Prospects for whole genome linkage disequilibrium mapping in domestic dog breeds

Linkage disequilibrium (LD) mapping is commonly used as a fine mapping tool in human genome mapping and has been used with some success for initial disease gene isolation in certain isolated inbred human populations. An understanding of the population history of domestic dog breeds suggests that LID mapping could be routinely utilized in this species for initial genome-wide scans. Such an approach offers significant advantages over traditional linkage analysis. Here, we demonstrate, using canine copper toxicosis in the Bedlington terrier as the model, that LID mapping could be reasonably expected to be a useful strategy in low-resolution, genome-wide scans in pure-bred dogs. Significant LID was demonstrated over distances up to 33.3 cM. It is very unlikely, for a number of reasons discussed, that this result could be extrapolated to the rest of the genome. It is, however, consistent with the expectation given the population structure of canine breeds and, in this breed at least, with the hypothesis that it may be possible to utilize LID in a genome-wide scan. In this study, LD mapping confirmed the location of the copper toxicosis in Bedlington terrier gene (CT-BT) and was able to do so in a population that was refractory to traditional linkage analysis.

Geometric nonlinear analysis of thin plates by a refined nonlinear non-conforming triangular plate element

Based on the refined non-conforming element method for geometric nonlinear analysis, a refined nonlinear non-conforming triangular plate element is constructed using the Total Lagrangian (T.L.) and the Updated Lagrangian (U.L.) approach. The refined nonlinear non-conforming triangular plate element is based on the Allman's triangular plane element with drilling degrees of freedom [1] and the refined non-conforming triangular plate element RT9 [2]. The element is used to analyze the geometric nonlinear behavior of plates and the numerical examples show that the refined non-conforming triangular plate element by the T.L. and U.L. approach can give satisfactory results. The computed results obtained from the T.L. and U.L. approach for the same numerical examples are somewhat different and the reasons for the difference of the computed results are given in detail in this paper. © 2003 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

High rate of detection of primary aldosteronism, including surgically treatable forms, after 'non-selective' screening of hypertensive patients

Background Wide testing of the aldosterone: renin ratio among hypertensive individuals has revealed primary aldosteronism to be common, with most patients normokalaemic. Some investigators, however, have reported aldosterone-producing adenoma to be rare among patients so detected. Objective To test the hypothesis that differences among reported studies in the rate of detection of aldosterone-producing adenoma (as opposed to bilateral adrenal hyperplasia) reflect differences in the procedures used for diagnosis of primary aldosteronism, and the methods used to identify aldosterone-producing adenomas. Methods In the newly established Princess Alexandra Hospital Hypertension Unit (PAHHU), we used procedures developed by Greenslopes Hospital Hypertension Unit (which reports that more than 30% of patients with primary aldosteronism have aldosterone-producing adenomas) to diagnose primary aldosteronism and determine the subtype. All patients with an increased aldosterone: renin ratio (measured after correction for hypokalaemia and while the patient was not receiving interfering medications) underwent fludrocortisone suppression testing to confirm or exclude primary aldosteronism; if they were positive, they underwent genetic testing to exclude glucocorticoid-remediable aldosteronism before adrenal venous sampling was used to differentiate lateralizing from bilateral primary aldosteronism. Results This approach allowed PAHHU to diagnose, within 2 years, 54 patients [only seven (13%) hypokalaemic] with primary aldosteronism. All tested negative for glucocorticoid-remediable aldosteronism. Aldosterone production was lateralized to one adrenal in 15 patients (31%; only six hypokalaemic) and was bilateral in 34 (69%; all normokalaemic) of 49 patients who underwent adrenal venous sampling. Among patients with lateralizing adrenal hyperplasia, computed tomography revealed an ipsilateral mass in only six and a contralateral lesion in one. Fourteen patients underwent unilateral adrenalectomy, which cured the hypertension in seven and improved it in the remainder. In patients with bilateral primary aldlosteronism, hypertension responded to spironolactone (112.5-50 mg/ day) or amiloride (2.5-10 mg/day). Conclusion When performed with careful regard to confounding factors, measurement of the aldosterone: renin ratio in all hypertensive individuals, followed by fludrocortisone suppression testing to confirm or exclude primary aldosteronism and adrenal venous sampling to determine the subtype, can result in the detection of significant numbers of patients with specifically treatable or potentially curable hypertension. (C) 2003 Lippincott Williams Wilkins.

Time will tell: Ambiguous non-responses on internet relay chat

The design of Internet Relay Chat (IRC) affords for, and itself produces, non-response situations that are not possible in FTF or telephone interaction. These system-occasioned nonresponses produce almost isomorphic stimuli to participant non-responses. Situations thus arise in which non-responses are interpersonally accountable despite agentive ambiguity. This study explores four intersections of participant-action and system-occasioned non-responses. An extension to Pomerantz's (1984b) 'pursuing a response' problems/solutions is proposed. The impact of IRC's design on its popularity is discussed in contrast to more recent chat systems. Suggestions are made for active and passive presence and non-response accounting features in future chat systems.

The use of 16s rDNA restriction fragment length polymorphism analysis for the identification of non-fermenting gram negative bacilli in a cystic fibrosis microbiology referral service

The utility of 16s rDNA restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis for the partial genomovar differentiation of Burkholderia cepacia complex bacterium is well documented. We compared the 16s rDNA RFLP signatures for a number of non-fermenting gram negative bacilli (NF GNB) LMG control strains and clinical isolates pertaining to the genera Burkholderia, Pseudomonas, Achromobacter (Alcaligenes), Ralstonia, Stenotrophomonas and Pandoraea. A collection of 24 control strain (LMG) and 25 clinical isolates were included in the study. Using conventional PCR, a 1.2 kbp 16s rDNA fragment was generated for each organism. Following restriction digestion and electrophoresis, each clinical isolate RFLP signature was compared to those of the control strain panel. Nineteen different RFLP signatures were detected from the 28 control strains included in the study. TwentyoneyTwenty- five of the clinical isolates could be classified by RFLP analysis into a single genus and species when compared to the patterns produced by the control strain panel. Four clinical B. pseudomallei isolates produced RFLP signatures which were indistinguishable from B. cepacia genomovars I, III and VIII. The identity of these four isolates were confirmed using B. pseudomallei specific PCR. 16s rDNA RFLP analysis can be a useful identification strategy when applied to NF GNB, particularly for those which exhibit colistin sulfate resistance. The use of this molecular based methodology has proved very useful in the setting of a CF referral laboratory particularly when utilised in conjunction with B. cepacia complex and genomovar specific PCR techniques. Species specific PCR or sequence analysis should be considered for selected isolates; especially where discrepancies between epidemiology, phenotypic and genotypic characteristics occur.

Adsorption of supercritical fluids in non-porous and porous carbons: analysis of adsorbed phase volume and density

In this paper, we revisit the surface mass excess in adsorption studies and investigate the role of the volume of the adsorbed phase and its density in the analysis of supercritical gas adsorption in non-porous as well as microporous solids. For many supercritical fluids tested (krypton, argon, nitrogen, methane) on many different carbonaceous solids, it is found that the volume of the adsorbed phase is confined mostly to a geometrical volume having a thickness of up to a few molecular diameters. At high pressure the adsorbed phase density is also found to be very close to but never equal or greater than the liquid phase density. (C) 2003 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

Mapping the royal road and other hierarchical functions

In this paper we present a technique for visualising hierarchical and symmetric, multimodal fitness functions that have been investigated in the evolutionary computation literature. The focus of this technique is on landscapes in moderate-dimensional, binary spaces (i.e., fitness functions defined over {0, 1}(n), for n less than or equal to 16). The visualisation approach involves an unfolding of the hyperspace into a two-dimensional graph, whose layout represents the topology of the space using a recursive relationship, and whose shading defines the shape of the cost surface defined on the space. Using this technique we present case-study explorations of three fitness functions: royal road, hierarchical-if-and-only-if (H-IFF), and hierarchically decomposable functions (HDF). The visualisation approach provides an insight into the properties of these functions, particularly with respect to the size and shape of the basins of attraction around each of the local optima.

Non-volant tetrapods from Reserva Biológica de Duas Bocas, State of Espírito Santo, Southeastern Brazil

A Reserva Biológica de Duas Bocas (2.190 ha) é um dos maiores remanescentes de Mata Atlântica do Estado do Espírito Santo, Sudeste do Brasil. Nós amostramos tetrápodes não voadores nessa área entre maio de 2007 e abril de 2008, utilizando armadilhas de queda, armadilhas de isca, armadilhas fotográficas e buscas oportunísticas diurnas e noturnas. Além disso, nós compilamos registros de vertebrados não voadores ocorrentes nesta área disponíveis na literatura e através de espécimes em museus. Nós documentamos 52 espécies de anfíbios, 24 espécies de répteis não voadores e 39 espécies de mamíferos não voadores. Do total de 115 espécies, 47 configuram novos registros para a área e seis outras espécies tiveram sua distribuição geográfica ampliada com os resultados do presente estudo. Além disso, apresentamos o registro de predação da perereca Hypsiboas faber pela serpente Chironius bicarinatus. Cinco das espécies registradas são listadas como ameaçadas no Estado do Espírito Santo e muitas outras possuem estado de conservação incerto. A Reserva Biológica de Duas Bocas é um importante refúgio de vida selvagem, principalmente quando consideramos a expansão de áreas urbanas no seu entorno.

O trabalho e a competência industriosa no beneficiamento de granitos : uma cartografia ergológica

O intuito inicial desta pesquisa foi acompanhar processos de trabalho à luz do referencial teórico da Ergologia e, portanto, concebendo o trabalho como relação dialética entre técnica e ação humana. O objetivo era cartografar o trabalho no processo de beneficiamento de granitos em uma organização de grande porte localizada no Espírito Santo e, após algum tempo em campo, o problema delineou- se do seguinte modo: como se constitui a competência industriosa no beneficiamento de granitos em uma organização de grande porte? A pesquisa justifica-se uma vez que, a despeito da relevância econômica, o cenário capixaba de rochas ornamentais apresenta problemas precários no que diz respeito à gestão. Para os Estudos Organizacionais, a relevância é reforçada pelo fato de aproximar desta área a abordagem ergológica e demarcar no debate sobre competência a noção de competência industriosa, ainda não explorada nesse campo de estudo. Para realização da pesquisa, foi praticada uma cartografia ergológica, a partir da articulação das pistas cartográficas com o referencial teórico-conceitual da Ergologia, sendo utilizadas como técnicas: observação participante durante 6 meses, com uma média de 3 visitas a campo por semana; 8 entrevistas semiestruturadas e em profundidade de cerca de 50 minutos cada com trabalhadores operacionais; uma entrevista com gerente de produção e outra com representante da área de Gestão de Pessoas; conversas com os demais trabalhadores, a fim de enriquecer o diário de campo; novas conversas e observações ao final da análise, para confrontação-validação com os trabalhadores. A sistematização dos procedimentos de análise pode ser assim descrita: a) leituras flutuantes com objetivo de fazer emergirem aspectos centrais relacionados às duas dimensões do trabalho, técnica e ação humana; b) leituras em profundidade com objetivo de fazer emergirem singularidades e especificidades relativas à dialética entre ambas; c) leituras em profundidade com objetivo de fazer emergirem aspectos relativos aos ingredientes da competência industriosa. A despeito da não delimitação de categorias analíticas e subcategorias, a partir da análise emergiram cinco eixos analíticos: 1) os procedimentos a serem empregados no processo de beneficiamento de granitos, englobando: as etapas do beneficiamento; as funções a serem desempenhadas e as tarefas a serem desenvolvidas; as normas regulamentadoras; os conhecimentos técnicos necessários para programação e operação de máquinas; a ordem de produção prescrita pelo setor comercial; 2) o trabalho real, diferenciado do trabalho como emprego de procedimentos pelo foco dado à ação humana no enfrentamento de situações reais, repletas de eventos e variabilidades, em todo o processo, englobando: preparo de carga; laminação; serrada; levigamento; resinagem; polimento-classificação; retoque; fechamento de pacote; ovada de contêiner; 3) diferentes modos de usos de si que, em tendência, são responsáveis pela constituição do agir em competência em cada etapa do processo, na dialética entre técnica e ação humana; 4) o modo como cada ingrediente da competência industriosa atua e se constitui, bem como sua concentração, em tendência, em cada etapa do processo, a partir dos tipos de usos de si que, também em tendência, são mais responsáveis pelo agir em competência, apresentando assim o perfil da competência industriosa no beneficiamento de granitos na empresa em análise; 5) dois possíveis fatores potencializadores dos ingredientes da competência industriosa, a saber, a transdução e os não-humanos. A partir de todo o exposto, as últimas considerações problematizam aspectos relativos ao debate sobre competências e práticas de gestão de pessoas a partir da competência compreendida da seguinte forma: mestria no ato de tirar partido do meio e de si para gerir situações de trabalho, em que a ação consiste na mobilização de recursos dificilmente perceptíveis e descritíveis, inerentes ao trabalhador, porém constituídos e manifestos por usos de si por si e pelos outros no e para o ato real de trabalho, marcadamente num nível infinitesimal, diante de situações que demandam aplicação de protocolos concomitante à gestão de variabilidades e eventos em parte inantecipáveis e inelimináveis.

Lucidez-Embriaguez, movimento e arrebatamento: homens,(Semi)deuses que perambulam e a educação menor num bairro de uma rede municipal

A tese afirma a vida por meio das biopotências que se manifestam em movimentações invisíveis aos olhos acostumados a permitir o ver, o julgar e o falar. Foca o tempo presente, na comunicação em redes, traz em si a potência de reatar a multidão, com a capacidade de sondar possibilidades mostrando o que antes parecia opaco e impossível. Perambular é ligar nas redes quentes de um bairro com/no/do território ao privilegiar o movimento, o processo, sempre caminhando pelas vias e conexões abertas, aposta estética-ética-política nos paradoxos sem superação e não hierarquizados. Toma como método de pesquisa-intervenção elementos de uma cartografia de movimentos e devires, traçando um perambular rizomático em que são problematizados a constituição do problema de pesquisa, que considera a construção do conhecimento diversificada, descentralizada e horizontalizada. Problematiza as práticas discursivas de si em suas relações com a biopolítica, a governabilidade e a biopolítica das populações. O que está(rá) rolando nesse bairro, no que foi chamado de criança, adolescente, escola, compor para que as coisas apareçam, junto com outros que vivem a loucura em duplas e trios. A tese é a possibilidade da existência de uma educação menor na periferia para as populações marginalizadas, muçulmanizadas. Educação menor, da sala de aula, do bairro, do cotidiano de professores, familiares e alunos. Educação que permite revolucionários, na medida em que alguma revolução ainda faz sentido na educação nesses dias. A educação menor constitui-se, assim, num empreendimento de militância, de professores militantes. Plano das afecções em que não há unidades, apenas intensidade. A tese fala do processo, de como reproduzir, ou não, os modos de subjetividade dominante, não se trata de medidas - "menor" ou "pequeno". Nesse sentido, é preciso considerar os efeitos de produção de subjetividade e a incorporação dos fatos à própria vida. A tese analisa movimentos instituintes buscando reconhecê-los em sua natureza contestatória e transgressora e ter conhecimento de como se organiza na escola e muito além dela. Discutindo a produtividade dessa coreografia do perambular, esboçamos movimentos que denominamos: estradas que levam a nada, além muro

Entre imagens cinema e imagens escola, movimentando o pensamento com a formação de professores

A presente pesquisa aborda o estudo dos movimentos do pensamento nas redes formação com professores no Ensino Fundamental. Procura problematizar a constituição de processos formativos não dogmáticos nos cotidianos escolares, pela articulação de imagens cinema e imagens escola, exibidas, compartilhadas e criadas nas redes de conversações em uma escola municipal de Vitória/ES, entre os anos de 2013 a 2014. Apresenta um campo problemático que se dedica a compreender que movimentos do pensamento são produzidos a partir do uso de imagens cinema nas redes de conversações com professores em formação continuada, a partir de uma cartografia de pesquisa que articula o mapeamento de virtualidades presentes no banco de teses da CAPES e as cinecartografias do cotidiano escolar em duas dobras do tempo. Tece um debate teórico que se compõe pelas linhas de pensamento, principalmente, de Bergson (2006a; 2006b), Carvalho (2008; 2009; 2010; 2012) Deleuze (1988; 1991; 1992; 1995; 1996; 2003; 2006; 2007; 2010; 2011), Foucault (1979; 1999. 2006a; 2006b; 2008), Guéron (2010; 2011), Pelbart (2011), Sauvagnargues (2009), dentre outros. As opções teórico-metodológicas estabelecem uma pesquisa de campo na intercessão entre os estudos com o cotidiano escolar e os da pesquisa cartográfica, tomando o plano de imanência como mundo material para a ocorrência de acontecimentos. Utiliza, para a produção de dados a observação participante, os registros em diário de campo, considerados como uma descrição cristalina, assim como, as narrativas cristalinas que emergiam nas redes de conversações com as personagens-escolas (docentes), que se configuram como imagensnarrativas de pesquisa. Organiza o debate dos dados produzidos em sete capítulos. Apresenta como considerações três principais agrupamentos do movimento do pensamento nas redes de conversações com professores provocados pelas imagens cinema: cinescola-clichês, imagensformação docente e cristaisescolas. Destaca que não há uma realidade que comporte uma só verdade sobre a formação com professores, mas o que existe são cortes, percepções, afecções e produções de verdades que entrelaçam os diferentes modos de existir e reexistir na educação brasileira. As telasescolas, assim como as telas do cinema, apresentam e nos cercam com um mundo que articula um cinescola-clichê, imagensformação docente e cristaisescolas, que para além do pensamento reto e dogmático, exibem entre imagens cinema e imagens escolas, outros movimentos do pensamento com a formação de professores, sendo capazes de potencializar as pesquisas educacionais a não ir em ‘busca de um tempo perdido, mas de um tempo a ser redescoberto’, fazendo crer ainda mais nesse mundo e na educação.

Mapping the Obama administration's response to the Arab Spring

When the Arab Spring broke out, the United States was in a quandary over how to handle the crisis in its attempt to balance its moral obligations and ideals without undercutting its strategic interests and those of its close allies. Flaws in US diplomatic approach have contributed to one of the most serious foreign policy crisis for a US administration to date with consequential upheaval and erosion of the US-built balance of power. The reactions and policy responses of the Obama administration highlight the difficulties in grasping with the new reality in the Middle East and in enunciating a policy platform that could combine American interests and values.