First report of the use of a saxitoxin-protein conjugate to develop a DNA aptamer to a small molecule toxin

Saxitoxin (STX) is a low molecular weight neurotoxin mainly produced by certain marine dinoflagellates that, along with its family of similarly related paralytic shellfish toxins, may cause the potentially fatal intoxication known as paralytic shellfish poisoning. Illness and fatality rates are low due to the effective monitoring programs that determine when toxins exceed the established regulatory action level and effectuate shellfish harvesting closures accordingly. Such monitoring programs rely on the ability to rapidly screen large volumes of samples. Many of the screening assays currently available employ antibodies or live animals. This research focused on developing an analytical recognition element that would eliminate the challenges associated with the limited availability of antibodies and the use of animals. Here we report the discovery of a DNA aptamer that targets STX. Concentration-dependent and selective binding of the aptamer to STX was determined using a surface plasmon resonance sensor. Not only does this work represent the first reported aptamer to STX, but also the first aptamer to any marine biotoxin. A novel strategy of using a toxin-protein conjugate for DNA aptamer selection was successfully implemented to overcome the challenges associated with aptamer selection to small molecules. Taking advantage of such an approach could lead to increased diversity and accessibility of aptamers to low molecular weight toxins, which could then be incorporated as analytical recognition elements in diagnostic assays for foodborne toxin detection. The selected STX aptamer sequence is provided here, making it available to any investigator for use in assay development for the detection of STX.

Un modèle de développement de logiciels-outils de support à l'enseignement

En tant qu'enseignant dans le programme des Techniques du génie électrique (T.G.E, anciennement Électrotechnique) nous avons pu constater qu'en moins de 10 ans, le micro-ordinateur est devenu une réalité qui concerne pratiquement tous les cours des trois années de formation, alors qu'ils n'étaient utilisés dans aucun cours avant. Cet exemple est typique de la révolution informatique que nous vivons actuellement et qui pénètre tous les secteurs d'activités de notre société. Dans ce contexte de changements importants, les enseignants ont malgré eux un rôle de pionniers car ils n'ont que peu de ressources à leur disposition pour maîtriser cette technologie et l'intégrer dans leur enseignement. Ce virage informatique, s'il est à peine commencé dans l'enseignement général, pose de nombreux problèmes aux enseignants du secteur professionnel qui doivent trouver la place et déterminer le rôle que doit jouer cette nouvelle technologie dans l'enseignement. La majorité des recherches sur les didacticiels ont pour objet les logiciels qui cherchent à assurer des tâches d'enseignement, tels que les tests, exerciseurs ou tutoriels, et auxquels s'ajoutent maintenant les applications multimédia. Une étude menée dans les collèges (Mataigne, 1992) montre cependant que ce sont d'abord les logiciels de bureautique et ensuite les logiciels de programmation et de simulation-modélisation, qui sont de loin les plus utilisés dans l'enseignement. S'il n'existe pratiquement pas de logiciels de bureautique ou de programmation conçus pour l'enseignement, les logiciels de simulation et de modélisation constituent plus des deux tiers des développements de didacticiels de ces dix dernières années pour le réseau collégial. Ces logiciels, dont la forme et le contenu se rapprochent plus de logiciels conçus pour les entreprises que de logiciels pédagogiques traditionnels, appartiennent à une catégorie où il se fait très peu de recherche didactique et où il n'existe pas de modèle de développement spécifique. Par ailleurs, nous avons constaté que la grande majorité des auteurs de didacticiels sont des enseignants qui réalisent parfois leur logiciel eux-mêmes. La conception d'un didacticiel étant une tâche particulièrement complexe, il nous a semblé utile d'analyser les différences entre les didacticiels traditionnels et les logiciels de simulation-modélisation afin de dégager la problématique du développement de ces derniers. Après avoir analysé les différents modèles de développement proposés par la recherche ou par le génie informatique, nous nous proposons, dans cette recherche, de dégager et de justifier une méthodologie de développement spécifique aux logiciels de simulation-modélisation fondée sur des éléments empruntés aux modèles du génie logiciel et de la didactique, sur notre expérience de développement et sur celle d'experts dans le domaine.

The Pirates of Penzance, March 10, 1987

Concert Program for The Pirates of Penzance, March 10, 1987

Elevated blood pressure prevalence in children did not follow the increase in overweight: results from a school-based study in a rapidly developing country, 1998-2006

Background: Blood pressure (BP) is strongly associated with body weight and there is concern that the pediatric overweight epidemic could lead to an increase in children's mean BP. Objectives: We analyzed BP trends from 1998 to 2006 among children of the Seychelles, a rapidly developing middle-income country in Africa. Methods: Serial school-based surveys of weight, height and BP were conducted yearly between 1998-2006 among all students of the country in four school grades (kindergarten, 4th, 7th and 10th years of compulsory school). We used the CDC criteria to define "overweight" (BMI _95th sex-, and age-specific percentile) and the NHBPEP criteria for "elevated BP" (BP _95th sex-, age-, and height specific percentile). Methods for height, weight, and BP measurements were identical over the study period. The trends in mean BMI and mean systolic/diastolic BP were assessed with linear regression. Results: 27,703 children aged 4-18 years (participation rate: 79%) contributed 43,927 observations on weight, height, and BP. The prevalence of overweight increased from 5.1% in 1998-2000 to 8.1% in 2004-2006 among boys, and from 6.1% to 9.1% among girls, respectively. The prevalence of elevated BP was 8.4% in 1998-2000 and 6.9% in 2004-2006 among boys; 9.8% and 7.8% among girls, respectively. Over the 9-years study period, age-adjusted body mass index (BMI) increased by 0.078 kg/m2/year in boys and by 0.083 kg/m2/year in girls (both sexes, P_0.001). Age- and height-adjusted systolic BP decreased by -0.37 mmHg/year in boys and by -0.34 mmHg/year in girls (both sexes, P_0.001). Diastolic BP did not change in boys (-0.02 mmHg/year, P: 0.40) and slightly increased in girls (0.07 mmHg/year, P: 0.003). These trend estimates were altered modestly upon further adjustment for BMI or if analyses were based on median rather than mean values. Conclusion: Although body weight increased markedly between 1998 and 2006 in this population, systolic BP decreased and diastolic BP changed only marginally. This suggests that population increases in body weight are not necessarily associated with corresponding rises in BP in children.

Frecuencia de desove de la anchoveta peruana, engraulis ringens, en agosto y setiembre 1995

Se estimó la frecuencia de desove (F) de la anchoveta peruana Engraulis ringens, colectada en el área Tambo de Mora a Paita, en el Crucero BIC Humboldt y BIC SNP-1 9508-09. El valor de la frecuencia de desove fue de 0,119 (11,9%) con una varianza (V) de 0,00046 y un coeficiente de variación (CV) de 0,180402. Es decir que en el período de muestreo de 28 días una hembra promedio desovó 3,3 veces, o cada 8 días. Se calculó los valores de F por grado latitudinal y se discutió su relación con la temperatura superficial del mar.

Estado reproductivo de la anchoveta peruana engraulis ringens durante los veranos 1996 y 1997

Mediante el análisis histológico de gónadas se muestra la variabilidad del estado reproductivo de la anchoveta peruana en distintas latitudes. En el año 1996 las áreas en las que se observó mayor actividad reproductiva estuvieron entre los grados 4°-14°S y 16° -18°S. El área 14°-16° se caracterizó por el predominio del estado de reposo sexual. En el año 1997 las áreas en las que hubo mayor actividad reproductiva fueron 4°-6°S y 8°-12°S; el estado de reposo sexual fue el predominante. Se observó un mayor porcentaje de hembras en desove en 1996 que en 1997, probablemente debido a que el verano de 1996 fue frío. Las hembras mayores de 14 cm fueron reproductivamente más activas que las de 12 a 14 cm.

Estimación de la biomasa desovante del stock norte centro de la anchoveta por el método de producción de huevos durante el invierno 1996

La biomasa desovante de la anchoveta peruana Engraulis ringens en el área comprendida entre Tambo de Mora (13°30 'S) y Punta Falsa (06° S), fue estimada en 4,02 millones de toneladas. En esta oportunidad, a diferencia de las anteriores, se hicieron ajustes en la determinación de la producción diaria de huevos (Po) así como en la fecundidad. En el primer caso, por efectos de la dispersión de los huevos en un área de desove mayor; y en el segundo, por no cubrir todo el rango de tamaños. El crucero se llevó a cabo del 11 de agosto al 27 de setiembre de 1996 a bordo del BIC Humboldt. Los valores promedio de los parámetros involucrados en la estimación fueron: proporción de hembras, 0,52; producción diaria de huevos, 10.14E+13; peso promedio de hembras, 29,79 g; fecundidad parcial, 18 495 huevos por hembra y frecuencia de desove, 7,8%. Los parámetros que presentaron mayor variación con respecto a 1995 fueron: la fecundidad parcial, producción diaria de huevos y frecuencia de desove.

Aspectos reproductivos de la anchoveta peruana durante el periodo 1992-2000

Se colectaron y se analizaron con métodos histológicos, ovarios de anchoveta adulta(> 12 cm LT), para comparar algunos parámetros reproductivos: fracción desovante parcial por mes (FDPM),fecundidad parcial (FP), factor de condición (FC) e índice gonadosomático (IGS), durante años normales y años El Niño. El material se obtuvo del monitoreo de las pesquerías en los puertos de desembarque desde mayo 1992 hasta abril 2000, además de once cruceros de evaluación de biomasa de anchoveta entre 1997 y 2000. La FDPM mostró una buena correlación directa con elGS (R = 0,89), pero una correlación inversa con el FC (R=0,7). Este factor comparado con la temperatura superficial del mar (TSM) mensual presentó una baja correlación (R =0,4), pero ésta fue mayor cuando se comparó con la desviación estándar de la TSM mensual (R = -0,7) . Este resultado confirmó que la estación de desove coincidió con el periodo de menor variabilidad de la TSM. En relación a El Niño 1997-98,la anchoveta respondió con una estación de desove más corta, un retraso en máximo de desove una reducción de la FP.

Biología de la anchoveta peruana, Engraulis ringens Jenyns

La anchoveta es la especie clave de la cadena alimentaria del sistema de afloramiento del mar peruano, que se caracteriza por sus altos niveles de productividad no superados por ningún otro ecosistema marino. Se analizaron los principales aspectos biológicos de la anchoveta en periodos de abundancia del recurso, y cuando disminuyeron los niveles poblacionales de esta especie. La recuperación de la población de la anchoveta es rápida después de los eventos cálidos debido a que la población responde a la normalización de las condiciones ambientales, disminuyendo también su mortalidad

Valores críticos en ovarios desovantes y en recuperación de anchoveta (Engraulis ringens) y sardina (Sardinops sagax) en las épocas de desove

Procesa datos provenientes de los anáisis histológicos de ovarios de anchoveta y sardina durante los años 1993-1995 y de enero a marzo de 1996, con la finalidad de obtener valores estadísticamente significativos que permitan tener mayor confianza en la determinación del inicio y fin de las época de mayor intensidad de desove.

Madurez sexual, frecuencia de desove y fecundidad de la anchoveta peruana durante invierno-primavera de 1997

Analiza tres aspectos importantes en el estudio de la biología reproductiva de la anchoveta Engraulis ringens: el estado reproductivo por grado latitudinal (entre 16° y 5°S), la frecuencia de desove y la fecundidad parcial. El desove fue más intenso en el área comprendida entre los grados 10°S y 12°S. La frecuencia de desove fue 0,071, disminuyendo en 32,0% en comparación al cálculo del año anterior.

Estado reproductivo de la Merluza Merluccius gayi peruanus durante el crucero de evaluación BIC Humboldt 9705-06

Se da a conocer la actividad reproductiva de la merluza, Merluccius gayi peruanus, a través del análisis histológico de los ovarios durante el crucero de evaluación BIC Humboldt 9705-06 entre el 15 de mayo y el 08 de junio de 1997. Se identificaron cinco estadios de madurez sexual y se efectuó un análisis de la variación de estos estadios de acuerdo a un muestreo aleatorio estratificado por talla en cuatro áreas de muestreo: 3°30 '-4°59 'S; 5°-6°59 'S; 7°-8°59 'S; 9°-11°59 'S. Se determinaron dos grupos disímiles, uno en el que predominó el reposo sexual (3°30 ' - 6°59 ' S) y el otro en el que la mayoría se encontraba maduro (7°-11°59 ' S). En este último grupo el porcentaje de hembras maduras fue la más frecuente en aquellas iguales o mayores a 31 cm de longitud total. No se observaron diferencias del estado reproductivo a diferentes profundidades

Aplicación del método de congelación de ovarios para estimar la distribución espacial de cardúmenes desovantes de anchoveta

Estudia los resultados acerca del uso y ventajas de la técnica de congelación de ovarios mediante un criostato portátil, para estimar a tiempo real, el estado reproductivo de la anchoveta mediante análisis microscópico de gónadas, durante los cruceros de evaluación.