Pupil constriction can alter the accuracy of dark room provocative test.

BACKGROUND: Primary angle-closure glaucoma (PACG) is a major cause of visual morbidity in East Asia. Dark-room provocative test (DRPT) has been used to determine which narrow angles have the risk to develop angle closure. However, the accuracy of DRPT might be altered because that after emerging from the dark room, the configuration of the angle is affected by the light of the slit-lamp and the appositionally closed angle reopens. The aim of this study was to examine the pupillary diameter in different light conditions and use it as a parameter to assess the accuracy of dark-room provocative test. METHODS: Patients with suspected primary angle-closure glaucoma undergoing DRPT were recruited. The anterior chamber angle was examined by anterior segment optical coherence tomography under the following conditions: (1) in standard room illumination; (2) after short-term dark-adaptation and (3) after DRPT. Mean values of pupil size and numbers of appositionally closed angle under different conditions were compared. RESULTS: A total of 47 eyes of 47 patients were analyzed. The pupil size after DRPT was smaller than that after short-term dark-adaptation (P < 0.001) and smaller than that in standard room illumination (P = 0.026). The numbers of appositionally closed angles after short-term dark-adaptation were significantly larger than those after DRPT (P < 0.001). There was no significant difference between the numbers of appositionally closed angles in standard room illumination and after DRPT (P = 0.157). CONCLUSIONS: Constriction of pupil size immediately after prolonged dark room provocative test may lead to change in the angle configuration, which may lead to false negative results. We suggest a modified protocol of recording intraocular pressure immediately after DRPT and performing gonioscopy following short-term dark adaptation to improve the accuracy of angle closure assessment.

LS-ADT: Lightweight and Scalable Anomaly Detection for Cloud Datacentres

Cloud data centres are implemented as large-scale clusters with demanding requirements for service performance, availability and cost of operation. As a result of scale and complexity, data centres typically exhibit large numbers of system anomalies resulting from operator error, resource over/under provisioning, hardware or software failures and security issus anomalies are inherently difficult to identify and resolve promptly via human inspection. Therefore, it is vital in a cloud system to have automatic system monitoring that detects potential anomalies and identifies their source. In this paper we present a lightweight anomaly detection tool for Cloud data centres which combines extended log analysis and rigorous correlation of system metrics, implemented by an efficient correlation algorithm which does not require training or complex infrastructure set up. The LADT algorithm is based on the premise that there is a strong correlation between node level and VM level metrics in a cloud system. This correlation will drop significantly in the event of any performance anomaly at the node-level and a continuous drop in the correlation can indicate the presence of a true anomaly in the node. The log analysis of LADT assists in determining whether the correlation drop could be caused by naturally occurring cloud management activity such as VM migration, creation, suspension, termination or resizing. In this way, any potential anomaly alerts are reasoned about to prevent false positives that could be caused by the cloud operator’s activity. We demonstrate LADT with log analysis in a Cloud environment to show how the log analysis is combined with the correlation of systems metrics to achieve accurate anomaly detection.

Approaches through Materiality

Religion is a funny thing, because it always seems to be riding two horses at once. One could describe these horses in a number of different ways, using all sorts of familiar dichotomies; practice and belief, body and soul, earthly and heavenly, here and hereafter. “Give us this day our daily bread and forgive us our trespasses”. Here, food and forgiveness, or, perhaps more accurately, ingestion and salvation, are claimed, simultaneously – even seamlessly – by religion. This list could (and does) go on, being inclusive of, for example, immanence and transcendence – but more on this below. Yet these binary pairs can clearly be observed bleeding into one another. Ingesting pork, for example, often appears to be religiously more troublesome than does ingesting bread. This is because matter matters. We may ask, then, is religion really riding two horses, or are these ‘familiar dichotomies’ so familiar because they are false? Rephrasing the question in terms that partially echo the title and subtitle of Morgan’s (2010) landmark edited volume Religion and Material Culture: The Matter of Belief, is, I think, helpfully clarifying. What, then, is the matter with religion? The answer presented below is that, very often, the matter with religion is the matter of religion. Put more simply still, the problem with religion is its materiality. This chapter examines the whys and wherefores of this problem for the anthropology of religion – its ethnographic puzzles and methodological opportunities, as well as its conceptual impasses and theoretical insights.

Whose sins do the Brethren confess? The problem of sin as the problem of expiation

Among Brethren fisher families in Gamrie, northeast Scotland, professional clergy and written liturgy are held to be blasphemous denials of the true workings of the Holy Spirit. God, I was told, chooses to speak through all born-again (male) persons, unrestricted by the vain repetitions of lettered clerics and their prayer books. In this context, confession of one’s own sin is a private and pointedly interior affair. In Gamrie, not only did every man seek to be his own skipper, but also his own priest. Yet, much of Brethren worship is given over to ritualised acts of confession. So whose sins do the Brethren confess, and to what end? This article argues that among the Brethren of Gamrie, such acts involve confessing not one’s own sin, but the sins of a ‘sick’ and ‘fallen’ world. More than this, by attending to the sociological (as opposed to theological) processes of confessing the sins of another, we see a collapse in the distinction between confiteor and credo that has so dogged anthropological studies of Christianity. In Brethren prayer and bible study, as well as in everyday gossip, the “I confess” of the confiteor and the “I believe” of credo co-constitute one another in and through evidences of the ‘lostness’ of ‘this present age’. But how, if at all, does this solve ‘the problem of sin’? This article suggests that, with the ritual gaze of confession turned radically outward, Brethren announcements of global wickedness enact (in a deliberate tautology) both a totalising call for repentance from sin, and a millenarian creed of the imminent apocalypse. Here, the problem of ritual can be understood as the problem of (partially failed) expiation.

Establishing the ‘Truth’ of the Matter: Confessional Reflexivity as Introspection and Avowal

The conceptualisation of reflexivity commonly found in social anthropology deploys the term as if it were both a ‘virtuous’ mechanism of self‐reflection and an ethical technique of truth telling, with reflexivity frequently deployed as an moral practice of introspection and avowal. Further, because reflexivity is used as a methodology for constructing the authority of ethnographic accounts, reflexivity in anthropology has come to closely resemble Foucault’s descriptions of confession. By discussing Lynch’s (2000) critical analysis of reflexivity as an ‘academic virtue’, I consider his argument through the lens of my own concept of ‘confessional reflexivity’. While supporting Lynch’s diagnosis of the ‘problem of reflexivity’, I attempt to critique his ethnomethodological cure as essentialist, I conclude that a way forward might be found by blending Foucault’s (1976, 1993) theory of confession with Bourdieu’s (1992) theory of ‘epistemic reflexivity’.

Pesquisa de Campylobacter fetus em amostras prepuciais de touros da região do Alentejo

A bactéria Campylobacter fetus divide-se em duas subespécies C. fetus fetus (Cff) e C. fetus venerealis (Cfv). Cfv é o agente patogénico responsável pela campilobacteriose genital bovina (CGB), uma doença que provoca infertilidade em vacas. Cff pode provocar abortos esporádicos, mas não provoca CGB. Neste trabalho procedeu-se à pesquisa de C. fetus por imunofluorescência direta (IFD) em 117 amostras prepuciais, recolhidas por raspagem, de touros pertencentes a 25 explorações na região do Alentejo. A prevalência real de CGB na amostra, considerando a sensibilidade e especificidade do teste, foi de 52,89% de animais e 80% de explorações. Foi também realizada uma comparação entre dois testes de diagnóstico de CGB, a IFD e o isolamento bacteriológico. O isolamento bacteriológico foi difícil de executar e a presença de bactérias contaminantes foi bastante problemática, levando a resultados falso-negativos. A sua correlação com a IFD foi muito baixa, tendo esta revelado ser muito mais sensível; #### Abstract Search for Campylobacter fetus in preputial samples of bulls from Alentejo region The bacteria Campylobacter fetus comprises two subspecies, C. fetus fetus (Cff) and C. fetus venerealis (Cfv). Cfv is the pathogen responsible for bovine genital campylobacteriosis (BGC), a disease that causes infertility in cows. Cff may lead to sporadic miscarriages, but does not cause BGC. In this work we searched for C. fetus by direct immunofluorescence (DIF) in 117 preputial samples, collected by scraping, from bulls from Alentejo region. The actual prevalence of BGC, considering the sensitivity and specificity of the test was 52.89% of animals and 80 % of farms. It was also performed a comparison between two BGC diagnostic tests, bacterial isolation and DIF. The bacterial isolation was difficult to perform and the presence of bacterial contaminants was very problematic, leading to false-negative results. The presence of bacterial contaminants in bacterial isolation was problematic, leading to false-negative results. Its correlation with DIF was quite low, and DIF proved to be much more sensitive.

Teoria da mente, linguagem e competências sociais em crianças ao nível pré-escolar

A compreensão dos estados mentais dos outros – Teoria da Mente (TM) – é um processo crucial no desenvolvimento cognitivo e social. A relação entre a Teoria da Mente e a Linguagem tem sido alvo de vários estudos ao longo das últimas décadas (Happé, 1995; de Villiers & Villiers, 2000; Astington, 2001; Ruffman et al., 2002; Lohmann & Tomasello, 2003; Astington & Baird, 2005; Astington & Pelletier, 2005; Farrar et al, 2009). Neste estudo avaliaram-se 229 crianças entre os 3 e os 7 anos que frequentavam jardim-de-infância. Destas 229 crianças, foram constituídos dois grupos, um constituído por crianças com desenvolvimento típico (GN) e outra por crianças com Perturbações da Fala/ Linguagem (GPFL), sendo que neste último foi ainda criado um sub-grupo de crianças com Perturbações Desenvolvimentais da Linguagem (SGPDL). Foi aplicado um teste de avaliação da TM, constituído por três sub-testes (Compreensão de falsas crenças de primeira ordem, crenças e desejos e acesso ao conhecimento) e um teste de avaliação de linguagem (T.A.L.C.) Foi também pedido aos cuidadores o preenchimento de um Questionário de Avaliação das Competências Sociais (Rydell et al., 1997). Verificou-se a existência de uma associação positiva e significativa entre a idade e a TM. Por outro lado, observou-se a presença de uma associação negativa e significativa entre a idade de início de fala e a TM. De uma forma geral, verifica-se que a TM está associada de forma positiva e estatisticamente significativa com os scores da linguagem, sendo esta relação mais forte relativamente aos aspectos relativos às Intenções comunicativas e score total de Expressão e Compreensão da linguagem. Vimos também que as crianças do SGPDL apresentaram scores inferiores ao nível da TM relativamente ao GN. Encontramos diferenças estatisticamente significativas em relação ao tempo de duração da prova de TM entre o GN e o GPFL, tendo estes últimos necessitado de maior tempo de resposta. Relativamente à associação existente entre competências sociais e TM, verificamos que não se encontrou a existência de correlações estatisticamente significativas, excepto para o factor “Altruísmo”. Pensa-se que este aspecto estará relacionado com o facto das competências de TM avaliadas neste estudo não se encontrarem associadas às questões emocionais, as quais constituem um sub-tipo de TM do tipo afectivo, mas antes do sub-tipo cognitivo. Os indivíduos GN apresentaram valores para a “Orientação Pró-Social”, “Iniciação Social” e score Total das Competências Sociais significativamente superiores às crianças do GPFL.

Genotoxic risk of herbicides to Anguilla anguilla L.

No contexto dos contaminantes aquáticos, os herbicidas são considerados como um dos grupos mais perigosos. Uma vez aplicados, estes são facilmente transportados para cursos de água, quer devido a uma pulverização pouco cuidada ou devido a fenómenos de escorrência superficial e/ou subterrânea. A presença destes agroquímicos no ambiente tem vindo a ser associada a efeitos nefastos em organismos não-alvo, como é o caso dos peixes. Contudo, existe ainda uma grande lacuna no que diz respeito à informação científica relacionada com o seu impacto genotóxico. Deste modo, a presente tese foi delineada com o intuito de avaliar o risco genotóxico em peixes de duas formulações de herbicidas: o Roundup®, que tem como princípio activo o glifosato, e o Garlon®, que apresenta o triclopir na base da sua constituição, produtos estes largamente utilizados na limpeza de campos agrícolas, assim como em florestas. Foi ainda planeado desenvolver uma base de conhecimento no que diz respeito aos mecanismos de dano do ADN. Como último objectivo, pretendeu-se contribuir para a mitigação dos efeitos dos agroquímicos no biota aquático, nomeadamente em peixes, fornecendo dados científicos no sentido de melhorar as práticas agrícolas e florestais. Este estudo foi realizado adoptando a enguia europeia (Anguilla anguilla L.) como organismo-teste, e submetendo-a a exposições de curta duração (1 e 3 dias) dos produtos comerciais mencionados, em concentrações consideradas ambientalmente realistas. Para a avaliação da genotoxicidade foram aplicadas duas metodologias: o ensaio do cometa e o teste das anomalias nucleares eritrocíticas (ANE). Enquanto o ensaio do cometa detecta quebras na cadeia do ADN, um dano passível de ser reparado, o aparecimento das ANE revela lesões cromossomais, sinalizando um tipo de dano de difícil reparação. O ensaio do cometa foi ainda melhorado com uma nova etapa que incluiu a incubação com enzimas de reparação (FPG e EndoIII), permitindo perceber a ocorrência de dano oxidativo no ADN. No que diz respeito ao Roundup®, o envolvimento do sistema antioxidante como indicador de um estado próoxidante foi também alvo de estudo. Uma vez que as referidas formulações se apresentam sob a forma de misturas, o potencial genotóxico dos seus princípios activos foi também avaliado individualmente. No caso particular do Roundup®, também foram estudados o seu surfactante (amina polietoxilada; POEA) e o principal metabolito ambiental (ácido aminometilfosfórico; AMPA). Os resultados obtidos mostraram a capacidade do Roundup® em induzir tanto dano no ADN (em células de sangue, guelras e fígado) como dano cromossómico (em células de sangue). A investigação sobre o possível envolvimento do stresse oxidativo demonstrou que o tipo de dano no ADN varia com as concentrações testadas e com a duração da exposição. Deste modo, com o aumento do tempo de exposição, os processos relacionados com o envolvimento de espécies reactivas de oxigénio (ERO) ganharam preponderância como mecanismo de dano no ADN, facto que é corroborado pela activação do sistema antioxidante observado nas guelras, assim como pelo aumento dos sítios sensíveis a FPG em hepatócitos. O glifosato e o POEA foram também considerados genotóxicos. O POEA mostrou induzir uma maior extensão de dano no ADN, tanto comparado com o glifosato como com a mistura comercial. Apesar de ambos os componentes contribuirem para a genotoxicidade da formulação, a soma dos seus efeitos individuais nunca foi observada, apontando para um antagonismo entre eles e indicando que o POEA não aumenta o risco associado ao princípio activo. Deste modo, realça-se a necessidade de regulamentar limiares de segurança para todos os componentes da formulação, recomendando, em particular, a revisão da classificação do risco do POEA (actualmente classificado com “inerte”). Uma vez confirmada a capacidade do principal metabolito do glifosato – AMPA – em exercer dano no ADN assim como dano cromossómico, os produtos da degradação ambiental dos princípios activos assumem-se como um problema silencioso, realçando assim a importância de incluir o AMPA na avaliação do risco relacionado com herbicidas com base no glifosato. A formulação Garlon® e o seu princípio activo triclopir mostraram um claro potencial genotóxico. Adicionalmente, o Garlon® mostrou possuir um potencial genotóxico mais elevado do que o seu princípio activo. No entanto, a capacidade de infligir dano oxidativo no ADN não foi demonstrada para nenhum dos agentes. No que concerne à avaliação da progressão do dano após a remoção da fonte de contaminação, nem os peixes expostos a Roundup® nem os expostos a Garlon® conseguiram restaurar completamente a integridade do seu ADN ao fim de 14 dias. No que concerne ao Roundup®, o uso de enzimas de reparação de lesões específicas do ADN associado ao teste do cometa permitiu detectar um aparecimento tardio de dano oxidativo, indicando deste modo um decaimento progressivo da protecção antioxidante e ainda uma incapacidade de reparar este tipo de dano. O período de pós-exposição correspondente ao Garlon® revelou uma tendência de diminuição dos níveis de dano, apesar de nunca se observar uma completa recuperação. Ainda assim, foi evidente uma intervenção eficiente das enzimas de reparação do ADN, mais concretamente as direccionadas às purinas oxidadas. A avaliação das metodologias adoptadas tornou evidente que o procedimento base do ensaio do cometa, que detecta apenas o dano nãoespecífico no ADN, possui algumas limitações quando comparado com a metodologia que incluiu a incubação com as enzimas de reparação, uma vez que a última mostrou reduzir a possibilidade de ocorrência de resultados falsos negativos. Os dois parâmetros adoptados (ensaio do cometa e teste das ANE) demonstraram possuir aptidões complementares, sendo assim recomendado a sua utilização conjunta com vista a efectuar uma avaliação mais adequada do risco genotóxico. Globalmente, os resultados obtidos forneceram indicações de grande utilidade para as entidades reguladoras, contribuindo ainda para a (re)formulação de medidas de conservação do ambiente aquático. Neste sentido, os dados obtidos apontam para a importância da avaliação de risco dos herbicidas incluir testes de genotoxicidade. A magnitude de risco detectada para ambas as formulações adverte para a necessidade de adopção de medidas restritivas em relação à sua aplicação na proximidade de cursos de água. Como medidas mitigadoras de impactos ambientais, aponta-se o desenvolvimento de formulações que incorporem adjuvantes selecionados com base na sua baixa toxicidade.

Analysis of annuli in otoliths, age distribution and growth rates of the Namibian hake (Merluccius capensis)

Dissertação mest., Gestão da Água e da Costa, Universidade do Algarve, 2007

Entre o olhar e o gesto, elementos para uma poética da imagem animada

O que é a animação? O que é o cinema? Qual é a relação entre ambos? Este livro busca responder a essas perguntas e ao mesmo tempo construir uma estrutura concetual para a interpretação do filme animado.

A identidade social : trajectória de um discurso ideológico em José Saramago e Miguel Otero Silva

Tese de doutoramento, Estudos de Literatura e de Cultura (Estudos Comparatistas), Universidade de Lisboa, Faculdade de Letras, 2014

Acute Asthma Epidemics, Weather and Pollen in England, 1987-1994

Recent epidemics of acute asthma have caused speculation that, if their causes were known, early warnings might be feasible. In particular, some epidemics seemed to be associated with thunderstorms. We wondered what risk factors predicting epidemics could be identified. Daily asthma admissions counts during 1987-1994, for two age groups (0-14 yrs and > or = 15 yrs), were measured using the Hospital Episodes System (HES). Epidemics were defined as combinations of date, age group and English Regional Health Authority (RHA) with exceptionally high asthma admission counts compared to the predictions of a log-linear autoregression model. They were compared with control days 1 week before and afterwards, regarding seven meteorological variables and 5 day average pollen counts for four species. Fifty six asthma epidemics were identified. The mean density of sferics (lightning flashes), temperature and rainfall on epidemic days were greater than those on control days. High sferics densities were overrepresented in epidemics. Simultaneously high sferics and grass pollen further increased the probability of an epidemic, but only to 15% (95% confidence interval 2-45%). Two thirds of epidemics were not preceded by thunderstorms. Thunderstorms and high grass pollen levels precede asthma epidemics more often than expected by chance. However, most epidemics are not associated with thunderstorms or unusual weather conditions, and most thunderstorms, even following high grass pollen levels, do not precede epidemics. An early warning system based on the indicators examined here would, therefore, detect few epidemics and generate an unacceptably high rate of false alarms.

New method for the simultaneous identification of pathogenic human viruses using multiplex PCR

Tese de mestrado. Biologia (Biologia Molecular e Genética). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2014

A memória do testemunho e a influência das emoções na recolha e preservação da prova

Tese de doutoramento, Ciências e Tecnologias da Saúde (Desenvolvimento Humano e Social), Universidade de Lisboa, Faculdade de Medicina, 2015