Brf1 post-transcriptionally regulates pluripotency and differentiation responses downstream of Erk MAP Kinase

FGF/Erk MAP Kinase Signaling is a central regulator of mouse embryonic stem cell (mESC) self-renewal, pluripotency and differentiation. However, the mechanistic connection between this signaling pathway activity and the gene circuits stabilizing mESCs in vitro remain unclear. Here we show that FGF signaling post-transcriptionally regulates the mESC transcription factor network by controlling the expression of Brf1 (zfp36l1), an AU-rich element mRNA binding protein. Changes in Brf1 level disrupts the expression of core pluripotency-associated genes and attenuates mESC self-renewal without inducing differentiation. These regulatory effects are mediated by rapid and direct destabilization of Brf1 targets, such as Nanog mRNA. Interestingly, enhancing Brf1 expression does not compromise mESC pluripotency, but does preferentially regulate differentiation to mesendoderm by accelerating the expression of primitive streak markers. Together, these studies demonstrate that FGF signals utilize targeted mRNA degradation by Brf1 to enable rapid post-transcriptional control of gene expression.

Sensitivity map of laser tweezers Raman spectroscopy for single-cell analysis of colorectal cancer

Raman spectroscopy on single, living epithelial cells captured in a laser trap is shown to have diagnostic power over colorectal cancer. This new single-cell technology comprises three major components: primary culture processing of human tissue samples to produce single-cell suspensions, Raman detection on singly trapped cells, and diagnoses of the cells by artificial neural network classifications. it is compared with DNA flow cytometry for similarities and differences. Its advantages over tissue Raman spectroscopy are also discussed. In the actual construction of a diagnostic model for colorectal cancer, real patient data were taken to generate a training set of 320 Raman spectra and, a test set of 80. By incorporating outlier corrections to a conventional binary neural classifier, our network accomplished significantly better predictions than logistic regressions, with sensitivity improved from 77.5% to 86.3% and specificity improved from 81.3% to 86.3% for the training set and moderate improvements for the test set. Most important, the network approach enables a sensitivity map analysis to quantitate the relevance of each Raman band to the normal-to-cancer transform at the cell level. Our technique has direct clinic applications for diagnosing cancers and basic science potential in the study of cell dynamics of carcinogenesis. (C) 2007 Society of Photo-Optical Instrumentation Engineers.

Testable models of aquatic systems: A NERC special topic for integrating experiments and modelling

A major part of the support for fundamental research on aquatic ecosystems continues to be provided by the Natural Environment Research Council (NERC). Funds are released for ”thematic” studies in a selected special topic or programme. ”Testable Models of Aquatic Ecosystems” was a Special Topic of the NERC, initiated in 1995, the aim of which was to promote ecological modelling by making new links between experimental aquatic biologists and state-of-the-art modellers. The Topic covered both marine and freshwater systems. This paper summarises projects on aspects of the responses of individual organisms to the effects of environmental variability, on the assembly, permanence and resilience of communities, and on aspects of spatial models. The authors conclude that the NERC Special Topic has been highly successful in promoting the development and application of models, most particularly through the interplay between experimental ecologists and formal modellers.

Sensitivity map of laser tweezers Raman spectroscopy for single-cell analysis of colorectal cancer

Raman spectroscopy on single, living epithelial cells captured in a laser trap is shown to have diagnostic power over colorectal cancer. This new single-cell technology comprises three major components: primary culture processing of human tissue samples to produce single-cell suspensions, Raman detection on singly trapped cells, and diagnoses of the cells by artificial neural network classifications. it is compared with DNA flow cytometry for similarities and differences. Its advantages over tissue Raman spectroscopy are also discussed. In the actual construction of a diagnostic model for colorectal cancer, real patient data were taken to generate a training set of 320 Raman spectra and, a test set of 80. By incorporating outlier corrections to a conventional binary neural classifier, our network accomplished significantly better predictions than logistic regressions, with sensitivity improved from 77.5% to 86.3% and specificity improved from 81.3% to 86.3% for the training set and moderate improvements for the test set. Most important, the network approach enables a sensitivity map analysis to quantitate the relevance of each Raman band to the normal-to-cancer transform at the cell level. Our technique has direct clinic applications for diagnosing cancers and basic science potential in the study of cell dynamics of carcinogenesis. (C) 2007 Society of Photo-Optical Instrumentation Engineers.

A Percepção do usuário de drogas sobre o mundo do trabalho: uma contribuição para a prática do enfermeiro

Estudo qualitativo, com base na Análise de Conteúdo, a partir da interrogação sobre como o usuário de drogas em situação de tratamento para a dependência química percebe-se como trabalhador, e qual sua relação com o mundo do trabalho. O referencial teórico apoiou-se nas definições de drogas psicotrópicas, dependência química e trabalho, das seguintes fontes, respectivamente, Organização das Nações Unidas (ONU), Classificação Internacional das Doenças (CID-10) e Ministério do Trabalho (MT) e a teoria da Psicodinâmica do trabalho. A metodologia baseou-se na Análise de Conteúdo Temática. A coleta de dados desenvolveu-se por meio de entrevistas em profundidade, e pela obtenção de dados sociodemográficos e de trabalho a partir dos registros. Foram realizadas trinta e oitos entrevistas semi estruturadas com dez mulheres, quatorze homens usuários de múltiplas drogas e quatorze homens usuários somente de bebidas alcoólicas. Todos os sujeitos eram trabalhadores em tratamento no Centro de Atenção Psicossocial-álcool e drogas Centro Estadual de Tratamento e Reabilitação de Adictos (Caps-ad CENTRA-RIO). Foram organizadas e analisadas seis categorias: conciliação ente o trabalho e o consumo de drogas; trabalho e angústia; o mundo do trabalho favorecendo/estimulando o consumo; beneficio e UD; trabalho pleno; perspectivas de vida do UD. Discutiu-se a intensa relação de sofrimento que permeia o tempo todo o trabalhador usuário de drogas, as diversas alternativas experimentadas para conseguir conciliar o binômio trabalho e drogas, a submissão aos valores construídos no ambiente de trabalho, a função de integradora intragrupo dos trabalhadores e terapêutica das drogas para conseguir cumprir o trabalho real, sua função relaxante e domadora da angústia e do medo. Nas conclusões, discutem-se os limites do mundo do trabalho em acompanhar a evolução do campo da saúde mental e a Reforma Psiquiátrica, e a importância para a enfermagem do trabalho. O enfermeiro deve ser o articulador para que este trabalhador usuário de drogas atue como protagonista ativo da sua própria história, contribuindo com sua experiência, para que os profissionais de saúde, o trabalho e a sociedade em geral aperfeiçoem formas de cuidar integral.

Novel method to construct a quality map for phase unwrapping based on modulation and the phase gradient

A novel method to construct a quality map, called modulation-phase-gradient variance (MPGV), is proposed, based on modulation and the phase gradient. The MPGV map is successfully applied to two phase-unwrapping algorithms - the improved weighted least square and the quality-guided unwrapping algorithm. Both simulated and experimental data testify to the validity of our proposed quality map. Moreover, the unwrapped-phase results show that the new quality map can have higher reliability than the conventional phase-derivative variance quality map in helping to unwrap noisy, low-modulation, and/or discontinuous phase maps. (c) 2006 Society of Photo-Optical Instrumentation Engineers.

A reliable phase unwrapping algorithm based on the local fitting plane and quality map

A fast and reliable phase unwrapping (PhU) algorithm, based on the local quality-guided fitting plane, is presented. Its framework depends on the basic plane-approximated assumption for phase values of local pixels and on the phase derivative variance (PDV) quality map. Compared with other existing popular unwrapping algorithms, the proposed algorithm demonstrated improved robustness and immunity to strong noise and high phase variations, given that the plane assumption for local phase is reasonably satisfied. Its effectiveness is demonstrated by computer-simulated and experimental results.

Novel method to construct a quality map for phase unwrapping based on modulation and the phase gradient

A novel method to construct a quality map, called modulation-phase-gradient variance (MPGV), is proposed, based on modulation and the phase gradient. The MPGV map is successfully applied to two phase-unwrapping algorithms - the improved weighted least square and the quality-guided unwrapping algorithm. Both simulated and experimental data testify to the validity of our proposed quality map. Moreover, the unwrapped-phase results show that the new quality map can have higher reliability than the conventional phase-derivative variance quality map in helping to unwrap noisy, low-modulation, and/or discontinuous phase maps. (c) 2006 Society of Photo-Optical Instrumentation Engineers.

Sistema de classificação da gestão ambiental pública municipal baseado em lógica nebulosa

A partir da Lei n. 6.938 de 31 de agosto de 1981, que constituiu o Sistema Nacional do Meio Ambiente, criou-se o Conselho Nacional do Meio Ambiente e instituiu-se o Cadastro Técnico Federal de Atividades e Instrumentos de Defesa Ambiental, a gestão ambiental pública ganhou um espaço cada vez maior nas administrações municipais, com a implementação de instrumentos de gestão ambiental propiciando aos municípios a possibilidade de ações efetivas que contribuam para uma melhor qualidade de vida a população. Esse trabalho propõe a criação de um método de classificação municipal que indicará qual o nível da gestão ambiental do município. Verificando o número de instrumentos de gestão ambiental constituído e o número de problemas ambientais ocorridos em cada município na visão do gestor local nos anos de 2006/2008. E ainda qual a influência do IDH tanto na implementação de tais instrumentos de gestão ambiental, como nas ocorrências dos problemas ambientais. Tal classificação tem a intenção de verificar se o município encontra-se bem aparelhado no que se refere à gestão ambiental, auxiliando para futuras decisões nas ações da política ambiental local. O foco desse trabalho serão os municípios dos estados de Minas Gerais, Piauí e Rio de Janeiro. Os resultados serão processados via o software MATLAB utilizando lógica nebulosa (fuzzy) e apresentados em um website utilizando as linguagens de programação JSP, HTML, JavaScript e esse website armazenado em um servidor TomCat e tais resultados serão apresentados nas formas de valores alfanuméricos em tabelas e espaciais através de mapas temáticos em uma solução sig-web. Os dados estão armazenados em um Sistema Gerenciador de Banco de Dados PostgreSQL com sua extensão espacial PostGIS, e o acesso aos mapas será feito através do servidor de mapas MapServer.

Caracterização espaço-temporal de plumas de sedimentos por sensoriamento remoto: um estudo de caso na foz do rio Paraíba do Sul.

Sedimentos em suspensão representam um dos principais fatores que afetam a qualidade dos sistemas aquáticos no mundo; influenciam os processos geomórficos de construção da paisagem e podem indicar problemas de erosão e perda de solo na bacia hidrográfica contribuinte. O seu monitoramento espacial e temporal é fundamental nas atividades de gestão ambiental de áreas costeiras. Nesse sentido, a hipótese básica desta pesquisa é que o padrão espacial e temporal de plumas de sedimentos costeiras associado ao regime hidrológico do rio pode ser caracterizado a partir de imagens orbitais de média resolução espacial. Para comprová-la, elegeu-se a foz do rio Paraíba do Sul como área de estudo para definição e teste metodológico, e formulou-se como principal objetivo mapear qualitativamente a pluma costeira deste rio a partir de imagens Landsat 5 e CBERS-2, ao longo do período compreendido entre 1985 e 2007. As datas avaliadas foram criteriosamente definidas através de três estratégias de análise, totalizando cinqüenta imagens. Pesquisa bibliográfica e avaliação da resposta espectral da feição de interesse nas imagens selecionadas consistiram nas etapas principais da definição da metodologia. As plumas foram então identificadas, mapeadas e extraídas; posteriormente, suas características espaciais e temporais foram analisadas por intermédio de sistemas de informação geográfica e avaliadas em conjunto com dados históricos de vazão. Os resultados indicam que a banda do vermelho forneceu uma melhor discriminação interna da pluma, sendo, portanto, utilizada como base para as análises realizadas neste trabalho. Com exceção do procedimento de correção atmosférica, a metodologia proposta consiste na utilização de técnicas simples de processamento digital de imagens, baseadas na integração de técnicas semi-automáticas e de análise visual. A avaliação do padrão dos sedimentos e dos mapas temáticos qualitativos de concentração de sedimentos em suspensão indica a forte diferenciação existente entre cenários representativos de épocas de cheia e seca do rio. Análises espaciais do comportamento da pluma contribuem ainda para um maior conhecimento do espaço geográfico, fornecendo subsídios aos mais variados setores do planejamento e gestão ambiental.

Weighted least-squares phase unwrapping algorithm based on derivative variance correlation map

Among different phase unwrapping approaches, the weighted least-squares minimization methods are gaining attention. In these algorithms, weighting coefficient is generated from a quality map. The intrinsic drawbacks of existing quality maps constrain the application of these algorithms. They often fail to handle wrapped phase data contains error sources, such as phase discontinuities, noise and undersampling. In order to deal with those intractable wrapped phase data, a new weighted least-squares phase unwrapping algorithm based on derivative variance correlation map is proposed. In the algorithm, derivative variance correlation map, a novel quality map, can truly reflect wrapped phase quality, ensuring a more reliable unwrapped result. The definition of the derivative variance correlation map and the principle of the proposed algorithm are present in detail. The performance of the new algorithm has been tested by use of a simulated spherical surface wrapped data and an experimental interferometric synthetic aperture radar (IFSAR) wrapped data. Computer simulation and experimental results have verified that the proposed algorithm can work effectively even when a wrapped phase map contains intractable error sources. (c) 2006 Elsevier GmbH. All rights reserved.

O papel dos grupos de interesse no "trade policy making" brasileiro: o caso das negociações Brasil-Argentina para o setor automotivo

Desde a redemocratização do país em 1985 o MRE já vinha se posicionando à favor do diálogo com os mais diversos grupos e entidades sociais. Neste sentido, observou-se ao longo dos últimos anos um aprofundamento da interação com parlamentares, governos estaduais e municipais, empresários, sindicalistas, ONGs e imprensa. A construção de vínculos entre as organizações da sociedade civil críticas das negociações comerciais ao longo da década de 1990 permite falar na criação de um novo campo de ação coletiva transnacional, definido como um espaço de ação política formado por indivíduos e organizações da sociedade civil que participam do processo de elaboração de um conjunto comum de práticas, objetivos e crenças. O que se pode concluir é que diante de um contexto mais competitivo e globalizado, após processo de abertura comercial e intensificação da participação brasileira nas negociações internacionais, a representação dos interesses da classe empresarial teve que se adaptar criando uma nova forma de organização. Desse modo, o presente trabalho visa analisar a crescente interferência de grupos de interesse no processo de tomada de decisão, no que tange aos assuntos de política externa comercial brasileira, tais como as negociações comerciais internacionais por se tratar de um ambiente cujos interesses da classe empresarial mais podem ser afetados. As negociações comerciais internacionais é o ambiente em que a atuação empresarial mais pode ser percebida. As negociações do Mercosul e da ALCA possibilitam observar a participação ativa destes novos atores. Sendo assim, o trabalho apresenta a nova dinâmica de relacionamento entre Estado e grupos da sociedade civil (classe empresarial) para temas ligados a comércio exterior.