Modelagem matemática para a dispersão de fungos fitopatogênicos via autômatos celulares

Brazil is a major world producer and exporter of agricultural products like soybeans, sugar, coffee, orange and tobacoo. However, the action of phytopathogenic fungi has been one of the largest challenges encountered in the field as they are responsible for approximately 25 to 50 per cent of losses in crops of fruits and vegetables. The presence of these pathogens is always a problem, because the damage on the tissues and organs promote lesions which decreses growth vegetation and often leads the individual (host) to death. Therefore, it is crucial to understand the process of spreading of these pathogens in the field to develop strategies which prevent the epidemics caused by them. In this study, the dispersal of fungi phytopathogenic in the field was modeled using the automata cellular formalism. The growth rate of infected plants population was measured by the radius of gyration and the influence of host different susceptibility degrees into the disease spread was assessed. The spatial anisotropy related to the plant-to-plant space and the system’s response to distinct seasonal patterns were also evaluated. The results obtained by a mean field model (spatially implicit models) emphasized the importance of the spatial structure on the spreading process, and dispersal patterns obtained by simulation (using a cellular automata) were in agreement with thse observed in data. All computational implementation was held in language Cl

Organogênese direta do ipê-branco

O ipê-branco é uma espécie de difícil propagação por sementes devido à sua curta longevidade. A cultura de tecidos tem possibilitado a melhor propagação de diversas espécies, tendo como base o crescimento de células, tecidos e órgãos em condições assépticas, possibilitando a rápida multiplicação da planta selecionada, obtendo mudas livres de patógenos. A primeira etapa da cultura de tecidos está baseada na desinfestação das sementes para obter as mudas in vitro, possibilitando as posteriores etapas do processo. Foram testadas diversas concentrações de álcool etílico e hipoclorito de sódio em busca da desinfestação mais efetiva. O melhor processo para a desinfestação das sementes do ipê branco está nos tratamentos de germinação em apenas ágar com a retirada das alas da semente após a sua lavagem, com passagem por 30 segundos em álcool etílico e 5 minutos em hipoclorito de sódio, com posterior transferência da plântula para meio MS suplementado com 0,7% de ágar e 3% de sacarose. Sobre as plantas germinadas in vitro foram aplicados tratamentos com hormônios vegetais em busca das melhores concentrações para a obtenção de novas mudas. Os explantes caulinares tratados com BAP a 4,0 mg L-1 apresentaram 93,3% de brotações bem desenvolvidas, enquanto em meio WPM a melhor concentração para brotação com BAP é a de 4,0 mg L-1, não promovendo no entanto um tratamento tão efetivo como em meio MS. Para cinetina, todos os tratamentos exibiram formação de calo e/ou ausência de brotações em meio MS, e baixa porcentagem de brotação em meio WPM. Os tratamentos realizados com AIB e ANA não tiveram rizogênese efetiva em meio MS, apresentando formação de raízes pouco desenvolvidas em apenas poucos explantes no tratamento de 4,0 mg L-1 de ANA em meio WPM

Avaliação da estabilidade da capacidade de produção de cefamicina C por Streptomyces clavuligerus

Streptomyces clavuligerus é uma importante espécie industrial que produz múltiplos compostos de interesse clínico, destacando-se o antibiótico cefamicina C (CefC) e o ácido clavulânico (AC), um potente inibidor de b-lactamases produzidas por bactérias resistentes a penicilinas e cefalosporinas. Sabe-se que situações limite como subculturas sucessivas, forma inadequada de armazenamento das células, variações bruscas de condições de cultura, podem causar deleções de mais de 25% dos genes de Streptomyces sp que, embora muitas vezes não comprometam a sobrevivência do micro-organismo, acarretam perdas na capacidade produtiva. Neste trabalho, investigou-se a estabilidade da linhagem selvagem S. clavuligerus ATCC 27064 quanto à produção de CefC variando-se condições do inóculo utilizado nos cultivos submersos de obtenção do antibiótico. As fermentações foram realizadas em frascos agitados (28ºC, 260 rpm) e as amostras coletadas em 48 e 72 horas do caldo fermentativo foram analisadas quanto ao pH, biomassa (massa seca a 105ºC por 24 h) e CefC foi determinada por bioensaio de difusão em ágar (bactéria-teste Escherichia coli ESS 2235). Foi selecionado o micro-organismo melhor produtor por meio de screening, e o que apresentou a melhor produção de CefC e os menores desvios com relação à média foi utilizado para preparar novos lotes de células: ampolas de micélios liofilizados e criotubos contendo 108 esporos.mL-1 . Observou-se que a capacidade produtiva foi afetada quando foram utilizadas subculturas do micro-organismo original. A realização do screening mostrou-se eficiente na seleção de colônias superiores em termos de produção volumétrica, sendo recomendada a realização de tal procedimento periodicamente para manutenção de uma linhagem com maior potencial produtivo... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Estudo de dinâmicas populacionais aplicado a processos de tratamento biológico de efluentes

The purpose of this work is to perform studies of mathematical modeling of the relationship of interaction occurring between microrganisms participants from wastewater treatment processes aimed at understanding, through simulations, such as inter-relationships can affect the performance of such units. The methodology was the implementation in FORTRAN computer language of mathematical models of microbial interactions. The first model addresses the interaction of bacteria-forming flakes and filamentous bacteria in activated sludge systems, which seeks to strike a balance between these bacteria to improve efficiency of the process. Another model is studied the interaction between bacteria and protozoa in activated sludge systems and analyzing the efficiency of the process, observing the changes in daily load. Microbial interactions in anaerobic reactors were dealt a third model, in which there is the mutualistic interaction between acidogenic and methanogenic bacteria. In a fourth and final model was examined the relationship between the bacteria Acinetobacter sp. and Gordonia sp., which are present in activated sludge systems, showing the competitive capacity of Acinetobacter sp. can control the growth of unwanted bacteria.

Etiologia e perfil de sensibilidade aos antimicrobianos de pacientes ambulatoriais de Botucatu e região

As infecções do trato urinário (ITU) são definidas como a invasão e posterior multiplicação de microorganismos nos tecidos das vias urinárias, sendo a bactéria gram-negativa E.coli o principal uropatógeno envolvido nessa infecção. A avaliação para a presença de ITU é feita através do quadro clínico característico desse tipo de paciente e o exame de cultura de urina. As amostras positivas para as culturas são avaliadas quanto ao perfil de sensibilidade aos antimicrobianos dos agentes etiológicos encontrados. Descrever a porcentagem de ocorrência dos agentes etiológicos e o perfil de sensibilidade aos antimicrobianos das Infecções do Trato Urinário em pacientes ambulatoriais de Botucatu e região. Foram incluídas neste estudo culturas de urinas de pacientes atendidos em UBS de Botucatu e região Pólo Cuesta, no período de Janeiro de 2008 a Maio de 2010. As culturas positivas foram avaliadas quanto a porcentagem de ocorrência dos uropatógenos segundo sexo, faixa etária e origem. Foi utilizado o teste do qui-quadrado para verificar associação entre cada antimicrobiano e as porcentagens de sensibilidade e resistência encontradas. Foram avaliadas 11.768 culturas de urina provenientes de 11 municípios da região, sendo consideradas as culturas positivas (28%). Quanto à ocorrência dos agentes etiológicos verificou-se que a E.coli é responsável 58,76% dos casos. A distribuição dos uropatógenos segundo sexo revelou maior ocorrência de E.coli nos dois sexos. O segundo agente etiológico de maior ocorrência foi, nos homens o Proteus mirabilis e nas mulheres, o S. saprophyticus. Dentre as faixas etárias, a E.coli foi o patógeno de maior ocorrência. O perfil de sensibilidade aos antimicrobianos revelou que a E.coli é mais sensível a Ertapenem, Imipenem, Meropenem, Fosfomicina, Amicacina, Ceftriaxona, Nitrofurantoína e Norfloxacina; e mais resistente... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Desenvolvimento e validação de método bioanalítico por difusão em ágar para determinação da potência do fenticonazol creme vaginal

O nitrato de fenticonazol é um derivado imidazólico de amplo espectro de ação contra patógenos dermatófitos, como Malassezia furfur e leveduras, a principal delas Candida albicans. É necessário que se possa garantir a qualidade dos medicamentos produzidos. O controle de qualidade é uma ferramenta que assegura a qualidade, eficácia e segurança desses produtos até o momento de sua utilização e faz-se necessário que métodos analíticos sejam desenvolvidos e validados para o doseamento desses fármacos. A grande importância dos métodos microbiológicos utilizados no controle de qualidade de fármacos com atividade antimicrobiana é demonstrar sua atividade biológica por meio de seu efeito inibitório no crescimento de micro-organismo. A diminuição da atividade antimicrobiana ou potência pode indicar alguma alteração sutil na molécula, que é pouco detectável em um método analítico físico-químico. O objetivo deste trabalho foi desenvolver e validar o método microbiológico difusão em ágar para o produto nitrato de fenticonazol creme vaginal. O método de difusão em ágar foi desenvolvido utilizando meio de cultura ágar Sabouraud e cepa de Candida albicans ATCC 64548 como micro-organismo teste. Para o ensaio foi utilizado o delineamento 3 x 3, conforme preconiza a Farmacopeia Brasileira (2010). A validação do método proposto demonstrou linearidade entre os diâmetros dos halos de inibição e o logaritmo da concentração na faixa de 50,0 a 200,0 μg/mL. O método obteve resultados precisos e lineares com r2=1. A exatidão foi comprovada pelo intervalo de tolerância de 98,83%, dentro dos limites permitidos. O método foi validado de maneira satisfatória, podendo ser utilizado em análises do Controle de Qualidade deste fármaco.

Projeto de um sistema anaeróbico para estabilização de lodo e recuperação de energia

The treatment of domestic and industrial effluents through Wastewater Treatment Plants (WTPs) generates a residue termed sewage sludge, rich in organic matter, high-volume, occasionally containing pathogens and heavy metals. The sludge generation can minimize the benefits brought by the treatment of sewage, because this residue does not always receive appropriate treatment before final disposal. The disposal is another problem related to sludge. Landfills generally does not have physical space and alternatives such as the use in agriculture requires an intense treatment that could be in many cases operational or economic unfeasible. The objective of this work is the theoretical research about the processes of stabilization of the sludge by anaerobic digestion and the methanogenic activity during the process. Through analysis of each step and contemplating each relevant factor in anaerobic digestion process in order to optimize them, we proposed a theoretical model of reactors capable of stabilize the sludge, reduce its volume and eliminate pathogens. The obtained configuration consists of two anaerobic reactors connected in series. The first one operates in the range mesophilic temperature (35 ° C) and has higher hydraulic retention time (25 days) working primarily in the stabilization of organic matter present in the sludge and producing biogas, whereas the second one operates in the thermophilic range (55 ° C) in order to eliminate pathogens, and to reduce the volume. The hydraulic retention time in the second reactor is lower (10 days). Both mesophilic and thermophilic processes were efficient in what was proposed, promoting the stabilization of organic matter present in the sludge and significant reduction of pathogens. As a final step with the sludge previously digested, it is indicated a final dehydration... (Complete abstract click electronic access below)

Qualidade microbiológica de lanches e salgados comercializados em Botucatu, SP

A entrada das mulheres no mercado de trabalho, a dificuldade de locomoção do local de trabalho até a residência, a falta de tempo para o preparo das refeições e o preço mais acessível fez com que a escolha por lanches e refeições rápidas tenha crescido muito, nos últimos anos. Entretanto, esses alimentos estão sujeitos a contaminação desde seu preparo até o momento do consumo, além da manutenção em temperaturas inadequadas. Assim, o objetivo do trabalho foi avaliar microbiológica lanches e salgados comercializados em lanchonetes, “lojas de conveniência” e trailers das principais áreas da cidade de Botucatu, deacordo com os padrões estabelecidos pela ANVISA (RDC N º 12, 2001). As análises foram realizadas de acordo com o Compendium (APHA, 2001). Foram analisadas 122 amostras de salgados de carne, coxinhas, risoles de queijo, camarão e palmito, enrolado de salsicha além de salgado de frios e sanduíches, das quais 17 (13,9%) excederam aos limites microbiológicos. Excesso de coliformes termotolerantes foram encontrados 2 coxinhas, 2 risoles de palmito e 6 salgados de carne, no total de 10 amostras (8,2%). A presença Salmonella spp. foi detectada em duas amostras (1,6%) e clostrídios sulfito redutores apresentaram concentrações acima dos limites em somente uma (0,8%) amostra de salgado de carne. Não foram encontradas amostras com excesso de Bacillus cereus. Staphyloccocus aureus foi observado em valores acima dos permitidos em 8 amostras (6,6%) (5 coxinhas, 2 risoles de frios e 1 salgado). A partir das amostras analisadas, os resultados obtidos indicam que a maioria dos salgados estava dentro dos limites microbiológicos estabelecidos pela ANVISA (2001). Entretanto, 9% das amostras apresentaram patógenos, expondo a população a riscos. É necessária maior vigilância das autoridades competentes e, principalmente, conscientização por parte dos vendedores

Seleção de leveduras fermentadoras de D-xilose / L-arabinose

Não disponível

Síntese de microesferas de quitosana para aplicação em liberação controlada de drogas pelo método de atomização e coagulação

Chitosan is a natural biodegradable polymer with great potential for pharmaceutical applications due to its biocompatibility, high charge density , nontoxicity and mucoadhesion. Gel formation can be obtained by the interactions of chitosans with low molecular counterions such as polyphosphates, sulphates and crosslinking with glutaraldehyde. This gelling property of chitosan allows a wide range of applications such as coating of pharmaceuticals and food products, gel entrapment of biochemicals, whole cells, microorganisms and algae. One of its main applications is the synthesis of microspheres for coating of pharmaceuticals , magnetic particles an other substances. In such a way, we can build targeted drug delivery systems. In the present work, we applied the method of spraying and coagulation. The resulting microspheres, then, were characterized by optical microscopy

Avaliação da adição da Lactobacillus acidophilus CRL 1014 e Enterococcus faecium CRL 183 sobre a microbiota intestinal em Simulador do Ecossistema Microbiano Humano (SEMH)

Os micro-organismos probióticos são utilizados em vários produtos alimentícios ou em suplementos alimentares. Simuladores intestinais representam uma opção de realização de estudos com a microbiota intestinal. O simulador do ecossistema microbiano humano (SEMH) consiste em uma sucessão de cinco reatores conectados que representam as diferentes partes do trato gastrointestinal humano com seus respectivos valores de pH, tempo de residência e capacidade volumétrica. O SEMH foi utilizado para estudar o efeito do Enterococcus faecium CRL 183 e do Lactobacillus acidophilus CRL 1014 sobre a microbiota intestinal nativa. Inicialmente, o inóculo preparado com fezes humanas foi introduzido nos três reatores, responsáveis por simular o cólon ascendente, transverso e descendente. Após duas semanas de estabilização foi adicionado, diariamente, durante quatro semanas, E. faecium CRL 183 e L. acidophilus CRL 1014 contendo 108 UFC/mL nos três compartimentos que simulam o cólon ascendente, transverso e descendente. Após as quatro semanas de tratamento o sistema permaneceu durante duas semanas sem adição de probióticos. Durante todo o experimento, foi realizado semanalmente a composição da microbiota intestinal baseada na enumeração de bactérias aeróbias e anaeróbias totais, Enterococcus spp., Lactobacillus spp., Bifidobacterium spp., Enterobactérias e Clostridium spp. Semanalmente, também, foram realizadas análises de ácidos graxos de cadeia curta (acetato, butirato e propionato) e amônia. Através da análise microbiológica observou-se alterações significativas na composição da microbiota do SEMH no decorrer do período do experimento. Alterações significativas também foram observadas na concentração de amônia e de AGCC, podendo assim observar a influência da inoculação de probióticos na microbiota nativa e os metabólitos produzidos por ela

Antagonismo de actinobactérias isoladas de Trachymyrmex frente ao fungo parasita Escovopsis

As formigas da tribo Attini mantêm uma associação com actinobactérias encontradas nos biofilmes presentes no integumento desses insetos. Dentre as actinobactérias associadas às formigas Attini, os gêneros Pseudonocardia e Streptomyces são considerados prevalentes. Estudos indicam que essas bactérias auxiliam na defesa do jardim contra patógenos através da secreção de compostos antimicrobianos. Recentemente foi sugerido que tais bactérias podem ser importantes na defesa do próprio inseto, especialmente contra entomopatógenos. Duas teorias principais foram propostas para explicar as interações entre actinobactérias, formigas Attini e o microfungo parasita Escovopsis. Uma delas defende a coevolução entre esses organismos e a outra rejeita a existência da mesma, argumentando que a interação formiga-actinobactéria é uma simbiose aberta. Neste trabalho, avaliamos a interação entre actinobactérias e Escovopsis em experimentos in vitro. Um total de 14 linhagens de actinobactérias, compreendendo 12 de Pseudonocardia, uma de Streptomyces e uma de Actinoplanes, isoladas de Trachymyrmex (um gênero de formiga Attini não cortadeira) foram testadas frente a quatro linhagens de Escovopsis. Os Escovopsis foram isolados tanto de jardins de fungos de formigas Trachymyrmex quanto de cortadeiras de folhas (Acromyrmex e Atta). O crescimento micelial de Escovopsis (em cm²) foi medido na presença e na ausência (controle) das actinobactérias. Os resultados demonstraram que todas as actinobactérias testadas inibiram Escovopsis, mas as taxas de inibição foram variáveis dependendo da linhagem da actinobactéria (p < 0,05). A linhagem de Streptomyces foi a mais efetiva, corroborando dados da literatura que indicam que outros micro-organismos, além de Pseudonocardia, também apresentam ação inibitória frente à Escovopsis... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Expressão de receptores Toll-like - 2 e Toll-like - 4 em membranas corioamnióticas de gestações complicadas por corioamnionite

Corioamnionite é definida como inflamação das membranas corioamnióticas, sendo que tal inflamação resulta geralmente de infecção bacteriana do líquido amniótico, das membranas fetais e da placenta. O sistema imune inato constitui a primeira linha de defesa do hospedeiro contra patógenos e nesse sentido os receptores Toll-like (TLR) são importantes reguladores dessa resposta inespecífica. Entretanto, a expressão desses receptores nas membranas corioamnióticas de gestações complicadas por corioamnionite não está bem estabelecida. Investigar a expressão de receptores Toll-like -2 e -4 em membranas corioamnióticas de gestações complicadas por corioamnionite. Foram incluídas no estudo 48 membranas corioamnióticas, coletadas no Serviço de Obstetrícia do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu, UNESP, no período de janeiro a novembro de 2008, de gestações pré-termo e de termo, incluindo gestantes com rotura prematura de membranas pré-termo (RPM-PT), trabalho de parto pré-termo (TPP) além de gestações de termo (GT). Fragmentos das membranas corioamnióticas foram encaminhados à análise histopatológica para confirmação de corioamnionite histológica. Outros fragmentos de 1cm2 das membranas foram acondicionados em RNA later® e foram submetidos à extração de RNA total. Após a extração do RNA, as amostras com concentração entre 0,02 e 0,2μg/ μL de RNA foram submetidas à obtenção de cDNA para posterior utilização na quantificação da expressão de TRL-2 e TLR-4 pela técnica da PCR em tempo real empregando-se o sistema TaqMan® Gene Expression Assays. Dentre as 24 membranas corioamnióticas com presença de corioamnionite, 41,7% foram obtidas de... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Avaliação do potencial anti-inflamtório de extratos isolados de microrganismos marinhos

O Brasil possui cerca de 8.000 quilômetros de costa litorânea, a segunda maior do mundo depois da Austrália. Apesar do território marítimo brasileiro apresentar 3,6 milhões de quilômetros quadrados de extensão, as pesquisas relacionadas ao levantamento de potenciais recursos brasileiros obtidos a partir de espécies marinhas ainda são incipientes. O interesse de empresas farmacêuticas por compostos isolados de microrganismos vem crescendo lentamente devido às dificuldades até então encontradas para o isolamento e cultivo dos mesmos. No entanto, com o avanço destas técnicas, recentes estudos demonstram que compostos isolados de microrganismos marinhos representam uma rica e ainda pouco explorada fonte de novos compostos bioativos (estima-se que apenas 1% dos microrganismos marinhos foram cultivados e identificados). Recentes estudos que apontam para o potencial farmacológico de compostos isolados de microrganismos nos instigaram à busca de novos fármacos com potencial imunoestimulador não apenas a partir de invertebrados, mas também de microrganismos marinhos e seus metabólitos secundários bioativos. Neste trabalho, após avaliação do potencial imunomodulador de extratos brutos derivados de microrganismos marinhos, obteve-se a substância pura Pirenocine A, isolada do fungo Penicillium paxilli, que mostrou-se promissora devido sua capacidade de diminuir a produção de óxido nítrico e citocinas pró-inflamatórias em macrófagos estimulados com LPS tanto no protocolo profilático quanto terapêutico ...

Evolução do Receptor do Peptídeo Sexual nos anofelinos Neotropicais

A evolução da hematofagia em mosquitos é sem dúvida a adaptação mais importante desse grupo de inseto em termos da miséria humana e dos patógenos transmitidos pelos vetores no mundo de hoje. Por outro lado, os mosquitos têm muito a oferecer à ciência básica, por exemplo, como indicadores da biodiversidade Neotropical. O peptídeo sexual é expresso nas glândulas acessórias dos machos e inseminado nas fêmeas durante a cópula. A ligação deste peptídeo com o seu receptor desencadeia uma vasta resposta comportamental nos mosquitos. Nessa Revisão discutiremos como o estudo do gene codificante do Receptor do Peptídeo Sexual pode auxiliar o estudo das espécies de anofelinos e as possíveis mudanças comportamentais após a alimentação sanguínea, que pode ter influência na epidemiologia da malária