Mycobacterium bovis: polymerase chain reaction identification in bovine Lymphonode biopsies and genotyping in isolates from Southeast Brazil by spolygotyping and restriction fragment length polymorphism

Diagnosis of the Mycobacterium tuberculosis complex by direct PCR of mediastinal lymphnode DNA and microbiological tests were compared in cattle suspicious of bearing tuberculous-like lesions detected during slaughter. The PCR procedure applied on DNA samples (n=54) obtained by adding alpha -casein into the thiocyanate extraction mix was positive in 70% of the samples. PCR confirmed the identification of 23 samples (100%) that grew in culture, 9 samples (60%) that failed to grow in culture, plus 6 (37.5%) samples that resulted in growth of bacterial contaminants. Genotyping by IS6110-RFLP and DR-spoligotyping analysis of seven samples revealed the presence of several polimorphisms. Seven of the isolates contained multiple copies of IS6110, thus defining the existence of five singular genotypes.

Avaluació i predicció del risc de reincidencia en agressors sexuals

En el marc de la intervenció penitenciària amb agressors sexuals, té una especial rellevància la predicció de risc del seu comportament futur, atenent les greus repercussions que poden arribar a tenir les reincidències, tant per a les possibles víctimes com des de la perspectiva de l’impacte mediàtic i pànic moral que generen. En el context internacional, gran part de l’esforç investigador en aquesta matèria ha anat adreçat a l’estandardització de protocols per avaluar el risc de reincidència d’aquests subjectes i orientar la presa de decisions envers ells i la seva vida fora del règim penitenciari. Un dels instruments més novedosos per a la predicció del risc d’agressió sexual és el Sexual Violence Risc – 20 (SVR-20) desenvolupat per un equip d’investigadors canadencs. El treball que aquí es presenta s’inscriu en el marc de l’aplicació pràctica d’aquests procediments predictius al nostre país. L’objectiu principal és aplicar l’SVR-20, de manera retrospectiva, a una mostra d’agressors sexuals per avaluar la capacitat predictiva d’aquest instrument i, així, poder anticipar la possible reincidència dels subjectes. Per aconseguir aquest objectiu, la puntuació total del SVR-20 ha estat correlacionada amb la reincidència veritable, considerant el tractament com una variable a tenir en compte. La regressió logística ha estat utilitzada per examinar el calibratge del model. Aquesta anàlisi avalua el grau de correspondència entre les probabilitats predites (de reincidència) i la reincidència esdevinguda. L’SVR-20 prediu correctament el 55% dels no-reincidents i el 16% dels reincidents. Podem afirmar que aquest model prediu molt millor la reincidència que la no-reincidència. A més, la predicció millora quan hi incloem la variable de tractament. Aquest estudi és el primer a Catalunya que avalua la validesa predictiva d’un instrument d’avaluació del risc de violència sexual. Futures recerques haurien de centrar-se a estimar un punt de tall per a l’SVR-20 que permeti classificar els subjectes de risc de reincidència dels subjectes segurs.

Evaluación y predicción del riesgo de reincidencia en agresores sexuales

Puesto que es muy importante la predicción del riesgo de reincidencia en agresores sexuales, la investigación que aquí se presenta tiene como objetivo la aplicación de uno de los instrumentos más novedosos para la predicción del riesgo de agresión sexual, el Sexual Violence Risc – 20 (SVR-20) desarrollado por un equipo de investigadores canadienses, de manera retrospectiva, a una muestra de agresores sexuales para evaluar la capacidad predictiva de este instrumento y así, poder anticipar la posible reincidencia de los sujetos

Aplicació web per l'empresa Canals d'Urgell

El projecte que es presenta en aquest estudi és la realització d’una aplicació web , destinada a l’empresa Canals d’Urgell, situada a Mollerussa, Lleida. Aquesta aplicació tindrà com a objectiu principal la gestió , el disseny i la visualització dels continguts de l’empresa. Aquest projecte disposarà de dues parts: la part frontal destinada a la visualització dels continguts (front-end) i una administració per gestionar els continguts i interactuar amb la base de dades. (back – end).

Automatització integral d'un habitatge

En aquest projecte discutirem i aprovarem la viabilitat d'implementar una automatització integral d'un habitatge utilitzant les tecnologies domòtiques existents a l'actualitat. La idea inicial és substituir tots els elements que integren la construcció (il·luminació, climatització, parts mòbils,...) per dispositius domòtics i implementar un software de visualització sobre aparells mòbils (smartphones, tablets) que ens permeti un control total sobre l'habitacle. S’avaluarà quina és la solució de mercat que millor s’adapta al projecte i s’implementarà integrant-la posteriorment als sistemes de visualització i control.

Detection and Characterization of Rotavirus G and P Types from Children Participating in a Rotavirus Vaccine Trial in Belém, Brazil

This study sought the characterization of rotaviruses in a trial with a tetravalent rhesus-human rotavirus vaccine in Belém, Brazil in children who received three doses of vaccine or placebo in the 1st, 3rd and 5th months of life. Rotavirus electropherotypes, subgroups, G serotypes, G, [P] and [P],G genotypes were determined in 93.3%, 95.9%, 93.3%, 73.3%, 95.5% and 92.2% of isolates, respectively. Serotypes G1, G2 and G4 were detected in 58.9%, 30% and 4.4% of the cases, respectively. Rotavirus genotype G5 was detected for the first time in Northern region in 4.4% of the infections. Rotavirus genotypes P[8], P[4], P[6] and P[8+6] were detected in 54.5%, 26.7%, 12.2%, and 2.2% of the cases, respectively. The predominant genotypes were P[8],G1 and P[4],G2 with 53% and 26.6% of the infections, respectively. Unusual strains accounted for 20.5% including P[4],G1, P[6],G1, P[6],G4, P[6],G5, P[8],G2, P[8],G5. Mixed infections involving P[8+6],G2 and P[8+6],G1 were also noted. The neonatal P[6] strains associated with diarrhea were detected among children aged 9-24 months. To our knowledge, this study represents the first in Brazil to analyse, on molecular basis, rotavirus genotypes from children participating in a rotavirus vaccine trial. These results are of potential importance regarding future rotavirus vaccination strategies in Brazil.

CYP3A5 and ABCB1 genes influence blood pressure and response to treatment, and their effect is modified by salt.

The permeability-glycoprotein efflux-transporter encoded by the multidrug resistance 1 (ABCB1) gene and the cytochromes P450 3A4/5 encoded by the CYP3A4/5 genes are known to interact in the transport and metabolism of many drugs. Recent data have shown that the CYP3A5 genotypes influence blood pressure and that permeability-glycoprotein activity might influence the activity of the renin-angiotensin system. Hence, these 2 genes may contribute to blood pressure regulation in humans. We analyzed the association of variants of the ABCB1 and CYP3A5 genes with ambulatory blood pressure, plasma renin activity, plasma aldosterone, endogenous lithium clearance, and blood pressure response to treatment in 72 families (373 individuals; 55% women; mean age: 46 years) of East African descent. The ABCB1 and CYP3A5 genes interact with urinary sodium excretion in their effect on ambulatory blood pressure (daytime systolic: P=0.05; nighttime systolic and diastolic: P<0.01), suggesting a gene-gene-environment interaction. The combined action of these genes is also associated with postproximal tubular sodium reabsorption, plasma renin activity, plasma aldosterone, and with an altered blood pressure response to the angiotensin-converting enzyme inhibitor lisinopril (P<0.05). This is the first reported association of the ABCB1 gene with blood pressure in humans and demonstration that genes encoding for proteins metabolizing and transporting drugs and endogenous substrates contribute to blood pressure regulation.

Execució penal de sancions a conductors sota els efectes de drogues d’abús basats en estudi de saliva: ingerència i repercussió futura en el Codi penal

El consum de drogues no institucionalitzades té una important dimensió epidemiològica. En l'actualitat augmenta el consum de cocaïna i de cànnabis i s'estabilitza o disminueix el de opiacis. En la majoria dels països hi ha una relació entre la drogoaddicció i el delicte. Objectius: 1) Obtenir dades sociodemogràfiques en una població detinguda en els jutjats de guàrdia que passen a disposició judicial; 2) Obtenir dades sanitàries referents a infecció per VIH, VHC I VHB; 3) Obtenir dades de consums de cocaïna, haxis, heroïna, benzodiazepines i drogues de síntesis; 4) Conèixer la correlació o concordança clínico-analítica i, 5) Valorar la relació de l'addicció a drogues amb la delictologia. Subjectes i Mètodes: Estudi realitzat en una població de 151 subjectes consumidors de drogues il·legals detinguts a disposició judicial al Jutjat de guàrdia de la ciutat de Barcelona. Temps de l'estudi: 1,5 anys. Mètodes: Administració d'un qüestionari amb dades sociodemogràfiques, sanitàries i de consums de tòxics. Obtenció d'una mostra d'orina que es va analitzar per immunoassaig en l'analitzador AsXym (*Abbot). Els resultats es van interpretar com positius o negatius segons el punt de tall establert per al mètode. Resultats: El perfil de la mostra és un home solter, edat mitjana de 31.4 anys, amb estudis primaris i sense professió qualificada. La droga il·legal més consumida és la cocaïna, 77,5%, seguida dels opiacis 62,9%, del cànnabis 60,3% i benzodiazepines 61.6% (auto-medicades 40,9%). La prevalença de HIV va ser del 16,7%, VHC 37,9% i VHB 19,1%. La via intravenosa és utilitzada pel 46% dels cocainòmans i pel 53.8% del heroinòmans. Un 45.5% tenen signes compatibles amb UDVP. Només un 14.2% presentava signes de deteriorament físic i un 23.1% una clara síndrome d’abstinència. Existeix un 74.3% de correlació o concordança clínico-analítica. El delicte més relacionat amb el consum de drogues va ser els delictes contra la propietat. Conclusions i Discusió: Es detecta un alt consum de cocaïna i disminució de l'heroïna. El consum de cànnabis i benzodiazepines és elevat. Els delictes contra la propietat estan associats al consum de drogues il·legals. Propostes: L'estudi té aplicabilitat en medicina forense. El screening rutinari d'orina en població detinguda és una mesura d'utilitat. Permet obtenir dades objectives quan se sol·liciten informes de drogoaddicció als perits. Els detinguts poden beneficiar-se de circumstàncies modificadores de la responsabilitat criminal en cas de ser consumidors de tòxics, d’acord amb la legislació actual. Els lletrats i l'autoritat judicial tindran una prova objectiva en les seves actuacions per poder resoldre amb més coneixement els procediments on es troben implicats els consumidors de drogues d'abús.

Monitor de servidors JMS

El monitor de servidors JMS és un projecte basat en el disseny i implementacio d'una eina GUI, destinada a programadors i equips de proves que treballin amb la tecnología Java Message Service, multiplataforma i multiservidor, que podrà monitoritzar un nombre variat de servidors JMS des de qualsevol sistema que tingui una màquina virtual de Java instal·lada. L'aplicació té com a principal objectiu visualitzar de forma clara i senzilla l'estat global d'un servidor JMS, mostrant les cues i tòpics creats, juntament amb la possibilitat de realitzar accions sobre les mateixes destinacions (enviament i eliminació de missatges residents al servidor) i la creació de gràfiques sobre el tràfic de missatges.

Sistema de monitorización de servidores Linux

El present projecte pretén cobrir les necessitats de monitorització d'una xarxa per definir. Principalment hauran de ser monitoritzats tant els servidors com les estacions de treball. Tots aquests hosts tindran en comú que funcionaran amb sistemes operatius GNU/Linux, intentant en la mesura del possible abastar diverses distribucions, encara que principalment es treballarà per les basades en Debian, i més concretament en Ubuntu.

Gestor de contenidos web ASP.NET

Mediante el presente documento se pretende describir el proceso de creación de una herramienta de tipo CMS (Gestor de contenidos). Concretamente, se desarrollará una herramienta que permita al usuario crear su propio sitio web sin necesidad de tener conocimientos de programación. Debido a la gran variedad de sitios web tanto en su forma como en su contenido y ante la imposibilidad de abarcar todo el espectro desde la primera versión del producto, se centrarán los esfuerzos en obtener una aplicación sencilla pero funcional y, sobretodo, escalable, para que mediante futuras actualizaciones se puedan ir incrementando sus posibilidades y capacidad.

Interplay between wheat cultivars, biocontrol pseudomonads, and soil.

There is a significant potential to improve the plant-beneficial effects of root-colonizing pseudomonads by breeding wheat genotypes with a greater capacity to sustain interactions with these bacteria. However, the interaction between pseudomonads and crop plants at the cultivar level, as well as the conditions which favor the accumulation of beneficial microorganisms in the wheat rhizosphere, is largely unknown. Therefore, we characterized the three Swiss winter wheat (Triticum aestivum) cultivars Arina, Zinal, and Cimetta for their ability to accumulate naturally occurring plant-beneficial pseudomonads in the rhizosphere. Cultivar performance was measured also by the ability to select for specific genotypes of 2,4-diacetylphloroglucinol (DAPG) producers in two different soils. Cultivar-specific differences were found; however, these were strongly influenced by the soil type. Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis of fragments of the DAPG biosynthetic gene phlD amplified from natural Pseudomonas rhizosphere populations revealed that phlD diversity substantially varied between the two soils and that there was a cultivar-specific accumulation of certain phlD genotypes in one soil but not in the other. Furthermore, the three cultivars were tested for their ability to benefit from Pseudomonas inoculants. Interestingly, Arina, which was best protected against Pythium ultimum infection by inoculation with Pseudomonas fluorescens biocontrol strain CHA0, was the cultivar which profited the least from the bacterial inoculant in terms of plant growth promotion in the absence of the pathogen. Knowledge gained of the interactions between wheat cultivars, beneficial pseudomonads, and soil types allows us to optimize cultivar-soil combinations for the promotion of growth through beneficial pseudomonads. Additionally, this information can be implemented by breeders into a new and unique breeding strategy for low-input and organic conditions.

Genome-wide association analysis identifies 20 loci that influence adult height.

Adult height is a model polygenic trait, but there has been limited success in identifying the genes underlying its normal variation. To identify genetic variants influencing adult human height, we used genome-wide association data from 13,665 individuals and genotyped 39 variants in an additional 16,482 samples. We identified 20 variants associated with adult height (P < 5 x 10(-7), with 10 reaching P < 1 x 10(-10)). Combined, the 20 SNPs explain approximately 3% of height variation, with a approximately 5 cm difference between the 6.2% of people with 17 or fewer 'tall' alleles compared to the 5.5% with 27 or more 'tall' alleles. The loci we identified implicate genes in Hedgehog signaling (IHH, HHIP, PTCH1), extracellular matrix (EFEMP1, ADAMTSL3, ACAN) and cancer (CDK6, HMGA2, DLEU7) pathways, and provide new insights into human growth and developmental processes. Finally, our results provide insights into the genetic architecture of a classic quantitative trait.

Establishment of HEV RNA reverse transcriptase PCR assays for the diagnosis of acute and chronic hepatitis E

Background and aim: H epatitis E v irus (HEV) infection has emerged as a c ause o f travel-related a nd autochthonous a cute hepatitis as well as chronic hepatitis in immunosuppressed patients. While t ravel-related cases a re c aused primarily b y infections w ith HEV of g enotype 1 ( HEV-1), autochthonous c ases a nd chronic cases a re d ue t o genotype 3 (HEV-3), which is s hared between humans and diverse animal species. The aim of this study was to establish HEV RNA detection assays f or q uantitative v iral load testing and genotyping. Methods: V iral RNA was p urified from plasma or s erum a nd converted to cDNA prior to (1) multiplex real-time PCR for HEV RNA quantification and (2) multiplex PCR coupled to DNA sequencing for HEV genotype determination. Real-time PCR was d esigned to match a ll known HEV genotypes available i n Genbank while PCR was designed using conserved primers flanking a variable region of the HEV RNA. Results: In a validation panel, the newly developed assays allowed for the reliable detection and genotyping of HEV-1 or HEV-3. Cases of t ravel-related and a utochthonous a cute h epatitis E a s well a s chronic hepatitis E i n immunosuppressed patients have b een identified using t hese a ssays a nd will be p resented in detail. Anti- HEV antibodies were n egative i n three well-characterized patients with chronic hepatitis E after organ transplantation. Conclusions: We developed and validated a quantitative HEV RNA detection assay that c an now be o ffered on a r outine basis (www.chuv.ch/imul/imu-collaborations-viral_hepatitis). Genotyping can also be offered on selected cases. HEV RNA detection is key in diagnosing chronic hepatitis E i n immunosuppressed patients with unexplained transaminase elevations, as serology can be negative in these patients.

Hepatitis B and C in the hemodialysis unit of Tocantins, Brazil: serological and molecular profiles

A survey was conducted in the hemodialysis population of the state of Tocantins, Brazil, aiming to assess the prevalence of hepatitis B virus (HBV) and hepatitis C virus (HCV) infections, to analyze associated risk factors, and also to investigate these viruses genotypes distribution. During January and March 2001, all patients (n = 100) were interviewed at the unique dialysis unit in Tocantins. Blood samples were collected and serum samples were screened for HBV serological markers. Hepatitis B surface antigen positive samples were tested for HBV DNA. All samples were also tested for anti-HCV antibodies and HCV RNA. An overall prevalence of 45% was found for HBV infection (4% were HBsAg/anti-HBc positive, 2% were anti-HBc only and 39% had anti-HBc/anti-HBs markers). Concerning HCV infection, anti-HCV and HCV RNA were detected in 13% and 14% of the subjects, respectively. Three patients were HCV RNA positive and anti-HCV negative, resulting in an overall HCV prevalence of 16%. Univariate analysis of risk factors showed that only shift and length of time on hemodialysis were associated with HBV and HCV positivity, respectively. Among the four HBsAg-positive samples, HBV DNA was detected in three of them, which were identified as genotype A by restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. All 14 HCV RNA-positive samples were genotyped by INNO-LiPA. Genotypes 1a and 3a were found in 85% and 15%, respectively. The present data show low HBsAg and HCV prevalence rates. The risk factors associated with HBV and HCV positivity suggest that nosocomial transmission may influence in spreading these viruses in the dialysis unit studied.