e refletido no leitor. Por conseguinte, identificam-se e analisam-se os aspectos distintivos do leitor desse tipo de narrativa, reconhecendo-se seu papel na construção do gênero e na manutenção do caráter aberto da obra, como em uma coautoria cuja marca registrada é a hesitação. Entretanto, da relação entre vampiro e leitor, evidencia-se mais que isso, afinal a narrativa fantástica de modo geral e não apenas a de vertente vampiresca sempre aponta para o leitor como sendo este o fio solto que não permite que a obra feche-se. Percebe-se ainda, por meio da descrição e análise de diferentes tipos de manifestação do vampiro na literatura, um processo de reconfiguração da relação existente entre vampiro e leitor, e entre este e a narrativa fantástica, bem como com a literatura de forma geral. Assim, considera-se a relação do leitor com o vampiro clássico um tipo assustador , marcada pela desidentificação; com o moderno um tipo sedutor, e humanizado na figura de Louis, personagem de Anne Rice , marcada pela identificação; e com o contemporâneo um tipo sedutor e humano , marcada pela apropriação de identidade. Neste último movimento, entendido como a vampirização do leitor, intenta-se provar que este, depois de transformado, reconhecendo-se como tal em seu duplo (o vampiro), nutre-se da força vital deste seu duplo e da narrativa fantástica e retém a aparência de hesitação, a qual é a força motriz do gênero em questão. O leitor torna-se o personagem mais atuante sobre a/na narrativa, operando no campo da realidade e também no da ficção. A compreensão desse processo que vai da desidentificação à apropriação de identidade é aprofundada na análise destas três narrativas vampirescas marcantes ao pensamento desenvolvido neste estudo: Drácula, de Bram Stoker; Entrevista com o vampiro, de Anne Rice; e A confissão, de Flávio Carneiro

A sede do deserto: Lavoura arcaica e a parábola do pródigo

Desde que foi publicado, em 1975, Lavoura arcaica vem intrigando os leitores com a sua dessemelhança. Em meio a livros que absorviam a violência do regime militar brasileiro, Raduan Nassar surgiu com uma obra estranha, que se nutria de uma linguagem poética profundamente ressonante, do pensamento monoteísta mediterrâneo, da herança cultural árabe, da subversão pela via da sexualidade. O tempo passou, o escritor abandonou a literatura, muita coisa interessante foi dita sobre o romance, mas seus enigmas são ainda sementes lançadas em solo fértil. Lavoura arcaica é mais uma releitura da prolífica parábola do filho pródigo, presente no Evangelho de Lucas e reelaborada inúmeras vezes ao longo dos seus dois mil anos de existência. A história do jovem rebelde que decide romper os laços com a família para se lançar no mundo tem se mostrado generosa para com a imaginação de muitos autores, que se dispuseram a reescrevê-la com o filtro de suas óticas particulares. Alguns deles estão no presente trabalho: Gide, Kipling, Kafka, Rilke, Dalton Trevisan, Lúcio Cardoso e também o teólogo católico Henri Nouwen. Apesar das variações, a volta para casa ocupa em todas as narrativas um lugar privilegiado. Essa é uma história, afinal, sobre os motivos que levam o sujeito a ir embora e, mais ainda, sobre as razões que fazem com que regresse. Arrependimento, recomeço, fraqueza, derrota, amor? A despeito das muitas antíteses que encontramos no texto de Raduan, elas não exigem que façamos uma escolha entre o arcaico e o moderno, entre ficar ou partir, entre o individual e o coletivo, entre a contenção e a entrega. Essa é a questão: Lavoura arcaica não é um livro sobre a luta do bem contra o mal, da liberdade contra a opressão, mas um painel que mostra como tudo isso se mistura na mesma paisagem ou, parafraseando o personagem André, como as coisas só se unem se desunindo

Distinctive Paleo-Indian Migration Routes from Beringia Marked by Two Rare mtDNA Haplogroups

Background: It is widely accepted that the ancestors of Native Americans arrived in the New World via Beringia approximately 10 to 30 thousand years ago (kya). However, the arrival time(s), number of expansion events, and migration routes into the Western