Use of self-organizing maps and molecular descriptors to predict the cytotoxic activity of sesquiterpene lactones

Some sesquiterpene lactones (SLs) are the active compounds of a great number of traditionally medicinal plants from the Asteraceae family and possess considerable cytotoxic activity. Several studies in vitro have shown the inhibitory activity against cells derived from human carcinoma of the nasopharynx (KB). Chemical studies showed that the cytotoxic activity is due to the reaction of alpha,beta-unsaturated carbonyl structures of the SLs with thiols, such as cysteine. These studies support the view that SLs inhibit tumour growth by selective alkylation of growth-regulatory biological macromolecules, such as key enzymes, which control cell division, thereby inhibiting a variety of cellular functions, which directs the cells into apoptosis. In this study we investigated a set of 55 different sesquiterpene lactones, represented by 5 skeletons (22 germacranolides, 6 elemanolides, 2 eudesmanolides, 16 guaianolides and nor-derivatives and 9 pseudoguaianolides), in respect to their cytotoxic properties. The experimental results and 3D molecular descriptors were submitted to Kohonen self-organizing map (SOM) to classify (training set) and predict (test set) the cytotoxic activity. From the obtained results, it was concluded that only the geometrical descriptors showed satisfactory values. The Kohonen map obtained after training set using 25 geometrical descriptors shows a very significant match, mainly among the inactive compounds (similar to 84%). Analyzing both groups, the percentage seen is high (83%). The test set shows the highest match, where 89% of the substances had their cytotoxic activity correctly predicted. From these results, important properties for the inhibition potency are discussed for the whole dataset and for subsets of the different structural skeletons. (C) 2008 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.

Chemotaxonomic relationships in Celastraceae inferred from principal component analysis (PCA) and partial least squares (PLS)

This paper describes a chemotaxonomic analysis of a database of triterpenoid compounds from the Celastraceae family using principal component analysis (PCA). The numbers of occurrences of thirty types of triterpene skeleton in different tribes of the family were used as variables. The study shows that PCA applied to chemical data can contribute to an intrafamilial classification of Celastraceae, once some questionable taxa affinity was observed, from chemotaxonomic inferences about genera and they are in agreement with the phylogeny previously proposed. The inclusion of Hippocrateaceae within Celastraceae is supported by the triterpene chemistry.

Volsurf Descriptors to Analyse Anti-HCV and Cytotoxic Activities of Sesquiterpene Lactones from Asteraceae Family

Various significant anti-HCV and cytotoxic sesquiterpene lactones (SLs) have been characterized. In this work, the chemometric tool Principal Component Analysis (PCA) was applied to two sets of SLs and the variance of the biological activity was explored. The first principal component accounts for as much of the variability in the data as possible, and each succeeding component accounts for as much of the remaining variability as possible. The calculations were performed using VolSurf program. For anti-HCV activity, PC1 (First Principal Component) explained 30.3% and PC2 (Second Principal Component) explained 26.5% of matrix total variance, while for cytotoxic activity, PC1 explained 30.9% and PC2 explained 15.6% of the total variance. The formalism employed generated good exploratory and predictive results and we identified some structural features, for both sets, important to the suitable biological activity and pharmacokinetic profile.

Endocytosis of prion protein is required for ERK1/2 signaling induced by stress-inducible protein 1

The secreted cochaperone STI1 triggers activation of protein kinase A (PKA) and ERK1/2 signaling by interacting with the cellular prion (PrPC) at the cell surface, resulting in neuroprotection and increased neuritogenesis. Here, we investigated whether STI1 triggers PrPC trafficking and tested whether this process controls PrPC-dependent signaling. We found that STI1, but not a STI1 mutant unable to bind PrPC, induced PrPC endocytosis. STI1-induced signaling did not occur in cells devoid of endogenous PrPC; however, heterologous expression of PrPC reconstituted both PKA and ERK1/2 activation. In contrast, a PrPC mutant lacking endocytic activity was unable to promote ERK1/2 activation induced by STI1, whereas it reconstituted PKA activity in the same condition, suggesting a key role of endocytosis in the former process. The activation of ERK1/2 by STI1 was transient and appeared to depend on the interaction of the two proteins at the cell surface or shortly after internalization. Moreover, inhibition of dynamin activity by expression of a dominant-negative mutant caused the accumulation and colocalization of these proteins at the plasma membrane, suggesting that both proteins use a dynamin-dependent internalization pathway. These results show that PrPC endocytosis is a necessary step to modulate STI1-dependent ERK1/2 signaling involved in neuritogenesis.

Total syntheses of trikentrins and of herbindoles

CNPq

A Diastereoselective Total Synthesis of trans-Trikentrin A: A Ring Contraction Approach

A new route to obtain the polyalkylated indole (+/-)-trans-trikentrin A was developed. The synthesis of this natural alkaloid features a thallium(III)mediated ring contraction reaction to obtain the trans-1,3-disubstituted five-membered ring in a diastereoselective manner. Thallium(III) is chemoselective in this rearrangement, reacting with the olefin without oxidation of the indole moiety. Other key transformations are the Bartoli`s reaction to construct the heterocyclic ring and a Heck coupling to add the carbons atom that will originate the nonaromatic cycle.

Utveckling av logik för handelsagent

Detta examensarbete behandlar agenter och logiken som används för att styra dessa. ESR (Experimenterande Svenska Radioamatörer) är en geografiskt spridd organisation och fysiska möten mellan medlemmarna försvåras på grund av detta. Swap Meet, som är en del av Radioträff Syd, arrangeras årligen på olika platser runt om i Sverige. Medlemmar från andra platser i landet finner det då svårt att ta sig till dessa träffar. Dessutom vill många medlemmar köpa och sälja komponenter under hela året vilket inte är möjligt i dagsläget. På något sätt vill medlemmarna ha möjlighet köpa och sälja sina komponenter och dessutom förhandla om pris och kvantitet. Kan man utveckla en agent för att utföra detta på distans? Hur skall handelslogiken till en sådan agent struktureras? Syftet med denna rapport är att utveckla en lämplig handelslogik för en agent som förhandlar med andra agenter angående köp och försäljning av utrustning.

Shop4athletes : E-handelswebbplats och användbarhet

Medvetenheten har ökat hos svenska folket om att det är viktigt att motionera och att det till viss del krävs funktionell utrustning. Situationen idag för svensk friidrott är att sporten är het med alla internationella framgångar samt att tillgången till träningsmöjligheter är stor. Trots detta är det svårt för friidrottare att hitta ett brett sortiment av friidrottsartiklar, speciellt för de som inte bor nära storstäderna. Vår affärsidé är att starta ett e-handelsföretag som ska sälja ett brett sortiment av friidrottsartiklar över Internet där marknaden är Sverige och på sikt kanske även övriga skandinaviska länder. Även om marknaden ofta är för liten i enskilda svenska städer för ett stort sortiment av friidrottsartiklar tror vi att marknaden ändå är tillräckligt stor sammantaget i Sverige. Projektet har utmynnat i en fullt funktionell e-handelswebbplats som ska kunna ligga till grund för startandet av e-handelsföretaget shop4athletes. Förutom att e-handelswebbplatsen ska vara funktionell har fokus legat på att skapa en unik, stilren och lättnavigerad webbplats som genom design och användbarhet ska kunna attrahera målgruppen.

Skolan och det mångkulturella mötet : Några gymnasielärares beskrivning av mötet med muslimska elever och arbetet med skolans värdegrund

Uppsatsen berör problemområdet med mångkulturella möten i gymnasieskolan. Det är ett lärarperspektiv där några yrkesverksamma lärare beskriver sin egen erfarenhet av mötet med muslimska elever. De positiva erfarenheterna dominerar lärarnas synsätt och beskrivning av de mångkulturella mötena. Men beskriver även islam i Sverige idag och hur religionen har anpassat sig till nya förhållanden de senaste 50 åren. Sverige har utvecklats från en enhetskultur till ett mångkulturellt samhälle vilket även påverkat skolan i samma utsträckning. Den litteratur som använts i uppsatsen är religionshistorisk, religionssociologisk och pedagogisk.