Wide Screening of Phage-Displayed Libraries Identifies Immune Targets in Planta

Microbe-Associated Molecular Patterns and virulence effectors are recognized by plants as a first step to mount a defence response against potential pathogens. This recognition involves a large family of extracellular membrane receptors and other immune proteins located in different sub-cellular compartments. We have used phage-display technology to express and select for Arabidopsis proteins able to bind bacterial pathogens. To rapidly identify microbe-bound phage, we developed a monitoring method based on microarrays. This combined strategy allowed for a genome-wide screening of plant proteins involved in pathogen perception. Two phage libraries for high-throughput selection were constructed from cDNA of plants infected with Pseudomonas aeruginosa PA14, or from combined samples of the virulent isolate DC3000 of Pseudomonas syringae pv. tomato and its avirulent variant avrRpt2. These three pathosystems represent different degrees in the specificity of plant-microbe interactions. Libraries cover up to 26107 different plant transcripts that can be displayed as functional proteins on the surface of T7 bacteriophage. A number of these were selected in a bio-panning assay for binding to Pseudomonas cells. Among the selected clones we isolated the ethylene response factor ATERF-1, which was able to bind the three bacterial strains in competition assays. ATERF-1 was rapidly exported from the nucleus upon infiltration of either alive or heat-killed Pseudomonas. Moreover, aterf-1 mutants exhibited enhanced susceptibility to infection. These findings suggest that ATERF-1 contains a microbe-recognition domain with a role in plant defence. To identify other putative pathogen-binding proteins on a genome-wide scale, the copy number of selected-vs.-total clones was compared by hybridizing phage cDNAs with Arabidopsis microarrays. Microarray analysis revealed a set of 472 candidates with significant fold change. Within this set defence-related genes, including well-known targets of bacterial effectors, are over-represented. Other genes non-previously related to defence can be associated through this study with general or strain-specific recognition of Pseudomonas.

Cambios oceanográficos y climáticos en el sur del golfo de Vizcaya durante el Cuaternario final, detectados por medio de los foraminíferos y ostrácodos

La microfauna bentónica y planctónica se ha convertido en una herramienta precisa de detección de las variaciones paleoceanográficas y paleoclimáticas. La combinación de grupos faunísticos diferentes, cuya respuesta ante los mismos factores ecológicos puede ser diversa, permite analizar de manera aún más concreta los cambios oceanográficos y climáticos en la misma área de estudio. Así mismo, el estudio de las asociaciones microfaunísticas con técnicas isotópicas y sedimentológicas, posibilitan la determinación del grado de afectación de los parámetros ecológicos considerados en las especies identificadas. La comparación de las variaciones específicas detectadas en el pasado con la distribución de dichas asociaciones en los modelos actuales, permite caracterizar los cambios pretéritos del medio que habitaban estos organismos. El presente trabajo está estructurado en dos bloques principales: por un lado, se estudia la microfauna (foraminíferos bentónicos, planctónicos y ostrácodos) en muestras superficiales de la plataforma, con el objetivo de determinar los parámetros ecológicos que controlan su distribución a lo largo del área de estudio. Por otra parte, se analizan 5 sondeos obtenidos a diferente profundidad, que permiten definir las variaciones oceanográficas y climáticas acontecidas en la plataforma Vasca a finales del Cuaternario, basándonos en los cambios de las asociaciones de microfauna que se suceden a lo largo de los sondeos. Estas variaciones faunísticas denotan, por tanto, cambios ambientales.

Assisting blog publication: annotation, model transformation, and crossblogging techniques

Although blogs exist from the beginning of the Internet, their use has considerablybeen increased in the last decade. Nowadays, they are ready for being used bya broad range of people. From teenagers to multinationals, everyone can have aglobal communication space.Companies know blogs are a valuable publicity tool to share information withthe participants, and the importance of creating consumer communities aroundthem: participants come together to exchange ideas, review and recommend newproducts, and even support each other. Also, companies can use blogs for differentpurposes, such as a content management system to manage the content of websites,a bulletin board to support communication and document sharing in teams,an instrument in marketing to communicate with Internet users, or a KnowledgeManagement Tool. However, an increasing number of blog content do not findtheir source in the personal experiences of the writer. Thus, the information cancurrently be kept in the user¿s desktop documents, in the companies¿ catalogues,or in another blogs. Although the gap between blog and data source can be manuallytraversed in a manual coding, this is a cumbersome task that defeats the blog¿seasiness principle. Moreover, depending on the quantity of information and itscharacterisation (i.e., structured content, unstructured content, etc.), an automaticapproach can be more effective.Based on these observations, the aim of this dissertation is to assist blog publicationthrough annotation, model transformation and crossblogging techniques.These techniques have been implemented to give rise to Blogouse, Catablog, andBlogUnion. These tools strive to improve the publication process considering theaforementioned data sources.

New genetic markers for treatment personalization in pediatric acute lymphoblastic leukemia

La Leucemia Linfoblástica Aguda (LLA) es el cáncer pediátrico más común. Es un desorden de las células linfoblásticas, que son las precursoras de las células linfáticas, y se caracteriza por la acumulación en médula ósea y sangre de pequeñas células blásticas con poco citoplasma y cromatina dispersa. En las últimas décadas, se ha conseguido aumentar la supervivencia del 10% al 80% pero todavía hay un 20% de pacientes que no responden al tratamiento. Esta mejoría se ha conseguido mediante la implantación de terapias combinadas y la adecuación de la terapia a grupos de riesgo. Los pacientes se separan en tres grupos de riesgo, Riesgo Estándar (RE), Alto Riesgo (AR) y Muy Alto Riesgo (MAR), en base a marcadores pronósticos, entre los que se incluyen alteraciones citogenéticas. Sin embargo, a lo largo del tratamiento, nos encontramos con dos problemas:1) Por un lado, algunos de los pacientes incluidos en el grupo de RE y AR no responden bien al tratamiento y pasan AR y MAR respectivamente. Esto quiere decir que los grupos de riesgo no están bien definidos. Por lo tanto, sería de interés poder caracterizar los pacientes que realmente son RE y AR y aquéllos que desde un principio deberían haber sido considerados como de mayor riesgo.2) Por otro lado, un alto porcentaje de pacientes experimenta toxicidad, que puede llegar a ser muy grave en algunos casos, siendo necesario parar el tratamiento. Por este motivo, sería altamente beneficioso poder reconocer a los pacientes que van a ser más sensibles al tratamiento para, de ese modo, poder ajustar la dosis.Por todo esto, creemos que una mejor asignación de los pacientes de LLA a grupos de riesgo y la personalización de la dosis, mediante nuevos marcadores genéticos, permitiría mejorar la respuesta al tratamiento.En este estudio nos planteamos, por lo tanto, dos objetivos: 1) Llevar a cabo la identificación de nuevas alteraciones genéticas presentes en el tumor para una mejor caracterización del riesgo y 2) Realizar una caracterización genética del individuo que permita predecir la respuesta al tratamiento.

Retos y oportunidades de pequeños y medianos despachos y firmas de auditoria ante cambios en la regulación. Marco teórico y estudio empírico

X,429 p.

Collision tumour involving a rectal gastrointestinal stromal tumour with invasion of the prostate and a prostatic adenocarcinoma

Background: Gastrointestinal stromal tumours (GISTs) are the most common primary mesenchymal neoplasia in the gastrointestinal tract, although they represent only a small fraction of total gastrointestinal malignancies in adults (<2%). GISTs can be located at any level of the gastrointestinal tract; the stomach is the most common location (60-70%), in contrast to the rectum, which is most rare (4%). When a GIST invades into the adjacent prostate tissue, it can simulate prostate cancer. In this study, we report on a case comprising the unexpected collision between a rectal GIST tumour and a prostatic adenocarcinoma. Findings: We describe the complexity of the clinical, endoscopic and radiological diagnosis, of the differential diagnosis based on tumour biopsy, and of the role of neoadjuvant therapy using imatinib prior to surgical treatment. Conclusions: Although isolated cases of coexisting GISTs and prostatic adenocarcinomas have reviously been described, this is the first reported case in the medical literature of a collision tumour involving a rectal GIST and prostatic adenocarcinoma components.

A neural extracellular matrix-based method for in vitro hippocampal neuron culture and dopaminergic differentiation of neural stem cells

Background: The ability to recreate an optimal cellular microenvironment is critical to understand neuronal behavior and functionality in vitro. An organized neural extracellular matrix (nECM) promotes neural cell adhesion, proliferation and differentiation. Here, we expanded previous observations on the ability of nECM to support in vitro neuronal differentiation, with the following goals: (i) to recreate complex neuronal networks of embryonic rat hippocampal cells, and (ii) to achieve improved levels of dopaminergic differentiation of subventricular zone (SVZ) neural progenitor cells. Methods: Hippocampal cells from E18 rat embryos were seeded on PLL- and nECM-coated substrates. Neurosphere cultures were prepared from the SVZ of P4-P7 rat pups, and differentiation of neurospheres assayed on PLL- and nECM-coated substrates. Results: When seeded on nECM-coated substrates, both hippocampal cells and SVZ progenitor cells showed neural expression patterns that were similar to their poly-L-lysine-seeded counterparts. However, nECM-based cultures of both hippocampal neurons and SVZ progenitor cells could be maintained for longer times as compared to poly-L-lysine-based cultures. As a result, nECM-based cultures gave rise to a more branched neurite arborization of hippocampal neurons. Interestingly, the prolonged differentiation time of SVZ progenitor cells in nECM allowed us to obtain a purer population of dopaminergic neurons. Conclusions: We conclude that nECM-based coating is an efficient substrate to culture neural cells at different stages of differentiation. In addition, neural ECM-coated substrates increased neuronal survival and neuronal differentiation efficiency as compared to cationic polymers such as poly-L-lysine.

Human Papillomavirus (HPV) genotype 18 variants in patients with clinical manifestations of HPV related infections in Bilbao, Spain

Background:Human papillomavirus (HPV) variants differ in their biological and chemical properties, and therefore, may present differences in pathogenicity. Most authors classified variants based on the phylogenetic analysis of L1 region. Nevertheless, recombination in HPV samples is becoming a usual finding and thus, characterizing genetic variability in other regions should be essential. Objectives:We aimed to characterize the genetic variability of HPV 18 in 5 genomic regions: E6, E7, E4, L1 and the Upstream Regulatory Region (URR), working with both single infection and multiple HPV infection samples. Furthermore, we aimed to assess the prevalence of HPV 18 variants in our region and look for possible existence of recombination as well as analyze the relationship between these variants and the type of lesion. Methods: From 2007 to 2010, Clinical Microbiology and Infection Control Department analyzed 44 samples which were positive for HPV 18. Genetic variability was determined in PCR products and variants were assigned to European, Asian-amerindian or African lineage. Recombination and association of variants with different types of lesion was studied. Results: Genetic analysis of the regions revealed a total of 56 nucleotide variations. European, African and Asian-amerindian variants were found in 25/44 (56.8%), 10/44 (22.7%) and 5/44 (11.4%) samples, respectively. We detected the presence of recombinant variants in 2/44 (4.5%) cases. Samples taken from high-grade squamous intraepithelial lesions (H-SIL) only presented variants with specific-african substitutions. Conclusions: Multiple HPV infection, non-european HPV variants prevalence and existence of recombination are considered risk factors for HPV persistence and progression of intraepithelial abnormalities, and therefore, should be taken into consideration in order to help to design and optimize diagnostics protocols as well as improve epidemiologic studies. Our study is one of the few studies in Spain which analyses the genetic variability of HPV18 and we showed the importance of characterizing more than one genomic region in order to detect recombination and classify HPV variants properly

NewsMonitor: Desarrollo de un sistema de seguimiento de noticias

Desarrollo de un sistema de recuperación y almacenamiento de las noticias multilíngües que aparecen en el Europe Media Monitor

Nuevas fórmulas publicitarias: los advergames como herramienta de las comunicaciones de marketing

Los advergames son videojuegos orientados a la comunicación publicitaria. Su naturaleza de mensaje híbrido, al combinar contenido publicitario y contenido de entretenimiento, aporta interesantes posibilidades al desarrollo de comunicaciones de marketing en un entorno mediático en el que la publicidad tradicional ha ido perdiendo eficacia. El presente artículo delimita el concepto de advergame, analizando las diferentes tipologías existentes y sus efectos sobre diversos objetivos de marketing y de comunicación. Asimismo, se apuntan algunas recomendaciones a la hora de desarrollar comunicaciones de marketing mediante advergames, así como las cuestiones éticas y morales que deben considerarse

La importancia de la participación en el trabajo como determinante de la competitividad empresarial

Hoy por hoy, todos los expertos coinciden en señalar que el logro de una mayor competitividad es el principal reto que tiene ante sí la empresa española. Esto significa que la empresa necesita una mayor capacidad para lograr un producto en condiciones de calidad, precio, diseño, prestaciones, servicios, etc. suficientemente buenas y generando con ello un coste que le permita ser rentable. Esta definición, aportada por Alvarez y Ruesga, acierta al identificar los dos componentes de la competitividad, al igual que aciertan otros autores, entre los que podemos citar a García Echevarría. Para éste último la competitividad implica una buena utilización de los potenciales de cada empresa, logrando al mismo tiempo las prestaciones que en ese momento precisa el mercado.

Vías para el desarrollo de actividades de innovación y su relación con el desempeño innovador

El trabajo estudia el efecto sobre el desempeño innovador de diferentes vías para el desarrollo de actividades de innovación. El estudio empírico utiliza la Encuesta sobre Innovación Tecnológica de las Empresas para el año 2007. Los resultados sugieren que la utilización de una única vía, ya sea interna o externa, tiene un efecto mayoritariamente negativo sobre el desempeño innovador y que los mejores resultados parecen obtenerse de la combinación de todas las vías. Finalmente, las vías cuyo efecto sobre el desempeño parece más independiente de la medida de rendimiento utilizada son interna&externa, sólo externa e interna&externa&cooperación.

Confianza como consecuencia del compromiso percibido: Implicaciones sobre el aprendizaje y la innovación

En este trabajo pretendemos alcanzar un doble objetivo. En primer lugar, estudiamos la influencia del compromiso afectivo de los empleados percibido por el directivo, tanto sobre su nivel de confianza, como sobre la capacidad de aprendizaje organizativo (CAO). Igualmente, analizamos cómo influye sobre la CAO esta predisposición del directivo a confiar en sus empleados. En segundo lugar, examinamos si el compromiso afectivo de los empleados percibido por el directivo, la confianza del directivo y la CAO favorecen la innovación en producto. Aplicando modelos de ecuaciones estructurales (Partial Least Squares -PLS-) sobre una muestra de 92 empresas pertenecientes a sectores innovadores españoles se concluye que el compromiso afectivo que el directivo percibe en los empleados determina su nivel de confianza en aquellos. Asimismo, ambas variables (compromiso afectivo de los empleados percibido por el directivo y confianza del directivo) explican la CAO. Finalmente, se comprueba que los dos factores considerados (compromiso afectivo percibido y confianza) influyen sobre la innovación en producto a través de la CAO.

¿Puede la gestión del conocimiento influir en los resultados empresariales?

El objetivo de este artículo es analizar la influencia de la gestión del conocimiento en los resultados empresariales. En primer lugar, se ha realizado una revisión de la literatura, que ha permitido establecer las dimensiones más comunes de la gestión del conocimiento y de los resultados, para su posterior medición. Se han tomado como dimensiones de la gestión del conocimiento: la creación; el almacenamiento y la transferencia; y la aplicación y uso del conocimiento. La adquisición de información, la diseminación de ésta y la interpretación compartida se han utilizado como medidas para la creación de conocimiento. Asimismo, se han utilizado como medidas de la aplicación y uso del conocimiento, el empowerment, el trabajo en equipo y el compromiso con el conocimiento. Como dimensiones de los resultados se han utilizado resultados operativos, financieros y de innovación. La metodología utilizada se basa en el estudio del caso, a través de datos primarios y secundarios. Los resultados obtenidos muestran que la gestión del conocimiento influye en los resultados tanto operativos, como financieros y de innovación. De este modo, las empresas analizadas que tienen un mayor grado de gestión del conocimiento, a través del trabajo en equipo, incremento del empowerment, flexibilización en la toma de decisiones y una visión global de la empresa, entre otras prácticas, obtienen mayores resultados, tanto operativos, como financieros y de innovación.

Formas de establecimiento en el mercado extranjero: factores determinantes para el caso de la multinacional india Tata

En este trabajo trataremos de explicar los motivos que hay detrás de la forma de inversión directa en el exterior (IDE) a través de adquisiciones frente a la opción de establecerse en el mercado extranjero con recursos propios. Para una muestra de 117 decisiones de IDE efectuadas por la multinacional india Tata en 43 países, los resultados obtenidos indican que la intensidad tecnológica del sector, el riesgo asociado al país de destino, el atractivo del mercado extranjero, la experiencia previa internacional o las exportaciones indias al país donde se decide invertir son factores que condicionan dicha elección.