Produção de um documentário colaborativo com seniores sobre os desafios enfrentados nas tecnologias da informação e comunicação

O trabalho apresentado pretende identificar as principais linhas orientadoras para a produção de um documentário sobre os principais desafios enfrentados pelos seniores quando utilizam as Tecnologias da Informação e Comunicação (TIC), particularmente para acederem a vários serviços. É inegável que as TIC têm um papel cada vez mais relevante nas sociedades contemporâneas, pelo que é essencial que os indivíduos que as compõem tenham as competências mínimas para a sua utilização. Os vários estudos levados a cabo sobre esta temática identificam os seniores como o grupo que em média menos utiliza as TIC e que mais dificuldades enfrenta quando as usa, o que pode resultar na infoexclusão dos indivíduos de uma faixa etária mais elevada. Tal situação é preocupante porque o envelhecimento populacional mundial parece inevitável, pelo que, embora possam ser pensadas e aplicadas medidas para o atenuar, será importante que cada país se prepare para esta realidade. Uma das formas de o fazer é identificar as principais dificuldades e/ou facilidades que os seniores sentem quando utilizam as Tecnologias da Informação e Comunicação e definir soluções que ajudem a contornar as dificuldades enfrentadas e potenciar as facilidades. Desta forma, incentiva-se um envelhecimento ativo de um grupo populacional que vai progressivamente aumentando a sua dimensão. O projeto MaQueIsto enquadra-se na investigação sobre o envelhecimento ativo e as TIC do grupo DigiMedia da Universidade de Aveiro. O principal propósito deste trabalho é produzir um documentário onde sejam identificados alguns dos principais desafios que o cidadão sénior enfrenta sistematicamente quando utiliza as TIC, por exemplo ao aceder aos múltiplos serviços indispensáveis ao seu quotidiano, tais como o multibanco, o correio eletrónico, os serviços das finanças, entre outros. O documentário produzido teve como bases a leitura e análise de estudos relacionados com a área, os dados recolhidos no trabalho de campo e os testemunhos dos seniores que aceitaram colaborar no projeto.

Investigation of the role of long non-coding RNAs in oncogene induced cellular senescence

Cellular senescence is a stable arrest of cell proliferation induced by several factors such as activated oncogenes, oxidative stress and shortening of telomeres. Senescence acts as a tumour suppression mechanism to halt the progression of cancer. However, senescence may also impact negatively upon tissue regeneration, thus contributing to the effects of ageing. The eukaryotic genome is controlled by various modes of transcriptional and translational regulation. Focus has therefore centred on the role of long non- coding RNAs (lncRNAs) in regulating the genome. Accordingly, understanding how lncRNAs function to regulate the senescent genome is integral to improving our knowledge and understanding of tumour suppression and ageing. Within this study, I set out to investigate the expression of lncRNAs’ expression within models of senescence. Through a custom expression array, I have shown that expression of multiple different lncRNAs is up-regulated and down regulated in IMR90 replicative senescent fibroblasts and oncogene-induced senescent melanocytes. LncRNA expression was determined to be specific to stable senescence-associated cell arrest and predominantly within the nucleus of senescent cells. In order to examine the function of lncRNA expression in senescence, I selected lncRNA transcript ENST0000430998 (lncRNA_98) to focus my investigations upon. LncRNA_98 was robustly upregulated within multiple models of senescence and efficiently depleted using anti-sense oligonucleotide technology. Characterisation and unbiased RNA-sequencing of lncRNA_98 deficient senescent cells highlighted a list of genes that are regulated by lncRNA_98 expression in senescent cells and may regulate aspects of the senescence program. Specifically, the formation of SAHF was impeded upon depletion of lncRNA_98 expression and levels of total pRB protein expression severely decreased. Validation and recapitulation of consequences of pRB depletion was confirmed through lncRNA_98 knock-out cells generated using CRISPR technology. Surprisingly, inhibition of ATM kinase functions permitted the restoration of pRB protein levels within lncRNA_98 deficient cells. I propose that lncRNA_98 antagonizes the ability of ATM kinase to downregulate pRB expression at a post-transcriptional level, thereby potentiating senescence. Furthermore, lncRNA expression was detected within fibroblasts of old individuals and visualised within senescent melanocytes in human benign nevi, a barrier to melanoma progression. Conversely, mining of 337 TCGA primary melanoma data sets highlighted that the lncRNA_98 gene and its expression was lost from a significant proportion of melanoma samples, consistent with lncRNA_98 having a tumour suppressor functions. The data presented in this study illustrates that lncRNA_98 expression has a regulatory role over pRB expression in senescence and may regulate aspects of tumourigenesis and ageing.

Impacto da acidificação dos oceanos no desenvolvimento embrionário e larvar de peixes marinhos

Devido à acumulação atmosférica de CO2 antropogénico, a pressão parcial de dióxido de carbono (ρCO2) na água do mar aumenta e o pH diminui. Atualmente, este processo conhecido como a acidificação dos oceanos, está a ocorrer a um ritmo mais rápido do que em qualquer outro momento dos últimos 300 milhões de anos, o que leva a um desafio ecológico para os organismos marinhos a nível mundial. Embora este processo afete significativamente mais os organismos marinhos que sintetizam exosqueletos de calcário ou conchas, ainda não está claro como este processo irá afetar organismos calcificados internamente, tais como peixes marinhos. Embora se pense que os peixes adultos são relativamente mais tolerantes a níveis elevados de CO2 ambiental, sabe-se muito pouco sobre a sensibilidade dos estágios iniciais de vida, que são geralmente mais vulneráveis às mudanças ambientais do que os juvenis e os adultos. Determinar que espécies marinhas são sensíveis ou tolerantes aos elevados níveis de CO2 e redução do pH é fundamental para prever os impactos da acidificação dos oceanos nas cadeias alimentares marinhas e nos ecossistemas nos próximos 300 anos. O presente estudo aborda o efeito da acidificação dos oceanos sobre os estágios iniciais de desenvolvimento de três espécies comercialmente importantes, Solea senegalensis, Diplodus sargus, Argyrosomus regius. Estas espécies foram sujeitas a diferentes níveis de pH e ρCO2 (pH 8.0, ~400 μatm; pH 7.8, ~1000 μatm; pH 7.6, ~2000 μatm) desde a fase do ovo até à abertura de boca. Os resultados deste estudo sugerem que a exposição das fases iniciais de vida de Solea senegalensis e Diplodus sargus a elevadas concentrações de CO2 podem levar a taxas de eclosão e crescimento reduzidas e taxas de sobrevivência e peso seco elevados. Quando comparado com os níveis atuais de ρCO2 (400 ppm), a exposição de embriões Argyrosomus regius a 1000 μatm aumentou a sua sobrevivência, crescimento e comprimento total ao fim de 3 dias após eclosão. Não se detetaram diferenças significativas entre tratamentos no que respeita à organogénese e às dimensões e morfologia do ovo. De uma forma geral, este estudo parece indicar que Diplodus sargus e Solea senegalensis são substancialmente mais suscetíveis aos efeitos fisiológicos da acidificação dos oceanos do que Argyrososmus regius que está presumivelmente melhor adaptada às variações das condições ambientais, devido ao seu rápido desenvolvimento e ampla distribuição geográfica.

Effect of Inorganic and Organic Carbon Enrichments (DIC and DOC) on the Photosynthesis and Calcification Rates of Two Calcifying Green Algae from a Caribbean Reef Lagoon

Coral reefs worldwide are affected by increasing dissolved inorganic carbon (DIC) and organic carbon (DOC) concentrations due to ocean acidification (OA) and coastal eutrophication. These two stressors can occur simultaneously, particularly in near-shore reef environments with increasing anthropogenic pressure. However, experimental studies on how elevated DIC and DOC interact are scarce and fundamental to understanding potential synergistic effects and foreseeing future changes in coral reef function. Using an open mesocosm experiment, the present study investigated the impact of elevated DIC (pHNBS: 8.2 and 7.8; pCO2: 377 and 1076 μatm) and DOC (added as 833 μmol L-1 of glucose) on calcification and photosynthesis rates of two common calcifying green algae, Halimeda incrassata and Udotea flabellum, in a shallow reef environment. Our results revealed that under elevated DIC, algal photosynthesis decreased similarly for both species, but calcification was more affected in H. incrassata, which also showed carbonate dissolution rates. Elevated DOC reduced photosynthesis and calcification rates in H. incrassata, while in U. flabellum photosynthesis was unaffected and thalus calcification was severely impaired. The combined treatment showed an antagonistic effect of elevated DIC and DOC on the photosynthesis and calcification rates of H. incrassata, and an additive effect in U. flabellum. We conclude that the dominant sand dweller H. incrassata is more negatively affected by both DIC and DOC enrichments, but that their impact could be mitigated when they occur simultaneously. In contrast, U. flabellum can be less affected in coastal eutrophic waters by elevated DIC, but its contribution to reef carbonate sediment production could be further reduced. Accordingly, while the capacity of environmental eutrophication to exacerbate the impact of OA on algal-derived carbonate sand production seems to be species-specific, significant reductions can be expected under future OA scenarios, with important consequences for beach erosion and coastal sediment dynamics.

Implication des protéines MCM dans la réponse cellulaire aux dommages à l’ADN

Les protéines MCM (minichromosome maintenance) forment un complexe hétérohexamérique composé des protéines MCM2 à MCM7 qui possède une activité hélicase nécessaire lors de la réplication de l’ADN. Ce complexe est la cible des protéines ATM et ATR, kinases responsables de l’initiation de la réponse cellulaires aux dommages à l’ADN, pour permettre l’arrêt de la réplication lors de la détection de cassure double brin. De plus, les MCM permettent le remodelage de la chromatine par leur activité hélicase mais aussi par leur association avec une chaperone d’histone la protéine ASF1. Toutefois, la majorité des complexes MCM ne co-localisent pas avec les origines de réplication. De plus, la quantité des protéines MCM dans la cellule est nettement supérieure à la quantité requise lors de la réplication. Ces deux faits laissent présager que ce complexe hélicase pourrait jouer un second rôle. Des études effectuées au laboratoire ont démontré une augmentation de la fixation à la chromatine des protéines MCM suite au traitement avec l’étoposide, un inhibiteur de la topoisomérase II qui cause des cassures double brin. L’étude des interactions de la protéine MCM2 par spectrométrie de masse ainsi que par immunobuvardage ont démontré une augmentation de l’interaction entre la protéine MCM2 et ASF1 suite aux dommages. Ceci suggère que les protéines MCM pourraient être impliquées dans les mécanismes de réparation de l’ADN. La nature de l’interaction entre la protéine MCM2 et ASF1 a été déterminée in vitro par des immunobuvardages de type Far western et des Dot blot avec des mutants de la protéine MCM2. Des cellules U2OS-Flp-in ont été utilisées pour générer des lignées stables exprimants les protéines MCM2 à MCM7 avec une étiquette GFP ou fusionnées avec une biotine-ligase (BirA). Les cellules ont été cultivées dans du milieu SILAC et des immunoprécipitations ont été effectuées sur des cellules contrôles (R0K0), des cellules qui expriment MCM-GFP ou BirA (R6K4) non-traitées et des cellules qui expriment MCM-GFP ou BirA traitées à l’étoposide (R10K8). Les immunoprécipitations ont été analysés au spectromètre de masse pour déterminer la modulation des interactions avant et après dommages à l’ADN. Les études d’interactions in vitro ont permis d’identifier que l’interaction entre la protéine MCM2 et ASF1 se situe entre les acides aminés 81-162 sur la protéine MCM2. L’approche de spectrométrie de masse a permis d’identifier plusieurs protéines liant le complexe MCM qui sont impliquées non seulement dans la réplication de l’ADN mais aussi dans le remodelage de la chromatine. De plus, certains de ces nouveaux partenaires augmentent leur interaction avec le complexe suite à l’induction de dommages. Ces résultats suggèrent que les protéines MCM jouent un rôle dans la réorganisation de la chromatine dans les mécanismes de réparation de l’ADN.

On Growth Rate of Wind Waves: Impact of Short-Scale Breaking Modulations

The wave generation model based on the rapid distortion concept significantly underestimates empirical values of the wave growth rate. As suggested before, inclusion of the aerodynamic roughness modulations effect on the amplitude of the slope-correlated surface pressure could potentially reconcile this model approach with observations. This study explores the role of short-scale breaking modulations to amplify the growth rate of modulating longer waves. As developed, airflow separations from modulated breaking waves result in strong modulations of the turbulent stress in the inner region of the modulating waves. In turn, this leads to amplifying the slope-correlated surface pressure anomalies. As evaluated, such a mechanism can be very efficient for enhancing the wind-wave growth rate by a factor of 2-3.

Trajectory prediction uncertainty modelling for Air Traffic Management

The anticipated growth of air traffic worldwide requires enhanced Air Traffic Management (ATM) technologies and procedures to increase the system capacity, efficiency, and resilience, while reducing environmental impact and maintaining operational safety. To deal with these challenges, new automation and information exchange capabilities are being developed through different modernisation initiatives toward a new global operational concept called Trajectory Based Operations (TBO), in which aircraft trajectory information becomes the cornerstone of advanced ATM applications. This transformation will lead to higher levels of system complexity requiring enhanced Decision Support Tools (DST) to aid humans in the decision making processes. These will rely on accurate predicted aircraft trajectories, provided by advanced Trajectory Predictors (TP). The trajectory prediction process is subject to stochastic effects that introduce uncertainty into the predictions. Regardless of the assumptions that define the aircraft motion model underpinning the TP, deviations between predicted and actual trajectories are unavoidable. This thesis proposes an innovative method to characterise the uncertainty associated with a trajectory prediction based on the mathematical theory of Polynomial Chaos Expansions (PCE). Assuming univariate PCEs of the trajectory prediction inputs, the method describes how to generate multivariate PCEs of the prediction outputs that quantify their associated uncertainty. Arbitrary PCE (aPCE) was chosen because it allows a higher degree of flexibility to model input uncertainty. The obtained polynomial description can be used in subsequent prediction sensitivity analyses thanks to the relationship between polynomial coefficients and Sobol indices. The Sobol indices enable ranking the input parameters according to their influence on trajectory prediction uncertainty. The applicability of the aPCE-based uncertainty quantification detailed herein is analysed through a study case. This study case represents a typical aircraft trajectory prediction problem in ATM, in which uncertain parameters regarding aircraft performance, aircraft intent description, weather forecast, and initial conditions are considered simultaneously. Numerical results are compared to those obtained from a Monte Carlo simulation, demonstrating the advantages of the proposed method. The thesis includes two examples of DSTs (Demand and Capacity Balancing tool, and Arrival Manager) to illustrate the potential benefits of exploiting the proposed uncertainty quantification method.

The EMSO-ERIC Pan-European Consortium: Data Benefits and Lessons Learned as the Legal Entity Forms

The European Multidisciplinary Seafloor and water-column Observatory (EMSO) European Research Infrastructure Consortium (ERIC) provides power, communications, sensors, and data infrastructure for continuous, high-resolution, (near-)real-time, interactive ocean observations across a multidisciplinary and interdisciplinary range of research areas including biology, geology, chemistry, physics, engineering, and computer science, from polar to subtropical environments, through the water column down to the abyss. Eleven deep-sea and four shallow nodes span from the Arctic through the Atlantic and Mediterranean, to the Black Sea. Coordination among the consortium nodes is being strengthened through the EMSOdev project (H2020), which will produce the EMSO Generic Instrument Module (EGIM). Early installations are now being upgraded, for example, at the Ligurian, Ionian, Azores, and Porcupine Abyssal Plain (PAP) nodes. Significant findings have been flowing in over the years; for example, high-frequency surface and subsurface water-column measurements of the PAP node show an increase in seawater pCO2 (from 339 μatm in 2003 to 353 μatm in 2011) with little variability in the mean air-sea CO2 flux. In the Central Eastern Atlantic, the Oceanic Platform of the Canary Islands open-ocean canary node (aka ESTOC station) has a long-standing time series on water column physical, biogeochemical, and acidification processes that have contributed to the assessment efforts of the Intergovernmental Panel on Climate Change (IPCC). EMSO not only brings together countries and disciplines but also allows the pooling of resources and coordination to assemble harmonized data into a comprehensive regional ocean picture, which will then be made available to researchers and stakeholders worldwide on an open and interoperable access basis.

Fatores de eleição do destino turístico para a região norte de Portugal alto Trás-os-Montes: uma análise multivariada

O objetivo deste trabalho consiste em identificar os fatores de eleição do destino turístico para a região Norte de Portugal Alto Trás-os-Montes (ATM). Especificamente, visa-se: i) a identificação dos principais fatores motivacionais de eleição do destino turístico ATM; ii) a identificação dos principais fatores de atração de eleição do destino turístico ATM. Os fatores de eleição em análise foram selecionados com base na revisão da literatura turística e no modelo de Crompton (1979). Para tal, aplicou-se um inquérito por questionário aos visitantes nacionais e estrangeiros que se deslocaram à região ATM no período de agosto de 2013 a agosto de 2014, e os dados foram tratados tendo por base uma Análise Fatorial Exploratória. Dos resultados obtidos extraíram-se quatro Fatores Motivacionais que explicam 60.87% da variância total, a saber: 1) competências sócio e interculturais, 2) relacionamento e vivências interpessoais, 3) conveniência e lazer e 4) escape e autorrenovação. Por outro lado, identificaram-se quatro Fatores de Atração que explicam 62% da estrutura dos dados: 1) acolhimento e qualidade dos serviços, 2) animação e atrações turísticas, 3) facilitadores e promotores da viagem e 4) encantos rurais. Estes resultados podem ser utilizados para a aplicação de outras técnicas estatísticas e como um elemento informativo para os stakeholders da atividade turística.

Efeito de diferentes concentrações do óleo de nim no crescimento micelial de fungos entomopatogênicos e Trichoderma harzianum.

A associação de extratos de origem vegetal com fungos entomopatogênicos pode aumentar a eficiência do controle biológico de pragas e doenças de plantas e ainda reduzir custos e impactos ambientais. No presente trabalho foi avaliado o efeito do óleo de nim, incorporado ao meio BDA (Batata-dextrose-ágar) nas concentrações de 0, 1, 10, 100, 1.000, 10.000 e 100.000 μ/L, sobre o crescimento micelial de Metarhizium anisopliae, Beauveria bassiana, Trichoderma harzianum e Lecanicillium lecanii. O óleo de nim foi adicionado ao meio antes e após a esterilização em autoclave por 20 min. e 1 atm. Na parte central das placas de Petri contendo os meios foi transferido um disco de micélio dos agentes de biocontrole e mantidas em sala de incubação a 27 ± 2°C. O crescimento da colônia foi avaliado diariamente por seis dias, considerando dois sentidos do diâmetro. Cada placa correspondeu a uma repetição sendo cinco placas por tratamento. O óleo de nim adicionado antes e após autoclavagem em todas as concentrações testadas, estimularam o crescimento micelial de todos os agentes de biocontrole. Esta associação é de grande valia para o controle biológico, pode aumentar a eficiência destes fungos e reduzir impactos ambientais.

Imagiologia da articulação temporomandibular

Dissertação para obtenção do grau de Mestre no Instituto Superior de Ciências da Saúde Egas Moniz

Efeito do fungo Metarhizium anisopliae (Metsch.) Sorok. (Deuteromycetes) para Astyanax scabripinnis (Jenyns, 1842) (Pisces: Characidae).

Avaliou-se o efeito de Metarhizium anisopliae (Metsch.) para Astyanax scabripinnis (Jenyns, 1842)(Pisces, Characidae), em condições de laboratório. Suspensões aquosas de conídios recémproduzidos, viáveis (viabilidade mínima 90%) e inviabilizados por meio de autoclavagem (121º C, 20 minutos, a 1 atm), na concentração de 6,5 x 1010 conídios/aquário (equivalente a 5 x 1015 conídios/ ha, que representa 1.000 vezes a concentração recomendada para o controle de cigarrinhas de pastagens, principal praga-alvo deste entomopatógeno no Brasil), foram aplicadas em aquários contendo A. scabripinnis. Foram analisadas amostras de água e dos peixes, dos quais foram dissecados as brânquias e o estômago, em diferentes intervalos de tempo, a fim de se avaliar a presença dos conídios. Observaram-se diariamente o comportamento e a mortalidade de peixes em ambos os tratamentos. Avaliou-se nos peixes sobreviventes a morfologia das células das brânquias e do fígado. Verificou-se que nas brânquias não houve alteração no número de conídios ao longo de 16 dias de contato, sendo que no estômago houve um ligeiro acréscimo inicial seguido de redução constante. A viabilidade dos conídios em todos os locais avaliados decresceu após 24 horas da aplicação. Constatou-se que não houve morte ou quaisquer alterações comportamentais após 30 dias de contato, indicando a ausência de efeitos adversos associados à capacidade do fungo em provocar infecção ou exercer efeitos tóxicos em ambos os organismos-teste.

European lobster (Homarus gammarus) larvae under an acidification scenario: addressing biochemical, development and behaviour responses

A acidificação dos oceanos constitui uma problemática global e a realidade de que está, efetivamente, a acontecer não é uma consideração subjetiva. A Acidificação dos oceanos provocada por emissões de dióxido de carbono de origem antropogénica tem vindo a reduzir o pH das águas superficiais do Oceano e projeções preveem a continuidade deste processo. Embora muita investigação tenha sido desenvolvida no âmbito dos invertebrados que calcificam, tais como moluscos e crustáceos, poucos consideraram o estudo de efeitos ao nível sub-celular para avaliar stress oxidativo ou respostas funcionais do metabolismo energético em tais condições, interligando vários níveis de organização biológica. O objetivo do presente estudo foi o de avaliar os efeitos da exposição a diferentes níveis-alvo de pCO2 (controlo: 370 μatm; aumentado: 710 μatm) e de pH (controlo: 8.15; reduzido: 7.85) em parâmetros de crescimento bem como avaliar respostas comportamentais e bioquímicas relacionadas com stress oxidativo e metabolismo energético durante o desenvolvimento larvar de um crustáceo decápode. Este cenário de acidificação está de acordo com os RCPs previstos pelo Painel Intergovernamental para as Alterações Climáticas (IPCC, 2014) para o ano 2100. Para o presente estudo, foi utilizado o crustáceo Homarus gammarus (L.) – sendo uma espécie com elevado valor comercial, que tem vindo a sofrer elevada pressão de pesca em águas Europeias. Fêmeas adultas provenientes da costa Atlântica Oeste Portuguesa foram obtidas de um retalhista local. Após a eclosão em ambiente laboratorial controlado, larvas provenientes da mesma progenitora foram expostas às condições acima descritas desde o momento da eclosão até à chegada ao Estádio III. A sobrevivência individual e ocorrência de ecdise foram avaliados individualmente de 12h em 12h. Réplicas de cada tratamento foram recolhidas em momentos específicos durante o Estádio I (primeiro estádio larvar) e Estádio III (último estádio larvar) para análise morfométrica e de crescimento (peso fresco e comprimento carapaça) e respostas bioquímicas. Os biomarcadores analisados incluíram parâmetros relacionados com stress oxidativo e danos (atividade da enzima superóxido dismutase (SOD), peroxidação lipídica (LPO) e danos no DNA) e metabolismo energético (atividade da cadeia transportadora de eletrões (ETS) e da enzima lactato desidrogenase (LDH) e quantificação de Hidratos de Carbono). Os resultados obtidos sugerem que a sobrevivência diminui e que o período inter-muda é afetado durante a exposição a cenários de acidificação. No que respeita aos parâmetros de crescimento/morfométricos, larvas do cenário de acidificação apresentam uma tendência para crescimento diminuído, menor peso e comprimento de carapaça. As análises bioquímicas realizadas indicam a ocorrência de stress oxidativo sob condições de acidificação. Respostas ao nível do metabolismo energético não variaram significativamente entre tratamentos. Os resultados apontam também para que fases larvares possam possuir um sistema antioxidante ainda em desenvolvimento, tornando-as mais suscetíveis ao stress oxidativo. As fases larvares são uma fase vulnerável e crucial no ciclo de vida das espécies, influenciando o recrutamento e a renovação de stocks. Este estudo contribui para um melhor entendimento sobre a vulnerabilidade desta espécie num cenário de alterações climáticas – Acidificação dos oceanos – ao endereçar os mecanismos envolvidos nas respostas deste crustáceo a este agente causador de stress.

The Herpesvirus Nuclear Egress Complex Component, UL31, is Recruited to Sites of DNA Damage Through Poly(ADP-RIBOSE) Binding

Thesis (Master, Biomedical & Molecular Sciences) -- Queen's University, 2016-08-23 15:03:30.807

Implications of obesity in exceptional longevity

Fondo de Investigaciones Sanitarias (PI15/00558)