Planning and reporting of quality-of-life outcomes in cancer trials.

BACKGROUND: Information about the impact of cancer treatments on patients' quality of life (QoL) is of paramount importance to patients and treating oncologists. Cancer trials that do not specify QoL as an outcome or fail to report collected QoL data, omit crucial information for decision making. To estimate the magnitude of these problems, we investigated how frequently QoL outcomes were specified in protocols of cancer trials and subsequently reported. DESIGN: Retrospective cohort study of RCT protocols approved by six research ethics committees in Switzerland, Germany, and Canada between 2000 and 2003. We compared protocols to corresponding publications, which were identified through literature searches and investigator surveys. RESULTS: Of the 173 cancer trials, 90 (52%) specified QoL outcomes in their protocol, 2 (1%) as primary and 88 (51%) as secondary outcome. Of the 173 trials, 35 (20%) reported QoL outcomes in a corresponding publication (4 modified from the protocol), 18 (10%) were published but failed to report QoL outcomes in the primary or a secondary publication, and 37 (21%) were not published at all. Of the 83 (48%) trials that did not specify QoL outcomes in their protocol, none subsequently reported QoL outcomes. Failure to report pre-specified QoL outcomes was not associated with industry sponsorship (versus non-industry), sample size, and multicentre (versus single centre) status but possibly with trial discontinuation. CONCLUSIONS: About half of cancer trials specified QoL outcomes in their protocols. However, only 20% reported any QoL data in associated publications. Highly relevant information for decision making is often unavailable to patients, oncologists, and health policymakers.

Apical closure device for transapical valve procedures?.

OBJECTIVES: Transapical transcatheter valve procedures are performed through a left minithoracotomy and require apical sutures to seal the apical access site. The use of large-calibre devices compromises any attempt to fully perform the procedure with a thoracoscopic approach or percutaneously. We report our preliminary experience in animals with a new sutureless self-expandable apical occluder, engineered to perform transapical access site closure in a minimally invasive setting with large-size introducer sheaths. METHODS: The apical occluder with extendable waist was implanted in six young pigs during an acute animal study. Under general anaesthesia, animals (mean weight: 62 ± 8 kg) received full heparinization (heparin: 100 UI/kg; activated clotting time above 250 s). Through a median sternotomy, a 21-Fr Certitude? introducer sheath (outer diameter: 25 Fr) was placed over the wire into the cardiac apex. The delivery catheter carrying the constrained apical plug was inserted into the sheath and deployed under fluoroscopic control, whereas the Certitude? was retrieved. After protamine infusion, we observed and recorded the 1-h bleeding with standard haemodynamic parameters. Animals were sacrificed, and hearts analysed. RESULTS: Six apical closure devices were successfully introduced and deployed in six pig hearts through large-size apical sheaths at first attempt. In all animals, the plugs guaranteed immediate apical sealing and traces of blood were collected in the pericardium during the 1-h observational period (mean of 16 ± 3.4 ml of blood loss per animal). Haemodynamic parameters remained stable during the entire study period and no plug dislodgement was detected with normal systemic blood pressure (mean arterial mean blood pressure: 65 ± 7 mmHg). Post-mortem analysis confirmed the full deployment and good fixation of all plugs, without macroscopic damages to the surrounding myocardium. CONCLUSIONS: This sutureless self-expandable apical occluder is a simple device capable of sealing large-size apical access sites (20-35 Fr) in an acute animal study. This approach is a step further towards less invasive transapical valve procedures in the clinical setting, and further animal tests will be performed to confirm the long-term efficacy and safety of this device.

An analysis of protocols and publications suggested that most discontinuations of clinical trials were not based on preplanned interim analyses or stopping rules.

OBJECTIVES: To investigate the frequency of interim analyses, stopping rules, and data safety and monitoring boards (DSMBs) in protocols of randomized controlled trials (RCTs); to examine these features across different reasons for trial discontinuation; and to identify discrepancies in reporting between protocols and publications. STUDY DESIGN AND SETTING: We used data from a cohort of RCT protocols approved between 2000 and 2003 by six research ethics committees in Switzerland, Germany, and Canada. RESULTS: Of 894 RCT protocols, 289 prespecified interim analyses (32.3%), 153 stopping rules (17.1%), and 257 DSMBs (28.7%). Overall, 249 of 894 RCTs (27.9%) were prematurely discontinued; mostly due to reasons such as poor recruitment, administrative reasons, or unexpected harm. Forty-six of 249 RCTs (18.4%) were discontinued due to early benefit or futility; of those, 37 (80.4%) were stopped outside a formal interim analysis or stopping rule. Of 515 published RCTs, there were discrepancies between protocols and publications for interim analyses (21.1%), stopping rules (14.4%), and DSMBs (19.6%). CONCLUSION: Two-thirds of RCT protocols did not consider interim analyses, stopping rules, or DSMBs. Most RCTs discontinued for early benefit or futility were stopped without a prespecified mechanism. When assessing trial manuscripts, journals should require access to the protocol.

Animal modelling for inherited central vision loss.

Disease-causing variants of a large number of genes trigger inherited retinal degeneration leading to photoreceptor loss. Because cones are essential for daylight and central vision such as reading, mobility, and face recognition, this review focuses on a variety of animal models for cone diseases. The pertinence of using these models to reveal genotype/phenotype correlations and to evaluate new therapeutic strategies is discussed. Interestingly, several large animal models recapitulate human diseases and can serve as a strong base from which to study the biology of disease and to assess the scale-up of new therapies. Examples of innovative approaches will be presented such as lentiviral-based transgenesis in pigs and adeno-associated virus (AAV)-gene transfer into the monkey eye to investigate the neural circuitry plasticity of the visual system. The models reported herein permit the exploration of common mechanisms that exist between different species and the identification and highlighting of pathways that may be specific to primates, including humans.

Estudi tècnic-econòmic de l'adaptació a la Llei de Benestar Animal d'una explotació porcina de la comarca d'Osona i posterior valoració de la seva implementació

Des de la publicació de la Llei de Benestar Animal RD 1135/ 2002, de 31 d’octubre que regula els tres aspectes clau de la producció porcina‐ sistemes d’estabulació i construccions permeses; formació obligatòria dels ramaders i maneig dels animals‐ totes les granges de nova construcció han estat projectades seguint els seus preceptes. Mentre que les granges existents han hagut d’adaptar‐hi les seves instal∙lacions sota amenaça de tancament si no es complien els requisits. L’objectiu d’aquest treball ha estat l’elaboració de l’estudi tècnic‐ econòmic per a l’adaptació a la Llei de Benestar Animal d’una explotació porcina de la comarca d’Osona. Després d’avaluar la situació inicial de les instal∙lacions, establir les línies de previsió de creixement i analitzar els avantatges i inconvenients de cada sistema i model, s’opta pel sistema d’alimentació electrònic model Nedap en grup dinàmic de truges sobre sòl amb jaç de palla. Una decisió no massa extesa en granges del sud d’Europa on se sol preferir l’slat de formigó i/o superfície pavimentada, però imprescindible perquè aquesta explotació pogués aconseguir una millor gestió de les dejeccions ramaderes i assegurar una millora agronòmica de les terres de conreu. El treball conclou amb el seguiment del desenvolupament de l’alternativa escollida i una valoració dels canvis derivats de l’adaptació al Benestar Animal després del primer any i mig en ús. Les millores obtingudes en termes de maneig, funcionament de la granja, salut dels animals i índex productius són remarcables. D’una banda, cal destacar el fet de tenir un nombre de coixeres molt menor respecte les granges amb superfície dura, així com la facilitat i rapidesa en els parts degut al benestar. De l’altra,la reducció del volum de purí, l’increment de la fracció sòlida i la disponibilitat de compost per al camp. Per això, no és exagerat observar el jaç amb palla com una de les solucions més adequades i equilibrades per aquesta explotació que combina boví, porcí i terra per a la producció de cultius.

Avaliação ultrassonográfica dos distúrbios intracapsulares temporomandibulares

OBJETIVO: Avaliar a sensibilidade e a especificidade do exame ultrassonográfico de alta resolução para a avaliação dos distúrbios intracapsulares temporomandibulares. MATERIAIS E MÉTODOS: Estudamos 38 pacientes (76 articulações) com queixas de distúrbios temporomandibulares. Todos os pacientes realizaram exames de ultrassonografia e ressonância magnética (padrão ouro para a avaliação) e os resultados obtidos foram comparados. RESULTADOS: De 24 articulações evidenciando deslocamento discal com o paciente em repouso na ressonância magnética, 7 foram confirmados pela ultrassonografia, em 13 não foram visualizados os discos e 4 estavam tópicos na ultrassonografia. Em 48 articulações, o disco articular não foi visualizado na ultrassonografia com o paciente em repouso. Destes, 41 apresentavam posicionamento normal na ressonância magnética e 7 apresentavam deslocamento anterior. Alterações morfológicas do côndilo mandibular foram visualizadas pela ressonância magnética em 13 articulações, identificadas pela ultrassonografia em 2 delas. CONCLUSÃO: Podemos concluir, no estudo, que o exame de ultrassonografia apresenta alta sensibilidade e especificidade para o diagnóstico da localização do disco articular com o paciente em repouso, tanto para a análise de seu posicionamento anatômico como nos casos de deslocamentos, não apresentando resultados significativos para a análise dos discos com o paciente com a boca aberta e para a análise de alterações morfológicas discais e condilares.

Antifungal activity against planktonic and biofilm Candida albicans in an experimental model of foreign-body infection.

OBJECTIVES: The treatment of Candida implant-associated infections remains challenging. We investigated the antifungal activity against planktonic and biofilm Candida albicans in a foreign-body infection model. METHODS: Teflon cages were subcutaneously implanted in guinea pigs, infected with C. albicans (ATCC 90028). Animals were treated intraperitoneally 12 h after infection for 4 days once daily with saline, fluconazole (16 mg/kg), amphotericin B (2.5 mg/kg), caspofungin (2.5 mg/kg) or anidulafungin (20 mg/kg). Planktonic Candida was quantified, the clearance rate and cure rate determined. RESULTS: In untreated animals, planktonic Candida was cleared from cage fluid in 25% (infected with 4.5 × 10(3) CFU/cage), 8% (infected with 4.8 × 10(4) CFU/cage) and 0% (infected with 6.2 × 10(5) CFU/cage). Candida biofilm persisted on all explanted cages. Compared to untreated controls, caspofungin reduced the number of planktonic C. albicans to 0.22 and 0.0 CFU/ml, respectively, and anidulafungin to 0.11 and 0.13 CFU/ml, respectively. Fluconazole cured 2/12 cages (17%), amphotericin B and anidulafungin 1/12 cages (8%) and caspofungin 3/12 cages (25%). CONCLUSION: Echinocandins showed superior activity against planktonic C. albicans. Caspofungin showed the highest cure rate of C. albicans biofilm. However, no antifungal exceeded 25% cure rate, demonstrating the difficulty of eradicating Candida biofilms from implants.

Effect of supplementation with MgCO3 and L-tryptophan on the welfare and on the carcass and meat quality of two halothane pig genotypes (NN and nn)

Sixty-one animals with different Halothane genes (homozygous halothane positive, n=34; and homozygous halothane negative, n=27) were fed with three diets (controlgroup, with no supplement; magnesium (Mg) group with 1.28g MgCO3/kg and tryptophan (Trp) group with 5g L-Trp/kg) during the last 5 days before slaughter. Animals were submitted to minimal stress ante mortem conditions. Pig behaviour was recorded at the experimental farm, raceway to the CO2 stunning system and during the stunning period. Corneal reflexes were recorded after stunning as well. There were no differences in feed intake among diets (p>0.05) during the 5 days of treatment. Thehalothane positive (nn) group had lower intake than the halothane negative (NN) group(p<0.01). The behaviour of the pigs in the raceway did not differ (p>0.05) among treatments or halothane genotype. A significant (p<0.001) interaction diet*halothane was found in the time to appear the first retreat attempt during the exposure to the CO2 system. In the nn group, the time of performing the first retreat attempt was later in the Mg (p<0.05) than the Control group. Moreover, in the Mg group, the nn had a later (p<0.05) first retreat attempt than the NN. Thus, Mg supplementation could have a positive effect on welfare of nn pigs. The nn had a lower proportion of animals thatshowed corneal reflexes after stunning than NN, indicating a higher effectiveness of thestunning method in nn pigs. Neither Mg nor Trp affected carcass quality and meat quality parameters, although significant differences were found between genotypes

Modelo de cuentas estelares de la Vía Láctea

Son muchos los estudios que se han realizado sobre la Vía Láctea. El Grupo de Investigación de Morfología y Dinámica de la Vía Láctea del Instituto de Astrofísica de Canarias (IAC) ha realizado numerosos trabajos acerca de la estructura galáctica, entre los cuales son de especial relevancia los relativos a la estructura del disco fino, el bulbo y la barra larga. Sin embargo, el grupo carece de un código propio que unifique en un modelo común el conocimiento actual de la estructura galáctica. En este proyecto de final de carrera se presenta la implementación de un código informático de un modelo de cuentas estelares de la Vía Láctea realizado en colaboración con investigadores del IAC.

Efecto de la suplementación con ácidos grasos de cadena media sobre la evolución de peso en lechones con poco peso al nacimiento

La evolución de peso en los períodos de lactación y transición de 583 lechones fue estudiada mediante un análisis estadístico, evaluando el efecto de la suplementación con ácidos grasos de cadena media (AGCM) en lechones con poco peso al nacimiento. 188 de los 375 lechones que nacieron con un peso al nacimiento (PN) <1250 g recibieron 3mL de AGCM cada 24 h durante los primeros 3 días de vida; su peso medio al destete (día 28) fue inferior respecto al grupo control (lechones no suplementados) (-114,17 g). No obstante, 106 de los 180 lechones nacidos con un PN <1000 g fueron suplementados, y su peso medio al destete y a finales de transición (día 63) fue superior respecto al grupo control (destete: +315,16 g; día 63: +775,47 g). Finalmente, los lechones suplementados con PN<800 g tuvieron los peores resultados: su diferencia de peso medio al destete fue de -177,58 g respecto al grupo control. Por lo tanto, en esta prueba fueron estudiados los lechones con un PN entre 800 y 999 g porque el grupo suplementado al destete tuvo una diferencia de peso medio considerable respecto al grupo control:+511,58 g. Asimismo, considerando una probabilidad de error inferior a 0,05, no hubieron diferencias significativas en las diferentes categorías de PN analizadas. De todas maneras, es importante destacar el alto grado de significación en la suplementación con AGCM en lechones con PN entre 800 y 999g (P=0,059). Por otra parte, el PN del grupo suplementado con PN<1000 g fue inferior que el del grupo no suplementado con PN<1000 g; esta diferencia de PN fue significativa (P=0,004) y como consecuencia el grado de significación en la suplementación con AGCM en lechones con PN entre 800 y 999 g fue inferior al esperado. Además, en esta prueba se incluyeron algunos resultados generales y también un análisis simple de supervivencia, aunque no era el objetivo principal

Biotecnología de la Reproducción Porcina: Estado actual y futuro de las técnicas de análisis seminal

Estat actual i futur de les tècniques d'anàlisi seminal

Resistência de somaclones da cultivar de arroz IAC 47 a Monographella albescens

A escaldadura cujo agente causal é o fungo Monographella albescens é uma das principais doenças de arroz (Oryza sativa) no Brasil. Somaclones derivados de panículas imaturas de IAC 47 foram avaliados quanto à resistência genética à escaldadura em condições de infecção natural de campo e de inoculações artificiais em casa de vegetação. As diferenças entre os somaclones quanto à incidência e severidade foram significativas em experimento realizado em condições de campo. As severidades variaram de 12,4% a 32,03% para os somaclones SCIA14 e SCIA28, respectivamente. A relação entre a incidência e a severidade em experimento de campo foi linear e positiva (r = 0,87; P<=0.01). O comprimento da lesão nas folhas dos somaclones, em inoculações com disco de micélio, correlacionou com a severidade (r = 0,93; P<=0.01) e com a incidência no campo (r = 0,88; P<=0.01). A relação entre a largura da folha bandeira dos somaclones e o grau de suscetibilidade foi linear e positiva. Considerando a avaliação em condições de campo e em condições de casa de vegetação, 19 somaclones apresentaram resistência maior do que a cultivar IAC 47.

Warranttihaarojen tuotot ja markkinoiden tehokkuus Nokian osavuosikatsausten yhteydessä vuosina 2002-2009

Työssä pyrittiin löytämään indikaatioita markkinoiden epätehokkuudesta ja arbitraasimahdollisuuksia Suomen warranttimarkkinoilla muodostamalla osavuosikatsausten ympärille erilaisia aikaikkunoita at-the-money warranttihaaroilla. Kohde-etuutena käytettiin Nokian osaketta. Tilastollista merkitsevyyttä testattiin haarojen päivittäisistä logaritmisista tuotoista muodostetulla jakaumalla ja Excelin prosenttijärjestys() -funktiolla. Työn pohjana käytettiin McKentzien, Thomsenin ja Phelanin (2007) työtä, jossa löydettiin teurassikafutuurimarkkinoilta tilastollisesti merkitseviä tuottoja straddle-haaroilla markkinakatsausten aikana. Työssä ei löydetty tilastollisesti merkitseviä tuottoja tai tappioita pääasialli-sella merkitsevyyden mittausmenetelmällä, mutta kahdensuuntaista t-jakauman jakaumaa käyttämällä kyllä.

Avaliação de métodos de inoculação de Phytophthora parasitica em plântulas e plantas jovens de citros

Este trabalho teve como objetivo avaliar métodos de inoculação de Phytophthoraparasitica em plântulas e plantas jovens de citros (Citrus spp.) visando sua utilização em estudos de resistência de porta-enxertos à gomose de Phytophthora. Os métodos de inoculação testados foram: contato planta sem ferimento-patógeno, casca destacada, inserção de disco de meio de cultura contendo micélio sob a casca, método do disco e inserção de agulha e palito infestados em plântulas e plantas jovens de citros. A resistência de genótipos à gomose pode ser avaliada em plântulas in vitro, através de inserção de agulha infestada. O método do disco e o da inserção sob casca foram os melhores quando utilizados em plantas jovens. A medida da área total da lesão é a variável ideal para avaliação da doença. No entanto, o comprimento da lesão pode ser utilizado na avaliação da doença em plântulas, plantas jovens e no campo.

Produção de micélio de Crinipellis perniciosa em quatro meios de cultura, visando extração de DNA

A produção de massa micelial é o primeiro passo para obter amostras de DNA de qualidade e quantidade suficiente para análises moleculares. Neste trabalho, objetivou-se analisar a quantidade e a qualidade do DNA de Crinipellis perniciosa extraído a partir de massa micelial obtida em quatro meios de cultura. Foi avaliado o peso de micélio liofilizado produzido nos seguintes meios de cultura: 1. extrato de levedura (2,5%); 2. extrato de malte (2,5%); 3. BD (batata 20% e dextrose 2%) e 4. extrato de malte + BD (50% de cada meio). O crescimento micelial foi iniciado a partir de um disco de micélio colocado no centro de placas de Petri de 90 mm contendo o meio testado e mantidas a 25 ºC e fotoperíodo de 12 h, por dez dias. Foi utilizado o DIC com dez repetições. O micélio produzido foi liofilizado e o DNA extraído utilizando-se o método do SDS com a desproteinização feita com ou sem fenol. A pureza do DNA baseada na relação A260/A280 e a integridade em gel de agarose 0,8% foram analisadas. A quantidade de micélio produzida nos meios de cultura 1 e 4 foi maior do que nos meios 2 e 3. O DNA extraído a partir de micélio produzido nos meios 2 e 3 apresentou maior integridade, obtendo-se produtos de amplificação mais nítidos. A desproteinização com fenol possibilitou a extração de DNA mais puro. Porém, DNA de ótima qualidade e em quantidade suficiente pode ser extraído a partir de micélio produzido em meios baratos como o BD, sem a necessidade da desproteinização com fenol.