Structural characterization of folded pentapeptides containing centrally positioned beta(R)Val, gamma(R)Val and gamma(S)Val residues

A cylindrical pore of similar to 7.5 angstrom diameter containing a one-dimensional water wire, within the confines of a hydrophobic channel lined with the valine side chain, has been observed in crystals of the peptide Boc-D-Pro-Aib-Val-Aib-Val-OMe (1) (Raghavender et al., 2009, 2010). The synthesis and structural characterization in crystals of three backbone homologated analogues Boc-D-Pro-Aib-beta(3)(R) Val-Aib-Val-OMe (2), Boc-D-Pro-Aib-gamma(4)(R)Val-Aib-Val-OMe (3), Boc-D-Pro-Aib-gamma(4)(S)Val-Aib-Val-OMe (4) are described. Crystal structures of peptides 2, 3 and 4 reveal close-packed arrangements in which no pore was formed. In peptides 2 and 3 the N-terminus D-Pro-Aib segment adopted conformations closely related to Type II' beta-turns, while residues 2-4 form one turn of an alpha beta right-handed C-11 helix in 2 and an alpha gamma C-12 helix in 3. In peptide 4, a continuous left-handed helical structure was observed with the D-Pro-Aib segment forming a Type III' beta-turn, followed by one turn of a left-handed alpha gamma C-12 helix. (C) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Cytotoxic and pro-apoptotic effects of Abrus precatorius L. on human metastatic breast cancer cell line, MDA-MB-231

Abrus precatorius is highly regarded as a universal panacea in the herbal medicine with diverse pharmacological activity spectra. This experimental study on the mechanism of the anticancer activity of A. precatorius leaf extracts, may offer new evidence for A. precatorius in the treatment of breast cancer in clinical practice. Cell death was determined by using MTT assay. Further analyses were carried out by doing DNA laddering, PARP cleavage, FACS, semi-quantitative RT-PCR and detection of cellular reactive oxygen species (ROS) by DCFDA assay. A. precatorius showed very striking inhibition on MDA-MB-231 cells. MTT assay showed more than 75 % inhibition of the cells and treated cells indicated visible laddering pattern with thick compact band. PARP cleavage produced 89 kDa cleavage product which was associated with apoptosis. Flow cytometer exhibited a sub-G0/G1 peak as an indicative of apoptosis. mRNA expression level of apoptosis-related genes p21 and p53 was markedly increased in cells treated with the extract as compared to control. The up-regulation of p21 and p53 may be the molecular mechanisms by which A. precatorius extract which induces apoptosis. An increase in the concentration of A. precatorius extract does not generate ROS, instead it reduces ROS formation in MDA-MB-231 cells, as evident from the shift in fluorescence below untreated control. This is the first report showing that A. precatorius leaf extract exhibits a growth inhibitory effect by induction of apoptosis in MDA-MB-231 cells. Our results contribute towards validation of the A. precatorius extract as a potentially effective chemopreventive or therapeutic agent against breast cancer.

Crystal-structure analysis of cis-X-pro-containing peptidomimetics: understanding the steric interactions at cis X-pro amide bonds

Catch the twist: The cis Piv-Pro conformer (Piv=pivaloyl) of peptides is no longer inaccessible. Any cis X-Pro tertiary-amide-bond conformer can be stabilized in crystals of peptides by accommodating the unavoidable distortion of the dihedral angle of the peptide bond to the carbonyl group of the Pro residue (see picture), in this case through ni−1→πi* interactions. Steric clashes were not observed in the cis Piv-Pro rotamers studied.

Steric and Electronic Interactions Controlling the cis/trans Isomer Equilibrium at X-Pro Tertiary Amide Motifs in Solution

A systematic understanding of the noncovalent interactions that influence the structures of the cis conformers and the equilibrium between the cis and the trans conformers, of the X-Pro tertiary amide motifs, is presented based on analyses of H-1-, C-13-NMR and FTIR absorption spectra of two sets of homologous peptides, X-Pro-Aib-OMe and X-Pro-NH-Me (where X is acetyl, propionyl, isobutyryl and pivaloyl), in solvents of varying polarities. First, this work shows that the cis conformers of any X-Pro tertiary amide motif, including Piv-Pro, are accessible in the new motifs X-Pro-Aib-OMe, in solution. These conformers are uniquely observable by FTIR spectroscopy at ambient temperatures and by NMR spectroscopy from temperatures as high as 273 K. This is made possible by the persistent presence of n(i-1i)* interactions at Aib, which also influence the disappearance of steric effects at these cis X-Pro rotamers. Second, contrary to conventional understanding, the energy contribution of steric effects to the cis/trans equilibrium at the X-Pro motifs is found to be nonvariant (0.54 +/- 0.02 kcal/mol) with increase in steric bulk on the X group. Third, the current studies provide direct evidence for the weak intramolecular interactions namely the n(i-1i)*, the N-Pro center dot center dot center dot Hi+1 (C(5)a), and the C-7 hydrogen bond that operate and influence the structures, stabilities, and dynamics between different conformational states of X-Pro tertiary amide motifs. NMR and IR spectral data suggest that the cis conformers of X-Pro motifs are ensembles of short-lived rotamers about the C-X-N-Pro bond. (c) 2013 Wiley Periodicals, Inc. Biopolymers 101: 66-77, 2014.

Insertion Reactions of Six-Membered Cyclopalladated N,N `,N `'-Triarylguanidine, Pd{kappa(2)(C,N)-C6H3Me-3(NHC(NHAr)(=NAr))-2)(mu-Br)](2) (Ar=2-MeC6H4) with PhCC C-C(O)OR (R = Me and Et): A Gateway to Second Orthopalladation through Novel Rearrangements

The reaction of Pd{kappa(2)(C,N)-C6H3Me-3-(NHC(NHAr)(=NAr))-2}(mu-Br)](2) (Ar = 2-MeC6H4; 1) with 4 equiv of PhC C-C(O)OMe in CH2Cl2 afforded Pd{kappa(2)(C,N)-C(Ph)=C(C(O)OMe)C(Ph)=C(C(O)-OMe)C6H3Me-3(N=C(NH Ar)(2))-2}Br] (Ar = 2-MeC6H4; 2) in 70% yield, and the aforementioned reaction carried out with 10 equiv of PhC C-C(O)OR (R = Me, and Et) afforded an admixture of two regioisomers of Pd{kappa(3)(N,C,O)-O=C(OR)-C5Ph3(C(O)OR)C(C(O)OR)C6H3Me-3(N=C(NHAr)( 2))- 2}Br] (Ar = 2-MeC6H4; R = Me (3a/3b), Et (4a/4b)) in 80 and 87% yields, respectively. In one attempt, the minor regioisomer, 4b, was isolated from the mixture in 6% yield by fractional crystallization. Palladacycles 3a/3b and 4a/4b, upon stirring in CH2Cl2/MeCN (1/1, v/v) mixture at ambient condition for S days, afforded Pd{eta(3)-allyl,(KN)-N-1)-C-5(C(O)OR)(2)Ph3C-(C(O)OR)C6H3Me-3(N=C(NH Ar)(2))(-2)}Br] (Ar = 2-MeC6H4; R = Me (5a/5b), Et (6a/6b)) in 94 and 93% yields, respectively. Palladacycles 3a/3b and 4a/4b, upon reaction with AgOTf in CH2CH2/Me2C(O) (1/1, v/v) mixture at ambient temperature for 15 min, afforded Pd{kappa(3)(N,C,O)-O=C(OR)C5Ph3(C(O)OR)C(C(O)OR)C6H3Me-3(N=C(NHAr)(2 ))-2}(OTf)] (Ar = 2-MeC6H4; R = Me (7a/7b), Et (8a/8b)) in 79 and 77% yields, respectively. Palladacycles 7a/7b and 8a/ 8b, upon reflux in PhC1 separately for 6 h, or palladacycles 5a/5b and 6a/6b, upon treatment with AgOTf in CH2Cl2/Me2C(O) (7/3, v/v) mixture for 15 min, afforded Pd{(eta(2)-Ph)C5Ph2(C(O)OR)kappa(2)(C,N)-C(C(O)OR)C6H3Me-3(N=C(NHAr) (2))-2}(OTf)] (Ar = 2-MeC6H4; R = Me (9a/9h), Et (10a/10b)) in >= 87% yields. Palladacycles 9a/9b, upon stirring in MeCN in the presence of excess NaOAc followed by crystallization of the reaction mixture in the same solvent, afforded Pd{kappa(3)(N,C,C)-(C6H4)C5Ph2(C(O)OMe)(2)C(C(O)OMe)(2)C6H3Me-3(N=C( NHAr)(2))-2}(NCMe)] (Ar = 2-MeC6H4; 11a/11b) in 82% yield. The new palladacycles were characterized by analytical, IR, and NMR (H-1 and C-13) spectroscopic techniques, and the molecular structures of 2, 3a, 4a, 4b, 5a, 6a, 7a, 9a, 10a, and 11a-d(3) were determined by single crystal X-ray diffraction. The frameworks in the aforementioned palladacycles, except that present in 2, are unprecedented. Plausible pathways for the formation of new palladacycles and the influence of the guanidine unit in 1, substituents in alkynes, reaction conditions, and electrophilicity of the bromide and the triflate upon the frameworks of the insertion products have been discussed.

Unconjugated Bilirubin exerts Pro-Apoptotic Effect on Platelets via p38-MAPK activation

Thrombocytopenia is one of the most frequently observed secondary complications in many pathological conditions including liver diseases, where hyperbilirubinemia is very common. The present study sought to find the cause of thrombocytopenia in unconjugated hyperbilirubinemic conditions. Unconjugated bilirubin (UCB), an end-product of heme catabolism, is known to have pro-oxidative and cytotoxic effects at high serum concentration. We investigated the molecular mechanism underlying the pro-apoptotic effect of UCB on human platelets in vitro, and followed it up with studies in phenylhydrazine-induced hyperbilirubinemic rat model and hyperbilirubinemic human subjects. UCB is indeed found to significantly induce platelet apoptotic events including elevated endogenous reactive oxygen species generation, mitochondrial membrane depolarization, increased intracellular calcium levels, cardiolipin peroxidation and phosphatidylserine externalization (p < 0.001) as evident by FACS analysis. The immunoblots show the elevated levels of cytosolic cytochrome c and caspase activation in UCB-treated platelets. Further, UCB is found to induce mitochondrial ROS generation leading to p38 activation, followed by downstream activation of p53, ultimately resulting in altered expression of Bcl-2 and Bax proteins as evident from immunoblotting. All these parameters conclude that elevated unconjugated bilirubin causes thrombocytopenia by stimulating platelet apoptosis via mitochondrial ROS-induced p38 and p53 activation.

Evaluacion de Nosodes contra mastitis bovina en la Hacienda Santa Lastenia, municipio de Malacatoya, departamento de Granada

El presente trabajo se realizó en la Hacienda Santa Lastenia en municipio de Malacatoya, departamento de Granada, con el objetivo de evaluar un tratamiento homeopáticos (Nosodes de leche mastitica • CH7), contra mastitis bovina, la cual es normalmente atendida con antibióticos. El problema de los residuos ha motivado el interés en buscar diferentes alternativas de tratamientos, los cuales se han estado implementando para la prevención y control de la mastitis bovina y que estos no generan residuos en el producto final Para este fin, durante el trabajo de investigación se aplicó el Nosodes y el tratamiento convencional con Oxitetraciclina, se seleccionó cuarenta vacas con mastitis dividiéndolas en dos grupos de 20 cada uno. Los grupos de vacas tratadas con Nosodes resulto estadísticamente mejor en el control de mastitis con un estimado de 0.6672 con respecto a la oxitetraciclina que presento 0.3717 con un significancia (p< 0.01 y 0.16) respectivamente, presentando el Nosodes mayor efecto en los niveles altos de mastitis. Este trabajo fue desarrollado durante el mes de Octubre 2005, donde la investigación refleja que ninguno de los tratamientos controlo en un 1 00"/o la mastitis, sino que disminuyo su intensidad y que no todos los antibióticos que se compran por los productores para el tratamiento de mastitis realizan el efecto de eliminación de los agentes patógenos implicados.

Períodos críticos de protección contra Spodoptera frugiperda (J.E. smith) (Lepidoptera: noctuidae) para producción de chilote en maíz (Zea mays) de riego y primera

Este estudio fue realizado con el objetivo de determinar el periodo critico para el control de spodoptera fruiperda en la producción de chilotes tanto en época de riego como de primera. Para su realización se usó carboofurán al momento de la siembra (30 lbs/mz) y clorpirifos en dósis de 0.5 lts/mz, estableciéndose 8 períodos de protección para s. frugiperda que van desde 0 hasta 50 días después de la emergencia (DDE), tiempo en el cual la planta de maíz es suceptible al ataque de cogollero. Los resultados indican que las aplicaciones de cabofurán no ejercen control sobre corgollero en las 2 épocas de siembra. En primera, cuando las infestaciones son menores del 45% de corgollos infestados, las aplicaciones de clorpirifos resultan innecesarias. en época de Riego 1 aplicación de clorpirifos después de los 20 DDE es suficiente para obtener los rendimientos máximos. Esta aseveración es fundamentada en el análisis económico el que demuestra que los 5 diferentes tratamientos (0-50, 20-40, 20-50 y 10-40 días de protección) ejercen igual control y no existe diferencia estadística entre ellos en relación a la ganancia neta.

Efecto de la temperatura y métodos de aplicación en la patogenecidad del aislado 38/87 de Beauveria bassiana (Bals) vuill, contra Plutella xylostella (L) (Lepidoptera: plutellidae)

Con el objetivo de darle seguimiento al manejo de Plutella xylostella (L) considerada como plaga principal del cultivo del repollo (Brassica oleracea (L), Se evaluó el efecto que ejercen las temperaturas sobre el aislado 38/87 de Beauveria bassiana. (Bals) Vuill, realizado en el laboratorio de control microbial de la Universidad Nacional Agraria, (U.NA). Managua, Nicaragua. Las temperaturas evaluadas fueron 23, 25, 26, 28, 30 °C. con 75% de humedad relativa y una misma concentración 10º conidias/ml aplicando las conidias a las larvas por el método de inmersión y aspersión de las hojas de repollo. La prueba de Tukey estableció diferencias significativas entre tratamientos siendo la temperatura de 26ºc la más óptima en la mortalidad de larvas, para ambos métodos, con porcentajes de mortalidad por aspersión de 87.2% e inmersión con 81.7%, seguido de las temperaturas de 30ºC con 73.4% inmersión y 70.9% aspersión. Los valores más bajos del ensayo se obtuvieron con un porcentaje de 37.0% para la temperatura de 23ºC por el método de aspersión. El análisis de varianza realizado para determinar el nivel de significancia entre ambos métodos de aplicación, resultó con diferencias Significativas. El método de aplicación influye en los resultados de bioensayos. Se encontró que la inoculación de larvas por inmersión resulta más eficiente en la mortalidad de larvas. Los valores de TL50(tiempo letal medio) variaron en dependencia de la temperatura siendo el TL50 más bajo en la temperatura de 30ºC por el método de inmersión con O.72 días después de la inoculación , seguida de la temperatura de 26ºC con 2.52 días después de la inoculación. Por el método de aspersión se obtuvo mejores resultados en las temperaturas de 26 y 28ºC con 1.15 y 6.37 días. respectivamente.

Evaluación de sustratos para la reproducción de Pitahaya (Hylocereus undatus britt et rose) en condiciones de vivero

La Economía de Nicaragua es eminentemente agrícola, lo que ha motivado el establecimiento de areas de cultivos no tradicionales para la exportación, pues estos poseen buen precio en el mercado internacional. Entre la fruta que se perfila con muy buenas perspectivas es la Pitahaya (Hylocereus undatus Brítt et Rose), por su agradable sabor y la utilidad de su fiuto. Se quiere su explotación a gran escala pero que no se cuenta con tecnología suficientemente desarrollada para producir fiuta de buena calidad, por lo que se hace necesario realizar trabajos experimentales de campo para determinar las medidas agronómicas. Una de esas condiciones es el uso de un sustrato adecuado para enraizar vainas de Pitahaya en bolsas, generando una mayor producción de plantas en menor tiempo, mayor seguridad sanitaria y ahorro en los costos de producción. Con el fin de lograr estos objetivos se pretenden estudiar distintas combinaciones de desechos orgánicos de fácil obtención al productor. La investigación se realizó a nivel de vivero en el Centro Experimental Campos Azules, en el Municipio de Masatepe, departamento de Masaya. Se utilizó el diseño completamente azarizado (DCA), con once tratamientos, cada tratamiento estuvo representado por cuarenta bolsas, con un número total de 440 plantas. Los materiales orgánicos utilizados para el estudio fueron; gallinaza, cascarilla de arroz, pulpa de café, estiércol vacuno, aserrín. Se estudiaron las variables: inicio de brotación, porcentaje de plantas brotadas, número de brotes por planta, longitud de brotes, inicio de enraizamiento, longitud de raíz, peso seco de brotes, peso seco de raíz, presencia de plagas y enfermedades. Se realizó análisis de varianza y separación de medias mediante la prueba de Tukey, con un nivel de significancia del 5% para longitud de brotes y longitud de raíz; para el resto de tratamientos se realizo a través de las medias obtenidas. No existió estadísticamente diferencias significativas entre los tratamientos evaluados para la variable inicio de brotación. En el porcentaje de plantas brotadas se puede asumir que todos los tratamientos presentaron respuestas satisfactorias a excepción del sustrato solo aserrín. Para la variable número de brotes por planta, el sustrato compuesto con gallinasa + cascarilla de arroz + pulpa de café fue superior al resto de tratamientos en la séptima semana evaluada. En la variable longitud de brotes, el tratamiento que superó estadísticamente fue el gallinaza + cascarilla de arroz + estiércol. Para el inicio de enraizamiento muestreado en la tercera semana, se encontró que todos los tratamientos presentaban raíces a excepción del sustrato compusto con gallinaza + cascarilla de arroz. Con respecto a la longitud de raíz tomada en la quinta y treceava semana de evaluación se observó que el tratamiento solo suelo fue superior. Con respecto al peso seco de brotes tomado en la séptima semana de evaluación se observó que el sustrato gallinaza + cascarilla de arroz + pulpa de café presento diferencias significativas con respecto al resto de tratamientos; en la treceava semana el tratamiento gallinaza + cascarilla de arroz + estiércol fue el mejor. Para el peso seco de raíz el tratamiento solo suelo presentó el mayor peso en comparación con el resto. En cuanto a problemas fitosanitarios él único tratamiento que presentó alto número de plantas dañadas fue el sustrato gallinaza + cascarilla de arroz. Se puede concluir que la utilización de sustratos con combinaciones de Cascarilla de Arroz + estiércol y suelo + pulpa de café, presentan los mejores resultados.

Crecimiento y desarrollo juvenil de cinco filiales de pitahaya (Hylocereus undatus Britt et Rose) a partir de semilla botánica

La presente investigación se realizó de febrero a noviembre de 1998, en los campos del Programa Recursos Genéticos Nicaragüenses (REGEN) adscrito a la UNA, ubicado en Managua. Se realizó con el objetivo de obtener y brindar información sobre el crecimiento y desarrollo juvenil de cinco híbridos de pitahaya (Hylocereus undatus) a partir de semilla botánica. El diseño utilizado fue un bifactorial completamente al azar (DCA). Se evaluaron 17 descriptores o variables, de las cuales siete fueron cuantitativas y diez cualitativas. A las variables cuantitativas se les realizó análisis de varianza (ANDEVA) y separación de medias de acuerdo a la prueba de rangos múltiples de Duncan al 5 %; y para las variables cualitativas se utilizó el valor modal en cada una de ellas, como valor predominante en su comportamiento. En general, el comportamiento de las variables cualitativas fue bastante similar entre cada una de ellas, sin embargo hubieron diferencias en cuanto a la germinación y el número de aristas intravainas, influenciados principalmente por el sustrato número dos, dado su alto contenido de materia orgánica. Respecto a las variables cuantitativas, la variable altura de planta o crecimiento presentó un comportamiento bastante similar entre los híbridos, superado ligeramente sólo por el híbrido dos fundamentalmente en la etapa final que resultó ser el mejor de ellos. En cuanto al número de aristas fue evidente que estuvo determinado por efectos genéticos, por cuanto predominaron los de cuatro aristas; finalmente en cuanto al peso fresco y seco el híbrido cinco presentó los mejores valores seguido del híbrido tres.

Sapientia, 1997, Vol. LII, nº 201 (número completo)

Contenido: El aristotelismo y el tomismo frente al egoísmo psicológico / María L. Lukac de Stier – El deseo natural de ver a Dios en la Summa contra Gentiles / Guillermo Jorge Cambiasso – La creación como encuentro del ser y de la nada en la teología del maestro Eckhart de Hochheim O.P. (1260-1327) / Brian J. Farrelly – Malebranche y el libertinage érudit / Francisco Leocata – The problem of person and Jean Mouroux / John M. McDermott ; Glenn J. Comandini – Los fundamentos de la Bioética de H. Tristram Engelhardt / Jorge Martínez Barrera – Cuando las contradictorias son verdaderas / Marisa Villalba de Tablón – Examen del escepticismo moral y del relativismo moral / Camilo Tale – Saint Thomas et le mystère de la création : une réponse aux interrogations de l’homme d’aujourd’hui / Marie-Dominique Philippe – La finalidad de la naturaleza humana : alcance y actualidad de la cuestión / Beatriz Eugenia Reyes Oribe – La providencia y el gobierno del mundo / Alberto Caturelli – Saint Thomas et le problème de la possibilité d’un univers créé éternel / Alain-Marie de Lassus – La causalidad material de los elementos en la generación de los cuerpos mixtos / Mario Enrique Sacchi -- Bibliografía