979 resultados para Sequenciamento de nucleotídeos de alto rendimento


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The soybean crop is considered a high expression around the world. In plant breeding programs, knowledge of genetic diversity is extremely important and in this context, are frequently used multivariate analyzes. Thus, the aim of the present study was to evaluate the genetic divergence between soybean crosses through multivariate techniques. In total, 16 crosses were evaluated, which were in the F2 generation of inbreeding. The evaluated characteristics were plant height at maturity, height of the first pod, number of branches per plant, number of pods per plant, number of nodes per plant, hundred seed weight, grain yield and oil content. For the analyzes was used Euclidean distance, methods of hierarchical clustering UPGMA and Ward and principal component analysis. Genetic distances estimated using Euclidean distance ranged from 1.24 to 8.13, with the smallest distance observed between crosses C1 and C4, and the greatest distance between the C2 crosses and C6. The methods UPGMA clustering and Ward met crossings in five different groups. The principal component analysis explained 86.2% of the variance contained in the original eight variables with three main components. The APM characters, NV, NR, NN, PG% and oil were the main contributors to genetic divergence among traits. Multivariate techniques were crucial to the analysis of genetic diversity, and the methods of Ward and UPGMA clustering and principal components have consistent results in this way, the simultaneous use of these tools in genetic analysis of crosses is indicated

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Nas florestas Neotropicais, os mamíferos podem desempenhar papéis importantes como predadores e/ou dispersores de sementes, polinizadores, frugívoros, folívoros ou até mesmo predadores de topo e, por isso, são importantes para a manutenção e regeneração das comunidades biológicas. Os objetivos deste trabalho foram: (i) realizar um levantamento da diversidade de espécies de aves e mamíferos cinegéticos no PETAR, (ii) estimar a abundância relativa, densidade, biomassa e tamanho populacional das aves e mamíferos mais avistados, (iii) comparar a diversidade e abundância das espécies estudadas em dois núcleos com diferentes pressões antrópicas. A área de estudo esta localizada na Serra da Paranapiacaba, que é a segunda maior área protegida do estado de São Paulo, possuindo mais de 125 000 ha, onde quatro Unidades de Conservação estão conectadas (Parque Estadual Turístico do Alto Ribeira, Parque Estadual de Intervales, Parque Estadual de Carlos Botelho e Estação Ecológica Xituê). Ligadas a Serra do Mar, estas UC´s formam um grande corredor de biodiversidade que compreende o maior contínuo florestal de Mata Atlântica. O presente estudo segue o mesmo protocolo de amostragem do projeto BIOTA Fapesp (01/14463-05). As espécies alvo da amostragem foram aves de grande porte (Cracídeos, Tinamídeos e Fasianídeos) e mamíferos acima de 1kg, com exceção do esquilo (Guerlinguetus ingrami) que é uma espécie indicadoras de áreas defaunadas. Para o levantamento qualitativo (riqueza) foram utilizadas identificação de pegadas, carcaças, rastros e observações ad libitum. Já o levantamento quantitativo (abundância, densidade, biomassa e tamanho populacional) foi obtido pelo método de transecções lineares, em que para cada indivíduo observado foram obtidas a distância perpendicular animal-trilha, horário do avistamento, número de indivíduos e sua localização... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

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A biodiversidade pode ser considerada como uma base da existência por proporcionar recursos e regular os processos naturais responsáveis pela manutenção da vida. Nas últimas décadas, a biodiversidade vem sendo perdida rapidamente, apresentando taxas de decréscimo nunca antes vistas, o que reduz a capacidade de aporte de recursos naturais para as gerações futuras. Em relação às estratégias de conservação da biodiversidade, os orgãos ambientais brasileiros têm empreendido diversos esforços na sistematização de dados e informações sobre biomas, ecossistemas e espécies ameaçadas com a finalidade do estabelecimento de indicadores e diretrizes para a conservação da diversidade biológica direcionados à tomada de decisões por parte de gestores públicos e privados, como aquelas que são deflagradas no âmbito dos processos de licenciamento ambiental. Dentre os instrumentos de gestão ambiental, o licencimaneto ambiental é aquele responsável pela autorização da implantação de empreendimentos potencialmente causadores de significativo impacto ambiental, como é o caso de usinas hidrelétricas. Para isso, o licenciamento ambiental deve estar baseado em estudos ambientais realizados a partir dos procedimentos metodológicos de avaliação de impacto ambiental, os quais devem preconizar os aspectos que caracterizam a vulnerabilidade ambiental da localidade geográfica onde está planejado o empreendimento. Neste sentido, o presente trabalho objetivou analisar de que forma os dados, informações, indicadores e diretrizes sobre a diversidade biológica brasileira, produzidos e estabelecidos pelo governo federal estão sendo utilizados no processo de licenciamento ambiental da usina hidrelétrica de Tijuco Alto do rio Ribeira de Iguape.

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In this work, it was studied the thermal and fluid dynamic behavior from theorical and experimental point of view of a blast furnace tuyere. The tuyere is responsible for the hot air insuflation into the blast furnace. The parameter used in the comparison was the difference between the cooling water inlet and outlet temperatures. There were used forced convection correlations inside circular sections with adequations for non circular sections. Based on operations dates of flux and thermal loads it was possible to model numerically the tuyere, and, since it was obtained the wall temperatures, estimate the conduction and convection resistances and the heat flux through the walls in contact with the water. The total heat fluxes from wall to water were applied to the energy conservation equation where could be estimated the theorical temperature variation. Compared to the real value, the theorical value presented a difference of 0,2 °C. Considering that the boundary conditions around the tuyere are transitories and that your channels have some rugosity irregularities we can consider the estimation method for cooling system coherent with the real operational parameters

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The granites Rondonianos, located in Rondônia Tin Pronvíncia, the southwestern portion of the Amazonian Craton, have great economic importance due to its large potential metallogenic. These granites stands out Intrusive Suite or Suite Granites Latest Rondônia Rondônia, with approximately 997-998 Ma (Bettencourt et al., 1997, 1999), for their tin mineralization having the largest reserves of this ore from Brazil. These tin mineralization in veins greissen are genetically related to these granites, deposits with different structural styles both within granitic plutons (endogreissen) as the host rocks (exogreissen). The western region of the Massif Caritianas has few published works, and the geology and potential econômicoão that were never fully known, now with the recovery of tin in the world market need new campaigns and prospective discoveries of new deposits

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Os curimatídeos são espécies comuns em ambientes lênticos represados, artificialmente construídos. Estudar o ciclo reprodutivo de uma espécie é fundamental para a compreensão da biologia reprodutiva da população em seu ambiente. Por isso, o presente estudo analisou os aspectos da biologia reprodutiva dos sagüirus Cyphocharax modestus, C. cf. nagelii e Steindachnerina insculpta (Curimatidae), no reservatório da pequena central hidrelétrica Mogi Guaçu, município de Mogi Guaçu, estado de São Paulo. Os exemplares foram coletados bimensalmente entre agosto de 2005 e julho de 2006 com o auxílio de redes de emalhar (malhas 1,0 a 5,0 cm entre nós adjacentes), totalizando seis amostras. No total, foram analisados 777 exemplares, sendo 525 de C. modestus, 82 de C.cf. nagelii e 170 de S. insculpta. A dinâmica reprodutiva foi analisada considerando-se os períodos seco e chuvoso. A fecundidade foi estimada de acordo com o método volumétrico a partir da análise de 168 pares de ovários maduros, sendo 121 de C. modestus, 18 de C. cf nagelii e 29 de S. insculpta. Também foram estimadas as relações gonadossomáticas médias e as correlações do número total de ovócitos em relação ao peso e ao comprimento para cada uma das três espécies. Os resultados encontrados apontaram para desova total (sincrônica em dois grupos) para as três espécies. O número médio de ovócitos foi de 15.309 a 28.825 para C. modestus, 29.031 para C. cf. nagelii e 27.206 para S. insculpta.

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The construction industry is booming, and the federal government is heavily financially supporting public housing. This scenario is very favorable for the development of construction materials, especially low-cost construction. Thus, this study aims to develop a new class of unfired clay masonry bricks: GGBS stabilized bricks. Studies show that the ground granulated blast furnace slag, a material used as raw material in cement manufacture, can be used together with calcium oxide in soil stabilization for the manufacture of bricks. This study aims to test and identify the best parameters for the manufacture of unfired bricks, adapting its composition to the materials found in Brazil and identify the optimum curing conditions for our climate. So far preliminary studies were done to verify the technical feasibility of the material. Future studies should be done to ascertain the economic feasibility and environmental gains of such material

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The Coffee Genome Project made available to the scientific community relevant information that made practical the identification and cloning of important genes, as well as the identification of the major sequences involved on their regulation. The aim of the present study was to amplify, clone and sequence coffee promoters with specific expression patterns. For that, coffee ESTs which known expression profiles were employed. First, the promoter regions of coffee genes showing, respectively, fruitspecific and ubiquitous expression were amplified using the Genome Walking strategy. Amplified sequences were then inserted in the pGEM-Teasy vector (Promega) and sequenced. Once completed the sequencing, an expression cassette was constructed using the binary vector pCAMBIA-1381z (Cambia). These expression cassettes were cloned into Agrobacterium tumefaciens, and transgenic tobacco plants were generated aiming the functional characterization of these promoters

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A grande diversidade das formigas implica na enorme variedade de hábitats de nidificação, preferências alimentares e comportamento social com divisão de trabalho, além da estruturação de seu ninho que por sua vez, podem revelar parte de sua história evolutiva. Camponotus textor é uma espécie tecelã, a qual constrói seu ninho a partir da seda produzida pelas suas próprias larvas, garantindo um dos mais notáveis exemplos de cooperação social. É uma formiga arborícola e de grande importância para a agricultura, já que pode nidificar no cafeeiro (Coffea arabica) e ser usada como agente de controle biológico impedindo o estabelecimento de outras pragas. Atualmente, existem poucos estudos abordando comportamento, fisiologia, genética, endossimbiontes e filogenia desse grupo. Segundo dados da literatura, o DNA mitocondrial tem sido utilizado em análises de filogenia devido ao ótimo número de cópias por célula, altas taxas mutacionais e pouca ou nenhuma recombinação. Sendo assim, o presente trabalho visa realizar o sequenciamento de um fragmento do DNA mitocondrial de populações distintas de Camponotus textor para ser utilizado como marcador molecular, tornandose uma ferramenta para diferenciação de populações e determinação das relações filogenéticas entre outras espécies de formigas relacionadas. Foi feita a extração do DNA em TNES (Tris, NaCl, EDTA, SDS), seguida da amplificação da região COI (citocromo oxidase I) do DNA mitocondrial utilizando-se os primers elaborados para este trabalho e o sequencimento foi realizado no 3130 Genetic Analyzer (Applied Biosystems). As seqüências obtidas foram editadas no BioEdit, e posteriormente comparadas com o banco de dados GenBank, utilizando-se a ferramenta BLAST, e assim a construção da análise filogenética através do programa MEGA. Foi possível a separação das cinco populações em duas linhagens distantes geograficamente

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A biotecnologia define-se pelo uso de conhecimentos sobre os processos biológicos e sobre as propriedades dos seres vivos, com o fim de resolver problemas e criar produtos de utilidade. É importante frisar que uma das principais vantagens da biotecnologia moderna voltada para a área vegetal é a de poder gerar estratégias de melhoramento aplicáveis a diferentes culturas. Uma das principais estratégias de ação nessa área trata da produção de plantas geneticamente modificadas com transgenes de interesse. Nesse contexto, a identificação e caracterização de promotores com padrão de expressão tecido-específico é essencial para que a expressão de tais transgenes em plantas de interesse agronômico e florestal, como em eucalipto, fique limitada a determinados órgãos/tecidos. Assim, o presente trabalho teve por objetivo clonar e sequenciar a região promotora de um gene com expressão específica em raiz de eucalipto cujo produto gênico tem similaridade a uma aquaporina. Uma vez clonado, o promotor foi introduzido em vetor binário e inserido em plantas de tabaco visando a sua caracterização funcional. Além disso, a expressão do gene em estudo foi investigada em eucalipto, e uma analise filogenética comparativa com outras angiospermas foi empreendida

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This work presents a study that aims to validate the fatigue analyses developed on finite element commercial software, ANSYS Workbench. It was based on mechanical tests development of traction and hardness, to verify the mechanical properties of material that the shaft was manufactured (ABNT 1045 steel), it was developed bend test, with purpose to prove the confiability degree of computational analyses, obtaining the maximum stress in a work condition determined with 40 [kgf] of load applied, and at the end, was developed the fatigue test to obtain the number of cycles that the transmission shaft can support in a work condition with 8 [kgf] of load applied. The results obtained during the work present, have to be quite satisfactory with the theoretically expected

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The growing demand for electricity in Brazil has stimulated the implementation of Small Hydro Power (PCH) in various regions of the country. However, the silting of reservoirs is a major problem faced by power plants and power plants. In this context, this study aimed to evaluate the data hydrosedimentological strategic points of the watershed of the Alto Rio Sucuriú (MS) to identify the possible causes siltation of the reservoir PCH Costa Rica and suggest mitigation measures. Hydrosedimentological surveys were conducted during the rainy season (February / March 2012) and drought (August 2012), and obtained data flow, discharge liquid, suspended solids and bottom and organic matter content. Based on these results it was determined that the points 2, 4, 7 and 9 are the largest contributors to sedimentation, and point 4 got most liquid discharge (38,20 m3s-1), point 7 largest discharge of solid suspension (906,3 mg L-1), points 2 and 4 major discharges solid totals (231,59 t dia-1 and 238,185 t dia-1 respectively) and point 9 higher organic matter content (22,18%) . Found greater fraction of fine sand and very fine suspended solids and solid medium sand in the background. As mitigation measures for the process of silting of the reservoir PCH Costa Rica (MS) highlights the orientation of landowners in adopting conservation measures and planting of leguminous species native to the region in symbiosis with nitrogen-fixing bacteria

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A infecção genital por Papilomavírus Humano (HPV) é uma das doenças sexualmente transmissíveis (DST), de origem viral, mais prevalente no mundo. As lesões intraepiteliais escamosas de baixo grau (LIEBG) e de alto grau (LIEAG), assim como carcinoma cervical invasor (CCI), estão associadas à presença do HPV. A resposta imune tem papel importante na infecção pelo HPV na cérvice uterina, sendo as citocinas importantes reguladoras da transcrição viral. Avaliar a concentração de IL-1β, IL-2, IL-4, IL-5, IL-6, IL-8, IL-10, IL-12, IFN-γ e TNF-α no soro de mulheres portadoras de LIEBG, LIEAG e CCI. Foram incluídas no estudo 40 mulheres com diagnóstico histopatológico de LIEBG (n=11), LIEAG (n=10), CCI (n=10) e 9 mulheres com suspeita de doença HPV induzida, mas sem alterações histopatológicas na biópsia do colo do útero (controle), atendidas no Ambulatório de Colposcopia da Faculdade de Medicina de Botucatu (UNESP) e no Ambulatório de Ginecologia Preventiva do Hospital Amaral Carvalho, Jaú, SP. O sangue periférico foi colhido por punção venosa e o soro armazenado até o processamento. A dosagem das citocinas no soro foi avaliada por ensaio imunoenzimático (ELISA). A pesquisa de HPV foi realizada empregando-se a técnica da reação em cadeia da polimerase (PCR). Os dados sócio-demográficos foram obtidos por entrevista no momento da consulta ginecológica. A mediana de idade das pacientes do grupo controle, LIEBG, LIEAG, e CCI foi de 38 (21-69), 32,5 (17-51), 39 (23-65) e 51,5 (29-72), respectivamente. Houve diferença estatisticamente significante de mediana de idade das pacientes do grupo CCI quando esta foi comparada com os demais grupos. Em relação às características das pacientes, 76% eram brancas, 68% relataram união estável, 31% concluíram o 2º grau, 42% eram fumantes, 37% das mulheres relataram 3 ou mais parceiros sexuais durante... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

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Tuberculose (TB), causada por Mycobacterium tuberculosis, é uma das doenças infecciosas que mais causam mortes. Estima-se que mais de dois bilhões de pessoas estejam infectadas no mundo. O tratamento da TB consite em associação de fármacos, isoniazida, rifampicina, pirazinamida e etambutol, nos primeiros 2 meses e 4 meses de isoniazida e de rifampicina. Internacionalmente, são consideradas cepas multi resistentes (MDR), as que apresentam resistência simultânea a isoniazida e a rifampicina. A rápida detecção de resistência é essencial para o controle e tratamento da TB, reduzindo, assim, o custo do tratamento e a transmissão da doença. Neste projeto, os isolados já identificados fenotipicamente como resistentes a isoniazida e/ou rifampicina, foram submetidos ao sequenciamento de Sanger para pesquisa de 3 genes relacionados a resistência a isoniazida (katG, inhA e ahpC) e 1 gene de resistência a rifampicina (rpoB). Foi realizada uma comparação destes genes mutados para a resistência utilizando o novo teste desenvolvido pela Biomérieux, denominado GenoType® MTBDRplus, que se baseia na tecnologia DNA-STRIP. Através deste novo teste, foi observada mutação em 22 isolados clínicos de M. tuberculosis para genes de resistência a isoniazida e/ou rifampicina, sendo 4 provenientes do MS e 18 de SP. Já pelo sequenciamento genético foi observada mutação em 24 isolados para genes de resistência a isoniazida e/ou rifampicina, sendo 6 provenientes do MS e 18 de SP. Portanto, através do sequenciamento de Sanger, foi possível detectar um número maior de isolados mutados e mais mutações quando comparado ao teste GenoType® MTBDRplus. Isso acontece porque na técnica de sequenciamento, um fragmento do gene como um todo é analisado e no caso do teste GenoType® MTBDRplus, é verificada apenas a ausência ou presença das mutações mais frequentes descritas na literatura, além de não ser analisado o gene ahpC. A grande ...