Modeling Techniques for the High-Resolution Interpretation of Cryo-Electron Microscopy Reconstructions

Essential biological processes are governed by organized, dynamic interactions between multiple biomolecular systems. Complexes are thus formed to enable the biological function and get dissembled as the process is completed. Examples of such processes include the translation of the messenger RNA into protein by the ribosome, the folding of proteins by chaperonins or the entry of viruses in host cells. Understanding these fundamental processes by characterizing the molecular mechanisms that enable then, would allow the (better) design of therapies and drugs. Such molecular mechanisms may be revealed trough the structural elucidation of the biomolecular assemblies at the core of these processes. Various experimental techniques may be applied to investigate the molecular architecture of biomolecular assemblies. High-resolution techniques, such as X-ray crystallography, may solve the atomic structure of the system, but are typically constrained to biomolecules of reduced flexibility and dimensions. In particular, X-ray crystallography requires the sample to form a three dimensional (3D) crystal lattice which is technically di‑cult, if not impossible, to obtain, especially for large, dynamic systems. Often these techniques solve the structure of the different constituent components within the assembly, but encounter difficulties when investigating the entire system. On the other hand, imaging techniques, such as cryo-electron microscopy (cryo-EM), are able to depict large systems in near-native environment, without requiring the formation of crystals. The structures solved by cryo-EM cover a wide range of resolutions, from very low level of detail where only the overall shape of the system is visible, to high-resolution that approach, but not yet reach, atomic level of detail. In this dissertation, several modeling methods are introduced to either integrate cryo-EM datasets with structural data from X-ray crystallography, or to directly interpret the cryo-EM reconstruction. Such computational techniques were developed with the goal of creating an atomic model for the cryo-EM data. The low-resolution reconstructions lack the level of detail to permit a direct atomic interpretation, i.e. one cannot reliably locate the atoms or amino-acid residues within the structure obtained by cryo-EM. Thereby one needs to consider additional information, for example, structural data from other sources such as X-ray crystallography, in order to enable such a high-resolution interpretation. Modeling techniques are thus developed to integrate the structural data from the different biophysical sources, examples including the work described in the manuscript I and II of this dissertation. At intermediate and high-resolution, cryo-EM reconstructions depict consistent 3D folds such as tubular features which in general correspond to alpha-helices. Such features can be annotated and later on used to build the atomic model of the system, see manuscript III as alternative. Three manuscripts are presented as part of the PhD dissertation, each introducing a computational technique that facilitates the interpretation of cryo-EM reconstructions. The first manuscript is an application paper that describes a heuristics to generate the atomic model for the protein envelope of the Rift Valley fever virus. The second manuscript introduces the evolutionary tabu search strategies to enable the integration of multiple component atomic structures with the cryo-EM map of their assembly. Finally, the third manuscript develops further the latter technique and apply it to annotate consistent 3D patterns in intermediate-resolution cryo-EM reconstructions. The first manuscript, titled An assembly model for Rift Valley fever virus, was submitted for publication in the Journal of Molecular Biology. The cryo-EM structure of the Rift Valley fever virus was previously solved at 27Å-resolution by Dr. Freiberg and collaborators. Such reconstruction shows the overall shape of the virus envelope, yet the reduced level of detail prevents the direct atomic interpretation. High-resolution structures are not yet available for the entire virus nor for the two different component glycoproteins that form its envelope. However, homology models may be generated for these glycoproteins based on similar structures that are available at atomic resolutions. The manuscript presents the steps required to identify an atomic model of the entire virus envelope, based on the low-resolution cryo-EM map of the envelope and the homology models of the two glycoproteins. Starting with the results of the exhaustive search to place the two glycoproteins, the model is built iterative by running multiple multi-body refinements to hierarchically generate models for the different regions of the envelope. The generated atomic model is supported by prior knowledge regarding virus biology and contains valuable information about the molecular architecture of the system. It provides the basis for further investigations seeking to reveal different processes in which the virus is involved such as assembly or fusion. The second manuscript was recently published in the of Journal of Structural Biology (doi:10.1016/j.jsb.2009.12.028) under the title Evolutionary tabu search strategies for the simultaneous registration of multiple atomic structures in cryo-EM reconstructions. This manuscript introduces the evolutionary tabu search strategies applied to enable a multi-body registration. This technique is a hybrid approach that combines a genetic algorithm with a tabu search strategy to promote the proper exploration of the high-dimensional search space. Similar to the Rift Valley fever virus, it is common that the structure of a large multi-component assembly is available at low-resolution from cryo-EM, while high-resolution structures are solved for the different components but lack for the entire system. Evolutionary tabu search strategies enable the building of an atomic model for the entire system by considering simultaneously the different components. Such registration indirectly introduces spatial constrains as all components need to be placed within the assembly, enabling the proper docked in the low-resolution map of the entire assembly. Along with the method description, the manuscript covers the validation, presenting the benefit of the technique in both synthetic and experimental test cases. Such approach successfully docked multiple components up to resolutions of 40Å. The third manuscript is entitled Evolutionary Bidirectional Expansion for the Annotation of Alpha Helices in Electron Cryo-Microscopy Reconstructions and was submitted for publication in the Journal of Structural Biology. The modeling approach described in this manuscript applies the evolutionary tabu search strategies in combination with the bidirectional expansion to annotate secondary structure elements in intermediate resolution cryo-EM reconstructions. In particular, secondary structure elements such as alpha helices show consistent patterns in cryo-EM data, and are visible as rod-like patterns of high density. The evolutionary tabu search strategy is applied to identify the placement of the different alpha helices, while the bidirectional expansion characterizes their length and curvature. The manuscript presents the validation of the approach at resolutions ranging between 6 and 14Å, a level of detail where alpha helices are visible. Up to resolution of 12 Å, the method measures sensitivities between 70-100% as estimated in experimental test cases, i.e. 70-100% of the alpha-helices were correctly predicted in an automatic manner in the experimental data. The three manuscripts presented in this PhD dissertation cover different computation methods for the integration and interpretation of cryo-EM reconstructions. The methods were developed in the molecular modeling software Sculptor (http://sculptor.biomachina.org) and are available for the scientific community interested in the multi-resolution modeling of cryo-EM data. The work spans a wide range of resolution covering multi-body refinement and registration at low-resolution along with annotation of consistent patterns at high-resolution. Such methods are essential for the modeling of cryo-EM data, and may be applied in other fields where similar spatial problems are encountered, such as medical imaging.

The SanaViz: Human Centered Geovisualization to facilitate visual exploration of Public Health data

These three manuscripts are presented as a PhD dissertation for the study of using GeoVis application to evaluate telehealth programs. The primary reason of this research was to understand how the GeoVis applications can be designed and developed using combined approaches of HC approach and cognitive fit theory and in terms utilized to evaluate telehealth program in Brazil. First manuscript The first manuscript in this dissertation presented a background about the use of GeoVisualization to facilitate visual exploration of public health data. The manuscript covered the existing challenges that were associated with an adoption of existing GeoVis applications. The manuscript combines the principles of Human Centered approach and Cognitive Fit Theory and a framework using a combination of these approaches is developed that lays the foundation of this research. The framework is then utilized to propose the design, development and evaluation of “the SanaViz” to evaluate telehealth data in Brazil, as a proof of concept. Second manuscript The second manuscript is a methods paper that describes the approaches that can be employed to design and develop “the SanaViz” based on the proposed framework. By defining the various elements of the HC approach and CFT, a mixed methods approach is utilized for the card sorting and sketching techniques. A representative sample of 20 study participants currently involved in the telehealth program at the NUTES telehealth center at UFPE, Recife, Brazil was enrolled. The findings of this manuscript helped us understand the needs of the diverse group of telehealth users, the tasks that they perform and helped us determine the essential features that might be necessary to be included in the proposed GeoVis application “the SanaViz”. Third manuscript The third manuscript involved mix- methods approach to compare the effectiveness and usefulness of the HC GeoVis application “the SanaViz” against a conventional GeoVis application “Instant Atlas”. The same group of 20 study participants who had earlier participated during Aim 2 was enrolled and a combination of quantitative and qualitative assessments was done. Effectiveness was gauged by the time that the participants took to complete the tasks using both the GeoVis applications, the ease with which they completed the tasks and the number of attempts that were taken to complete each task. Usefulness was assessed by System Usability Scale (SUS), a validated questionnaire tested in prior studies. In-depth interviews were conducted to gather opinions about both the GeoVis applications. This manuscript helped us in the demonstration of the usefulness and effectiveness of HC GeoVis applications to facilitate visual exploration of telehealth data, as a proof of concept. Together, these three manuscripts represent challenges of combining principles of Human Centered approach, Cognitive Fit Theory to design and develop GeoVis applications as a method to evaluate Telehealth data. To our knowledge, this is the first study to explore the usefulness and effectiveness of GeoVis to facilitate visual exploration of telehealth data. The results of the research enabled us to develop a framework for the design and development of GeoVis applications related to the areas of public health and especially telehealth. The results of our study showed that the varied users were involved with the telehealth program and the tasks that they performed. Further it enabled us to identify the components that might be essential to be included in these GeoVis applications. The results of our research answered the following questions; (a) Telehealth users vary in their level of understanding about GeoVis (b) Interaction features such as zooming, sorting, and linking and multiple views and representation features such as bar chart and choropleth maps were considered the most essential features of the GeoVis applications. (c) Comparing and sorting were two important tasks that the telehealth users would perform for exploratory data analysis. (d) A HC GeoVis prototype application is more effective and useful for exploration of telehealth data than a conventional GeoVis application. Future studies should be done to incorporate the proposed HC GeoVis framework to enable comprehensive assessment of the users and the tasks they perform to identify the features that might be necessary to be a part of the GeoVis applications. The results of this study demonstrate a novel approach to comprehensively and systematically enhance the evaluation of telehealth programs using the proposed GeoVis Framework.

Proceedings of the Twenty-Fifth Annual Biochemical Engineering Symposium

The Annual Biochemical Engineering Symposium Series started in 1970 when Professors Larry E. Erickson (Kansas State University) and Peter J. Reilly (then with University of Nebraska-Lincoln) got together in Manhattan, KS along with their students for a half-day powwow and technical presentation by their students. Ever since then, it has been a forum for Biochemical Engineering students in the heartland of USA to present their research to their colleagues in the form of talks and posters. The institutions actively involved with this annual symposium include Colorado State University, Kansas State University, Iowa State University, University of Colorado, University of Kansas, University of Missouri-Columbia, and University of Oklahoma. The University of lowa and University of Nebraska-Lincoln have also participated in the conference in recent years. The host institutions for the different symposia have been: Kansas State University (1, 3, 5, 9, 12, 16, 20), Iowa State University (6, 7, 10, 13, 17, 22), University of Missouri-Columbia (8, 14, 19, 25), Colorado State University (II, 15, 21), University of Colorado (18, 24), University of Nebraska-Lincoln (2, 4), University of Oklahoma (23). The next symposium will be held at Kansas State University. Proceedings of the Symposium are edited by faculty of the host institution and include manuscripts written and submitted by the presenters (students). These often include works-in-progress and final publication usually takes place in refereed journals. ContentsPatrick C. Gilcrease and Vincent G. Murphy, Colorado State University. Use of 2,4,6-Trinitrotoluene (TNT) As A Nitrogen Source By A Pseudomonas florescens Species Under Aerobic Conditions. Marulidharan Narayanan, Lawrence C. Davis, and Larry E. Erickson, Kansas State University. Biodegradation Studies of Chlorinated Organic Pollutants in a Chamber in the Presence of Alfalfa Plants. S.K. Santharam, L.E. Erickson, and L.T. Fan, Kansas State University.Surfactant-Enhanced Remediation of a Non-Aqueous Phase Contaminant in Soil. Barry Vant-Hull, Larry Gold, and Robert H. Davis, University of Colorado.The Binding of T7 RNA Polymerase to Double-Stranded RNA. Jeffrey A. Kern and Robert H. Davis, University of Colorado.Improvement of RNA Transcription Yield Using a Fed-Batch Enzyme Reactor. G. Szakacs, M. Pecs, J. Sipocz, I. Kaszas, S.R. Deecker, J.C. Linden, R.P. Tengerdy, Colorado State University.Bioprocessing of Sweet Sorghum With In Situ Produced Enzymes. Brad Forlow and Matthias Nollert, University of Oklahoma.The Effect of Shear Stress ad P-selectin Site Density on the Rolling Velocity of White Blood Cells. Martin C. Heller and Theodore W. Randolph, University of Colorado.The Effects of Plyethylene Glycol and Dextran on the Lyophilization of Human Hemoglobin. LaToya S. Jones and Theodore W. Randolph, University of Colorado.Purification of Recombinant Hepatitis B Vaccine: Effect of Virus/Surfactant Interactions. Ching-Yuan Lee, Michael G. Sportiello, Stephen Cape, Sean Ferree, Paul Todd, Craig E. Kundrot, and Cindy Barnes, University of Colorado.Application of Osmotic Dewatering to the Crystallization of Oligonucleotides for Crystallography. Xueou Deng, L.E. Erickson, and D.Y.C. Fung, Kansas State University.Production of Protein-Rich Beverages from Cheese Whey and Soybean by rapid Hydration Hydrothermal Cooking. Pedro M. Coutinho, Michael K. Dowd, and Peter J. Reilly, Iowa State University.Automated Docking of Glucoamylase Substrates and Inhibitors. J. Johansson and R.K. Bajpai, University of Missouri.Adsorption of Albumin on Polymeric Microporous Membranes.

Grapholita molesta

La larva de Grapholita molesta (Busck), que produce daños en brotes y frutos de carozo y de pepita, fue criada en condiciones artificiales con dietas a base de granos y otros nutrientes. Se prepararon y evaluaron siete dietas con poroto, garbanzo, arveja, maíz, soja, trigo y avena. Los objetivos del trabajo fueron: 1. Evaluar dietas con granos de cultivares locales. 2. Evaluar las características físico-químicas (pH y sólidos solubles). 3. Evaluar la eficiencia mediante ciclo biológico, grados día, viabilidad, peso de pupas, recuperación de huevo a adulto, fecundidad y adultos esperados. 4. Determinar costos y rendimientos. El análisis de los parámetros biológicos y económicos indicó que las dietas de menor costo y mayor rendimiento fueron, en orden decreciente, poroto y garbanzo, pero la primera además presentó características físicoquímicas similares a la dieta preferencial de la larva salvaje: los brotes de duraznero.

Evaluación sensorial de mermeladas de tomate de color no tradicional

Nuevas cultivares de tomate, de colores distintos al tradicional rojo, se adaptan a la elaboración de productos alternativos, como las confituras. Se estudió la aceptabilidad por parte del consumidor de mermeladas elaboradas con las variedades Victoria FCA, Don Armando FCA y Santa Rosa FCA. Sus frutos: amarillos, anaranjados y rojos, respectivamente, fueron caracterizados por color, peso, acidez: titulable y potencial, y sólidos solubles. Las mermeladas, aromatizadas con clavo de olor, se elaboraron en una planta experimental hasta concentración 67-69 % de sólidos solubles. Un panel de 39 consumidores -clasificados en menores y mayores de 30 años- evaluó aspecto, color, aroma, textura y sabor, aplicando escalas no estructuradas. Las evaluaciones de ambos grupos fueron distintas. Para todas las características sensoriales la prueba de Friedman indicó diferencias entre los tres productos (a = 0,001). En una escala para cinco categorías, más del 50 % de los jueces consideraron las tres mermeladas en las categorías más altas: me gusta y me gusta mucho. El análisis de los datos categóricos de preferencia otorgó el primer lugar a la variedad roja, seguida por la anaranjada y la amarilla. Podría existir un segmento de consumidores interesados en el desarrollo de confituras de tomate amarillo, pero en el caso específico de la mermelada, tuvo mayor aceptabilidad el producto de color igual o parecido al tradicional.

Flora de un área de la Sierra La Barrosa (Balcarce) y fenología de especies con potencial ornamental

Los objetivos de este trabajo fueron inventariar la flora vascular en un área de la Sierra La Barrosa (Sistema de Tandilia, Buenos Aires), determinar la utilidad actual o potencial de las especies e iniciar un estudio fenológico preliminar in situ de 10 especies nativas de interés ornamental. El relevamiento florístico se realizó en un sector de la cima y laderas y se elaboró una base de datos con registros taxonómicos, origen, ciclo, forma biológica y utilidad de las especies. Se identificaron 204 especies, pertenecientes a 51 familias y 135 géneros; de ellas 70,6% son nativas no endémicas; 9,31% endémicas y 20,1% exóticas. El 76% de las especies son perennes y predominan las hemicriptófitas (41,2%). El 65% de las especies inventariadas tiene interés agronómico por su utilidad potencial como medicinal (21,5%), ornamental (25%), forrajera (13,7%), o por ser malezas o tóxicas (13,2 %). Por su potencial ornamental (hábito, atributos del follaje, flores e inflorescencias), se efectuó un estudio fenológico en Achyrocline satureioides, Eupatorium subhastatum, E. tanacetifolium, Hysterionica pinifolia, Senecio pulcher, Sommerfeltia spinulosa, Lathyrus pubescens, Mimosa rocae, Pavonia cymbalaria y Gomphrena perennis, que indicó diferencias en la época y duración de la floración.

Prescripción de medicamentos en las farmacias : una realidad preocupante

Se presume que la prescripción de medicamentos sin receta médica en las farmacias es una práctica frecuente. El objetivo fue conocer la conducta del personal de las farmacias ante una consulta realizada por estudiantes de medicina entrenados para actuar como pacientes simulados de las siguientes situaciones: 1: Infección respiratoria alta, 2: Diarrea aguda; 3: Disuria, 4: Ulcera genital, 5: Hipertensión arterial, 6: Cefalea aguda, 7: Artralgia de tobillo. Se efectuaron 100 entrevistas y cada una de las situaciones se realizó al menos 12 veces. En solo el 28% de los casos no se indicó tratamiento y las 72 prescripciones fueron realizadas por 38 farmacéuticos y 34 no profesionales. La medicación se consideró inadecuada en 58.3%, iatrogénica en 51.4% y la posología incorrecta en 50%. Los fármacos más indicados fueron antibióticos (23.6%), AINES (20.8%), antidiarreicos (11.8%) y antigripales (9.7%). Las situaciones 7 (100%), 1 (93.3%) y 2 (84.6%) tuvieron la mayor frecuencia de indicación de tratamiento y fue significativa la negativa a medicar en las situaciones 4 (OR, 0.16) y 5 (OR, 0.22) (p<0.05). La prescripción fue incorrecta en el 100% de las situaciones 2 y 4 y iatrogénica en el 100% de las situaciones 2, 4 y 5. En 48 casos se sugirió consulta médica y la situación 5 tuvo 4.27 veces más posibilidades de ser derivada (p= 0.01). Este estudio demuestra que en las farmacias del gran Mendoza es común la venta de medicamentos sin prescripción médica lo que compromete la seguridad y salud de las personas.

Estructura y dinámica de un bosque de Lenga (Nothofagus pumilio (Poepp. et Endl.) Krasser) bajo disturbios naturales en el valle del Río Toro, provincia de Santa Cruz, Argentina

El empleo de técnicas dendroecológicas fue efectivo para evaluar las variaciones temporales y espaciales de disturbios naturales, como los volteos por vientos y las avalanchas de nieve de un bosque de Nothofagus pumilio en el valle del Río Toro, provincia de Santa Cruz, Argentina. Se realizó un muestreo de 264 árboles en dos transectas de 1750 m de longitud con una diferencia altitudinal de 148 m, paralelas entre sí dispuestas en forma perpendicular a la pendiente. Los bosques a diferentes altitudes no presentaron diferencias significativas en las proporciones de individuos vivos y muertos, ni en el estado del fuste muerto al momento del muestreo. La distribución de las clases de edad de los árboles muertos indicó que la mortalidad es independiente a la longevidad de los árboles. El intervalo promedio entre eventos de mortalidad fue de 4,5 y 8,2 años para el bosque de mayor y menor altitud, respectivamente. Sin embargo, se encontraron diferencias significativas en la altura, el diámetro y la edad en dichos bosques. El bosque situado a menor altitud presentó árboles con mayores edades, de mayor altura y diámetros superiores. A su vez, este bosque presentó mayores tasas de crecimiento y área basimétrica por hectárea y se caracterizó por una menor densidad de árboles y de renovales. En ambos bosques, se observaron frecuencias máximas de establecimientos de individuos durante el período 1850-1860. La construcción de cronologías de disturbios determinó que la frecuencia y la magnitud de los eventos de disturbios en los bosques variaron según la altitud.

Edad dentaria : adecuación regional de los métodos de Nolla y Demirjian

El presente trabajo aborda los métodos de estimación de las edades dentarias en una población representativa de la región de Cuyo en la República Argentina. Si bien los métodos desarrollados para medir el desarrollo dentario constituyen herramientas de gran utilidad, éstos han sido formulados en conjuntos poblacionales muy acotados. Por ello, el objetivo general de este trabajo ha sido aplicar los métodos tradicionales de medición, obtener datos referenciales de la edad dentaria y evaluar el error de estimación de estos métodos para medir la edad dentaría en la población en estudio. Se calcularon las edades dentarias por los métodos de Nolla y Demirjian sobre 374 estudios panorámicos de niños y adolescentes entre 5 y 17 años, previa estratificación nutricional de la población en estudio y se compararon con edades cronológicas decimales. Los datos obtenidos fueron sometidos a prueba estadística ANOVA y prueba de correlación de Pearson mediante paquete estadístico Graphpad Prism 5. Los resultados obtenidos presentaron correlación adecuada r = 0,92; p < 0,0001, sin embargo revelaron diferencias estadísticamente significativas entre la edad cronológica y las edades dentarias calculadas Test ANOVA p < 0,0001, lo que expresó la limitación diagnóstica de los métodos estudiados al aplicarlos en esta población. El método de Nolla produjo una subestimación, lo que reflejó que nuestra población estuvo atrasada entre 4 y 6 meses respecto a la muestra estudiada para el método. En cambio, el método de Demirjian arrojó una sobrestimación, lo que indicó que nuestra población estuvo adelantada respecto de la muestra estudiada para la realización del método. Estas correcciones calculadas permiten realizar la correcta estimación de la edad dentaria al ser aplicadas a la población de nuestra región.

Control de evolución de antocianos, aplicando la técnica de Ribereau-Gayón en aceitunas negras procesadas, por oxidación de burbujeo y difusión de aire

La producción de aceitunas de mesa, junto con el aceite de oliva, se encuentra en franco aumento, gracias al auge dado en el consumo a estos alimentos. El color es un atributo fundamental en el momento de apreciar su calidad, ya que es lo primero que percibe el consumidor, siendo esta valoración en gran medida subjetiva. Los antocianos, son los pigmentos encargados de dar colores que van desde el rosado al violeta, característico en aceitunas negras pero a diferencia de otros pigmentos, éstos no son estables, especialmente en soluciones alcalinas, manifestándose en la pérdida del color. Se trabajó con la variedad Nevadillo, en tres momentos de cosecha: verdes, pre- envero y envero avanzado. Se aplicaron dos tratamientos de oxidación durante cuatro días: uno por incorporación de aire por burbujeo fino y otro por incorporación de aire por recirculación y solubilización por Venturi. Se aplicó la técnica Ribereau–Gayon para la cuantificación de antocianos y se expresaron en miligramos por litro, en pulpa y líquido de gobierno, utilizando espectrofotometría ultravioleta visible. Se analizó estadísticamente como un experimento factorial con diseño completamente aleatorizado y los datos de la cuantificación de antocianos indicó una diferencia significativa (α=0,005) de orden superior. Con lo cual la cantidad de antocianos depende del momento de cosecha del fruto, la muestra a la que se aplica el método de análisis (pulpa o líquido de cobertura), los tratamientos de oxidación aplicados y los días que se sometieron las aceitunas a esos tratamientos

Evaluación de la potencialidad de uso de Deuterocohnia longipetala (Baker – Mez) “Chaguar", para la revegetación de laderas degradadas por la actividad minera no metalífera

El área de trabajo fue la planta de la cementera Minetti S.A., ubicada en el distrito Capdeville, del departamento Las Heras, al Norte de la ciudad de Mendoza. El objetivo de la presente tesina fue estudiar la propagación por semilla de la especie Deuterocohnia longipetala (Baker - Mez), Bromeliaceae, de uso potencial en la protección de laderas rocosas con pronunciada pendiente. Conocida como “chaguar", se localiza principalmente en los ambientes secos de las exposiciones más cálidas, N y NW, siendo prácticamente nula su presencia en faldeos Sur. Se localiza en las grietas donde la roca aún no ha sido meteorizada. Se midió para distintos tamaños de plantas la biomasa aérea, radical y el suelo retenido hasta 0,30 m de profundidad Se determinó el poder germinativo de la especie de semillas procedentes del departamento de Rivadavia, San Juan. Se relevó la vegetación y la cobertura de las distintas exposiciones de las laderas de preferencia para la especie. El análisis factorial realizado al ensayo en cajas de Petri, indicó que existe interacción entre la luz y la temperatura, produciéndose el mayor número de semillas germinadas a temperaturas de 25° y 30°C con iluminación. En cuanto a los ensayos en speedling, se utilizaron dos tipos de cobertura; nailon oscuro y nailon transparente. El análisis aplicado fue Odds ratio, considerando como alta germinación aquellas celdas con 2 y 3 semillas eclosionadas. El resultado fue que, al final del ensayo no hubo diferencias significativas entre las coberturas. Sin embargo a los 12 días la bandeja con cobertura oscura manifiesta una germinación superior a la cobertura transparente. En la bandeja sin cobertura (testigo), no se obtuvo germinación. La especie manifiesta un lento crecimiento y una gran rusticidad, con lo cual se concluye que es una buena especie para tareas de revegetación y protección de laderas por sus bajos requerimientos en cuidados y mantenimiento, pero su bajo crecimiento puede prolongar demasiado los tiempos necesarios para obtener la protección deseada.

T-388/2009. Objeción de conciencia y aborto: una perspectiva global sobre la experiencia colombiana

Disponible la versión en español y en inglés.

La creación del espacio poético en Momento de Simetría (1973) de Arturo Carrera y en sus manuscritos : Una constante formación de la materia escrituaria

El trabajo explora, desde los aportes de la crítica genética y literaria, la construcción del espacio poético y sus espacios creativos de escritura. Para ello se cuenta con manuscritos del poeta argentino Arturo Carrera, pertenecientes a su segunda obra édita, Momento de simetría [1973]. Partiendo de una referencia astronómica existente en el poemario se revisa lo dicho por la crítica literaria argentina sobre la obra del autor así como también la posibilidad de leer el mapa poético y sus manuscritos como imágenes estéticas en suspensión. Por este motivo, el trabajo cuenta además con un Anexo (en CD) con las imágenes digitales del Archivo Momento de simetría y sus correspondientes transcripciones, a fin de que el lector pueda ir y venir del texto a las imágenes -y viceversa- y construir dicho recorrido

Los manuscritos de El yo y el ello : Una relectura del Icc

Indagamos, a partir de los manuscritos inéditos de Das Ich und das Es, los puntos eminentes instaurados por la lectura de sus tres versiones: borrador, copia en limpio y texto publicado, en el momento en que surge una disimetría entre lo reprimido-icc y un Icc no-todo reprimido. Estos documentos revelan una transcripción 'casi' directa de las formulaciones freudianas en un estado naciente que llevan la marca de pensamientos urgidos por lo real del psicoanálisis, cuando todavía no está presente el tiempo de hacerse comprender en el contexto de su obra. Y es, justamente, en esta condición de inicial que el texto manuscrito ofrece una novedosa redefinición del Icc. Tal como señala en la Introducción las cuestiones que interroga en El yo y el ello retoman los pensamientos iniciados en su escrito de 1920 pero sin seguir la elaboración teórica que llama 'especulación analítica', aunque a último momento incluya sus conclusiones. Esta relectura interroga el encuentro de la pulsión de muerte con la segunda tópica, es decir, con ese material Icc que permanece no-reconocido. Y, a partir de 1924, establece de que manera el supuesto de la pulsión de muerte ilumina la discontinuidad existente ente icc e Icc [ello]. El cruce entre la hipótesis especulativa y un masoquismo erógeno primario produce un giro y da entrada a la cura misma como satisfacción sustitutiva. En síntesis, la lectura de los textos de El yo y el ello contando, por primera vez, con las tres versiones y sus dos anexos, introducen, con la disimilitud icc e Icc, un cambio de pregunta; anticipan la hendidura o Spaltung del sujeto, con ese objeto [el yo-cuerpo] que Freud no termina de construir; y anuncian que el Icc es lo que se funda de la huella de lo no-reconocido, que clama por ese mismo campo heterogéneo que obligaba en 1920 a tomar en consideración un más allá del principio de placer que divide el espacio euclidiano dejando asomar también su carácter disímil, asimétrico. Así, en ciertos momentos privilegiados de un análisis, vía trabajo del sueño, se produce la activación de los restos de lo visto y de lo oído, es decir, de un saber hecho de sedimentos, de los excedentes traumáticos del tesoro de palabras, para cada cual, de su lengua materna, cuando dicha lengua se separa del lenguaje produciendo un Icc no-todo reprimido que bordea el agujero de lo no-reconocido, es decir, de su punto de fracaso mismo: la imposibilidad con que el sexo se inscribe en el inconsciente

Descripción de colecciones de manuscritos : Una propuesta articulada desde la bibliotecología y la archivística

Los documentos manuscritos constituyen fuentes de información primaria, tanto para estudios históricos como para estudios literarios del área de la filología y la crítica genética. La descripción y difusión de este patrimonio constituye una prioridad para las bibliotecas que son depositarias del mismo, dado el creciente interés observado por este tipo de documentos. En pos de contribuir a este objetivo, se brinda un panorama de la normativa vigente aplicable a la descripción de manuscritos. Se enfatizan los beneficios de la descripción normalizada y del empleo de esquemas de metadatos específicos para la difusión de este tipo de material en Internet y se propone su integración a las prácticas bibliotecológicas corrientes