Phosphate closes the solution structure of the 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase (EPSPS) from Mycobacterium tuberculosis

The 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase catalyses the sixth step of the shikimate pathway that is responsible for synthesizing aromatic compounds and is absent in mammals, which makes it a potential target for drugs development against microbial diseases. Here, we report the phosphate binding effects at the structure of the 5-enolpyruvyl shikimate-3-phosphate synthase from Mycobacterium tuberculosis. This enzyme is formed by two similar domains that close on each other induced by ligand binding, showing the occurrence of a large conformation change. We have monitored the phosphate binding effects using analytical ultracentrifugation, small angle X-ray scattering and, circular dichroism techniques. The low resolution results showed that the enzyme in the presence of phosphate clearly presented a more compact structure. Thermal-induced unfolding experiments followed by circular dichroism suggested that phosphate rigidified the enzyme. Summarizing, these data suggested that the phosphate itself is able to induce conformational change resulting in the closure movement in the M. tuberculosis 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase. (c) 2006 Elsevier B.V. All rights reserved.

OXIDES AS HETEROGENEOUS PROMOTERS FOR LIQUID-PHASE HYDROCARBONYLATION REACTIONS WITH IODOCARBONYLRUTHENIUM CATALYSTS

Basic or acid oxides, used as heterogeneous promoters of carbonylruthenium catalysts in liquid-phase hydrocarbonylation reactions on oxygenated substrates, strongly affect the activity and selectivity of the catalytic system. Concurrent or successive reactions of simple carbonylation, homologation, hydrogenation to hydrocarbons, and etherification take place to varying extents. Carbonylation and etherification are favored by acid oxides and homologation and hydrogenation by basic oxides. This behavior is related to the formation and stabilization by the oxides of H+ and H- hydridocarbonylruthenium catalytic species, whose relative concentrations in solution depend on the nature of the oxide. Heterogeneous oxides are easily separated and recycled from the reaction mixture. Their use simplifies the catalytic system and allows one to direct the catalytic process toward the target product.

β-lactam antibiotics epitope mapping with STD NMR spectroscopy: A study of drug-human serum albumin interaction

Molecular recognition events are key issues in many biological processes. STD NMR (saturation transfer difference nuclear magnetic resonance spectroscopy) is one of the techniques used to understand such biological interactions. Herein, we have investigated the interactions of four β-lactam antibiotics belonging to two classes (cephalosporins and penicillins) with human serum albumin (HSA) by 1H STD NMR revealing that the interaction between the aromatic moiety and HSA is responsible for the binding efficiency. Thus, the structural differences from the five to six-membered thio ring in penicillins and cephalosporins do not seem to influence antibiotic-albumin interactions. © 2012 Sociedade Brasileira de Química.

Pre-harvest sugarcane burning: Determination of emission factors through laboratory measurements

Sugarcane is an important crop for the Brazilian economy and roughly 50% of its production is used to produce ethanol. However, the common practice of pre-harvest burning of sugarcane straw emits particulate material, greenhouse gases, and tropospheric ozone precursors to the atmosphere. Even with policies to eliminate the practice of pre-harvest sugarcane burning in the near future, there is still significant environmental damage. Thus, the generation of reliable inventories of emissions due to this activity is crucial in order to assess their environmental impact. Nevertheless, the official Brazilian emissions inventory does not presently include the contribution from pre-harvest sugarcane burning. In this context, this work aims to determine sugarcane straw burning emission factors for some trace gases and particulate material smaller than 2.5μm in the laboratory. Excess mixing ratios for CO2, CO, NOX, UHC (unburned hydrocarbons), and PM2.5 were measured, allowing the estimation of their respective emission factors. Average estimated values for emission factors (g kg-1 of burned dry biomass) were 1,303 ± 218 for CO2, 65 ± 14 for CO, 1.5 ± 0.4 for NOX, 16 ± 6 for UHC, and 2.6 ± 1.6 for PM2.5. These emission factors can be used to generate more realistic emission inventories and therefore improve the results of air quality models. © 2012 by the authors; licensee MDPI, Basel, Switzerland.

The macroeconomics of the Latin American economic boom

Includes bibliography

Estudo da relação estrutura/atividade para as ações neurotóxica/neuroprotetora das acilpoliaminotoxinas NSTX-3 e JSTX-3 em sistema nervoso central de ratos

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Biologia Celular e Molecular) - IBRC

Influências do protocolo agroambiental do setor sucroalcooleiro na produção de açúcar, álcool e energia: estudo de caso em uma usina no interior do Estado de São Paulo

Pós-graduação em Agronomia (Energia na Agricultura) - FCA

Utilização de parâmetros microbiológicos para avaliação do impacto da contaminação por petróleo e derivados em sedimentos marinhos. -

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Avaliação ecotoxicológica da biodegradação utilizando inóculo enriquecido com Bacillus subtilis em solo contaminado com petróleo, diesel e biodiesel

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Microbiologia Aplicada) - IBRC

Avaliação da mutagenicidade, antimutagenicidade e estrogenicidade de Byrsonima spp

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Síntese de filmes finos a-C:H pela técnica de implantação e deposição por imersão em plasma

Pós-graduação em Ciência e Tecnologia de Materiais - FC

Estudo sobre o uso do pentacloreto de nióbio em reações multicomponentes para síntese de derivados de 4-ARIL-3,4-DI-Hidrocumarinas

Pós-graduação em Ciência e Tecnologia de Materiais - FC

Avaliação da viabilidade do lodo de esgosto como recondicionante de solos agrícolas, após processo de atenuação natural, por meio de diferentes bioensaios

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Análise da toxicidade e da mutagenicidade de um solo de landfarming, proveniente de um refinaria de petróleo, antes e depois de processos que visam estimular a biodegradação de hidrocarbonetos

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Biologia Celular e Molecular) - IBRC

Respostas eletromagnéticas dos arranjos coplanar e coaxial em poço

Foi estudado a viabilidade de aplicação do arranjo coplanar de bobinas nas sondas de perfilagem em poço por indução eletromagnética. Paralelamente foram geradas as respostas do convencional arranjo coaxial, que é o amplamente utilizado nas sondas comerciais, com o propósito de elaborar uma análise comparativa. Através da solução analítica (meios homogêneos) e semi-analítica (meios heterogêneos) foram geradas inicialmente as respostas para modelos mais simples, tais como os do (1) meio homogêneo, isotrópico e ilimitado; (2) uma casca cilíndrica simulando a frente de invasão; (3) duas cascas cilíndricas para simular o efeito annulus; (4) uma interface plana e dois semi-espaços simulando o contato entre duas camadas espessas e (5) uma camada plano-horizontal e dois semi-espaços iguais. Apesar da simplicidade destes modelos, eles permitem uma análise detalhada dos efeitos que alguns parâmetros geoelétricos têm sobre as respostas. Aí então, aplicando ainda as condições de contorno nas fronteiras (Sommerfeld Boundary Value Problem), obtivemos as soluções semi-analíticas que nos permitiram simular as respostas em modelos relativamente mais complexos, tais como (1) zonas de transição gradacional nas frentes de invasão; (2) seqüências de camadas plano-paralelas horizontais e inclinadas; (3) seqüências laminadas que permitem simular meios anisotrópicos e (4) passagem gradacional entre duas camadas espessas. Concluimos que o arranjo coplanar de bobinas pode ser uma ferramenta auxiliar na (1) demarcação das interfaces de camadas espessas; (2) posicionamento dos reservatórios de pequenas espessuras; (3) avaliação de perfis de invasão e (4) localizar variações de condutividade azimutalmente.