Association of GH and IGF-1 polymorphisms with growth traits in a synthetic beef cattle breed

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Peso adulto de matrizes em rebanhos de seleção da raça Nelore no Brasil

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Tendência Genética dos Efeitos Direto e Materno sobre os Pesos à Desmama e Pós-Desmama de Bovinos da Raça Tabapuã no Brasil

Os dados são relativos aos pesos de animais da raça Tabapuã, nascidos no período de 1959 a 1996 em várias regiões brasileiras. As observações foram analisadas com o objetivo de avaliar as mudanças genéticas aditivas diretas e maternas dos pesos padronizados para 205 (P205), 365 (P365) e 550 (P550) dias de idade. As estimativas dos componentes de (co) variância utilizadas no cálculo dos valores genéticos foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança restrita livre de derivadas (REML), usando o aplicativo MTDFREML, cujo modelo continha os efeitos aleatórios aditivo direto, materno e de ambiente permanente, além dos efeitos fixos de grupo de contemporâneos (unidade da federação, fazenda, sexo, estação e ano de nascimento do animal) e a covariável idade da vaca ao parto (efeitos linear e quadrático). As tendências genéticas dos efeitos genéticos direto e materno foram estimadas pela regressão, ponderada, das médias anuais dos valores genéticos dos animais. As tendências genéticas dos efeitos direto no período estudado foram 0,134 ; 0,207, e 0,276 kg/ano, para P205, P365 e P550, respectivamente. Ainda para os três pesos, na mesma ordem, as estimativas das tendências genéticas maternas foram 0,019; -0,011; e -0,022 kg/ano. em virtude da variação genética existente, os resultados observados estão bem aquém das mudanças possíveis.

Efeito da interação reprodutor x rebanho sobre as produções de leite e de gordura na raça Pardo-Suíça

Dados de 4.959 lactações de 2.414 vacas da raça Pardo-Suíça, filhas de 70 reprodutores, distribuídos em 51 rebanhos, foram utilizados para se estimar o componente de variância para a interação reprodutor x rebanho das produções de leite e de gordura e verificar o efeito desta interação sobre a avaliação genética dos reprodutores, por meio de modelos que diferiam na presença e ausência do termo de interação. As produções de leite e de gordura foram ajustadas para duas ordenhas diárias, 305 dias de lactação e idade adulta da vaca. O teste da razão de verossimilhança foi utilizado na verificação da efetividade da inclusão da interação no modelo. As médias das produções de leite e de gordura foram 6085,79 ± 1629,73 kg e 225,61 ± 60,44 kg, respectivamente. A proporção da variância total decorrente da interação reprodutor x rebanho foi 0,4%, para a produção de leite, e 1%, para a produção de gordura. A estimativa de herdabilidade foi 0,38, para a produção de leite, utilizando-se ambos os modelos, e reduziu de 0,40 para 0,39, para a produção de gordura, quando o modelo com interação foi considerado. A função de verossimilhança aumentou significativamente com a inclusão da interação no modelo. A correlação de Spearman foi próxima de um para ambas as características, quando todos os reprodutores foram considerados. Houve redução de 1% na estimativa de acurácia dos valores genéticos preditos para ambas as características, porém, a correlação de Pearson estimada entre as acurácias obtidas para cada modelo estudado foi próxima à unidade. A interaçãoreprodutor x rebanho não afetou as estimativas de componentes de variâncias genética e residual e a ordem de classificação dos reprodutores para ambas as características.

Herdabilidades para ganho de peso da desmama ao sobreano e perímetro escrotal ao sobreano e tendências genética e fenotípica para ganho de peso da desmama ao sobreano em bovinos Nelore-Angus

Com o objetivo de estimar herdabilidades para ganho de peso médio diário da desmama ao sobreano (GMDDS) e para perímetro escrotal ao sobreano (PES) e tendências genética e fenotípica para GMDDS, foram utilizados 47.668 registros de peso e de ganho de peso de uma população multirracial Nelore-Angus, coletados entre 1991 e 2001 em diversas regiões do Brasil. Os dados foram analisados pelo método REML e as estimativas das (co)variâncias foram obtidas por meio de um modelo animal, no qual foram considerados fixos os efeitos da composição racial do animal (obtida pela concatenação do percentual da raça Nelore do próprio animal, de seu pai e de sua mãe) e do grupo de contemporâneos pós-desmama (animais nascidos no mesmo rebanho, ano, época e pertencentes ao mesmo sexo e grupo de manejo) e, como aleatórios, os efeitos genético aditivo direto e residual. A herdabilidade para PES foi estimada utlizando-se o mesmo modelo, acrescido dos efeitos fixos do peso e da idade do animal ao sobreano (covariáveis). As médias para idade nas pesagens foram 215 e 528 dias para a desmama e o sobreano, respectivamente. A herdabilidade estimada para GMDDS foi 0,44 ± 0,02 e para PES, 0,22 ± 0,08. A tendência genética anual predita para GMDDS foi decrescente até 1996 e crescente a partir desse período. A tendência fenotípica anual foi de 9,4 g/dia/ano.

Parâmetros e tendências da produção de leite em bubalinos da raça Murrah no Brasil

Objetivou-se estimar os parâmetros e avaliar as tendências genética e fenotípica para a produção de leite ajustada aos 305 dias em bubalinos da raça Murrah nascidos no período de 1982 a 2003. Os parâmetros e os valores genéticos foram estimados por meio do aplicativo MTDFREML. A tendência genética foi estimada pela regressão dos valores genéticos sobre o ano de nascimento, por duas metodologias: 1) regressão linear; 2) regressão por meio de polinômios articulados utilizando-se a função de alisamento spline. A herdabilidade e a repetibilidade estimadas foram de 0,20 e 0,36, respectivamente. As tendências (regressão linear) fenotípica e genética foram significativas e iguais a 32,86 e 0,85 kg/ano, respectivamente. O ganho genético foi positivo, constatando-se instabilidade na tendência genética no decorrer dos anos, com períodos de ganhos e outros de perdas genéticas. A maior parte do ganho observado em alguns períodos resultou de melhorias nas condições ambientais.

Study of stayability in Nellore cows using a threshold model

The objectives of the current study were to assess the feasibility of using stayability traits to improve fertility of Nellore cows and to examine the genetic relationship among the stayabilities at different ages. Stayability was defined as whether a cow calved every year up to the age of 5 (Stay5), 6 (Stay6), or 7 (Stay7) yr of age or more, given that she was provided the opportunity to breed. Data were analyzed based on a maximum a posteriori probit threshold model to predict breeding values on the liability scale, whereas the Gibbs sampler was used to estimate variance components. The EBV were obtained using all animals included in the pedigree or bulls with at least 10 daughters with stayability observations, and average genetic trends were obtained in the liability and transformed to the probability scale. Additional analyses were performed to study the genetic relationship among stayability traits, which were compared by contrasting results in terms of EBV and the average genetic superiority as a function of the selected proportion of sires. Heritability estimates and SD were 0.25 +/- 0.02, 0.22 +/- 0.03, and 0.28 +/- 0.03 for Stay5, Stay6, and Stay7, respectively. Average genetic trends, by year, were 0.51 +/- 0.34, and 0.38% for Stay5, Stay6, and Stay7, respectively. Estimates of EBV SD, in the probability scale, for all animals included in the pedigree and for bulls with at least 10 daughters with stayability observations were 7.98 and 12.95, 6.93 and 11.38, and 8.24 and 14.30% for Stay5, Stay6, and Stay7, respectively. A reduction in the average genetic superiorities in Stay7 would be expected if the selection were based on Stay5 or Stay6. Nonetheless, the reduction in EPD, depending on selection intensity, is on average 0.74 and 1.55%, respectively. Regressions of the sires' EBV for Stay5 and Stay6 on the sires' EBV for Stay7 confirmed these results. The heritability and genetic trend estimates for all stayability traits indicate that it is possible to improve fertility with selection based on a threshold analysis of stayability. The SD of EBV for stayability traits show that there is adequate genetic variability among animals to justify inclusion of stayability as a selection criterion. The potential linear relationship among stayability traits indicates that selection for improved female traits would be more effective by having predictions on the Stay5 trait.

Buffalos milk yield analysis using random regression models

Data comprising 1,719 milk yield records from 357 females (predominantly Murrah breed), daughters of 110 sires, with births from 1974 to 2004, obtained from the Programa de Melhoramento Genetic de Bubalinos (PROMEBUL) and from records of EMBRAPA Amazonia Oriental - EAO herd, located in Belem, Para, Brazil, were used to compare random regression models for estimating variance components and predicting breeding values of the sires. The data were analyzed by different models using the Legendre's polynomial functions from second to fourth orders. The random regression models included the effects of herd-year, month of parity date of the control; regression coefficients for age of females (in order to describe the fixed part of the lactation curve) and random regression coefficients related to the direct genetic and permanent environment effects. The comparisons among the models were based on the Akaike Infromation Criterion. The random effects regression model using third order Legendre's polynomials with four classes of the environmental effect were the one that best described the additive genetic variation in milk yield. The heritability estimates varied from 0.08 to 0.40. The genetic correlation between milk yields in younger ages was close to the unit, but in older ages it was low.

Estimativas de (Co)Variâncias e Tendências Genéticas para Pesos em um Rebanho Canchim

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Abordagens freqüentista e bayesiana para avaliação genética de bovinos da raça Canchim para características de crescimento

This study aimed to: a) to compare the covariance components obtained by Restricted Maximum Likelihood (REML) and by bayesian inference (BI): b) to run genetic evaluations for weights of Canchim cattle measured at weaning (W240) and at eighteen months of age (W550), adjusted or not to 240 and 550 days of age, respectively, using the mixed model methodology with covariance components obtained by REML or by BI; and c) to compare selection decisions from genetic evaluations using observed or adjusted weights and by REML or BI. Covariance components, heritabilities and genetic correlation for W240 and W550 were estimated and the predicted breeding values were used to select 10% and 50% of the best bulls and cows, respectively. The covariance components obtained by REML were smaller than the a posteriori means obtained by Bl. Selected animals from both procedures were not the same, probably because the covariance components and genetic parameters were different. The inclusion of age of animal at weighing as a covariate in the statistical model fitted by BI did not change the selected bulls and cows.

Two-Way Selection for Daily Gain and Feed Conversion in a Composite Rabbit Population

We conducted a two-way selection experiment in a composite rabbit population to investigate the responses to selection for postweaning ADG and feed conversion (FC). Two generations of crossing, followed by four generations of random pair matings, preceded three generations of selection. Selection was practiced within four lines: high-feed conversion (HFC), low-feed conversion (LFC), high gain (HG), and low gain (LG). Data on 1,446 rabbits from the random mating and selection generations were fitted to an animal model to estimate heritabilities of and the genetic correlation between ADG and FC. The two-trait model included rabbit and common litter random effects and line, generation, and sex fixed effects. Estimates of heritability of ADG and FC were .48 and .29, respectively, and the genetic correlation between them was -.82. Common litter environmental effects accounted for a proportion of .11 and . 13 of the phenotypic variation of the two traits, respectively. For ADG (in g/d) the regressions of mean breeding values on generation number during the selection period were 1.23 ± .12 (P < .01) in the HG line and -.86 ± .12 (P < .01) in the LG line; the regressions for FC (in g feed/g gain) were -.07 ± .01 (P < .01) in the HFC line and .03 ± .01 (P < .05) in the LFC line. Selection for ADG was effective in improving ADG and FC.

Tendências genéticas para características relacionadas à velocidade de crescimento em bovinos nelore na região nordeste do brasil

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Efeito do desbaste seletivo nas estimativas de parâmetros genéticos em progénies de Pinus caribaea Morelet var. hondurensis

The objective of this work was to study the effect of selective thinning on the estimates of genetic parameters in progenies of Pinus caribaea var. hondurensis. The progeny test was installed in June 1986, following a 10 × 10, triple square lattice design, containing ten trees in linear plots in 3.0 × 3.0m spacing. Twelve years after the planting, a selective thinning based on Multi-effect index (selection for DBH) was performed, leaving six trees per plot. The assessments were done in four situations: A (before thinning); B (among thinned trees); C (among remnant trees at 13 years of age) and D (two years after the thinning). The following traits were analyzed: total height (H), diameter at breast height (DBH), volume (VOL), stem form (FOR), foxtail (FT), wood density at 1.3 m (WD1) and wood density at the half height (WD2). The thinning led to increase in the estimates of variability among progenies for VOL and decrease for ALT and DBH. There was a high and positive genetic correlation among the growth traits, mainly between DBH and VOL. The latter remained unchanged after thinning. The narrow-sense heritabilities at the individual level, showed a slight increase while at the family mean level had a reduction with the thinning. The estimates of breeding values increased with the thinning. This may lead to an easier identification of the best progenies in further selection.

Profitability measures of dairy cows

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Estudio cuantitativo de los tiempos en las carreras de purasangre en pistas de tierra y césped en Brasil

This study was conducted to estimate the genetic parameters for race times on turf and dirt tracks of Thoroughbred race horses. Data used were recorded by the Turftotal Ltd. for 343,419 racing performance of 26,713 animals, from January 1992 to January 2003. The model used in analysis included random animal and permanent environmental effects, and age, post position at start, sex and race as fixed effects. The variance and covariance components and the breeding value were estimated using the MTGSAM software. Heritability estimates were 0.29 for time on dirt track and 0.25 for time on turf track, indicating a moderate association between the animals' breeding values and their phenotypic values. Although genetic and environmental variances were smaller in turf tracks, their repeatability was equal to that of dirt (0.56), in terms of the highest estimated phenotypic variance for the latter type of track. The genetic correlation between times on different tracks was high (0.70). Considering the mean breeding value of the progeny of 465 stallions with 10 or more offspring, Spearman's correlation was 0.80, indicating that most Thoroughbred stallions produce offspring suited to both dirt and turf racing tracks.