The promoter of a gene encoding an isoflavone reductase-like protein in coffee (Coffea arabica) drives a stress-responsive expression in leaves

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Identification and expression analysis of microRNAs and targets in the biofuel crop sugarcane

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Identification of suitable internal control genes for expression studies in Coffea arabica under different experimental conditions

Background: Quantitative data from gene expression experiments are often normalized by transcription levels of reference or housekeeping genes. An inherent assumption for their use is that the expression of these genes is highly uniform in living organisms during various phases of development, in different cell types and under diverse environmental conditions. To date, the validation of reference genes in plants has received very little attention and suitable reference genes have not been defined for a great number of crop species including Coffea arabica. The aim of the research reported herein was to compare the relative expression of a set of potential reference genes across different types of tissue/organ samples of coffee. We also validated the expression profiles of the selected reference genes at various stages of development and under a specific biotic stress.Results: The expression levels of five frequently used housekeeping genes (reference genes), namely alcohol dehydrogenase (adh), 14-3-3, polyubiquitin (poly), beta-actin (actin) and glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (gapdh) was assessed by quantitative real-time RT-PCR over a set of five tissue/organ samples (root, stem, leaf, flower, and fruits) of Coffea arabica plants. In addition to these commonly used internal controls, three other genes encoding a cysteine proteinase (cys), a caffeine synthase (ccs) and the 60S ribosomal protein L7 (rpl7) were also tested. Their stability and suitability as reference genes were validated by geNorm, NormFinder and BestKeeper programs. The obtained results revealed significantly variable expression levels of all reference genes analyzed, with the exception of gapdh, which showed no significant changes in expression among the investigated experimental conditions.Conclusion: Our data suggests that the expression of housekeeping genes is not completely stable in coffee. Based on our results, gapdh, followed by 14-3-3 and rpl7 were found to be homogeneously expressed and are therefore adequate for normalization purposes, showing equivalent transcript levels in different tissue/ organ samples. Gapdh is therefore the recommended reference gene for measuring gene expression in Coffea arabica. Its use will enable more accurate and reliable normalization of tissue/organ-specific gene expression studies in this important cherry crop plant.

Endophytic microorganisms from coffee tissues as plant growth promoters and biocontrol agents of coffee leaf rust

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Green lacewings (Neuroptera: Chrysopidae) associated with Melon Crop in Mossoró, Rio Grande do Norte State, Brazil

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Start-up of horizontal anaerobic reactors with sludge blanket and fixed bed for wastewater treatment from coffee processing by wet method

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Upland rice yield as affected by previous summer crop rotation (soybean or upland rice) and glyphosate management on cover crops

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

WATER NEEDS FOR WINTER BEAN CROP

Um estudo sobre o uso de água do feijoeiro de inverno (Phaseolus vulgaris L. cv. Carioca) foi realizado num solo Latossol Vermelho Amarelo de textura argilosa. Um sistema de sulcos de infiltração foi usado para proceder a irrigação com o intuito de manter o solo em potenciais de água superiores a -40,0 KPa. Duas doses de aplicação de N em cobertura (0 a 30 Kg N/ha) foram colocados 25 dias após o plantio. Os principais objetivos do estudo foram: avaliar a interação entre as duas doses de N com a evapotranspiração e medir os coeficientes de cultura (Kc). A evapotranspiração média máxima (ETm) foi 1,71 mm/dia, ou 157,16 mm nos 92 dias de observações; os valores de ETm para as fases vegetativa (1), florescimento (2) e formação de vagens (3) foram 1,48; 2,35 e 1,50 mm/dia, respectivamente, para a dose de 30 Kg/ha e 1,48, 1,88 e 1,45 mm/dia para o tratamento sem aplicação de N em cobertura. Os coeficientes de cultura (Kc = ETm/ETo) foram 0,62 e 0,78 para a fase 1, 0,80 e 1,10 para a 2, 0,45 e 0,55 para a 3 e 0,61 e 0,80 para o ciclo todo, respectivamente, baseados no método de FAO-Penman e do Tanque Classe A. Este mostrou melhores resultados para estimar o máximo uso de água pelo feijoeiro de inverno. Os tratamentos de N não afetaram a evapotranspiração significativamente. Entretanto, a evapotranspiração, medida pelo método do balanço de água, foi 59,78 e 27,12% maior no estágio do florescimento que no estádio vegetativo, respectivamente, nas doses de 30 e 0 Kg N/ha.

Marigold (Tagetes erecta L.) as an attractive crop to natural enemies in onion fields

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Yield performance and leaf nutrient levels of coffee cultivars under different plant densities

Cultivares de cafeeiro (Coffea Arabica L.) adaptadas às regiões de cultivo, com população de plantas otimizada e adequado estado nutricional são premissas para a obtenção de produções elevadas de café. Estudou-se a produção trienal de café e o teor foliar de macronutrientes de cultivares de cafeeiro em função das densidades de plantio. Foram utilizados os cultivares Catuaí Amarelo (IAC 47), Obatã (IAC 1669-20), Acaiá (IAC 474-19) e Icatu Amarelo (IAC 2944) nas populações de 2.500 plantas ha-1 com duas plantas por cova; e, 5.000, 7.519 e 10.000 plantas ha-1 com uma planta por cova. As plantas foram adubadas de modo homogêneo, porém, sem calagem. À medida que a população de cafeeiros aumentou, a produtividade trienal de café aumentou, a produção de frutos por planta diminuiu e os teores foliares de fósforo (P), potássio (K) e enxofre (S) aumentaram. Nos cafeeiros sob adensamento encontrou-se igual ou maior teor de macronutrientes do que naqueles sob espaçamento convencional, sendo que os maiores teores foram observados nas cultivares de porte alto, e os menores, na cultivar Obatã, de porte baixo. Nos cafeeiros das covas com uma planta observou-se maior produção de café e menores concentrações de P, Ca e S do que naqueles das covas com duas plantas. No geral, os cultivares e as populações de cafeeiros estavam com teores de N e S acima dos limites de referência citados na literatura, mas com teores dos demais macronutrientes dentro da faixa adequada.

Vegetative and productive aspects of organically grown coffee cultivars under shaded and unshaded systems

Although Coffea arabica species has its origin in the African understories, there is great resistance on the part of the Brazilian producers for growing this species under agroforestry systems as they fear that shading reduces production. This study aimed at evaluating some vegetative traits and the productivity of organically grown coffee (Coffea arabica L.) cultivars under shaded and unshaded systems. Twelve treatments consisting of two cultivation systems (shaded and unshaded) and six coffee cultivars were arranged in randomized blocks with four replicates, in a split-plot scheme. Shading was provided by banana (Musa sp.) and coral bean plants (Erythrinaverna). Shading delayed fruit maturation. Late maturation cultivars, such as the Icatu and the Obatã, matured early in both cultivation systems, while medium and early maturation cultivars presented late maturation. Cultivation in the shaded system increased the leaf area and the number of lower branches, decreased the number of productive nodes per branch, and increased the distance between the nodes and the number of leaves present in the branches. Cultivation in the unshaded system presented greater number of plants with branch blight in relation to plants grown in the shade. The productivity of the cultivars was not different, at 30.0 processed bags per hectare in the shaded system, and 25.8 processed bags per hectare in the unshaded system. The most productive cultivars in the shaded system were the Tupi, the Obatã, and the Catuaí, while no differences between cultivars were obtained in the unshaded system.

Resistance of wild and near isogenic bean lines with arcelin variants to Zabrotes subfasciatus (Boheman): I - Winter crop

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Quality of natural coffee subjected to different rest periods during the drying process

O parcelamento da secagem pode ser eficiente tanto no que diz respeito à qualidade final do café, quanto na redução do consumo específico de energia. Diante disso, objetivou-se, com o presente trabalho, avaliar o efeito do teor de água dos frutos no momento da interrupção da secagem e do período de repouso até a retomada da secagem na qualidade do café natural, por meio da análise sensorial e dos testes de condutividade elétrica e lixiviação de potássio. Frutos de café maduros foram colhidos manual e seletivamente e, em seguida, secados ao sol em terreiros de concreto por dois dias e, então, submetidos à secagem mecânica em secadores de camada fixa. Quando o café atingiu os teores de água de 20%, 17% e 14% (base úmida, bu), a secagem foi interrompida e o café permaneceu em repouso por cinco, quinze e trinta dias e, posteriormente, foi secado em secadores mecânicos até o teor de água de 11% (bu). O controle constituiu-se na secagem completa em terreiro. Observou-se que as combinações entre o menor teor de água e o maior período de repouso e entre o maior teor de água e o menor período de repouso, proporcionam menores valores de lixiviação de potássio. A qualidade da bebida melhora progressivamente com o aumento do período de repouso. A interrupção da secagem com teores de água de 17% e 20% (bu) não altera a qualidade do café natural, comparativamente à secagem completa em terreiro.

Effects of caffeine and used coffee grounds on biological features of Aedes aegypti (Diptera, Culicidae) and their possible use in alternative control

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)