Low-grade malignant Triton tumor of the oral cavity:a case report

Malignant Triton tumor (MTT) is a malignant peripheral nerve sheath tumor showing rhabdomyoblastic differentiation. It is considered a high-grade neoplasm with poor outcome. This report describes an MTT appearing in the oral cavity. On histologic examination the encapsulated lesion was composed of interlacing fascicles of spindle cells and scattered, large, strap-like pleomorphic cells with abundant eosinophilic cytoplasm. No cross striations were seen. Examination of levels through the tissue showed a total of only 4 normal mitoses and no necrosis. Immunohistochemistry demonstrated diffuse S100 positivity in the spindle cells. The large pleomorphic cells were weakly positive for alpha-sarcomeric actin and myoglobin, although variably but strongly positive for desmin. Management involved a small en bloc resection of the maxilla. After 33 months there was no sign of recurrence or distant metastasis. It was concluded that low-grade variants of MTT occur that do not have an aggressive clinical course.

Effects of tobacco products on the attachment and growth of periodontal ligament fibroblasts

BACKGROUND: Cigarette smoking is one of the most significant risk factors in the development and further advancement of inflammatory periodontal disease, however, the role of either nicotine or its primary metabolite cotinine in the progression of periodontitis is unclear. This study aimed to investigate the effects of nicotine and cotinine on the attachment and growth of fibroblasts derived from human periodontal ligament (PDL).

METHODS: Primary cultures were prepared from the roots of extracted premolar teeth. Cells were used at both low (P3 to P5) and high (P11 to P13) passage. Cell numbers were determined over 14 days using either the 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2, 5-diphenyl tetrazolium bromide (MTT) assay or with a Coulter counter. Cultures were exposed to culture medium supplemented with 1) 15% fetal calf serum (FCS) only; 2) 1% FCS only; 3) 1% FCS and nicotine (concentration range 5 ng/ml to 10 mg/ml); or 4) 1% FCS and cotinine (concentration range 0.5 ng/ml to 10 microg/ml).

RESULTS: Nicotine significantly (P <0.05, by ANOVA) inhibits attachment and growth of low passage cells at concentrations >1 mg/ml and high passage PDL fibroblasts at concentrations >0.5 mg/ml. Cotinine, at the highest concentration used (10 microg/ml), appeared to inhibit attachment and growth of both low and high passage fibroblasts but this was not statistically significant (P >0.05, by ANOVA).

CONCLUSIONS: Tobacco products inhibit attachment and growth of human PDL fibroblasts. This may partly explain the role of these substances in the progression of periodontitis.

The role of JAK1/2-STAT3 as acute resistance mechanism to MEK inhibition in BRAF-mutant colorectal cancer cell lines.

Background: Oncogenic mutations in BRAF occur in 8% of patients with advanced colorectal cancer (CRC) and have been shown to correlate with poor prognosis. In contrast to BRAF mutant (MT) melanoma, where the BRAF inhibitor Vemurafenib (PLX4032) has shown significant increases in response rates and overall survival, only minor responses to Vemurafenib treatment have been reported in BRAFMT CRC. Clear understanding of the vulnerabilities of BRAFMT CRC is important, and identification of druggable targets uniquely required by BRAFMT CRC tumours has the potential to fill a gap in the therapeutic armamentarium of advanced CRC. The aim of this study was to identify novel resistance mechanisms to MEK inhibition in BRAFMT CRC. Methods: Paired BRAFMT/WT RKO and VACO432 CRC cells and non-isogenic BRAFMT LIM2405, WiDR, HT-29 and COLO205 CRC cells were used. Changes in protein expression/activity were assessed by Western Blotting. Interactions between MEK1/2 and JAK1/2 or c-MET inhibition were assessed using the MTT cell viability assays and Flow Cytometry. Apoptosis was measured using Western Blotting for PARP, cleaved caspase 3, 8 and 9, and caspase 3/7 and 8 activity assays. Results: Treatment with MEK1/2 inhibitors AZD6244, trametinib, UO126 and PD98059 resulted in acute increases in STAT3 activity in the BRAFMT RKO and VACO432 cells but not in their BRAFWT clones and this was associated with increases in JAK2 activity. Inhibition of JAK/STAT3 activation using gene specific siRNA or small molecule inhibitors TG101348 or AZD1480, abrogated this survival response and resulted in synergy and significant increases in cell death when combined with MEK1/2 inhibitors AZD6244 or trametinib in BRAFMT CRC cells. The RTK c-MET is activated upstream of STAT3 following MEK1/2 inhibition. Inhibition of c-MET and MEK1/2, using pharmacological inhibitors (crizotinib and AZD6244), results in synergy and increased cell death in BRAFMT CRC cells. Conclusions: We have identified JAK/STAT3 activation as an important escape mechanism for BRAFMT CRC following MEK1/2 inhibition in vitro. Combinations of JAK/MEKi or MET/MEKi can be a potential novel treatment strategy for poor prognostic BRAFMT advanced CRC patients.

The role of LL-37 in periodontal wound healing

Introduction: As a result of chronic inflammation during periodontal disease the junctional epithelium becomes micro-ulcerated. The inflammatory process is mediated by both bacterial and host cell products. Host defence peptides such as defensins, secretory leucocyte protease inhibitor (SLPI) and the sole human cathelicidin, LL-37, are secreted by both periodontal cells and neutrophils into gingival crevicular fluid (GCF). They have the ability to modulate the immune response in periodontitis and are thought to have a potential role in periodontal wound healing. Objectives: The aims of this study were to determine the role of LL-37 in the production of Interleukin (IL)-8, IL-6, hepatocyte growth factor (HGF) and basic-fibroblast growth factor (bFGF) by gingival fibroblasts. The role of LL-37 in modulating total matrix metalloproteinase (MMP) activity and expression of tissue inhibitors of metalloproteinase (TIMP)-1 and -2 by gingival fibroblasts was also investigated. Methods: Primary gingival fibroblasts were co-cultured with concentrations of LL-37 (1, 5 and 10µg/ml) for 24 hours and their supernatants tested for levels of IL-8 and IL-6, HGF, bFGF, TIMP-1 and TIMP-2 by ELISA. Rates of MMP turnover in the supernatants were tested by fluorogenic assay using fluorescence resonance energy transfer (FRET) peptide substrates. Cytotoxicity was measured by MTT assay. Statistical significance was measured using the independent t-test and p<0.05 was considered significant. Results: LL-37 significantly upregulated levels of IL-8, IL-6, HGF, bFGF and TIMP-1 (p<0.05) in a dose-dependent fashion. LL-37 significantly decreased the total MMP activity (p<0.05). None of the LL-37 concentrations tested were cytotoxic to gingival fibroblasts. Conclusion: These results indicate that LL-37 is involved in periodontal wound healing. LL-37 increased levels of proinflammatory cytokines and increased levels of growth factors involved in re-epithelialisation. LL-37 has the ability to regulate remodelling of the periodontium by controlling MMP overactivity both directly and by stimulating production of inhibitors by gingival fibroblasts.

Gingival fibroblasts respond to the TRPV1 agonist capsaicin

Background: The oral cavity is a frontline barrier which is often exposed to physical trauma and noxious substances, leading to pro-inflammatory responses designed to be protective in nature. The transient receptor potential (TRP) super family of ion channels is believed to play a critical role in sensory physiology, acting as transducers for thermal, mechanical and chemical stimuli. Our understanding of the role of TRP channel activation in gingival and periodontal inflammation is currently limited. Gingival fibroblasts are the most abundant structural cell in periodontal tissues and we hypothesised that they may have a role in the inflammatory response associated with TRP channel activation. Objectives: The present study was designed to determine whether the TRPV1 agonist capsaicin could elicit a pro-inflammatory response in gingival fibroblasts in vitro by up-regulation of interleukin-8 (IL-8) production. Methods: Gingival fibroblasts were derived by explant culture from surgical tissues following ethical approval. Cells were maintained in Dulbecco's modified Eagle's medium (DMEM), containing 10% fetal calf serum (FCS) in 5% CO2. Following treatment of gingival fibroblasts with capsaicin, IL-8 levels were measured by ELISA. The potential cytotoxicity of capsaicin was determined by the MTT assay. Results: In gingival fibroblasts treated with the TRPV1 agonist capsaicin (10µM), IL-8 production was significantly increased compared with untreated control cells. Capsaicin was shown not to be toxic to gingival fibroblasts at the concentrations studied. Conclusion: The identification of factors that modulate pro-inflammatory cytokine production is important for our understanding of gingival and periodontal inflammation. This study reports for the first time that gingival fibroblasts respond to the TRPV1 agonist capsaicin by increased production of IL-8. Activation of TRPV1 on gingival fibroblasts could therefore have an important role in initiating and sustaining the inflammatory response associated with periodontal diseases

Effects of LL-37 Peptide Mimetics on Gingival Fibroblast Function

Host defence peptides, including the cathelicidin LL-37, play an important role in mucosal immunity, functioning as both antimicrobial agents and modulators of the inflammatory response. In the current climate of antibiotic resistance, the idea of using naturally occurring antimicrobial peptides, or their synthetic mimetics, to combat oral infection is particularly appealing. Objectives: The aim of this study was to investigate the effects of parent LL-37, and two peptide mimetics (KR-12 and KE-18), on cytokine expression and response to bacterial challenge by gingival fibroblasts. Methods: KR-12 and KE-18 are peptide mimetics of the biologically active, mid-region sequence of LL-37. The effects of commercially available LL-37, KR-12 and KE-18 on gingival fibroblast response to E coli and P gingivalis LPS challenge, analysed by IL-6 and IL-8 expression, were determined in cell culture by ELISA. The direct effects of each peptide on IL-6, IL-8, CXCL-1 and HGF expression were also determined by ELISA. The MTT assay was used to evaluate peptide effects on fibroblast viability. Results: LL-37 and KE-18, but not KR-12, inhibited LPS induction of inflammatory cytokine expression and directly stimulated CXCL-1 production by fibroblasts. All 3 peptides stimulated production of IL-8 and HGF. Neither LL-37 nor KE-12 affected cell viability, while KE-18, at higher concentrations, induced cell death. Conclusions: Shorter, peptide mimetics of LL-37, in particular KE-18, retain the immunomodulatory effects of the parent molecule and possess excellent potential as therapeutic agents in the treatment of oral infections including periodontal disease.

Antibacterial Activity of Peptides from the African Volcano Frog

Introduction: Cationic, α- helical antimicrobial peptides found in skin secretions of the African Volcano Frog, Xenopus amieti include magainin-AM1, peptide glycine-leucine-amide (PGLa-AM1) and caerulein-precursor fragment (CPF-AM1). Objectives: The principle objective of this study was to determine the antibacterial activity of these peptides against a range of aerobic and anaerobic and oral pathogens. Secondary objectives were to establish their lipopolysaccharide (LPS) binding activity and determine potential cytotoxic effects against host cells. Methods: Magainin-AM1, PGLa-AM1 and CPF-AM1 were assessed for their antimicrobial activity against Fusobacteriim nucleatum, Streptococcus mutans, Lactobacillus acidophilus, Enterococcus faecalis and Streptococcus milleri using a double layer radial diffusion assay. The propensity for each peptide to bind LPS was determined using an indirect ELISA. The potential cytotoxicity of the peptides against human pulp cells in vitro was determined using the 3-(4,5-Dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide (MTT) assay. Results: Magainin-AM1, PGLa-AM1 and CPF-AM1 displayed potent antimicrobial activity against all the bacterial pathogens tested, with Magainin-AM1 being the least effective. PGLa-AM1 was most potent against S. mutans, with a minimum inhibitory concentration (MIC) of 1.2 μM. PGLa-AM1 and CPF-AM1 were both very active against F. nucleatum with MIC values of 1.5 μM and 2.2 μM respectively. The LPS binding ability of the peptides varied depending on the bacterial source of the LPS, with PGLa-AM-1 being the most effective at binding LPS. Cytotoxicity studies revealed all three peptides lacked cytotoxic effects at the concentrations tested. Conclusions: The peptides magainin-AM1, PGLa-AM1 and CPF-AM1 from the African Volcano Frog, Xenopus amieti displayed potent antimicrobial activity and LPS binding activity against a range of oral pathogens with little cytotoxic effects. These peptides merit further studies for the development of novel therapeutics to combat common oral bacterial infections.

Abstract B64: The role of JAK1/2-STAT3 as acute resistance mechanism to MEK inhibition in BRAF mutant colorectal cancer.

Background: Oncogenic mutations in BRAF occur in 8% of patients with advanced colorectal cancer (CRC) and have been shown to correlate with poor prognosis. In contrast to BRAF mutant (MT) melanoma, where the BRAF inhibitor PLX4032 has shown significant increases in response rates and overall survival compared to standard Dacarbazine treatment, only minor responses to PLX4032 treatment have been reported in BRAFMT CRC. Clear understanding of the vulnerabilities of BRAFMT CRC is important, and identification of druggable targets uniquely required by BRAFMT CRC tumors has the potential to fill a gap in the therapeutic armamentarium of advanced CRC. The aim of this study was to identify novel resistance mechanisms to MAPK inhibition in BRAFMT CRC.

Methods: Paired BRAFMT/WT RKO and VACO432 CRC cell line models and non-isogenic BRAFMT LIM2405, WiDR and COLO205 CRC cells were used. Changes in protein expression/activity were assessed by Western Blotting. Interaction between MEK1/2 and JAK1/2 inhibition was assessed using the MTT cell viability assays and flow cytometry. Apoptosis was measured using Western blotting for PARP, cleaved caspase 3/8 and caspase 8, 3/7 activity assays.

Results: Treatment with MEK1/2 inhibitors AZD6244, GSK1120212, UO126 and PD98059 resulted in acute increases in STAT3 activity in the BRAFMT RKO and VACO432 cells but not in their BRAFWT clones and this was associated with increases in JAK2 activity. Inhibition of JAK/STAT3 activation using gene specific siRNA or small molecule inhibitors TG101348 or AZD1480, abrogated this survival response and resulted in significant increases in cell death when combined with MEK1/2 inhibitors AZD6244 or GSK1120212 in BRAFMT CRC cells. In addition, combination of MEK1/2 and JAK/STAT3 inhibition resulted in strong synergy with CI values between 0.3 and 0.7 in BRAFMT CRC cells.

Conclusions: We have identified JAK/STAT3 activation as an important escape mechanism for BRAFMT CRC following MEK1/2 inhibition. These data provide a strong rationale for further investigation of combination of MEK1/2 and JAK/STAT3 inhibition in BRAFMT in vivo models.

Laser Surface Treatment of Polyamide and NiTi Alloy and the Effects on Mesenchymal Stem Cell Response

Mesenchymal stem cells (MSCs) are known to play important roles in development, post-natal growth, repair, and regeneration of mesenchymal tissues. What is more, surface treatments are widely reported to affect the biomimetic nature of materials. This paper will detail, discuss and compare laser surface treatment of polyamide (Polyamide 6,6), using a 60 W CO2 laser, and NiTi alloy, using a 100 W fiber laser, and the effects of these treatments on mesenchymal stem cell response. The surface morphology and composition of the polyamide and NiTi alloy were studied by scanning electron microscopy (SEM) and X-ray photoemission spectroscopy (XPS), respectively. MSC cell morphology cell counting and viability measurements were done by employing a haemocytometer and MTT colorimetric assay. The success of enhanced adhesion and spreading of the MSCs on each of the laser surface treated samples, when compared to as-received samples, is evidenced in this work. © (2015) COPYRIGHT Society of Photo-Optical Instrumentation Engineers (SPIE). Downloading of the abstract is permitted for personal use only.

Influência do tratamento de material vegetativo de videira, por imersão em água quente, no seu desenvolvimento em viveiro e na eliminação da flavescência dourada

Dissertação de mestrado em Agricultura Sustentável, apresentada na Escola Superior Agrária de Santarém, Instituto Politécnico de Santarém.

Reciclagem termoquímica de resíduos de plásticos e de pneus por pirólise

A sociedade moderna encontra-se cada vez mais dependente dos combustíveis líquidos bem como de produtos derivados do petróleo. Em virtude do limitado tempo de vida das reservas naturais de petróleo, torna-se imperativo encontrar fontes alternativas de produção de hidrocarbonetos. A pirólise de resíduos de pneus e plásticos pode ser uma dessas possíveis fontes. Neste processo, o tratamento termoquímico implementado aos resíduos permite, não só, a valorização económica resultante da sua transformação em produtos de valor acrescido, como também a recuperação do conteúdo orgânico. O referido processo conduz à formação de hidrocarbonetos em fase líquida que podem ser utilizados pela indústria como combustíveis líquidos e/ou como matéria-prima. O presente trabalho tem como objectivo principal a definição das condições experimentais mais propícias à obtenção de combustíveis líquidos (maximização) resultantes da pirólise de misturas de resíduos de borracha de pneus e plásticos nomeadamente polietileno (PE), polipropileno (PP) e poliestireno (PS). Como instrumento de optimização das condições experimentais optou-se pela Metodologia dos Planos Factoriais de Ensaios. Os resultados experimentais obtidos mostram que as taxas de conversão em fase líquida podem atingir valores superiores a 80% (m/m) dependendo das condições experimentais utilizadas bem como do tipo e mistura de resíduos a pirolisar. Os rendimentos das fracções gasosa e sólida podem atingir valores na ordem dos 5% e 12% (respectivamente). Foi também estudado o efeito das condições experimentais nomeadamente a temperatura de reacção, pressão inicial, tempo de reacção e composição da mistura. Este estudo revelou que a maximização da fracção líquida é favorecida por uma temperatura de ensaio de 370ºC, uma pressão inicial de 0,48MPa e um tempo de ensaio de 15 minutos. Relativamente à composição da mistura, os melhores resultados foram obtidos com 30% (m/m) de resíduos de borracha de pneus (BP) associados a uma mistura de 70% (m/m) de resíduos de plásticos composta por 20% polietileno, 30% polipropileno e 20% poliestireno. Igualmente foi feita a caracterização física e química da matéria-prima e dos produtos obtidos pelo referido processo, bem como, o estudo da presença de diferentes substâncias potencialmente doadores de hidrogénio ao meio reaccional de forma a melhorar o rendimento líquido. Por último, foram realizados estudos cinéticos das reacções químicas de formação dos diferentes produtos aos resíduos de borracha de pneus (BP), misturas de resíduos de plástico (PE, PP e PS) e suas misturas. Ainda, foram ajustados os resultados obtidos pelo modelo teórico aos resultados experimentais, propostos mecanismos reaccionais de formação dos produtos e calculados os parâmetros cinéticos. De acordo com os resultados obtidos, a pirólise pode representar um papel significativo na valorização energética e orgânica destes resíduos apesar de, ainda, ser necessário o desenvolvimento de alguns aspectos tecnológicos de modo a tornar mais atraente a implementação desta tecnologia à escala industrial.

Influence of speciation in the bioavailability of cadmium to an isopod

Devido às actividades antropogénicas várias substâncias químicas têm sido introduzidas no meio ambiente em concentrações que de outro modo não ocorreriam de forma tão elevada naturalmente. Assim, o conhecimento acerca das características de um químico, tais como, o potencial para se acumular em diferentes níveis tróficos, a sua mobilidade dentro do ecossistema, a toxicidade específica e a bioacumulação, é fundamental para compreender os seus efeitos nos ecossistemas. Esta tese investiga a influência de especiação, na biodisponibilidade do cádmio (Cd) para o isópode Porcellio dilatatus, incluindo os efeitos de especiação do metal: (i) na assimilação do Cd, (ii) no modo como o Cd se distribui internamente no organismo, e (iii) como a sobrevivência e a reprodução são afectadas em isópodes terrestres. Num primeiro ensaio laboratorial avaliou-se a importância da transferência trófica na assimilação do Cd em P. dilatatus. Para tal analisou-se a eficiência de assimilação (EA) do Cd em isópodes, adicionado superficialmente ao alimento (alface) na forma de Cd(NO3)2 e contaminando o meio de crescimento da alface. A hipótese era de que a alface contaminada biologicamente através do cultivo em meio hidropónico contaminado teria uma maior proporção de complexos com proteína ou conjugado na forma de Cd (ex. Cd cisteína). A EA de Cd foi maior entre os isópodes que foram alimentados com o sal (71%, SE = 7%), do que entre os isópodes que se alimentaram de alface contaminada biologicamente (52%, SE = 5%), demonstrando-se assim num teste laboratorial que é provável que a especiação do Cd influencie a taxa de assimilação e acumulação do Cd. Na experiência alimentar que se seguiu, estudou-se em detalhe a especiação do metal comparando as EA do Cd conjugado com cisteína (Cd(Cys)2) e na forma de Cd(NO3)2, com os quais se contaminou gelatina com alface. A utilização de Cd-cisteína, proporcionou uma forma experimental para explorar a biodisponibilidade do Cd complexado dentro do tecido biológico. Como esperado, a EA de Cd em isópodes alimentados com nitrato de Cd (64%, SE = 5%) foi maior do que no caso de isópodes alimentados com o conjugado de cisteína (20%, SE = 3%). De seguida estudou-se a distribuição subcelular das espécies de Cd assimilado através de um processo de fraccionamento. Supunha-se que as diferenças de especiação de Cd reflectiria diferentes estratégias de compartimentalização, com consequências ao nível da detoxificação, armazenamento celular e distribuição subcelular do metal. O “sequestro” na forma de metal biologicamente detoxificado (BDM = proteínas estáveis ao calor - HSP e grânulos ricos em metal - RMG) foi maior nos isópodes alimentados com Cd(NO3)2, sugerindo que são mais eficientes na detoxificação de Cd (22%) do que quando alimentados com Cd(Cys)2 (15%). Foi também demonstrado que os isópodes alimentados com Cd(Cys)2 possuíam níveis de armazenamento de Cd superior nas fracções sensíveis ao metal (MSF = organelos e proteínas desnaturadas pelo calor - HDP) consideradas fracções potencialmente vulneráveis e afectando os isópodes em termos de toxicidade. As diferentes distribuições internas que se seguiram à assimilação e detoxificação das diferentes espécies de Cd foram finalmente avaliadas em termos da sobrevivência e reprodução dos isópodes. O tratamento com Cd(Cys)2 teve maior mortalidade, provavelmente devido à maior disponibilidade de Cd ingerido com implicações ao nível dos processos fisiológicos. Os isópodes alimentados com Cd(NO3)2 armazenaram o Cd nos MRG, como estratégia de detoxificação, sendo mais eficientes a detoxificar o Cd ainda que aumentando a concentração total do metal que se tornou menos tóxico para o isópode. Desta forma, o Cd nos grânulos não estava disponível para os processos fisiológicos e deixou de ser tóxico. Isso poderia estar relacionado com a resistência e tolerância aos metais devido à capacidade dos isópodes compartimentalizarem o Cd no hepatopâncreas, que actua como um mecanismo de detoxificação e contribui para a tolerância a altos níveis de cádmio. Em termos de parâmetros reprodutivos, observou-se uma redução de gestações e duração da gestação na presença de ambas as espécies de metal, mas no caso do Cd(Cys)2 as gravidezes não se concluíram. O número de jovens produzido por fêmeas alimentadas com Cd(NO3)2 foi menor do que no controlo, mas os pesos dos juvenis foram superiores. Finalmente sugere-se assim que esta abordagem seja considerada em estudos do movimento trófico de metais nas cadeias alimentares dado que se espera que a especiação de metais implique diferentes fluxos, dentro de uma dada cadeia trófica.

Arsénio em águas subterrâneas em Portugal

Da totalidade da água existente na Terra, somente 1% diz respeito à água subterrânea, recurso finito e essencial para a sobrevivência do Homem. A composição química das águas subterrâneas é influência não só pela actividade humana, mas também pelas características químicas do substrato geológico. As rochas e os sedimentos funcionam como meio de transporte e armazém desse tipo de águas e a presença de certos minerais pode originar a contaminação natural das águas subterrâneas em elementos prejudiciais para o Homem. Um desses elementos é o arsénio. Uma vez que a concentração máxima admitida de arsénio para água consumo humano diminuiu dos anteriores 50 mg.l-1 para os actuais 10 mg.l-1,a probabilidade de encontrar concentrações naturais em arsénio em águas subterrâneas acima desse limite aumentou. Este trabalho visa estudar e compreender, através de ensaios laboratoriais, a interacção água/rocha em termos químicos e a mobilidade/comportamento do arsénio em seis zonas de Portugal Continental com contextos geológicos diferentes (Vila Flor – Formação Filito-Quartzítica, Baião – granitos, Cacia – sedimentos do Cretácico, Mamodeiro – sedimentos do Neogénico, Escusa – calcários dolomíticos e Beja - gabros). Para o efeito, nas zonas de estudo mencionadas foram colhidas amostras de rocha ou sedimento e de água subterrânea que foram analisadas para 36 e 76 elementos, respectivamente. A componente mineralógica e as fases suporte do As foram estudadas recorrendo à análise por difracção de raios X, microssonda electrónica e à aplicação da extracção química selectiva sequencial. A mobilização do As foi avaliada através da realização de ensaios de coluna e de agitação com hidrocarbonetos derivados do petróleo. No primeiro ensaio, a circulação de diferentes soluções com diferentes velocidades lineares no interior de colunas de vidro cheias de rocha moída, avaliou a presença de As associado a fases hidrossolúveis e biodisponíveis. No segundo, a agitação de rocha moída com água e hidrocarbonetos derivados do petróleo pretendeu avaliar o comportamento do As quando um aquífero apresenta uma contaminação com aquele tipo de hidrocarbonetos.

Evolução da população do fungo nematófago Pochonia chlamydosporia -isolado PcMR, após inoculação, no solo e na raiz do tomateiro cultivado em estufa

O fungo Pochonia chlamydospoia é um potencial agente de controlo biológico dos nemátodes-das-galhas-radiculares. Com este trabalho, pretendeu-se avaliar a eficácia de inoculações de clamidósporos no solo, no estabelecimento de uma população do fungo no solo e na raiz de tomateiro em estufa com níveis de densidade iguais ou superiores aos considerados como necessários para um eficaz controlo dos nematodes-das-galhas-radiculares. Ao longo de dois anos de ensaio, fórum efetuadas inoculações do isolado PcMR e avaliada a densidade de fungo no solo e na raiz, As inoculações efetuadas permitiram estabelecer uma população de P. chlamydosporia no solo e atingir os valores de densidade pretendidos. No entanto, os valores pretendidos para colonização da raiz pelo fungo foram atingidos apenas no primeiro ano. Foi igualmente demonstrada a capacidade do fungo em se manter no solo durante longos períodos de tempo mesmo na ausência de cultura e em condições adversas de humidade e temperatura. /ABSTRACT: Pochonia chlamydosporia is a potential root-knot nematode biological control agent. The aim of this work was to evaluate the effectiveness of chlamydospore inoculations at the soil, for the establishment at both soil and greenhouse tomato root, of a fungus population in density levels equal or superior to those considered as needed for an effective control of root-knot nematode. Along two years, several inoculations using the Portuguese isolate PcMR were made and the density of fungus at the soil and roots studied. These inoculations allowed the establishment of a population of P. chlamydosporia at the soil and achieve the desired density values. However, only in the first year of assay, the desired values of root colonization by fungus were achieved. lt was also demonstrated that P. chlamydosporia can survive for itself at the soil for a long period of time even in the absence of plant culture and in adverse moist and temperature conditions.

Protein phosphatases acting on the replication checkpoint

A génese de um cancro está dependente da acumulação de mutações genéticas que dão origem a instabilidade genómica, que por sua vez resulta na proliferação descontrolada. Para prevenir a acumulação destas mutações, as células têm mecanismos de controlo (checkpoints) que suspendem o ciclo celular e accionam as vias de reparação do ADN. Estes eventos são muitas vezes regulados por dinâmicas de (des)fosforilação de proteínas. As proteínas fosfatases (PPs), enzimas responsáveis pela remoção do grupo fosfato de resíduos fosforilados, desempenham funções cruciais na regulação de muitos mecanismos celulares. Enquanto que no início do projecto as cinases envolvidas no checkpoint da replicação estavam bem estabelecidas, as PPs envolvidas não eram conhecidas. A Chk1, um componente da maquinaria do checkpoint da replicação, é exemplo dessa regulação por (des)fosforilação, como sejam nos resíduos Ser317 e Ser345. Assim, como primeira abordagem para determinar quais os grupos de PPs envolvidos na regulação do checkpoint da replicação, decidimos investigar o seu papel na regulação da fosforilação da Chk1. A primeira conclusão é que a desfosforilação da Chk1 ao longo do tempo, tanto in vivo como in vitro, ocorre com uma dinâmica bi-fásica. Em segundo, a abordagem in vitro sugere que as famílias PP1, PP2A e PP2C estão envolvidas na desfosforilação da Chk1. Uma vez que a família PP2A foi a que mostrou a maior acção nesta reacção, decidimos investigar outros membros da família in vivo, primeiro com uma abordagem geral (tratando com OA ou sobreexpressando a PME-1), e depois com o knockdown específico da PP4 e PP6 (através de siRNA). Os resultados mostram que a inibição das PPs afectam tanto a desfosforilação como o estado de activação da Chk1 em resposta a tratamento com Hidroxiureia (HU). Todas as PPs testadas in vivo pareceram ser capazes de regular, a níveis diferentes, tanto a fosforilação como a desfosforilação da Chk1. A função das PPs foi também investigada ao nível: da regulação do disparo das origens de replicação, e da recuperação da suspensão da replicação, induzida pela HU. No último caso, os dados indicam que na situação simultânea de knockdown da PP4 com tratamento de HU, há um atraso do ciclo celular na resolução da transição de G2/M. No ensaio de replicação por pulse-chase, os resultamos mostram que tanto o tratamento com OA, como a sobre-expressão de I-2 ou PME-1, atrasam a cronologia do disparo programado das origens de replicação. No entanto, nenhum dos tratamentos efectuados parece desregular o início do checkpoint da replicação. Um rastreio de 2-híbrido de levedura com uma biblioteca de cDNA de testículo humano foi realizado, usando a Chk1 como isco, no sentido de descobrir novos interactores e definir novas possíveis funções para a Chk1 no contexto da meiose. Com base nos resultados do rastreio, duas novas funções são sugeridas: a interacção com a GAGE12 sugere uma função na recombinação genómica/vigilância do genoma durante a meiose, e as interacções com a EEF1α1 e a RPS5 sugerem uma função na regulação da síntese proteíca. Estas experiências fornecem um visão geral para a compreensão da diversidade de funções das proteínas fosfatases envolvidas no checkpoint da replicação, bem como, abre novos caminhos para o desenvolvimento de novas drogas para o tratamento do cancro.