转Rubisco 活化酶大型同工酶基因(rca)水稻的光合作用特性研究

Rubisco 是催化光合暗反应第一步反应的酶，是唯一能将CO2 转变成碳水化合物的酶，由它固定和最后转化成的碳水化合物提供了植物、动物和微生物的食物和能量。但是，Rubisco 催化该反应的效率十分低，使之成为光合作用的限速步骤。由于Rubisco 的合成和催化过程十分复杂，人们很难通过直接改造Rubisco 提高植物固定CO2 的能力。而Rubisco 活化酶能活化Rubisco，使植物在生理CO2 浓度下具有最大的CO2 同化速率，因此研究活化酶有重要意义。水稻活化酶有2 个同工酶，大型同工酶比小型同工酶C 端多37 个氨基酸，其中包括两个Cys 残基。这两个Cys 残基的存在使活化酶大型同工酶对ADP 的存在更加敏感，其活性在硫氧还蛋白的介导下能被基质中氧化还原状态的变化所调节。由于活化酶大型同工酶对调节Rubisco 的活性具有的这种特殊作用，在本研究中，将活化酶大型同工酶rca基因用正义和反义引入水稻基因组，获得了过量表达活化酶大型同工酶基因和反义抑制活化酶基因表达的转基因植株，对其光合作用进行了生理和生化分析。 本研究的主要结果如下： Rubisco 活化酶大型同工酶基因的克隆：从水稻镇恢249 中克隆了1525 bp 的活化酶大型同工酶cDNA 序列。经过测序，它与报道的粳稻品种活化酶大型同工酶cDNA 序列（rca）完全相同。 构建了4 个植物表达载体：3 个为过量表达rca的载体，分别是pCBUbirca，pCBSrca 和 pCBSUbirca ，其中rca分别在水稻中高效表达的玉米Ubiquitin 启动子、受光调控的Rubisco 小亚基基因启动子和由这两个启动子构成的双启动子控制下表达; 1 个在Ubiquitin 启动子控制的反义rca载体，即 pCBUbi-antirca。 获得了转化rca的水稻再生植株：用日本晴，台北309，武育梗7 号和籼稻品种培矮64S 水稻成熟种子诱导愈伤组织。用改良的农杆菌浸染法将rca基因转化这些愈伤组织，在潮霉素筛选压力下获得抗性愈伤组织，经过2 天的干燥处理后，转入到含山梨醇的高渗分化培养基上培养，能迅速获得大量的芽和转化体再生植株。 获得了转rca基因的水稻植株：抗性愈伤组织和再生水稻幼苗的叶片经GUS 染色呈蓝黑色。PCR 扩增转基因水稻基因组内的潮霉素基因和rca，大部分转基因水稻中含有841 bp 的潮霉素基因片段和1525 bp 长的rca cDNA 片段。251 粒T1 代转基因水稻种子中189粒呈现潮霉素抗性，抗性种子/非抗性种子的比率约为3：1，接近孟德尔分离规律。Southern杂交表明rca序列已整合到水稻基因组，一般含1－2个拷贝。Western 杂交显示Rubisco 活化酶含量在转pCBUbi －antirca 的水稻中和对照比，几乎看不出，被反义抑制;转pCBUbirca 的水稻与对照含量相差无几;转pCBSUbirca，pCBSrca 载体的水稻中活化酶的含量比对照有极显著的增加。 T1 代转rca水稻的光合作用发生显著变化：转pCBSrca 和pCBSUbirca 的水稻在饱和光强下的Rubisco 初始活性、羧化效率、光合速率都明显高于对照，但是表观量子效率、色素含量和Rubisco 总活性与对照相似。两者相比，前者比后者更高;转反义rca（pCBUbi-antirca）基因的水稻饱和光强下的光合速率、表观量子效率、羧化效率、Rubisco 初始活性明显降低，色素含量和Rubisco 总活性基本不变;转pCBUbirca 的水稻中，光合作用的各项参数与对照基本相似。 T1 代转rca水稻的叶绿素荧光明显改变：转pCBSrca 和pCBSUbirca 的水稻ΦPSII 的值明显高于对照，而且前者qP 的值明显高于对照。两者相比，前者的ΦPSII 和qP 的值比后者高;转反义rca的水稻ΦPSII，F′v/F′m，qP 值和对照比都明显降低，但qN 的值升高;转pCBUbirca 载体的水稻中，叶绿素荧光的各项参数与对照基本相似。 转rca基因的水稻生长发育的变化：转pCBUbirca 载体的水稻整个生长发育过程与对照相似;转化pCBSrca 和pCBSUbirca 载体的水稻和对照比，植株高大，生长发育速度加快，抽穗、开花和结籽的时间提前。两者本身相比，前者比后者明显;转反义rca（pCBUbi-antirca）基因的水稻生长发育延迟，植株矮小，种子败育。 由上可见，Rubisco 活化酶大型同工酶rca基因在Rubisco 小亚基基因启动子、Ubiquitin 基因启动子和Rubisco 小亚基基因启动子共同控制下正义转入水稻的转基因植物光合作用的参数最好，光合效率提高，植物表型最好，生长发育加快，提前开花结籽。这一研究可能为获得高光合效率和高产量的水稻奠定了基础。

谷子和甘蔗C4型磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的克隆及其转基因水稻光合效率的提高

水稻是我国重要的粮食作物之一，它是一种典型的C3植物。与其它C3作物不一样的是，水稻的生长需要相对较高的温度和充足的阳光照射。然而高温和高光强的生长环境更加适合于C4植物的生长，更加有利于发挥C4植物高光合效率的特点。因此本论文希望将C4植物中固定CO2的酶磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因导入水稻，获得一种更加适合高温和高光强生活环境的“C4型”水稻，这对于提高水稻的产量，满足人口增长对粮食需求具有重大意义。 本论文从C4植物谷子和甘蔗中克隆了其C4型磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶cDNA基因，获得了具有自主知识产权的基因克隆，并将它们导入粳稻品种中花8号，进而对转基因材料的光合生理特性进行了研究。结果如下： 首次从谷子中得到了ppc基因两个cDNA克隆，分别命名为Mppc1和Mppc2。前者是一个C3型的ppc基因，它可能属于在根中特异表达的C3-2型ppc基因;后者是在绿色叶片中大量表达的C4型ppc基因。它们所编码的蛋白的氨基酸残基数分别为961和964，序列同源性为82.5%。C4型PEPC多出的3个氨基酸位于N末端。利用RACE的方法我们得到了谷子C4型ppc基因完整的cDNA序列，包括63bp的5'非编码区，2895bp的编码区和256bp的3'非编码区。 首次获得了甘蔗C4型ppc基因完整的cDNA序列的克隆，命名为Sppc。它包括95bp的5'非编码区、2886bp的编码区，和224bp的3'非编码区。 利用所克隆的基因，分别连上强组成型启动子Ubiquitin启动子和强光调控启动子Rubisco小亚基启动子后，再插入两个标记基因不同的表达载体pCB和pPCB的多克隆位点中，构建了八个含有外源ppc基因的植物表达载体pCB-Pubi-Mppc、pCB-Pubi-Sppc、pCB-PrbcS-Mppc、pCB-PrbcS-Sppc、pPCB-Pubi-Mppc、pPCB-Pubi-Sppc、pPCB-PrbcS-Mppc和pPCB-PrbcS-Sppc。再加上含有玉米完整的C4型ppc 核基因的载体pCB-ZMppc，共有9个载体。利用农杆菌介导法进行了水稻的转化，各个载体都获得了大量的转基因植株。对标记基因潮霉素磷酸转移酶基因hpt和磷酸甘露糖异构酶基因pmi以及导入的目的ppc基因的PCR扩增检测，结果显示绝大多数转基因植株都能扩增出目的片段，而未转化的植株则没有扩增产物。对部分转基因水稻的Southern和Western杂交以及RT-PCR分析都表明，无论从DNA水平、mRNA水平，还是从蛋白质水平上都证明外源ppc基因都成功地导入了水稻，并获得了正确的表达。 对各载体转基因植株PEPC活性大规模的测定表明，转入玉米完整C4型PEPC核基因（有内含子）的水稻表现出极大的表达效率，大多数转基因材料的PEPC活性为对照的10-20倍，其活性最高可达到对照的44倍。转入谷子和甘蔗PEPC基因cDNA的水稻，表达的效率很低，多数材料活性增加仅为对照的2-5倍，但也有极少数材料活性增加了10倍以上。用Rubisco小亚基启动子控制的ppc基因在水稻的表达活性要略高于Ubiquitin启动子控制的ppc基因。以上结果说明ppc基因的内含子在其转录或mRNA的稳定上起着重要作用。 对部分转基因材料气体交换特征的研究发现，随着转基因水稻PEPC活性的增加，净光合速率也有逐渐增加的趋势。其中PEPC活性最大的ZM24株系的三个单株净光合速率比对照增加了39.8%、13.7%和28.6%，而它们的PEPC活性比对照分别增加了21.2、21.9和23.6倍。 转PEPC水稻的净光合速率与气孔导度具有显著的相关性。这说明表达的外源ppc 基因产物PEPC参与了转基因水稻的气孔运动，使气孔开放程度增加。更有意义的是过表达PEPC的水稻具有更高的水分利用效率，这就增加了其耐旱能力。在光抑制条件下转基因水稻也具有更高的光合能力。这些特征表明转ppc基因的水稻比对照更加适合于水稻高温高光强和干旱的原生环境。

蕨类植物铁芒萁（Dicranopteris dichotoma）体内稀土元素的分布及其光合特性的研究

为了阐明蕨类植物铁芒萁(Dicranopteris dichotoma Bernh.)体内稀土元素的分布及其光合特性，采用电感耦合等离子质谱分析了中国江西省龙南县轻、重稀土矿区和非矿区铁芒萁植物体内的稀土元素含量，并采用透射电子显微镜对其叶片细胞内的稀土元素进行精确定位。还比较系统的研究了自然条件下的铁芒萁与高浓度稀土元素处理条件下的非稀土元素富集植物黄瓜(Cucumis sativus Linn)的光合特性。结果表明： 1、0.5 mmol•L-1 LaCl3处理黄瓜后，可以诱导激发能向PS II分配。1和2 mmol•L-1 LaCl3处理黄瓜后，对黄瓜幼苗抑制作用表现在对其生长率，光合放氧活性和叶绿体完整率的抑制。这是由于LaCl3对黄瓜细胞结构和叶绿体膜结构的破坏所致。其表现为对类囊体膜结构的破坏，而导致PS II光合活性下降，并最终抑制黄瓜生长。 2、铁芒萁可以富集稀土元素，轻、重稀土矿区铁芒萁植物稀土元素的分布规律为叶片>根>土壤>茎>叶柄，非矿区铁芒萁植物稀土元素的分布规律为叶片>根>茎>叶柄。稀土元素在铁芒萁体内的运输和迁移过程中，发生了明显的分异作用，茎、叶柄、叶片中的重稀土相对贫乏，叶片中可以富集高浓度的轻稀土元素。 3、稀土元素可以进入完整的铁芒萁表皮细胞和叶肉细胞中，但多以沉淀的形式聚集在一起。非矿区铁芒萁叶绿体中的稀土元素含量约占其叶片中含量的5％。轻稀土矿区铁芒萁叶绿体中的稀土元素含量约占其叶片中含量的10％。部分稀土元素定位于富含PS II的基粒片层上。 4、铁芒萁富集稀土元素受环境和遗传特性的双重影响，但主要由其自身的生理、生化特性决定。其富集稀土元素的机制是隔离稀土元素在细胞壁、液泡中和分泌结合物质使稀土元素成为沉淀沉积下来，从而避免对光合活性的破坏。 5、与非矿区铁芒萁相比，轻稀土矿区植物叶绿体膜的全链电子传递速率增加了34.9％，PS II的电子传递活性增高了252.9％，PS I的电子传递活性增加了16.8％。轻稀土矿区铁芒萁全链电子传递活性的增加主要来自PS II电子传递活性的大幅提高，这可能与其调节激发能更多向PS II分配，提高PS II反应中心色素蛋白复合体（67.0％）和捕光色素蛋白复合体的含量相关。 6、与非矿区铁芒萁相比，重稀土矿区植物叶绿体膜的全链电子传递速率增加了46.3％，PS II的电子传递活性增高了23.8％，PS I的电子传递活性增加了60.4％。重稀土矿区铁芒萁电子传递活性的提高主要来自PS I电子传递活性的大量增加，这可能与其PS I反应中心蛋白复合体含量的提高（60.0％）有关。 铁芒萁富集并吸收稀土元素主要是由自身的理化特性决定的。它能够将稀土元素以沉淀的形式固定在细胞内部，并通过改变生理代谢来避免高浓度稀土元素对其光合作用的影响。可以在治理稀土元素污染的环保工程中用作植物修复材料。

Effects of probiotics and antibiotics on biofilms

Experiments were conducted to study the effects of probiotics and antibiotics on 3-months old biofilms formed on three different substrates, namely glass, granite and fiberglass reinforced plastic. The variations in heterotrophic bacterial populations associated with biofilms were monitored for a period of one month after one-time application of the probiotic Biogreen (Gee Key Marine Pvt. Ltd, Chennai) at 0.2 mg lˉ¹ and the antibiotic tetracycline at 1.0 mg lˉ¹. The variations in heterotrophic bacterial populations associated with biofilms were compared with that of control to analyse the effects of probiotics and antibiotics on biofilms. The observations showed that the biofilm formation and succession in aquatic environment is substrate dependent and that the resistance to antibiotics also depends on the substrate. The probiotics did not show significant effect on biofilms.

RNAi沉默光合膜磷脂合成酶基因的研究

磷脂是动物和植物非光合组织细胞膜系统的主要组成成分，在细胞生命过程中扮演着重要角色。尽管绿色植物光合膜的的甘油脂主要是糖脂，但是它仍然含有大约10％的磷脂，说明磷脂在光合膜的结构和功能中起重要作用。构成生物膜的磷脂有多种，但是，光合膜只含有磷脂酰甘油（PG）一种磷脂。光合膜中的PG有其特殊性，即：在PG的sn-2位上总连着一个棕榈酸（16:0）或者反式十六碳烯酸（16:1trans），说明了这种具有特殊结构的甘油脂在维持类囊体膜的结构和功能方面具有重要的作用。 叶绿体中有两个重要酶参与了PG的生物合成，它们分别是胞嘧啶二脂酰甘油合成酶（CDS）和磷脂酰甘油合成酶（PGS）。本实验以烟草和马铃薯为材料，利用RNAi技术，对CDS和PGS基因的表达进行抑制，通过PG缺失突变体，研究其功能。 对转含有PGS片段的沉默结构的转基因烟草叶片膜脂进行了分析，结果表明，与野生型烟草相比较，其PG含量下降了约20%，同时，SQDG和PC的含量增加。PG含量的降低没有引起MGDG和DGDG含量的变化。另外，我们还对转基因植株目的基因片段的RNA表达水平进行了RT-PCR分析，发现其表达量大幅度降低。这些结果表明，在转基因株系中，PGS基因的表达受到了抑制，说明我们获得了PG部分缺失的烟草PGS突变体。 对烟草PG缺失体的PG脂肪酸组成进行分析，表明其特征性脂肪酸反式十六碳烯酸含量明显下降，比野生型降低了44%，C18:0、C18:1和C18:2的相对含量增加，整个变化与总脂脂肪酸变化基本一致。 为了研究PG缺失对光合作用的影响，我们分析了多种光合指标。对叶绿素含量的分析表明，PG含量的降低影响了光合色素的组成。PG部分缺失的转基因烟草中的叶绿素总的含量下降，其中叶绿素b含量下降更为明显，结果，叶绿素a与叶绿素b的比值较野生型高。转基因植株净光合速率下降，二氧化碳利用率降低;PSII的最大光化学效率（Fv/Fm）和实际光化学效率（фPSII）降低，光化学猝灭下降，非光化学猝灭增加，尤其老叶的变化更为明显。这些结果说明了PG的部分缺失影响了植株的光合能力，捕光色素蛋白复合体的结构受到了影响，PSII功能遭受损伤。 同时，我们根据已经报道的马铃薯CDS基因，克隆了一个片段，构建沉默结构，并对沉默结构进行了转化。通过抗性基因的筛选以及RT-PCR检测，证明了沉默结构转化成功，目的基因的表达受到抑制，获得了马铃薯CDS转基因植株。 对马铃薯野生型和CDS转基因植株进行膜脂和脂肪酸分析表明，转基因植株叶片的PE、PG和PC等磷脂含量降低，SQDG和DGDG含量增加;C16:1（3t）、C16:2、C16:3、C18:1和C18:2含量下降，C16:0和C18:3含量增加，而C16:1和C18:0变化不明显。马铃薯CDS转基因植株的叶绿素荧光分析表明，PSII最大光化学效率降低，从野生型的0.82下降到0.77。

拟南芥光系统复合物组装调控因子的功能研究

光系统I与光系统II ( PSI和PSII ) 是由核基因与叶绿体基因共同编码的蛋白组成的多亚基色素蛋白复合体，其复合物组装过程中蛋白以一定地次序合成并组装。现有研究表明光合膜多亚基复合物形成的每一个过程都需要一个或多个调节因子的参与。发现这些调节因子，并研究它们的作用机制将有助于我们认识高等植物两个光系统复合物组装和功能调控的分子机理。因此，我们采用正向遗传学和反向遗传学方法去寻找这些调控因子。我们一方面应用Gateway技术构建拟南芥cDNA表达文库，采用酵母双杂交技术从中筛选与Alb3互作的蛋白，称为ALIP ( Albino3 Interacting Protein )；从ABRC订购编码这些互作蛋白的基因的T-DNA插入突变株系，其中发现了一个影响PSI功能的突变体alip1；另一方面，通过对拟南芥T-DNA插入突变体库进行筛选，发现了一批影响PSII功能的突变体 ( low photosystem II accumulation )，其中包括lpa1、lpa2和lpa66-1。本实验对alip1和lpa66-1突变体进行了深入研究，初步探讨了这两个基因编码的蛋白参与调控PSI以及PSII的组装机理。 突变体lpa66-1是一个高叶绿素荧光突变体，与野生型比较生长缓慢，叶色黄，叶绿素含量低。叶绿素荧光慢诱导曲线显示它是一个影响PSII功能的突变体。类囊体膜蛋白的免疫印迹发现lpa66-1突变体中PSII复合物的累积量降低到野生型的30%左右，其他复合物的含量变化不大。体内蛋白标记实验显示，PSII反应中心蛋白D1，D2的合成速率下降，PSII核心蛋白的周转加快。新合成的蛋白组装进PSII的效率比野生型显著降低。LPA66是一个定位于叶绿体的PPR蛋白。因为野生型拟南芥LPA66蛋白能够特异性的编辑psbF转录本，故野生型psbF转录本中第77C被编辑为77U，从而使相应的氨基酸序列中第26个氨基酸丝氨酸被编辑为苯丙氨酸，而lpa66-1突变体中，LPA66蛋白的缺失导致该位点不能被编辑，PSII复合体也不能有效组装。 Alb3/Oxa1p/YidC蛋白家族广泛的参与蛋白质转运和多亚基复合物组装，采用分裂泛素化酵母双杂交发现与Alb3相互作用蛋白ALIP1。突变体alip1也是一个高叶绿素荧光突变体，叶色黄，在土里生长极为缓慢，且不能开花，不育。叶绿素荧光慢诱导曲线显示，突变体中PSII功能基本没有受影响；而P700显示alip1是一个影响PSI功能的突变体。类囊体膜蛋白的免疫印迹发现突变体中PSI核心蛋白PsaA/B的累积量为野生型的40%左右，而PSII及其他复合物的含量无明显变化。Northern印迹结果显示PsaA/B在转录水平不受影响，而体内蛋白标记实验显示，PSI反应中心蛋白PsaA/B的合成速度下降。蔗糖密度梯度离心分析类囊体膜蛋白的组分显示ALIP1能够与Alb3共迁移。而Alb3对于类囊体膜上大分子复合体的组装有重要作用，我们推测，ALIP1可能与Alb3形成一个复合物，或者作为一个中间体介导Alb3参与PSI的组装。

百合鳞茎低温贮藏及热胁迫下新铁炮百合的光合特性

百合是重要的球根花卉，是世界五大切花之一。我国的百合野生资源丰富，但百合鲜切花生产与世界花卉大国相比仍然存在差距，优质的商品种球大量依靠进口，实现商品种球国产化能够促进百合鲜切花生产和农业经济发展。温度是影响百合生长发育最重要的因子之一，影响百合鳞茎发育，限制百合的分布区域。 百合鳞茎具有自然休眠的特性，低温处理是目前打破百合鳞茎休眠的最常用的方法。低温处理期间，鳞茎内发生复杂的反应，淀粉水解，鳞茎内的淀粉酶（α-淀粉酶和β-淀粉酶）活性增加，可溶性糖主要是蔗糖积累;可溶性蛋白质含量增加，游离氨基酸在鳞茎相对幼嫩的器官中集中;休眠解除期间脱落酸和玉米素核苷含量呈下降趋势，赤霉素含量呈上升趋势且活性增高，鳞茎各部位生长素都有上升，一些其他生长调节剂如Me-JA和多胺对解除百合鳞茎也有作用。低温处理期间，鳞茎内各种激素相互作用，共同调控鳞茎的休眠状态。利用低温处理打破百合鳞茎休眠的过程中，温度要求控制在稳定的范围内。利用冰箱低温处理打破百合鳞茎休眠的实验中，放入样品前冰箱内的温度在所设定温度±1℃范围内波动，且不同部位温度均匀;但冰箱内放入样品后，其内部不同部位的温度相差较大，表现为上部温度高，下部温度低，冰箱内部不同部位温度差异很大。 从百合资源在中国的分布看，华北地区的百合资源相对稀缺，温度是限制其生长的重要环境因子。新铁炮百合能够在炎热的华南地区露地栽培，将其在华北地区进行区域化露地栽培实验，对百合栽培应用推广，扩大栽培面积，降低运输成本，以及保证鲜切花质量有重要意义。通过气体交换测定的光合作用是对高温最敏感和综合的生理指标，可以在植物生长和生物量积累未发生明显变化之前揭示高温的影响。本研究通过人工气候箱，设定四个温度梯度：25℃，32℃，38℃，44℃，处理2h，通过测定新铁炮百合幼苗的光合特性研究其耐热程度、探讨可能的耐热机制。结果表明：净光合作用速率（Pn）在小于38℃时下降幅度不大，大于38℃后显著下降，随着处理温度的提高，气孔导度（Gs）呈下降的趋势，胞间二氧化碳浓度（Ci）则上升，而气孔限制值（Ls）下降。高温下，两品种叶片最小荧光（Fo）无明显变化，最大荧光（Fm）和光系统II（PSⅡ）最大光化学效率（Fv/Fm）下降程度较小;光下，PSⅡ实际光化学效率（ΦPSⅡ）呈下降趋势，44℃处理后显著下降;NPQ随处理温度的提高而上升;处理温度升高，SOD、APX、CAT、POD活力增强。研究表明新铁炮百合能够耐受32-38℃的高温;热胁迫下，叶片通过提高非光化猝灭和抗氧化酶活性两种机制来抵御高温胁迫。

青藏高原几种植物的光合特性研究

通过气体交换、荧光猝灭动力学以及反射光谱等技术研究了两个青稞（Hordeum vulgare L.）品种的光合特性及激发能分配。结果表明，青稞的光饱和点1000 μmol m-2 s-1左右。在0～500 μmol m-2 s-1的光强范围里，青稞叶片的光呼吸(Pr)随着光强升高而增加;光强超过500 μmol m-2 s-1以后，光呼吸变化不明显。光呼吸占总光合的比例(Pr/Pm)随光强增强下降。随着光强增强，PSⅡ有效光化学量子效率（Fv′/Fm′），PSⅡ反应中心的实际光化学量子效率（ΦPSⅡ），光化学猝灭系数（qP）不断降低而青稞叶片的非光化学猝灭(NPQ)不断升高，说明越来越多的光能以热耗散的形式耗散掉。光谱分析表明△PRI 随着青稞叶片暴露于光下的时间迅速增大。因此，我们认为光呼吸不是青稞主要的光破坏防御机制，依赖叶黄素循环的热耗散可能是田间青稞耗散过剩光能的主要途径。 通过气体交换、荧光猝灭动力学等技术研究了四种乔木在拉萨和那曲的光合特性及激发能分配。结果表明，四种乔木藏川杨（Populus szechuanica var. tibetica schneid.），银白杨（Populus alba L.），左旋柳(Salix paraplesia var. subintegra C. Wang et P. Y. Pu)，墨竹柳(Salix maizhokunggarensis N. Chao)在拉萨市的光合速率（Pn），叶片气孔导度（Gs），蒸腾速率（Tr）均显著高于那曲。藏川杨和墨竹柳的光下实际光化学效率（ΦPSⅡ）在拉萨显著高于那曲，银白杨和左旋柳的光下实际光化学效率在拉萨和那曲没有显著差异。四种乔木开放反应中心激发能捕获效率（Fv′/Fm′）和天线热耗散（1－Fv′/Fm′）在拉萨和那曲的差异不显著。测量光合时的气温（Tair）拉萨显著高于那曲，除墨竹柳外叶温（Tleaf）也显著高于那曲，墨竹柳的上述两参数在两地间无显著差异。除藏川杨外其余三种乔木在拉萨的胞间二氧化碳浓度（Ci）显著高于那曲，气孔限制值(Ls)显著低于那曲，藏川杨的上述两指标在两地间无显著差异。除墨竹柳外，其余三种乔木在两地的光合（Pn）与叶温（Tleaf）成显著正相关。对银白杨和左旋柳来说，低叶温通过降低气孔导度（Gs）从而降低胞间二氧化碳浓度（Ci）是造成那曲光合低的主要因素之一。对于墨竹柳来说，可能有其他非温度的环境条件影响其气孔导度进而造成气孔限制。此外，叶温可能主要通过非气孔限制来影响藏川杨的光合速率。因此，我们认为在西藏地区不同乔木对海拔高度的响应机制可能不同，但具体机制还需要进一步研究。

淹水及淹水后出水对皇冠草光合特性和光抑制的影响

通过气体交换和叶绿素荧光等方法，研究了淹水胁迫条件下及胁迫解除后皇冠草不同功能叶片的光合特性及光抑制的变化。结果表明： （1）在淹水阶段，与对照相比，气生叶（全淹组淹水前形成的功能叶）在水淹条件下叶片大小和气孔没有明显变化；但是沉水叶（全淹组淹水后新生的功能叶）的叶面积明显增加，气孔变小，上表皮气孔密度增加，下表皮气孔密度减小。 （2）水淹导致气生叶碳同化能力、光化学效率和叶绿素含量下降。沉水叶在发育过程中碳同化能力、光化学效率和叶绿素逐渐升高。 （3）出水后，在自然强光下气生叶和沉水叶的相对含水量和最大光化学效率Fv/Fm急剧且大幅度下降，发生明显的光抑制；而在弱光下Fv/Fm无明显下降。 （4）出水后离体叶片在水分充足的条件下，在强光下照射6h后气生叶和水生叶均发生严重光抑制，且在弱光下页不能恢复。 因此，我们认为淹水条件下，叶片上表皮气孔密度的增加使其蒸腾速率提高；水生叶较强的碳同化能力和增加的叶面积是确保其植株水下生存的关键；强光使水生叶出水后发生光抑制和反应中心失活，导度和蒸腾速率提高导致的叶片水分丧失则加剧了这一过程，这两者共同作用导致了自然条件下水生叶的出水死亡。

干旱胁迫下草莓水分调控及光合特性研究

以盆栽草莓(Fragaria×ananassa)为材料研究了水分胁迫下克隆植物草莓母株和子株间的水分调控机制及其与碳同化、光系统II激发能分配的关系。实验材料分为匍匐茎连接和剪断两个大组，进行两步实验。第一步实验，对连接组和剪断组的所有母株控水，子株充分供水；4天后进入第二步实验，把连接组分为两小组，对其中一组充分供水子株开始控水，另一组保持不变。结果表明，土壤干旱引起母株叶片失水，并使其净光合速率和气孔导度显著降低。但是连接组中供水良好的子株能有效缓解缺水母株的水分胁迫。当供水良好的子株也开始受到干旱处理的时候，则会加剧与之相连母株的水分胁迫。受胁迫母株可以通过加强渗透调节能力和降低水势从相连子株获取水分。虽然土壤干旱会造成受胁迫母株叶片脱落酸（abscisic acid, ABA）含量的大幅度增加，但是与之相连子株的叶片ABA含量并没有增加；并且气孔导度与ABA变化趋势一致。因此，我们认为：(1)草莓母株和子株间的水分运输是由二者的水势差驱动的；（2）ABA不会通过匍匐茎在母株和子株间传递并影响相邻子株气孔导度；（3）在水分异质性较大情况下，生理整合可明显提高克隆系统的碳同化能力和光系统II激发能利用效率。 同时研究了水分胁迫对草莓叶片叶绿素荧光诱导动力学参数Fm的影响。结果表明，在水分胁迫初期, 活体草莓叶片失水萎缩、叶面积和叶片厚度减小，单位叶面积的叶绿素含量升高，此时叶绿素荧光动力学参数Fm上升；当水分胁迫进一步加剧，单位叶面积的叶绿素含量开始下降，但Fm没有随之下降。离体叶片测定则没有出现Fm上升这一过程，Fm随着单位叶面积叶绿素含量的下降而下降。叶片叠加实验证明，增加叶片厚度也可以使Fm上升。综上我们认为在干旱胁迫进程中，活体草莓叶片的荧光动力学参数Fm出现上升是由单位面积叶绿素含量和叶片结构的变化共同决定的。

盘叶忍冬和贯月忍冬及其子代生长和光合特性的比较研究

以父本贯月忍冬(Lonicera sempervirens．L) 、母本盘叶忍冬(Lonicera tragophylla Hemsl.) 及其子代台尔曼忍冬(Lonicera×tellmanniana Hort. Späth)为试材，研究了整个生长季3种材料的生长与光合特性。结果显示：子代台尔曼忍冬在花期和单株花序数方面存在显著的杂种优势；3种材料的最大光化学效率（Fv/Fm）差异不显著；父本贯月忍冬的光合速率、实际光化学效率、藤茎长、基茎以及盛花期时的生物量和子代差异不显著，但在实验结束时生物量显著低于子代；母本盘叶忍冬各种指标除Fv/Fm外均显著低于子代，表现出了极弱的生长特性；子代台尔曼忍冬生长期能持续到8月下旬，虽然超中优势（HOMP）明显，但只在单株总叶面积、叶片数和盛花期单株花序数方面表现出了显著的超亲优势。我们认为台尔曼忍冬在观赏效果方面形成杂种优势的主要生理基础不是通常所认为的光合能力的提高，而是在生长前期显著高的总叶面积使子代形成足够多的同化物质，在其内部分配机制的影响下，子代把大量的同化物质用于花芽分化，而在盛花期后，由于子代的生长期较长，以及较强地耐高温胁迫能力，就会源源不断地形成同化物用于花芽分化，而使得子代在花期和观赏效果方面明显优于贯月和盘叶忍冬。因此，在生长早期采取一些增加总叶面积的栽培措施将有助于改善贯月忍冬和盘叶忍冬的生长和观赏效果。

Studies on cultural conditions of marine Chromatium buderi Truper and Jannasch 1968

Photosynthetic characteristics of a purple sulfur bacterium, Chromatium buderi, cultured under different ranges of pH, temperature, light intensities and ammonium chloride concentrations were examined. Maximum bacteriochlorophyll a synthesis was observed at pH 6.5 whereas the optimum growth was at pH 8.0. In general, higher temperature tended to inhibit the chlorophyll a synthesis and growth. 30°C is the optimum temperature both for chlorophyll a synthesis and growth. At 25µE mˉ²Sˉ¹ the bacteriochlorophyll a content and growth attained maximum level. The response to this low light intensity is an adaptation that ensures a high photosynthetic rate for the purple sulfur bacterium that usually occurs in dimly lit environment. Besides these, ammonium chloride at low concentration enhances both chlorophyll a synthesis and growth. Above 0.5% of it causes the nitrogen-chlorosis and also retards the growth of the bacterium. Possible chemical and structural mechanisms involved are discussed.

Molecular identification of symbiotic dinoflagellates (Zooxanthellae) of dominant reef-building corals off Kish Island

Scleractinian coral species harbour communities of photosynthetic taxa of the genus Symbiodinium. As many as eight genetic clades (A, B, C, D, E, F, G and H) of Symbiodinium have been discovered using molecular biology. These clades may differ from each other in their physiology, and thus influence the ecological distribution and resilience of their host corals to environmental stresses. Corals of the Persian Gulf are normally subject to extreme environmental conditions including high salinity and seasonal variation in temperature. This study is the first to use molecular techniques to identify the Symbiodinium of the Iranian coral reefs to the level of phylogenetic clades. Samples of eight coral species were collected at two different depths from the eastern part of Kish Island in the northern Persian Gulf. Partial 28S nuclear ribosomal (nr) DNA of Symbiodinium (D1/D2 domains) were amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR). PCR products were analyzed using Single Stranded Conformational Polymorphism (SSCP) and phylogenetic analyses of the LSU DNA sequences from a subset of the samples. The results showed that Symbiodinium populations were generally uniform among and within the populations of 8 coral species studied, and there are at least two clades of Symbiodinium from Kish Island. Clade D was detected from 8 of the coral species while clade C90 was found in 2 of species only (one species hosted two clades simultaneously). The dominance of clade D might be explained by high temperatures or the extreme temperature variation, typical of the Persian Gulf.

Thylakoid terminal oxidases are essential for the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 to survive rapidly changing light intensities.

Cyanobacteria perform photosynthesis and respiration in the thylakoid membrane, suggesting that the two processes are interlinked. However, the role of the respiratory electron transfer chain under natural environmental conditions has not been established. Through targeted gene disruption, mutants of Synechocystis sp. PCC 6803 were generated that lacked combinations of the three terminal oxidases: the thylakoid membrane-localized cytochrome c oxidase (COX) and quinol oxidase (Cyd) and the cytoplasmic membrane-localized alternative respiratory terminal oxidase. All strains demonstrated similar growth under continuous moderate or high light or 12-h moderate-light/dark square-wave cycles. However, under 12-h high-light/dark square-wave cycles, the COX/Cyd mutant displayed impaired growth and was completely photobleached after approximately 2 d. In contrast, use of sinusoidal light/dark cycles to simulate natural diurnal conditions resulted in little photobleaching, although growth was slower. Under high-light/dark square-wave cycles, the COX/Cyd mutant suffered a significant loss of photosynthetic efficiency during dark periods, a greater level of oxidative stress, and reduced glycogen degradation compared with the wild type. The mutant was susceptible to photoinhibition under pulsing but not constant light. These findings confirm a role for thylakoid-localized terminal oxidases in efficient dark respiration, reduction of oxidative stress, and accommodation of sudden light changes, demonstrating the strong selective pressure to maintain linked photosynthetic and respiratory electron chains within the thylakoid membrane. To our knowledge, this study is the first to report a phenotypic difference in growth between terminal oxidase mutants and wild-type cells and highlights the need to examine mutant phenotypes under a range of conditions.

Liquid transport facilitated by channels in Bacillus subtilis biofilms.

Many bacteria on earth exist in surface-attached communities known as biofilms. These films are responsible for manifold problems, including hospital-acquired infections and biofouling, but they can also be beneficial. Biofilm growth depends on the transport of nutrients and waste, for which diffusion is thought to be the main source of transport. However, diffusion is ineffective for transport over large distances and thus should limit growth. Nevertheless, biofilms can grow to be very large. Here we report the presence of a remarkable network of well-defined channels that form in wild-type Bacillus subtilis biofilms and provide a system for enhanced transport. We observe that these channels have high permeability to liquid flow and facilitate the transport of liquid through the biofilm. In addition, we find that spatial variations in evaporative flux from the surface of these biofilms provide a driving force for the flow of liquid in the channels. These channels offer a remarkably simple system for liquid transport, and their discovery provides insight into the physiology and growth of biofilms.