A problemática trazida pelos bancos de perfis genéticos criminais no Brasil

Pós-graduação em Direito - FCHS

Mutações putativo-causais em genes candidatos associadas à fertilidade de bovinos de corte e bubalinos

Pós-graduação em Genética e Melhoramento Animal - FCAV

Mapeamento físico de sequênias repetitivas de DNA no genoma de espécies do gênero Trichomycterus (Siluriformes, Trichomycteridae)

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Estudo da interação entre a via genética do microRNA156/squamosa promoter-binding protein-like e brassinosteróides durante o desenvolvimento de Arabidopsis thaliana

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Genética) - IBB

Caracterização molecular, citogenética e sensibilidade a herbicidas em três populações de Rottboellia cochinchinensis em cana-de-açúcar no estado de São Paulo

Pós-graduação em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas) - FCAV

Prediction of genomic-enabled breeding values and genome-wide association study for feedlot average daily weight gain in Nelore cattle

Pós-graduação em Genética e Melhoramento Animal - FCAV

Extensive spreading of interstitial telomeric sites on the chromosomes of Characidium (Teleostei, Characiformes)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Genotoxic potential of the latex from cotton-leaf physicnut (Jatropha gossypiifolia L.)

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Eucalyptus urograndis stem proteome is responsive to short-term cold stress

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

De novo transcriptome assembly for a non-model species, the blood-sucking bug Triatoma brasiliensis, a vector of Chagas disease

High throughput sequencing (HTS) provides new research opportunities for work on non-model organisms, such as differential expression studies between populations exposed to different environmental conditions. However, such transcriptomic studies first require the production of a reference assembly. The choice of sampling procedure, sequencing strategy and assembly workflow is crucial. To develop a reliable reference transcriptome for Triatoma brasiliensis, the major Chagas disease vector in Northeastern Brazil, different de novo assembly protocols were generated using various datasets and software. Both 454 and Illumina sequencing technologies were applied on RNA extracted from antennae and mouthparts from single or pooled individuals. The 454 library yielded 278 Mb. Fifteen Illumina libraries were constructed and yielded nearly 360 million RNA-seq single reads and 46 million RNA-seq paired-end reads for nearly 45 Gb. For the 454 reads, we used three assemblers, Newbler, CAP3 and/or MIRA and for the Illumina reads, the Trinity assembler. Ten assembly workflows were compared using these programs separately or in combination. To compare the assemblies obtained, quantitative and qualitative criteria were used, including contig length, N50, contig number and the percentage of chimeric contigs. Completeness of the assemblies was estimated using the CEGMA pipeline. The best assembly (57,657 contigs, completeness of 80 %, < 1 % chimeric contigs) was a hybrid assembly leading to recommend the use of (1) a single individual with large representation of biological tissues, (2) merging both long reads and short paired-end Illumina reads, (3) several assemblers in order to combine the specific advantages of each.

Complex sex chromosome system in Eigenmannia sp. (Pisces, Gymnotiformes)

Chromosomes of Eigenmannia sp. (7 males and 15 females) collected from the Tietê River in Botucatu (SP, Brazil) were examined from gill, kidney and testicular cells. The diploid chromosome number in males was 2n=31 and in females, 2n=32. In both sexes the number of chromosomal arms was 40. The difference in diploid number was due to the fusion of two acrocentrics. Mitotic and meiotic studies suggested that one of the fused acrocentrics was the Y chromosome. The sex-determining mechanism in Eigenmannia sp. could therefore be XX, AA in the female and X, \-YA A in the males. One of the males presented 2n=30 chromosomes due to the occurrence of another fusion of acrocentrics. C-banding analysis of the mitotic chromosomes revealed constitutive heterochromatin in the centromeric regions of all acrocentrics. However, small metacentrics were C-band negative. The YA chromosome is C-band negative except for a small amount of heterochromatin in the centromeric region. The nucleolar organizer region as identified by Ag-staining is present in the interstitial region of chromosome pair No. 10. © 1984 Dr W. Junk Publishers.

Estudo da hibridação entre espécies do gênero Pitcairnia (Bromeliaceae) através de marcadores plastidiais

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Organização de DNAs microssatélites nos cromossomos do gafanhoto Abracris flavolineata, com ênfase em cromossomos supranumerários

Com o propósito de se obter um conhecimento aprofundado sobre DNAs repetitivos e sua organização nos cromossomos de gafanhotos, nós utilizamos a técnica citogenética de Hibridização in situ fluorescente (FISH) para o mapeamento da distribuição de dezesseis sequências de microssatélites, incluindo mono-, di-, tri- e tetra-nucleotídeos, nos cromossomos da espécie Abracris flavolineata (Acrididae), que comporta um cromossomo B (supranumerário). A FISH (Hibridização in situ fluorescente) revelou pelo menos dois padrões distintos: (i) sinais exclusivamente espalhados, e (ii) sinais espalhados e específicos, formando blocos evidentes. O enriquecimento foi observado em ambas áreas de eucromatina e heterocromatina e também apenas o motivo (C)30 apresentou ausência na heterocromatina. Os cromossomos A e B se apresentaram enriquecidos com todos os elementos mapeados, sendo observado para o cromossomo a presença de blocos mais distintivos para (GA)15 e (GAG)10. Para o complemento A blocos distintos foram observados para (A)30, (CA)15, (CG)15, (GA)15, (CAC)10, (CAA)10, (CGG)10, (GAA)10, (GAC)10 e (GATA)8. Estes resultados revelaram um intenso espalhamento dos microssatélites no genoma de Abracris flavolineata independentemente de enriquecimento de A+T ou G+C de cada uma das sequências. Os dados indicam que os microssatélites compõem o cromossomo B e que poderiam estar envolvidos na evolução deste elemento na espécie em estudo, embora nenhuma relação específica com qualquer cromossomo A tenha sido observado para discutir sobre sua origem. A análise sistemática apresentada neste trabalho contribui para o conhecimento sobre DNAs repetitivos e sua organização nos cromossomos dos gafanhotos, incluindo os cromossomos B