Understanding mutational and selective processes that govern gene duplication in mammals

Abstract : Gene duplication is an essential source of material for the origin of genetic novelties. The reverse transcription of source gene mRNA followed by the genomic insertion of the resulting cDNA - retroposition - has provided the human genome with at least ~3600 detectable retrocopies. We find that ~30% of these retrocopies are transcribed, generally in testes. Their transcription often relies on preexisting regulatory elements (or open chromatin) close to their insertion site, which is illustrated by mRNA molecules containing retrocopies fused to their neighboring genes. Retrocopies appear to have been profoundly shaped by selection. Consistently, human retrocopies with an intact open reading (ORF) are more often transcribed than retropseudogenes, which leads to a minimal estimate of 120 functional retrogenes present in our genome. We also performed an analysis of Ka/Ks for human retrocopies. This analysis demonstrates that several intact retrocopies evolved under purifying selection and yields an estimated formation rate of ~1 retrogene per million year in the primate lineage. Using DNA sequencing and evolutionary simulations, we have identified 7 such primate-specific retrogenes that emerged on the lineage leading to humans In therian genomes, we found an excess of retrogenes with X-linked parents. Expression analyses support the idea that this "out of X" movement was driven by natural selection to produce autosomal functional counterparts for X-linked genes, which are silenced during male meiosis. Phylogenetic dating of this "out of X" movement suggests that our sex chromosomes arose about 180 MYA ago and are thus much younger than previously thought. Finally, we have also analyzed young gene duplications (and deletions) that arose by non allelic-homologous recombination and are not fixed in species. Using wild-caught and laboratory animals, we detected thousands of DNA segments that are polymorphic in copy number in mice. These copy number variants were found to profoundly alter the transcriptome of several mouse tissues. Strikingly, their influence on gene expression is not limited to the gene they contain but seems to extend to genes located up to 1.5 million bases away.

[Pise. Camposanto monumentale]

Référence bibliographique : Weigert, 359

The determinants of queen size in a socially polymorphic ant.

In social animals, body size can be shaped by multiple factors, such as direct genetic effects, maternal effects, or the social environment. In ants, the body size of queens correlates with the social structure of the colony: colonies headed by a single queen (monogyne) generally produce larger queens that are able to found colonies independently, whereas colonies headed by multiple queens (polygyne) tend to produce smaller queens that stay in their natal colony or disperse with workers. We performed a cross-fostering experiment to investigate the proximate causes of queen size variation in the socially polymorphic ant Formica selysi. As expected if genetic or maternal effects influence queen size, eggs originating from monogyne colonies developed into larger queens than eggs collected from polygyne colonies, be they raised by monogyne or polygyne workers. In contrast, eggs sampled in monogyne colonies were smaller than eggs sampled in polygyne colonies. Hence, eggs from monogyne colonies are smaller but develop into larger queens than eggs from polygyne colonies, independently of the social structure of the workers caring for the brood. These results demonstrate that a genetic polymorphism or maternal effect transmitted to the eggs influences queen size, which probably affects the social structure of new colonies.

Composite Precast Prestressed Concrete Bridge Slabs, HR-310, 1991

Precast prestressed concrete panels have been used as subdecks in bridge construction in Iowa and other states. To investigate the performance of these types of composite slabs at locations adjacent to abutment and pier diaphragms in skewed bridges, a research prcject which involved surveys of design agencies and precast producers, field inspections of existing bridges, analytical studies, and experimental testing was conducted. The survey results from the design agencies and panel producers showed that standardization of precast panel construction would be desirable, that additional inspections at the precast plant and at the bridge site would be beneficial, and that some form of economical study should be undertaken to determine actual cost savings associated with composite slab construction. Three bridges in Hardin County, Iowa were inspected to observe general geometric relationships, construction details, and to note the visual condition of the bridges. Hairline cracks beneath several of the prestressing strands in many of the precast panels were observed, and a slight discoloration of the concrete was seen beneath most of the strands. Also, some rust staining was visible at isolated locations on several panels. Based on the findings of these inspections, future inspections are recommended to monitor the condition of these and other bridges constructed with precast panel subdecks. Five full-scale composite slab specimens were constructed in the Structural Engineering Laboratory at Iowa State University. One specimen modeled bridge deck conditions which are not adjacent to abutment or pier diaphragms, and the other four specimens represented the geometric conditions which occur for skewed diaphragms of 0, 15, 30, and 40 degrees. The specimens were subjected to wheel loads of service and factored level magnitudes at many locations on the slab surface and to concentrated loads which produced failure of the composite slab. The measured slab deflections and bending strains at both service and factored load levels compared reasonably well with the results predicted by simplified Finite element analyses of the specimens. To analytically evaluate the nominal strength for a composite slab specimen, yield-line and punching shear theories were applied. Yield-line limit loads were computed using the crack patterns generated during an ultimate strength test. In most cases, these analyses indicated that the failure mode was not flexural. Since the punching shear limit loads in most instances were close to the failure loads, and since the failure surfaces immediately adjacent to the wheel load footprint appeared to be a truncated prism shape, the probable failure mode for all of the specimens was punching shear. The development lengths for the prestressing strands in the rectangular and trapezoidal shaped panels was qualitatively investigated by monitoring strand slippage at the ends of selected prestressing strands. The initial strand transfer length was established experimentally by monitoring concrete strains during strand detensioning, and this length was verified analytically by a finite element analysis. Even though the computed strand embedment lengths in the panels were not sufficient to fully develop the ultimate strand stress, sufficient stab strength existed. Composite behavior for the slab specimens was evaluated by monitoring slippage between a panel and the topping slab and by computation of the difference in the flexural strains between the top of the precast panel and the underside of the topping slab at various locations. Prior to the failure of a composite slab specimen, a localized loss of composite behavior was detected. The static load strength performance of the composite slab specimens significantly exceeded the design load requirements. Even with skew angles of up to 40 degrees, the nominal strength of the slabs did not appear to be affected when the ultimate strength test load was positioned on the portion of each slab containing the trapezoidal-shaped panel. At service and factored level loads, the joint between precast panels did not appear to influence the load distribution along the length of the specimens. Based on the static load strength of the composite slab specimens, the continued use of precast panels as subdecks in bridge deck construction is recommended.

THE INFLUENCE OF THE REGULATORY ENVIRONMENT ON THE DEFINITION OF PERFORMANCE: THE EXAMPLE OF THE SPORT BETTING AND LOTTERY SECTORS

This thesis examines the interplay between state regulation and the way organisations define performance. Performance is generally understood to be a multidimensional concept, but the extent to which its different facets are shaped by regulation remains an understudied question. This thesis aims to address this question and provide at least a partial answer to it. To do so, it examines whether the level of regulation amplifies or abates the multidimensionality of regulated entities' performance definition, i.e. the way they define the concept of performance. The leading question is whether an organisation's performance definition can be associated with the regulatory intensity its environment confronts it with. Moreover, the study explores whether the type of ownership-public or private-plays a role in regard to how a regulated entity defines performance. In order to undertake this investigation, the thesis focuses on the performance definitions of organisations in six different sport betting and lottery regulations. Qualitative data is gathered from primary and secondary documents as well as through semi-structured interviews with chief executive officers (CEO), members of executive management and gambling experts in each of these countries. The thesis concludes that the performance definitions of the organisations under study are indeed multidimensional, as well as clearly influenced by their respective regulatory environments. However, not all performance dimensions identified in the literature are present, nor can they all be estimated to be part of the performance definition. In addition, the public-private difference in defining performance-as conceptualised in the literature- seems to be abated in a regulated environment. The central role played by regulation in regard to the multidimensionality of the performance definition partially outweighs the effect of the nature of ownership.

Molecular biology of baculovirus and its use in biological control in Brazil

Baculoviruses are insect viruses found mainly in Lepidoptera. The family Baculoviridae is taxonomically divided in two genera, Nucleopolyhedrovirus and Granulovirus, which differ by occlusion body morphology. NPVs (Nucleopolyhedroviruses) have polyhedrical inclusion bodies (PIBs) containing multiple viral particles, while GVs (Granuloviruses) appear to be generally single particles occluded in oval shaped occlusion bodies. During the life cycle, two different viral progenies are produced: BV (Budded Virus) and PDV (Polyhedra Derived Virus), which are essential for the infectious process and virus propagation in host cells. Baculoviruses are being used for pest control and they are especially safe due to their specificity and invertebrate-restricted host range. Baculoviruses have been used as vectors for high level protein expression ofheterologous genes from prokaryotic and eukaryotic organisms. Also, recombinant DNA techniques have allowed the production of genetically modified viral insecticides. This study is a review on the taxonomy, structure, replication and molecular biology of baculoviruses, as well as their use as bioinsecticides in Brazil.

Dermatofibrosarcoma presenting as a nodule in the breast of a 75-year-old woman: a case report.

ABSTRACT: INTRODUCTION: Dermatofibrosarcoma protuberans is a rare neoplasm of soft tissues and its location in the breast is extremely uncommon. Confusion is possible with other primary breast lesions. CASE PRESENTATION: A 75-year-old Caucasian woman presented with a mass in her left breast 21 years after being diagnosed with invasive ductal carcinoma of the right breast, treated by a right mastectomy and axillary dissection followed by radiotherapy and breast reconstruction. Mammography revealed a dish-shaped skin nodule formation in the upper outer quadrant of her left breast. Echography confirmed the presence of a lesion measuring 1.4 x 0.8 cm. Based on imaging, the diagnosis was a probable angiosarcoma. Due to the presence of a pacemaker for cardiac arrhythmia and full anticoagulation therapy for a pulmonary embolism, magnetic resonance imaging and a biopsy were not done. We proceeded directly to a quadrantectomy and the final diagnosis revealed a dermatofibrosarcoma protuberans, 1. 8 cm in its greatest microscopic dimension, located 0.1 cm from the upper surgical margin. To ensure the wide resection margins required for this type of neoplasm, a re-excision was performed. CONCLUSION: A dermatofibrosarcoma protuberans of the breast is an uncommon discovery. The aim of this case report is to highlight the importance of the surgical procedure in cases of the discovery of dermatofibrosarcoma protuberans. Re-excision may be necessary to ensure adequate resection margins.

Development of blast resistant somaclones of the upland rice cultivar araguaia

The degree of blast resistance of upland rice (Oryza sativa L.) cultivar Araguaia has decreased over time causing significant yield losses. The major objective of this study was to obtain blast (Pyricularia grisea) resistant somaclones, adapting greenhouse and field selection procedures. Rice blast resistance and agronomic traits were assessed in R2 to R6 generations derived from regenerant plants (R1) from immature panicles of Araguaia. The evaluation and selection procedures include testing of early segregating populations and fixed lines in the advanced generations, under natural field conditions, and artificial inoculations in the greenhouse, with prevalent races IB-1 and IB-9 of P. grisea. Somaclones with both vertical resistance and slow blasting resistance were obtained. Twenty of 31 somaclones developed with a high degree of vertical resistance and fan shaped plant type maintained resistance in field and blast nursery tests in the R6 generation. Greenhouse selection with two specific physiologic races yielded 44 somaclones with slow blasting resistance, similar plant type and yield potential as that of Araguaia.

Non-contact microdrilling of mouse zona pellucida with an objective-delivered 1.48-microns diode laser.

BACKGROUND and OBJECTIVE: A non-touch laser-induced microdrilling procedure is studied on mouse zona pellucida (ZP). STUDY DESIGN/MATERIALS and METHODS: A 1.48-microns diode laser beam is focused in a 8-microns spot through a 45x objective of an inverted microscope. Mouse zygotes, suspended in a culture medium, are microdrilled by exposing their ZP to a short laser irradiation and allowed to develop in vitro. RESULTS: Various sharp-edged holes can be generated in the ZP with a single laser irradiation. Sizes can be varied by changing irradiation time (3-100 ms) or laser power (22-55 mW). Drilled zygotes present no signs of thermal damage under light and scanning electron microscopy and develop as expected in vitro, except for a distinct eight-shaped hatching behavior. CONCLUSION: The microdrilling procedure can generate standardized holes in mouse ZP, without any visible side effects. The hole formation can be explained by a local photothermolysis of the protein matrix.

An Investigation of Portland Cement Concrete Utilizing 70% Class V Aggregate and 30% Calcareous Coarse Aggregate, R-255, 1973

The main sources of coarse aggregate for secondary slip form paving in Southwest Iowa exhibit undesirable "D" cracking. "D" cracking is a discoloration of the concrete caused by fine, hairline cracks. These cracks are caused by the freezing and thawing of moisture inside the coarse aggregate. The cracks are often hour glass shaped, are parallel to each other, and occur along saw joints. The B-4, a typical secondary mix, utilizes 50% fine aggregate and 50% coarse aggregate. It has been proposed that a concrete mix with less coarse aggregate and more fine aggregate might impede this type of deterioration. The Nebraska Standard 47B Mix, a 70% fine aggregate, and 30% coarse aggregate mix, as used by Nebraska Department of Roads produces concrete with ultimate strengths in excess of 4500 psi but because of the higher cost of cement (it is a six bag per cubic yard mix) is not competitive with our present secondary mixes. The sands of Southwest Iowa generally have poorer mortar strengths than the average Iowa Sand. Class V Aggregate also found in Southwest Iowa has a coarser sand fraction, therefore it has a better mortar strength, but exhibits an acidic reaction and therefore must be·used with limestone. This illustrates the need to find a mix for use in Southwest Iowa that possesses adequate strength and satisfactory durability at a low cost. The purpose of this study is to determine a concrete mix with an acceptable cement content which will produce physical properties similar to that of our present secondary paving mixes.

Lipid-bloated subretinal microglial cells are at the origin of drusen appearance in CX3CR1-deficient mice.

Drusen, the white yellowish deposits that can be seen in funduscopy, are a hallmark of age-related macular degeneration. Histologically, drusen are believed to be dome-shaped or more confluent lipid accumulations between the retinal pigment epithelium and the choriocapillaries. Recent advances in mouse funduscopy have revealed the presence of drusen-like structures in chemokine knockout animals in the absence of sizeable dome-shaped material below the retinal pigment epithelium. We show that aged CX3CR1-/- mice present with drusen-like appearance in funduscopy that is associated with a progressive age-related microglial cell accumulation in the subretinal space. We demonstrate that the anatomical equivalent of the drusen-like appearance in these mice are lipid-bloated subretinal microglial cells rather than subretinal pigment epithelium deposits [Combadière C, et al: J Clin Invest 2007;117:2920-2928].

Critical Mobilities

The field of mobility studies examines social phenomena through the lens of movement. In this perspective, societies are regarded as being constantly reconfigured as they are shaped by a series of mobile entities (capital, people, information). This book engages critically with many of the claims and challenges of mobility studies by providing empirically rich reports of mobilities and their limitations. Instead of assuming a seamless world of flows, the volume foregrounds questions of power, inequality, and moorings as integral to the movement of capital, goods, images, practices, or people. It brings together the work of several internationally renowned scholars, who engage with these movements at critical sites. This is the first book to provide a critical and interdisciplinary view of mobilities covering a broad range of issues rather than a single domain. The chapters deal with current and important issues, such as organ transplants, illegal migrations, urban globalization, international policies of higher education institutions, and scientific diasporas. As a whole, the book provides new insights into how power relations shape mobilities and societies.

La pierre et l'image : étude monographique de l'église de Saint-Chef-en-Dauphiné

La pierre et l'image. Etude monographique de l'église de Saint-Chef en Dauphiné: L'ancienne abbatiale de Saint-Chef-en-Dauphiné est située dans l'Isère, à 10 km de Bourgoin-Jallieu et à 2 km de l'ancienne voie romaine qui joignait Vienne à Aoste par le col du Petit-Saint-Bernard. L'abbaye dépendait, dès sa fondation, des archevêques de Vienne, dont la cité se trouvait à 70 km plus à l'ouest. Selon le récit de l'archevêque Adon de Vienne, écrit à la fin du IXe siècle, l'abbaye de Saint-Chef aurait été fondée au cours du VIe siècle par saint Theudère sur un territoire appartenant à sa famille, le Val Rupien. D'abord dédié à la Vierge le monastère est placé, dès l'époque carolingienne, sous le double patronage de la Vierge et du saint fondateur, dont les reliques furent déposées dans l'église. Sans doute détruite et abandonnée lors des guerres bosonides qui provoquèrent la ruine de Vienne (882), l'abbaye est restaurée quelques années plus tard par des moines venus de Champagne : en 887 les moines de Montier-en-Der, fuyant leur abbaye menacée par les invasions normandes, trouvent refuge à Saint-Chef. Afin de promouvoir la reconstruction de l'abbaye, l'archevêque Barnoin, soutenu par Louis l'Aveugle, roi de Bourgogne, lui offrent des privilèges d'exemption et plusieurs donations. Signe de la renommée et de la prospérité dont bénéficiait alors le monastère, Hugues, héritier de Louis l'Aveugle, y reçoit son éducation. Vers 925 ou 926, alors que la Champagne est à. nouveau pacifiée, les moines de Montier-en-Der regagnent leur abbaye d'origine après avoir reconstruit, selon les sources, le « petit monastère de Saint-Chef ». L'abbaye dauphinoise n'est pas pour autant abandonnée et reste vraisemblablement en contact avec les moines champenois : en 928, Hugues de Provence fait des donations importantes d l'abbaye qui est alors formellement placée sous la juridiction de l'Eglise de Vienne. En 962, le Viennois est intégré au royaume de Bourgogne puis, en 1032, au domaine impérial. Construction de l'abbaye : Après le départ des moines de Montier-en-Der, l'église dauphinoise a vraisemblablement été reconstruite par saint Thibaud, archevêque de Vienne entre 970 et l'an mil. Ayant peut-être reçu son éducation dans l'abbaye dauphinoise, il est enterré dans l'église qui, selon certaines sources, associe dès lors son patronage à celui du saint fondateur. Elevée en petit appareil irrégulier, la nef actuelle de l'église de Saint-Chef pourrait appartenir à cette phase de construction de l'église. Fils du comte Hugues de Vienne qui possédait d'importants territoires autour de Saint-Chef, Thibaud était aussi lié aux comtes de Troyes et de Champagne : ce sont ces liens qui expliquent la présence répétée de l'archevêque en Champagne et dans la région de Montier-en-Der. Or, à la même époque, l'église champenoise est reconstruite par le célèbre Adson, abbé de 968 à 992. Des ressemblances entre cette construction et celle de Saint-Chef suggèrent la réalisation, au Xe siècle, de deux églises-soeurs. L'église préromane de Montier-en-Der possédait, à. l'ouest, un massif à double étage et l'est, des tours jumelles s'élevant au-dessus des deux chapelles latérales entourant l'abside. Ce plan présente plusieurs points de comparaison avec l'église actuelle de Saint-Chef : on constate en particulier une équivalence au niveau des dimensions (largeur-longueur des nefs et le diamètre de l'abside), un choix identique pour l'emplacement du choeur et des entrées secondaires : à l'extrémité ouest du bas-côté nord et à l'extrémité orientale du bas-côté sud. Ces analogies nous aident à. restituer le plan de Saint-Chef, tel qu'il pouvait apparaître du temps de Thibaud : la partie orientale de l'église, alors élevée en petit appareil irrégulier comme la nef actuelle, était sans doute dépourvue de transept ; à l'image de l'église champenoise, des tours jumelles pouvaient toutefois s'élever au-dessus des deux chapelles orientales. Si notre hypothèse est exacte, le parti architectural adopté à Saint-Chef comme à Montier¬en-Der correspond au plan des églises monastiques réformées au Xe siècle par les abbayes de Fleury et de Gorze (dès 934). Dans ce type d'églises que l'on rencontre essentiellement dans l'ancienne Lotharingie, mais aussi dans une région proche de Saint-Chef, en Savoie, les tours orientales possédaient, à l'étage, des tribunes qui donnaient sur le choeur. La forme caractéristique de ces églises est déterminée par l'observance de coutumes liturgiques communes aux abbayes réformées. Ainsi, la règle établie par la réforme indiquait la nécessité d'espaces surélevés situés à l'est et à l'ouest de l'église : ces espaces avaient pour fonction d'accueillir les choeurs des moines dont les chants alternaient avec ceux des moines réunis au niveau inférieur, devant le sanctuaire. Par la suite, sans doute en raison de nouvelles pratiques liturgiques, la partie orientale de l'église de Saint-Chef, reconstruite en moyen appareil régulier, est augmentée d'un transept à quatre chapelles latérales. Les deux tours, si elles existaient, sont détruites pour être reconstruites aux extrémités du transept, abritant des chapelles hautes qui donnaient sur les bras du transept et le choeur. La vision latérale entre les deux tribunes est alors favorisée par l'alignement des baies des tribunes et des arcades du transept. Grâce à ce système d'ouverture, les choeurs des moines se voyaient et s'entendaient parfaitement. Ce système de tribunes orientales apparaît dans certaines églises normandes du XIe siècle ou dans d'autres églises contemporaines qui semblent s'en inspirer, telles que la cathédrale du Puy ou l'abbatiale de Saint-Sever-sur-l'Adour. L'importance croissante des chants alternés dans les offices semble avoir favorisé l'émergence d'une telle architecture. L'étude du décor sculpté, et notamment des chapiteaux ornant les différentes parties de l'édifice, permet de dater les étapes de transformation de l'abbatiale. L'aménagement des chapelles orientales semble remonter à la première moitié du XIe siècle ; l'installation des piliers soutenant le transept et les deux tours de l'édifice est datable des années 1060-1080. Par la suite, sans doute du temps de Guillaume de la Tour-du-Pin, archevêque de Vienne entre 1165 et 1170, le transept et la croisée sont surélevés et voûtés et des fenêtres viennent ajourer le mur pignon oriental. Les indices de datation tardives, rassemblés au niveau supérieur du transept, ont été utilisés par les spécialistes de l'architecture, tels Raymond Oursel et Guy Barruol, pour dater l'ensemble de l'église du XIIe siècle. Pourtant, dans d'autres études, Otto Demus, Paul Deschamp et Marcel Thiboud dataient les peintures de Saint-Chef de la seconde moitié du XIe siècle, soit un demi-siècle au moins avant la datation proposée pour l'élévation architecturale. Cette contradiction apparente se trouve désormais résolue par la mise en évidence de phases distinctes de construction et de transformations de l'édifice. Les peintures : Le décor peint de l'abbatiale est conservé dans trois chapelles du transept : dans la chapelle Saint-Theudère, à l'extrémité sud du transept, dans la chapelle Saint-Clément, à son autre extrémité, et dans la chapelle haute s'élevant au-dessus de celle-ci. Selon une dédicace peinte derrière l'autel, cette chapelle est dédiée au Christ, aux archanges et à saint Georges martyr. L'analyse stylistique permet de dater les peintures du troisième ou du dernier quart du XIe siècle : leur réalisation semble donc succéder immédiatement à l'élévation du transept et des deux tours que l'on situe, on l'a vu, dans les années 1060-1080. Au cours de cette étude, on a aussi relevé la parenté des peintures avec des oeuvres normandes et espagnoles : ces ressemblances s'affirment par certaines caractéristiques de style, mais aussi par le traitement de l'espace. Par exemple, l'alignement des anges sur la voûte, ou des élus sur le mur ouest de la chapelle haute de Saint-Chef, rappellent certains Beatus du XIe siècle, tels que celui de Saint-Sever antérieur à 1072. Dans la chapelle haute, la hiérarchie céleste est distribuée par catégories autour du Christ, représenté au centre de la voûte ; cette disposition se retrouve à Saint-Michel d'Aiguilhe au Xe siècle, ainsi que dans le premier quart du XIIe siècle à Maderuelo en Catalogne et à Fenouilla en Roussillon. D'autres rapprochements avec des oeuvres ottoniennes et carolingiennes ont aussi été observés, ainsi qu'avec certaines enluminures d'Ingelard, moine à Saint-Germain des Prés entre 1030 et 1060. L'iconographie: Le sens de l'image avait donné lieu à quelques études ponctuelles. Cette thèse a permis, d'une part, la mise en évidence d'un unique programme iconographique auquel participent les peintures des trois chapelles de l'abbatiale et, d'autre part, la découverte des liens entre le choix iconographique de Saint-Chef et certaines sources littéraires. Ces rapports ont par exemple été relevés pour la figure de l'ange conduisant saint Jean à la Jérusalem céleste, sur le voûtain ouest de la chapelle haute. La figure très soignée de l'ange, portant les mêmes vêtements que le Christ peint au centre de la voûte, présente sur son auréole quelques traces sombres qui devaient à l'origine dessiner une croix : ce détail fait de l'ange une figure du Christ, figure qui apparaît dans certaines exégèses apocalyptiques telles que le Commentaire d'Ambroise Autpert au Ville siècle, celui d'Haymon d'Auxerre au IXe siècle ou, au début du XIIe siècle, de Rupert de Deutz. Pour Ambroise Autpert, l'ange guidant saint Jean est une image du Christ amenant l'Eglise terrestre à la Jérusalem céleste, à laquelle elle sera unie à la fin des temps. Les deux figures symboliquement unies par le geste du Christ empoignant la main de saint Jean est une image du corps mystique de Jésus, le corps étant l'Eglise et la tête, le Christ qui enseigne aux fidèles. L'iconographie des peintures de la chapelle haute est centrée autour de l'oeuvre de Rédemption et des moyens pour gagner le salut, la Jérusalem céleste étant le lieu de destination pour les élus. Au centre de la voûte, le Christ présente ses deux bras écartés, en signe d'accueil. Sur le livre ouvert qu'il tient entre les genoux, les mots pax vobis - ego sum renvoient aux paroles prononcées lors de son apparition aux disciples, après sa Résurrection et au terme de son oeuvre de Rédemption. A ses pieds, sur le voûtain oriental, la Vierge en orante, première médiatrice auprès de son Fils, intercède en faveur des humains. Grâce au sacrifice du Christ et à travers la médiation de la Vierge, les hommes peuvent accéder à la Jérusalem céleste : les élus sont ici représentés sur le dernier registre du mur ouest, directement sous la Jérusalem ; un cadre plus sombre y indique symboliquement l'accès à la cité céleste. A l'autre extrémité du voûtain, Adam et Eve sont figurés deux fois autour de l'arbre de la connaissance : chassés du paradis, ils s'éloignent de la cité ; mais une fois accomplie l'oeuvre de Rédemption, ils peuvent à nouveau s'acheminer vers elle. Les peintures de la chapelle inférieure participent elles aussi au projet iconographique de la Rédemption. Sur la voûte de la chapelle, les quatre fleuves paradisiaques entouraient à l'origine une colombe. Selon l'exégèse médiévale, ces fleuves représentent les quatre temps de l'histoire, les vertus ou les quatre évangiles, diffusés aux quatre coins de la terre. Selon une tradition littéraire et iconographique d'origine paléochrétienne, ce sont aussi les eaux paradisiaques qui viennent alimenter les fonts baptismaux : l'association de la colombe, figure du Saint-Esprit et des fleuves du paradis suggère la présence, au centre de la chapelle, des fonts baptismaux. L'image de la colombe se trouve, on l'a vu, dans le prolongement vertical du Christ ressuscité, représenté au centre de la voûte supérieure. Or, selon une tradition qui remonte à Philon et Ambroise de Milan, la source des quatre fleuves, de la Parole divine diffusée par les quatre Evangiles, c'est le Christ. Dans son traité sur le Saint-Esprit, l'évêque de Milan place à la source de l'Esprit saint l'enseignement du Verbe fait homme. Il ajoute que lorsqu'il s'était fait homme, le Saint-Esprit planait au-dessus de lui ; mais depuis la transfiguration de son humanité et sa Résurrection, le Fils de Dieu se tient au-dessus des hommes, à la source du Saint-Esprit : c'est la même logique verticale qui est traduite dans les peintures de Saint-Chef, le Christ ressuscité étant situé au-dessus du Saint-Esprit et des eaux paradisiaques, dans la chapelle haute. Si les grâces divines se diffusent de la source christique aux hommes selon un mouvement descendant, l'image suggère aussi la remontée vers Dieu : en plongeant dans les eaux du baptême, le fidèle initie un parcours qui le ramènera à la source, auprès du Christ. Or, cet ascension ne peut se faire qu'à travers la médiation de l'Eglise : dans la chapelle Saint-Clément, autour de la fenêtre nord, saint Pierre et Paul, princes de l'Eglise, reçoivent la Loi du Christ. Dans la chapelle supérieure, ici aussi autour de la fenêtre septentrionale, deux personnifications déversaient les eaux, sans doute contenues dans un vase, au-dessus d'un prêtre et d'un évêque peints dans les embrasures de la fenêtre : c'est ce dont témoigne une aquarelle du XIXe siècle. Ainsi baignés par l'eau vive de la doctrine, des vertus et des grâces issue de la source divine, les représentants de l'Eglise peuvent eux aussi devenir sources d'enseignement pour les hommes. Ils apparaissent, en tant que transmetteurs de la Parole divine, comme les médiateurs indispensables entre les fidèles et le Christ. C'est par les sacrements et par leur enseignement que les âmes peuvent remonter vers la source divine et jouir de la béatitude. Si l'espace nord est connoté de manière très positive puisqu'il est le lieu de la représentation théophanique et de la Rédemption, les peintures de la chapelle sud renvoient à un sens plus négatif. Sur l'intrados d'arc, des monstres marins sont répartis autour d'un masque barbu aux yeux écarquillés, dont les dents serrées laissent échapper des serpents : ce motif d'origine antique pourrait représenter la source des eaux infernales, dont le « verrou » sera rompu lors du Jugement dernier, à la fin des temps. La peinture située dans la conque absidale est d'ailleurs une allusion au Jugement. On y voit le Christ entouré de deux personnifications en attitude d'intercession, dont Misericordia : elle est, avec Pax, Justifia et Veritas, une des quatre vertus présentes lors du Jugement dernier. Sur le fond de l'absidiole apparaissent des couronnes : elles seront distribuées aux justes en signe de récompense et de vie éternelle. L'allusion au Jugement et à l'enfer est la vision qui s'offre au moine lorsqu'il gagnait l'église en franchissant la porte sud du transept. S'avançant vers le choeur où il rejoignait les stalles, le moine pouvait presque aussitôt, grâce au système ingénieux d'ouvertures que nous avons mentionné plus haut, contempler les peintures situées sur le plafond de la chapelle haute, soit le Christ en attitude d'accueil, les anges et peut-être la Jérusalem céleste ; de là jaillissaient les chants des moines. De façon symbolique, ils se rapprochaient ainsi de leurs modèles, les anges. Dans ce parcours symbolique qui le conduisait de la mer maléfique, représentée dans la chapelle Saint¬Theudère, à Dieu et aux anges, les moines pouvaient compter sur les prières des intercesseurs, de la Vierge, des anges et des saints, tous représentés dans la chapelle haute. A Saint-Chef, l'espace nord peut-être assimilé, pour plusieurs aspects, aux Westwerke carolingiens ou aux galilées clunisiennes. Les massifs occidentaux étaient en effet le lieu de commémoration de l'histoire du salut : sites Westwerke étaient surtout le lieu de la liturgie pascale et abritaient les fonts baptismaux, les galilées clunisiennes étaient réservées à la liturgie des morts, les moines cherchant, par leurs prières, à gagner le salut des défunts. A l'entrée des galilées comme à Saint-Chef, l'image du Christ annonçait le face à face auquel les élus auront droit, à la fin des temps. Elevée au Xe siècle et vraisemblablement transformée dans les années 1060-1080, l'église de Saint-Chef reflète, par son évolution architecturale, celle des pratiques liturgiques ; son programme iconographique, qui unit trois espaces distincts de l'église, traduit d'une manière parfois originale les préoccupations et les aspirations d'une communauté monastique du XIe siècle. On soulignera toutefois que notre compréhension des peintures est limitée par la perte du décor qui, sans doute, ornait l'abside et d'autres parties de l'église ; la disparition de la crypte du choeur nuit aussi à l'appréhension de l'organisation liturgique sur cette partie de l'édifice. Seules des fouilles archéologiques ou la découverte de nouvelles peintures pourront peut-être, à l'avenir, enrichir l'état de nos connaissances.

Totally implantable robot to treat chronic atrial fibrillation

Chronic atrial fibrillation affects millions of people worldwide. Its surgical treatment often fails to restore the transport function of the atrium. This study first introduces the concept of an atrial assist device (AAD) to restore the pump function of the atrium. The AAD is developed to be totally implantable in the human body with a transcutaneous energy transfer system to recharge the implanted battery. The ADD consists of a motorless pump based on artificial muscle technology, positioned on the external surface of the atrium to compress it and restore its muscular activity. A bench model reproduces the function of a fibrillating atrium to assess the circulatory support that this pump can provide. Atripump (Nanopowers SA, Switzerland) is a dome-shaped silicone-coated nitinol actuator 5 mm high, sutured on the external surface of the atrium. A pacemaker-like control unit drives the actuator that compresses the atrium, providing the mechanical support to the blood circulation. Electrical characteristics: the system is composed of one actuator that needs a minimal tension of 15 V and has a maximum current of 1.5 A with a 50% duty cycle. The implantable rechargeable battery is made of a cell having the following specifications: nominal tension of a cell: 4.1 V, tension after 90% of discharge: 3.5 V, nominal capacity of a cell: 163 mA h. The bench model consists of an open circuit made of latex bladder 60 mm in diameter filled with water. The bladder is connected to a vertically positioned tube that is filled to different levels, reproducing changes in cardiac preload. The Atripump is placed on the outer surface of the bladder. Pressure, volume and temperature changes were recorded. The contraction rate was 1 Hz with a power supply of 12 V, 400 mA for 200 ms. Preload ranged from 15 to 21 cm H(2)O. Maximal silicone membrane temperature was 55 degrees C and maximal temperature of the liquid environment was 35 degrees C. The pump produced a maximal work of 16 x 10(-3) J. Maximal volume pumped was 492 ml min(-1). This artificial muscle pump is compact, follows the Starling law and reproduces the hemodynamic performances of a normal atrium. It could represent a new tool to restore the atrial kick in persistent atrial fibrillation.

Further ultrastructural evidence that spirochaetes may play a role in the aetiology of Alzheimer's disease

Recently it was reported that, at autopsy, in neuropathologically confirmed cases of Alzheimer's disease spirochaetes were found in blood and cerebrospinal fluid using dark-field microscopy. Moreover, the spirochaetes were isolated and cultured from brain tissue. We now show, using scanning electron microscopy and atomic force microscopy that the helically shaped microorganisms isolated and cultured from the Alzheimer brains possess axial filaments. This indicates that these microorganisms taxonomically indeed belong to the order Spirochaetales. A morphometric analysis reinforces this notion.