Integral finite surgeries on knots in S^3

Using the correction terms in Heegaard Floer homology, we prove that if a knot in S³ admits a positive integral T-, O-, or I-type surgery, it must have the same knot Floer homology as one of the knots given in our complete list, and the resulting manifold is orientation-preservingly homeomorphic to the p-surgery on the corresponding knot.

Binding Site Structure and Stoichiometry in Serotonin Type 3 Receptors

This dissertation primarily describes studies of serotonin type 3 (5-HT₃) receptors of the Cys-loop super-family of ligand gated ion channels. The first chapter provides a general introduction to these important proteins and the methods used to interrogate their structure and function. The second chapter details the delineation of a structural unit of the ligand binding site of homomeric 5-HT₃A receptors on which the ligands serotonin (5-HT) and m-chlorophenyl biguanide (mCPBG) are reliant for effective receptor activation. Unnatural amino acid mutagenesis results show that the details of each ligand’s interaction with this organizing feature of the binding site differ, providing insights into general principles of receptor activation.

The third chapter describes a study in which florescent protein fusions of the A and B subunits of the heteromeric 5-HT₃AB receptor are employed to determine the subunit stoichiometry and order within functional receptors. Strong evidence is found for an A₃B₂ stoichiometry with A-A-B-A-B order. The fourth chapter investigates the potential for ligand binding across heteromeric binding sites in the 5-HT₃AB receptor. Unlike serotonin, mCPBG is found to bind the receptor at heteromeric binding sites. Further mCPBG is capable of allosterically modulating the response of serotonin on the 5-HT₃AB receptor from these heteromeric sites.

Finally, the fifth chapter describes progress towards the application of unnatural amino acid mutagenesis to an important new class of proteins, transcription factors. Experiments optimizing novel methods for the detection of function are described, using RARα of the nuclear receptor family of transcription factors.

Radio frequency studies of surface resistance and critical magnetic field of type I and type II superconductors

The surface resistance and the critical magnetic field of lead electroplated on copper were studied at 205 MHz in a half-wave coaxial resonator. The observed surface resistance at a low field level below 4.2°K could be well described by the BCS surface resistance with the addition of a temperature independent residual resistance. The available experimental data suggest that the major fraction of the residual resistance in the present experiment was due to the presence of an oxide layer on the surface. At higher magnetic field levels the surface resistance was found to be enhanced due to surface imperfections.

The attainable rf critical magnetic field between 2.2°K and T_c of lead was found to be limited not by the thermodynamic critical field but rather by the superheating field predicted by the one-dimensional Ginzburg-Landau theory. The observed rf critical field was very close to the expected superheating field, particularly in the higher reduced temperature range, but showed somewhat stronger temperature dependence than the expected superheating field in the lower reduced temperature range.

The rf critical magnetic field was also studied at 90 MHz for pure tin and indium, and for a series of SnIn and InBi alloys spanning both type I and type II superconductivity. The samples were spherical with typical diameters of 1-2 mm and a helical resonator was used to generate the rf magnetic field in the measurement. The results of pure samples of tin and indium showed that a vortex-like nucleation of the normal phase was responsible for the superconducting-to-normal phase transition in the rf field at temperatures up to about 0.98-0.99 T_c' where the ideal superheating limit was being reached. The results of the alloy samples showed that the attainable rf critical fields near T_c were well described by the superheating field predicted by the one-dimensional GL theory in both the type I and type II regimes. The measurement was also made at 300 MHz resulting in no significant change in the rf critical field. Thus it was inferred that the nucleation time of the normal phase, once the critical field was reached, was small compared with the rf period in this frequency range.

Adesão dos cimentos Epiphany SE e iRoot SP: Resistência à tração e mapeamento dentinário por microscopia digital

O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da microestrutura dentinária na adesão de cimentos endodônticos modernos através: do desenvolvimento de uma metodologia para caracterizar microestruturalmente a dentina; da avaliação da resistência de união (através de ensaios de tração) dos cimentos endodônticos Epiphany SE, iRoot SP e AH Plus; da correlação dos dados obtidos da caracterização da microestrutura dentinária e dos ensaios de tração. Trinta terceiros molares inclusos, recém extraídos, foram embutidos em resina epóxi e seccionados 0,5mm abaixo da junção esmalte-dentina. Doze amostras foram eliminadas durante à preparação metalográfica devido à exposição da câmara pulpar. De cada dente, uma área de análise (AA) com 3,25 mm de diâmetro foi mapeada utilizando técnicas de microscopia ótica digital para: captura de ~400 imagens formando um mosaico; análise digital de imagens, obtendo os resultados de quantidade de túbulos (QT) e de fração de área de túbulos (FAT) do mosaico; conversão da imagem do mosaico em um mapa colorido em que as cores estão diretamente relacionadas à densidade de área tubular. As dezoito amostras restantes foram divididas em 3 grupos (N=6), de acordo com o cimento utilizado, para confecção dos corpos de prova para os ensaios de tração. Os valores de da resistência de união (RU) obtidos foram analisados estatisticamente com teste não-pareado t com correção de Welch e pelo teste F para comparar variâncias Os dados de FAT e de QT foram submetidos ao teste de D'Agostino & Pearson revelando-se não normais (P>0,05), o que indica grande variabilidade da amostragem. O cimento Epiphany SE apresentou uma resistência de união significativamente menor que o cimento AH Plus (P <0,05). Os corpos de prova do iRoot SP falharam prematuramente e não foram analisados. A aplicação do teste r de Spearman não demonstrou correlação significativa entre FAT e RU (P>0,05). O MEV de pressão variável foi utilizado para avaliar qualitativamente a superfície de fratura após os ensaios de tração. A análise revelou um padrão de fratura mista para o AH Plus e o Epiphany SE, além de diferenças no tamanho e na forma das partículas desses cimentos, o que pode influenciar no comportamento mecânico. Dentro da amostragem realizada, não se encontrou correlação significativa entre microestrutura dentinária e a resistência de união.

Estudo clínico randomizado duplo cego comparando duas técnicas de plicatura nasal após osteotomias tipo Le Fort I

A correção de deformidades esqueléticas da face por meio de um tratamento ortodôntico-cirúrgico tornou-se uma opção segura e previsível. Os movimentos ósseos são milimetricamente calculados e executados cirurgicamente, assim como a oclusão é meticulosamente engrenada através dos movimentos ortodônticos. Os efeitos que os tecidos moles sofrem com as cirurgias ortognáticas são, no entanto, menos previsíveis, e apesar do principal objetivo da cirurgia ortognática ser uma melhora funcional, o componente estético é sem dúvida de extrema importância. Em especial, a região de base alar apresenta resultados muito variáveis, a despeito dos bons resultados esqueléticos atingidos. O objetivo deste estudo foi comparar 2 diferentes tipos de sutura utilizados na região de base do nariz, e observar qual tipo apresenta um resultado que melhor acompanhe os movimentos realizados pelo tecido esquelético. Trinta e cinco pacientes foram aleatoriamente distribuídos em 2 grupos. O grupo 1 funcionou como controle e os pacientes receberam a plicatura nasal intra-oral, que é o tipo de plicatura nasal mais descrito na literatura. Já os pacientes do grupo 2 receberam plicatura nasal extra-oral. Para análise estatística foram calculadas as médias e desvios padrões dos grupos, e a hipótese nula de que não havia diferença entre os 2 grupos foi testata com o teste T de Student. Em ambos os grupos ocorreu um alargamento da base do nariz, porém a média de alargamento do grupo 1 foi de 2,50 milímetros (mm), enquanto que a média de alargamento do grupo 2 foi de 1,26 mm. Além disso, o desvio padrão foi menor para o grupo 2, e a hipótese nula foi rejeitada (p<0,05), demonstrando que a diferença entre os grupos foi estatisticamente significativa. Pôde-se concluir que quando objetiva-se um controle mais previsível e rigoroso da base do nariz, a plicatura nasal extra-oral cumprirá melhor esta função.

Phase effects on group velocity propagation in a V-type system with spontaneously generated coherence

The effects of the relative phase between two laser beams on the propagation of a weak electromagnetic pulse are investigated in a V-type system with spontaneously generated coherence (SGC). Due to the relative phase, the subluminal and superluminal group velocity can be unified. Meanwhile, SGC can be regarded as a knob to manipulate light propagation between subluminal and superluminal.

Upper level and phase controlling group velocity in V-type system

With the external field coupling the two upper levels, we investigate the light pulse propagation properties with weak probe field in a V-type system. Due to the external upper level (UL) coupling field, the dispersion of the system has been influenced by the relative phase. It is shown that the UL field and the relative phase can be regarded as switches to manipulate light propagation between subluminal and superluminal. (c) 2007 Elsevier B.V. All rights reserved.

Controlling the group velocity in a five-level K-type atomic system

The properties of a five-level K-type system are investigated. With the controlling fields, the properties of the dispersion and absorption of the system are changed greatly. The system can produce anomalous dispersion regions with absorption and normal dispersion regions with absorption or transparency. Furthermore, the group velocity can be varied from subluminal to superluminal by varying the intensity of the controlling field and the probe detunings in principle. (C) 2008 Elsevier B.V. All rights reserved.

Part I. Coenzyme B12 as a hydroformylation-type catalyst. Part II. Mechanisms of hydrogen transfer in the methylmalonyl coenzyme a mutase reaction

Part I

The mechanism of the hydroformylation reaction was studied. Using cobalt deuterotetracarbonyl and 1-pentene as substrates, the first step in the reaction, addition of cobalt tetracarbonyl to an olefin, was shown to be reversible.

Part II

The role of coenzyme B₁₂ in the isomerization of methylmalonyl coenzyme A to succinyl coenzyme A by methylmalonyl coenzyme A mutase was studied. The reaction was allowed to proceed to partial completion using a mixture of methylmalonyl coenzyme A and 4, 4, 4-tri-²H-methylmalonyl coenzyme A as substrate. The deuterium distribution in the product, succinyl coenzyme A, was shown to best fit a model in which hydrogen is transferred from C-4 of methylmalonyl coenzyme A to C-5’ of the adenosyl moiety of coenzyme B₁₂ in the rate determining step. The three hydrogens at the 5’-adenosyl position of the coenzyme B₁₂ intermediate are then able to become enzymatically equivalent before hydrogen is transferred from the coenzyme B₁₂ intermediate to form succinyl coenzyme A.

Efetividade da cirurgia bariátrica, com ênfase na técnica sleeve gástrico, para o controle ou reversão do diabetes mellitus tipo 2: revisão sistemática

A obesidade e o Diabetes mellitus tipo 2 se tornaram importantes problemas de saúde pública nos últimos anos. O aumento da prevalência do diabetes está intimamente relacionado ao aumento da prevalência da obesidade. As cirurgias bariátricas surgiram nos últimos cinqüenta anos e vêm se popularizando como uma opção terapêutica efetiva para a redução do peso e controle ou reversão do diabetes no paciente obeso. Dentre as técnicas cirúrgicas disponíveis, o Sleeve gástrico, que era utilizado como parte integrante da técnica de derivação bílio-pancreática ou como primeiro estágio, em pacientes de alto risco, a fim de prepará-los para a cirurgia definitiva, tem sido adotado, por alguns grupos de cirurgiões, como técnica definitiva. Como é recente sua utilização como procedimento bariátrico definitivo, faltam estudos que avaliem sua efetividade. O presente estudo teve por objetivo avaliar o Sleeve gástrico, para o controle ou reversão do Diabetes mellitus tipo 2, no paciente obeso. Para tanto, foi realizada uma revisão sistemática. A busca na literatura resultou em 698 títulos e resumos. Após aplicação dos critérios de inclusão foram recuperados 96 textos completos e incluídos, na revisão sistemática, sete artigos com ensaios clínicos controlados. Foi possível realizar metanálise entre estudos comparando o Sleeve gástrico à derivação gástrica com Y de Roux e com a bandagem gástrica. Foram avaliados os desfechos glicemia de jejum e hemoglobina glicosilada. O resultado da metanálise foi favorável ao Sleeve gástrico, em comparação ao Y de Roux, para o desfecho redução pós-operatória da hemoglobina glicosilada. O Sleeve gástrico se apresenta como mais uma opção terapêutica para a obesidade e correção das co-morbidades associadas. Porém, os resultados são bastante preliminares, e ensaios clínicos controlados, de boa qualidade metodológica, são necessários para melhor avaliação.

Theoretical research on noncollinear match conditions of the type I optical parametric process

Broad bandwidth group match conditions are reported for a noncollinear type I optical parametric process. The theoretical calculations corresponding to two special situations in practice were made, respectively, which are in accordance with the published experimental results. Furthermore, we provide a method to not only achieve maximal parametric bandwidth output but also match the group velocities between three waves. (c) 2006 Optical Society of America.