Biblioteca digital de teses e dissertaçoes: uma referência fundamental

OLIVEIRA, Raimundo Muniz de. Biblioteca digital de teses e dissertaçoes: uma referencia fundamental. In: CINFORM ENCONTRO NACIONAL DE ENSINO E PESQUISA DA INFORMAÇAO,HUMANISMO E DESENVOLVIMENTO CIENTIFICO E TECNOLOGICO,7.,2007,Salvador. Anais...Salvador:UFBA, 2007.Disponivel em:www.cinform.ufba.br>. Acesso em: 27 set. 2007. Acesso em: 27 set. 2010.

Bibblioteca Digital de Teses e Dissertações: uma estratégia de preservação digital

CUNHA, Jacqueline de Araújo. Biblioteca Digital de Teses e Dissertações: uma estratégia de preservação da memória científica. 2009. 141f. Dissertação (Mestrado)- Programa de Pós-Graduação em Ciência da Informação. Universidade Federal da Paraíba, João Pessoa, 2009.

A more reliable PCR for detection of Mycobacterium tuberculosis in clinical samples

Diagnostic techniques based on PCR have two major problems: false-positive reactions due to contamination with DNA fragments from previous PCRs (amplicons) and false-negative reactions caused by inhibitors that interfere with the PCR. We have improved our previously reported PCR based on the amplification of a fragment of the Mycobacterium tuberculosis complex-specific insertion element IS6110 with respect to both problems. False-positive reactions caused by amplicon contamination were prevented by the use of uracil-N-glycosylase and dUTP instead of dTTP. We selected a new set of primers outside the region spanned by the formerly used primers to avoid false-positive reactions caused by dTTP-containing amplicons still present in the laboratory. With this new primer set, 16 copies of the IS6110 insertion element, the equivalent of two bacteria, could be amplified 10(10) times in 40 cycles, resulting in a mean efficiency of 77% per cycle. To detect the presence of inhibitors of the Taq polymerase, which may cause false-negative reactions, part of each sample was spiked with M. tuberculosis DNA. The DNA purification method using guanidinium thiocyanate and diatoms effectively removed most or all inhibitors of the PCR. However, this was not suitable for blood samples, for which we developed a proteinase K treatment followed by phenol-chloroform extraction. This method permitted detection of 20 M. tuberculosis bacteria per ml of whole blood. Various laboratory procedures were introduced to reduce failure or inhibition of PCR and avoid DNA cross contamination. We have tested 218 different clinical specimens obtained from patients suspected of having tuberculosis. The samples included sputum (n=145), tissue biopsy samples (n=25), cerebrospinal fluid (n=15), blood (n=14), pleural fluid (n=9), feces, (n=7), fluid from fistulae (n=2), and pus from a wound (n=1). The results obtained by PCR were consistent with those obtained with culture, which is the "gold standard." We demonstrate that PCR is a useful technique for the rapid diagnosis of tuberculosis at various sites.

Second worldwide proficiency study on variable number of tandem repeats typing of Mycobacterium tuberculosis complex

Global Network for the Molecular Surveillance of Tuberculosis 2010: A. Miranda (Tuberculosis Laboratory of the National Institute of Health, Porto, Portugal)

Teses dos Programas de Pós-Graduação em Ciência da Informação níveis seis na CAPES em relação às linhas de pesquisa

Estudo de natureza descritiva que utilizou como instrumento metodológico a análise documental. O artigo teve como finalidade estudar as teses de doutorado dos Programas de Pós-Graduação em Ciência da Informação (PPGsCI) nível seis na CAPES em relação as suas linhas de pesquisa, no triênio 2010-2012. Obteve-se como resultado, os PPGsCI da Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG) e o da Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (UNESP). O universo de estudo foi composto por 52 teses. Para procedimentos de análise temática utilizou-se o Tesauro Brasileiro de Ciência da Informação. As temáticas identificadas nas teses refletem as características e os objetivos propostos na descrição das linhas de pesquisa dos dois programas. Palavras-chave: Produção científica. Comunicação científica. Literatura Cinzenta. Tesauros.

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações: grau de utilização pelos mestrandos do curso de Ciência da Informação das Universidades Públicas Brasileiras

A pesquisa aborda o uso das Tecnologias de Informação e Comunicação, que vem revolucionando as atividades e ocasionando muitas mudanças relacionadas ao acesso e uso de informações. O objetivo foi analisar o grau de utilização do conhecimento científico produzido pelos Programas de Pós-Graduação das Universidades Públicas Brasileiras, através da BDTD, pelos mestrandos dos referidos programas. Nos procedimentos metodológicos realizados, procurou-se inicialmente analisar o amplo espectro da população do corpus da pesquisa. Em razão da impossibilidade de trabalhar com os Programas de Pós-Graduação como um todo, optou-se por fazer um recorte, elegendo os cursos de Pós-Graduação em Ciência da Informação, vez que estes representam o principal segmento social de interesse da pesquisa. Foi utilizado o método de estudo de usuários, onde se optou por adotar o grupo, “estudos orientados aos usuários”, que identifica as necessidades e comportamento de acesso e uso da informação. Para coletar os dados, elaborou-se um questionário semi-estruturado com 25 questões, que versavam sobre o uso, dificuldades de acesso e recuperação da informação, bem como a satisfação na utilização dessa fonte informacional. Dentre os vários resultados obtidos, podemos destacar o fato de que a maioria dos mestrandos (71,8%) só teve contato com a BDTD somente no momento em que se encontrava cursando o mestrado e, somente 24,3%, tiveram contato durante a graduação. Estes resultados representam um problema, que pode afetar o bom desempenho do projeto BDTD, o qual consiste em disseminar e divulgar a produção científica dos Programas de Pós-Graduação das Universidades Públicas Brasileiras para a sua comunidade. Foi observado também, que os mestrandos oriundos do curso de Biblioteconomia tende a ter contato com a BDTD bem mais cedo do que mestrandos de outros cursos de graduação. A fim de minimizar o problema detectado, propõe-se uma divulgação mais eficaz na graduação através de dois procedimentos: Primeiro, o docente deve fazer uma divulgação mais eficaz da BDTD junto aos discentes de todos os cursos de graduação; segundo: deverá ser feita a divulgação na mídia eletrônica, através da inserção de ícones da BDTD, nos portais dos Departamentos dos Cursos de Graduação das Universidades Públicas Brasileiras. Acredita-se que com estes procedimentos seja possível aperfeiçoar o uso dessa fonte de informação científica.

Bibliotecas digitais de teses e dissertações brasileiras: paradigma do acesso livre à informação científica

A evolução da comunicação científica ao longo do tempo e o impacto causado pela A evolução da comunicação científica ao longo do tempo e o impacto causado pela A evolução da comunicação científica ao longo do tempo e o impacto causado pela se analisar as contribuições da Biblioteca Digital de Teses e Dissertações (BDTD)para a comunicação científica atual, destacando possibilidades emergentes e desafios a serem superados. Apresenta uma breve evolução da comunicação científica ao longo do tempo; discute os impactos causados pela Internet na comunicação, disponibilização e acessibilidade de informações técnico-científicas; e caracteriza BDTD destacando os desafios a serem superados. Dentre eles estão, a questão dos direitos autorais que ocasionam a baixa adesão dos autores ao projeto piloto do IBICT para disponibilizar teses e dissertações no meio eletrônico. Para este desafio, são apontadas sugestões.

Panorama brasileiro das bibliotecas digitais de teses e dissertações

As bibliotecas de teses e dissertações têm um papel fundamental para o desenvolvimento científico e cultural de um país. Nesse sentido, buscou-se, de modo geral, analisar o panorama brasileiro das bibliotecas digitais de teses e dissertações. Especificamente, objetivou-se caracterizar a sociedade da informação enquanto contexto das BDTD; caracterizar os vários tipos de bibliotecas surgidos a partir da inserção das novas tecnologias de informação e comunicação; identificar as diretrizes norteadoras da implantação de BDTD; e levantar as BDTD existentes no Brasil. Para tato, além de levantamento bibliográfico, realizou-se uma pesquisa nos sites de instituições de ensino superior brasileiras que já dispõe de bibliotecas digitais de teses e dissertações em funcionamento. A análise e interpretação destes dados nos permite considerar que no Brasil as BDTD encontram-se num estágio embrionário, sendo relevante pesquisar a histórica implantação e configuração desse novo modelo de biblioteca.

Safety assessment in primary Mycobacterium tuberculosis smear microscopy centres in Blantyre Malawi: a facility based cross sectional survey

Introduction Tuberculosis (TB) is caused by Mycobacterium tuberculosis and is transmitted mainly through aerosolization of infected sputum which puts laboratory workers at risk in spite of the laboratory workers’ risk of infection being at 3 to 9 times higher than the general public. Laboratory safety should therefore be prioritized and optimized to provide sufficient safety to laboratory workers. Objective To assess the safety for the laboratory workers in TB primary microscopy centres in Blantyre urban. Methodology TB primary microscopy centers in Blantyre urban were assessed in aspects of equipment availability, facility layout, and work practice, using a standardized WHO/AFRO ISO 15189 checklist for the developing countries which sets the minimum safety score at ≥80%. Each center was graded according to the score it earned upon assessment. Results Only one (1) microscopy center out nine (9) reached the minimum safety requirement. Four (4) centers were awarded 1 star level, four (4) centers were awarded 2 star level and only one (1) center was awarded 3 star level. Conclusion In Blantyre urban, 89% of the Tuberculosis microscopy centers are failing to provide the minimum safety to the laboratory workers. Government and other stake holders should be committed in addressing the safety challenges of TB microscopy centres in the country to ensure safety for the laboratory workers. Recommendations It is recommended that the study be conducted at the regional or national level for both public and private laboratories in order to have a general picture of safety in Tb microscopy centres possibly across the country.

Análisis del potencial epizoótico de cepas de Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis aisladas de diversos hospedadores empleando modelos de infección in vitro

299 p.

A molecular platform for the diagnosis of multidrug-resistant and pre-extensively drug-resistant tuberculosis based on single nucleotide polymorphism mutations present in Colombian isolates of Mycobacterium tuberculosis

Developing a fast, inexpensive, and specific test that reflects the mutations present in Mycobacterium tuberculosis isolates according to geographic region is the main challenge for drug-resistant tuberculosis (TB) control. The objective of this study was to develop a molecular platform to make a rapid diagnosis of multidrug-resistant (MDR) and extensively drug-resistant TB based on single nucleotide polymorphism (SNP) mutations present in the rpoB, katG, inhA, ahpC, and gyrA genes from Colombian M. tuberculosis isolates. The amplification and sequencing of each target gene was performed. Capture oligonucleotides, which were tested before being used with isolates to assess the performance, were designed for wild type and mutated codons, and the platform was standardised based on the reverse hybridisation principle. This method was tested on DNA samples extracted from clinical isolates from 160 Colombian patients who were previously phenotypically and genotypically characterised as having susceptible or MDR M. tuberculosis. For our method, the kappa index of the sequencing results was 0,966, 0,825, 0,766, 0,740, and 0,625 for rpoB, katG, inhA, ahpC, and gyrA, respectively. Sensitivity and specificity were ranked between 90-100% compared with those of phenotypic drug susceptibility testing. Our assay helps to pave the way for implementation locally and for specifically adapted methods that can simultaneously detect drug resistance mutations to first and second-line drugs within a few hours.

O problema religioso como preâmbulo do idealismo italiano : das teses de Maurizio Viroli à religião da liberdade em Croce

O objetivo do presente artigo é analisar o quanto o chamado idealismo italiano de Croce e Gentile é, em verdade, dependente da concepção religiosa italiana. Para tanto, nos deteremos, na primeira parte do nosso trabalho, principalmente numa análise das teses de Maurizio Viroli. Já no segundo parte do nosso artigo nos deteremos na análise dessa temática dentro do conceito de religião da liberdade em Croce. Assim, após tal inventário, teceremos nossas conclusões. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT

Drug resistance and genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis in Luanda, Angola: a molecular epidemiological perspective

Poster presented at the 36th Annual Congress of the European Society of Mycobacteriology. Riga, Latvia, 28 June - 1 July 2015

Protein expression of Myt272-3 recombinant clone and in silico prediction of a possible vaccine candidate against Mycobacterium tuberculosis

Purpose: To investigate the expression of Myt272-3 recombinant protein and also to predict a possible protein vaccine candidate against Mycobacterium tuberculosis . Methods: Myt272-3 protein was expressed in pET30a+-Myt272-3 clone. The purity of the protein was determined using Dynabeads® His-Tag Isolation & Pulldown. Protein sequence was analysed in silico using bioinformatics software for the prediction of allergenicity, antigenicity, MHC-I and MHC-II binding, and B-cell epitope binding. Results: The candidate protein was a non-allergen with 15.19 % positive predictive value. It was also predicted to be antigenic, with binding affinity to MHC-I and MHC-II, as well as B-cell epitope binding. Conclusion: The predicted results obtained in this study provide a guide for practical design of a new tuberculosis vaccine.

Mycobacterium tuberculosis infection in women with unexplained infertility

Background: Genital tuberculosis (GTB) is an important cause of female infertility, especially in developing countries. The positive results of polymerase chain reaction (PCR) in endometrial GTB in the absence of tubal damage raise the possibility of the detection of sub-clinical or latent disease, with doubtful benefits of treatment. Objective: To evaluate the mycobacterium tuberculosis infection in endometrial biopsy samples collected from unexplained infertile women attending Yazd Research and Clinical Center for Infertility by using PCR techniques. Materials and Methods: In this cross sectional study, 144 infertile women with unexplained infertility aged 20-35 years old and normal Histro-saplango graphy findings were enrolled. Endometrial biopsy samples from each participant were tested for mycobacterium tuberculosis detecting by PCR. In 93 patients, peritoneal fluid was also taken for culture and PCR. Results: The PCR results of endometrial specimens were negative in all cases, demonstrating that there was no GTB infection among our patients. Conclusion: Our results showed that GTB could not be considered as a major problem in women with unexplained infertility. Although, studies have indicated that PCR is a useful method in diagnosing early GTB disease in infertile women with no demonstrable evidence of tubal or endometrial involvement.