Co-evolution of specific amino acid in sigma 1.2 region and nucleotide base in the discriminator to act as sensors of small molecule effectors of transcription initiation in mycobacteria

The transcription from rrn and a number of other promoters is regulated by initiating ribonucleotides (iNTPs) and guanosine tetra/penta phosphate (p)ppGpp], either by strengthening or by weakening of the RNA polymerase (RNAP)-promoter interactions during initiation. Studies in Escherichia coli revealed the importance of a sequence termed discriminator, located between -10 and the transcription start site of the responsive promoters in this mode of regulation. Instability of the open complex at these promoters is attributed to the lack of stabilizing interactions between the suboptimal discriminator and the 1.2 region of sigma 70 (Sig70) in RNAP holoenzyme. We demonstrate a different pattern of interaction between the promoters and sigma A (SigA) of Mycobacterium tuberculosis to execute similar regulation. Instead of cytosine and methionine, thymine at three nucleotides downstream to -10 element and leucine 232 in SigA are found to be essential for iNTPs and pppGpp mediated response at the rrn and gyr promoters of the organism. The specificity of the interaction is substantiated by mutational replacements, either in the discriminator or in SigA, which abolish the nucleotide mediated regulation in vitro or in vivo. Specific yet distinct bases and the amino acids appear to have co-evolved' to retain the discriminator-sigma 1.2 region regulatory switch operated by iNTPs/pppGpp during the transcription initiation in different bacteria.

Teología pastoral Inter Loci : una disciplina teológica ante el aporte de las experiencias creyentes en escenarios sociales contemporáneos

Resumen: El texto realiza una relectura del método Ver-Juzgar-Actuar teniendo en cuenta el acercamiento biográfico que ofrecen las ciencias sociales. Propone considerar que la Teología Pastoral desarrolla así un discurso sobre la Iglesia, la Academia y la Plaza Pública en el cruce que estos ámbitos tienen en las mismas prácticas cristianas, dando lugar a una Teología Inter Loci. Y describe el perfil teológico emergente en dicha experiencia utilizando el marco de las inteligencias múltiples.

Agricultural Best Management Practices and Treatment Wetlands in the Gabilan Watershed: Project Asessment and Evaluation Plan

Several local groups have come together for this project to addresses water quality concerns in the Gabilan Watershed – also known as the Reclamation Ditch Watershed (Fig. 1.1). These are Moss Landing Marine Laboratories (MLML), the Resource Conservation District of Monterey County (RCDMC), Central Coast Watershed Studies (CCoWS), Return of the Natives (RON), Community Alliance with Family Farmers (CAFF), and Coastal Conservation and Research (CC&R). The primary goal is to reduce non-point source pollution – particularly suspended sediment, nutrients, and pesticides – and thereby improve near-shore coastal waters of Moss Landing Harbor and the Monterey Bay. (Document contains 33 pages)

Guide to best practices for ocean CO2 measurements

CHAP 1 - Introduction to the Guide CHAP 2 - Solution chemistry of carbon dioxide in sea water CHAP 3 - Quality assurance CHAP 4 - Recommended standard operating procedures (SOPs) SOP 1 - Water sampling for the parameters of the oceanic carbon dioxide system SOP 2 - Determination of total dissolved inorganic carbon in sea water SOP 3a - Determination of total alkalinity in sea water using a closed-cell titration SOP 3b - Determination of total alkalinity in sea water using an open-cell titration SOP 4 - Determination of p(CO2) in air that is in equilibrium with a discrete sample of sea water SOP 5 - Determination of p(CO2) in air that is in equilibrium with a continuous stream of sea water SOP 6a - Determination of the pH of sea water using a glass/reference electrode cell SOP 6b - Determination of the pH of sea water using the indicator dye m-cresol purple SOP 7 - Determination of dissolved organic carbon and total dissolved nitrogen in sea water SOP 7 en Español - Determinacion de carbono organico disuelto y nitrogeno total disuelto en agua de mar SOP 11 - Gravimetric calibration of the volume of a gas loop using water SOP 12 - Gravimetric calibration of volume delivered using water SOP 13 - Gravimetric calibration of volume contained using water SOP 14 - Procedure for preparing sodium carbonate solutions for the calibration of coulometric CT measurements SOP 21 - Applying air buoyancy corrections SOP 22 - Preparation of control charts SOP 23 - Statistical techniques used in quality assessment SOP 24 - Calculation of the fugacity of carbon dioxide in the pure gas or in air CHAP 5 - Physical and thermodynamic data Errata - to the hard copy of the Guide to best practices for ocean CO2 measurements

A lei de acesso à informação e a sua influência nos processos de atendimento às demandas da sociedade : estudo do caso do Centro de Documentação e Informação da Câmara dos Deputados

Examina a aplicação da Lei nº 12.527, de 18 de novembro de 2011 – a Lei de Acesso à Informação (LAI) – tendo como locus a Câmara dos Deputados e o seu órgão de gestão da informação, de relacionamento e de atendimento ao público usuário, o Centro de Documentação e Informação (Cedi) e, em particular, a Coordenação de Relacionamento, Pesquisa e Informação (Corpi). Analisa-se, à luz da Ciência da Informação, o impacto causado pela LAI no processo de provimento de informação e na disponibilidade da informação institucional para a sociedade, no contexto do amplo acesso às informações públicas, desejável na Câmara. A pesquisa, de caráter documental, firma-se em documentos e na legislação produzidos na esfera da Câmara dos Deputados. Para o estudo do caso, utilizou-se entrevista com servidores da Corpi, onde se colheram impressões sobre o impacto da LAI na dinâmica do trabalho de atendimento e pesquisa, identificaram-se os principais problemas percebidos e as suas sugestões de melhoria. Discorre-se, também, subsidiariamente, sobre a gestão da informação como parte do ciclo informacional e condição para o acesso à informação, tópico central desta pesquisa. Aborda-se a questão da cidadania e do controle social, bem o direito à informação e transparência governamental que subjazem à proposta de amplo acesso à informação pública preconizada pela LAI, em razão da mudança de paradigma e do regime de informação a que a LAI conduz. O estudo dos efeitos da LAI no âmbito da Câmara teve como marco temporal o período de maio a dezembro de 2012. Estima-se que os indicadores desta pesquisa possam contribuir com estudos futuros relacionados com a governança da informação na Câmara.

Phase II Low Intensity Chemical Dosing (LICD): Development of Management Practices

(pdf contains 265 pages)