Variation of phytoplankton assemblages along the Mozambique coast as revealed by HPLC and microscopy

This study is an integrated overview of pigment and microscopic analysis of phytoplankton communities throughout the Mozambican coast. Collected samples revealed notable patterns of phytoplankton occurrence and distribution, with community structure changing between regions and sample depth. Pigment data showed Delagoa Bight, Sofala Bank and Angoche as the most productive regions throughout the sampled area. In general, micro-sized phytoplankton, particularly diatoms, were important contributors to biomass both at surface and sub-surface maximum (SSM) samples, although were almost absent in the northern stations. In contrast, nano- and pico-sized phytoplankton revealed opposing patterns. Picophytoplankton were most abundant at surface, as opposed to nanophytoplankton, which were more abundant at the SSM. Microphytoplankton were associated with cooler southern water masses, while picophytoplankton were related to warmer northern water masses. Nanophytoplankton were found to increase their contribution to biomass with increasing SSM. Microscopy information on the genera and species level revealed the diatoms Chaetoceros spp., Proboscia alata, Pseudo-nitzschia spp., Cylindrotheca closterium and Hemiaulus haukii as the most abundant taxa of the micro-sized phytoplankton. Discosphaera tubifera and Emiliania huxleyi were the most abundant coccolithophores, nano-sized phytoplankton.

Role of light and photophysiological properties on phytoplankton succession during the spring bloom in the north-western Mediterranean Sea

This study aimed to determine the role of light on the succession of the phytoplankton community during the spring bloom in the northwestern Mediterranean Sea. To this end, three successive Lagrangian experiments were carried out between March and April 2003. The three experiments correspond to distinct phases of the bloom development (pre-bloom, bloom peak and post-bloom, respectively) and therefore to different trophic conditions. Phytoplankton (sampled on a daily scale) was grouped in size-based classes (pico and nano+micro) each of them were characterised in terms of chemotaxonomic composition, primary production and photophysiological properties. The phytoplankton community evolved with time changing in both size-class dominance and specie/group dominance within each size class. The bloom peak was characterised by highly dynamic condition (i.e. vertical mixing) and by the dominance of both small (pico) and large (nano and micro) diatoms, as a result of their capacity to photoacclimate to changing light regimes (‘physiological plasticity’). Concluding, we suggest that the physiological adaptation to light is the main factor driving the succession of the phytoplankton community during the first phases of the bloom (until the onset of thermal stratification) in the western Mediterranean Sea.

Comparison of two methods to derive the size-structure of natural populations of phytoplankton

Various methods have been proposed to estimate the size structure of phytoplankton in situ , each exhibiting limitations and advantages. Two common approaches are size-fractionated filtration (SFF) and analysis of pigments derived from High Performance Liquid Chromatography (HPLC), and yet these two techniques have rarely been compared. In this paper, size-fractionated chlorophylls for pico- (View the MathML source<2μm), nano- (View the MathML source2–20μm) and micro-phytoplankton (View the MathML source>20μm) were estimated independently from concurrent measurements of HPLC and SFF data collected along Atlantic Meridional Transect cruises. Three methods for estimating size-fractionated chlorophyll from HPLC data were tested. Size-fractionated chlorophylls estimated from HPLC and SFF data were significantly correlated, with HPLC data explaining between 40 and 88% of the variability in the SFF data. However, there were significant biases between the two methods, with HPLC methods overestimating nanoplankton chlorophyll and underestimating picoplankton chlorophyll when compared with SFF. Uncertainty in both HPLC and SFF data makes it difficult to ascertain which is more reliable. Our results highlight the importance of using multiple methods when determining the size-structure of phytoplankton in situ, to reduce uncertainty and facilitate interpretation of data.

Absorption-based algorithm of primary production for total and size-fractionated phytoplankton in coastal waters

Most satellite models of production have been designed and calibrated for use in the open ocean. Coastal waters are optically more complex, and the use of chlorophyll a (chl a) as a first-order predictor of primary production may lead to substantial errors due to significant quantities of coloured dissolved organic matter (CDOM) and total suspended material (TSM) within the first optical depth. We demonstrate the use of phytoplankton absorption as a proxy to estimate primary production in the coastal waters of the North Sea and Western English Channel for both total, micro- and nano+pico-phytoplankton production. The method is implemented to extrapolate the absorption coefficient of phytoplankton and production at the sea surface to depth to give integrated fields of total and micro- and nano+pico-phytoplankton primary production using the peak in absorption coefficient at red wavelengths. The model is accurate to 8% in the Western English Channel and 22% in this region and the North Sea. By comparison, the accuracy of similar chl a based production models was >250%. The applicability of the method to autonomous optical sensors and remotely sensed aircraft data in both coastal and estuarine environments is discussed.

Temporal changes in total and size-fractioned chlorophyll-a in surface waters of three provinces in the Atlantic Ocean (September to November) between 2003 and 2010

Phytoplankton total chlorophyll concentration (TCHLa) and phytoplankton size structure are two important ecological indicators in biological oceanography. Using high performance liquid chromatography (HPLC) pigment data, collected from surface waters along the Atlantic Meridional Transect (AMT), we examine temporal changes in TCHLa and phytoplankton size class (PSC: micro-, nano- and pico-phytoplankton) between 2003 and 2010 (September to November cruises only), in three ecological provinces of the Atlantic Ocean. The HPLC data indicate no significant change in TCHLa in northern and equatorial provinces, and an increase in the southern province. These changes were not significantly different to changes in TCHLa derived using satellite ocean-colour data over the same study period. Despite no change in AMT TCHLa in northern and equatorial provinces, significant differences in PSC were observed, related to changes in key diagnostic pigments (fucoxanthin, peridinin, 19′-hexanoyloxyfucoxanthin and zeaxanthin), with an increase in small cells (nano- and pico-phytoplankton) and a decrease in larger cells (micro-phytoplankton). When fitting a three-component model of phytoplankton size structure — designed to quantify the relationship between PSC and TCHLa to each AMT cruise, model parameters varied over the study period. Changes in the relationship between PSC and TCHLa have wide implications in ecology and marine biogeochemistry, and provide key information for the development and use of empirical ocean-colour algorithms. Results illustrate the importance of maintaining a time-series of in-situ observations in remote regions of the ocean, such as that acquired in the AMT programme.

Temporal variability in total, micro- and nano-phytoplankton primary production at a coastal site in the Western English Channel

Primary productivity and subsequent carbon cycling in the coastal zone have a significant impact on the global carbon budget. It is currently unclear how anthropogenic activity could alter these budgets but long term coastal time series of hydrological, biogeochemical and biological measurements represent a key means to better understand past drivers, and hence to predicting future seasonal and inter-annual variability in carbon fixation in coastal ecosystems. An 8-year time series of primary production from 2003 to 2010, estimated using a recently developed absorption-based algorithm, was used to determine the nature and extent of change in primary production at a coastal station (L4) in the Western English Channel (WEC). Analysis of the seasonal and inter-annual variability in production demonstrated that on average, nano- and pico-phytoplankton account for 48% of the total carbon fixation and micro-phytoplankton for 52%. A recent decline in the primary production of nano- and pico-phytoplankton from 2005 to 2010 was observed, corresponding with a decrease in winter nutrient concentrations and a decrease in the biomass of Phaeocystis sp. Micro-phytoplankton primary production (PPM) remained relatively constant over the time series and was enhanced in summer during periods of high precipitation. Increases in sea surface temperature, and decreases in wind speeds and salinity were associated with later spring maxima in PPM. Together these trends indicate that predicted increases in temperature and decrease in wind speeds in future would drive later spring production whilst predicted increases in precipitation would also continue these blooms throughout the summer at this site.

Feeding rates and prey selectivity of planktonic decapod larvae in the Western English Channel

Meroplankton are seasonally important contributors to the zooplankton, particularly at inshore sites, yet their feeding ecology is poorly known relative to holoplankton. While several studies have measured feeding in decapod larvae, few studies have examined the feeding rates of decapod larvae on natural prey assemblages throughout the reproductive season. We conducted 8 feeding experiments with Necora puber, Liocarcinus spp. and Upogebia spp. zoea larvae collected from the L4 monitoring site off Plymouth (50°15.00′N, 4°13.02′W) during spring–summer 2009 and 2010. This period spanned moderate-to-high food availability (0.5–1.6 µg chl-a L−1), but a great range in food composition with small cells <20 µm dominating in 2010. Daily rations averaged 17, 60 and 22 % of body C for the 3 respective decapod species. Clearance rates differed according to prey type, and all 3 decapod genera showed evidence of selection of dinoflagellates. Importantly, small cells including nano- and pico-plankton were ingested, this being demonstrated independently by flow cytometric analysis of the feeding experiments and molecular analysis. PCR-based analysis of the haptophyte portion of the diet revealed ingestion of Isochrysis galbana by decapod larvae in the bottle incubations and Isochrysis galbana and Phaeocystis globosa by decapod larvae collected directly from the field. This study has shown that pico- and nano-sized plankton form an important supplement to the diverse and variable diet of decapod larvae.

The first chronicle of Miguel Hernandez: The New Journalism (1936-1939)

This paper presents and analyzes the first literary-journalistic chronicle writen and published by Miguel Hernández: “Defensa de Madrid. Madrid y las ciudades de Retaguardia”, during the Spanish Civil War (1936-1939). This chronicle is the first one of a series establishing a new and personal type of journalism: literary chronicles –poetical and political-. Miguel Hernandez published his masterpieces in different newspapers as a war reporter, with his own name and with a pen-name, playing roles of director and political commissar in different newspapers in the war-trenches. Thematically, this first article shows his personal and political engagement, as well as his desire and strategy to protect the capital city of Spain: Madrid. Methodologically, the analysis is an approached to linguistics in social sciences, which presents some of the personal characteristics and style of the chronist Miguel Hernández. Thus, it becomes patent that the so-called New Journalism (narrative and literary), which flourished in the 70s, had already been deeply and efficiently practiced by Miguel Hernández 40 years before. That is the reason why Miguel Hernández deserves to be added to the well-known collective of chronicle writers that have already been rescued to this moment. His literary style and quality are installing him in a outstanding position as well as pioneer of the genre nowadays known as New Journalism that in his case, it is politically engaged

MRI diffusion tractography study in individuals with schizotypal features: A pilot study

Diffusion tensor imaging (DTI) studies have identified changes in white matter tracts in schizophrenia patients and those at high risk of transition. Schizotypal samples represent a group on the schizophrenia continuum that share some aetiological risk factors but without the confounds of illness. The aim of the current study was to compare tract microstructural coherence as measured by
fractional anisotropy (FA) between 12 psychometrically defined schizotypes and controls. We investigated bilaterally the uncinate and arcuate fasciculi (UF and AF) via a probabilistic tractography algorithm (PICo), with FA values compared between groups. Partial correlations were also examined between measures of subclinical hallucinatory/delusional experiences and FA values. High schizotypes
were found to have significantly higher FA values in bilateral UF only, but failed to reach significance in each hemisphere. In the whole sample there was a positive correlation between increasing FA values and measures of hallucinatory experience in the right AF. These findings suggest subtle changes in microstructural coherence are present in schizotypes. Correlations between mild hallucinatory experience and increasing FA values could indicate increasing coherence could be associated with symptom formation.

Methodologies for the Development of the Management of Cough: CHEST Guideline and Expert Panel Report

BACKGROUND: This series of guidance documents on cough, which will be published over time, is a hybrid of two processes: (1) evidence-based guidelines and (2) trustworthy consensus statements based on a robust and transparent process.

METHODS: The CHEST Guidelines Oversight Committee selected a nonconflicted Panel Chair and jointly assembled an international panel of experts in each clinical area with few, if any, conflicts of interest. PICO (population, intervention, comparator, outcome)-based key questions and parameters of eligibility were developed for each clinical topic to inform the comprehensive literature search. Existing guidelines, systematic reviews, and primary studies were assessed for relevance and quality. Data elements were extracted into evidence tables and synthesized to provide summary statistics. These, in turn, are presented to support the evidence-based graded recommendations. A highly structured consensus-based Delphi approach was used to provide expert advice on all guidance statements. Transparency of process was documented.

RESULTS: Evidence-based guideline recommendations and consensus-based suggestions were carefully crafted to provide direction to health-care providers and investigators who treat and/or study patients with cough. Manuscripts and tables summarize the evidence in each clinical area supporting the recommendations and suggestions.

CONCLUSIONS: The resulting guidance statements are based on a rigorous methodology and transparency of process. Unless otherwise stated, the recommendations and suggestions meet the guidelines for trustworthiness developed by the Institute of Medicine and can be applied with confidence by physicians, nurses, other health-care providers, investigators, and patients.

Pegada hídrica de um olival super-intensivo sob clima mediterrânico, utilizando medições de campo e deteção remota

A pegada hídrica de uma cultura representa o volume de água necessário para produzir, relacionando as necessidades hídricas da cultura com a produção. As suas componentes, pegadas hídricas azul, verde e cinzenta, referem-se respectivamente aos volumes de água superficial e subterrânea, precipitação e de água necessária para assimilar a poluição utilizados pela cultura. A determinação das pegadas hídricas azul e verde é normalmente conseguida através da estimativa da evapotranspiração cultural, aplicando coeficientes culturais a uma evapotranspiração de referência, calculada a partir de dados meteorológicos. No presente estudo foram utilizadas medições da evapotranspiração para estimar a pegada hídrica de um olival super-intensivo na região de Évora. As necessidades hídricas foram medidas utilizando um método de fluxo de seiva para determinar a transpiração e o método micrometeorológico das flutuações instantâneas para medir directamente a evapotranspiração. Esta técnica foi utilizada durante um período de tempo limitado, enquanto as medições do fluxo de seiva, que foram efectuadas para períodos alargados, permitiram a extensão dos registos. A evapotranspiração medida directamente apresentou valores de cerca de 3 mm d-1 e o quociente entre evapotranspiração real e evapotranspiração de referência é próximo de 0,6 para o mesmo período. Comparou-se a estimativa da pegada hídrica obtida com o procedimento habitual com a resultante de medições in-situ e utilizando técnicas de deteção remota. A pegada hídrica do olival sob estudo foi inferior às simulações encontradas na literatura, o que pode ser explicado por diferenças na densidade de plantação, produção e gestão da rega. O olival em estudo obteve uma produção elevada, com um azeite que preencheu as características essenciais à classificação de azeite extra virgem, o mais valorizado, o que contraria o efeito do elevado consumo de água, resultando numa pegada hídrica inferior à de olivais não regados ou com menor densidade de plantação.

List of the terrestriaL nematodes (nematoda) from Azores

Os nemátodes são um grupo de invertebrados, não segmentados que formam um Filo (Nematoda) bem definido e claramente distinto dos outros grupos de organismos. Este Filo constitui um dos grupos animais mais disseminados no planeta, e em termos de número de indivíduos os nemátodes são o grupo animal mais abundante na Terra: quatro em cada cinco animais da Biosfera são nemátodes. Apesar de microscópicos, os animais multicelulares que constituem este grupo são capazes de explorar uma enorme variedade de habitats, nos mares, nas águas doces, nos solos, como parasitas de animais ou de plantas, ou mesmo em condições extremas, como nos solos secos da Antárctida ou em fontes termais (Baldwin et al. 1999). A actual informação sobre a nematofauna do arquipélago dos Açores encontra-se fraccionada e espalhada em diversas publicações científicas, mas igualmente em dados ainda não publicados (Sturhan, comunicação pessoal). Entre as diversas publicações de nemátodes para os Açores, há que salientar os trabalhos realizados por Sturhan (1973, 1975, 1983) e Macara (1994), que muito contribuíram para o conhecimento e distribuição actual das espécies de vida livre e parasitas de plantas; bem como os trabalhos de Afonso-Roque (1995) e Casanova et al. (1996) relativamente a espécies parasitas de animais, reportadas para as diferentes ilhas do arquipélago. A lista de nemátodes apresentada neste capítulo, tem como base as publicações conhecidas para o arquipélago (ver listagem de publicações até 2010 em www. naturdata.com), bem como o registo de espécies assinaladas pela primeira vez para o arquipélago (Sturhan, comunicação pessoal). A classificação utilizada baseia-se na recente revisão da sistemática e filogenia proposta por De Ley & Blaxter (2002) para todo o Filo, até ao nível da Família. A classificação dos restantes taxa segue o critério utilizado para a fauna terrestre da Fauna Europaea (http://www. faunaeur.org). É apresentada a distribuição das espécies nas nove ilhas dos Açores, usando-se a seguinte simbologia: COR – Corvo; FLO – Flores; FAI – Faial; PIC – Pico; GRA – Graciosa; SJG – São Jorge; TER – Terceira; SMG – São Miguel e SMR – Santa Maria.

Infecção de mycobacterium bovis em células fagocíticas: estratégia aplicada ao diagnóstico da tuberculose bovina

Neste trabalho foram estudadas as interacções entre Mycobacterium bovis e células hospedeiras, na perspectiva de aplicar os conhecimentos resultantes desse estudo ao melhoramento do diagnóstico da tuberculose bovina. Foi estudada a dinâmica da infecção de células fagocíticas com estirpes de M. bovis, com ênfase para a invasão e multiplicação intracelular das micobactérias. Avaliações efectuadas por citometria de fluxo, microscopia de fluorescência e contagem de colónias demonstraram que as micobactérias invadiram e replicaram em todos os modelos celulares, sendo que as células epiteliais de pulmão de bovino foram as mais permissivas ao seu crescimento. Foi nas células macrofágicas J774 e THP-1 que se verificaram as maiores concentrações micobacterianas, pelo que foram utilizadas para a detecção e identificação de M. bovis por um método molecular. A optimização da extracção de DNA, por um processo mecânico, e o desenvolvimento do método de PCR-RFLP baseado no gene gyrB, com controlo interno, permitiram a identificação de M. bovis. A sensibilidade deste método foi de 100% quando aplicado a estirpes isoladas e apenas de 40% quando utilizado directamente em amostras de macerados de tecidos de bovinos com tuberculose. Uma pré-incubação (3 dias) das amostras nas culturas celulares contribuiu para melhorar significativamente a sensibilidade (77%) do PCR-RFLP gyrB. A cultura celular, como matriz a ser utilizada para aumentar a quantidade de M. bovis presente em amostras biológicas, revela-se um método promissor para o diagnóstico laboratorial rápido, específico e sensível da tuberculose bovina. ### - Summary - Interactions between Mycobacterium bovis and host cells were studied with the purpose to apply the outcome knowledge in the improvement of bovine tuberculosis diagnosis. The dynamic of infection of four cell models with three strains of M. bovis was evaluated, with emphasis given to the invasion and intracellular multiplication of mycobacteria. Assessments by flow cytometry, fluorescence microscopy and colony counting showed that every cell models permitted the replication of mycobacteria, although bovine lung epithelial cells had been the most permissive one. The highest mycobacteria) load was found, however, in J774 and THP-1 macrophages, and hence these cells were used for the optimization of a molecular method for detection and identification of M. bovis. The optimisation of a DNA extraction step, by a mechanical process, and the development of PCR-RFLP based on gyrB gene, with an internal control, allowed the identification of M. bovis. The sensitivity of this method was 100% when applied to isolated strains and only 40% when directly used on samples of macerated of tissues from cattle with tuberculosis. Assays in which a pre-incubation step (three days) of biological samples in cell cultures was introduced significantly improved the sensitivity (77%) of the gyrB PCR-RFLP. Cell cultures as a support for growth and rapid isolation of M. bovis is a promising method for the specific, sensitive and rapid laboratorial diagnosis of bovine tuberculosis.

Estratégias para a valorização do coberto vegetal da Ilha de Porto Santo

No presente trabalho desenvolveram-se estudos visando a valorização do coberto vegetal da Ilha de Porto Santo, através de duas metodologias de investigação complementares: a) preservação e reintrodução na Ilha de uma espécie endémica e em risco do Arquipélago da Madeira (Olea maderensis) e de uma espécie naturalizada (Olea europaea ssp. europaea var. sylvestris), recorrendo para o efeito a técnicas de biotecnologia (micropropagação); b) análise da percepção da comunidade local e visitante sobre o fenómeno da desertificação e a valorização do coberto vegetal bem como a sua aceitação relativamente à aplicação de técnicas de biotecnologia (para micropropagar e reintroduzir espécies de oliveira na Ilha) para minimização do processo de desertificação. A dissertação estrutura-se em quatro partes principais. A Parte I caracteriza a Ilha de Porto Santo em termos geográficos, geológicos, climáticos, sócio-economicos e do uso do solo. Enquadra, ainda, o problema da desertificação, através da caracterização/evolução do coberto vegetal ao longo dos anos. Finalmente apresentam-se os objectivos gerais deste estudo. A Parte II centra-se no desenvolvimento de metodologias no âmbito da biotecnologia vegetal para propagação de espécies de O. maderensis e O. europaea ssp. europaea var. sylvestris. em larga escala. Esta parte está dividida em seis capítulos. O Capítulo II.1 aborda a distribuição geográfica das espécies de oliveira e faz uma revisão bibliográfica dos aspectos mais importantes da micropropagação de oliveira (O. europaea L.), principalmente através da micropropagação por estimulação de gomos axilares. No final deste capítulo apresentam-se os objectivos específicos desta investigação. No Capítulo II.2 faz-se a caracterização genética de genótipos de O. maderensis do Arquipélago da Madeira através da análise da ploidia e do conteúdo em DNA por citometria de fluxo (FCM) e através da detecção de polimorfismos por análise de microssatélites (SSR). Nesta análise usaram-se ainda outros genótipos, nomeadamente: O. europaea ssp. europaea var. sylvestris, O. cerasiformes e O. europaea ssp. europaea var. europaea. Este estudo contribuiu para uma melhor caracterização desta espécie e permitiu a detecção de um nível de ploidia novo no género Olea (tetraploidia). O Capítulo II.3 descreve a optimização das condições de cultura in vitro (e.g. desinfecção, meio de cultura e enraizamento) para propagar e preservar a O. maderensis. Avalia-se ainda a “performance” dos rebentos in vitro (taxas de crescimento, avaliação da aparência das folhas e estudos fisiológicos), de modo a confirmar a optimização das condições de propagação. Neste capítulo define-se um meio novo (OMG) para propagação desta espécie endémica. O Capítulo II.4 descreve dois protocolos de micropropagação e aclimatização de ambas as espécies (O. maderensis e O. europaea ssp. europaea var. sylvestris) e a qualidade das plantas (“true-to-type”) é avaliada através da possível ocorrência de variabilidade genética através de FCM (ploidia) e SSRs. O Capítulo II.5 descreve um protocolo eficiente de aclimatização ao campo de O. maderensis e avalia a “performance” das plantas micropropagadas no campo através da análise de parâmetros fisiológicos durante o processo. O Capítulo II.6 apresenta os estudos em curso relativamente às plantas de O. maderensis em aclimatização no campo, bem como a introdução de plantas micropropagadas num outro local da Ilha com um maior grau de degradação dos solos. Estas estratégias estão a ser aplicadas juntamente com a DRFRAM, no âmbito de programas de florestação em curso. Finalmente é realçada a necessidade de estudos semelhantes com outras espécies nativas. Na Parte III, são apresentados os estudos sobre a percepção da comunidade local relativamente à valorização do coberto vegetal para a minimização dos processos de degradação dos solos/desertificação. A introdução faz o enquadramento teórico sobre o fenómeno da desertificação, particularmente na Ilha de Porto Santo e sobre a percepção social da desertificação. São ainda apresentados os objectivos específicos desta investigação. A metodologia adoptada recorreu à aplicação de inquéritos por questionário à população residente e aos visitantes da Ilha de Porto Santo e ainda a realização de inquéritos por entrevista a algumas entidades e especialistas. Estes estudos permitiram verificar que existe uma nítida consciência da situação de risco da ilha, das medidas tomadas e a tomar e da premência da resolução do problema. Face ao recurso de estratégias alternativas envolvendo biotecnologia, e apesar de existir algum desconhecimento, concluiu-se ainda que a população manifesta aceitação, desde que essas estratégias valorizem o coberto vegetal e, assim, ajudem a combater a degradação biofísica dos solos. Finalmente são apresentadas as conclusões e algumas recomendações. Na Parte IV apresentam-se as conclusões gerais e perspectivas futuras, onde o potencial ambiental destas oliveiras bravas micropropagadas é destacado, bem como é considerado o alargamento da aplicação destas estratégias a outras espécies indígenas em risco, nesta Ilha (e noutros locais). São ainda resumidas as principais visões da população e das entidades e dos especialistas que poderão contribuir para apoiar a elaboração de medidas de mitigação e prevenção no combate ao processo de degradação dos solos/desertificação em curso.

Methodologies for a sustainable development of estuarine ecosystems

As zonas costeiras, estuarinas e lagunares são consideradas áreas muito produtivas e dotadas de grande biodiversidade sendo, por isso, consideradas de elevado valor ecológico e económico. No entanto, nas últimas décadas tem vindo a verificar-se um aumento da contaminação destes ecossistemas como resultado de diversas actividades antrópicas. As abordagens actualmente disponíveis para avaliação do impacto da poluição em ecossistemas estuarinos e lagunares apresentam diversos tipos de lacunas, pelo que é importante desenvolver metodologias mais eficazes com organismos autóctones. Neste contexto, o objectivo central desta dissertação consistiu em desenvolver e validar métodos ecologicamente relevantes para avaliação da contaminação estuarina e dos seus efeitos, utilizando o góbio-comum (Pomatoschistus microps), quer como organismo-teste quer como espécie sentinela, devido à importante função que desempenha nas cadeias tróficas de diversos estuários da costa Portuguesa. A Ria de Aveiro foi seleccionada como área de estudo principalmente pelo facto de possuir zonas com diferentes tipos de contaminação predominante e de haver conhecimento científico de base abundante e de elevada qualidade sobre este ecosistema. Na primeira fase do estudo, foram investigados os efeitos agudos de dois hidrocarbonetos aromáticos policíclicos (HAPs) (benzo[a]pireno e antraceno), de um fuel-óleo e de dois metais (cobre e mercúrio) em P. microps, utilizando ensaios laboratoriais baseados em biomarcadores e em parâmetros comportamentais, os quais foram avaliados utilizando um dispositivo expressamente desenvolvido para o efeito, designado por speed performance device (SPEDE). Como biomarcadores foram utilizados parâmetros envolvidos em funções fisiológicas determinantes para a sobrevivência e desempenho dos animais (neurotransmissão, obtenção de energia, destoxificação e defesas anti-oxidantes), nomeadamente a actividade das enzimas acetilcolinesterase, lactato desidrogenase, CYP1A1, glutationa S-transferases, glutationa reductase, glutationa peroxidase, superóxido dismutase, catalase, tendo ainda sido determinados os níveis de peroxidação lipídica como indicador de danos oxidativos. De forma global, os resultados indicaram que os agentes e a mistura testados têm a capacidade de interferir com a função neurológica, de alterar as vias utilizadas para obtenção de energia celular, induzir as defesas antioxidantes e, no caso do cobre e do mercúrio, de causarem peroxidação lipídica. Foram ainda obtidas relações concentração-resposta a nível dos parâmetros comportamentais testados, nomeadamente a capacidade de nadar contra a corrente e a distância percorrida a nadar contra o fluxo de água, sugerindo que os agentes testados podem, por exemplo, diminuir a capacidade de fuga aos predadores, as probabilidades de captura de presas e o sucesso reprodutivo. Na segunda fase, tendo sido já adaptadas técnicas para determinação de vários biomarcadores em P. microps e estudada a sua resposta a dois grupos de poluentes particularmente relevantes em ecossistemas estuarinos e lagunares (metais e HAPs), foi efectuado um estudo de monitorização utilizando P. microps como bioindicador e que incluiu diversos parâmetros ecológicos e ecotoxicológicos, nomedamente: 20 parâmetros indicativos da qualidade da água e do sedimento, concentração de 9 metais em sedimentos e no corpo de P. microps, 8 biomarcadores e 2 índices de condição na espécie seleccionada. A amostragem foi efectuada em quatro locais da Ria de Aveiro, um considerado como referência (Barra) e três com diferentes tipos predominantes de contaminação (Vagueira, Porto de Aveiro e Cais do Bico), sazonalmente, durante um ano. Os resultados obtidos permitiram uma caracterização ecotoxicológica dos locais, incluindo informação sobre a qualidade da água, concentrações de contaminantes ambientais prioritários nos sedimentos e nos tecidos de P. microps, capacidade desta espécie para bioacumular metais, efeitos exercidos pelas complexas misturas de poluentes presentes em cada uma das zonas de amostragem nesta espécie e possíveis consequências para a população. A análise multivariada permitiu analisar de forma integrada todos os resultados, proporcionando informação que não poderia ser obtida analisando os dados de forma compartimentalizada. Em conclusão, os resultados obtidos no âmbito desta dissertação indicam que P. microps possui características adequadas para ser utilizado como organismoteste em ensaios laboratoriais (e.g. abundância, fácil manutenção, permite a determinação de diferentes tipos de critérios de efeito utilizando um número relativamente reduzido de animais, entre outras) e como organismo sentinela em estudos de monitorização da poluição e da qualidade ambiental, estando portanto de acordo com estudos de menor dimensão previamente efectuados. O trabalho desenvolvido permitiu ainda adaptar a P. microps diversas técnicas bioquímicas vulgarmente utilizadas como biomarcadores em Ecotoxicologia e validá-las quer no laboratório quer em cenários reais; desenvolver um novo bioensaio, utilizando um dispositivo de teste especialmente concebido para peixes epibentónicos baseado na performance natatória de uma espécie autóctone e em biomarcadores; relacionar os efeitos a nível bioquímico com parâmetros comportamentais que ao serem afectados podem reduzir de forma drástica e diversificada (e.g. aumento da mortalidade, diminuição do sucesso reprodutivo, redução do crescimento) a contribuição individual para a população. Finalmente, foi validada uma abordagem multidisciplinar, combinando metodologias ecológicas, ecotoxicológicas e químicas que, quando considerada de forma integrada utilizando análises de estatística multivariada, fornece informação científica da maior relevância susceptível de ser utilizada como suporte a medidas de conservação e gestão em estuários e sistemas lagunares.