Cu 2p core-level photoemission spectrum of Sr2CuO3

We measure the Cu 2p X-ray photoemission spectrum (XPS) of Sr2CuO3 and analyze it by means of exact diagonalization calculations for (CunO3n)(4n-) clusters. In Sr2CuO3, the intensity ratio of the 3d(y) satellite to the 3d(10)(L) under bar main line is 0.35-0.4, which is evidently smaller than that in the other high-T-c related cuprates. We ascribe it as the smaller charge-transfer energy between the Cu 3d and O 2p. The origin of the broad main-line of Sr2CuO3 is also discussed.

Theory of coexisting charge and spin-density waves in (TMTTF)(2)Br, (TMTSF)(2)PF6 and alpha-(BEDT-TTF)(2)MHg(SCN)(4)

We discuss a recently formulated microscopic theory of the unusual coexistence of spin density waves (SDWs) and charge density waves (CDWs) that has been seen in recent experiments on (TMTTF)2Br, (TMTSF)2PF6 and α-(BEDT-TTF)2MHg(SCN)4.

studies in terpenoids .53. revision of the structure assigned to a monoterpene isolated from piqueria-trinervia

Unambiguous synthesis of 2-methyl-3-isopropenylanisole (View the MathML source) and 2-isopropenyl-3-methylanisole (View the MathML source) has led to revision, from (View the MathML source) to (View the MathML source), of the structure assigned to a monoterpene phenol ether isolated from View the MathML source.

ATM- and ATR-mediated phosphorylation of XRCC3 regulates DNA double-strand break-induced checkpoint activation and repair

The RAD51 paralogs XRCC3 and RAD51C have been implicated in homologous recombination (HR) and DNA damage responses. However, the molecular mechanism(s) by which these paralogs regulate HR and DNA damage signaling remains obscure. Here, we show that an SQ motif serine 225 in XRCC3 is phosphorylated by ATR kinase in an ATM signaling pathway. We find that RAD51C but not XRCC2 is essential for XRCC3 phosphorylation, and this modification follows end resection and is specific to S and G(2) phases. XRCC3 phosphorylation is required for chromatin loading of RAD51 and HR-mediated repair of double-strand breaks (DSBs). Notably, in response to DSBs, XRCC3 participates in the intra-S-phase checkpoint following its phosphorylation and in the G(2)/M checkpoint independently of its phosphorylation. Strikingly, we find that XRCC3 distinctly regulates recovery of stalled and collapsed replication forks such that phosphorylation is required for the HR-mediated recovery of collapsed replication forks but is dispensable for the restart of stalled replication forks. Together, these findings suggest that XRCC3 is a new player in the ATM/ATR-induced DNA damage responses to control checkpoint and HR-mediated repair.

MolBridge: a program for identifying nonbonded interactions in small molecules and biomolecular structures

Identification and analysis of nonbonded interactions within a molecule and with the surrounding molecules are an essential part of structural studies, given the importance of these interactions in defining the structure and function of any supramolecular entity. MolBridge is an easy to use algorithm based purely on geometric criteria that can identify all possible nonbonded interactions, such as hydrogen bond, halogen bond, cation-pi, pi-pi and van der Waals, in small molecules as well as biomolecules. The user can either upload three-dimensional coordinate files or enter the molecular ID corresponding to the relevant database. The program is available in a standalone form and as an interactive web server with Jmol and JME incorporated into it. The program is freely downloadable and the web server version is also available at http://nucleix.mbu.iisc.ernet.in/molbridge/index.php.

Immunogen design for HIV-1 and influenza

Vaccines provide the most cost effective defense against pathogens. Although vaccines have been designed for a number of viral diseases, a vaccine against HIV-1 still remains elusive. In contrast while there are excellent influenza vaccines, these need to be changed every few years because of antigenic drift and shift The recent discovery of a large number of broadly neutralizing antibodies (bNAbs) and structural characterization of the conserved epitopes targeted by them presents an opportunity for structure based HIV-1 and influenza A vaccine design. We discuss strategies to design immunogens either targeting a particular antigenic region or focusing on native structure stabilization. This article is part of a Special Issue entitled: Recent advances in molecular engineering of antibody. (C) 2014 Elsevier B.V. All rights reserved.

Oscillatory Instabilities of Two-Layer Rayleigh-Marangoni-Benard Convection

The Rayleigh–Marangoni–Bénard convective instability (R–M–B instability) in the two-layer systems such as Silicone oil (10cSt)/Fluorinert (FC70) and Silicone oil (2cSt)/water liquids are studied. Both linear instability analysis and nonlinear instability analysis (2D numerical simulation) were performed to study the influence of thermocapillary force on the convective instability of the two-layer system. The results show the strong effects of thermocapillary force at the interface on the time-dependent oscillations at the onset of instability convection. The secondary instability phenomenon found in the real two-layer system of Silicone oil over water could explain the difference in the comparison of the Degen’s experimental observation with the previous linear stability analysis results of Renardy et al.

Influence of Forced Convection on Columnar Microstructure During Directional Solidification of Al-Ni Alloys

This paper presents a summary of cellular and dendritic morphologies resulting from the upward directional solidification of Al - Ni alloys in a cylindrical crucible. We analysed the coupling of solid-liquid interface morphology with natural and forced convection. The influence of natural convection was first analyzed as a function of growth parameters (solute concentration, growth rate and thermal gradient). In a second step, the influence of axial vibrations on solidification microstructure was investigated by varying vibration parameters (amplitude and frequency). Experimental results were compared to preliminary numerical simulations and a good agreement is found for natural convection. In this study, the critical role of the mushy zone in the interaction between fluid flow and solidification microstructure is pointed out.

Determinación de los agentes patógenos causales de la pata negra en ajonjolí (Sesamum indicum L.)

El presente estudio se realizó de octubre 1997 a julio de 1999 con muestras de ajonjolí recolectadas en las fincas La Planta ubicada en el municipio de León, departamento de León, La Grecia del municipio de Chinandega, departamento de Chinandega y en el municipio de Tipitapa, departamento de Managua. Los propósitos del estudio fueron determinar los agentes patógenos causales de la Pata Negra en el cultivo de ajonjolí (Sesamun indícum L), caracterizar los síntomas, demostrar la patogenicidad y describir los daños de los agentes causales de la enfermedad. En las plantas colectadas se observaron síntomas característicos de la enfermedad conocida como Pata Negra, ya que la base de los tallos y las raíces mostraban. coloraciones negras y rojizas, las hojas presentaban manchas cloroticas y marchitez, algunas plantas presentaban maduración temprana y muerte prematura. Las muestras de material enfermo de ajonjolí fueron procesadas e identificados los patógenos en el laboratorio de micología de la Escuela de Sanidad Vegetal de la Universidad Nacional Agraria (U.N.A.), ubicada en el Km 12 Y. carretera Norte, Managua, Nicaragua. Siguiendo los postulados de Koch se procedió a hacer cultivos en el laboratorio de las diferentes partes afectadas de las plantas traídas del campo y posteriormente se reprodujeron los síntomas en invernadero. En las muestras se identificaron los hongos Fusarium oxysporum ftp, Macrophomina phaseolina(Tassi) G. Goid y la bacteria Xanthomonas sp. VIl Se sembraron 120 plantas en el invernadero de una misma variedad (Maporal), de las cuales 40 plantas se inocularon con Fusarium oxysporum fsp, 40 plantas se inocularon con Macrophomina phaseolina (Tassi) G. Goid y 40 plantas se dejaron como testigos. Los síntomas observados en las plantas inoculadas (0,15,30,45 días después de la siembra) fueron: marchitez de las hojas, crecimiento lento y poco grosor del tallo, bases de los tallos y raíces con presencia de coloración negra y rojiza, presencia de deformaciones en algunos tallos y en algunos casos se observaron micelios de los hongos. Ademas se comprobó que en plantas adultas los síntomas fueron más severos. Para describir los daños que causan los agentes patógenos de la enfermedad en invernadero, a las plantas se les midió algunas variables como : altura, grosor del tallo, producción de granos, y se observó en la base del tallo y en la raíz de cada planta la presencia del patógeno, las plantas inoculadas con Fusarium oxysporum fsp fueron las que presentaron menor rendimiento en las variables que se les midió.

Determinación del período de adquisición, inoculación y retención del geminivirus transmitido por la mosca blanca (Bemisia tabaci Genn) en el cultivo de tomate (Licopersicon esculentum Mill) en el Valle de Sébaco

El objetivo del presente trabajo consistió en la caracterización biológica de un geminivirus que afectó el cultivo del tomate ( Licpersicon esculentum Mill ). El estudio se realizó en la Universidad Nacional Agraria (UNA), en el periodo de enero 2001 - enero del 2002. Esta i nvestigación se realizó en tres fases: la primera de invernadero, donde se cultivaron plantas de tomate de la variedad UC - 82, se improvisó una cría de moscas blancas ( Bemisia tabaci Genn) vector del geminivirus en estudio y donde se estuvo reproduciendo el geminivirus de Sébaco en las plantas de tomate de la variedad ya mencionada, que servirían posteriormente como fuente de inóculo, esto se hizo por medio de injertos e inoculaciones, con el propósito de caracterizarlo biológicamente determinando los periodos de adquisición, inoculación, retención así como el rango de hospedero. Para este estudio se determinó a demás el porcentaje de infectividad de las colonias de moscas blancas, el cual fue de 66.6%, lo que indicó que se necesitaban cinco moscas por tratamiento, ya que estas garantizarían que al menos tres de ellas serían portadoras del geminivirus una vez que han adquirido el virus de la fuente de inóculo. Los tratamientos consistían en los diferentes tiempos expresados en horas como 0.08, 0.16, 1, 2, 4, 8, 10, 12, 18, 24, 48, h con tres repeticiones para cada uno de ellos. La fase de laboratorio de vectores consistió en llevar a cabo prácticamente los periodos de adquisición, inoculación y retención, los cuales dieron como resultados que B.tabaci necesita alimentarse de una planta infestada tan sólo 0.16 h que es equivalente a 10 minutos para adquirir el virus y que necesita un mismo tiempo para transmitirlo una vez que se ha alimentado en una planta sana. Respecto al periodo de retención el vector es capaz de retener las partículas virales hasta un séptimo día y que a medida que pasan los días la capacidad de transmisión disminuye. En el estudio era también objetivo conocer cual era el rango de hospedante que tenía el geminivirus de Sébaco, por lo que se evaluaron 5 especies de la familia Solanácea, injertándolas con plantas infestadas del cultivo del tomate, resultando la especie Nicotiana tabacum cv Benthamiana con síntomas del virus. La última fase se llevó a cabo en el laboratorio de Biología Molecu lar donde se analizó a través de la técnica de PCR la presencia y ausencia de geminivirus en las plantas con las que se estuvo trabajando en el transcurso de la investigación. Finalmente los resultados obtenidos en los diferentes periodos fueron analizados mediante un análisis de Regresión Logística Binaria, ya que los datos eran categóricos, es decir, cuyas respuestas son de sí o no en otras palabras presencia o ausencia del geminivirus, donde la presencia era igual a uno y la ausencia de este mismo igual a cero.

Agustín de Hipona: bienes creados y felicidad

Introducción: En el siguiente trabajo nos proponemos indagar ciertas cuestiones correspondientes a uno de los problemas esenciales de toda la filosofía: ¿cuál es el fin último del hombre y en qué consiste su felicidad? Dada la inabarcabilidad de dicho propósito, entraremos en diálogo únicamente con el pensamiento de Agustín de Hipona y su postura frente a la problemática que nos atañe. Conforma el eje central de nuestro estudio la postura del Hiponense respecto de los bienes terrenales, agrupables bajo el concepto de mundo, y su relación con el fin último del hombre. En primer lugar intentaremos presentar qué entiende Agustín por felicidad y cuál es el objeto más propio de dicho deseo. A continuación presentaremos el concepto de mundo desarrollado por el autor, dejando en evidencia el conjunto de bienes que este abarca. Más adelante abordaremos la tensión que se genera en el pensamiento del Hiponense entre el mundo y Dios, trayendo a colación las posturas adoptadas por Romano Guardini y Victorino Capánaga...

El conocimiento y sus horizontes : análisis y comparación del papel de la perspectiva entre las gnoseologías de Kant, Nietzsche, Husserl y Ortega y Gasset

Resumen: En este artículo se abordan los planteos gnoseológicos básicos de Kant, Nietzsche, Husserl y Ortega con el fin de establecer un paralelismo entre ellos. El elemento común que se busca es la noción de perspectiva como límite de nuestro conocimiento y a la vez como puerta de entrada y salida entre el Yo y el mundo. En esa búsqueda se tendrá especialmente en cuenta la respuesta orteguiana a la dicotomía racionalismo-relativismo, acaso ya intuida por los otros tres autores.

La abstracción formal y la validación del razonamiento inductivo

Resumen: Suele admitirse que uno de los problemas pendientes, al menos desde Hume, en la teoría de la ciencia es la justificación crítica de los procesos inductivos, que son los que siguen las ciencias experimentales, como son las ciencias naturales. Frente a las ineficaces explicaciones aportadas por el empirismo o neopositivismo, así como por los racionalismos o idealismos, que son radicalmente incapaces para resolver el problema, nosotros presentamos la respuesta del realismo aristotélico, basada en el correcto concepto de abstracción formal, ignorado o malentendido incluso por muchos aristotélicos tanto antiguos como modernos. La respuesta consiste, en suma, en ver que el término del proceso inductivo, en cuanto llega a conclusiones universales a partir de lo particular, debe estar mediado por un proceso previo de abstracción de la forma, bien entendida, en lo mismo concreto y particular. Ello permite ver que la conclusión universal no desborda las premisas, que es el problema clásico de la epagogé aristotélica.

Historia, olvido y perdón. Nietzsche y Ricoeur : apertura de la memoria y el olvido a la vida

Resumen: El presente trabajo gira en torno al problema de la memoria y el olvido, su relación recíproca y su influencia en la salud vital del hombre. Para eso, se apoya principalmente en las ideas que desarrolla Friedrich Nietzsche en sus obras Sobre la utilidad y el perjuicio de la historia para la vida y Genealogía de la Moral, así como en la lectura de estos temas que realiza Ricoeur. En esta misma línea, desarrolla también el significado que tienen para ambos las nociones de promesa y perdón y las relaciones que guardan tanto con la dupla olvido-memoria como con la sana vitalidad del hombre y su relación con los demás.

San Agustín : la luz de la ley y el bien del hombre

Pensamos que el tema del orden natural es determinante de la antropología y la ética de San Agustín. La contemplación del orden real y la conquista de la restauración y reproducción del mismo en el seno del ser y el obrar del hombre, son imperativos ineludibles en el camino hacia la realización del destino humano. Nos guían en este estudio diversos intereses. En primer lugar pretendemos poner en evidencia la importancia del conocimiento del orden del ser para la antropología y la ética agustiniana, en la que es central el tema de la caridad entendida como ordo amoris. En segundo lugar prestaremos atención a las principales consecuencias del orden: la unidad y la paz que esta conlleva a distintos estratos señalados por la reflexión agustiniana. Finalmente proponemos iluminar a partir de estas ideas de San Agustín, ciertas tesis de la filosofía contemporánea que consideran, en su intento por procurar la paz, que la caridad sólo halla fundamento en el nihilismo de las ontologías débiles.