Label-free DNA detection of hepatitis C virus based on modified conducting polypyrrole films at microelectrodes and atomic force microscopy tip-integrated electrodes

We present a new strategy for the label-free electrochemical detection of DNA hybridization for detecting hepatitis C virus based on electrostatic modulation of the ion-exchange kinetics of a polypyrrole film deposited at microelectrodes. Synthetic single-stranded 18-mer HCV genotype-1-specific probe DNA has been immobilized at a 2,5-bis(2-thienyl)-N-(3-phosphoryl-n-alkyl)pyrrole film established by electropolymerization at the previously formed polypyrrole layer. HCV DNA sequences (244-mer) resulting from the reverse transcriptase-linked polymerase chain reaction amplification of the original viral RNA were monitored by affecting the ion-exchange properties of the polypyrrole film. The performance of this miniaturized DNA sensor system was studied in respect to selectivity, sensitivity, and reproducibility. The limit of detection was determined at 1.82 x 10(-21) mol L-1. Control experiments were performed with cDNA from HCV genotypes 2a/c, 2b, and 3 and did not show any unspecific binding. Additionally, the influence of the spacer length of 2,5-bis(2-thienyl)-N-(3-phosphoryl-n-alkyl)pyrrole on the behavior of the DNA sensor was investigated. This biosensing scheme was finally extended to the electrochemical detection of DNA at submicrometer-sized DNA biosensors integrated into bifunctional atomic force scanning electrochemical microscopy probes. The 18-mer DNA target was again monitored by following the ion-exchange properties of the polypyrrole film. Control experiments were performed with 12-base pair mismatched sequences.

Study of zinc hexacyanoferrate-modified platinum electrodes using electrochemical quartz crystal microbalance

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Determination of Hg in water by CVAAS using 2-aminothiazole modified silica

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Determination of Copper, Iron, Nickel and Zinc in fuel kerosene by FAAS after adsorption and pre-concentration on 2-aminothiazole-modified silica gel

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Effect of lactic acid and UV irradiation on the cassava and corn starches

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Organic acid profile of commercial sour cassava starch

A presença de ácidos orgânicos no polvilho azedo, além de contribuir com aspectos como sabor e aroma, tem, conforme a literatura indica, correlação com a propriedade de expansão, que é um fator determinante no uso alimentício. Amostras de polvilho azedo foram coletadas nas Regiões Sul e Sudeste diretamente nas empresas ou no comércio. Foram preparadas para análise em cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE), sendo que o cromatógrafo estava equipado com coluna Biorad Aminex HPX-87H para análise de ácidos orgânicos e detector refratométrico. As condições de análise envolveram o emprego da fase móvel ácido sulfúrico 0,005M, fluxo de 0,6 ml/min e temperatura da coluna de 60oC. Os ácidos quantificados foram lático (0,036 a 0,813 g/100g), acético (0 a 0,068 g/100g), propiônico (0 a 0,013 g/100g) e butírico (0 a 0,057 g/100g), presentes na fermentação natural. Os resultados revelaram grande variação entre as amostras, com diferenças mesmo dentro das Regiões. Algumas amostras apresentaram quantidades elevadas de ácidos, especialmente do ácido lático, mas nestas amostras os ácidos propiônico e butírico não foram detectados. A ausência do ácido butírico não era esperada, uma vez que esse ácido está diretamente relacionado com o aroma característico do polvilho azedo. O fato pode sugerir que a obtenção de algumas das amostras estudadas pode ter ocorrido sem o processo fermentativo natural.

Effect of addition of different hydrocolloids on pasting, thermal, and rheological properties of cassava starch

Amidos e gomas são hidrocoloides frequentemente usados em sistemas alimentícios com a finalidade de fornecer textura, umidade e mobilidade de água. A interação amido-goma em sistemas alimentícios pode alterar o inchamento do grânulo de amido e as suas propriedades de gelatinização e reológicas. Neste trabalho, o efeito da adição de goma xantana (GX), carboximetilcelulose sódica (CMC) e carragena (CAR) nas concentrações de 0,15, 0,25, 0,35 e 0,45% (p/v) sobre as propriedades de pasta, térmicas e reológicas do amido de mandioca foi estudado. O Poder de inchamento (PI) e a Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV) dos géis de amido também foram avaliados. Os resultados obtidos mostraram que a GX apresentou forte interação com o amido, penetrando entre os grânulos e provocando aumento das viscosidades de pasta, PI, G' e G, e redução da retrogradação do amido; CMCS aumentou as viscosidades de pasta, PI, G' e G das misturas, principalmente em função da sua maior capacidade de reter água, e não por causa da interação com o amido; CAR não modificou qualquer das propriedades do amido, porque não houve nenhuma interação entre essa goma e o amido de mandioca nas concentrações usadas.

Modified E-test by the addition of EDTA-Tris and dimethyl sulfoxide on the potentiation of the effects of some antimicrobials in Pseudomonas aeruginosa strains isolated from bovine mastitis

A concentração inibitória mínima-MIC em 30 estirpes de Pseudomonas aeruginosa isoladas de mastite bovina foi avaliada utilizando o E-test padrão e o método modificado, pela adição de Tris-EDTA e DMSO. Os métodos modificados apresentaram redução significativa da MIC das estirpes utilizando a gentamicina, a ciprofloxacina e a norfloxacina.

Modified extracapsular extraction versus endocapsular phacoemulsification: intraoperative and immediate postoperative events

Compararam-se os eventos clínicos e as variações da pressão intra-ocular (PIO) das técnicas facoemulsificação endocapsular e extração extracapsular com modificações, no intra e no pós-operatório imediato. A facoemulsificação resultou em menor edema corneano, menor desconforto ocular e menos intercorrências no pós-operatório em relação à extração extracapsular modificada. É imperativo que se faça o monitoramento da PIO no pós-operatório, uma vez que ela ocorreu na facoemulsificação, e o uso de hipotensores oculares, quando os valores da PIO ultrapassarem os limites aceitáveis.

Planting time, developmental stages and characteristics of roots and starch of Pachyrhizus ahipa

De forma geral, as características do amido variam não somente com a planta de origem, mas também com o estádio de desenvolvimento desta. Neste trabalho objetivou-se avaliar a influência da época de plantio e estádio de desenvolvimento da planta de ahipa sobre as características físico-químicas das raízes, tamanho de grânulos do amido e suas propriedades viscográficas. Constatou-se influência do estádio de desenvolvimento da planta nas características físico-químicas das raízes e do amido, independentemente da época de plantio. A melhor época para o plantio de Pachyrhizus ahipa é outubro e a colheita deve ser feita no máximo com 9 meses, adotando-se o procedimento de retirada das flores a partir dos 3 meses.

Properties of chemically modified gelatin films

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

FACTORS THAT AFFECT THE ENZYMATIC DEGRADATION OF NATURAL STARCH GRANULES - EFFECT OF THE SIZE OF THE GRANULES

In this study the relationship between the enzymatic susceptibility and the size of the com and cassava starch granules was studied. The starch granules were separated by size and classified according to their average diameter in: a) larger than 16 mum; b) between 15 and 10 mum and c) smaller than 10 mum. The starch granules of various sizes were hydrolyzed by bacterial alpha-amylase and fungal amyloglucosidase. The results showed a relationship between the enzymatic susceptibility and the size of the starch granules; smaller size of the starch granules resulted in a higher percentage of hydrolysis. A basic difference in the mode of action of enzymes on small and large granules was observed. Enzymatic attack on the large granules was characterized by considerable surface corrosion, mainly at the radial axis. For small granules, the enzymatic action occurred on the surface of the granules and was characterized by an erosion with solubilization of the granules. Chemical and physical analysis of the starches suggested that hydrolysis should occur mainly at the amorphous areas of the granules.

Investigations on the stability of plasma modified silicone surfaces

In this work it was investigated the effect of the exposure to different plasmas on the wettability of silicone samples. We have observed that oxygen. argon, and hydrogen glow discharges are quite effective in reducing the water contact angle of such polymer. However, indifferently to efficiency of the treatment, practically all the modified surfaces recovered great part of their original hydrophobicity. We have investigated this hydrophobic recovery using surface energy measurements and theoretical simulations based on the exponential decay of the population of polar groups on the surface. According to our results such recovery can be attributed to the decrease of polar species at the interface water-polymer surface.

Non-Hermitian multichannel theory of ultracold collisions modified by intense light fields tuned to the red of the trapping transition

We develop a systematic scheme to treat binary collisions between ultracold atoms in the presence of a strong laser field, tuned to the red of the trapping transition. We assume that the Rabi frequency is much less than the spacing between adjacent bound-state resonances, In this approach we neglect fine and hyperfine structures, but consider fully the three-dimensional aspects of the scattering process, up to the partial d wave. We apply the scheme to calculate the S matrix elements up to the second order in the ratio between the Rabi frequency and the laser detuning, We also obtain, fur this simplified multichannel model, the asymmetric line shapes of photoassociation spectroscopy, and the modification of the scattering length due to the light field at low, but finite, entrance kinetic energy. We emphasize that the present calculations can be generalized to treat more realistic models, and suggest how to carry out a thorough numerical comparison to this semianalytic theory. [S1050-2947(98)04902-6].