Ontologia d'aprenentatge en l'àrea de la cirurgia traumatològica

Creació d'una wiki semàntica per l'aprenentatge en l'àrea de la cirurgia traumatològica amb OntoWiki i Semantic MediaWiki.

Web semántica: RDF y SGBD que lo soportan

En aquest treball es fa una breu introducció a la web semàntica i el seu estat actual. S'analitzen els llenguatges que hi ha a la base del munt de recomanacions del World Wide Web Consortium (XML, XML Schema, RDF i RDF Schema) i s'examinen diferents sistemes de gestió de bases de dades que donen suport a les metadades, que són la base de la web semàntica.

Llenguatges de consulta en l'àmbit de la Web Semàntica : Cas d'estudi SPARQL

Aquest projecte s'emmarca dintre la idea de la Web Semàntica. A la primera part introdueix progressivament al tema de la Web Semàntica fins arribar a establir la necessitat de tenir SGBDs. La segon part explota algun dels SGBDs estudiats per realitzar una aplicació web que permeti mostrar alguna aplicació de la Web Semàntica.

Estudi del concepte d'ontologia i del llenguatge RDF : Aplicació a l'arqueologia

L'objectiu final d'aquest treball és conèixer i entendre l'anotació semàntica en pàgines web a partir d'un estudi de recerca i d'un cas pràctic.

Estudi de com OWL amplia la funcionalitat d' RDF i aquest, a la vegada d' XML.

L'objectiu general d'aquest treball és conèixer el concepte de web semàntica i aprofundir-hi, i també entendre els principis bàsics d'algunes de les tecnologies en què recolza: les ontologies, l'XML, l'RDF i l'OWL.

XML i Web Semàntica

En aquest treball es realitza una descripció dels llenguatges que constitueixen la base de la construcció de la Web Semàntica: l'XML, l'RDF i l'OWL. En concret, es realitza un estudi de la base de dades lèxica WordNet. Finalment, es presenta el disseny i la implementació d'una ontologia per representar les relacions lèxiques dels mots del català. A partir d'aquesta ontologia es crea una petita base de dades basada en la temàtica dels animals de companyia. Aquest cas pràctic permet extreure conclusions sobre els avantatges d'introduir metadades en els documents electrònics, i sobre les facilitats que ofereixen les aplicacions actuals pel desenvolupament d'aquest tipus de documents.

Llenguatges de consulta per documents RDF

Els objectius principals d'aquest projecte són analitzar i descartar algunes dels llenguatges de consulta, gestors relacionals i reposadors que s'estan utilitzant més habitualment en l'entorn de la Web Semàntica. Amb l'estudi de les principals tecnologies implicades en la Web Semàntica es tractarà de realitzar una aplicació que permeti el maneig de dades d'un graf RDF.

Plasma membrane cyclic nucleotide gated calcium channels control land plant thermal sensing and acquired thermotolerance.

Typically at dawn on a hot summer day, land plants need precise molecular thermometers to sense harmless increments in the ambient temperature to induce a timely heat shock response (HSR) and accumulate protective heat shock proteins in anticipation of harmful temperatures at mid-day. Here, we found that the cyclic nucleotide gated calcium channel (CNGC) CNGCb gene from Physcomitrella patens and its Arabidopsis thaliana ortholog CNGC2, encode a component of cyclic nucleotide gated Ca(2+) channels that act as the primary thermosensors of land plant cells. Disruption of CNGCb or CNGC2 produced a hyper-thermosensitive phenotype, giving rise to an HSR and acquired thermotolerance at significantly milder heat-priming treatments than in wild-type plants. In an aequorin-expressing moss, CNGCb loss-of-function caused a hyper-thermoresponsive Ca(2+) influx and altered Ca(2+) signaling. Patch clamp recordings on moss protoplasts showed the presence of three distinct thermoresponsive Ca(2+) channels in wild-type cells. Deletion of CNGCb led to a total absence of one and increased the open probability of the remaining two thermoresponsive Ca(2+) channels. Thus, CNGC2 and CNGCb are expected to form heteromeric Ca(2+) channels with other related CNGCs. These channels in the plasma membrane respond to increments in the ambient temperature by triggering an optimal HSR, leading to the onset of plant acquired thermotolerance.

RDF i Web Semàntica

En aquest treball s'explica el concepte de Web Semàntica, junt amb la seva estructura i els diferents termes relacionats amb aquesta idea. A més, es fa especial atenció al paper dels sistemes gestors de bases de dades en aquest camp, tenint en compte sobretot el nivell de compatibilitat que ofereixen aquests per a tracta dades en notació RDF, basada en el llenguatge XML.

Aplicació de la Web Semàntica : Anotació semàntica de pàgines Web

Aquest treball, basant-se en una aplicació concreta d'aquest concepte de web semàntic anomenada anotació semàntica de pàgines web, presenta els conceptes i els elements propis, com ara les ontologies i els llenguatges semàntics, i també un cas pràctic de disseny i desenvolupament d'una ontologia i una anotació semàntica de les pàgines d'un web a partir de l'ontologia creada.

Effector function of human tumor-specific CD8 T cells in melanoma lesions: a state of local functional tolerance.

Although tumor-specific CD8 T-cell responses often develop in cancer patients, they rarely result in tumor eradication. We aimed at studying directly the functional efficacy of tumor-specific CD8 T cells at the site of immune attack. Tumor lesions in lymphoid and nonlymphoid tissues (metastatic lymph nodes and soft tissue/visceral metastases, respectively) were collected from stage III/IV melanoma patients and investigated for the presence and function of CD8 T cells specific for the tumor differentiation antigen Melan-A/MART-1. Comparative analysis was conducted with peripheral blood T cells. We provide evidence that in vivo-priming selects, within the available naive Melan-A/MART-1-specific CD8 T-cell repertoire, cells with high T-cell receptor avidity that can efficiently kill melanoma cells in vitro. In vivo, primed Melan-A/MART-1-specific CD8 T cells accumulate at high frequency in both lymphoid and nonlymphoid tumor lesions. Unexpectedly, however, whereas primed Melan-A/MART-1-specific CD8 T cells that circulate in the blood display robust inflammatory and cytotoxic functions, those that reside in tumor lesions (particularly in metastatic lymph nodes) are functionally tolerant. We show that both the lymph node and the tumor environments blunt T-cell effector functions and offer a rationale for the failure of tumor-specific responses to effectively counter tumor progression.

Membrane fluidization triggers membrane remodeling which affects the thermotolerance in Escherichia coli.

Treatment of Escherichia coli with non-lethal doses of heat or benzyl alcohol (BA) causes transient membrane fluidization and permeabilization, and induces the rapid transcription of heat-shock genes in a sigma32-dependent manner. This early response is followed by a rapid adaptation (priming) of the cells to otherwise lethal elevated temperature, in strong correlation with an observed remodeling of the composition and alkyl chain unsaturation of membrane lipids. The acquisition of cellular thermotolerance in BA-primed cells is unrelated to protein denaturation and is not accompanied by the formation of major heat-shock proteins, such as GroEL and DnaK. This suggests that the rapid remodeling of membrane composition is sufficient for the short-term bacterial thermotolerance.

Llenguatges de consulta en l'àmbit de la Web Semàntica : Cas d'estudi SPARQL

El projecte es basa en estudiar i avaluar diferents sistemes gestors de bases de dades (SGBD) per desar informació dins del context de la Web Semàntica., tal com es veurà en el capítol 4. La Web Semàntica permet dotar de significat al contingut textual de la web, permetent que sigui interpretable per una màquina.

Estudi dels llenguatges de consulta per a documents RDF

Aquest treball aporta una visió general de la Web Semàntica i alhora n'estudia en suficient detall les principals tecnologies relacionades. Com a objectiu final per comprovar de forma pràctica la teoria descrita, l'aplicació web permet consultar bases de dades RDF mitjançant el llenguatge de consulta SPARQL.

Creació d'una ontologia universal

L'objectiu d'aquest treball és introduir al lector en les tecnologies que condueixen al desenvolupament de la web semàntica, destacant-ne les parts més importants d'aquestes i veient com cadascuna amplia la funcionalitat de la seva predecessora a l'hora d'aportar un sentit semàntic als documents.