Polydnavirus of the parasitic wasp Chelonus inanitus (Braconidae): characterization, genome organization and time point of replication

Ultrastructural analysis of the polydnavirus of the braconid wasp Chelonus inanitus revealed that virions consist of one cylindrical nucleocapsid enveloped by a single unit membrane. Nucleocapsids have a constant diameter of 33.7 +/- 1.4 nm and a variable length of between 8 and 46 nm. Spreading of viral DNA showed that the genome consists of circular dsDNA molecules of variable sizes and measurement of the contour lengths indicated sizes of between 7 and 31 kbp. When virions were exposed to osmotic shock conditions to release the DNA, only one circular molecule was released per particle suggesting that the various DNA molecules are singly encapsidated in this bracovirus. The viral genome was seen to consist of at least 10 different segments and the aggregate genome size is in the order of 200 kbp. By partial digestion of viral DNA with HindIII or EcoRI in the presence of ethidium bromide and subsequent ligation with HindIII-cut pSP65 or EcoRI-cut pSP64 and transfection into Escherichia coli, libraries of 103 HindIII and 23 EcoRI clones were obtained. Southern blots revealed that complete and unrearranged segments were cloned with this approach, and restriction maps for five segments were obtained. Part of a 16.8 kbp segment was sequenced, found to be AT-rich (73%) and to contain six copies of a 17 bp repeated sequence. The development of the female reproductive tract in the course of pupal-adult development of the wasp was investigated and seen to be strictly correlated with the pigmentation pattern. By the use of a semiquantitative PCR, replication of viral DNA was observed to initiate at a specific stage of pupal-adult development.

One-stage (Warsaw) and two-stage (Oslo) repair of unilateral cleft lip and palate: Craniofacial outcomes

The aim of this study was to compare facial development in subjects with complete unilateral cleft lip and palate (CUCLP) treated with two different surgical protocols. Lateral cephalometric radiographs of 61 patients (42 boys, 19 girls; mean age, 10.9 years; SD, 1) treated consecutively in Warsaw with one-stage repair and 61 age-matched and sex-matched patients treated in Oslo with two-stage surgery were selected to evaluate craniofacial morphology. On each radiograph 13 angular and two ratio variables were measured in order to describe hard and soft tissues of the facial region. The analysis showed that differences between the groups were limited to hard tissues – the maxillary prominence in subjects from the Warsaw group was decreased by almost 4° in comparison with the Oslo group (sella-nasion-A-point (SNA) = 75.3° and 79.1°, respectively) and maxillo-mandibular morphology was less favorable in the Warsaw group than the Oslo group (ANB angle = 0.8° and 2.8°, respectively). The soft tissue contour was comparable in both groups. In conclusion, inter-group differences suggest a more favorable outcome in the Oslo group. However, the distinctiveness of facial morphology in background populations (ie, in Poles and Norwegians) could have contributed to the observed results.

Using the Morse Potential to Understand Reaction Coördinates using Maple

The interactions employed in the “linear” reaction A(g)+BC(g) -> AB(g) + C(g) in a “one dimensional world” can be used to illustrate the “reaction coördinate”, using Maple, in a manner which allows students to inspect potential energy surfaces, make contour maps of those surfaces, and conceptually construct the “reaction coördinate” by tracing the local minimum path on the surface created.“one dimensional world” can be used to illustrate the “reaction coördinate”, using Maple, in a manner which allows students to inspect potential energy surfaces, make contour maps of those surfaces, and conceptually construct the “reaction coördinate” by tracing the local minimum path on the surface created.

Creating Useful Products From Connecticut's 2000 LIDAR Data Set JHR 08-314 Project 07-2

The State of Connecticut owns a LIght Detection and Ranging (LIDAR) data set that was collected in 2000 as part of the State’s periodic aerial reconnaissance missions. Although collected eight years ago, these data are just now becoming ready to be made available to the public. These data constitute a massive “point cloud”, being a long list of east-north-up triplets in the State Plane Coordinate System Zone 0600 (SPCS83 0600), orthometric heights (NAVD 88) in US Survey feet. Unfortunately, point clouds have no structure or organization, and consequently they are not as useful as Triangulated Irregular Networks (TINs), digital elevation models (DEMs), contour maps, slope and aspect layers, curvature layers, among others. The goal of this project was to provide the computational infrastructure to create a first cut of these products and to serve them to the public via the World Wide Web. The products are available at http://clear.uconn.edu/data/ct_lidar/index.htm.

Percepción de la erosión agraria

Esta investigación analiza mediante la metodología Delphi varios indicadores de calidad del suelo del olivar español, en particular, la textura, la fertilidad, el color, la profundidad, la compactación, la aireación, la materia orgánica y la infiltración del agua. El objetivo consiste en describir la percepción de los olivicultores acerca del grado de erosión en la zona de estudio, teniendo en cuenta su propia autovaloración referida a su nivel de adopción de innovaciones y a su actitud frente al riesgo de aplicar nuevas tecnologías. El panel de expertos seleccionados está formado por 63 olivicultores de la cuenca granadina del Alto Genil en el año 2005; esta zona se caracteriza por el cultivo del olivar en ladera y sus consiguientes niveles de erosión medio-altos, por lo que la actividad agraria se encuentra fuertemente condicionada por el grado de implementación de prácticas de conservación del suelo, específicamente por el laboreo según curvas de nivel, el no laboreo con herbicidas y el mantenimiento de restos de poda sobre la capa edáfica (según una encuesta preliminar del año 2004), así como por su promoción a través de la reciente legislación europea en materia agroambiental.

El CIFOT como apoyo a la tarea empresarial : the CIFOT as support to the business task

Empresas como HEXA S.A. desean introducir SIG como elemento para incrementar el valor agregado de los proyectos de consultoría que realizan. Tal es el caso del trabajo encomendado por ellos al CIFOT titulado Esquema hidromorfológico de la cuenca del río Tunuyán Superior y clasificación de Usos del Suelo del Oasis Centro Oeste; Provincia de Mendoza. Se unifica en un único modelo digital una serie de cartas topográficas (IGM) digitalizan diversos niveles de información (curvas de nivel, hidrografía de la cuenca del río Tunuyán), red de caminos y su jerarquía. A partir de la base de datos lograda, se generan mapas temáticos de cada cuenca, apoyados con imágenes satelitales Landsat TM, que permiten identificar cobertura nivo- glacial y usos del suelo en el Oasis. Con esta información la empresa obtiene un modelo de simulación del Río Tunuyán para predecir el caudal que conduciría el río ante determinadas nevadas, por ejemplo. Se propone además un modelo de SIG para el monitoreo de la zona.

Determinación de la precisión de DEMs generados con puntos digitalizados a partir de cartografía existente : relación con el algoritmo utilizado

La información básica sobre el relieve de cuencas hidrográficas, mediante metodologías analítico-descriptivas permite contar con los parámetros físicos necesarios para el estudio de los recursos naturales tales como manejo integrado de cuencas, impacto ambiental, degradación de suelos, deforestación, conservación de los recursos hídricos, entre otros. Todos estos procesos ligados a una fuerte componente espacial permiten el uso de sistemas de información geográfica. Los Modelos Digitales de Elevación (DEM) y sus derivados son un componente relevante de estas fuentes de datos. En este trabajo se planteó evaluar los DEMs, generados por captura indirecta de datos fuente, (puntos digitalizados sobre un plano, en formato papel, con curvas de nivel) para determinar si su calidad altimétrica varía con la resolución espacial del mismo (tamaño de grilla). Asimismo se evaluó la posible existencia de alguna interacción entre el software utilizado y los tamaños de grilla, que podría influir sobre la calidad altimétrica del DEM. Se concluyó que la resolución espacial afecta la calidad altimétrica del DEM. Se constató, asimismo, que es posible encontrar un tamaño de grilla ideal en cuanto a calidad altimétrica y peso informático del modelo digital de elevaciones generado. Respecto de la existencia de una interacción entre el tamaño de grilla y el software, que pudieran afectar la calidad de los modelos obtenidos en función de la metodología de adquisición de datos fuente, se demostró que existe esta posibilidad cuando la base de datos se genera a partir de puntos digitalizados.

High resolution bathymetric compilation for Potter Cove, WAP, Antarctica, with links to data in ArcGIS format

The bathymetry raster with a resolution of 5 m x 5 m was processed from unpublished single beam data from the Argentine Antarctica Institute (IAA, 2010) and multibeam data from the United Kingdom Hydrographic Office (UKHO, 2012) with a cell size of 5 m x 5 m. A coastline digitized from a satellite image (DigitalGlobe, 2014) supplemented the interpolation process. The 'Topo to Raster' tool in ArcMap 10.3 was used to merge the three data sets, while the coastline represented the 0-m-contour to the interpolation process ('contour type option').