Estructura computacional i aplicacions de la semblança molecular quàntica

La tesis tracta diferents aspectes relacionats amb el càlcul de la semblança quàntica, així com la seva aplicació en la racionalització i predicció de l'activitat de fàrmacs. Es poden destacar dos progressos importants en el desenvolupament de noves metodologies que faciliten el càlcul de les mesures de semblança quàntica. En primer lloc, la descripció de les molècules mitjançant les funciones densitat aproximades PASA (Promolecular Atomic Shell Approximation) ha permès descriure amb suficient precisió la densitat electrònica dels sistemes moleculars analitzats, reduint substancialment el temps de càlcul de les mesures de semblança. En segon lloc, el desenvolupament de tècniques de superposició molecular específiques de les mesures de semblança quàntica ha permès resoldre el problema de l'alineament en l'espai dels compostos comparats. El perfeccionament d'aquests nous procediments i algoritmes matemàtics associats a les mesures de semblança molecular quàntica, ha estat essencial per poder progressar en diferents disciplines de la química computacional, sobretot les relacionades amb les anàlisis quantitatives entre les estructures moleculars i les seves activitats biològiques, conegudes amb les sigles angleses QSAR (Quantitative Structure-Activity Relationships). Precisament en l'àrea de les relacions estructura-activitat s'han presentat dues aproximacions fonamentades en la semblança molecular quàntica que s'originen a partir de dues representacions diferents de les molècules. La primera descripció considera la densitat electrònica global de les molècules i és important, entre altres, la disposició dels objectes comparats en l'espai i la seva conformació tridimensional. El resultat és una matriu de semblança amb les mesures de semblança de tots els parells de compostos que formen el conjunt estudiat. La segona descripció es fonamenta en la partició de la densitat global de les molècules en fragments. S'utilitzen mesures d'autosemblança per analitzar els requeriments bàsics d'una determinada activitat des del punt de vista de la semblança quàntica. El procés permet la detecció de les regions moleculars que són responsables d'una alta resposta biològica. Això permet obtenir un patró amb les regions actives que és d'evident interès per als propòsits del disseny de fàrmacs. En definitiva, s'ha comprovat que mitjançant la simulació i manipulació informàtica de les molècules en tres dimensions es pot obtenir una informació essencial en l'estudi de la interacció entre els fàrmacs i els seus receptors macromoleculars.

Cambios en la estructura del paisaje del Alt Empordà en el período 1957-2001

El paisaje, concebido como una unidad espacial y temporalmente pluriescalar caracterizada por unos patrones de distribución - una estructura-, unas funciones y una red de flujos de materia, energía e información (Forman y Godron, 1986), constituye un modelo apropiado para estudiar el territorio (Marull, 2002). En la presente investigación se hace un análisis de los cambios ocurridos en la estructura del mosaico paisajístico de la comarca de l´Alt Empordà entre 1957 y 2001, para ellos se divide la comarca en unidades paisajísticas basadas en criterios fisiográficos determinados a escala 1:25000. El análisis de la estructura paisajística de las diferentes unidades paisajísticas se ha realizado a través de indicadores de composición y de estructura según clases paisajísticas (cubiertas o usos del suelo), mediante el cálculo y análisis de indicadores de estructura desarrollados por la ecología del paisaje, los cuales, han permitido caracterizar y analizar las transformaciones en el tamaño, la forma y el arreglo espacial de los parches tipo que configuran el mosaico paisajístico. Para el proceso de cálculo y análisis espacial se han empleado los sistemas de información geográfica (SIGs), el programa Patch Analyst 1.2. La información cartográfica se elaboró a partir de ortofotomapas digitales y fotos aéreas generados por el ICC, así como de fuentes secundarias. Además, el trabajo incluye una aplicación teórico-metodológica a la identificación de redes ecológicas a través del uso de indicadores, así como el uso de inventarios fitosociológicos en la evaluación de hábitats borde.

Hand-held 3D-scanner for large surface registration

L'objectiu d'aquesta tesi és l'estudi de les diferents tècniques per alinear vistes tridimensionals. Aquest estudi ens ha permès detectar els principals problemes de les tècniques existents, aprotant una solució novedosa i contribuint resolent algunes de les mancances detectades especialment en l'alineament de vistes a temps real. Per tal d'adquirir les esmentades vistes, s'ha dissenyat un sensor 3D manual que ens permet fer adquisicions tridimensionals amb total llibertat de moviments. Així mateix, s'han estudiat les tècniques de minimització global per tal de reduir els efectes de la propagació de l'error.

Ativação do sistema renina-angiotensina-aldosterona em cães assintomáticos com doença mixomatosa valvular mitral

As doenças cardíacas são um achado frequente na prática clínica. Saber se pacientes assintomáticos com doença mixomatosa da válvula mitral necessitam ou não de medicação numa fase inicial da doença não é tarefa fácil. A ativação neuro-hormonal, apesar de ter um efeito benéfico compensatório a curto prazo, torna-se deletéria a longo prazo, sendo que para isso é necessária intervenção farmacológica para inibir a sua atividade O SRAA (sistema renina angiotensina aldosterona) tem importantes mecanismos patofisiológicos implicados no desenvolvimento da insuficiência cardíaca congestiva e tem como produto final a aldosterona, que contribui para a remodelagem cardíaca. Neste trabalho verifiquei a inexistência de uma diferença significativa de valores de aldosterona sérica de cães assintomáticos com Doença Mixomatosa Valvular Mitral (estadio B2 da classificação ACVIM) e os valores do intervalo de referência desta hormona. Concluí também não haver relação entre a idade, ureia, creatinina, rácio Proteina-Creainina, Pressões arteriais sistólica, média e diastólica, frequência de pulso, parâmetros de remodelagem cardíaca e padrão do fluxo transmitral com os valores da aldosterona medidos. É através da evidência destes achados que sugiro a não instituição de um IECA neste tipo de pacientes. O uso precoce de IECA pode não só não trazer vantagens terapêuticas nesta fase da doença como também vai promover o aparecimento precoce de fenómenos de “escape da aldosterona”.

Neoplasias testiculares em canídeos observados no Hospital Veterinário Doutor Marques de Almeida

Neste trabalho é feito um estudo retrospectivo dos animais apresentados à consulta no Hospital Veterinário Doutor Marques de Almeida (HVDMA), num período de um ano, cujo objectivo foi caracterizar a ocorrência de neoplasias testiculares em canídeos e comparar com os dados recolhidos na revisão bibliográfica. A idade, raça, historial clínico, exames complementares, apresentação clínica da neoplasia testicular, classificação histológica e procedimento cirúrgico efectuado foram as variáveis analisadas. Neste mesmo trabalho, é feita a descrição da abordagem clínica de um caso de neoplasia das células de Sertoli num canídeo, nesta instituição hospitalar. Os cães de raça indeterminada foram os que apresentaram maior incidência de neoplasias testiculares correspondendo a 56% da amostra, com idade igual ou superior a 10 anos sendo a média de incidência de 11 anos. As neoplasias testiculares mais diagnosticadas foram os Seminomas, equivalendo a 7 casos (54%), sendo a menos diagnosticada o tumor testicular misto, com apenas 1 caso (8%). Em todos os casos, foi realizada orquiectomia bilateral. Este estudo não se trata de um ensaio clínico, pois a amostra usada é demasiado pequena, contudo existem factos, tanto de acordo como contra, a revisão bibliográfica usada. As neoplasias testiculares correspondem a 90 por cento (%) das neoplasias que afectam a genitália de cães machos inteiros e geriátricos. O exame clínico detalhado, alicerçado nos conhecimentos de anatomia, fisiologia e prevalência destes tipos de tumores, é importante para detectar este tipo de neoplasia em canídeos, sendo fundamental o exame histopatológico para confirmação do diagnóstico definitivo.

Feminismos estéticos y antiestéticos en el Ecuador de principios del siglo XX: un análisis de género y generaciones (Estudios)

El ensayo analiza los cambios jurídicos y sociales que experimentaron las mujeres durante los años posteriores a la Revolución Liberal de 1895. La mayoría de las mujeres pioneras en la vida pública del Ecuador provinieron de las clases sociales media y alta. El estudio se concentra en los casos de María Luisa Gómez de la Torre, profesora y la única mujer participante en la fundación del Partido Socialista del Ecuador, y Matilde Hidalgo de Prócel, primera mujer graduada de médico, primera en sufragar en una elección y en obtener un escaño en el Congreso. El artículo indaga si estos cambios institucionales fueron el resultado de una concesión del poder o de una lucha social desde abajo.

Roberto Arlt, la nación y su angustiosa trayectoria (Dossier: Literaturas de la integración, el Sur y su diversidad)

En las primeras décadas del siglo XX, la Argentina sufrió un desajuste económico y social respecto del plan estratégico de 1880. Los acontecimientos históricos rompieron el modelo de la prosperidad infinita y pusieron de manifiesto la disolución del ser nacional en revueltas militares, fraude electoral, corrupción, caudillismo y brechas profundas entre regiones y clases sociales. Hacia 1930, la escritura de Roberto Artl se presenta como un cuestionamiento acerca de los límites del proyecto modernizador y de las instancias más significativas del mandato de progreso histórico. Los personajes de sus ficciones le permiten al escritor proyectar una interpretación no solo de su ser caído y angustiado, sino también del sujeto desligado de aquella sociabilidad propuesta por la generación de los románticos y que en 1880 parecía determinar una identidad estable, según reglas aparentemente seguras. El escritor posee la visión de que 1930 es el momento histórico que exige otro estatuto de lo real. El efecto de lectura de la obra de Arlt reside en la manipulación indefinida del lenguaje literario a través de la propuesta de personajes anclados en la percepción de un mundo que los excluye y de una peripecia narrativa que devela la descentración de la Historia como relato total. Consecuentemente, su eficacia es impactar y movilizar el cuerpo social a través de la producción imaginaria como una versión literaria de la Historia.

La circulación del darwinismo en el Ecuador (1870-1874) (Debates)

En 1871, el jesuita alemán Theodor Wolf comenzó a difundir el darwinismo en el Ecuador a través de las clases de geología y paleontología que impartía en la Escuela Politécnica. Expuso una posición conciliadora del evolucionismo con el catolicismo, en el contexto de un Estado que promovía la cohesión y la identidad nacional a través de la moral católica y las ciencias como vehículo para el progreso. En este estudio se discuten algunos apuntes que atribuyeron estas enseñanzas como la razón por la cual Wolf se separó de la Politécnica y de la Orden Jesuita en 1874, en el marco de una controversia mayor, en la cual el darwinismo fue determinante.

A sovereign wealth fund to lift Germany's curse of excess savings. CEPS Policy Brief No. 280, 28 August 2012

As an alternative to the present system of intermediation of the German savings surplus, this paper suggests that the risk-adjusted rate of return could be improved by creating a sovereign wealth fund for Germany (designated DESWF), which could invest excess German savings globally. Such a DESWF would offer German savers a secure vehicle paying a guaranteed positive minimum real interest rate, with a top-up when real investment returns allowed. The vehicle would invest the funds in a portfolio that is highly diversified by geography and asset classes. Positive real returns can be expected in the long run based on positive real global growth. Since, in this case, a significant amount of funds would flow outside the euro area, the euro would depreciate, which would help crisis countries presently struggling to revive growth through exports and to close their external deficits so as to recoup their international credit-worthiness. Target imbalances would gradually disappear and German claims abroad would move from nominal claims on the ECB to diversified real and nominal claims on various private and public foreign entities in a variety of asset classes.

The double triangular test in practice

The double triangular test was introduced twenty years ago, and the purpose of this paper is to review applications that have been made since then. In fact, take-up of the method was rather slow until the late 1990s, but in recent years several clinical trial reports have been published describing its use in a wide range of therapeutic areas. The core of this paper is a detailed account of five trials that have been published since 2000 in which the method was applied to studies of pancreatic cancer, breast cancer, myocardial infarction, epilepsy and bedsores. Before those accounts are given, the method is described and the history behind its evolution is presented. The future potential of the method for sequential case-control and equivalence trials is also discussed. Copyright © 2004 John Wiley & Sons, Ltd.

Statistical evaluation of an acute dermal toxicity test using the dermal fixed dose procedure

The conventional method for the assessment of acute dermal toxicity (OECD Test Guideline 402, 1987) uses death of animals as an endpoint to identify the median lethal dose (LD50). A new OECD Testing Guideline called the dermal fixed dose procedure (dermal FDP) is being prepared to provide an alternative to Test Guideline 402. In contrast to Test Guideline 402, the dermal FDP does not provide a point estimate of the LD50, but aims to identify that dose of the substance under investigation that causes clear signs of nonlethal toxicity. This is then used to assign classification according to the new Globally Harmonised System of Classification and Labelling scheme (GHS). The dermal FDP has been validated using statistical modelling rather than by in vivo testing. The statistical modelling approach enables calculation of the probability of each GHS classification and the expected numbers of deaths and animals used in the test for imaginary substances with a range of LD50 values and dose-response curve slopes. This paper describes the dermal FDP and reports the results from the statistical evaluation. It is shown that the procedure will be completed with considerably less death and suffering than guideline 402, and will classify substances either in the same or a more stringent GHS class than that assigned on the basis of the LD50 value.

Statistical evaluation of the fixed concentration procedure for acute inhalation toxicity assessment

The conventional method for the assessment of acute inhalation toxicity (OECD Test Guideline 403, 1981) uses death of animals as an endpoint to identify the median lethal concentration (LC50). A new OECD Testing Guideline called the Fixed Concentration Procedure (FCP) is being prepared to provide an alternative to Test Guideline 403. Unlike Test Guideline 403, the FCP does not provide a point estimate of the LC50, but aims to identify an airborne exposure level that causes clear signs of nonlethal toxicity. This is then used to assign classification according to the new Globally Harmonized System of Classification and Labelling scheme (GHS). The FCP has been validated using statistical simulation rather than byin vivo testing. The statistical simulation approach predicts the GHS classification outcome and the numbers of deaths and animals used in the test for imaginary substances with a range of LC50 values and dose response curve slopes. This paper describes the FCP and reports the results from the statistical simulation study assessing its properties. It is shown that the procedure will be completed with considerably less death and suffering than Test Guideline 403, and will classify substances either in the same or a more stringent GHS class than that assigned on the basis of the LC50 value.

A statistical evaluation of the fixed dose procedure

The fixed-dose procedure (FDP) was introduced as OECD Test Guideline 420 in 1992, as an alternative to the conventional median lethal dose (LD50) test for the assessment of acute oral toxicity (OECD Test Guideline 401). The FDP uses fewer animals and causes less suffering than the conventional test, while providing information on the acute toxicity to allow substances to be ranked according to the EU hazard classification system. Recently the FDP has been revised, with the aim of providing further reductions and refinements, and classification according to the criteria of the Globally Harmonized Hazard Classification and Labelling scheme (GHS). This paper describes the revised FDP and analyses its properties, as determined by a statistical modelling approach. The analysis shows that the revised FDP classifies substances for acute oral toxicity generally in the same, or a more stringent, hazard class as that based on the LD50 value, according to either the GHS or the EU classification scheme. The likelihood of achieving the same classification is greatest for substances with a steep dose-response curve and median toxic dose (TD50) close to the LD50. The revised FDP usually requires five or six animals with two or fewer dying as a result of treatment in most cases.

Activity patterns of urban red foxes (Vulpes vulpes) reduce the risk of traffic-induced mortality

Traffic collisions can be a major source of mortality in wild populations, and animals may be expected to exhibit behavioral mechanisms that reduce the risk associated with crossing roads. Animals living in urban areas in particular have to negotiate very dense road networks, often with high levels of traffic flow. We examined traffic-related mortality of red foxes (Vulpes vulpes) in the city of Bristol, UK, and the extent to which roads affected fox activity by comparing real and randomly generated patterns of movement. There were significant seasonal differences in the number of traffic-related fox deaths for different age and sex classes; peaks were associated with periods when individuals were likely to be moving through unfamiliar terrain and would have had to cross major roads. Mortality rates per unit road length increased with road magnitude. The number of roads crossed by foxes and the rate at which roads were crossed per hour of activity increased after midnight when traffic flow was lower. Adults and juveniles crossed 17% and 30% fewer roads, respectively, than expected from randomly generated movement. This highly mobile species appeared to reduce the mortality risk of minor category roads by changing its activity patterns, but it remained vulnerable to the effects of larger roads with higher traffic flows during periods associated with extraterritorial movements.