Visualizing Rare Watson-Crick-Like Tautomeric and Anionic Mismatches in DNA and RNA

The central dogma of molecular biology relies on the correct Watson-Crick (WC) geometry of canonical deoxyribonucleic acid (DNA) dG•dC and dA•dT base pairs to replicate and transcribe genetic information with speed and an astonishing level of fidelity. In addition, the Watson-Crick geometry of canonical ribonucleic acid (RNA) rG•rC and rA•rU base pairs is highly conserved to ensure that proteins are translated with high fidelity. However, numerous other potential nucleobase tautomeric and ionic configurations are possible that can give rise to entirely new pairing modes between the nucleotide bases. Very early on, James Watson and Francis Crick recognized their importance and in 1953 postulated that if bases adopted one of their less energetically disfavored tautomeric forms (and later ionic forms) during replication it could lead to the formation of a mismatch with a Watson-Crick-like geometry and could give rise to “natural mutations.”

Since this time numerous studies have provided evidence in support of this hypothesis and have expanded upon it; computational studies have addressed the energetic feasibilities of different nucleobases’ tautomeric and ionic forms in siico; crystallographic studies have trapped different mismatches with WC-like geometries in polymerase or ribosome active sites. However, no direct evidence has been given for (i) the direct existence of these WC-like mismatches in canonical DNA duplex, RNA duplexes, or non-coding RNAs; (ii) which, if any, tautomeric or ionic form stabilizes the WC-like geometry. This thesis utilizes nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy and rotating frame relaxation dispersion (R1ρ RD) in combination with density functional theory (DFT), biochemical assays, and targeted chemical perturbations to show that (i) dG•dT mismatches in DNA duplexes, as well as rG•rU mismatches RNA duplexes and non-coding RNAs, transiently adopt a WC-like geometry that is stabilized by (ii) an interconnected network of rapidly interconverting rare tautomers and anionic bases. These results support Watson and Crick’s tautomer hypothesis, but additionally support subsequent hypotheses invoking anionic mismatches and ultimately tie them together. This dissertation shows that a common mismatch can adopt a Watson-Crick-like geometry globally, in both DNA and RNA, and whose geometry is stabilized by a kinetically linked network of rare tautomeric and anionic bases. The studies herein also provide compelling evidence for their involvement in spontaneous replication and translation errors.

Length-weight relationship of two palaemonid prawns, Macrobrachium idella and M. scabriculum: a comparative study

Length-weight relationships of two commercially important freshwater prawns, Macrobrachium idella and M. scabriculum, have been worked out separately for the two sexes of the two species. 't' test showed that growth departs significantly from the isometric growth in the case of both sexes of M. idella and in the female of M. scabriculum. Therefore, the cubic formula W = CL^3 may be applied only in the case of males of M. scabriculum. In all the other cases W = CL^n may be followed.

Two new records of palaemonid prawns from Indian waters

Descriptions with suitable illustrations of two species of palaemonid prawns - Macrobrachium aemulum and Palaemon (Palaemon) concinnus are furnished. M. aemulum has been enjoying an isolated distribution in New Caledonia. It is reported for the first time from India and is therefore a clear case of discontinuous distribution. Studies revealed that M. aemulum is distinct from M. nobilii and the reasons for separating the two species are discussed. New distributional records for P. (P.) concinnus in the south-west coast of India are also given.

La fiction est-elle un outil adapté pour transmettre l’Évangile? : réflexion à partir de ma pratique d’auteure

L’objectif de ce mémoire est d’analyser une praxis, la mienne, au moyen des techniques de la praxéologie, en tentant ainsi de réaffirmer le bien-fondé de mon travail d’auteure au service de la foi. En effet, la rédaction de Saffia, femme de Smyrne, débutée après une quinzaine d’années de vie professionnelle active en tant qu’écrivaine, me laisse croire que ce roman historique et sa présentation sont des outils adaptés pour transmettre l’Évangile. Ma recherche débute par une présentation générale de l’œuvre de fiction Saffia, femme de Smyrne ainsi que des conférences qui en découlent. Je mettrai ensuite en mots l’observation du discours secondaire, composé des appréciations ou des impressions de lecteurs. Mon interprétation ou mon hypothèse surgiront de ma problématisation par la question praxéologique Pourquoi est-ce que je fais ce que je fais et seront formulées au moyen des cinq fonctions d’élaboration. La partie ayant trait à la transmission de l’Évangile sera évaluée par des lectures en théologie, qui mettent en exergue les études d’auteurs : Jean-Guy Nadeau, Pierre Vadeboncœur, et Norbert Greinacher tandis que celle référant aux sciences humaines sera étudiée au moyen des œuvres de spécialistes Gérard Delteil, Régis Debray, Félix Moser et Antoine Compagnon. Soutenue par ces différentes études, je serai en mesure de mieux définir ce que la fiction en général peut apporter à la transmission de l’Évangile en m’appuyant sur l’étude de la fiction en théologie faite par des auteurs comme Paul Ricœur et Joseph Moingt. Je conclurai par une réflexion sur le mode de transmission de Saffia, femme de Smyrne et, je l’espère, par une explication de la raison pour laquelle je continuerai à utiliser la fiction pour transmettre l’Évangile. Une courte nouvelle me permettra d’appliquer mon étude et ainsi d’ouvrir ma réflexion dans une praxis.

Educación Física : investigación, innovación y buenas prácticas.

Resumen basado en el de la publicación. Bibliografía al final de los capítulos

El espacio urbano, el transeúnte y lo efímero: reflexión sobre los nuevos horizontes del debate (Tema Central)

La pregunta por el espacio público, la vida cotidiana y los intersticios que se erigen en los avatares del diario vivir, han tenido revuelo en las investigaciones sobre la sociedad y la manera en qué esta se comprende. Es así que el presente documento da cuenta de los aportes que en el marco de esta discusión han realizado Michel de Certeau, Isaac Joseph, Zygmunt Bauman y Jesús Martín-Barbero. Por medio del acercamiento a algunos textos de los autores señalados se indicarán las propuestas más sólidas y las reflexiones más desarrolladas sobre el espacio urbano y la percepción del transeúnte que, como se verá, dan cobijo a nuevas consideraciones sobre el “estar” en la ciudad.

Die gesetzliche Stellung des jüdischen Religions-Unterrichts in Preußen und deren Folgen

von I. Bamberger

Unmaßgebliche Gedanken über Betteljuden und ihre bessere und zweckmäßigere Versorgung : menschenfreundl. Regenten u. Vorstehern zur weiteren Prüfung vorgelegt

von Joseph Isaak. Aus d. Jüd. frey ins Teutsche übers.

Das aramäische Verbum im babylonischen Talmud

von I. Rosenberg

Kyrie eleison! : ein Roman von Juden und von Christen aus dem alten Speyer

von Max Joseph [d.i. Maximilian Joseph Pfeiffer]

Valencia regocijada por las beatificaciones de ... Pedro Nicolas Factor, y Fr. Gaspar de Bono del Sagrado Orden de San Francisco de Asis y San Francisco de Paula o Relacion de las fiestas que en esta ciudad ... se hicieron en 1787 con veinte y seis notas criticas sobre varias antiguedades de ella, destructivas de algunos errores

Según Palau, t.XXI, nº 310534 la fecha de imp. es 1788

Le Progrès par le christianisme : conférences de Notre Dame de Paris.

Mode of access: Internet.

J. Georgii Altmanni ling. graec. [et] ethic. in Acad. Bernensi Professoris Meletemata philologico-critica : quibus difficilioribus Novi Testamenti locis ex antiquitate lux affunditur, et verus eorundem sensus indagatur ...

Contiene: T. II ([2], 294 p., [2] en bl.) -- T. III ([2], 168, [21] , [3] en bl.)