Everything that rises must converge: a neo-Marxist analysis of Canadian business-government relations

The following thesis presents an analysis of business-government relations within a neo-Marxist framework. Specifically, the discussion encompasses how the business interest group. the Business Council on National Issues, maintains consensus and unity amongst its monopoly capital members. Furthermore. the study elaborates on the process through which the group's interests are acknowledged and legitimized by the state under the "public interest" f8fue. Most of the literature pertaining to business-government relations within the context of interactions between business interest groups and the state, and such specific branches of the state as the government and/or the civil service. emphasize a liberal-pluralist perspective. Essentially, these writings serve to reflect and legitimate the current slatus quo. Marxist discourses on the subject, while attempting to transcend the liberal-pluralist framework. nevertheless suffer from either economic determinism .. ie., stressing the state's accumulation function but not its legitimation function or historical specificity. A cogent and comprehensive neo-Marxist analysis of business-government relations must discuss both the accumulation and legitimation functions of the state. The process by which the concerns of a particular business interest group become part of the state's policy agenda and subsequently are formulated and implemented into policies which legitimate its dominance is also studied. This inquiry is significant given the liberal-pluralist assumptions of a neutral state and that all interest groups compete "on a level playing field". The author's neo-Marxist paradigm rejects both of these assumptions. Building on concepts from nea-Marxist instrumentalism. structuralism. state monopoly capitalism, and forms and functions of the state perspectives. the author proposes that policies which legitimize the interests of the monopoly capital fraction cannot. be discerned only from the state's activities. per StJ. Clearly, if the liberal-pluralist 3 contention of multiple and conflicting interest groups, including those within the capitalist class, is taken at face value, M interest group such as the Business Council on National Issues (BCND, must somehow maintain. internal consensus Md unity amongst its members. Internal consensus amongst its members ensures that the state can better acknowledge and articulate its concerns into policies that maintain hegemonic dominance of the monopoly capital fraction under the "public interest" fllf.JJdq. The author contends that the BCNI focuses most of its interactions on the upper echelons of the civil service since it is this branch of the state which is most responsible for policy formulation and implementation. The author's paradigm is applied within the context of extensively analyzing newspaper coverage. BCN! publications, and other published sources, as well as a personal interview with an executive administrative member of the BeNI. The discussion focuses on how agreement and unity amongst the various interests of the monopoly capital fraction are maintained through the business organization, its policy scope, and finally its interactions with the state. The analysis suggests that while the civil service is an important player in expressing the interests of the BCNI's membership through policies which ostensibly also reflect the "public interest", it is not the only strategic target for the BCNI's interactions with the state. The author's research also highlights the importance of government officials at the Cabinet level and Cabinet Committees. Senior elected officials from the Federal government are also significant in avoiding intergovernmental or interprovincial conflict in implementing policies that legitimize hegemonic dominance of the monopoly capital fraction over other fractions and classes.

A Foucaultian analysis of power relations in child protection case work with youth and families

This thesis takes some steps in examining the child protection system from a position that is rarely discussed. Specifically, I explore how Foucault's concept of disciplinary power can be used to demonstrate how power operates within the client/worker relationship. This relationship is shown to be quite complex with power flowing bidirectionally, rather than hierarchically. Instead of viewing power imbalances as a function of state control, I show how the client/worker relationship is constituted by the worker, the client, the organization and the social body. A postmodern auto ethnography is used to document my journey as I expose the disciplinary practices and instruments that I was subject to and used with my clients. 2 Given that the child protection system is constantly shifting and changing in order to improve its ability to safeguard children a greater emphasis is required to examine how workers operate within this complex, overwhelming and multi-dimensional world. This thesis has shown that by engaging in a reflexive examination of my position of power different approaches to making intervention beneficial to all involved become available. This is important if child protection work aims to work with clients rather than on clients.

The structure of arabidopsis NPR1 : its function as a salicylic acid receptor and a metal-binding protein

The Arabidopsis NPRI protein regulates systemic acquired resistance dependent on salicylic acid. Analyses by plant two-hybrid analysis in vivo and pull-down assays in vitro showed that the BTB/POZ domain of NPRI at the N-terminus serves as an autoinhibitory domain to negate the function of the transactivation domain at the C-terminus through direct binding of these two domains. I t was also shown that the binding of the BTB/POZ domain to the C-terminus of NPRI was abolished by SA treatment, suggesting that SA could interfere directly with this binding. By gel filtration, it was demonstrated that SA affects the conformation of full-length NPRl , confirming the role of NPRI as an SA receptor. Gel filtration analysis also indicated that NPRI could be converted from an oligomer to a dimer with SA treatment. Furthermore, one N-terminal deletion ~513 has been shown to act as a metal-binding protein and its two Cys-521 and Cys-529 are important for binding to Ni 2 + by pull-down assays.

Sarcolemmal lipid analysis from mechanically skinned rat muscle fibres.

Membrane lipid composition, which includes phospholipid (PL) headgroup, and fatty acid (FA) saturation, has been shown to affect cellular function. The sarcolemma (SL) membrane is integral to skeletal muscle function and health. Previous studies assessing SL lipid composition are limited as they have 1) restricted analysis to a PL level and neglected FA composition and 2) relied on aggressive membrane isolation procedures resulting in t-tubule and sarcoplasmic reticulum contamination and unknown levels of nuclear and mitochondrial contamination. Thus, to overcome these limitations, this study assessed a method of individually skinned skeletal muscle fibres as an alternative to analyze complete sarcolemmal membrane lipid composition. The major findings of this study were 1) complete SL lipid composition can be obtained 2) the SL had higher sphingomyelin content than previous studies and 3) the SL membrane had minimal nuclear and mitochondrial contamination and was void of contamination from sarcoplasmic reticulum and t-tubules.

Functional analysis and treatment of OCD-related behaviour in a child with Autism Spectrum Disorder

Research indicates that Obsessive-Compulsive Disorder (OCD; DSM-IV-TR, American Psychiatric Association, 2000) is the second most frequent disorder to coincide with Autism Spectrum Disorder (ASD; Leyfer et aI., 2006). Excessive collecting and hoarding are also frequently reported in children with ASD (Berjerot, 2007). Although functional analysis (Iwata, Dorsey, Slifer, Bauman, & Richman, 1982/1994) has successfully identified maintaining variables for repetitive behaviours such as of bizarre vocalizations (e.g., Wilder, Masuda, O'Connor, & Baham, 2001), tics (e.g., Scotti, Schulman, & Hojnacki, 1994), and habit disorders (e.g., Woods & Miltenberger, 1996), extant literature ofOCD and functional analysis methodology is scarce (May et aI., 2008). The current studies utilized functional analysis methodology to identify the types of operant functions associated with the OCD-related hoarding behaviour of a child with ASD and examined the efficacy of function-based intervention. Results supported hypotheses of automatic and socially mediated positive reinforcement. A corresponding function-based treatment plan incorporated antecedent strategies and differential reinforcement (Deitz, 1977; Lindberg, Iwata, Kahng, and DeLeon, 1999; Reynolds, 1961). Reductions in problem behaviour were evidenced through use of a multiple baseline across behaviours design and maintained during two-month follow-up. Decreases in symptom severity were also discerned through subjective measures of treatment effectiveness.

The development of a Flanders Interaction Analysis style instrument for use in educational computer mediated communication research

Please consult the paper edition of this thesis to read. It is available on the 5th Floor of the Library at Call Number: Z 9999 E38 D56 1992

The form and function of aggressive subtypes: Relations with the goodness of fit between adolescent temperament and parent personality

The current research investigated whether the interaction between adolescent temperament and parent personality, consistent with the goodness of fit perspective, differentially predicted overt (e.g., kicking, punching, insulting) and relational (e.g., gossiping, rumour spreading, ostracising) forms of reactive (e.g., provoked, a response to goal blocking, unplanned and emotional) and proactive (e.g., unprovoked, goal-directed, deliberate and relatively unemotional) aggression. Mothers, fathers and their adolescent child (N = 448, age 10-17) from southern Ontario, Canada filled out questionnaires on adolescent temperament (i.e., frustration, fear, and effortful control) and aggression. Parents reported on their own personality traits (i.e., agreeableness, conscientiousness, and emotional stability). The form and function of aggression not encompassed by the subtype under investigation were controlled in each regression analysis. Consistent with the hypothesis, results indicated that a poor fit between adolescent temperament vulnerabilities and lower parent personality traits, including agreeableness, conscientiousness and emotional stability, was predictive of greater levels of differentiated aggression. For instance, lower father conscientiousness strengthened the relation between higher frustration and reactive overt aggression. Unexpectedly in some cases, temperament risk factors were more strongly associated with aggression subtypes when personality scores were at higher levels, particularly agreeableness and conscientiousness, traits normally considered to be at the optimal end of the dimension. For example, higher father agreeableness strengthened the relation between higher frustration and reactive relational aggression. At the main effects level, low fearfulness was significantly associated with only the overt subtypes of aggression, and unexpectedly, higher frustration and lower effortful control were related to both proactive and reactive subtypes of aggression. A temperamentally vulnerable adolescent was also at greater risk of displaying aggressive behaviour when the father lacked emotional stability, but not the mother. These results are broadly consistent with the prediction that temperament risk factors are more strongly associated with aggression subtypes when an adolescent predisposition does not fit well with parent personality traits. Mechanisms pertaining to stress in the family environment and the fostering of self-regulation abilities are discussed with respect to why a poor fit between temperament and parent personality is predictive of adolescent differentiated aggression.

Frontal Lobe Function and Performance Monitoring following Total Sleep Deprivation

Imaging studies have shown reduced frontal lobe resources following total sleep deprivation (TSD). The anterior cingulate cortex (ACC) in the frontal region plays a role in performance monitoring and cognitive control; both error detection and response inhibition are impaired following sleep loss. Event-related potentials (ERPs) are an electrophysiological tool used to index the brain's response to stimuli and information processing. In the Flanker task, the error-related negativity (ERN) and error positivity (Pe) ERPs are elicited after erroneous button presses. In a Go/NoGo task, NoGo-N2 and NoGo-P3 ERPs are elicited during high conflict stimulus processing. Research investigating the impact of sleep loss on ERPs during performance monitoring is equivocal, possibly due to task differences, sample size differences and varying degrees of sleep loss. Based on the effects of sleep loss on frontal function and prior research, it was expected that the sleep deprivation group would have lower accuracy, slower reaction time and impaired remediation on performance monitoring tasks, along with attenuated and delayed stimulus- and response-locked ERPs. In the current study, 49 young adults (24 male) were screened to be healthy good sleepers and then randomly assigned to a sleep deprived (n = 24) or rested control (n = 25) group. Participants slept in the laboratory on a baseline night, followed by a second night of sleep or wake. Flanker and Go/NoGo tasks were administered in a battery at 1O:30am (i.e., 27 hours awake for the sleep deprivation group) to measure performance monitoring. On the Flanker task, the sleep deprivation group was significantly slower than controls (p's <.05), but groups did not differ on accuracy. No group differences were observed in post-error slowing, but a trend was observed for less remedial accuracy in the sleep deprived group compared to controls (p = .09), suggesting impairment in the ability to take remedial action following TSD. Delayed P300s were observed in the sleep deprived group on congruent and incongruent Flanker trials combined (p = .001). On the Go/NoGo task, the hit rate (i.e., Go accuracy) was significantly lower in the sleep deprived group compared to controls (p <.001), but no differences were found on false alarm rates (i.e., NoGo Accuracy). For the sleep deprived group, the Go-P3 was significantly smaller (p = .045) and there was a trend for a smaller NoGo-N2 compared to controls (p = .08). The ERN amplitude was reduced in the TSD group compared to controls in both the Flanker and Go/NoGo tasks. Error rate was significantly correlated with the amplitude of response-locked ERNs in control (r = -.55, p=.005) and sleep deprived groups (r = -.46, p = .021); error rate was also correlated with Pe amplitude in controls (r = .46, p=.022) and a trend was found in the sleep deprived participants (r = .39, p =. 052). An exploratory analysis showed significantly larger Pe mean amplitudes (p = .025) in the sleep deprived group compared to controls for participants who made more than 40+ errors on the Flanker task. Altered stimulus processing as indexed by delayed P3 latency during the Flanker task and smaller amplitude Go-P3s during the Go/NoGo task indicate impairment in stimulus evaluation and / or context updating during frontal lobe tasks. ERN and NoGoN2 reductions in the sleep deprived group confirm impairments in the monitoring system. These data add to a body of evidence showing that the frontal brain region is particularly vulnerable to sleep loss. Understanding the neural basis of these deficits in performance monitoring abilities is particularly important for our increasingly sleep deprived society and for safety and productivity in situations like driving and sustained operations.

Effects of Cerebral Blood Flow and PETCO2 on Cognitive Function During Passive Heat Stress

This thesis tested whether cognitive performance during passive heat stress may be affected by changes in cerebrovascular variables as opposed to strictly thermally-induced changes. A pharmacological reduction in cerebral blood flow (CBF) using indomethacin along with a hypocapnia-induced CBF reduction during passive heat stress (Tre ~1.5°C above baseline) were used to investigate any cerebrovascular-mediated changes in cognitive performance. Repeated measures analysis of variance indicated that One-Touch Stockings of Cambridge (OTS) performance was not affected by a significant reduction in CBF during passive heat stress. More specifically, OTS accuracy measures did not change as a result of either a reduction in CBF or increasing passive heat stress. However, it was found that OTS response time indices improved with increasing passive heat stress independent of CBF changes. In conclusion, a significant reduction in CBF does not cause additional changes in performance of an executive functioning task during severe passive heat stress.

Bayesian Analysis for a Theory of Random Consumer Demand: The Case of Indivisible Goods

McCausland (2004a) describes a new theory of random consumer demand. Theoretically consistent random demand can be represented by a \"regular\" \"L-utility\" function on the consumption set X. The present paper is about Bayesian inference for regular L-utility functions. We express prior and posterior uncertainty in terms of distributions over the indefinite-dimensional parameter set of a flexible functional form. We propose a class of proper priors on the parameter set. The priors are flexible, in the sense that they put positive probability in the neighborhood of any L-utility function that is regular on a large subset bar(X) of X; and regular, in the sense that they assign zero probability to the set of L-utility functions that are irregular on bar(X). We propose methods of Bayesian inference for an environment with indivisible goods, leaving the more difficult case of indefinitely divisible goods for another paper. We analyse individual choice data from a consumer experiment described in Harbaugh et al. (2001).

In silico analysis of mitochondrial proteins

Le rôle important joué par la mitochondrie dans la cellule eucaryote est admis depuis longtemps. Cependant, la composition exacte des mitochondries, ainsi que les processus biologiques qui sy déroulent restent encore largement inconnus. Deux facteurs principaux permettent dexpliquer pourquoi létude des mitochondries progresse si lentement : le manque defficacité des méthodes didentification des protéines mitochondriales et le manque de précision dans lannotation de ces protéines. En conséquence, nous avons développé un nouvel outil informatique, YimLoc, qui permet de prédire avec succès les protéines mitochondriales à partir des séquences génomiques. Cet outil intègre plusieurs indicateurs existants, et sa performance est supérieure à celle des indicateurs considérés individuellement. Nous avons analysé environ 60 génomes fongiques avec YimLoc afin de lever la controverse concernant la localisation de la bêta-oxydation dans ces organismes. Contrairement à ce qui était généralement admis, nos résultats montrent que la plupart des groupes de Fungi possèdent une bêta-oxydation mitochondriale. Ce travail met également en évidence la diversité des processus de bêta-oxydation chez les champignons, en corrélation avec leur utilisation des acides gras comme source dénergie et de carbone. De plus, nous avons étudié le composant clef de la voie de bêta-oxydation mitochondriale, lacyl-CoA déshydrogénase (ACAD), dans 250 espèces, couvrant les 3 domaines de la vie, en combinant la prédiction de la localisation subcellulaire avec la classification en sous-familles et linférence phylogénétique. Notre étude suggère que les gènes ACAD font partie dune ancienne famille qui a adopté des stratégies évolutionnaires innovatrices afin de générer un large ensemble denzymes susceptibles dutiliser la plupart des acides gras et des acides aminés. Finalement, afin de permettre la prédiction de protéines mitochondriales à partir de données autres que les séquences génomiques, nous avons développé le logiciel TESTLoc qui utilise comme données des Expressed Sequence Tags (ESTs). La performance de TESTLoc est significativement supérieure à celle de tout autre outil de prédiction connu. En plus de fournir deux nouveaux outils de prédiction de la localisation subcellulaire utilisant différents types de données, nos travaux démontrent comment lassociation de la prédiction de la localisation subcellulaire à dautres méthodes danalyse in silico permet daméliorer la connaissance des protéines mitochondriales. De plus, ces travaux proposent des hypothèses claires et faciles à vérifier par des expériences, ce qui présente un grand potentiel pour faire progresser nos connaissances des métabolismes mitochondriaux.

Non-negative matrix decomposition approaches to frequency domain analysis of music audio signals

On étudie l’application des algorithmes de décomposition matricielles tel que la Factorisation Matricielle Non-négative (FMN), aux représentations fréquentielles de signaux audio musicaux. Ces algorithmes, dirigés par une fonction d’erreur de reconstruction, apprennent un ensemble de fonctions de base et un ensemble de coef- ficients correspondants qui approximent le signal d’entrée. On compare l’utilisation de trois fonctions d’erreur de reconstruction quand la FMN est appliquée à des gammes monophoniques et harmonisées: moindre carré, divergence Kullback-Leibler, et une mesure de divergence dépendente de la phase, introduite récemment. Des nouvelles méthodes pour interpréter les décompositions résultantes sont présentées et sont comparées aux méthodes utilisées précédemment qui nécessitent des connaissances du domaine acoustique. Finalement, on analyse la capacité de généralisation des fonctions de bases apprises par rapport à trois paramètres musicaux: l’amplitude, la durée et le type d’instrument. Pour ce faire, on introduit deux algorithmes d’étiquetage des fonctions de bases qui performent mieux que l’approche précédente dans la majorité de nos tests, la tâche d’instrument avec audio monophonique étant la seule exception importante.

The role of NHL-2 in regulating C.elegans P granule function

La divison cellulaire asymétrique est un processus essentiel qui permet aux cellules souches de s’auto-renouveller et de produire une cellule fille destinée à la différenciation. La lignée germinale de C. elegans, totipotente et immortelle, est une lignée de cellules souches qui contient des organites ribonucléoprotéiques appelés granules P. Au cours du développement ces derniers sont toujours localisés spécifiquement dans les cellules précurseurs de la lignée germinals, suggérant qu’ils sont des déterminants de la lignée germinale. De façon intéressante, des granules ribonucléoprotéiques, comme les P bodies impliqués dans le contrôle post-transcriptionnel, ont été observés chez tous les organismes. Néanmoins, la fonction précise des granules P de C. elegans est inconnue. Récemment, notre laboratoire a montré que NHL-2, un homologue de Mei-P26 de Drosophile, colocalise avec les granules P dans des embryons précoces et joue un rôle dans la division cellulaire asymétrique et dans la polarité cellulaire. Tous les granules P contiennent NHL- 2, ce qui nous a mené à poser l’hypothèse que NHL-2 régule la biogenèse et la fonction des granules P. Nous avons testé cette hypothèse par imagerie et quantification de l'intensité de PGL-1, un composant essentiel des granules P, dans des embryons fixés. Nos résultats montrent que dans des embryons mutants pour nhl-2 il y a une réduction du nombre de granules P, de l'intensité de fluorescence moyenne (IFM) et de l'intensité de fluorescence total (IFT) de PGL-1. Une analyse plus poussée a montré qu'il existe deux populations distinctes d’embryons mutants pour nhl-2 : l’une présente une intensité de PGL-1 comparable à celle d’une population sauvage alors que le second groupe présente une forte réduction des quantités de PGL-1 et est comparable à des mutants pour pgl-1. Cette variabilité est aussi observée dans le phénotype de stérilité de nhl-2 mutant à des températures élevées. Globalement, nos résultats suggèrent que la perte de fonction de NHL-2 perturbe la prolifération des cellules germinales ainsi que la formation et/ou la stabilité des granules P au cours des étapes précoces du développement des précurseurs de la lignée germinals. D’autre part, ils suggèrent que la fonction de NHL-2 pourrait être partiellement redondants avec les autres régulateurs de la stabilité des granules P. Mots-clés : Granules P, NHL-2, Cellules germinals.

Bcl-xL regulation and function in cell cycle checkpoints and progression

Quelques évidences suggèrent que Bcl-xL, un membre anti-apoptotique de la famille Bcl-2, possède également des fonctions au niveau du cycle cellulaire et de ses points-contrôle. Pour étudier la régulation et fonction de Bcl-xL au cours du cycle cellulaire, nous avons généré et exprimé dans des cellules humaines une série de mutants de phosphorylation incluant Thr41Ala, Ser43Ala, Thr47Ala, Ser49Ala, Ser56Ala, Ser62Ala et Thr115Ala. L'analyse de cette série de mutants révèle que les cellules exprimant Bcl-xL(Ser62Ala) sont moins stables au point-contrôle G2 du cycle cellulaire comparées aux cellules exprimant le type sauvage ou les autres mutants de phosphorylation incluant Thr41Ala, Ser43Ala, Thr47Ala, Ser56Ala et Thr115Ala. Les études de cinétiques de phosphorylation et de localisation de phospho-Bcl-xL(Ser62) dans des cellules synchronisées et suite à l'activation du point-contrôle en G2 médié par l'étoposide (VP16), nous indiquent que phospho-Bcl-xL(Ser62) migre dans les corps nucléolaires durant l'arrêt en G2 dans les cellules exposées au VP16. Une série d'expériences incluant des essais kinase in vitro, l'utilisation d'inhibiteurs pharmacologiques et d'ARN interférant, nous révèlent que Polo kinase 1 (PLK1) et MAPK9/JNK2 sont les protéines kinase impliquées dans la phosphorylation de Bcl-xL(Ser62), et pour son accumulation dans les corps nucléolaires pendant le point-contrôle en G2. Nos résultats indiquent que durant le point-contrôle en G2, phospho-Bcl-xL(Ser62) se lie et se co-localise avec CDK1(CDC2), le complexe cycline-kinase qui contrôle l'entrée en mitose. Nos résultats suggèrent que dans les corps nucléolaires, phospho-Bcl-xL(Ser62) stabilise l'arrêt en G2 en séquestrant CDK1(CDC2) pour retarder l'entrée en mitose. Ces résultats soulignent également que les dommages à l'ADN influencent la composition des corps nucléolaires, structure nucléaire qui émerge maintenant comme une composante importante de la réponse aux dommages à l'ADN. Dans une deuxième étude, nous décrivons que les cellules exprimant le mutant de phosphorylation Bcl-xL(Ser62Ala) sont également plus stables au point-contrôle de l'assemblage du fuseau de la chromatine (SAC) suite à une exposition au taxol, comparées aux cellules exprimant le type sauvage ou d'autres mutants de phosphorylation de Bcl-xL, incluant Thr41Ala, Ser43Ala, Thr47Ala, Ser56Ala. Cet effet est indépendent de la fonction anti-apoptotique de Bcl-xL. Bcl-xL(Ser62) est fortement phosphorylé par PLK1 et MAPK14/SAPKp38α à la prométaphase, la métaphase et à la frontière de l'anaphase, et déphosphorylé à la télophase et la cytokinèse. Phospho-Bcl-xL(Ser62) se trouve dans les centrosomes avec γ-tubuline, le long du fuseau mitotique avec la protéine moteure dynéine et dans le cytosol mitotique avec des composantes du SAC. Dans des cellules exposées au taxol, phospho-Bcl-xL(Ser62) se lie au complexe inhibiteur CDC20/MAD2/BUBR1/BUB3, alors que le mutant Bcl-xL(Ser62Ala) ne se lie pas à ce complexe. Ces résultats indiquent que durant le SAC, la phosphorylation de Bcl-xL(Ser62) accélère la résolution du SAC et l'entrée des cellules en anaphase. Des expériences bloquant l'expression de Bcl-xL révèlent ègalement un taux très élevé de cellules tétraploïdes et binuclées après un traitement au nocodazole, consistant avec une fonction de Bcl-xL durant la mitose et dans la stabilité génomique. Dans la troisième étude, l'analyse fonctionnelle de cette série de mutants de phosphorylation indique également que les cellules exprimant Bcl-xL(Ser49Ala) sont moins stables durant le point-contrôle G2 et entre en cytokinèse plus lentement dans des cellules exposées aux inhibiteurs de la polymérisation/dépolymérisation des tubulines, composantes des microtubules. Ces effets de Bcl-xL(Ser49Ala) sont indépendents de sa fonction anti-apoptotique. La phosphorylation de Bcl-xL(Ser49) est dynamique au cours du cycle cellulaire. Dans des cellules synchronisées, Bcl-xL(Ser49) est phosphorylé en phase S et G2, déphosphorylé à la prométaphase, la métaphase et à la frontière de l'anaphase, et re-phosphorylé durant la télophase et la cytokinèse. Au cours du point-contrôle G2 induit par les dommages à l'ADN, un pool important de phospho-Bcl-xL(Ser49) se trouve aux centrosomes, un site important pour la régulation de l'entrée en mitose. Durant la télophase et la cytokinèse, phospho-Bcl-xL(Ser49) se trouve le long des microtubules avec la protéine moteure dynéine et dans le cytosol mitotique. Finalement, nos résultats suggèrent que PLK3 est responsable de la phosphorylation de Bcl-xL(Ser49), une protéine kinase impliquée pour l'entrée des cellules en mitose et pour la progression de la mitose jusqu'à la division cellulaire.

Clustering algorithms and shape factor methods to discriminate among small GTPase phenotypes using DIC image analysis.

Naïvement perçu, le processus d’évolution est une succession d’événements de duplication et de mutations graduelles dans le génome qui mènent à des changements dans les fonctions et les interactions du protéome. La famille des hydrolases de guanosine triphosphate (GTPases) similaire à Ras constitue un bon modèle de travail afin de comprendre ce phénomène fondamental, car cette famille de protéines contient un nombre limité d’éléments qui diffèrent en fonctionnalité et en interactions. Globalement, nous désirons comprendre comment les mutations singulières au niveau des GTPases affectent la morphologie des cellules ainsi que leur degré d’impact sur les populations asynchrones. Mon travail de maîtrise vise à classifier de manière significative différents phénotypes de la levure Saccaromyces cerevisiae via l’analyse de plusieurs critères morphologiques de souches exprimant des GTPases mutées et natives. Notre approche à base de microscopie et d’analyses bioinformatique des images DIC (microscopie d’interférence différentielle de contraste) permet de distinguer les phénotypes propres aux cellules natives et aux mutants. L’emploi de cette méthode a permis une détection automatisée et une caractérisation des phénotypes mutants associés à la sur-expression de GTPases constitutivement actives. Les mutants de GTPases constitutivement actifs Cdc42 Q61L, Rho5 Q91H, Ras1 Q68L et Rsr1 G12V ont été analysés avec succès. En effet, l’implémentation de différents algorithmes de partitionnement, permet d’analyser des données qui combinent les mesures morphologiques de population native et mutantes. Nos résultats démontrent que l’algorithme Fuzzy C-Means performe un partitionnement efficace des cellules natives ou mutantes, où les différents types de cellules sont classifiés en fonction de plusieurs facteurs de formes cellulaires obtenus à partir des images DIC. Cette analyse démontre que les mutations Cdc42 Q61L, Rho5 Q91H, Ras1 Q68L et Rsr1 G12V induisent respectivement des phénotypes amorphe, allongé, rond et large qui sont représentés par des vecteurs de facteurs de forme distincts. Ces distinctions sont observées avec différentes proportions (morphologie mutante / morphologie native) dans les populations de mutants. Le développement de nouvelles méthodes automatisées d’analyse morphologique des cellules natives et mutantes s’avère extrêmement utile pour l’étude de la famille des GTPases ainsi que des résidus spécifiques qui dictent leurs fonctions et réseau d’interaction. Nous pouvons maintenant envisager de produire des mutants de GTPases qui inversent leur fonction en ciblant des résidus divergents. La substitution fonctionnelle est ensuite détectée au niveau morphologique grâce à notre nouvelle stratégie quantitative. Ce type d’analyse peut également être transposé à d’autres familles de protéines et contribuer de manière significative au domaine de la biologie évolutive.