Selected aspects of common tern reproductive biology

Several factors influencing reproductive success were investigated at a Common Tern colony at Port Colborne, Ontario in 1976. In general three egg clutches hatched better than two egg clutches and early started clutches hatched eggs and fledged chicks better than late clutches; the fledging success of two and three egg clutches was similar. Early clutches took longer to hatch and hatched more synchronously than did late clutches. While hatching success differed with nesting substrate used fledging success' did not* No relationship was found between either incubation attentiveness and reproductive success or between incubation attentiveness and clutch size* At no time did food availability appear to be a factor limiting the successful upbringing of two chick broods. While fCf chicks (i.e. chicks hatching from the last laid eggs of three egg clutches) generally survived and grew poorly relative to their brood mates they grew best when they originated from clutches that hatched relatively asynchronously.

Dissecting cell cycle protein complexes using the pptimized yeast cytosine deaminase protein-fragment complementation assay “You too can play with an edge”

Les protéines sont les produits finaux de la machinerie génétique. Elles jouent des rôles essentiels dans la définition de la structure, de l'intégrité et de la dynamique de la cellule afin de promouvoir les diverses transformations chimiques requises dans le métabolisme et dans la transmission des signaux biochimique. Nous savons que la doctrine centrale de la biologie moléculaire: un gène = un ARN messager = une protéine, est une simplification grossière du système biologique. En effet, plusieurs ARN messagers peuvent provenir d’un seul gène grâce à l’épissage alternatif. De plus, une protéine peut adopter plusieurs fonctions au courant de sa vie selon son état de modification post-traductionelle, sa conformation et son interaction avec d’autres protéines. La formation de complexes protéiques peut, en elle-même, être déterminée par l’état de modifications des protéines influencées par le contexte génétique, les compartiments subcellulaires, les conditions environmentales ou être intrinsèque à la croissance et la division cellulaire. Les complexes protéiques impliqués dans la régulation du cycle cellulaire sont particulièrement difficiles à disséquer car ils ne se forment qu’au cours de phases spécifiques du cycle cellulaire, ils sont fortement régulés par les modifications post-traductionnelles et peuvent se produire dans tous les compartiments subcellulaires. À ce jour, aucune méthode générale n’a été développée pour permettre une dissection fine de ces complexes macromoléculaires. L'objectif de cette thèse est d'établir et de démontrer une nouvelle stratégie pour disséquer les complexes protéines formés lors du cycle cellulaire de la levure Saccharomyces cerevisiae (S. cerevisiae). Dans cette thèse, je décris le développement et l'optimisation d'une stratégie simple de sélection basée sur un essai de complémentation de fragments protéiques en utilisant la cytosine déaminase de la levure comme sonde (PCA OyCD). En outre, je décris une série d'études de validation du PCA OyCD afin de l’utiliser pour disséquer les mécanismes d'activation des facteurs de transcription et des interactions protéine-protéines (IPPs) entre les régulateurs du cycle cellulaire. Une caractéristique clé du PCA OyCD est qu'il peut être utilisé pour détecter à la fois la formation et la dissociation des IPPs et émettre un signal détectable (la croissance des cellules) pour les deux types de sélections. J'ai appliqué le PCA OyCD pour disséquer les interactions entre SBF et MBF, deux facteurs de transcription clés régulant la transition de la phase G1 à la phase S. SBF et MBF sont deux facteurs de transcription hétérodimériques composés de deux sous-unités : une protéine qui peut lier directement l’ADN (Swi4 ou Mbp1, respectivement) et une protéine commune contenant un domain d’activation de la transcription appelée Swi6. J'ai appliqué le PCA OyCD afin de générer un mutant de Swi6 qui restreint ses activités transcriptionnelles à SBF, abolissant l’activité MBF. Nous avons isolé des souches portant des mutations dans le domaine C-terminal de Swi6, préalablement identifié comme responsable dans la formation de l’interaction avec Swi4 et Mbp1, et également important pour les activités de SBF et MBF. Nos résultats appuient un modèle où Swi6 subit un changement conformationnel lors de la liaison à Swi4 ou Mbp1. De plus, ce mutant de Swi6 a été utilisé pour disséquer le mécanisme de régulation de l’entrée de la cellule dans un nouveau cycle de division cellulaire appelé « START ». Nous avons constaté que le répresseur de SBF et MBF nommé Whi5 se lie directement au domaine C-terminal de Swi6. Finalement, j'ai appliqué le PCA OyCD afin de disséquer les complexes protéiques de la kinase cycline-dépendante de la levure nommé Cdk1. Cdk1 est la kinase essentielle qui régule la progression du cycle cellulaire et peut phosphoryler un grand nombre de substrats différents en s'associant à l'une des neuf protéines cycline régulatrice (Cln1-3, Clb1-6). Je décris une stratégie à haut débit, voir à une échelle génomique, visant à identifier les partenaires d'interaction de Cdk1 et d’y associer la cycline appropriée(s) requise(s) à l’observation d’une interaction en utilisant le PCA OyCD et des souches délétées pour chacune des cyclines. Mes résultats nous permettent d’identifier la phase(s) du cycle cellulaire où Cdk1 peut phosphoryler un substrat particulier et la fonction potentielle ou connue de Cdk1 pendant cette phase. Par exemple, nous avons identifié que l’interaction entre Cdk1 et la γ-tubuline (Tub4) est dépendante de Clb3. Ce résultat est conforme au rôle de Tub4 dans la nucléation et la croissance des faisceaux mitotiques émanant des centromères. Cette stratégie peut également être appliquée à l’étude d'autres IPPs qui sont contrôlées par des sous-unités régulatrices.

Systems biology of the human MHC class I immunopeptidome

Le système de différenciation entre le « soi » et le « non-soi » des vertébrés permet la détection et le rejet de pathogènes et de cellules allogéniques. Il requiert la surveillance de petits peptides présentés à la surface cellulaire par les molécules du complexe majeur d’histocompatibilité de classe I (CMH I). Les molécules du CMH I sont des hétérodimères composés par une chaîne lourde encodée par des gènes du CMH et une chaîne légère encodée par le gène β2-microglobuline. L’ensemble des peptides est appelé l’immunopeptidome du CMH I. Nous avons utilisé des approches en biologie de systèmes pour définir la composition et l’origine cellulaire de l’immunopeptidome du CMH I présenté par des cellules B lymphoblastoïdes dérivés de deux pairs de fratries avec un CMH I identique. Nous avons découvert que l’immunopeptidome du CMH I est spécifique à l’individu et au type cellulaire, qu’il dérive préférentiellement de transcrits abondants, est enrichi en transcrits possédant d’éléments de reconnaissance par les petits ARNs, mais qu’il ne montre aucun biais ni vers les régions génétiques invariables ni vers les régions polymorphiques. Nous avons également développé une nouvelle méthode qui combine la spectrométrie de masse, le séquençage de nouvelle génération et la bioinformatique pour l’identification à grand échelle de peptides du CMH I, dont ceux résultants de polymorphismes nucléotidiques simples non-synonymes (PNS-ns), appelés antigènes mineurs d’histocompatibilité (AMHs), qui sont les cibles de réponses allo-immunitaires. La comparaison de l’origine génomique de l’immunopeptidome de soeurs avec un CMH I identique a révélé que 0,5% des PNS-ns étaient représentés dans l’immunopeptidome et que 0,3% des peptides du CMH I seraient immunogéniques envers une des deux soeurs. En résumé, nous avons découvert des nouveaux facteurs qui modèlent l’immunopeptidome du CMH I et nous présentons une nouvelle stratégie pour l’indentification de ces peptides, laquelle pourrait accélérer énormément le développement d’immunothérapies ciblant les AMHs.

Studies on the systematics and biology of the fisheries of the Vembanad lake

The thesis documents a comprehensive systematic account of Vembenad lake fishes and to study the effect of physico-chemical parameters on the distribution and abundance of fishes in the lake. This study is expected to advance the knowledge on the biological aspects of two commercially important fishes of the lake which are very desirable for brackish water fish farming. Additionally, the results of the studies on the ecology as habitat, occurrence, season and abundance of all the recorded fishes of the lake end the commercially important fish species of the lake are also incorporated. A general appraisal on the detrimental factors which are adversely affecting the fisheries resources of the lake are presented and some measures of conservation are also suggested. The results of the present study are helpful in formulating suitable schemes for management of parts of the Vembenad lake for capture and culture fisheries

Studies on The Eco Biology of The Indian Pearl Oyster, Pinctada Fucata (Gould)

The present work aims to study induced maturation of the pearl oyster for induced spawning experiments. The work on larval development was done with a view to developing techniques for the artificial rearing of commercially important pearl oyster P fucata, and also to elucidate the principles and problems of tropical bivalve larvae in general for detailed investigations in the future. The present study is designed to probe into the details of the basic aspects of the biology related to the hatchery technology of Pinctada fucata and the understanding of the factors which influence induction of maturation, spawning, larval rearing and spat settlement. This would go a long way in the upgradation of hatchery technology of the Indian Pearl oyster Pinctada fucata fora commercial level seed production..

“Studies on the Biology, Morphometrics and Biochemical composition of the Ommastrephid squid, Sthenoteuthis oualaniensis (Lesson,1830) of the south west coast of India”

With the stabilization of world finfish catches in general, and the depletion of a number of fish stocks that used to support industrial-scale fisheries, increasing attention is now being paid, to the so-called unconventional marine resources, which include many species of cephalopods. One of such important cephalopod resource is the tropical Indo-Pacific pelagic oceanic squid Sthenoteuthis oualaniensis. It is the most abundant large sized squid in the Indo- Pacific region with an estimated biomass of 8-11 metric tons. However, its distribution, biology, life cycle and nutrient value in the south west coast of India are still poorly known. So any new information of this species in the waters off the south west coast of India has important scientific significance for effective and rational utilization of this Oceanic fishery resources, especially during the time of depletion of shallow water resources. In view of that this study investigated different aspects of the Sthenoteuthis oualaniensis, such as morphometry, growth, mortality, maturation, spawning, food, feeding and biochemical composition in the south west coast of India to understand its possible prospective importance for commercial fishing and management of its fishery

The Usborne illustrated dictionary of Biology.

Obra de referencia para los estudiantes del General Certificate of Secundary Education (GCSE).Está organizada en secciones temáticas que abarcan todos los aspectos del currículo de biología. Los conceptos clave y las ideas básicas se explican con un texto sencillo completado con imágenes y diagramas. Incluye una sección de gráficos, tablas y conversiones. Tiene glosario, índice y , además, enlaces a sitios web educativos para ampliar el aprendizaje de esta materia.

AQA GCSE Biology. 'AQA GCSE Biología'.

Ofrece una cobertura completa de los conocimientos e ideas exigidos para el examen del General Certificate Secondary Education (GCSE) ofrecido por el organismo AQA. Pone énfasis en favorecer la comprensión en el alumnado de cómo trabaja la biología y para ello utiliza ejemplos y actividades tomados de situaciones cotidianas y muestra sus aplicaciones en la vida real. Estas experiencias les preparan, además, para adquirir habilidades en la investigación científica y en tareas prácticas. Va acompañado de una guía para el profesor.

AQA GCSE Biology : Teacher's guide. 'AQA GCSE Biología : guía del profesor'.

Al igual que el libro del alumno, esta guía para el profesor apoya un nuevo estilo de enseñanza para el examen del General Certificate Secondary Education (GCSE), basado en hacer hincapié en la comprensión de cómo trabaja la biología y en utilizar ejemplos y aplicaciones de ésta para situaciones de la vida real. Además, también favorece el desarrollo de habilidades científicas y de tareas prácticas en los estudiantes. Incluye un CD-ROM con material en formato Word con una planificación del trabajo que puede ser utilizada o modificada y, también, contiene actividades prácticas para la clase y tareas para casa.

Edexcel 360 Science. Teacher pack : for GCSE biology, chemistry and physics.

Prepara a los estudiantes para la obtención del título General Certificate Secondary Education (GCSE) otorgado por el organismo Edexcel. Este recurso proporciona al profesor las respuestas a las preguntas del libro del alumno, apoyo adicional con cuadernos de trabajo y actividades prácticas para las clases. Al texto impreso le acompaña un CD-ROM con material didáctico en formato Word y PDF. Tiene como material de apoyo el libro del alumno.

Edexcel 360 Science : for Edexcel GCSE biology, chemistry, physics.

Prepara a los estudiantes para la obtención del título General Certificate Secondary Education (GCSE) otorgado por el organismo Edexcel en ciencias, que comprende biología, química y física. Tiene como material de apoyo el recurso para el profesor, impreso y en CD-Rom, con hojas de trabajo y actividades.

Biology IGCSE. Revision guide.

Diseñado para seguir el plan de estudios más reciente de Biología del International General Certificate of Secundary Education ( IGCSE) de Cambridge International Education (CIE), proporciona material de revisión para estudiantes internacionales de catorce a dieciséis años. El texto puede ser utilizado para el estudio durante todo el año, pero fundamentalmente están orientado para una revisión del estudiante. Proporciona una gran cantidad de prácticas de examen. Ofrece todo lo necesario para garantizar el éxito de la prueba con preguntas y respuestas, revisión y asesoramiento de evaluación. Se incluyen actividades basadas en el vocabulario, como crucigramas, para apoyar a los estudiantes con inglés como segundo idioma.

Biology : IGCSE.

Recurso que permite a los estudiantes preparar el examen del International General Certificate of Secondary Education (IGCSE) de Biología. Cada capítulo cuenta con preguntas de revisión, sumario de los conceptos más importantes y actividades. Incluye un CD-ROM con un examen para permitir a los alumnos revisar a fondo la preparación con preguntas de opción múltiple, modelo de respuestas y sugerencias de los examinadores.

Edexcel A2 biology revision guide : for SNAB and concept-led approaches.

Guía para la revisión de los recursos Edexcel para la especificación General Certificate of Education (GCE ) Biología. Salters Nuffield Advanced Biology es el material de apoyo oficial. Curso completo diseñado para mostrar a los estudiantes cómo la comprensión de muchos problemas contemporáneos requiere de un conocimiento fundamental de las ideas biológicas. Favorece el aprendizaje autónomo de una amplia gama de conocimientos, incluidos el análisis de datos, evaluación crítica de información, comunicación y trabajo cooperativo. Se basa en datos de exámenes reales para ayudar a los estudiantes a evitar errores habituales y construir mejores respuestas. Los ejemplos de preguntas de examen incluyen las de opción múltiple. Tiene las soluciones a las preguntas del texto.

Edexcel AS biology revision guide : for SNAB and concept-led approaches.

Guía para la revisión de los recursos Edexcel para la especificación General Certificate of Education (GCE ) Biología. Salters Nuffield Advanced Biology es el material de apoyo oficial. Curso completo diseñado para mostrar a los estudiantes cómo la comprensión de muchos problemas contemporáneos requiere de un conocimiento fundamental de las ideas biológicas. Favorece el aprendizaje autónomo de una amplia gama de conocimientos, incluidos el análisis de datos, evaluación crítica de información, comunicación y trabajo cooperativo. Se basa en datos de exámenes reales para ayudar a los estudiantes a evitar errores habituales y construir mejores respuestas. Los ejemplos de preguntas de examen incluyen las de opción múltiple. Tiene las soluciones a las preguntas del texto.