Diversidad genética y estructura poblacional de caballa ("Scomber colias", Gmelin, 1789) en aguas del Atlántico y del Mediterráneo

Programa de doctorado: Oceanografía, Bienio 2007/09. La fecha de publicación es la fecha de lectura

Avaliação do papel dos polimorfismos em enzimas metabolizadoras e enzimas transportadoras de fármacos em neoplasias hematológicas

O cancro é um dos maiores causadores globais de mortalidade e morbilidade, ocorrendo cerca de 14 milhões de novos casos por ano e 8,2 milhões de mortes anuais com esta patologia, números que tendem a aumentar 70% nas próximas duas décadas. A característica tumoral mais nefasta é a sua capacidade de metastização para outros órgãos, um mecanismo que pode ser despoletado pela falha dos mecanismos normais de controlo de crescimento, proliferação e reparação celulares, que facilita o processo de transformação de células normais em células cancerígenas. A oncogénese processa-se em três etapas, a iniciação, a promoção e a progressão e pode ter origem em células estaminais cancerígenas, que regulam as capacidades de propagação e recidiva do tumor. As neoplasias hematológicas resultam de alterações genéticas e /ou epigenéticas que conduzem à desregulação da proliferação, ao bloqueio da diferenciação e/ou à resitência à apoptose. Para além dos fatores de risco exógenos, como agentes carcinogénicos físicos, químicos e biológicos, existem também fatores endógenos, incluindo características genéticas, que podem alterar a predisposição para o aparecimento de neoplasias, bem como influenciar a resposta à terapêutica. Uma das terapêuticas aplicadas no tratamento do cancro é a quimioterapia. Os fármacos administrados a doentes oncológicos seguem normalmente o percurso de absorção, distribuição, metabolização e eliminação. Este curso pode sofrer alterações caso as proteínas transportadoras e metabolizadoras necessárias não atuem corretamente. Para um melhor conhecimento da influência das alterações provocadas por variações nos genes que codificam proteínas transportadoras de efluxo (MDR1, MRP1), proteínas de influxo (OCTN2) e proteínas metabolizadoras (UCK2), o objetivo deste trabalho consistiu na avaliação de polimorfismos nos genes MDR1, MRP1, OCTN2 e UCK2 e da sua relação com a predisposição para o desenvolvimento de neoplasias hematológicas. Para isto, foram utilizadas amostras de 307 doentes com neoplasias hematológicas, 83 de Síndrome Mielodisplásica (SMD), 63 Leucemia Mieloide Aguda (LMA), 16 de Síndrome Mielodisplásica/Neoplasias Mieloproliferativas (SMD/NMP), 77 de Mieloma Múltiplo (MM) e 68 de Gamapatia Monoclonal de Significado Indeterminado (MGUS) e 164 de controlos não neoplásicos e/ou indivíduos saudáveis. As amostras de ADN foram extraídas do sangue periférico com protocolo adequado. De forma a determinar os genótipos correspondentes a cada amostra, realizaram-se técnicas de RFLP-PCR e ARMS-PCR. Posteriormente, calcularam-se estatisticamente as frequências alélicas e genotípicas relativas às variantes polimórficas dos genes MDR1, MRP1, OCTN2 e UCK2 e verificou-se se estavam em Equilíbrio de Hardy-Weinberg. De seguida, avaliou-se a força de associação entre as formas polimórficas e o risco de desenvolvimento de neoplasias hematológicas, através do cálculo do risco relativo por análise de regressão logística. Avaliaram-se ainda os perfis genéticos e a possível relação com o desenvolvimento e progressão da neoplasia com recurso a regressão logística e análise de Kaplan-Meier. De um modo geral as frequências alélicas e genotípicas não se revelaram alteradas comparativamente ao esperado. A análise do odds ratio associado ao polimorfismo rs1045642 do gene MDR1 revelou que o genótipo CT pode constituir um fator de risco aumentado de 1,84x para o desenvolvimento de Gamapatias Monoclonais e 2,27x para o desenvolvimento de Mieloma Múltiplo. Por outro lado, a presença de genótipos portadores do alelo T têm um efeito protetor no desenvolvimento de MM (OR=0,41). O cálculo do risco associado ao polimorfismo rs4148330 do gene MRP1 revela que o genótipo AG é um fator protetor (OR=0,50) para o desenvolvimento de LMA, assim como o alelo G (OR=0,50). Além disso, verificámos que existe uma associação de risco de desenvolver neoplasia com o polimorfismo rs2185268 do gene UCK2. De facto, a presença dos genótipos CC e AC representam um fator de risco 4,59x aumentado para o desenvolvimento de SMD/NMP. O polimorfismo rs274561 do gene OCTN2 não apresenta relação com o risco relativo de desenvolvimento neoplásico. Da avaliação da influência dos polimorfismos em estudo na sobrevivência global dos doentes, podemos assumir que a presença do genótipo GG relativo ao polimorfismo rs2185268 do gene UCK2 representa uma diminuição da sobrevivência em 11 meses. Os resultados obtidos a partir do nosso estudo permitem-nos concluir que os polimorfismos podem ser fatores relevantes na predisposição para o desenvolvimento de neoplasias hematológicas e na progressão destas doenças.

Characterization of 27 microsatellite loci in the European flat oyster Ostrea edulis

The flat oyster Ostrea edulis is native to Europe and populations have been severely depleted by the parasite Bonamia ostreae since the 1980s. Additional genetic markers are required to improve population genetics study and linkage map development for selection for B. ostrea-resistance in this species. Here, we characterized 27 novel microsatellite loci for O. edulis. Number of alleles per locus ranged from 6 to 25 and observed heterozygosity between 0.375 and 1. Null alleles were suggested at a few loci but most loci were in Hardy-Weinberg agreement enabling their reliable use in further population and mapping genetics approaches.

All one-loop scalar vertices in the effective potential approach

Using the one-loop Coleman-Weinberg effective potential, we derive a general analytic expression for all the derivatives of the effective potential with respect to any number of classical scalar fields. The result is valid for a renormalisable theory in four dimensions with any number of scalars, fermions or gauge bosons. This result corresponds to the zero-external momentum contribution to a general one-loop diagram with N scalar external legs. We illustrate the use of the general result in two simple scalar singlet extensions of the Standard Model, to obtain the dominant contributions to the triple couplings of light scalar particles under the zero external momentum approximation.

Etude électrophorétique des protéines solubles du cristallin de la sardine (Clupea pilchardus Walb.) du Golfe du Lion

The eye lens proteins electrophoresis of pilchard of the Gulf of Lion (Clupea pilchardus Walb.) shows the existence of 2 sub-populations. The hypothesis of an hereditary control by two co-dominant allels is in agreement with the expected Hardy-Weinberg distribution.

Rare sex or out of reach equilibrium? The dynamics of F-IS in partially clonal organisms

Background: Partially clonal organisms are very common in nature, yet the influence of partial asexuality on the temporal dynamics of genetic diversity remains poorly understood. Mathematical models accounting for clonality predict deviations only for extremely rare sex and only towards mean inbreeding coefficient (F-IS) over bar < 0. Yet in partially clonal species, both F-IS < 0 and F-IS > 0 are frequently observed also in populations where there is evidence for a significant amount of sexual reproduction. Here, we studied the joint effects of partial clonality, mutation and genetic drift with a state-and-time discrete Markov chain model to describe the dynamics of F-IS over time under increasing rates of clonality. Results: Results of the mathematical model and simulations show that partial clonality slows down the asymptotic convergence to F-IS = 0. Thus, although clonality alone does not lead to departures from Hardy-Weinberg expectations once reached the final equilibrium state, both negative and positive F-IS values can arise transiently even at intermediate rates of clonality. More importantly, such "transient" departures from Hardy Weinberg proportions may last long as clonality tunes up the temporal variation of F-IS and reduces its rate of change over time, leading to a hyperbolic increase of the maximal time needed to reach the final mean (F-IS,F-infinity) over bar value expected at equilibrium. Conclusion: Our results argue for a dynamical interpretation of F-IS in clonal populations. Negative values cannot be interpreted as unequivocal evidence for extremely scarce sex but also as intermediate rates of clonality in finite populations. Complementary observations (e.g. frequency distribution of multiloci genotypes, population history) or time series data may help to discriminate between different possible conclusions on the extent of clonality when mean (F-IS) over bar values deviating from zero and/or a large variation of F-IS over loci are observed.

A truncation in the Aryl Hydrocarbon Receptor of the CRL:WI(Han) rat does not affect the developmental toxicity of TCDD

The Aryl Hydrocarbon Receptor (AhR) is required for the toxicity of TCDD, and so the AhR of CRL:WI and CRL:WI(Han) rats was characterised. Western blot showed AhR proteins of ~110 and ~97 kDa in individual rats from both strains. The AhR cDNA from a CRL:WI(Han) rat with the ~110kDa protein revealed a sequence that was identical to that of the CRL:WI and SD rat. However, cloning of the AhR from a rat with the ~97kDa protein revealed a point mutation, and five variants encoding two C-terminally truncated variants of the AhR protein, arising from a point mutation in the intron/exon junction and consequent differential splicing. These C-terminally truncated variants were expressed and shown to give rise to a protein of ~97kDa; the recombinant AhR bound TCDD with an affinity that was not statistically different from the full-length protein. A single-nucleotide polymorphism (SNP) assay was developed, and showed that both alleles were represented in a Hardy-Weinberg equilibrium in samples of CRL:WI and CRL:WI(Han) populations; both alleles are abundant. Rats from two studies of TCDD developmental toxicity were genotyped, and the association with toxicity investigated using statistical analysis. There was no plausible evidence that the AhR allele had a significant effect on the toxic endpoints examined. These data show that the two AhR alleles are common in two strains of Wistar rat, and that the AhR alleles had no effect on TCDD-induced developmental toxicity in two independent studies.

Infección por virus sincitial respiratorio y su relación con valores de IGG en niños críticos

Antecedente: La infección por el virus sincitial respiratorio (VSR) representa una elevada morbimortalidad, y en algunos casos necesidad de manejo en unidades de cuidado intensivo pediátrico (UCIP). La respuesta inmunológica influye de manera directa en la expresión de la severidad y pronóstico de los pacientes con infección respiratoria. Metodología: Estudio de una cohorte retrospectiva de pacientes con infección respiratoria grave secundaria a VSR, sin historia de inmunodeficiencia, atendidos en la UCIP del Hospital Universitario Clínica San Rafael. Se realizó análisis descriptivoglobaly de acuerdo a la categorización de las prueba de IgG. Resultados: De 188 pacientes que ingresaron a la UCIP, 13% presentaron infección por VSR (24), con una edad promedio de 7,3 (DE=3,6) meses. Pertenecían al sexo masculino79,83%. Se encontró que 12,5% tenían un valor de IgGbajo para su edad, 58,33% tenían valores en límite inferior y el 29,17% dentro de rangos normales para su edad. En los pacientes con IgG baja, fue mayor la presentación de choque séptico que no responde a líquidos (100 vs 92 vs 86%), la mediana de días de ventilación mecánica fue mayor (8 vs 6 vs 5 respectivamente), así como la mortalidad (67 vs 7,1 vs 0%). Conclusión: Nuestra serie encontró que aquellos pacientes con niveles bajos o valores en el límite inferior de IgG sérica tuvieron mayor compromiso sistémico, mayor duración de ventilación mecánica y mayor mortalidad. Se necesitan estudios prospectivos que relaciones niveles bajos de IgG con severidad y pronostico en estos pacientes con infección grave por VSR.

Prevalencia e incidencia de cáncer en habitantes de Sibaté, y georeferenciación de casos 2010-2014

Introducción: El Cáncer es prevenible en algunos casos, si se evita la exposición a sustancias cancerígenas en el medio ambiente. En Colombia, Cundinamarca es uno de los departamentos con mayores incrementos en la tasa de mortalidad y en el municipio de Sibaté, habitantes han manifestado preocupación por el incremento de la enfermedad. En el campo de la salud ambiental mundial, la georreferenciación aplicada al estudio de fenómenos en salud, ha tenido éxito con resultados válidos. El estudio propuso usar herramientas de información geográfica, para generar análisis de tiempo y espacio que hicieran visible el comportamiento del cáncer en Sibaté y sustentaran hipótesis de influencias ambientales sobre concentraciones de casos. Objetivo: Obtener incidencia y prevalencia de casos de cáncer en habitantes de Sibaté y georreferenciar los casos en un periodo de 5 años, con base en indagación de registros. Metodología: Estudio exploratorio descriptivo de corte transversal,sobre todos los diagnósticos de cáncer entre los años 2010 a 2014, encontrados en los archivos de la Secretaria de Salud municipal. Se incluyeron unicamente quienes tuvieron residencia permanente en el municipio y fueron diagnosticados con cáncer entre los años de 2010 a 2104. Sobre cada caso se obtuvo género, edad, estrato socioeconómico, nivel académico, ocupación y estado civil. Para el análisis de tiempo se usó la fecha de diagnóstico y para el análisis de espacio, la dirección de residencia, tipo de cáncer y coordenada geográfica. Se generaron coordenadas geográficas con un equipo GPS Garmin y se crearon mapas con los puntos de la ubicación de las viviendas de los pacientes. Se proceso la información, con Epi Info 7 Resultados: Se encontraron 107 casos de cáncer registrados en la Secretaria de Salud de Sibaté, 66 mujeres, 41 hombres. Sin división de género, el 30.93% de la población presento cáncer del sistema reproductor, el 18,56% digestivo y el 17,53% tegumentario. Se presentaron 2 grandes casos de agrupaciones espaciales en el territorio estudiado, una en el Barrio Pablo Neruda con 12 (21,05%) casos y en el casco Urbano de Sibaté con 38 (66,67%) casos. Conclusión: Se corroboro que el análisis geográfico con variables espacio temporales y de exposición, puede ser la herramienta para generar hipótesis sobre asociaciones de casos de cáncer con factores ambientales.

Polymorphisms in the DGAT1 gene in buffaloes (Bubalus bubalis) in the Amazon.

Water buffaloes (Bubalus bubalis) are quite well adapted to climatic conditions in the Amazon, and in this biome, they are noted for the considerable amount of meat and milk they produce and how hard they are able to work. Because of a lack of research dedicated to improving the rearing of buffaloes in the Amazon, the objective of this study was to genetically characterize the Murrah and Mediterranean breeds, as well as a mixed-breed population, based on polymorphisms in the diacylglycerol O-acyltransferase 1 gene (DGAT1), and associate the genotypes with milk production. By using the polymerase chain reaction-single-strand conformation polymorphism technique, the alleles A (0.79), B (0.20), and D (0.01) were found in the Murrah breed. In the Mediterranean and mixed-breed buffaloes, we found alleles A (0.69) and (0.77) and B (0.31) and (0.23), respectively. The Murrah breed had the genotypes AA (0.63), AB (0.29), BB (0.05), and AD (0.03), and the Mediterranean and mixed-breed buffaloes had the genotypes AA (0.44) and (0.61), AB (0.50) and (0.31), and BB (0.06) and (0.08), respectively. For the Murrah, Mediterranean, and mixedbreed buffaloes, respectively, the expected heterozygosity values were 0.34, 0.43, and 0.35, the inbreeding coefficients were 0.78, -0.15, and 0.17, and the Hardy-Weinberg probabilities were 0.70, 0.67, and 0.52. The genotypes evaluated did not have an effect on milk production; however, the single nucleotide polymorphisms can be used in studies on genetic variability.

Adentrarse en el exilio

La presente obra se despliega a partir de esta gran pregunta: ¿cuál fue la respuesta de los intelectuales y escritores centroamericanos especialmente de -Costa Rica, Guatemala y Nicaragua– ante la Guerra Civil Española? Las reacciones a las cada vez más cruentas noticias que llegaban de España provinieron de distintos sectores de la sociedad, y particularmente de su inteligencia crítica, que a su vez las tradujo en grandes obras. Mario Oliva se dedica a hacer un seguimiento en dos géneros privilegiados: poesía y ensayo.

El ensayo como espacio de amistad intelectual

El presente trabajo expone cómo las condiciones materiales de producción y las redes de sociabilidad intelectual constituyen elementos fundamentales de aproximación al ensayo y constituye un espacio simbólico de amistad en las ideas que permea el propio texto. Importa analizar la forma cómo se tejen redes de afinidades y redes de sentido.

Polymorphic microsatellite loci from the endangered Giant Otter (Pteronura brasiliensis).

We describe the first microsatellite loci isolated from the giant otter (Pteronura brasiliensis), an endangered mustelid endemic to South America. Fourteen di- and trinucleotide polymorphic loci were characterised in fourteen individuals from the Pantanal wetlands, Central Brazil. Number of alleles per locus ranged from 2 to 5, and average observed heterozygosity was 0.577. Two loci were in linkage disequilibrium, and one further locus deviated from Hardy?Weinberg equilibrium, probably due to the presence of null alleles. The transferability of these markers to two other mustelids (Lontra longicaudis and Eira barbara) and to the mephitid Conepatus semistriatus was also evaluated. These loci are useful to study the ecology and evolution of these species.