CYP21 gene mutations in Brazilian patients with 21-hydroxylase deficiency from the Amazon region

ABSTRACT: Congenital adrenal hyperplasia (CAH) due to 21-hydroxylase deficiency (P450c21, CYP21) accounts for about 95% of all CAH cases. The incidence of CYP21 gene mutations has been extensively studied in the last years, but in Brazil it has been investigated only in Southeast Brazilian patients. This study is the first report on the distribution of CYP21 mutations in patients from the Amazon region. Direct sequencing of the CYP21 gene identified at least one mutation in 96% of the studied chromosomes. The most common mutations found were IVS2-13A/C > G (36%), Q318X (12%), V281L (12%), 1760_1761insT (9%), Cluster E6 (7%), and P30L (7%). The worldwide most common mutations were identified among patients from the Amazon region at frequencies that may be expected for a population resulting from the admixture of Europeans (predominantly Portuguese), African Blacks and Amerindians, in proportions that differ from those estimated for South Brazilian populations. Interethnic mixture may explain the differences in the frequencies of some mutations between Brazilian patients from the Amazon and from the Southeast of the country. However, the differences found may also be due to variation in the number of patients with the different clinical forms of 21-hydroxylase deficiency in the studies carried out so far.

Investigação dos polimorfismos no éxon 1 do gene MBL (Mannose-Binding Lectin) e sua associação com a síndrome da imunodeficiência adquirida (AIDS)

No presente estudo foram investigadas as freqüências das mutações no éxon 1 do gene MBL em um grupo de 128 pacientes com Aids, 116 portadores assintomáticos da infecção pelo HIV-1, 84 mulheres soronegativas profissionais do sexo, com comportamentos de alto risco e 99 indivíduos controles soronegativos, com o objetivo de avaliar a ocorrência de uma possível associação entre os polimorfismos neste gene e a infecção pelo HIV-1. A identificação dos alelos MBL *A, *B, *C e *D foi realizada por meio da reação em cadeia mediada pela polimerase, utilizando sequências de iniciadores específicos e posterior digestão enzimática (RFLP). As análises das frequências alélicas e genotípicas do éxon 1 não mostraram qualquer diferença significativa entre pacientes soropositivos (assintomáticos e Aids) e soronegativos (controle e controle de alto risco) (p>0,05). Não foram observadas associações significativas entre a presença de co-infecções e as variantes alélicas. Entretanto, tuberculose, neurotoxoplasmose, candidíase, neurocriptococose e pneumonia foram as co-infecções com maior prevalência. As associações entre o número de linfócitos TCD4+, a carga viral plasmática e os polimorfismos no éxon 1 do gene MBL nos pacientes com Aids e portadores assintomáticos não foram estatisticamente significante. Desse modo, pode-se sugerir a ausência de associação entre estes polimorfismos e a susceptibilidade à infecção pelo HIV-1, destacando a necessidade de estudos adicionais para determinar se estes polimorfismos apresentam qualquer impacto associado à infecção ou a progressão para a Aids.

Polimorfismo do éxon 1 do gene da lectina ligadora de manose (MBL) em indivíduos expostos à malária causada por Plasmodium vivax

Neste estudo analisamos a freqüência de polimorfismos no éxon 1 do gene 2 da lectina Ligadora de manose (MBL) em indivíduos expostos à malária causada por Plasmodium vivax. Foram analisadas amostras de 81 indivíduos primoinfectados e 250 não infectados. Os indivíduos não infectados constituíram dois grupos, um que relatou nunca ter tido malária e o outro que teve de 1 a 4 ou mais episódios da doença. No grupo infectado, foi investigada a associação entre os polimorfismos e a suscetibilidade à infecção, a intensidade dos sinais e sintomas clínicos e a parasitemia. As mutações foram identificadas por reação em cadeia da polimerase e análise de restrição. O grupo infectado apresentou distribuição de freqüências alélicas e genotípicas diferente do grupo não infectado. As freqüências dos alelos MBL*A, MBL*B, MBL*C e MBL*D nos indivíduos infectados foram 64,20%, 19,75%, 0,00% e 15,43%, nos não infectados que nunca tiveram malária as freqüências foram 72,96%, 14,80%, 3,06% e 9,18%, e nos não infectados que relataram episódio prévio de malária as freqüências foram 74,67%, 14,81%, 2,30% e 8,22%, respectivamente. O alelo MBL*B foi associado à sintomatologia intensa e ao aumento na parasitemia, enquanto o alelo MBL*D foi associado às parasitemias mais baixas. No grupo não infectado, a distribuição das freqüências alélicas e genotípicas variou com o número de episódios e o tempo decorrido após o último episódio de malária. As variantes MBL*B e MBL*D contribuíram para essa variação. Esse foi o primeiro estudo para avaliar o impacto desses polimorfismos do gene da lectina ligadora de manose na resposta imune inata em indivíduos expostos naturalmente à malária causada por Plasmodium vivax.

Nested-PCR do gene que codifica o antígeno b aplicada ao diagnóstico da tuberculose pulmonar

A reação em cadeia da polimerase usada para amplificação de uma seqüência interna de um fragmento previamente amplificado (nested-PCR) foi investigada como uma alternativa complementar a pesquisa de bacilos álcool ácido resistentes e a cultura do Mycobacterium tuberculosis em meio de Lowenstein-Jensen. Foram investigadas 144 amostras de escarro de pacientes suspeitos de tuberculose encaminhados ao Laboratório de Tuberculose do Instituto Evandro Chagas em Belém, no período de junho de 2002 a dezembro de 2003. Das 144 amostras, 121 foram caracterizadas como tuberculose, 119 foram positivas na cultura, 95 na baciloscopia e 128 na nested-PCR. A sensibilidade da nested-PCR foi 96% (116/121), enquanto a especificidade foi 48% (11/23). A nested-PCR poderá ser uma ferramenta complementar para o diagnóstico da tuberculose, pois apresenta sensibilidade equivalente à cultura, no entanto, necessita de maiores avaliações visando minimizar o número de resultados falso-positivos.

Estudo da influência do uso de agrotóxicos e de polimorfismo do gene GSTT1 na etiologia de fissuras labiopalatais em pacientes do Estado do Pará

Defeito congênito ou malformação congênita é qualquer anomalia anatômica, metabólica ou funcional, herdada por um mecanismo de transmissão mendeliana, ou causada por uma mutação gênica nova, por uma alteração cromossômica ou por uma agressão física, química ou infecciosa sobre o feto ou embrião em desenvolvimento. Suas causas podem ser genéticas ou ambientais, sendo, na maioria das vezes, de origem multifatorial, onde fatores de predisposição genética interagem com fatores ambientais desencadeadores. No estado do Pará, um grande número de indivíduos acometidos por Fissuras Labiopalatinas são oriundos de zonas rurais, principalmente no nordeste do estado onde sabidamente se faz uso indiscriminado de agrotóxicos nocivos a saúde humana, muitos dos quais tem alto potências teratogênico .O objetivo de nosso estudo foi Investigar a associação entre o polimorfismo (rs4630) no gene GSTT1 e a exposição a agrotóxicos na etiologia das fissuras lábio palatinas, bem como analisar o padrão das alterações de fala dos pacientes de acordo com o tipo da fissura . Foram analisados 83 pacientes portadores de Fissuras Palatinas, labiais ou Labiopalatinas de ambos os sexos, e 83 mães desses pacientes, todos oriundos do estado do Pará, com residência em zona rural e capital. Foram realizadas análises fonoaudiológicas e com o sangue desses indivíduos foi feita a análise molecular. A análise estatística foi realizada através dos programas estatísticos SPSS v. 12.0 e BioEstat v. 5.0. Os testes realizados foram os testes de Regressão Logística Multipla, teste x²e o teste exato de Fisher. O resultado consiste em cinco análises moleculares diferentes. Constatamos que a presença do alelo C no genótipo dos indivíduos pode influenciar no metabolismo de xenobióticos e aumentar o risco para desenvolver fissuras Orais.

Multivariate approach in the selection of superior soybean progeny which carry the RR gene

Efficiency in the use of genetic variability, whether existing or created, increases when properly explored and analysed. Incorporation of biotechnology into breeding programs has been the general practice. The challenge for the researcher is the constant development of new and improved cultivars. The aim of this experiment was to select progenies with superior characteristics, whether or not carriers of the RR gene, derived from bi-parental crosses in the soybean, with the help of multivariate techniques. The experiment was carried out in a family-type experimental design, including controls, during the agricultural year 2010/2011 and 2011/2012 in Jaboticabal in the Brazilian State of São Paulo. From the F3 generation, phenotypically superior plants were selected, which were evaluated for the following traits: number of days to flowering; number of days to maturity; height of first pod insertion; plant height at maturity; lodging; agronomic value; number of branches; number of pods per plant; 100-seed weight; number of seeds per plant; grain yield per plant. Given the results, it appears possible to select superior progeny by principal component analysis. Cluster analysis using the K-means method links progeny according to the most important characteristics in each group and identifies, by the Ward method and by means of a dendrogram, the structure of similarity and divergence between selected progeny. Both methods are effective in aiding progeny selection.

Worldwide HLA-E nucleotide and haplotype variability reveals a conserved gene for coding and 3 ' untranslated regions

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

The Mitochondrial Genome of the Leaf-Cutter Ant Atta laevigata: A Mitogenome with a Large Number of Intergenic Spacers

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Comprehensive Analysis of Gene Expression Profiles of the Beet Armyworm Spodoptera exigua Larvae Challenged with Bacillus thuringiensis Vip3Aa Toxin

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Polymorphisms in endothelial nitric oxide synthase gene in early and late severe preeclampsia

Preeclampsia (PE) is characterized by hypertension and proteinuria, occurring after the 20th week of pregnancy in women who have had no previous symptoms. The disease progresses with generalized vasoconstriction and endothelial dysfunction. Clinically, it is important to diagnose the severe form of the disease (sPE), in which blood pressure and proteinuria are much higher. Recently, the gestational age (GA) of the onset of PE has led to the classification of this disease as early (GA <34 weeks) and late (GA >= 34 weeks). Several genetic polymorphisms affecting endothelial nitric oxide synthase (eNOS) levels or function were described, including G894T (Glu298Asp), VNTR b/a (variable-number 27-bp tandem repeat) and T-786C (promoter) polymorphisms. Thus, the aim of this study was to compare the distribution of G894T, VNTR b/a and T-786C polymorphisms and their haplotypes in Brazilian early and late sPE, as well as in normotensive pregnant. A total of 201 women were evaluated, 53 with early sPE, 45 with late sPE and 103 as normotensive pregnant women. The frequency of 894T allele was higher in late sPE vs normotensive pregnant, and 894TT genotype was higher in late sPE vs early sPE and normotensive pregnant. For VNTR b/a polymorphism, higher frequencies of aa genotype and a allele were observed in early sPE vs late sPE and normotensive pregnant. Besides, the frequency of haplotype T-b-C was higher in late sPE vs early sPE and normotensive pregnant. Considering the results found for eNOS polymorphisms, it is possible to suggest that the functional alterations induced by these two polymorphisms may influence the time of severe PE onset, although both alterations are putatively associated with low NO bioavailability. However, other studies are necessary to validate these findings and clarify this issue. (C) 2014 Elsevier Inc. All rights reserved.

Dose and temporal effects on gene expression profiles of urothelial cells from rats exposed to diuron

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Association of Interleukin 4 Gene Polymorphisms With Dental Implant Loss

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Gene expression profiling in leiomyosarcomas and undifferentiated pleomorphic sarcomas: SRC as a new diagnostic marker

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Overexpression of the activated form of the AtAREB1 gene (AtAREB1 Delta QT) improves soybean responses to water deficit

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Estudo da associação de polimorfismos no gene MC1R com cor de pele e cor de cabelo para fins forenses

Melanin is a very important pigment to human species, and besides defining skin, eyes and hair color, it is also involved in sun exposure protection. This pigment is classified into two subtypes: pheomelanin, which is responsible for lighter pigmentation and eumelanin, the dark pigment related. Due to this type of melanin variation it is possible to found different phenotypes of hair and skin color. The genetics MC1R variations are described as the most important for diversity in pigmentation, and this gene is directly related to the complex process of melanin synthesis. The use of these variations to phenotype prediction using genetic information has been used in Europe countries to infer physical features from biological samples, with the purpose of directing searches of criminal suspects and victims identification. The aim of this study was to analyze 8 major MC1R polymorphisms in a sample of Brazilian individuals. Analyzing 91 individuals, we observed with higher frequencies the polymorphisms rs1805005:G>T, rs2228479:G>A and rs885479:G>A, which are related to skin and hair colors, as previously showed in literature. These data suggest the possibility of predicting phenotype from genetic polymorphisms in Brazilian population. However it will be necessary to analyze a larger number of individuals to be able to confirm these associations and to perform a more detailed statistical analysis