Return to sport after open and microdiscectomy surgery versus conservative treatment for lumbar disc herniation: a systematic review with meta-analysis.

BACKGROUND: Lumbar disc herniation has a prevalence of up to 58% in the athletic population. Lumbar discectomy is a common surgical procedure to alleviate pain and disability in athletes. We systematically reviewed the current clinical evidence regarding athlete return to sport (RTS) following lumbar discectomy compared to conservative treatment. METHODS: A computer-assisted literature search of MEDLINE, CINAHL, Web of Science, PEDro, OVID and PubMed databases (from inception to August 2015) was utilised using keywords related to lumbar disc herniation and surgery. The design of this systematic review was developed using the guidelines of the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA). Methodological quality of individual studies was assessed using the Downs and Black scale (0-16 points). RESULTS: The search strategy revealed 14 articles. Downs and Black quality scores were generally low with no articles in this review earning a high-quality rating, only 5 articles earning a moderate quality rating and 9 of the 14 articles earning a low-quality rating. The pooled RTS for surgical intervention of all included studies was 81% (95% CI 76% to 86%) with significant heterogeneity (I(2)=63.4%, p<0.001) although pooled estimates report only 59% RTS at same level. Pooled analysis showed no difference in RTS rate between surgical (84% (95% CI 77% to 90%)) and conservative intervention (76% (95% CI 56% to 92%); p=0.33). CONCLUSIONS: Studies comparing surgical versus conservative treatment found no significant difference between groups regarding RTS. Not all athletes that RTS return at the level of participation they performed at prior to surgery. Owing to the heterogeneity and low methodological quality of included studies, rates of RTS cannot be accurately determined.

The 2015 Bioinformatics Open Source Conference (BOSC 2015).

The Bioinformatics Open Source Conference (BOSC) is organized by the Open Bioinformatics Foundation (OBF), a nonprofit group dedicated to promoting the practice and philosophy of open source software development and open science within the biological research community. Since its inception in 2000, BOSC has provided bioinformatics developers with a forum for communicating the results of their latest efforts to the wider research community. BOSC offers a focused environment for developers and users to interact and share ideas about standards; software development practices; practical techniques for solving bioinformatics problems; and approaches that promote open science and sharing of data, results, and software. BOSC is run as a two-day special interest group (SIG) before the annual Intelligent Systems in Molecular Biology (ISMB) conference. BOSC 2015 took place in Dublin, Ireland, and was attended by over 125 people, about half of whom were first-time attendees. Session topics included "Data Science;" "Standards and Interoperability;" "Open Science and Reproducibility;" "Translational Bioinformatics;" "Visualization;" and "Bioinformatics Open Source Project Updates". In addition to two keynote talks and dozens of shorter talks chosen from submitted abstracts, BOSC 2015 included a panel, titled "Open Source, Open Door: Increasing Diversity in the Bioinformatics Open Source Community," that provided an opportunity for open discussion about ways to increase the diversity of participants in BOSC in particular, and in open source bioinformatics in general. The complete program of BOSC 2015 is available online at http://www.open-bio.org/wiki/BOSC_2015_Schedule.

Bayesian Model Averaging in the M-Open Framework

This chapter presents a model averaging approach in the M-open setting using sample re-use methods to approximate the predictive distribution of future observations. It first reviews the standard M-closed Bayesian Model Averaging approach and decision-theoretic methods for producing inferences and decisions. It then reviews model selection from the M-complete and M-open perspectives, before formulating a Bayesian solution to model averaging in the M-open perspective. It constructs optimal weights for MOMA:M-open Model Averaging using a decision-theoretic framework, where models are treated as part of the ‘action space’ rather than unknown states of nature. Using ‘incompatible’ retrospective and prospective models for data from a case-control study, the chapter demonstrates that MOMA gives better predictive accuracy than the proxy models. It concludes with open questions and future directions.

Distribución del agua en el suelo y su relación con la estructura radical y producción de biomasa de tres tipos funcionales, en un pastizal de la estepa magallánica seca, Santa Cruz

Uno de los principales aspectos del funcionamiento de los ecosistemas áridos es la dinámica del agua, que determina aspectos estructurales y funcionales, como la dominancia de tipos funcionales (Tf), fenología y productividad. Los objetivos de esta tesis fueron identificar para un pastizal xérico del sur patagónico, las principales variables ambientales que controlan la dinámica del agua en el suelo, los factores que determinan sus variaciones en el perfil (asociados a topografía y parches de vegetación) y evaluar la respuesta de los tres Tf presentes de la vegetación: gramíneas cortas (GC), gramíneas medianas (coirones) y subarbustos frente a esta variaciones temporales y espaciales. En exposiciones norte, sur y plano se midió: potencial hídrico de suelo (10, 25 y 60 cm de profundidad), potencial hídrico foliar y producción de biomasa aérea mensual de los tres Tf. Se determinó la distribución de raíces en cada Tf. y el contenido hídrico del suelo asociado a parches vegetados y de suelo desnudo. Las lluvias se distribuyeron a lo largo del año con dominancia de eventos menor a 5mm (90 por ciento) y ausencia de tormentas. Los tres Tf presentaron más del 60 por de la biomasa de raíces entre 0-10cm del suelo, siguiendo un perfil similar al del frente de mojado de las lluvias más frecuentes, mientras que capas más profundas fueron escasamente exploradas. Los parches de suelo desnudo constituyen una reserva de agua superficial durante el verano, que podría ser utilizada sólo por el subarbusto a través de raíces que se extienden lateralmente. El suelo estuvo húmedo en invierno-primavera, seco en verano y el otoño fue variable de acuerdo al año. La exposición generó un gradiente de humedad en el suelo; la exposición norte fue el extremo más xérico. Este gradiente afectó los potenciales hídricos foliares de los 3 Tf, pero sólo en GC modificó la producción de biomasa. La producción de GC constituye el principal forraje para los ovinos, y probablemente las variaciones temporales y en el paisaje se reflejen en el consumo animal y en la producción secundaria.

Exudados radicales y su efecto en la arquitectura radical de Arabidopsis thaliana

La arquitectura radical es de vital importancia para la nutrición y performance de las plantas. Está determinada genéticamente y recibe gran influencia del ambiente. En esta tesis se evaluó el efecto de los exudados radicales en la determinación de la arquitectura radical. Se trabajó en condiciones de esterilidad con plantas de Arabidopsis thaliana ecotipos Ler y Col en placas de Petri ubicadas en un cuarto de crecimiento con luz y temperatura controlada. Se incluyeron tratamientos con agregado de carbón activado (CA), asumiendo que este compuesto retiene parte de los exudados radicales. Se incluyeron experimentos con una y tres plantas por placa y con tratamientos de dosis de fósforo. En los ensayos con una planta por placa, se observó que cuando crecían con CA presentaban menos raíces laterales (38 por ciento en Ler y 27 por ciento en Col) y más largas (83 por ciento en Ler y 96 por ciento en Col). Los responsables de esta respuesta habrían sido los metabolitos secundarios, que disminuyeron su concentración en un 90 por ciento cuando se agregó CA. En los ensayos con tres plantas y utilizando a la planta central como objetivo, se observó que las raíces de ambos ecotipos evitaban la competencia con las plantas de diferente ecotipo invadiendo la zona de crecimiento de la planta del mismo ecotipo cuando crecían con alta disponibilidad de fósforo (P) y sin presencia de CA. Cuando las plantas crecieron con CA o sin (P), no se observó ninguna modificación en la disposición de las raíces en el espacio. Estos resultados indicarían que los metabolitos secundarios están implicados en la identificación de la identidad de las raíces vecinas y en la regulación de la disposición de las raíces laterales en el espacio, en respuesta a la presencia de otras raíces laterales.

Distribución del agua en el suelo y su relación con la estructura radical y producción de biomasa de tres tipos funcionales, en un pastizal de la estepa magallánica seca, Santa Cruz

Uno de los principales aspectos del funcionamiento de los ecosistemas áridos es la dinámica del agua, que determina aspectos estructurales y funcionales, como la dominancia de tipos funcionales (Tf), fenología y productividad. Los objetivos de esta tesis fueron identificar para un pastizal xérico del sur patagónico, las principales variables ambientales que controlan la dinámica del agua en el suelo, los factores que determinan sus variaciones en el perfil (asociados a topografía y parches de vegetación)y evaluar la respuesta de los tres Tf presentes de la vegetación: gramíneas cortas (GC), gramíneas medianas (coirones)y subarbustos frente a esta variaciones temporales y espaciales. En exposiciones norte, sur y plano se midió: potencial hídrico de suelo (10, 25 y 60 cm de profundidad), potencial hídrico foliar y producción de biomasa aérea mensual de los tres Tf. Se determinó la distribución de raíces en cada Tf. y el contenido hídrico del suelo asociado a parches vegetados y de suelo desnudo. Las lluvias se distribuyeron a lo largo del año con dominancia de eventos menor a 5mm (90 por ciento)y ausencia de tormentas. Los tres Tf presentaron más del 60 por de la biomasa de raíces entre 0-10cm del suelo, siguiendo un perfil similar al del frente de mojado de las lluvias más frecuentes, mientras que capas más profundas fueron escasamente exploradas. Los parches de suelo desnudo constituyen una reserva de agua superficial durante el verano, que podría ser utilizada sólo por el subarbusto a través de raíces que se extienden lateralmente. El suelo estuvo húmedo en invierno-primavera, seco en verano y el otoño fue variable de acuerdo al año. La exposición generó un gradiente de humedad en el suelo; la exposición norte fue el extremo más xérico. Este gradiente afectó los potenciales hídricos foliares de los 3 Tf, pero sólo en GC modificó la producción de biomasa. La producción de GC constituye el principal forraje para los ovinos, y probablemente las variaciones temporales y en el paisaje se reflejen en el consumo animal y en la producción secundaria.

Metadaten für Open Educational Resources (OER). Eine Handreichung für die öffentliche Hand, erstellt von der Technischen Informationsbibliothek (TIB)

"Im Zuge der weiteren Verbreitung der Social Media und der internetbasierten Lehre, gewinnen eLearning Inhalte immer mehr an Bedeutung. In den Kontext von eLearning und internetbasierter Lehre gehören auch Open Educational Resources (OER). OER sind digitale Lern- und Lehrmaterialien, die frei für Lehrende und Studierende zugänglich sind und auch frei verbreitet werden dürfen. [...] Um OER auszutauschen, zu finden, zu beschaffen und sie auf einer breiten Basis zugänglich zu machen, insbesondere auch über Suchmaschinen und dadurch verwenden zu können, werden für die jeweiligen Materialien Metadaten benötigt. [...] Um die Frage nach dem Handlungs- und Forschungsbedarf zum Thema Metadaten für Open Educational Resources zu untersuchen, wird zunächst ein Überblick über die momentan bestehenden nationalen und internationalen Metadatenstandards für eLearning Objekte gegeben. [...] Hieraus ergeben sich Empfehlungen, welche Metadaten-Standards für die weitere Nutzung und Förderung geeignet sein könnten. Es werden außerdem die Möglichkeiten der Erstellung eines neuen Metadaten-Standards sowie eines gemeinsamen Portals für OER erörtert. Hierbei wird vor allem auf die zu erwartenden Probleme und die damit verbundenen Anforderungen eingegangen." (DIPF/Orig.)

The open shop scheduling problem with a given sequence of jobs on one machine

The paper considers the open shop scheduling problem to minimize the make-span, provided that one of the machines has to process the jobs according to a given sequence. We show that in the preemptive case the problem is polynomially solvable for an arbitrary number of machines. If preemption is not allowed, the problem is NP-hard in the strong sense if the number of machines is variable, and is NP-hard in the ordinary sense in the case of two machines. For the latter case we give a heuristic algorithm that runs in linear time and produces a schedule with the makespan that is at most 5/4 times the optimal value. We also show that the two-machine problem in the nonpreemptive case is solvable in pseudopolynomial time by a dynamic programming algorithm, and that the algorithm can be converted into a fully polynomial approximation scheme. © 1998 John Wiley & Sons, Inc. Naval Research Logistics 45: 705–731, 1998

A greedy open shop heuristic with job priorities

The paper presents an improved version of the greedy open shop approximation algorithm with pre-ordering of jobs. It is shown that the algorithm compares favorably with the greedy algorithm with no pre-ordering by reducing either its absolute or relative error. In the case of three machines, the new algorithm creates a schedule with the makespan that is at most 3/2 times the optimal value.

A 3/2 algorithm for two-machine open shop with route-dependent processing times

This paper considers the problem of minimizing the schedule length of a two-machine shop in which not only can a job be assigned any of the two possible routes, but also the processing times depend on the chosen route. This problem is known to be NP-hard. We describe a simple approximation algorithm that guarantees a worst-case performance ratio of 2. We also present some modifications to this algorithm that improve its performance and guarantee a worst-case performance ratio of 3=2.

A polynomial algorithm for the three-machine open shop with a bottleneck machine

The paper considers the three‐machine open shop scheduling problem to minimize themakespan. It is assumed that each job consists of at most two operations, one of which is tobe processed on the bottleneck machine, the same for all jobs. A new lower bound on theoptimal makespan is derived, and a linear‐time algorithm for finding an optimalnon‐preemptive schedule is presented.

Group technology approach to the open shop scheduling problem with batch setup times

This paper studies the problem of scheduling jobs in a two-machine open shop to minimize the makespan. Jobs are grouped into batches and are processed without preemption. A batch setup time on each machine is required before the first job is processed, and when a machine switches from processing a job in some batch to a job of another batch. For this NP-hard problem, we propose a linear-time heuristic algorithm that creates a group technology schedule, in which no batch is split into sub-batches. We demonstrate that our heuristic is a -approximation algorithm. Moreover, we show that no group technology algorithm can guarantee a worst-case performance ratio less than 5/4.

An open shop scheduling problem with a non-bottleneck machine

This paper considers the problem of processing n jobs in a two-machine non-preemptive open shop to minimize the makespan, i.e., the maximum completion time. One of the machines is assumed to be non-bottleneck. It is shown that, unlike its flow shop counterpart, the problem is NP-hard in the ordinary sense. On the other hand, the problem is shown to be solvable by a dynamic programming algorithm that requires pseudopolynomial time. The latter algorithm can be converted into a fully polynomial approximation scheme that runs in time. An O(n log n) approximation algorithm is also designed whi finds a schedule with makespan at most 5/4 times the optimal value, and this bound is tight.